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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000079_pilon:36216..46301+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11041.1.p1 ID=MSTRG.11041.1.p1|Name=MSTRG.11041.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10086bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:36216..46301+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GATTCtctctattttctttttagatttctACTATTTAATATAACTAACAA
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ttgaaatcagaAATTCAAAGTGGCCAACTTGGAGAAGATGCAGCAGAAGG
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ttagctttagactgtccaatatctctataaTAGTGTACACTAACAGtctt
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ATGTACTCGTTTGATGTACAAGCAGTATTTGTCAAGGTCGACCATACAat
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CATCTCATCTCAACTTGTTAATCATATTAtcatattcttttttttctttt
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GGACTGGATATCAACTCATTACTATCAAATCCAGCTGTTATGAACATGGC
ACAAAATTTCATGACAAACCCAGCCATGCAGAACATGTAAGCTTTTATTT
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TTAGTTCCCAACAAGTTGCTGCCCAGTTAAGAGAGCAAAATCCAGAATTA
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GAATCCCCCTCCTTCtgatgaaaataatcaaaaataaaattaaataaaat
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TCTTCTTTAATGAAGACCCGATTCTCACTGCACGGTCAAGTTTACTGTTG
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TTCCTCAGGTTTCTTAGCTGAgctgaaacttttttcaaatcaacCTAACC
CATGTGTCATAATATTAACTTCCTTATAAGTGAAATCATAGTCCGTATAT
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GCCCACTTTGGCGTTTGGCAAGTCATTCTAAATAGATgcggaaaattctt
tttaatctGTTCTTTCACCGGTCGTGacttttatcatttatcatttttat
tttcctgAGAAccctttaaattattttaaggtGCGTTTGAACACGACTTA
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GGAGTCATTTAACTTAGccaaaccttgaaaacctttaTGCTATATAAATG
AATTGAACTTAAGATTTTATTCAAAGCAGAGCTTATAAAATCTCACAATG
TCATATTAGGTTGTATGAACGTAGTAATAGGGTCTAGTAGTGACAGTTGT
TCGGTTTGAAGTTTTAATTTAAAGTTTAGCAATCTTGTAAGGAATCTTAC
GAGTCttatattcttcttttttcattacagagtaaaatagaaaaaattaa
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CTCTTATAATTATAGTGGTTCAACTCTCTGCACTCTGTAGGGAAACTCAA
CATCATTTTCTTCGCCAATTACTGATCATAAATTCAAACCTTTTTTATTG
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CTTTATCGAATACCCTGGGTTCATAAAGAATGTAGACAAAATGCTGGCAA
CCCTGGGTggtgaagaaaaaatttctgaaacttATCGGAGCGGTAAACAA
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CGCCGATTTGCTACCATTTACTGGTTTATTATTAAAAGTACGGCGCCGAA
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GTCATACAGAGTCTATGGCTGCCCTTTATTCAAGTGCAGATGTGCCAAGT
AAACCTACAGAAAAAGCTTGTAccattattgaaaatttgaataaaggtCC
AGATGCGGATGCAATAAAACAACTCGAACTTATGTTTAACGAGAGACCGT
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GAGGACCCTTTGGTGTCGCATGGGCTACGACCCGAGAAAAGATCCGAAAG
CTAAACGTTATCAAATGGTTGAGTTTCGTTTGAGACGATCAAAAGAGAAT
AAGAAATGCTATAAGATGATGGTACCCGCTCGAAGATCCAATAAAGATTA
CTTAcctcgtaatttgagaaatattgTGTCCAGGGCACCGGCCTCAAAGT
CAGTCCTCGCCGCCTGTAATGAGCCAGAGAACAAAGAAGAAGGTGATAAA
GAACCGTATATTTTTCATCCAAATAAAATGATTCATTCGCGGAGTATGAT
