MSTRG.11034.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11034.1.p1
Unique NameMSTRG.11034.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:1388958..1404108-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11034.1.p1 ID=MSTRG.11034.1.p1|Name=MSTRG.11034.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15151bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1388958..1404108- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTACATGTGCAATATAAATTGACGAAAAGATGTTGTTGCATTGTAGCAGT AGAAGCAATCTAACGTCACTTTGCTACTAAAGTGCCCTGCGCTTTTTTCC AACACAAAAAGTGCATTTTTTTGTGTCACCGATAAACCAGTTATCATACA TTTGATAACTATTATATATTTTCAGTGGTCAATTTACTTATATTATTATA AATAACTGTCCTTTCGAAATCCAGGAACTTGTCGAGGCTAATCTGACAAA CTTCTTATCTGACAAACGCAAACAAAGTATATGTATCCTGGCTATAAAGA TTTATTACAATATTTTCAATATAATATTTTTAGGTTTTGAAGGCAACTTT CGAATACCACCTTTGGATTATTTGGATGTGCTTGGTGAACACTTTTGTTA TGAATCAGTTATGATGTATGGAAGGTAGGCAGATTGAAGGGGACTTCCTT ATACGTTATAAGAACAAACCATATAAGAACATAAGGCTTCGCTTTCCAAA ATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTTGTGTGTGGACTCAAA AACATCCTATTTCTTTGAAAAATGGTCAAAAATATTCACAAAATGGTCAA GAACATGTTAAGAACATAAGAACATGTTAAGAGCATTTTTAGGGCCTAAA TCTCAAAAAGTTAAGAACATCCGAATGCTTCAAAATTTTAGGACGTTCTT ATAAACAAAACGTGCACTTGCCGTAGAAAAAAAATCATGCACTAAAATCA CAAATCTTATGAATCCTATTAAGGTTGAATTTTGTAAAACGAACCTTAGG CGGGACTAATTTACCCATTTCCTGTAAATCTAAAGTGAGCAAGCGTACAC ACAACGTAATTTTTTGAATGAATCTTTCTTCTTCTTTGGCTTAAAAAACG TAATGGGGCGCCGAAATTAGTAATCGAAAGCAATTTTTTGACGCCCTTAT CCTTTAATCCCCAAAAGATAAACCATTAAGAAGCATAGGCGGTTTTAAAC CATGTCGAACTTATCAGAGGAAGAGATTTTTAATCGTAATCTAATTGTTT TTTAACGATCGTTGCACTCCTTCGCATTTTTCCAATGTACTTGCTATACA GGGTGTCCCTAATAAAAGTATCGAGTTTGAACATGCGATTGAGTAAAAAA GTTTGCGTGTGTTATCGCTAAAATATAAGAACGTTCTCCATCACACAGGC TTATTACAAAAGTTAGTTACAACGTATGAATTAATCGTAATGACAAAGAA AAAAGAGGGAAGTAGTGTAAATATGATAGTTCTACTCCAGCATGCTCAAA GTGAGTGACTCAATGTGTGAAAAACGACTCAATGTGTGAAAAACGACTCA ATGTGTGAAAAACGACTCAATGTGTGAAAAACGACTCAATGTGTGAAAAA CGACTCAATGTGTGAAAAACGACTCAATGTGTGAAAAACGACTCAATGCG TGAAAAACGACTCAATGTGTGAAAAACGACTCAATGTGTGAAAAACGACT CAATGCGTGAAAAACGACTCAATGCGTGAAAAACGACTCAATGTGTGAGA AAATAATGCTGAAAATGTGTGAAATCAAATATTCCAAACAAGACAAGTGT GAAAAACGACTCAATGTGTGAAAAATAATGCTGAAATTTTGCTCCCACAA ACCTAATTTAAGCTATGGGTAAATATTCTATCTTTTTCATTAACGAGAAA AATGAGCTTCGTTCGAGTTTGCTCTAAGATCTGGAATACTTGGTTCACTA CTAGAGGATTTCTTTACTCCCTTGGATTTATATTTTTTACGCTATCTCTC TGTTAAACAATGGCAACACCAAATCAAAAAAAGAAGTTTATCCTGTTCAG ATGCTCCAAAGAAGAAACGGTGTTTCAAGAGCAGAATTTCAAGGTGGAAG AATGACCGAACCTTAAATTTCAATGTCGAAAACTACTTTGATCAAGAAGA GGAATTCTTTATCATAACTCAAAAACTTAGTGGGCAACATACCAACTCGA TCATTTTCTCTCCTGACAAAGCTGATCTTCTCATCGCTAATGTCACTGGT