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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000077_pilon:962578..965194+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10908.1.p1 ID=MSTRG.10908.1.p1|Name=MSTRG.10908.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2617bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:962578..965194+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATACAGAAGATCAATGATGCCATCAGAAGTTCTTGATGATAACTTAACC
ATAAATGACAAGTGTAATGGTTTAAAATATTACAATTTTCACGTATGATA
GATCTACATTAAAAGCTACAGTAACATACtttgattttgtttaaaattag
taaatttagaTATTGttaacaaattgattttctcttctttttaatTATAG
GCAGTATGGTACCCTTATTGCCAAAGGCTTGCCCAGTTTGCAGTGGAAAA
GATATCACGAGAATTGCAGGAGATTACATCAATGTTGTCTCATTAACAGG
TGATTGAgtgattttatttgaaaaattcttgaatCCTATCCtgcaaaaat
cttttctaactattataaatttttcaatttcagggaAATGCTTATTGCGT
ACCTTCTCAACAAGATGCCTTGGGTGTGGGGAATTGAACAATCCTTTTAC
CATGGCAAACATAATTCAATCTGGGTTTTGGCCAAACTCACCAATAAGAT
TGAGTTACCTTTTCGATCAAGAagtgttcagattttgggatgGTCTCCGT
AAAAATGCACCAGGGACTTCGGAAAACTCGTTTCTTGAAGTTTTGAACAC
CTTGGCAAAATTCCATGGCAGGGTAAGCATTTAATTTGGGTAAAGTTTTT
TCGTATTAATCAATTTTCATAGCAAAATCGGGATTTAtctatttaatttg
atttgatttgaatgatgTACCTTGAAATAGTTTTCTCATGGTGTACGTTC
ATTTTAATTTTAGCATGGCAAAATTTCCCCATCCATCTTTTCAACAGCCT
TTAAAGAGTGGTGTTTCTGTCAGTACAAGATCGATTGTGCACAGCATAAG
AACTGGCTTGAATGTCCTGCCTGCGCATACGAACAGCATTCCTCTCATGT
AGACGGAAACTGTAAACTGTACTGTTACAAGAGTTCAGGAAAGTAAGTAC
TCTCAGTTGTTTATCTCCATTGTCACCCCTGGAACGTTTTATGATTCATT
ATTTTCCTCGTGTCGAGGTACTTTATCACAAattaatattttagaaaata
tcCTTTGTCTTTAATAATAAGAGTCATTATCAGGATTTGGTTTTTCTCAT
ACGATTGCAATAGTAGTTGTTTAATGTAATTTTGCAGACGAACAAGATCA
GAATTCTATGATGGTTTATTTATCGTCAACGACATGGAAGTCAAACCATT
CATTCAAGAGCTGTATCAAGGAAAGTTCGGAAAGGTTTTTAGCGAAAGAT
TTTATCATTTGATCATTTTTATACCACCTTAATTATCGGATGCATTTAAT
CAGGAAAATCAAAAGGTTCATCATGTTACAATAATAGTCTTTAGTCcggg
aggtaatatacgagatctaccttcaattaaaactttcgagacccaagcaa
tctcatgtttttgatgttcctgacattcaaggagtgatctttcttaatcg
acttcgggtcggtttcagtcatctcaacgagcataaatttagacatggct
