MSTRG.10916.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10916.1.p1
Unique NameMSTRG.10916.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000077_pilon:1031573..1045349-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10916.1.p1 ID=MSTRG.10916.1.p1|Name=MSTRG.10916.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13777bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:1031573..1045349- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GAAGGCGTTGACCTCTTCTTTTTTGAAGTCAAAGTTCTCTTTAATCTTCA GTTAGATAAAGTCAGGTCATCCCTTTCAAGCTTTGAACCTTTTAGTCTAA TTTTTCCTCCTTGATGTATTGTCACTACACGGGCACTTTTTTTATCATGG AGGTATTAGTTAATAAATTAAGATTTTTCACTGTATCTCTGTACTTTCAT AAAAACGACAGGCGTGGTCCATTAACATAAGATATTACTCAACGAAAAAT AACATAATAGATAAAGGTCGACGAAGTTTTAAAACACATTTTATGAAATT GTACCAAAGTTTATGTATAAATTAGCGACGAGTTTTATAATATCTTATCA GCGATTATGAATTTAAACGCTTAGCAAAACTCTTGTGATAGCTTTTGTAA TATTCCCATGACGCGATAACTAACCCCTTTGACCATTCAAGTAAACTTGA GATGTATCCCAATTCAAAAACCAGATTATTCTCACATTTTTTTTTAAATG ATTACTTTTCCAAAAAGTTGAAATCGAAATCACGTGAGAGAAGGGAGAGA TCTGGAAATCGATTTGACCTATGTCAATTGATATTTTTATCGGTAATAGA TTAACATCATCAAGACCTCACTTTTATTTTTTTTAAGTAGCGTGTGAAAT ATTTCAACATCCAAGAAGTAATTGAGAAATTACAAACTTGATTTTATTAA AGGAAGGATTGTTTTACAGAACCATGAAAAAGAATTTGACAGGACAGTTA TCCCCTACCGGACGATTGTCCCCCGAATGATTATCTTCCTAAAAAGAAAA TCTTCAATTTTTCAATATTTTACCATGAGTCAATTTTTTCTTCAAGAAAA ACTCAATTACTAAACATGACATTTTACAAAGGAACTACGTTTGGTTTGGT AGTATGGCCTTTTGAGTACTTAGTACAGGGTAATCGTCCGGGGCTACGCA AAATTATACATACACGTTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAA GGCTTCGATGGCAAAAATGTTAAAAGCAAGTTAAGAACTTTTTAAGGCCA TGCGGACTCAAAAACAACCAATTTCTTAGGAAAATGGACAAAAATACTCA AAAAATGGCGAAAATAAGAACATGTTAAGAACATTTTTAGGCTTGAAATA CAAAAAGTTAAGAACATCCAAAGGCTTCAAAATTTTTGGATGTTCTTATA AAAGAACATGTAGATGATACCCAGGGCGGGGGGGGGGGTCTTTACCAATA GTCACTAAAGTGAATATTTTCAAGGCAAGTGACGGGCTATTCTATTCACG AAATGCAAAAAGGTCTGTCCAGAATAATTTCATTTATGACAGATGCATGA TGGTTGTTGTCTGTGCTTTTTTTACATTGGAAATTTATGACGTTCTCTCC TTATCTCTTATGTAACCTCTTACATAGTAATTTTGTATAAGAATTTCCTT TCATAAGTTTCAAGGTTGAAGTTTTCAACTCGAGGCTGATATTTTAAAGT TCATCTTTATCCCCGATTCCTAAAAACCGACATTTGGATTTTTTTTATGG ACTTTCTTCAAGATTTTAATATTACTACAAAAATTAGGTGAATCACCAAA AGGGGAATTCATGTATTCTTATAATAAAATTATCAAGCCTTACGTAAGAG CCATTTGTATTCATTTTCCATCAAAAGTGCTACCTTCTGTAGCATTTATA TAGTAACAACGGATAAATCTTCATAATTAAAAGATATTTTTCATATAAGA TTAATTGATAATTAATCCCTCATATGATAACTACATAGAATTCTTTTGGC GGCGTCCAGAAGGAAATCAGCTTGTTTCCTTAGTACCGGCTTTGCTTCAG GTATTTTTGTCTAAATATGGTAAAGGTATTAGTCATCTTTGTTTTGATGT 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TGGTAAAACAGTATCATACTAATATAAGAAATAAACAACTTGGCCATAAT