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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000078_pilon:594441..601647- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10985.5.p1 ID=MSTRG.10985.5.p1|Name=MSTRG.10985.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7207bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:594441..601647- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTGTTTCAAGGTTAAAAAGTCATTGAATTTCGAGCGGGATGAAATCAAAG
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ACAGTTGTCTTTTATCAGTCACTTCCTCCCATAGAAAATGATGGATGCAT
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GTCGGCTATTATTTATCCGACATGAGCCTTTTGTTGGTAAGTATAAAAAG
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GATCTCAAGATTTCGCTTCTAATTCTATTATGTCAAGTTATCAGATGTAC
CATGAAGCAATTCACAAGTAAGCTAGCTAAAACTTTATATCAAATCAAAT
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CAGATCGCTTGAACAGATAAAGGAAGCTGAGCGCCGTGAAACATTGTTAG
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TCTTATCAAGTGCCGGATCTAAAGAGAGGTTCAAAATTTATAGCGGTGAG
TGCTTTTGTAAGGGCTATAATCCTTATCCCTAATAAGGAAAAAGTCTTTG
TGATAGACTTTGAACCCCCTCAAATCTGCCACTGTCATCAGTAGAACTAA
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AACTGTTTTCACTTTCCGTCGGCTGTAAATCTTACTGAAGAAACCTGTCA
ATCAGATTGAAATGGCTTATTGGTCCAAGTTGCGTTATTTCAGAAATGTC
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TTTTTATTGATTATTTGACATATTTCCTACTAGGAGCCGACCGTACGGTA
CGATTATGGAAGGGTCTGTTGGCTATCAACAAGATTCTTATTCTGCGTCA
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AACAAGTCAAGAACATTTTAAGCTTTCGTGGGCTCTAGAACACCCAATTT
TTTTGGAAAATGGTCAAAAATACTAAAAAAATAGCGAAAATAAGAACATG
TTTAGAACATTTTTAGGCCTGAAAGTAAAAAGTTTAAGAACATCCGAAGG
TTTCAAAAACTTTTGATGTTCTTATGAAAAAAAAACGTGTACCATTAGTT
TGGCTGACGTTTTAGTAGCTTAACTCAAGCTAATCTACACTAAATGAAGA
TTTTTATTTGGATAGAAATCTTTTTTCAACTATCTTTTTAGGTATTTACT
TGAATTTGTTTCATTGATATGATTCTCAAGTTTCGGCTAGATGAATTGTG
AATTTTATGGCTGACTTTTTTCATTTTTCTGTATTTGAAGGACATAAACT
ACGGCAATACATCTTTTCGAAGTTGATGATCTTTGGCACATACACAGCTA
GTGTGATGATGTTCAAGATTGTTTATTTCATCGGAAATTTGGACAAATAT
CTTAACAAATTGACCGATACTGAGACAGGTAACCTTTGTTTCACTAATTT
ATAGGATACATGTTTTTCCTTTTATAAACTCAATCGGCTTGTTCCTAATT
TTGTCAGCTTGTTAAAGTATATACACTTTGATTTAATTATTTCCATCTTT
TAGAATGCTAATCTACTACTGTAATATCGCTTAAAAAAACAATTTCTTCG
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AGACGTATGACTACAAAAATATTACCTTCGCTTGAGCCCCTTAGCAATAA
ATAAAATTACTAGAGTTTGTAAGCTTCGTCGCGAACCAACATTATCCAAT
