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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000073_pilon:933013..938530- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10529.1.p1 ID=MSTRG.10529.1.p1|Name=MSTRG.10529.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5518bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000073_pilon:933013..938530- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGTACAATGAATTTTCAGAACATTAAAAAGTACCCTAAATTTCGAATAT
GAAATAAAAACAAACAATTTTCTGCAAGACAATTTGTAAACCTAAGACAG
GTCTTCTTCAGTATGTGGAAAGTACGCTTTGATTCATGCAAGGACAAAGG
TAGTTGCCAAGTTTGCATGAAGGTAAGTTTATTTTATATTCTCATTAAGG
CTTTCCCCTCACGAACTGACATATTAAAGTTTTTTTCTGGAAAGTTCCAT
GTAGATAATTATGTAGAAGGATATAACATGTGTAATTTTCATACTCTGAC
TCATCAATATATCAGTAGTAGTGTCTCCAATATTCTTTATCGGTTCTTTG
AAGGTCTTACTTTGCCTTACGTTCTACGTTTAATGCATTTAAACAGATTG
TAAAAGATTTTGTTCTTGCAAAAACCCTAAATCCAAAAACCCCTCGTTGA
GATTACTGTAAACAAAGTTTGGCCAGAATTTCATCATAAATTGCTTTGTG
AATAAACATTGTTTTTGAATGAATGGAATTTTAAAGAAAATTCTAGGGCC
GTTGAAATTTATTTTAAATTTCGATCGAACAACTTCTTTAAGCTGTAACA
CAAACAAGAGTTTAAAGCCTACGCACGGAAACACGAAATAAAAACCTAAC
CAAACCAAACCTTGACGCCCCCACCCCATTTCCTTATGATGGTTTTATTA
CAATCTTTAACCATAATTAGCTGATTGTAATTTTCTTTTAACGTTGGGTC
TTTAAATTACTATATCACTTTAATTTTGCAATGTACTTTTAGCAGTTGCT
AATTGTTTTGGTTGTTCTTACTATAAAAGACGAAGACAAACATTATACTT
ATTCAGATTTGAAGGATTAGAGTGAAATTAATTAAGTTTGAAGCATTTTA
GACGCCTTAAAATCTGTCTGAAACTCTTTTCGTGCAAGATCAAGATTTCC
GTTACGACAGACAGACATATGTCAGATTACTCAATATAGCGTTTCCGACA
TCTTTACTTTTTGTCAATGACAAATTCTGTTTTTGAATGATAAGGACTTG
TCATGGCTATTGTGAAGCCTTTGTTAAAATGTATGGAGTCATGTAGTGTT
CTTTTTAGGTAAATTTAGAATAGCTTGTAGGAGTCTAGCCGCTTTCTCTG
AAAATAAACTGGACTGGCTCGTGTAGCCCACTCAACTAACAGAGTCGCTT
TCAGGCTACATAGCAACTGAATAACCCTATCATTTCTTTTTGAAGACTCA
ATTCGAAGTTTCATAAAATTGACAATGGCCAAGATCCGAAACTGAAATAC
TTACTGGGATGAAATTTATAAGCCGTGCTCTCTCTCGAAAAAGTTGCATG
GAACTGTATAGTAAGCTGATATCAAATGTTTTAGATTTGACAGGCCTGCC
CGACTTATTTTAGCTGTGTGAATATTTATGAAATTCGAGAGGAGGTTTGA
AAAGTGAGACGGGAAAACTTGGTGGTCGATATCATACCACTATTTTAGAT
TTTACCATATTTGTCAAAATAAAAGAAACTGCTTACTTTTGTTGTTTGTA
GTAGTATAGAATTTACAACATGAGACTTTCATCTGTTTATCATGCTCAGC
TACACCTCCTTCATGTGGAGTTGAACCTTTATATAGTTTTCTAATGGGGA
GTGTATCAATCGAATTTCATTCCCTGCTATCTTTTGTCTAAACAACTCTG
TTGGTAAGCTTTGTGCTGTGCTGGAGTGTAGGATGGAAGAACGCGAAGGT
TGTCCTTTCACCATTATCCTTTCTCAAACCCCAAAAACAAAATATTTCAT
TTTATTTATCATCCTTTTTCTTGGCAATACTTTGAAAGTTTATCAAACTC
CGGAAAAGCCACTTTAAGCCCTATCATCAAGAGCACCCATTGTATTTTAT
TGAGCAAGAATTTTTCTTTTCAAGTATTCTTGTCTAAAGTTATGATGGTT
TTTCCTAGATGACGTTTTTACAACTTCTCAAGCAACGTAATAGACGACGT