TATCTTTTGGAATGGAAACGAAAGAAGTTCAAAAATGAAATGCAAAACGT GTTTTTTAAGATCATGCGAGAAAAAGTCTTGCAAGTGCGGCGAGAAATGT GTGAAGGATGTTTGGAAGACTACCCAAGTCAACTTCATCACTACTGTCTC ACAACGGAGACTAAGCAATTTGTAGAAGATGCATTTTTGAATCTCCTTAA AGTGGTCGATGAAGAGGAAGCCAACGAAATTTGCAACAAGACGCTACAGA TGAATGGTGAAATCAAATATTCCAAACAAGAACTCTTAGTTGATGAACAA TGGGTCAGAAATTTGAAACAATTAATTTTAAAATATTTAAATTGTTAAAT TATTTTATTACTCATAATATACCGTTACATAAAATTAGAAAATAAATAAA TAAAGCTATAAATGAAATAATCAAATTGTTGTCTTTACATCTGTATTGAT CTCTTATAGAAAAATGAATGTCATCAATATAATAAATCAGCGTGTGAATA TAATCCACGTGTTCGATTTTCTTTTGTTGGGTACAGTTCTTTACACCTTT TGCTTTCTTTGATTGAATTGAGACCAGTCTCTTTTTATCTTTGTAGTGAG CGTGATGGTACATTGAGTACATCTTCGCTTTTAACTTGATAATACTCTCA TTCAGCAAAGCCTTAAAAATAACTCACTTTCGTCTTACTTACATTAAGGC AGCTGAGCTTGACGAAAACCTCAAATAACTTCAATAAAATACCTTGAAGA CTTTCAAAAAGCGAACGTTCCCAAATTCATTCTTTACAATTAAAAATAAG 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TTTTGGGACTAAACTAGCTTGATCGTATTCTACATTTCCTAGTCTATTTT ATTAATTATTTTGGGATTATTACCTAGTTTTTGTTTGGGATTACCTTATC CCTATTAAAGATTACCTAATCCCTCTTTGGGATTACCTAATCTAAGGCAA TCCTTTTTGAGATCACCTAATCCATGTTTAAGATTACCTAATCTTTAATT GGGATTATACTGAATCCATGTTAATATGTTTTGGAGATCACCTAATCCCT GTTTAAGATTACCTAATCCTTCACTTAATCTCTCTTTGGGATTACCTAAT CTCTGTTTGGGTTTACCTAATTCAAGCTAATCCTTATCTCAGATCACCTA ACCCCTATTATAAGATTTCCTAACCCCTCTTTGTAATTACCTGATTCAAG TAAATCTTTTAGAGATCACCCAATCCCTTTATTACTAGATTACCTAATCC CTCTTTGGGATCAACTAATCCTCATTTGAGATTATATAATCCCTTGGTTT TTTTCTTCCAATTCACATCAATAACTGAAATCGCTGGGCGGGGAACGCCT CCGGCGTTCCTTTTTAACAAAAAGGAAAACCTTTGGTAAGTGGTGGTACA GGGAACGCCGGAGGCGTTCCCCGCCCAGCGATTTCAGTTATTGATGTGAA TTGGAAGAAAAAATCCAAGGGATTATATAATCTCAAATGAGGATTAGTTG GTCCCAAAGAGGGATTTGGTAATCTAGTAATAAAGGGATTGGGTGATCTC TAAAAGATTTACTTGAATCAGGTAATTACAAAGAGGGGTTAGGAAATCTT ATAATAGGGGTTAGGTGATCTGAGATAAGGATTAGCTTGAATTAGGTAAA CCCAAACAGAGATTAGGTAATCCCAAAGAGAGATTAAGTGAAGGATTAGG TAATCTTAAACAGGGATTAGGTGATCTCCAAAACATATTAACATGGATTC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:1388958..1404108-

>MSTRG.11034.1.p1 ID=MSTRG.11034.1.p1|Name=MSTRG.11034.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5901bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1388958..1404108- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGAAAATTGATTGGTCAAATATACAGATAGGTCAATTTGCTGTAGCAGCT
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TACCCTACGAGCTTTTCCAAATGGGCAGTCAAGGTTTGGTTGGTAGTGCA
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ATACTCCTTCTTCAGATGCGGGCATTACAGAGCCAAACCTTGGGAGGGAT
TTTGCAATTGACCGGTCAAAAGATGTCATCTCTACACCAGGATACGACGG
AATAATTGGCCAGCGAGTGACATGGGCAAAATGTGATATCGACCAAATTA
ATCGTTATTATCATTGCGAAGATTATGTGAAAATCAAGGGCCCTGGTGAA
