MSTRG.11003.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11003.2.p1
Unique NameMSTRG.11003.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:858578..875276-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11003.2.p1 ID=MSTRG.11003.2.p1|Name=MSTRG.11003.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16699bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:858578..875276- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCCTCTGAAATTATGCTTTATCATACAATTCTTCTTCATCCTGACATTGA GTTCTCTATGTGATCTTATTTCTTATAAACGACGTGTTGTATCGGTATGT TATTGTTGCGTTGTTACATTTGTTAGAAATTACTTAAACATGAAAGATAA TTACTTTTTTCAATAATGTTGTTATAGAGAGTGTTTTTTGTAAATGCAAT ACCCCCTGTTTTTCTGTTCTGTTTTGTTCAAATCTCAATTTTTTTCAAAA GCACACAATCTACTGAACATTATGTTAAATATTGCAAATTTCAAATTATA TTTCCTAGTAAAAGTATATATTTTTGAAATCGCCAAGCTTTAAGCTTTCC AAAGATGTAAAAATTACGTTTATACAACCTATCCATAAAAAGTTGAATTT TTTCTTCTTCATTTTTCTTCATGTTCTTTTCAAATTTCACGGAAAAAGCT AACAGTAAATTAATAAGCTCCTTCCTACCTTTCCAACGATACCAAACTTT TTAAGATTGAAGCATTGGTTGAGAAATAACAAGCAAGTCAAAATTTAGTG CACACTTATCGTGAATAGACTTTAGTATTAAAGTCATAATAAAAAAGTAT ATAAACCTGGATTTATTAGTTTAAGATTATCCTAACTAGACCAGACACAG GAACAAGGGGATTGATTAATAAGTTGGTATTAGGATAGAATTGATTTAGC AAAACTTGAGACACAACCTACAGAACTTTGATTTTAACAACTGCACCAAG GCAAAGAGAAATAAATAAATAATCTAGAAGAGTTAGAATAATTGATGATT CTAGTAATATATAAAATCATTTTGTAAGACTCTACCAGTGGCTAAGGTGC CAAAGGTGATTTTATCAAGTTCTTTTTCAGTCAAACCTTTTTTAAATTGG TTGTAAGTCTTTTGCCTTAGTTCAACTGGTAAAACATTCCAAACGTTAGT 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TCTTGCATGATAGGATTCTGCCATTCTGCCAGCAAAAAGTAAATGACACT TGTAAACAATTTTCCATCGAAAGCAACCAAAAACATTACTACTTCCCAAA CCGGAAGGCCAAAACAAACCATTGTCCACAAAAGGTGGACATCCTAAAAA GGTGGACTGAGTTACAAAAAGAAAAAGGTGCCCACTGCTTTGAGGGTGGT AACGCCCAAAATGATCATCAGACAGAAGGCGAGTTGCTGCACAAGTTACA TCATTCACTCCACCACAGTGTGCGCAACAAATTATGTTTCAGTGAATCAA TAATTATTGTCATGACTTTTTTTTATTGCGGCTGCGTATAGAAACTTGCA GAATGTTCCTAATTCTATTTATTAAGGAAAGGAGCTTAATTTTGTTGTGA ACTGAATTTTCCAGCTGAATGTTGGCAAAATCGGCAGATTCGTGCAAAAT ACTATTTATTTGACTTATTGAATTTTTTGTTTCATTCTAGGTTGACAATT ATGTCAGTCGCCTCAAACAAAAAACTGGTTTGCGTGGATTGTGGAGTGGT AATAAATTTACTACCATGGTTGATGATGATAAAACGCCTGACATATCGCT CAGTTCAAGTGAAAATTTGAGTGACATGGACTTCACCCGTCTCAAACTTG ACAGTGATGAGGATGAAATGCGAATCGATTACATGAGAGATTCCAAACAA CGTGATATTAACAATAACATTGTTGTCAGTGATGATGAACAAAACAATTT AATGCAAAATATTCAATTTGCAGAACTCCAATTGGGAGATGTTGAATTGA GTAGTAATAATTATTCGCAAAAACTTGATGATGATTTCATGCCTAATGTT TATACAATGAATTTCAGTGATGACAATGAAGTTAATCAAAACAATAGTTC TGATTCTGTTAGTAGTTACAACCCACAAGGCAACATCAAATTCATGAGCA GTATTGAAACAGAAGCATCAGATGTAAACAATGTTCAAACTGACGATGAA ATTAAAACAGAATCTATATCAAGTGTTGCGGAAAGTGAAGTAGCTGAAAT TTTAACTGAAAAATCAAATTCTGAAAGTATTATCAAGAGTGATAGATATG TGAGTGATTTCTCATCTGGCAGAAGTAGTAAATTGAGCCGTAAGAAATCA