AATACAACATTTTTGATTTCTTTCCCATCATAATACAAGATCGTCGTGAA
TTCGATTATGTATTTAGTCCACATTCTTTCCCTAGCAAGAGCGAATAATT
AAGATTAATGATTATTTAGCAGTAATTTCTCCTCAATTATTTTATGGATT
ATTATGTAATGTCGCAATATTAACTCTCACTACAATTCTCACAAAACCTT
GACTTCCTGTCACAACAACCTTGTGTCTCCAAATGTTTTATTTTTACAGC
TTTTCCGAGATAAGGATTTAGCTGCTTTCCTTTGAACCTGTATTGAACTC
AGTTATTTGTTGTATTCAAGTATTCTTATCCGAATTCGCTACAAATCCAG
TGAGAAAATCACTGCTAAATATACTTTTTCTCAAACAACTTAAAAGGTTG
ACCTTGCCTTGTTACTTTGACAGGTCTTTGCATGTTTTAGCCACCAGTTT
TGAATGTTGTCAATAAAAGAAATGTCTTTGTAGTTACCACAAACGACTTG
TGATCGCCAACATCAATTTGAAAAACATGCTCTATAGACGTTTGCGAATA
ATTAAATTGTTGGAAATGATTGATTGTTTATAAGTTTGAAGATTCTTTGT
CGAACCGCAAAAGCCATTTTAATTAAAAACTTCTGCTCCCGATGCCAAGA
ATTTTTCTGATGTTTAGAAAAGTCCAGAAATTTCATTGGTAGCATTATTC
ATTTAGTGATATGATATTCTTTGCAAATTCATCGCTGTTAGAAAAGTAGA
CGTAAAAAAGATTAGAGCATCGAAAGTGTCAATCTCAGCGATTTTGTTTT
CTTTCCGGTCCTTGAATTATCACTATCTGCATTTTCTGTGATTTTGCTTT
GTTTGCGCGAATTATTCTGCTTTAAGCCATAGATTTTGCTTTGTTAAGTC
ACAGAATTGATTTAAGATTCTAGCAAGATTTTTAAAACATTGATCCTAAG
AATCCAAACTTGTTTTTTGTCTCTGTGATGTCACTTTCCAAAGACGCGGT
ATATAAAGGAAGGAATATTTGATTCTAAGAAACGGATTTGATGATCCTTA
TTCTATGGAAAATTTCCAGAACAACAACTTGAAATCTTTTTCTCTTGAGT
TTTGTTTATGCATACAAAGCTTTACATAATAACAGAGTTGCATTTTTAGC
TTGCAATGCCAACTCAGCATTAGATTCAACAATGTAGTAGGGTCGTTCTA
AAATTGGCTGAGTTTTGCATTAGATAAAGTGAACCCGCATTTTCTGATAA
TCTATCGCAGATAATCTTGATCAAAAGACTTTTTTTCGATCAACTTAATT
TTGTAAGCCTCTTTGTTGTATGGAAAGACAAATGAGTAAATGACGAATGT
AATTTTCCGTCACTGTTACATCACAATCGTTCGACCGCTAGACCAATATG
GCGGTCAGAGCAGCGATTGTCGTAACTTGTAGTACGTGAAAGGGTTGAGG
AGAATGGAGTTTTTATTGACGTCTTTTCAAATGAAAAAGTAATGATATCA
AAATGTTATGTTGTGAAAGTTTTATTAAGAAAAAAAGTTTAGTCAAAAAT
AGCGCTTGGAACTGTGATTTGCGTAAATTTATCTTGAACTTTGTTAAGAT
TAAAGTTATATGTTTTGTGTCAAAAGTCATGACGCTTTTAAGCAGGGGAC
AAATTTGAAAATTATCGCTTTAAAGTTTCTGTTGATGTTCACATTAACTT
GATGCTTAAATCAACATAGCGAACAAGGTTATTTGCCGAATAGCAAAAAG
CACGATCGGCTGTAGCTTTTTCACAGGACCCTCACAAGAAACCAATAACA
ATAAAAATGTATTTGGCTTCATGGCGAAGCAAGACAAAAAACATGTAATG
TTGATCCATTGTCTTCGGAAAAAAAAGTAATTAAAACCCCCTTAATTTAT
CCTTCATCATTTCATAAGAGAATTTCCCCCGTGTTTCGTTTCGATCGTCT
TTTTTGATTGACAGCTCGCGATGTCAATTAAGAATGATGTCATTTTGATG
TGATGAGGGAATAAAGAGATTGTACGTATATAAAAACTGTGTTACAACAA
GCTCCTCATTTTATTTACAAGGAAGCACAAGTACAGAGAAGACGTGGTGA
AAAATAACATTTATATAACCAAGTGAAAGTAGAGAAGGAAAATTTTTGAT
CAACATGTACGATCATAAGAAGTTGAGCAATCAACTAGAAACTTTATCCA
ATAATAATATGAACGCAAAGAAACCCATTCGAATTGTGGTTCTTGGACAG
TGTGGTGTTGGGAAAACAGGTACGTTCAATTCCTTACTTTTCTTCACATA
CTTGATTCTTTGTTTTTAAGTTCTCTATTAATGATTTACTTTTCATTCAG
CTTCTTCGAGTTTTGTCAGATGATCTTATTTTTATTTTTATTTTGTTCCT
GCTTTGAAAATTGCTTGATTCAAGTACTGTATTATCTTTTGACTAGACCT
