MSTRG.10975.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10975.1.p2
Unique NameMSTRG.10975.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:468218..487215-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10975.1.p2 ID=MSTRG.10975.1.p2|Name=MSTRG.10975.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18998bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:468218..487215- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTTTTTCTTACTTCACTCGTAGAGAAGCTTCGGCGCAATCGAAAAGAAC ACAGAAGTGTAATTCGCAGAATGCAAAGCAGTCCTACTACATCTGAACAA ACACCAGATACTCTTACCGTTCCGCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACA ACCGAAAGAAACGAAAATTGAGATCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAG AAATGAAACCGAAAATGGGAAAACAAATGTTAACTGTCCCTTCAGATAAA AAACATGCTATCTTGAGTAGAACACCAAATCGTCGATTAACCTCTAGCGA AAGTTTCAATTCGTTCCATTCATCTAGGAATACTAACCTTAGGGCGGCCG TAAAGGCGAAGAGGAGGATTACCTACCCTCAGGTTATTTGTGAATCGATC GCTTTGAAAGAATTGAGTAAATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGT GGAAAGTTACGACAACGTAATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATT GTTGTAAAAGTGAAATTAACCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGAT CAAGACCATGTTATGGCGCAGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTT TGAAAATTATACTTTAGAACATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTC CTTTCGTTGTACCAAACTCTACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCA CTAATTGATAATGGAACCATGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAAT TAAGCCAATTAAACCAAATGAAGCTCGAGATATGGAATTTGGTTTTTTTT GTAAAGGGAGAAGAAAACTAGACGAACGTCATTTCACTGATGTCGACGGT TTATTGGATTGGCCATATGTTGAATCTGGTGATGCTAAGATGACTTTACA ACGTATGCGATCTAATACTTTATGATACACGTTTTTTATAAGAACATCAC AAAATTTTTGAAGTCTTTGGTTATTCTTGATTTTTTGATTTAATAATATT CTTATTTTCACCATTTTGTAGTGAGTATTTTCCAAAGAAATCCAAAGAAA TCGGATGTTTCAGAGTCAGCAAAATCTTTACTCGTTCTTAACTTGTTCTT AATATTTTGGCCATCAAAGCCATATGTTCTTATATTGTTTGTTCTTATAA AAAAACGTGTAAGTTGTGATAATCCACCCATTTGGTGTCATATACTCTTA AAGGAGATTACCAGACAGATTTGTGAACAATTGAATGAAAGAAATGTGGA AATAGAGGGATGGAGGTGAGTAAGAGGTCAATTCTTACTTATCCAAAATC TTATATTAATTTTTTGGTATATCTTGAAAGGAGGCAGTTGCCTCTTTTTT GTGACTGAGAATTCAAGTCAACACTTGCTATGTTTGTTTGATAGGGGATA GTGATACAGTGATAACATTGGTAAAAGAATGACACTGTCATATCAAATTT GATATACGATTCAAGTCAATTTTGATAGAGAATTGGACAAAGGTTTGAAA GAATTACAATCAAATTATCCAATTGTCTAACCCCTTGCGATTTTTAATAT GATATTAGAGTAATATAACTAGATGAAAGTTTAAGCTATGTATGCTTTAC TTTTAATTTGATATGGATTTTTAGACTAGTTTTGACTGTAGGCTACTGGC ATCCACTAACGGATTCGTACTCCTTCTACTATACTATCTGTGGTTTCGTA GGGGTCTGTGATTCAGACAAGACTTGCTCCTTTTTCTTTTTTCAGAGATT GTTTGTTGAAACACATTTTTTTCTTCAAATCAACGGAATACTCAAGCATT GACCCATCTCAGTTCATGCAGTGTTTGAAGTATTGAAGTTTACAGAAACT GTTTACAAGTCACTATTTTCCGTTTTCCTTGCATTTCTATCAAGTCTTTT ACTCACTTAAGCGGTATCTTAATTTCCATTCCCAATATTTTCTTAATTTA