MSTRG.10874.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10874.2.p2
Unique NameMSTRG.10874.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000077_pilon:544314..569307-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10874.2.p2 ID=MSTRG.10874.2.p2|Name=MSTRG.10874.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=24994bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:544314..569307- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCCGTAAAACTGCTAGTGGAGGCAAGGCTAATTTGGCGGGAAAATTGAGA AAACGAAAGTCAGTTGCCCAGTAAACTAAACTTGATCACTTTTCGATTCC AAAATTTCAGAGAATCGAAAATCGAAATACATCTCATTCTGTTCTGTCAT TTTCTCTACTCAATTTTCTCCTTTTGTTGTCGCTACCTTCTTCATTATTT CACTGTTGATCAAGCTTGAATGAAGAGAGAGAAATCATGACCTTATCAAA CGAGGAAATGGTTAAATTTGATGATGTTTTCTTGGGGATTTTGCAACATT GTGGAAAGATTGAACCTTTTTTAGATTCTATTTTTTATTTCTTGTCCCGA CGTACTGACTTTTTCCAATTGATGCATTCAAAAGATGATAAACTTGGGTT TCCTCCAGGAGTAGCAGAGAAAATGTTGATAAAGGTATTTCATCCCATAG ACTTTTTCTACTTTTCAACATCATCTCTTCTCGAGACAGTGTCAAATCGA ACGAATCGAACAGTTAGTCACACTACACTAGGAAATCAAGCTTTCAGAAA AAACAACATCAGTCATCTACAGGATGTATATGCAACAACAAGGATGAGAG TTACCTGAATCAAGTTCGCAAGACAATTAATTAAAACTTGAAAGTTTGAA ACAAAATAAAACGTGCAGCAGCCAAAAATCAACCAAACAAATACCCCACC AAAATGCGTATCAAAGATTAATGCTGCGAAAGCAATATATCGTTTACTTG GCTCTCCAGCAAAAAAATGCGCCGCAAAACTTCTAAAGGAATTCATGAAA GAATAACCCGGCGCTTCGCTTTTTAATCCAGGCGTAGTTAATCGATATAA TCAATAATCTTGAGTAATCGATAAATAATCGATAAGTAATCGATGGATTA GATATCGATTAACCGATAGAATCGTTAGGTAATCGATACTCAAGATTTTT 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TAACAAAAACTATGATTGAAATGTCAGGCTACATTGTGTCCGAGATAAAA TGAAACTGATCATATCAACAAACATTTTCAAAATTCATGTCAACTCTAGA TTAGCATTTTAGCTCATTTTCTGAAAGATTTGCTCTGACTCCCCTGATAT TATACCATATTTATGTTTATTGGGGGCAAGGGCTTTCGTTTACCATGCTT AAATTATCTAAAAAAGCTATTACTTTACGAGATAGTGAAACAATTTTGGC TCGACCCTTAACCCTTAGCAACCTGGTTGCTTATAAACGAAAAAATGTAT ACTCTTTAGTTCAACATTCAAATGAAAATACCTCCGCTGAAAATGCAGAT TTCCACATACTTTTAGTGACGAACCAGGCTGGCCGTCTACAAACAAATTC CAAGAAGTGTGCCAGCCTGGTTTCTTTTCAAATGCAGCCCATAGATTTAA AAAGCCCGAAGGGCTAGATGTCGTGCTTTGGCTGAAAAGTGCGCCGTGAA TACGTAGGAAATCCTACCTAAGTCACGTGAAATAATTACAATAGAATTTC AGCGCTTGACCAATAAGGAGCTTGGCATGTTTTCGAAAACAATAGCAGCA ATATTTTTTGCGATGTTCACTTTTTTTTGCTTATGGAAGAGCTTAAAGCA TGACAACTAGCCCTTCGGGTTTTACAGAAATCTGTGATGCAGAATCCAAA TCAGACTTTCTTCATTGATCTTTTCCATTTTATATTTGTACAGGGGGGGG GGGGGTGGGGTTAGATGAACTTTTTCAGGTCTAAAATCTTCTTGGAAATG AGCGTATACTCCCTGGTAAAATAGCAAAGTTTGCATGACCCCCCCCCTAG AAAAAGAAATTCTACACCCCTTTAAACAATTATTCAATCTCTGGTAAATG