TTCTCTGTTAATTTCATATTATTACAACGGATAAATGAGCTGGTTTTTGA GTTGAAAACATGCTCTTGGCCATCTTCACTAAAATATTGGGATATTTTTC TATTTTTTTCACAGATCTATTTGAAAGATGATGGGCGATGTGTGTTGGAA GGGACCGAATCCGCATTTGCGTCAATCAATTCCTTAATTGATCATTACAG GTAAACCAGTAAATTCATTATACCTTTGTTTTTGCTGATTAATCACTTTA TCATAGATTGTTGGCTTCGATTGTCATCAATTAACGAAAGCTGTTAGTCA GGAATTTTCATAACTTTAAAAGGTGTCGTTATTATTATTGGCATTCTGCG ATTGATTAGGAACGCAGATTTCATTGACCATAACAAATTTCCTTGTAACC AAAATGTAATTTTGTGTAATTACCAAGAATCAAATCCCAAAACTCAGCGA AAAGAATTTAAAATCTAGCTTCTGTTATTCCACGCGCTTCCTATCCCTAT ATTCTTAATTAGTTTAATCCAAACTAAGCTATATTAAAGCCAAGCTAAGT AAATGTTTTCTTAGACCAACAAAATCAGGAGGTCGTACGGATTAGTGTTA GAATCCTCCTTGATTTTAGCAAAAATTGTCCCACAATTCCTAATACATAA CTCGAACCTGCAAGGGGAAGACAAATTTGTTCGAGGAAATTTCGAGTTAT GGAATAACGTTAATAAGGCATTGTTAACTGAAAGAACGGGAAAACTTGTT CGAGTTAAAAATTCATGCGAGTTATAGAGGTTCGTGTTAACCCTTTAACT GCCGTGGCATTTTTTTACACCCTCGACCTATTTGCCCATGTCGAGCGATT TTCACTTCATTTTCTGAATAATATATGAAGTATCAGCCAAGGACTATAAT 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TTTAAGGTTGATAATCTCTTAAAGAGAGTCCGTCCACGGTTTCGAATTTT GATGAGCAGTGCGGTCTTTGTCTTTGTGGTCAAAACATGTTTTGATCACG TGTTTATTTGTGATCTTCTCGTGAGTGCAGTGATAGATAAAACGTTCATT GCGGTTTCCATTCGCTTTCAAGAAATTAAGTAAAGGGTTTTTACGCTGTC ATTTTCATAAGTTCCAAACTAACACCAAAAGTGATACAACTTCTAAACCG AACTGTTTTGTATAAAAAGGTTAACCACCTCAAAAACATGAAAAATATTG ACGCATAAGTTTATTTTTATCCCCTTTTTATCGGTTTTTGAGTCCGAAAC ATTAAGAATCGGTAAATCGGGGGTCTCAAAATGGATTTGGCTTTACTGCT AGGGGAGTGGCGGCTTTTCGGTAGCTAAAATGTCCTATTTATTGATTGTT TTTATGAAAATAAATTAGTAGGCTGTG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000077_pilon:1031573..1045349-

>MSTRG.10916.1.p1 ID=MSTRG.10916.1.p1|Name=MSTRG.10916.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8337bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:1031573..1045349- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGATTTTGATGATTATTTAGCTGATTGTGTAATGAAATTACCTGAAGATC
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AAATCGCCCGCCACACAACAATGCTCATCCTCAACACGAGCCACAAAGAA
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AGTAGTTGTCCGGTAGTTTCATCGAAATTAAAAGGTGTCCGAGACGCGCT
TCACCAAGAGGGAAGAGTCCAAGAAGAGGATGGTCCTGAATTTAATTCAT
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AAAGCTAAATTAATACCATCATTTAGTGCTAGTTCGACGTCTAGTGGGTC
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CGATCGCTCCATCCTGGGTTCAACACGATCGTGATTCACCCGTGGATAAG
AATAGGATACTTTCAGCGACACCACCAAAGAATATGGTCACTCGTCAGAA
TGGTGATGTTTTGTACCATCAGCCTAAGAAGAAACAGAAAGATGACGATC
ATAATTATAAAAAATGGTACCCACTCTATAAACATTGAATGCGCTGGCCT
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GTGACTGGGCGTTTGGCCTCTTTGCAATGTTGGCAGTTATTGCTTTATTG