GTTACAATTGTGTGATATTCACGATCCAGCTGTTCAGAAAATCATCGTTG
AGAATGACGGTATGGAAACCAGGTGCGATGAGAGAGAGGGATGGTTTCCA
CAAGGTACAATGGGACGGATCCGTAACGAGATGACGAAAACGGTTGACGC
CTATTTTGAGAGGCAATACGAgaaacaaaaatctgaaaatctcaGCAGTG
ATAAAACTGGTGGCGGTGAAGCAGGCGTTCATTCTGATGTACAGGGTGAA
GGAGGCGGTGTCAAAGAGGAAGAGAGGTTCCGTGAAGGAGCGCTTTACGA
CGAAGACATGTACGAACGAGACACGGAACCGCCCTCCTCCACACAGATGT
TAAGCTACACACAAATGTTACAAGGTGATGATGATTATAGTATGGATACT
GGCCAATTCTATGATGAAGAAGAATTTAATGTTTATGCTTGAGAATTGAA
AATCATAAATTCTCTTCGGATTTGATCACACCTTTTTTGCGCTAGATAAG
GGCCCTAAGTTTTATTAAGAGGATTAAGAGAATTTGGTTCGAATTTActg
tggagtctccataactcgaacacgcatggggaaacacaaatttgttcgag
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TCTATATATGATCTTTTCAACGCGATGACTTTAGACATATGATGCTTTGT
CTCTTGTTAAGTCGAACCCAAACTGTGTGTAGCTAGCATGTGACCATGAA
ATGTGACGCCCTCAGCAATCTTGTATTTTCATTAACTTTGTAAGTCACTA
TTATTGCTAGGATTTGAACCTAATTGTACACATATACAAAATACTCTATT
GTACACGGTTTGATGGTAGTCTGTTCCTTTCTTATCCTATTTTACAGTCT
GTTCCTGTAAAGAATCCTGCAtaattgtaacacgcatgcgttcTGTCTCT
TTTAACCATATgtagttattctttgtattattaaac Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:36216..46301+ >MSTRG.11041.1.p1 ID=MSTRG.11041.1.p1|Name=MSTRG.11041.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:36216..46301+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAAGTCAAGATTGAAGATGAGATACAGAATGACCCATCACGTTTCAA AAAAGTCACAACCAAAAGGCTTGTCTTTATCGAATACCCTGGGTTCATAA AGAATGTAGACAAAATGCTGGCAACCCTGGGTggtgaagaaaaaatttct gaaacttATCGGAGCGGTAAACAACGTCTTCAAATGACGTATCGACCTGA AGATTTAAATGCTCATAACGCATGCGCCGATTTGCTACCATTTACTGGTT TATTATTAAAAGTACGGCGCCGAAGAAAGAAAGGAACTGATGAATTCGAA TACGAACAAGACATTGTAGGTATATCACGTGATCGTTATCGGTTTCAGAC TCTCATGGACTATCAATATTTGACACCTGAACCGCTATGGAATTATTTTA AATCAATTCATACTAGTGAGCTAGGGAACACTGACTTTCCACCTTATTTT GCACCGCCTGTCTTCGCGAGACTCGATTCCGCTGGAGTTTACCAATACAA ACCGGATCTAGTTACCGGGATTAAAACAGTTGCTAAAGCGCCGGAAATCG GTATTGATTCTATACGGAAGCGTCGTCATACAGAGTCTATGGCTGCCCTT TATTCAAGTGCAGATGTGCCAAGTAAACCTACAGAAAAAGCTTGTAccat tattgaaaatttgaataaaggtCCAGATGCGGATGCAATAAAACAACTCG AACTTATGTTTAACGAGAGACCGTTATGGTCCAAGCTTGCAATATCATGT TTGGTGGATGTCACTCCTGAGCGATTGAAGAAAGTCTTACAGTATTTTGC TTATTACTGGTTAAGTGGACCTTGGAGGACCCTTTGGTGTCGCATGGGCT ACGACCCGAGAAAAGATCCGAAAGCTAAACGTTATCAAATGGTTGAGTTT CGTTTGAGACGATCAAAAGAGAATAAGAAATGCTATAAGATGATGGTACC CGCTCGAAGATCCAATAAAGATTACTTAcctcgtaatttgagaaatattg TGTCCAGGGCACCGGCCTCAAAGTCAGTCCTCGCCGCCTGTAATGAGCCA GAGAACAAAGAAGAAGGTGATAAAGAACCGTATATTTTTCATCCAAATAA AATGATTCATTCGCGGAGTATGATGTTACAATTGTGTGATATTCACGATC CAGCTGTTCAGAAAATCATCGTTGAGAATGACGGTATGGAAACCAGGTGC GATGAGAGAGAGGGATGGTTTCCACAAGGTACAATGGGACGGATCCGTAA CGAGATGACGAAAACGGTTGACGCCTATTTTGAGAGGCAATACGAgaaac aaaaatctgaaaatctcaGCAGTGATAAAACTGGTGGCGGTGAAGCAGGC GTTCATTCTGATGTACAGGGTGAAGGAGGCGGTGTCAAAGAGGAAGAGAG GTTCCGTGAAGGAGCGCTTTACGACGAAGACATGTACGAACGAGACACGG AACCGCCCTCCTCCACACAGATGTTAAGCTACACACAAATGTTACAAGGT GATGATGATTATAGTATGGATACTGGCCAATTCTATGATGAAGAAGAATT TAATGTTTATGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000079_pilon | genome | sc0000079_pilon:36216..46301 + |
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