TTGTTTTTTCAAACAGAGTTGATTTTAACCAAACCACTGGAAAATCAAAA TAAACCTGGAAATGGGCTTTTCCAGAAAAAATTTGAATATAGGGGTTGAA GTCTAACCCCCGGACAGCAAGTCCCCCGGACAGCAGGTCTAACCCCCTGG ACATTCAAAATTACCCTCAAACAGAGCAAATTACTCTCCAAACAGAGCAA AATTGCCCCCCAGACAAAGTAAATTTTGTTAGATTTTTCACTACCCCCGG TCACTATATCCTCCACCTCCACTCCCATGTACGAACATTTTCTGGAAGAG CCCAATCCTTCTCGGCCTACCAGCACCTGTAAAAGTTCGTCCACGCCCTT GTATGAGATGATGTATTCCAATCTAACAGGTAGCAGACTTCGATCCTCAA ACACAATCAGACATTCGGAAAGTGATGTATGACCAACAACAAAAGATGAT GGGAAAACCAACCTCCGAAGAACAGGTAAATATATTAAAAGATCACTGAT ATCGGACGGAGGATCGAGACAAGAATACCATTAGGTGCTAGAAATTTATA AAAAGATCATTGTGCAAATGATTGTACGGAAGTGTGTTTATCAAAAATAT TTTTTCCACTATTACTTTTCTTCTAACATGCCTCATTCTCTATATGTTGG TTTTGATAGTTCATGATCATGTCTCGACTAATACCCTAAGCTATGATACA TCGGGACTACTTTCAATGTGGACAACTGCTTGGTTTTCAGACTGGGCCCC ATGGGGACGGTTCCCTTGTGTTTTTGTCCTACGGGAAATTAGTTTTTTTT TAAACCAAAATATAGTCTCGGATGCCCAAGAAGTGTCTCATCCCCTCCCC CTGCATATCAATTTGTTAACAATTTTTTTTCACACGCGGTATTTTATTAG CAACCCTCTCCTATTTATTTTGAAAACTCATTCAGCGTGTATATTTGAAG ATGGGCAATTGCTTTGAAAGGATTGTCCAATATCTTTATGTATGTCGTTG GTACCAGACATATTGATATCTACCAATGCGTCAAATGTCTCTGCCTTACC CATGCATCATGCTTAACGCTCTCCAAATACGAACAAAAACATATGACATC TCGCATCGTTGTACAATGGACATGCAGCGATTGTACTTTGACTGTCCTAC CCTTCTTTGGTTTGAGAGATTTGAATTTCGATGAAAGTTTTTCAAATGAG GAACTTGTTATTGAAAACACTCATCTAAAATTATTGAATGAGAACCGTAA TTTGACTTCGATCGCACACATAAACGCTCAGTCGCTTCTTTCTACATTCA CCGAATTCTCCACCATGTTAACCCTTCATCAGTTTGACATCATTACCGTC AATGAAACATGGCTGCAAGATAACAAACAAGCTAGAGAATACGTTGAAAT CGCCGGTTACACTCCTATCTTCAGACACCGAGGAAGTCGAGGAGGCGGTG TCGGTATCTACGCCAAAGATCACCTCCATTACCAACCTCGTAAGGACTTA ACCAAAAATTCGACGCTAGAAATTCTCGCTGCTGAATTCCGTAGCCGAAA TAAAAATACACCGTATCTTCTTGTTACCGTATACCAACCAAATTTCAAAG AAAAGGAAAAGTTACAATGGCTAGATCAATTTGAAACCACGATCGCTGAA ATTTGTACTAAGTGGAGCGGAATTATTATTCTGACAGGGGATATGAACTT CGATCTCATTGGTCAAGAAAAGTAGTCGACCAAGCGTTACAAAGAACTTC TGTCATCATACAATCTATTTCAACATGTAACGAAACCAACGAGACCCAAA ACACAAACCCTCATCGACCATGTGATCACCAACATACCAAGTAAAGTCAG CTTCACCGACGTATTATCTACAGATGAAATAAGTGATCACGACACCCCCT ACATTCTACTTAATATCAAGAAAGAACGTTTTGAACCTCGTTACAAATTC ATTCGTGACGTCAGGAATCTTGACATGAACTCCTACGTCAATGAGATTTC TAATCTACCATTCAGTATCGTATATGCTTTTGATGACCCTGAAGACCAAA TTGATATCCTTAATAATCTGATCCTCAGCTGCATCGAAACCCATGCCCCG TTAAAACGCATGAAATTAACACGTCCAATCGCACCATGGATGCGTGATCC AGCAATCGAAACTTGTCGAGCTAAACTTATTCGTCAGCAAGCTCGAATAG ATCCACGACTCAAAGCTTTATACAAAGAGAGGCTTACTGAGTATAAAAAG ACACTGAAACAAACCAAAAATAACTTCTTCAAGAAATCTTTATCGTCTAA AGATCCTAAAGCTGTATGGAACACCATCCATCGAGTACTGAACAACCAAA