GTGCCCATAGTGCTCGCTATTCATTGTGGAATCAGATGGTATCACAGGAA
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CTTTATATCCACATGAAGTAGAAGGGAGCAGCACAGAACCAGGAGAATCG
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TCTATTTGAAAGATGATGGGCGATGTGTGTTGGAAGGGACCGAATCCGCA
TTTGCGTCAATCAATTCCTTAATTGATCATTACAGGTGCTGACACTGTAT
TCGAAATCGTTAGAGAACAATGCATCTTTGTATTATTTCAAGGATTTTGA
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GATTGTTTCTTATACGAAATTCAACGACAGTTTCTAGCTGCAAGCATACT
ACCCATACCCTGCATACGGGACATACGATGACGTTTCCTTACCTGGGTCT
ACTGCTTCTTTATACAATACAGACACAGCGGACGGACAAGAAAATCGCCC
GCCACACAACAATGCTCATCCTCAACACGAGCCACAAAGAATACCATCTA
ATCCAAGTCAACAGCAAGCTCAATCCTCACCTTATTTGTCGAGTAGTTGT
CCGGTAGTTTCATCGAAATTAAAAGGTGTCCGAGACGCGCTTCACCAAGA
GGGAAGAGTCCAAGAAGAGGATGGTCCTGAATTTAATTCATTAGGAAAAA
GTCAAGCATCTAGAGACAGTTTTTACAACAAAGATGACTTTAAAGCTAAA
TTAATACCATCATTTAGTGCTAGTTCGACGTCTAGTGGGTCAAACACACA
ATCGTTGTTCGATGATTCGGTTGTCGGTGATCGAACGAAACCGATCGCTC
CATCCTGGGTTCAACACGATCGTGATTCACCCGTGGATAAGAATAGGATA
CTTTCAGCGACACCACCAAAGAATATGGTCACTCGTCAGAATGGTGATGT
TTTGTACCATCAGCCTAAGAAGAAACAGAAAGATGACGATCATAATTATA
AAAAATGGTACCCACTCTATAAACATTGAATGCGCTGGCCTCACTTACCT
ACAATATTGCCCTGATGATGACATCTACAGGTGCGAATACAGTGACTGGG
CGTTTGGCCTCTTTGCAATGTTGGCAGTTATTGCTTTATTGGTGCCCATA
GTGCTCGCTATTCATTGTGGAATCAGATGGTATCACAGGAAGTTGGATGA
GAATTTCAAACCGAATGTGAGCCGGCAGACATCTTATTCTTCTTTATATC
CACATGAAGTAGAAGGGAGCAGCACAGAACCAGGAGAATCGGACGATATT
ACCATGCCTTCTCACTGAATGCCTTGGCAAAAATTTCTAAATCTATTTGA
AAGATGATGGGCGATGTGTGTTGGAAGGGACCGAATCCGCATTTGCGTCA
ATCAATTCCTTAATTGATCATTACAGGTGCTGACACTGTATTCGAAATCG
TTAGAGAACAATGCATCTTTGTATTATTTCAAGGATTTTGATGATTATTT
AGCTGATTGTGTAATGAAATTACCTGAAGATCAACGTAATGGATTGTTTC
TTATACGAAATTCAACGACAGTTTCTAGCTGCAAGCATACTACCCATACC
CTGCATACGGGACATACGATGACGTTTCCTTACCTGGGTCTACTGCTTCT
TTATACAATACAGACACAGCGGACGGACAAGAAAATCGCCCGCCACACAA
CAATGCTCATCCTCAACACGAGCCACAAAGAATACCATCTAATCCAAGTC
AACAGCAAGCTCAATCCTCACCTTATTTGTCGAGTAGTTGTCCGGTAGTT
TCATCGAAATTAAAAGGTGTCCGAGACGCGCTTCACCAAGAGGGAAGAGT
CCAAGAAGAGGATGGTCCTGAATTTAATTCATTAGGAAAAAGTCAAGCAT
CTAGAGACAGTTTTTACAACAAAGATGACTTTAAAGCTAAATTAATACCA
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CGATGATTCGGTTGTCGGTGATCGAACGAAACCGATCGCTCCATCCTGGG
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ACCGAATGTGAGCCGGCAGACATCTTATTCTTCTTTATATCCACATGAAG
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TCTCACTGAATGCCTTGGCAAAAATTTCTAAATCTATTTGAAAGATGATG
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AATGCATCTTTGTATTATTTCAAGGATTTTGATGATTATTTAGCTGATTG
TGTAATGAAATTACCTGAAGATCAACGTAATGGATTGTTTCTTATACGAA