AGACTTATAGATCGATCAAAGATGACTGACCAGAGCAAAGAGGGAGCTGA AAACTACAGATTGACAAGTTCTAAAATACAACAACACTATTTTGACATGC TTATCAATACTATTGATATCCAGCCTGGATGGAAAGTTTTAGATCTAGGT TGTGGAACTGGCAATGGAACAAAGAAGCTATGTGAACGAGTTGGTGCTTC TGGACATGTCATTGGCATAGATCCTATTGCAGAGAGAATCGTTCAGGCGA AAGAGTACTATGCAGCAGGTAATATTAAATATCACACAGCATACGGTCGA GATGCGTGCACTTTCGGTGAAGGCATTTTCGATCTTGTAGTCGCAGGTAC AGTCATGCATTGGCTGTCCCCTGAAGAGAAACAAAAAACATTGGAAAGTG TGTACAAAGCCTTAAAACCTGGTGGAATCTTTCTCTTCAATAACATGTTG AAATATGACAGTGCAAACACCTTGAAATTTCTCGATTTCTTTAAAGATCA AAGCGTCAAAGAAAAGCTCTTCGCTGCTGTTTTCTGCCCAGATAAAAGAA CTTTTTATGATCTGGCACAGAAAACAGGATTCAGCAGAACGACAATTGAT GAAGTTTCAGTCCAAGTTCCATTTGATTCACTTGAACATGCAATTCATTG GTTTTCAGCTTCTCTACATGCTATTGGATTTCATACAGCTCTGGACGAAT TACGTCAAGTTACCAGCGACGAAAATAATAATTTGGATTTTCTTTTCAAT GAAAAAGGAGAACCTTATTTTGATAATAAATATCATTTTGTAACTAGTCA CAAGTAATTTTTCGGCGATAAATAGTGAATCTATTATATGATTGATTTTA AATCATTTTCGTAATAGCAGAAAAGATATCTTTCAAATAATTAAGTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:468218..487215-

>MSTRG.10975.1.p2 ID=MSTRG.10975.1.p2|Name=MSTRG.10975.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=786bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:468218..487215- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTGACCAGAGCAAAGAGGGAGCTGAAAACTACAGATTGACAAGTTC
TAAAATACAACAACACTATTTTGACATGCTTATCAATACTATTGATATCC
AGCCTGGATGGAAAGTTTTAGATCTAGGTTGTGGAACTGGCAATGGAACA
AAGAAGCTATGTGAACGAGTTGGTGCTTCTGGACATGTCATTGGCATAGA
TCCTATTGCAGAGAGAATCGTTCAGGCGAAAGAGTACTATGCAGCAGGTA
ATATTAAATATCACACAGCATACGGTCGAGATGCGTGCACTTTCGGTGAA
GGCATTTTCGATCTTGTAGTCGCAGGTACAGTCATGCATTGGCTGTCCCC
TGAAGAGAAACAAAAAACATTGGAAAGTGTGTACAAAGCCTTAAAACCTG
GTGGAATCTTTCTCTTCAATAACATGTTGAAATATGACAGTGCAAACACC
TTGAAATTTCTCGATTTCTTTAAAGATCAAAGCGTCAAAGAAAAGCTCTT
CGCTGCTGTTTTCTGCCCAGATAAAAGAACTTTTTATGATCTGGCACAGA
AAACAGGATTCAGCAGAACGACAATTGATGAAGTTTCAGTCCAAGTTCCA
TTTGATTCACTTGAACATGCAATTCATTGGTTTTCAGCTTCTCTACATGC
TATTGGATTTCATACAGCTCTGGACGAATTACGTCAAGTTACCAGCGACG
AAAATAATAATTTGGATTTTCTTTTCAATGAAAAAGGAGAACCTTATTTT
GATAATAAATATCATTTTGTAACTAGTCACAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10975MSTRG.10975Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10975.1.p2.exon6MSTRG.10975.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p2.exon5MSTRG.10975.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p2.exon4MSTRG.10975.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p2.exon3MSTRG.10975.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p2.exon2MSTRG.10975.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p2.exon1MSTRG.10975.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10975.1.p2MSTRG.10975.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:468218..487215 -