AAGACTCGTAACTCACAACCATAGGGCATAGCATTGGCGGACAATAGCTT
TTACCCCCCGGACAAGCATCTGCTGACCCCCCGGACACCCCAAATTACCC
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ATGTGTTTTCCCACTCTCTCATAGCAACTTTGTATATCAAATATTTTGGA
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TCGTGAGAATGTGGGAACCGAAAGATTATCTGCTCATCAAGATTTCGTTA
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GTGCTTATCGATGTCTTACAACTCGTTCAAAACATTTATCTATCGGTAAG
CTGTTACAACTTTTTTATAAAAACTATTTGGGGGGAGGGGTACTACCTTG
CCGACCGACGGTGTGTCCGCTGAAGTTAAAAAAATGGACCCTACATTGGA
CTCGTTTTTTTTTACATTTTGCCAAAGTTTTCGAAAAAGTGCCCTTGAAT
GGGATTAAAATTTCGACCATACTTGGGACTCATTGAGGTGAAAAAGGTAT
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ACTTCAATTTTCCTGTTATCGATAACTATTCCTAGATTCTTCAAGTGAAA
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CAGTTTGGTGTGGTGTTTCACTTCATTGTACTTCGCATATCTGTAAGTAG
TTCCCCTTTGAATTACAGTGGAGTTTTCATAACTCAAACTTTTATAACTC
GAAAGACTCCTTAACTCGAACAATGCCTTATAAACTAAGCTCCGTAACTC
GAACTTCCTTAACTTGACAAAAATTGTATTCCTTGTGCGTATTCGAGTTA
CGAAAACTTCACTAGGTTTCAATCCTGTTAGAAGTTGCCTCGGAAGTAAA
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AAAAAGGTACATTGATTGACGGTTATTATATTGTAACGCTTTTTTCTTCG
TATTTCAGGTTTCCGGCCAAGTACTACTGCACCTTGTATGGCATCGCAAC
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AAACTCGAACCCAGTCCCTTAGTTTTCTTTTCATGACTCCAAAAGTTTCA
TATCAAGTCCATCAATAAAATCAAAAAAAAGTTTTACCCTAATAATCGTC
TACTATATTGAAATATTAACAAAGGGCAATTCTTTTTGAGGAAAATCTCA
ACCCTTAGTTTAGAATATAAATGCTAAGGTGAATGTATGTAACTTTGGTA
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AACTCGATCCTCAACTCTAATTTATTCGAATTCAAGAGAGATTCGAATTA
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GAAAGATTTCGAATATAGAAGTTCGAATTGGCGAGAGTCTATTGTAGTTT
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GGGATTACTTATATCAACACTGGTGCTTCCATTCTACTTGGTGTATTTCT
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GTCTGATATGAATTTCAAGATGTATTTGTTAAGTTGTTAAAACTTGTGAA
ATTATTTTTTGGCTTAAACTAGTTCCTGGTTATTTGATCAAAAAGTTTTG
TGTATATGAAATGTGAGTATATTGAACTGTACTCATGATAGTTTAAAAAG
ATTTTGGCGGATATTTTTATTCGCGAGTTTTAAGATTTTAACATTCAAAA
GCTGATTTGACTTATTCCTGAGTTAATTATTTGTGACCTAATTACCTTTT
ACAGGAGAAGTATGAAATCGATTGTTTCCCCGATTTTAATGTTTTCATTT
ATTTTCGAAACCTACGAAATTACAAATCATAACTAGGATCAGATTCAGAA
AATAAAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:594441..601647- >MSTRG.10985.5.p1 ID=MSTRG.10985.5.p1|Name=MSTRG.10985.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=9456bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:594441..601647- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ACGAATCTTCTCATGTTGGGATTACTTATATCAACACTGGTGCTTCCATT CTACTTGGTGTATTTCTACAAAAAATTGAAAATGGCGGAAATTGAAACTC AAGAAAAACCTTGAGTTTCCGGCCAAGTACTACTGCACCTTGTATGGCAT CGCAACGGGAGTATCTGGAGCTGTCTCTTTCCTTCAATATCCGCTTCTTT CTCTTGAAAATTCTCTTTTCCACGGAGAACAATTCTATGTTCCAATTTTC ATTCTGTTTTTGTTTGGGAACAGTTTGGTGTGGTGTTTCACTTCATTGTA CTTCGCATATCTCAACTTTGTATATCAAATATTTTGGATATGTTCAGTTC GGTGGAATTATCGCTGCACCGATCTGCAGTATGTTATTTCGTGAGAATGT GGGAACCGAAAGATTATCTGCTCATCAAGATTTCGTTAAAAAAGTCAAAA TTTTAATCCTTCCTGGTTTTCTTCTCATCTTGTTCATCGTGCTTATCGAT GTCTTACAACTCGTTCAAAACATTTATCTATCGGACATAAACTACGGCAA TACATCTTTTCGAAGTTGATGATCTTTGGCACATACACAGCTAGTGTGAT GATGTTCAAGATTGTTTATTTCATCGGAAATTTGGACAAATATCTTAACA AATTGACCGATACTGAGACAGGAGCCGACCGTACGGTACGATTATGGAAG GGTCTGTTGGCTATCAACAAGATTCTTATTCTGCGTCATCACACCTTGTA TTCAACATAAAAAACAATAAGGAGGACGAAAAGACGCTCCTGTTACCAAT TCAACCTACCAGGGAAGAGCACCTGACCCCCTACTCAGATCGCTTGAACA GATAAAGGAAGCTGAGCGCCGTGAAACATTGTTAGCCAGTCTATCTGAAA ATCTGGCTATACAGTTTTCCAATAGAAGTTACGATGCAAACGATCACAAG ATACAGTATTTACCATGATTGCAACAACATTTCTTTATCCAACAAAGGAA GTTCTACAAGCGTTCATTGATGTTGAGACTGTTAACAACATTCGTCCCCA GCTCTCTGATGATGAAGATACAGATGATGAAAACCTTGTTGATACAGCAT CTTCTCATGTCATGCGATCTCAAGATTTCGCTTCTAATTCTATTATGTCA AGTTATCAGATGTACCATGAAGCAATTCACAAACGAATCTTCTCATGTTG GGATTACTTATATCAACACTGGTGCTTCCATTCTACTTGGTGTATTTCTA CAAAAAATTGAAAATGGCGGAAATTGAAACTCAAGAAAAACCTTGAGTTT CCGGCCAAGTACTACTGCACCTTGTATGGCATCGCAACGGGAGTATCTGG AGCTGTCTCTTTCCTTCAATATCCGCTTCTTTCTCTTGAAAATTCTCTTT TCCACGGAGAACAATTCTATGTTCCAATTTTCATTCTGTTTTTGTTTGGG AACAGTTTGGTGTGGTGTTTCACTTCATTGTACTTCGCATATCTCAACTT TGTATATCAAATATTTTGGATATGTTCAGTTCGGTGGAATTATCGCTGCA CCGATCTGCAGTATGTTATTTCGTGAGAATGTGGGAACCGAAAGATTATC TGCTCATCAAGATTTCGTTAAAAAAGTCAAAATTTTAATCCTTCCTGGTT TTCTTCTCATCTTGTTCATCGTGCTTATCGATGTCTTACAACTCGTTCAA AACATTTATCTATCGGACATAAACTACGGCAATACATCTTTTCGAAGTTG ATGATCTTTGGCACATACACAGCTAGTGTGATGATGTTCAAGATTGTTTA TTTCATCGGAAATTTGGACAAATATCTTAACAAATTGACCGATACTGAGA CAGGAGCCGACCGTACGGTACGATTATGGAAGGGTCTGTTGGCTATCAAC AAGATTCTTATTCTGCGTCATCACACCTTGTATTCAACATAAAAAACAAT AAGGAGGACGAAAAGACGCTCCTGTTACCAATTCAACCTACCAGGGAAGA GCACCTGACCCCCTACTCAGATCGCTTGAACAGATAAAGGAAGCTGAGCG CCGTGAAACATTGTTAGCCAGTCTATCTGAAAATCTGGCTATACAGTTTT CCAATAGAAGTTACGATGCAAACGATCACAAGATACAGTATTTACCATGA TTGCAACAACATTTCTTTATCCAACAAAGGAAGTTCTACAAGCGTTCATT GATGTTGAGACTGTTAACAACATTCGTCCCCAGCTCTCTGATGATGAAGA