ATTCAACGACAGTTTCTAGCTGCAAGCATACTACCCATACCCTGCATACG
GGACATACGATGACGTTTCCTTACCTGGGTCTACTGCTTCTTTATACAAT
ACAGACACAGCGGACGGACAAGAAAATCGCCCGCCACACAACAATGCTCA
TCCTCAACACGAGCCACAAAGAATACCATCTAATCCAAGTCAACAGCAAG
CTCAATCCTCACCTTATTTGTCGAGTAGTTGTCCGGTAGTTTCATCGAAA
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GGATGGTCCTGAATTTAATTCATTAGGAAAAAGTCAAGCATCTAGAGACA
GTTTTTACAACAAAGATGACTTTAAAGCTAAATTAATACCATCATTTAGT
GCTAGTTCGACGTCTAGTGGGTCAAACACACAATCGTTGTTCGATGATTC
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GCGGACGGACAAGAAAATCGCCCGCCACACAACAATGCTCATCCTCAACA
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GTCCGAGACGCGCTTCACCAAGAGGGAAGAGTCCAAGAAGAGGATGGTCC
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TGCTGACACTGTATTCGAAATCGTTAGAGAACAATGCATCTTTGTATTAT
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TGTCGAGTAGTTGTCCGGTAGTTTCATCGAAATTAAAAGGTGTCCGAGAC
GCGCTTCACCAAGAGGGAAGAGTCCAAGAAGAGGATGGTCCTGAATTTAA
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CGCCCGCCACACAACAATGCTCATCCTCAACACGAGCCACAAAGAATACC
ATCTAATCCAAGTCAACAGCAAGCTCAATCCTCACCTTATTTGTCGAGTA
GTTGTCCGGTAGTTTCATCGAAATTAAAAGGTGTCCGAGACGCGCTTCAC
CAAGAGGGAAGAGTCCAAGAAGAGGATGGTCCTGAATTTAATTCATTAGG
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CTAAATTAATACCATCATTTAGTGCTAGTTCGACGTCTAGTGGGTCAAAC
ACACAATCGTTGTTCGATGATTCGGTTGTCGGTGATCGAACGAAACCGAT
CGCTCCATCCTGGGTTCAACACGATCGTGATTCACCCGTGGATAAGAATA
GGATACTTTCAGCGACACCACCAAAGAATATGGTCACTCGTCAGAATGGT
GATGTTTTGTACCATCAGCCTAAGAAGAAACAGAAAGATGACGATCATAA
TTATAAAAAATGGTACCCACTCTATAAACATTGAATGCGCTGGCCTCACT
TACCTACAATATTGCCCTGATGATGACATCTACAGGTGCGAATACAGTGA
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GATGAGAATTTCAAACCGAATGTGAGCCGGCAGACATCTTATTCTTCTTT
ATATCCACATGAAGTAGAAGGGAGCAGCACAGAACCA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10916MSTRG.10916Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10916.1.p1MSTRG.10916.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10916.1.p1.exon7MSTRG.10916.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10916.1.p1.exon6MSTRG.10916.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10916.1.p1.exon5MSTRG.10916.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10916.1.p1.exon4MSTRG.10916.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10916.1.p1.exon3MSTRG.10916.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10916.1.p1.exon2MSTRG.10916.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10916.1.p1.exon1MSTRG.10916.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000077_pilongenomesc0000077_pilon:1031573..1045349 -