MSTRG.10974.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10974.1.p1
Unique NameMSTRG.10974.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:364788..391776-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10974.1.p1 ID=MSTRG.10974.1.p1|Name=MSTRG.10974.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=26989bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:364788..391776- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCCTTGCCCCCCCAGTTGCTACGGCACTGCAACAGAGATATCGATTACTA ACTTGTATATACAAGATGACAACAGCACACAACTGGTGATTGACTTTACA TATTAAGTAAGTACTTTTTATATCATATTGGAAATTTATTGTGGCTTCAT AACCAAAAGATTTACGTTTAAGCTTCTGGTATTTGTTCTTGAATTTCAAT TAGAAACGTTCAAGTATGAAATCTACGCGATAAAAATTCAAAACAAGTTT TCTAGGAGAAGAACGCAGGTTTTCTTCCCGGGTGTGAAGGTTAGTAGTTG TGACCCTTTATTCCATTTAGGAGATTGAGACCAGGGTGCTGAAACTCACT GAAAAATGTCTTACTTTCATGCGTTATTACCCTTACTTTACTCACTTTAT CGTATAACTCTGATTCAAGAGTATCCATGTCACACACGCCGTCTATGTGT AACAGAGCTGCTCAACATCAAAACACTTTCTCTCCCATGATGAGAGCATA TTGTTGTTAATTCCACCGTGCGCCCCTTTGACGTGCATAAAAATTAATAA CTCAAACCTCTACAAGTTTTATAATGAATAATGCCTTATAAACCTCAATA GTTCGGAAAAATTCTAAATAATTCAAGATTACCATAATTCGAACATATTT GTGTTCCCTGTGTGTGTTCGAGTTATAGAGACACTGTTGTATTGCTATAA CATTTTCTAATTCGATTAAATGGACCCATCCCGTTCTTTTTGTAAGGTGG GTCACCCTATTTCTCTTTTTAGTCCAATTTGGAAACTAGTCTCATACGGT CACCTGAGTATGATGTCATTGCTTCCGTTAGAATGATGACCTCACCCTTC TACACACCTCTTTTTTACCGTAGTATAAGAAGTCACAAAGGAAAAAAAAT GTTTGATTCAGGAATTGTATTACATTTTGTCCTTTTATGAATTACATTAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:364788..391776-

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TTATCTTTCCAACCGTGATTTATTAAACCCGTATGAAGAAGCTGCTCGCA
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AAATAACAATATGGAACGGTTACGTGTTAACACGTTAGATCGCGTTCTCC
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GACCTTTATCGTTACAACTTACACCTTCATCACACTATCATCCAGAGCTG
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CGAGGAGCCAGAACCTGACTCCTTTGAACAATTACCAGAGCCTTGTGATC
AGCATCCAGATTCACCAACACTTGCCAGATTCGCAGACCACCACCATCAT
CATAAACAGTGCGCTGATAGTTTAAATACATCAACAACAAGAACTCCACG
TAAAAGCTTCTTAGTTGTATTTTGGAGTCGCTTGTGGAAAAGTTCTGGAT
CAAAGAGTAGATCAGTTTCCACGGTTCGTATGGAGAATGAGATTTTGGTT
GTGGAAGAAAGACTAGCTGTTGTGTAGGTATCAGATGGCTCTTCTTGTCA
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TTTCCTATGTGTTCTTGGTATGGTTCTGTCTGCACATGCGCCAACACTCA
ATATCATGTACCTCACATTTGGAGTCACGTGGGGTCTCGGAACATCATTT
TGCTATTTTCCAACATTGATCATATTGGTTCCTTATTTCAACAAGAAACT
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TTTTGAGCCCTTCAATTCAGTGGTTTGCAGGACGTTATGGCGTCAAGTAC
ATGTTCTACTGTCTGGGGGCACTTCACGGTTTAGTACTTATAGCTGCAGC
TTTATATCGACCATTACCACAGAAATATTTAGAACGACAAGGTTATGTTA
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CTAACCAAAGAAACTCTTCTGAGTCGAGATTCAAGAAACCAACTGGATAA
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TTTCATGCTGGGTTATTTCGTACCTTTTGTACACATTATGAAACGGTTAA
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GATTCAAAAAAACAAACTCAAATAATGATTACTGAAAATAAAACAAGTGA
AGTTATCATCACCGCCCTTGAAGATGATAAACAGCCCAAAACACACCCTG
ATGGTGGGTGGGGCTGGGTGGTGGTTGCAGCCGCATTTTTAACACAATGG
ATTGTAGTTGGTTTGCAGAATTCATCGGGCGTCATTTTCAACGAACTGGT
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TTCAAGATTACTCGTACGCTTTTTACGTGGCCGGAATGATGAACATTTGT
GGCGTCCTCATCATGTTTTTTATAACGTACTTCAAACAAGAGGGTCATCT
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GACAAGAAGCCGCATCCAGAACGATCGTCATGACGTCATTTGCTTCTACT
GAACGTATTTATCTTTCCAACCGTGATTTATTAAACCCGTATGAAGAAGC
TGCTCGCAAACGAATCCCAACCGTATCGCGAGTTATCGAATTCACCAGTT
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TTCCCATCAAATAACAATATGGAACGGTTACGTGTTAACACGTTAGATCG
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TACCGCACCCGCGTTCTAGCAGCGACGGTGCGCGTGCAAAACGTCCTGAA
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ACCATCATCATAAACAGTGCGCTGATAGTTTAAATACATCAACAACAAGA
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AAGAAACTGGCCCTCGTGAATGGGATCGTATCGGCCGGAGCTGGGGTCGG
TACCCTCATTTTGAGCCCTTCAATTCAGTGGTTTGCAGGACGTTATGGCG
TCAAGTACATGTTCTACTGTCTGGGGGCACTTCACGGTTTAGTACTTATA
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CACAATGGATTGTAGTTGGTTTGCAGAATTCATCGGGCGTCATTTTCAAC
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10974MSTRG.10974Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10974.1.p1MSTRG.10974.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10974.1.p1.exon6MSTRG.10974.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10974.1.p1.exon5MSTRG.10974.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10974.1.p1.exon4MSTRG.10974.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10974.1.p1.exon3MSTRG.10974.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10974.1.p1.exon2MSTRG.10974.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10974.1.p1.exon1MSTRG.10974.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:364788..391776 -