MSTRG.10918.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10918.1.p1
Unique NameMSTRG.10918.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000077_pilon:1062517..1081985-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10918.1.p1 ID=MSTRG.10918.1.p1|Name=MSTRG.10918.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19469bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:1062517..1081985- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTGGTAAATTTAGAATAAAATCATAAATAATCATTTTTAGGCTTTGAAA TTTTACACCCAGGGTCGATGTCTTAGCACCCTATTGTCATAAATTTTTCG GAAGATTTTATGGGGTATTTTTGAGGTTACCATCATTTTTATAGGGTAAC CTTTGAAACACCACATCTTTTAGTAAAAACTATTTTAATCTCTAAAAACT AGAGAGCATACTCTATACTGACATGGCAACACTTGGTCAAAAAAAGTGCG AAAATTTGAAGATTTGGTGTGATTTTTGAGGTTACTTTTTGGTGGATTGT AGTAATCTCAAAAACCCATCAAAATTTGAATTTTAAAGATTCTGATTTCT TCTACTTCTAATAATCCATCTTGAGATGTGATTTAGTTTATGATTTGATG TTATAGTCATGCAAAACAAATAATATTGATCTTTGATTAATAGCCTCATT AGCTTTAGCTTAACACAGGATTACAGTGAAAATGGTACTTTTCTACAAGA GTAACCTTAAATATACAACCTTTTTGTTTATCAGGCATAATTTTCCATGA TGAATTTTGCTTCTATTACCTTTATCAAACCAATTGCCAACAAAATATCC ACTTTTTTTTGAAGCCAATTAGATGATAAAGGGGTTTATGAAAATTGTGA ATTGGTAACCTCAATTTAGCCCCAAAAATACAGCTTATAAGAAATCCAAA TTAGTTTTGCTTAGAATGAGGCCTACTTGAGGCATATTTAAATTTTGAGC AATTTTGCTTCAGTAGGTATTGATTTATAAGCTTTAGAATGAGGTAACCT CATTTGGGTAACCTCACTTTAACCACATCATATTTCTAAGTATTATTCAG GATTGAAGTAACCTCTTAAATTCGTGTTTCTTCTAAAACAACGAGAAATT TCTATACTTGAGTTCTTCAAAGTTTTGACATGGTAACCTCAAAATTCCAC CAGATATGGTATCAGATATGACAGAAGGTAGAAATGTCACAAAACCCCCC TTTATTTTTGACTGTGTTCTGGTCATTAAAATACAAAGTTAAATCAAACA AAAATGGAAGAGTAGAGCTGCGAGCGGAGCTACGTATCCAGGCCATATTT TAGAAAGGCAGGACAGCGTCCATTGGTCGCCACAAAAGGGCACTTTTTCT TGTGTTTTTCCGCTAAAAAGGCTGCTTTTACCAAAATTTTAGTGATTTCA GGAGGGGCAACGTCTGATGAAGGGTATAAAAAAAAGGGCATAAAAAATGG CCTGGTATCGTATCCTTTTTTGCCCTCGGAAATCCTGGTGTGTCGTCCGC CCCCCTGTTACAGACAAATTCTGGCATGGCCCATTAAAAACTTCAGTCTT AAAACAATGAAACAATGAAATTTTTCTTTTCTTTAGTTCTCAAACGAAAG CAAGAATTAGATGCAAGCG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000077_pilon:1062517..1081985-

>MSTRG.10918.1.p1 ID=MSTRG.10918.1.p1|Name=MSTRG.10918.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1488bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:1062517..1081985- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATCACAATCTACGATGCCCCGCTGCTTCTCTTGAATACAAATGGTGAATG
AAAAACAATATAAAAGTAGATTTTGGTGATGATGTTACATCTATATTTCT
TTGGCATAAAACAGATACTCTTCGAAAGCTGAAAGAATGTATTAACAAAC
GTTTCAATGTTCCAATAAATGATCAAATAATAAAACATGAAAACATTATT
GTGGATGAAGAGTTATTTAGTGCAATCTTTCGGAACCGATTCAACAGAAA
TGTTGTTTTCAAAGTTGAAATTCCTGATCCAGTAATTATCAAGGGTAGAC
GTGCTTGGATTTCAAAGCAAAATCGAGTCGGTGAAATTGTAGTTCCTGAT
CCTGATAAAATAGCTATCCAATTTCAAATCGGGGACCCTGAACGATTAGT
TTTAGACCTTAAACGTGACATAAAATCGGCTCTCCCAGTAGAAAGGAGGT
TGTTTCTGCTAAACAATTGTTTTATATTGGATGATGGATATGTGATAGCA
GATTTATTTCTCGACTTTGAAGATGTATTGCTAACTATGCTTGATAGTAA
AGAAAATATTCAGCTTATCCTTTCAAAATGGGCTATACCGTTAGTCGATA
TACTGATTCCAAGGATTGATTGTGAAGATCTCCTCATCGAATATCCTTTA
CACGAAATTGGAGACATGCGCATTAGTGTCCTGAAAGATTGGATTGAAGC
TCGTTTCCATATCCCTGTAGAAGAACAGGAACTGCATTGTGAAGATCACA
ATCTACGATGCCCCGCTGCTTCTCTTGAATACAAATGGTGAATGAAAAAC
AATATAAAAGTAGATTTTGGTGATGATGTTACATCTATATTTCTTTGGCA
TAAAACAGATACTCTTCGAAAGCTGAAAGAATGTATTAACAAACGTTTCA
ATGTTCCAATAAATGATCAAATAATAAAACATGAAAACATTATTGTGGAT
GAAGAGTTATTTAGTGCAATCTTTCGGAACCGATTCAACAGAAATGTTGT
TTTCAAAGTTGAAATTCCTGATCCAGTAATTATCAAGGGTAGACGTGCTT
GGATTTCAAAGCAAAATCGAGTCGGTGAAATTGTAGTTCCTGATCCTGAT
AAAATAGCTATCCAATTTCAAATCGGGGACCCTGAACGATTAGTTTTAGA
CCTTAAACGTGACATAAAATCGGCTCTCCCAGTAGAAAGGAGGTTGTTTC
TGCTAAACAATTGTTTTATATTGGATGATGGATATGTGATAGCAGATTTA
TTTCTCGACTTTGAAGATGTATTGCTAACTATGCTTGATAGTAAAGAAAA
TATTCAGCTTATCCTTTCAAAATGGGCTATACCGTTAGTCGATATACTGA
TTCCAAGGATTGATTGTGAAGATCTCCTCATCGAATATCCTTTACACGAA
ATTGGAGACATGCGCATTAGTGTCCTGAAAGATTGGATTGAAGCTCGTTT
CCATATCCCTGTAGAAGAACAGGAACTGCATTGTGAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10918MSTRG.10918Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10918.1.p1MSTRG.10918.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10918.1.p1.exon3MSTRG.10918.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10918.1.p1.exon2MSTRG.10918.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10918.1.p1.exon1MSTRG.10918.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000077_pilongenomesc0000077_pilon:1062517..1081985 -