tctgcgacactttagaccctttctgtggtttccgaactaactctgttgaa
aacactcagcactttcttctgcactgctctatatattcccatgcaagaca
atttttgttcgacaaacttcagaccctaggcattatttttcatccgccgc
ttaaccctccttttttctgtcggcttttattatatggggatgaaagtttg
acttcaaatctaaataaatctattctttgttctgttgttgaatttcttaa
cgaaactggaaggtttagtggtgctttattttaggcttttacctaacaat
tgtagcttccttctccaagattttttcattatttacttatttatttttta
catagtctagtacctctggcgatataacgttagttcctagcggggggagg
gactatattttatgtttaagtaatgttttgtaatatatgttcgtagtgta
cacgtgtttttgtttcaataaagaaaaaaaaataaagaaaaaaaatagtc
TTTAAACTCTCATTCTTTAAAGGTTGAAAAAGATGACAGGTGTGGTGGTG
TTTGGGGTGCTGCTCGTAACACAGCTCGTAACAAAAAGTCTCTCGACATT
ACTGGTCTTGAAGTCATGTCTTGCCGTCACCAATTAGGTCAAAAAGCACT
GAACATGCACCAGGGTGAACTGTATGGTTATGCCTTGTTTTTGATAAAAC
ATCACATGGTCCCTCGAAACGTCCAGTTTGTGTTTGCAGATGTGATGTGT
AAACTGCGTAAATATGTTGAACGGGTCGACCCAGCGACCGCGAAAAAGTT
TACCGGAGCATTGTCGGTGATGCACGCCAAGGGGCACGGACTTGATTGTC
AAGTATGAATACTCATATAATCTATAGCTAATAATGTTTTTCTTACAGCA
TCTGCTCagtaataaaataaacaaaatgacaAATCTATTTTCAGAATTCA
TTCTTTATGAATTCTTTATCGAAGATCTTCACCAACTTGTTCACAATCTT
GTTTAATTTTAATAAGACAGTATTTGTTTTATTTAACAGGTAATATGGGA
TGGAGAATGGATTGATGGTACGGGACGGTCTACTGGGGAAGAAACCGAAC
AAGTGTTTAGTTTTCTG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000077_pilon:962578..965194+ >MSTRG.10908.1.p1 ID=MSTRG.10908.1.p1|Name=MSTRG.10908.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6102bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:962578..965194+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTACCCTTATTGCCAAAGGCTTGCCCAGTTTGCAGTGGAAAAGATAT
CACGAGAATTGCAGGAGATTACATCAATGTTGTCTCATTAACAGggaAAT
GCTTATTGCGTACCTTCTCAACAAGATGCCTTGGGTGTGGGGAATTGAAC
AATCCTTTTACCATGGCAAACATAATTCAATCTGGGTTTTGGCCAAACTC
ACCAATAAGATTGAGTTACCTTTTCGATCAAGAagtgttcagattttggg
atgGTCTCCGTAAAAATGCACCAGGGACTTCGGAAAACTCGTTTCTTGAA
GTTTTGAACACCTTGGCAAAATTCCATGGCAGGCATGGCAAAATTTCCCC
ATCCATCTTTTCAACAGCCTTTAAAGAGTGGTGTTTCTGTCAGTACAAGA
TCGATTGTGCACAGCATAAGAACTGGCTTGAATGTCCTGCCTGCGCATAC
GAACAGCATTCCTCTCATGTAGACGGAAACTGTAAACTGTACTGTTACAA
