MSTRG.11025.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11025.1.p1
Unique NameMSTRG.11025.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:1192184..1240404-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11025.1.p1 ID=MSTRG.11025.1.p1|Name=MSTRG.11025.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=48221bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1192184..1240404- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTGATTTTTTAAAGATCTTGTAAATGGATGGTGTTTTCTTTGTCTGGAA ATTTAATCCTTATGATCATTAATAGAGAAAAGTATTAAAAGAATAAGTAA CAGAGAAAATGGCAGAAAAACAAACTGAAGATAACCTTGATCTTTCACTT GAGAGCACTGATAATGATGCTACAGAAGGTGCACCTGTTATAGCACATAA ACAAATGCAAGATGTGAGCGGCAGTGGAGCTTCAACACCGATGGAGGCTG ATGACTCTAAACCAGCAAGCCCGATAGAAGCTGATGATTCTAAACCGGCA AGCCCAATAGAAGCTGATAACTCTAAACTGGCAAGTCCAATGGATCAAAC TGAAAATGAGGCTGAAACTGAAACAAATGAAAATAAAACAGAAAGTTTTG AAGCTATCAGTGATGATGAGGAAGAACAAAATAATGAATCAAAAAGTACA GAAGATAACTCTAATGATGATAACGAAAAAACTGGTTTCAGTCCTATTAG TCCCTCTGATGAATCATTAAATAAAAGTGATGAAATAGAAACGACACAAA CTGTTGAAAAGTCTGTAGAAAATGATGATAAGGATGATTTAGATGCACCA GTGCCATCGCCCTTCTCAGATATAGGGGACGTCGAGGACATGGGAACGGG CACTGACCAAGAATTAATCAGTGATATAATGAAAGACTCAAATGAAGCTG ATTTCTCTATCGGCAATGTGTCAACAGAGAGTGTTATTGAACAGAAAAAT GAAAATGATGATCAAACTGAGGATAAACCACAAGAAAATCTTCCCTCTGA TGTGCAAGAAGAAATTGTTACTATTGATGCAGCTAAAGAGGAAACAACTC CTGCAGAAACAACATCTGATTCTATTGAAGTTACCGCTCTGGATGGACCT TCCACCTCTAATGTTGAGGAGAACAAAGGTACAACCTTAAATGTCTTTTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:1192184..1240404-

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AATGGATCAAACTGAAAATGAGGCTGAAACTGAAACAAATGAAAATAAAA
CAGAAAGTTTTGAAGCTATCAGTGATGATGAGGAAGAACAAAATAATGAA
TCAAAAAGTACAGAAGATAACTCTAATGATGATAACGAAAAAACTGGTTT
CAGTCCTATTAGTCCCTCTGATGAATCATTAAATAAAAGTGATGAAATAG
AAACGACACAAACTGTTGAAAAGTCTGTAGAAAATGATGATAAGGATGAT
TTAGATGCACCAGTGCCATCGCCCTTCTCAGATATAGGGGACGTCGAGGA
CATGGGAACGGGCACTGACCAAGAATTAATCAGTGATATAATGAAAGACT
CAAATGAAGCTGATTTCTCTATCGGCAATGTGTCAACAGAGAGTGTTATT
GAACAGAAAAATGAAAATGATGATCAAACTGAGGATAAACCACAAGAAAA
TCTTCCCTCTGATGTGCAAGAAGAAATTGTTACTATTGATGCAGCTAAAG
AGGAAACAACTCCTGCAGAAACAACATCTGATTCTATTGAAGTTACCGCT
CTGGATGGACCTTCCACCTCTAATGTTGAGGAGAACAAAGTTGAACAGCC
ATGTAAGGCTAACATCTACAGCTGAGGTTTTGCTGAAGAAGAAATTGGAG
AAGAAGAGTCTTCAGCTGCTAACGAAAAGAGGACGAAGACGATGATGAAG
ACAATTTGATTGCCAACATCTTTGGTGATTCTGATGATGAAGAGGAAGAA
TTTGAGATGAGGAGAAGGCAGAAGCTAAAGCAGGAGAGGATGATGGTGAA
GAAAAATGGCAGAAAAACAAACTGAAGATAACCTTGATCTTTCACTTGAG
AGCACTGATAATGATGCTACAGAAGGTGCACCTGTTATAGCACATAAACA
AATGCAAGATGTGAGCGGCAGTGGAGCTTCAACACCGATGGAGGCTGATG
ACTCTAAACCAGCAAGCCCGATAGAAGCTGATGATTCTAAACCGGCAAGC
CCAATAGAAGCTGATAACTCTAAACTGGCAAGTCCAATGGATCAAACTGA
AAATGAGGCTGAAACTGAAACAAATGAAAATAAAACAGAAAGTTTTGAAG
CTATCAGTGATGATGAGGAAGAACAAAATAATGAATCAAAAAGTACAGAA
GATAACTCTAATGATGATAACGAAAAAACTGGTTTCAGTCCTATTAGTCC
CTCTGATGAATCATTAAATAAAAGTGATGAAATAGAAACGACACAAACTG
TTGAAAAGTCTGTAGAAAATGATGATAAGGATGATTTAGATGCACCAGTG
CCATCGCCCTTCTCAGATATAGGGGACGTCGAGGACATGGGAACGGGCAC
TGACCAAGAATTAATCAGTGATATAATGAAAGACTCAAATGAAGCTGATT
TCTCTATCGGCAATGTGTCAACAGAGAGTGTTATTGAACAGAAAAATGAA
AATGATGATCAAACTGAGGATAAACCACAAGAAAATCTTCCCTCTGATGT
GCAAGAAGAAATTGTTACTATTGATGCAGCTAAAGAGGAAACAACTCCTG
CAGAAACAACATCTGATTCTATTGAAGTTACCGCTCTGGATGGACCTTCC
ACCTCTAATGTTGAGGAGAACAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11025MSTRG.11025Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11025.1.p1MSTRG.11025.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11025.1.p1.exon5MSTRG.11025.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11025.1.p1.exon4MSTRG.11025.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11025.1.p1.exon3MSTRG.11025.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11025.1.p1.exon2MSTRG.11025.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11025.1.p1.exon1MSTRG.11025.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:1192184..1240404 -