TACAGATGATGAAAACCTTGTTGATACAGCATCTTCTCATGTCATGCGAT CTCAAGATTTCGCTTCTAATTCTATTATGTCAAGTTATCAGATGTACCAT GAAGCAATTCACAAACGAATCTTCTCATGTTGGGATTACTTATATCAACA CTGGTGCTTCCATTCTACTTGGTGTATTTCTACAAAAAATTGAAAATGGC GGAAATTGAAACTCAAGAAAAACCTTGAGTTTCCGGCCAAGTACTACTGC ACCTTGTATGGCATCGCAACGGGAGTATCTGGAGCTGTCTCTTTCCTTCA ATATCCGCTTCTTTCTCTTGAAAATTCTCTTTTCCACGGAGAACAATTCT ATGTTCCAATTTTCATTCTGTTTTTGTTTGGGAACAGTTTGGTGTGGTGT TTCACTTCATTGTACTTCGCATATCTCAACTTTGTATATCAAATATTTTG GATATGTTCAGTTCGGTGGAATTATCGCTGCACCGATCTGCAGTATGTTA TTTCGTGAGAATGTGGGAACCGAAAGATTATCTGCTCATCAAGATTTCGT TAAAAAAGTCAAAATTTTAATCCTTCCTGGTTTTCTTCTCATCTTGTTCA TCGTGCTTATCGATGTCTTACAACTCGTTCAAAACATTTATCTATCGGAC ATAAACTACGGCAATACATCTTTTCGAAGTTGATGATCTTTGGCACATAC ACAGCTAGTGTGATGATGTTCAAGATTGTTTATTTCATCGGAAATTTGGA CAAATATCTTAACAAATTGACCGATACTGAGACAGGAGCCGACCGTACGG TACGATTATGGAAGGGTCTGTTGGCTATCAACAAGATTCTTATTCTGCGT CATCACACCTTGTATTCAACATAAAAAACAATAAGGAGGACGAAAAGACG CTCCTGTTACCAATTCAACCTACCAGGGAAGAGCACCTGACCCCCTACTC AGATCGCTTGAACAGATAAAGGAAGCTGAGCGCCGTGAAACATTGTTAGC CAGTCTATCTGAAAATCTGGCTATACAGTTTTCCAATAGAAGTTACGATG CAAACGATCACAAGATACAGTATTTACCATGATTGCAACAACATTTCTTT ATCCAACAAAGGAAGTTCTACAAGCGTTCATTGATGTTGAGACTGTTAAC AACATTCGTCCCCAGCTCTCTGATGATGAAGATACAGATGATGAAAACCT TGTTGATACAGCATCTTCTCATGTCATGCGATCTCAAGATTTCGCTTCTA ATTCTATTATGTCAAGTTATCAGATGTACCATGAAGCAATTCACAAACGA ATCTTCTCATGTTGGGATTACTTATATCAACACTGGTGCTTCCATTCTAC TTGGTGTATTTCTACAAAAAATTGAAAATGGCGGAAATTGAAACTCAAGA AAAACCTTGAGTTTCCGGCCAAGTACTACTGCACCTTGTATGGCATCGCA ACGGGAGTATCTGGAGCTGTCTCTTTCCTTCAATATCCGCTTCTTTCTCT TGAAAATTCTCTTTTCCACGGAGAACAATTCTATGTTCCAATTTTCATTC TGTTTTTGTTTGGGAACAGTTTGGTGTGGTGTTTCACTTCATTGTACTTC GCATATCTCAACTTTGTATATCAAATATTTTGGATATGTTCAGTTCGGTG GAATTATCGCTGCACCGATCTGCAGTATGTTATTTCGTGAGAATGTGGGA ACCGAAAGATTATCTGCTCATCAAGATTTCGTTAAAAAAGTCAAAATTTT AATCCTTCCTGGTTTTCTTCTCATCTTGTTCATCGTGCTTATCGATGTCT TACAACTCGTTCAAAACATTTATCTATCGGACATAAACTACGGCAATACA TCTTTTCGAAGTTGATGATCTTTGGCACATACACAGCTAGTGTGATGATG TTCAAGATTGTTTATTTCATCGGAAATTTGGACAAATATCTTAACAAATT GACCGATACTGAGACAGGAGCCGACCGTACGGTACGATTATGGAAGGGTC TGTTGGCTATCAACAAGATTCTTATTCTGCGTCATCACACCTTGTATTCA ACATAAAAAACAATAAGGAGGACGAAAAGACGCTCCTGTTACCAATTCAA CCTACCAGGGAAGAGCACCTGACCCCCTACTCAGATCGCTTGAACAGATA AAGGAAGCTGAGCGCCGTGAAACATTGTTAGCCAGTCTATCTGAAAATCT 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000078_pilon | genome | sc0000078_pilon:594441..601647 - |
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