GAGTTCAGGAAAACGAACAAGATCAGAATTCTATGATGGTTTATTTATCG
TCAACGACATGGAAGTCAAACCATTCATTCAAGAGCTGTATCAAGGAAAG
TTCGGAAAGGTTGAAAAAGATGACAGGTGTGGTGGTGTTTGGGGTGCTGC
TCGTAACACAGCTCGTAACAAAAAGTCTCTCGACATTACTGGTCTTGAAG
TCATGTCTTGCCGTCACCAATTAGGTCAAAAAGCACTGAACATGCACCAG
GGTGAACTGTATGGTTATGCCTTGTTTTTGATAAAACATCACATGGTCCC
TCGAAACGTCCAGTTTGTGTTTGCAGATGTGATGTGTAAACTGCGTAAAT
ATGTTGAACGGGTCGACCCAGCGACCGCGAAAAAGTTTACCGGAGCATTG
TCGGTGATGCACGCCAAGGGGCACGGACTTGATTGTCAAGTAATATGGGA
TGGAGAATGGATTGATGGTACGGGACGGTCTACTGGGGAAGAAACCGAAC
AAGTGTTTAGTTTTCTGATGGTACCCTTATTGCCAAAGGCTTGCCCAGTT
TGCAGTGGAAAAGATATCACGAGAATTGCAGGAGATTACATCAATGTTGT
CTCATTAACAGggaAATGCTTATTGCGTACCTTCTCAACAAGATGCCTTG
GGTGTGGGGAATTGAACAATCCTTTTACCATGGCAAACATAATTCAATCT
GGGTTTTGGCCAAACTCACCAATAAGATTGAGTTACCTTTTCGATCAAGA
agtgttcagattttgggatgGTCTCCGTAAAAATGCACCAGGGACTTCGG
AAAACTCGTTTCTTGAAGTTTTGAACACCTTGGCAAAATTCCATGGCAGG
CATGGCAAAATTTCCCCATCCATCTTTTCAACAGCCTTTAAAGAGTGGTG
TTTCTGTCAGTACAAGATCGATTGTGCACAGCATAAGAACTGGCTTGAAT
GTCCTGCCTGCGCATACGAACAGCATTCCTCTCATGTAGACGGAAACTGT
AAACTGTACTGTTACAAGAGTTCAGGAAAACGAACAAGATCAGAATTCTA
TGATGGTTTATTTATCGTCAACGACATGGAAGTCAAACCATTCATTCAAG
AGCTGTATCAAGGAAAGTTCGGAAAGGTTGAAAAAGATGACAGGTGTGGT
GGTGTTTGGGGTGCTGCTCGTAACACAGCTCGTAACAAAAAGTCTCTCGA
CATTACTGGTCTTGAAGTCATGTCTTGCCGTCACCAATTAGGTCAAAAAG
CACTGAACATGCACCAGGGTGAACTGTATGGTTATGCCTTGTTTTTGATA
AAACATCACATGGTCCCTCGAAACGTCCAGTTTGTGTTTGCAGATGTGAT
GTGTAAACTGCGTAAATATGTTGAACGGGTCGACCCAGCGACCGCGAAAA
AGTTTACCGGAGCATTGTCGGTGATGCACGCCAAGGGGCACGGACTTGAT
TGTCAAGTAATATGGGATGGAGAATGGATTGATGGTACGGGACGGTCTAC
TGGGGAAGAAACCGAACAAGTGTTTAGTTTTCTGATGGTACCCTTATTGC
CAAAGGCTTGCCCAGTTTGCAGTGGAAAAGATATCACGAGAATTGCAGGA
GATTACATCAATGTTGTCTCATTAACAGggaAATGCTTATTGCGTACCTT
CTCAACAAGATGCCTTGGGTGTGGGGAATTGAACAATCCTTTTACCATGG
CAAACATAATTCAATCTGGGTTTTGGCCAAACTCACCAATAAGATTGAGT
TACCTTTTCGATCAAGAagtgttcagattttgggatgGTCTCCGTAAAAA
TGCACCAGGGACTTCGGAAAACTCGTTTCTTGAAGTTTTGAACACCTTGG
CAAAATTCCATGGCAGGCATGGCAAAATTTCCCCATCCATCTTTTCAACA
GCCTTTAAAGAGTGGTGTTTCTGTCAGTACAAGATCGATTGTGCACAGCA