AGTCAAGAATCAACCACCATCCCTCCGAGATGAATGAATATTATAGCAAA CTTGCTTCAGAACTCACTGGTAAACCTAATGTAGAAGCAACGTTACCGCC CAACCTTGAGGCATTGAATGACCAAACCTCGTTCAAAATCCAACATACCA CGTATGATCAAGTAAACCAAATTCTAAAGAATATAAAGAATGACTGCTCT TGTGGCTCTGATAACATATCTATCAAGTTTGTTAAACCAATATCAGAGTT CGTCACATCACCACTCGTTCACATCATTAATAACTGTATCGACAAAAAAA TCTTTTCTCGCCAATGGAAAGTGGCTCGAGTATGTCCAATTCCAAAGATT GATTCACCTATAAAGATCAAAGATTACCGTCCTATATCCGTACTTCCTGT ACTTTCTAAAGTATTCGAGAGAGTTATCTTAGTCCAACTTTGCAAATTCA TCGAAGACAAAGCACTTTACCACCAAACACAGTCTGGATTTCGTAAAGGT CACTCCACCACAACCTTACTCGTAAAACTGAGGGATTATATCAAGAAAGC GATGGCGAAAAGTGAAGTTACCATATCCATCCTAATAGACTACTCAAAAG CCTTCGATACTATTGATCACACCAATTTGTTTCTGAAATTACGAGACATG AATTTTTCCATTGATTCTCTGCAGTTATTATCGAGCTATTTAAAAGACAG AAAGCAATATGTCCAAGTCGAAGATAAAACTTCATCAATTAAATCTATGT TTTTCGGAGTTCCACAGGGTAGTATACTAGGCCCTGTGTTATTCAATCTA TATGTCGTTGAACTTTCCGACCAAATATTATCCAGTAGCATTCAGTATGC CGACGACACCACCCTCTATCGGCACTGCAAAGTTAGAGACTTATTGCAGA CTATCAAGGAAATGGAGAAAGATGTCGAAAATCTTTGATCCTGGTCGAAG GATAGTAATCTACTTTTTAACAGTGATAAACTGCAACTTATCATCTTCCA TTCAAATCGTATAAGGAATTACCCAAAGAATCAAAGTCTACTCTTTCGAT GCTCTGGGAAATCCATCGAACACAAAGTCAATGTCAAACTACTTGGAGTT CAACTCGACGAAAATCTTACTTGGTCGACACACATAAACGGTATCATTAA ATCATCTCAAGGCACCCTACGCTCTCTTCGAAAATTCAGTCGTTTCACAC CCTTTAGTGTACGTAAAACACTTGCTGAAACATTGATACTATCAAAACTG AATTACAGTAATGTTGTCTTTGCACAGATTCCGAAATACTAACTTGATCG GCTACAAAAAATTCAGAACATAGCAGCTGGTTACGTTCTATCGCGATATG CTACCCTACACGATGTGATTGAATTAAAATGGTTACCTGTGAAAGAGTAT TTTGAGCTCAACACATCAAAAATTGTTCACAAATCCCGTCGTGATGCTAA CCACCCCCATGATCTGAAAGTTGAGTTTTGTGATCAAAGTAAGGGTCTTC GATCCACAGATAAAGAATCTTTGGTCAAAGTTGTAAATGATGGCACTTTC CAGGCACGATGTTATGATGATTTGCCGGAAAATATTAAATCTTTAGAAAC TCTAGATGAATTTAATTCAGAGGCAAAGAAATTTTATTTTGACAAATCAT TAGCTCGCTCTTTGTCTCTATGATCATATTTTTTAGCTTAGAATTCATTT TTTCTAGGTTCAATTTTTTTCTACCAATTTCTGTCACTATTACAACACTT CGACCTTTGATCCCCAATTCCATTCTTACATTACTATCCTATTCTAGCAA TCTTATGCCTATTTCAGTGATTTGAGTCTTGTGTTCTCTTTTGCTATTTT AAGTTAATAATTTATCTTAATTTATCATTATTTTATTAATTTCGCCTAGC GAAAGTATTACGATAGCCTTTCGCGGCGGCGGCGGCGGTGTAATAAAAAA ATTAGAAAACGAAAGTACTCGATACGGTGGACAAACTCACTAAATTTAAT TTACAATTTACACGCTCATACAACCACGGACGATTTTCGCGGGTTTTCTT TGGATTACGTCATATATCTTTGTGTCTTTAGATTCACAGTTCGGATTTTT TCTTTATTTTCTTATAAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTC TTAATAAACGGTGATATACCCTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACA AGGGATGTCGCACAATATGGGCATATTTATTTTTCATATAAGCATACACT TTATAAGAATCAAATCAATAACTCGTGATAAACGATGATATACCCTTCGG