TAAGTTTTGAAGGCAACTTTCGAATACCACCTTTGGATTATTTGGATGTG
CTTGGTGAACACTTTTGTTATGAATCAGTTATGATGTATGGAAGGTGTAG
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ATGGATGTCAAATAGAAGGAATAGCTATCCATGAGTTCCTCCATGCTTTG
GGACTTGGACACACGCAGCAACGTGGTGATCGAGATCGTTTTATGAAAAT
TGATTGGTCAAATATACAGATAGGTCAATTTGCTGTAGCAGCTGCTGCCA
GAGAGTTTGAAAATAAAACGTGTATTCGATTACGCGAGAAGAGACCAGAA
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GGATACCAGTGGAAATGACAACCAACCGTAAAAGACGTGCCGCTTTCTAT
ATCTTCAATAAATGGGACAAAAGTGCAGATGGGCTCGTTTATGTACCCTA
CGAGCTTTTCCAAATGGGCAGTCAAGGTTTGGTTGGTAGTGCAATCCTAC
TGATAACAATCTTCTGTGCACACGCTGTAGCAGCTGATAAAGATGAATAT
GAAATAAGTATCGCTGGTCGAATCGCAGAAATCAATATGAAGAATACTCC
TTCTTCAGATGCGGGCATTACAGAGCCAAACCTTGGGAGGGATTTTGCAA
TTGACCGGTCAAAAGATGTCATCTCTACACCAGGATACGACGGAATAATT
GGCCAGCGAGTGACATGGGCAAAATGTGATATCGACCAAATTAATCGTTA
TTATCATTGCGAAGATTATGTGAAAATCAAGGGCCCTGGTGAATAAGTTT
TGAAGGCAACTTTCGAATACCACCTTTGGATTATTTGGATGTGCTTGGTG
AACACTTTTGTTATGAATCAGTTATGATGTATGGAAGGTGTAGTTCATCA
ATCGGGCGAGTAGGTGGTCGACAAACTATCTCCTTAGCAAGTAATGGATG
TCAAATAGAAGGAATAGCTATCCATGAGTTCCTCCATGCTTTGGGACTTG
GACACACGCAGCAACGTGGTGATCGAGATCGTTTTATGAAAATTGATTGG
TCAAATATACAGATAGGTCAATTTGCTGTAGCAGCTGCTGCCAGAGAGTT
TGAAAATAAAACGTGTATTCGATTACGCGAGAAGAGACCAGAAGATGAAC
ATTTTATACGAGTTATTGACAGCTCCTTAGACGGACGATGAAAGGATACC
AGTGGAAATGACAACCAACCGTAAAAGACGTGCCGCTTTCTATATCTTCA
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TTCCAAATGGGCAGTCAAGGTTTGGTTGGTAGTGCAATCCTACTGATAAC
AATCTTCTGTGCACACGCTGTAGCAGCTGATAAAGATGAATATGAAATAA
GTATCGCTGGTCGAATCGCAGAAATCAATATGAAGAATACTCCTTCTTCA
GATGCGGGCATTACAGAGCCAAACCTTGGGAGGGATTTTGCAATTGACCG
GTCAAAAGATGTCATCTCTACACCAGGATACGACGGAATAATTGGCCAGC
GAGTGACATGGGCAAAATGTGATATCGACCAAATTAATCGTTATTATCAT
TGCGAAGATTATGTGAAAATCAAGGGCCCTGGTGAATAAGTTTTGAAGGC
AACTTTCGAATACCACCTTTGGATTATTTGGATGTGCTTGGTGAACACTT
TTGTTATGAATCAGTTATGATGTATGGAAGGTGTAGTTCATCAATCGGGC
GAGTAGGTGGTCGACAAACTATCTCCTTAGCAAGTAATGGATGTCAAATA
GAAGGAATAGCTATCCATGAGTTCCTCCATGCTTTGGGACTTGGACACAC
GCAGCAACGTGGTGATCGAGATCGTTTTATGAAAATTGATTGGTCAAATA
TACAGATAGGTCAATTTGCTGTAGCAGCTGCTGCCAGAGAGTTTGAAAAT
AAAACGTGTATTCGATTACGCGAGAAGAGACCAGAAGATGAACATTTTAT
ACGAGTTATTGACAGCTCCTTAGACGGACGATGAAAGGATACCAGTGGAA
ATGACAACCAACCGTAAAAGACGTGCCGCTTTCTATATCTTCAATAAATG
GGACAAAAGTGCAGATGGGCTCGTTTATGTACCCTACGAGCTTTTCCAAA
TGGGCAGTCAAGGTTTGGTTGGTAGTGCAATCCTACTGATAACAATCTTC
TGTGCACACGCTGTAGCAGCTGATAAAGATGAATATGAAATAAGTATCGC
TGGTCGAATCGCAGAAATCAATATGAAGAATACTCCTTCTTCAGATGCGG
GCATTACAGAGCCAAACCTTGGGAGGGATTTTGCAATTGACCGGTCAAAA
GATGTCATCTCTACACCAGGATACGACGGAATAATTGGCCAGCGAGTGAC
ATGGGCAAAATGTGATATCGACCAAATTAATCGTTATTATCATTGCGAAG