TAAGAACTGGCTTGAATGTCCTGCCTGCGCATACGAACAGCATTCCTCTC
ATGTAGACGGAAACTGTAAACTGTACTGTTACAAGAGTTCAGGAAAACGA
ACAAGATCAGAATTCTATGATGGTTTATTTATCGTCAACGACATGGAAGT
CAAACCATTCATTCAAGAGCTGTATCAAGGAAAGTTCGGAAAGGTTGAAA
AAGATGACAGGTGTGGTGGTGTTTGGGGTGCTGCTCGTAACACAGCTCGT
AACAAAAAGTCTCTCGACATTACTGGTCTTGAAGTCATGTCTTGCCGTCA
CCAATTAGGTCAAAAAGCACTGAACATGCACCAGGGTGAACTGTATGGTT
ATGCCTTGTTTTTGATAAAACATCACATGGTCCCTCGAAACGTCCAGTTT
GTGTTTGCAGATGTGATGTGTAAACTGCGTAAATATGTTGAACGGGTCGA
CCCAGCGACCGCGAAAAAGTTTACCGGAGCATTGTCGGTGATGCACGCCA
AGGGGCACGGACTTGATTGTCAAGTAATATGGGATGGAGAATGGATTGAT
GGTACGGGACGGTCTACTGGGGAAGAAACCGAACAAGTGTTTAGTTTTCT
GATGGTACCCTTATTGCCAAAGGCTTGCCCAGTTTGCAGTGGAAAAGATA
TCACGAGAATTGCAGGAGATTACATCAATGTTGTCTCATTAACAGggaAA
TGCTTATTGCGTACCTTCTCAACAAGATGCCTTGGGTGTGGGGAATTGAA
CAATCCTTTTACCATGGCAAACATAATTCAATCTGGGTTTTGGCCAAACT
CACCAATAAGATTGAGTTACCTTTTCGATCAAGAagtgttcagattttgg
gatgGTCTCCGTAAAAATGCACCAGGGACTTCGGAAAACTCGTTTCTTGA
AGTTTTGAACACCTTGGCAAAATTCCATGGCAGGCATGGCAAAATTTCCC
CATCCATCTTTTCAACAGCCTTTAAAGAGTGGTGTTTCTGTCAGTACAAG
ATCGATTGTGCACAGCATAAGAACTGGCTTGAATGTCCTGCCTGCGCATA
CGAACAGCATTCCTCTCATGTAGACGGAAACTGTAAACTGTACTGTTACA
AGAGTTCAGGAAAACGAACAAGATCAGAATTCTATGATGGTTTATTTATC
GTCAACGACATGGAAGTCAAACCATTCATTCAAGAGCTGTATCAAGGAAA
GTTCGGAAAGGTTGAAAAAGATGACAGGTGTGGTGGTGTTTGGGGTGCTG
CTCGTAACACAGCTCGTAACAAAAAGTCTCTCGACATTACTGGTCTTGAA
GTCATGTCTTGCCGTCACCAATTAGGTCAAAAAGCACTGAACATGCACCA
GGGTGAACTGTATGGTTATGCCTTGTTTTTGATAAAACATCACATGGTCC
CTCGAAACGTCCAGTTTGTGTTTGCAGATGTGATGTGTAAACTGCGTAAA
TATGTTGAACGGGTCGACCCAGCGACCGCGAAAAAGTTTACCGGAGCATT
GTCGGTGATGCACGCCAAGGGGCACGGACTTGATTGTCAAGTAATATGGG
ATGGAGAATGGATTGATGGTACGGGACGGTCTACTGGGGAAGAAACCGAA
CAAGTGTTTAGTTTTCTGATGGTACCCTTATTGCCAAAGGCTTGCCCAGT
TTGCAGTGGAAAAGATATCACGAGAATTGCAGGAGATTACATCAATGTTG
TCTCATTAACAGggaAATGCTTATTGCGTACCTTCTCAACAAGATGCCTT
GGGTGTGGGGAATTGAACAATCCTTTTACCATGGCAAACATAATTCAATC
TGGGTTTTGGCCAAACTCACCAATAAGATTGAGTTACCTTTTCGATCAAG
AagtgttcagattttgggatgGTCTCCGTAAAAATGCACCAGGGACTTCG