TAATTAGTTCTTACAAAGTAAATAAGGGATGGCGCACAATATGATCATAT CTATTTTTCTTATAAGCATATACTTTATAAGAATCAAACCAACAACTCTT GATAGACGGTGATATACCTTTCGGTAATTAGTTCTTACAAGGTAAACAAG GGATGGCACACAATATGAGCATATTTATTTTTCTTTTAAGCATATACTTT ATAAGAATCAAATCAATAACTCTTGATAGATGGTGATATACCTTTCGGTA ATTAGTTCTTACAAGGTAAACAAGGGATGGCACACAATATGAGCATATTT ATTTTTTCTTATAAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTTG ATAGATGGTGATATACCTTTCGGTACTTAGTTCTTACAAAGTAAACAAGG GATGGTGCACAATATTAGCATATTTATTTTTCTTATAAGCATATACTTTA TAAGAATCAAATCAATAACTCTTGATAGACTGTCATATACCTTTCGGTAA TTAGTTCTTACAAGGTAAATAAGGGATGGCACACAATATGAGCATATTTA TTTCTCTTATAAGCATATATTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTCGCT AGAATGCGATATAGCCTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAATAAAGGGA TGGCGCCCAATATGAACATATTTACATTATCGGGGAAAACTTCGTCGGGG AAAAATATTCGTCACTTGCTGATAGTTGGTAAACGCATTAAGGCTGGGGT AAATTTTCGTCGGGGAAAAATATTCGTCACTTGGCCAAAATTTCGTCACT TTTCCCGGACGAAGTTTTCCCTGATAAGGCTTTTTTTTTCTATAAGAATC AAATTAATAACCCTTTATAGATGGTGATATGCCCTTCAGTTATTAGTTCT TAAGAATTATAAACAACCATTGTTCGTAAATTGATCTTATCTTTTTAGCG ATTTTGAGCCTCGTTGTTCATATAAAATTGTTTCATCAAGGCTCGATGTA TGTAAAGTAGACTTCAGATTAGCTTTCATCTCTACTTCTTGTTTTTTCCT ATGCAGTTTAAACTTTAGGCGAAATTTTCGACTTCAAGTCGTCTTGTTTT TCTTAGATCTTAGATTAACTAAATATTTTTTTTTTTATCACAAAAATTTT TGCTGCTTTAGGCAGATATACACATTTAGACCTTTTCAACCACTTTAGAC TCTTTCCCATTTTACTCAATATACTCATTACTCAACTCCGGTAGTTTCAC TACTCTCAAGTCCTCATTCTAGCCTTGTTTAGCCTCTGGGTCGTTATAAA CTTTTTTAAACTTATATATTTAATAAAAATTTATAACTATTTATTCTATT TATTCTTTTGTATTTTCATTTTCATTTTTAAGTTTAGGCGGAAGAGCAAT TTGTACAAATTGAAGCCAAATAAATGTGAAATAAAAAAAAAAAATTTGAA ACCAACTGCTTGACCCCTCCCCCATCTGTTCGTATGTATGTTTGTTTTTG TTATTTATCGTTGACATAAAAACAAATAGCTACTAGGCTAATACAAGTCA ACCTATTTACAACTTATATAGTTATTAAATGAAGCCGACACCATCAATGT ACACTTTACATATTCTACATGGACATAACGTTGGTTTCCAATGCTTAATT TTGTCTTTAAATTCCTTAAGGTCATTAAGATGTCATTTACTTTTTTTTAG AAAACACACGATCTGCTGAAGAAAGCCTGGGATGCTGAAGGCTCGCCCTT CAAAGGAACGCCCTTCGATCCATCACGTGTTAATATGGGCGGTGAAAACT CACCTATGCCGTCCATCGAAAACACGCCCTAAGGCTTAATATCTTATCTT ATCATGTCCGAAAATTCGTTTGTGGTTGAGTGACTGTACAGTATATCAAA GTAGTATTGTCCATCAAAGTGGATGTCCATTGAATGAGTTTTGGTGGTTC TTGGACGGTAAATGAACATTGGAACGATGTCATCTGAACGTTGCATAGAT GTTGAAAGTTTTGGGGTTAAAGAAGAACGCATTCAAGAGACGTTTTTTGG ATGATATACATTTGTTTCATCAACCTTCTTTTTGAGAAGATATGAAGAGC TTGTTTCCACGGAGTAACAAAAACAGACCTTTTAAACTCAAAATGATTGC TGGAAATTCGAAACCGATTGTACGATGTGTAGAAAGTGAAAATGAAAGAA ATATGAAGTTAAGACATCTTAAAACGCGGAAATTAGTTCCCTTGAGGCAG CTCTCGGCAACACACCAGTAAACTCTGATGTTGATACTTTCTCCCTCTAG GCAACATTCCTTCATACTCATCGTTATTATTTTATAAGCATTGC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000077_pilon:544314..569307-