ACTGAAATGACAATGACTTCACCAGAGCATAGAAATACTTCAAGGCGAAA AATAAAACGTAGATCTAAATCTTCTCAACAAAAATCATCAACATCAGCCT CCAGCAGAAAGACAACTTCCACTGAATCAGATACTGGGACACTGTCATCG ACTTCAAGCATATCCTCAGATTCTGAACACTCCAAATCATCCAATGTTTA CACTGCCAAATCATCCCCCTCGCGTACTCGAAGAAAGCCAAAATCTTCCA AACACAAAACTAAAAAACAAACTCATACCTCAGTCCAAACAGACTTTAAA CCGAATACAGCAGACATTTTGAATTTCAAATATCCATGGCAACAAGACAG ACCAAACAACATTGCAGCTCAAGTAGTGACCGGAGAAACACTTCATGTTT TGACTAATTATGACCCAGCAGTTTTAGCAGCCCATGATATGATGAAATTT CACTTCAACCTTTTAAACCAACACATTGATAACAGTCGTCGACTATATGA AGCTTATTCAAAAGAAACTTCAAGTGGGAGATCTAAATATACTACTGTAG AAGATACGATGAATTTCATTGAGAAAAATCGACCTAAAGTTCAAACTTAC GAAGAGGCTCTTGAAGACATAAAACGCAACAACAAAGATAATTGATTGAT TTAAAAAAGGCTTTTAAATTTATCTTAATATATAAGGTCCTGTGAAAATT GGAAAAATGAAATTAGGTCATGGTACATAAGCTTAGATTTTTGTGGTTAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:858578..875276-

>MSTRG.11003.2.p1 ID=MSTRG.11003.2.p1|Name=MSTRG.11003.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1230bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:858578..875276- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTGATGATGATAAAACGCCTGACATATCGCTCAGTTCAAGTGAAAA
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AACATTGTTGTCAGTGATGATGAACAAAACAATTTAATGCAAAATATTCA
ATTTGCAGAACTCCAATTGGGAGATGTTGAATTGAGTAGTAATAATTATT
CGCAAAAACTTGATGATGATTTCATGCCTAATGTTTATACAATGAATTTC
AGTGATGACAATGAAGTTAATCAAAACAATAGTTCTGATTCTGTTAGTAG
TTACAACCCACAAGGCAACATCAAATTCATGAGCAGTATTGAAACAGAAG
CATCAGATGTAAACAATGTTCAAACTGACGATGAAATTAAAACAGAATCT
ATATCAAGTGTTGCGGAAAGTGAAGTAGCTGAAATTTTAACTGAAAAATC
AAATTCTGAAAGTATTATCAAGAGTGATAGATATGTGAGTGATTTCTCAT
CTGGCAGAAGTAGTAAATTGAGCCGTAAGAAATCAACTGAAATGACAATG
ACTTCACCAGAGCATAGAAATACTTCAAGGCGAAAAATAAAACGTAGATC
TAAATCTTCTCAACAAAAATCATCAACATCAGCCTCCAGCAGAAAGACAA
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TCAGATTCTGAACACTCCAAATCATCCAATGTTTACACTGCCAAATCATC
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ATTTTGAATTTCAAATATCCATGGCAACAAGACAGACCAAACAACATTGC
AGCTCAAGTAGTGACCGGAGAAACACTTCATGTTTTGACTAATTATGACC
CAGCAGTTTTAGCAGCCCATGATATGATGAAATTTCACTTCAACCTTTTA
AACCAACACATTGATAACAGTCGTCGACTATATGAAGCTTATTCAAAAGA
AACTTCAAGTGGGAGATCTAAATATACTACTGTAGAAGATACGATGAATT
TCATTGAGAAAAATCGACCTAAAGTTCAAACTTACGAAGAGGCTCTTGAA
GACATAAAACGCAACAACAAAGATAATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11003MSTRG.11003Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11003.2.p1MSTRG.11003.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11003.2.p1.exon2MSTRG.11003.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11003.2.p1.exon1MSTRG.11003.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:858578..875276 -