GAAAACTCGTTTCTTGAAGTTTTGAACACCTTGGCAAAATTCCATGGCAG
GCATGGCAAAATTTCCCCATCCATCTTTTCAACAGCCTTTAAAGAGTGGT
GTTTCTGTCAGTACAAGATCGATTGTGCACAGCATAAGAACTGGCTTGAA
TGTCCTGCCTGCGCATACGAACAGCATTCCTCTCATGTAGACGGAAACTG
TAAACTGTACTGTTACAAGAGTTCAGGAAAACGAACAAGATCAGAATTCT
ATGATGGTTTATTTATCGTCAACGACATGGAAGTCAAACCATTCATTCAA
GAGCTGTATCAAGGAAAGTTCGGAAAGGTTGAAAAAGATGACAGGTGTGG
TGGTGTTTGGGGTGCTGCTCGTAACACAGCTCGTAACAAAAAGTCTCTCG
ACATTACTGGTCTTGAAGTCATGTCTTGCCGTCACCAATTAGGTCAAAAA
GCACTGAACATGCACCAGGGTGAACTGTATGGTTATGCCTTGTTTTTGAT
AAAACATCACATGGTCCCTCGAAACGTCCAGTTTGTGTTTGCAGATGTGA
TGTGTAAACTGCGTAAATATGTTGAACGGGTCGACCCAGCGACCGCGAAA
AAGTTTACCGGAGCATTGTCGGTGATGCACGCCAAGGGGCACGGACTTGA
TTGTCAAGTAATATGGGATGGAGAATGGATTGATGGTACGGGACGGTCTA
CTGGGGAAGAAACCGAACAAGTGTTTAGTTTTCTGATGGTACCCTTATTG
CCAAAGGCTTGCCCAGTTTGCAGTGGAAAAGATATCACGAGAATTGCAGG
AGATTACATCAATGTTGTCTCATTAACAGggaAATGCTTATTGCGTACCT
TCTCAACAAGATGCCTTGGGTGTGGGGAATTGAACAATCCTTTTACCATG
GCAAACATAATTCAATCTGGGTTTTGGCCAAACTCACCAATAAGATTGAG
TTACCTTTTCGATCAAGAagtgttcagattttgggatgGTCTCCGTAAAA
ATGCACCAGGGACTTCGGAAAACTCGTTTCTTGAAGTTTTGAACACCTTG
GCAAAATTCCATGGCAGGCATGGCAAAATTTCCCCATCCATCTTTTCAAC
AGCCTTTAAAGAGTGGTGTTTCTGTCAGTACAAGATCGATTGTGCACAGC
ATAAGAACTGGCTTGAATGTCCTGCCTGCGCATACGAACAGCATTCCTCT
CATGTAGACGGAAACTGTAAACTGTACTGTTACAAGAGTTCAGGAAAACG
AACAAGATCAGAATTCTATGATGGTTTATTTATCGTCAACGACATGGAAG
TCAAACCATTCATTCAAGAGCTGTATCAAGGAAAGTTCGGAAAGGTTGAA
AAAGATGACAGGTGTGGTGGTGTTTGGGGTGCTGCTCGTAACACAGCTCG
TAACAAAAAGTCTCTCGACATTACTGGTCTTGAAGTCATGTCTTGCCGTC
ACCAATTAGGTCAAAAAGCACTGAACATGCACCAGGGTGAACTGTATGGT
TATGCCTTGTTTTTGATAAAACATCACATGGTCCCTCGAAACGTCCAGTT
TGTGTTTGCAGATGTGATGTGTAAACTGCGTAAATATGTTGAACGGGTCG
ACCCAGCGACCGCGAAAAAGTTTACCGGAGCATTGTCGGTGATGCACGCC
AAGGGGCACGGACTTGATTGTCAAGTAATATGGGATGGAGAATGGATTGA
TGGTACGGGACGGTCTACTGGGGAAGAAACCGAACAAGTGTTTAGTTTTC
TG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000077_pilon | genome | sc0000077_pilon:962578..965194 + |
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