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GAATACCACCTTTGGATTATTTGGATGTGCTTGGTGAACACTTTTGTTAT
GAATCAGTTATGATGTATGGAAGGTGTAGTTCATCAATCGGGCGAGTAGG
TGGTCGACAAACTATCTCCTTAGCAAGTAATGGATGTCAAATAGAAGGAA
TAGCTATCCATGAGTTCCTCCATGCTTTGGGACTTGGACACACGCAGCAA
CGTGGTGATCGAGATCGTTTTATGAAAATTGATTGGTCAAATATACAGAT
AGGTCAATTTGCTGTAGCAGCTGCTGCCAGAGAGTTTGAAAATAAAACGT
GTATTCGATTACGCGAGAAGAGACCAGAAGATGAACATTTTATACGAGTT
ATTGACAGCTCCTTAGACGGACGATGAAAGGATACCAGTGGAAATGACAA
CCAACCGTAAAAGACGTGCCGCTTTCTATATCTTCAATAAATGGGACAAA
AGTGCAGATGGGCTCGTTTATGTACCCTACGAGCTTTTCCAAATGGGCAG
TCAAGGTTTGGTTGGTAGTGCAATCCTACTGATAACAATCTTCTGTGCAC
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AGAGCCAAACCTTGGGAGGGATTTTGCAATTGACCGGTCAAAAGATGTCA
TCTCTACACCAGGATACGACGGAATAATTGGCCAGCGAGTGACATGGGCA
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GAAAATCAAGGGCCCTGGTGAATAAGTTTTGAAGGCAACTTTCGAATACC
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CAAACTATCTCCTTAGCAAGTAATGGATGTCAAATAGAAGGAATAGCTAT
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ATATCGACCAAATTAATCGTTATTATCATTGCGAAGATTATGTGAAAATC
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GATTATTTGGATGTGCTTGGTGAACACTTTTGTTATGAATCAGTTATGAT
GTATGGAAGGTGTAGTTCATCAATCGGGCGAGTAGGTGGTCGACAAACTA
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TCGTTTTATGAAAATTGATTGGTCAAATATACAGATAGGTCAATTTGCTG
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GAGAAGAGACCAGAAGATGAACATTTTATACGAGTTATTGACAGCTCCTT
AGACGGACGATGAAAGGATACCAGTGGAAATGACAACCAACCGTAAAAGA
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CGTTTATGTACCCTACGAGCTTTTCCAAATGGGCAGTCAAGGTTTGGTTG
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GATAAAGATGAATATGAAATAAGTATCGCTGGTCGAATCGCAGAAATCAA
TATGAAGAATACTCCTTCTTCAGATGCGGGCATTACAGAGCCAAACCTTG
G
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11034MSTRG.11034Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11034.1.p1MSTRG.11034.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11034.1.p1.exon7MSTRG.11034.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11034.1.p1.exon6MSTRG.11034.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11034.1.p1.exon5MSTRG.11034.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11034.1.p1.exon4MSTRG.11034.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11034.1.p1.exon3MSTRG.11034.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11034.1.p1.exon2MSTRG.11034.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11034.1.p1.exon1MSTRG.11034.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:1388958..1404108 -