>MSTRG.10874.2.p2 ID=MSTRG.10874.2.p2|Name=MSTRG.10874.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1188bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:544314..569307- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAACACACGATCTGCTGAAGAAAGCCTGGGATGCTGAAGGCTCGCCCTT
CAAAGGAACGCCCTTCGATCCATCACGTGTTAATATGGGCGGTGAAAACT
CACCTATGCCGTCCATCGAAAACACGCCCTAAGTAGCAGACTTCGATCCT
CAAACACAATCAGACATTCGGAAAGTGATGTATGACCAACAACAAAAGAT
GATGGGAAAACCAACCTCCGAAGAACAGATGGAAGGGACATTCTCCAACA
AAATACGTTGCGATGAAAGTCTATGGAGCTTGTTGCCATCACAGTATATC
TCTATCTGTTTGGAAAAATACGAACCCAAATGGTGGACGCGCGTTCTAGA
AGCGGACGCAGAGATTGACAAACAACAGATCGATACTACACAACAGAAAA
CACACGATCTGCTGAAGAAAGCCTGGGATGCTGAAGGCTCGCCCTTCAAA
GGAACGCCCTTCGATCCATCACGTGTTAATATGGGCGGTGAAAACTCACC
TATGCCGTCCATCGAAAACACGCCCTAAGTAGCAGACTTCGATCCTCAAA
CACAATCAGACATTCGGAAAGTGATGTATGACCAACAACAAAAGATGATG
GGAAAACCAACCTCCGAAGAACAGATGGAAGGGACATTCTCCAACAAAAT
ACGTTGCGATGAAAGTCTATGGAGCTTGTTGCCATCACAGTATATCTCTA
TCTGTTTGGAAAAATACGAACCCAAATGGTGGACGCGCGTTCTAGAAGCG
GACGCAGAGATTGACAAACAACAGATCGATACTACACAACAGAAAACACA
CGATCTGCTGAAGAAAGCCTGGGATGCTGAAGGCTCGCCCTTCAAAGGAA
CGCCCTTCGATCCATCACGTGTTAATATGGGCGGTGAAAACTCACCTATG
CCGTCCATCGAAAACACGCCCTAAGTAGCAGACTTCGATCCTCAAACACA
ATCAGACATTCGGAAAGTGATGTATGACCAACAACAAAAGATGATGGGAA
AACCAACCTCCGAAGAACAGATGGAAGGGACATTCTCCAACAAAATACGT
TGCGATGAAAGTCTATGGAGCTTGTTGCCATCACAGTATATCTCTATCTG
TTTGGAAAAATACGAACCCAAATGGTGGACGCGCGTTCTAGAAGCGGACG
CAGAGATTGACAAACAACAGATCGATACTACACAACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10874MSTRG.10874Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10874.2.p2.exon7MSTRG.10874.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10874.2.p2.exon6MSTRG.10874.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10874.2.p2.exon5MSTRG.10874.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10874.2.p2.exon4MSTRG.10874.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10874.2.p2.exon3MSTRG.10874.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10874.2.p2.exon2MSTRG.10874.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10874.2.p2.exon1MSTRG.10874.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10874.2.p2MSTRG.10874.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000077_pilongenomesc0000077_pilon:544314..569307 -