TTCATGAGTGGAATTTCAATGGCAAGTCTTTGGCCTTAGCTTTCATAAAT
TGGAGTACCCAGGTTTACAGACCTTTTTTGAAATTGAATTTATTTTTCGT
TCATTTTAGCATTGGTTTCGAGATGTTTACAAAATACGTTTCCACAAGAC
TCTTCATCGGGTAAAGACATTTCACATCGATACAACATGACAATCAATAA
AAAGAAAACCGTTTGTCTCGATATTGTCGATTTCAACGATAAAAACGACG
CACTTATCAGTTGTGCAGATGCTTTTATTATTTGTTACGCGATAAACGAT
CGAAAAAGTTTCGAAGCTATCGATGCTTATTTGGACAAAATTGTCGAGGC
TAATATAAAAAGTCCTAAAATTGGAATTGTTGGAAATAAAATTGACTTGT
ATAATGATAGAGAGGTAACGTCAACAGAAGGACTCGAACTAGCGAAAGAA
ATTAACAGTTTATTTTATGAAACGTCAGCTAAAGTTCCCGTTATAGATGT
GCGTCAAGTGTTTTATGATTTATATCAATCTAAAGAACGCTAAACGATCC
AAGAAAGGTAAAAGAGGAAGTATTGAACTTGAATCTTCAGACGTTTTCAG
TCTACTGAACTATTCCATTATTAATAATTCGGGCGTCATTGGGCGGTCAT
CAAACAGCAGTTGTTTCTCAGCTTTACTTAGCGCCCGAAGGAAAAAGTCG
CCCCCACCATTATTTGGACGAAGCTGGTCGTCAGAAAGTGTTTAATTGTT
AATTGGTTGATTTTCTGATTTAAACGGTCATGTTTTGGCAATTGCTTAGC
AGACTGACTGTCTATCAAAATAATTACACATACATAAACTTCTAACCTTG
ATTTTGTTTTGATTTGTTCCAATTTGAGGATGGTTACCTAATATATCTTT
TTTTGTTTTTGTTGATTTTTAAATTTAAAAAAGAAATATAGAATTTTATT
AACGGTTTATAAAAGACATTTAATTTTTTGTGTAAATAACAGAGTTAATA
TTTATTTATCGGTATTTTATATATATATATTCACGAAGAAATAAAAAGAC
ATCGCAAATAATAATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000073_pilon:933013..938530- >MSTRG.10529.1.p1 ID=MSTRG.10529.1.p1|Name=MSTRG.10529.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1098bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000073_pilon:933013..938530- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATTGGTTTCGAGATGTTTACAAAATACGTTTCCACAAGACTCTTCATCG
GGTAAAGACATTTCACATCGATACAACATGACAATCAATAAAAAGAAAAC
CGTTTGTCTCGATATTGTCGATTTCAACGATAAAAACGACGCACTTATCA
GTTGTGCAGATGCTTTTATTATTTGTTACGCGATAAACGATCGAAAAAGT
TTCGAAGCTATCGATGCTTATTTGGACAAAATTGTCGAGGCTAATATAAA
AAGTCCTAAAATTGGAATTGTTGGAAATAAAATTGACTTGTATAATGATA
GAGAGGTAACGTCAACAGAAGGACTCGAACTAGCGAAAGAAATTAACAGT
TTATTTTATGAAACGTCAGCTAAAGTTCCCGTTATAGATGTGCGTCAAGT
GTTTTATGATTTATATCAATCTAAAGAACGCTAAATGTACGATCATAAGA
AGTTGAGCAATCAACTAGAAACTTTATCCAATAATAATATGAACGCAAAG
AAACCCATTCGAATTGTGGTTCTTGGACAGTGTGGTGTTGGGAAAACAGC
ATTGGTTTCGAGATGTTTACAAAATACGTTTCCACAAGACTCTTCATCGG
GTAAAGACATTTCACATCGATACAACATGACAATCAATAAAAAGAAAACC
GTTTGTCTCGATATTGTCGATTTCAACGATAAAAACGACGCACTTATCAG
TTGTGCAGATGCTTTTATTATTTGTTACGCGATAAACGATCGAAAAAGTT
TCGAAGCTATCGATGCTTATTTGGACAAAATTGTCGAGGCTAATATAAAA
AGTCCTAAAATTGGAATTGTTGGAAATAAAATTGACTTGTATAATGATAG
AGAGGTAACGTCAACAGAAGGACTCGAACTAGCGAAAGAAATTAACAGTT
TATTTTATGAAACGTCAGCTAAAGTTCCCGTTATAGATGTGCGTCAAGTG
TTTTATGATTTATATCAATCTAAAGAACGCTAAATGTACGATCATAAGAA
GTTGAGCAATCAACTAGAAACTTTATCCAATAATAATATGAACGCAAAGA
AACCCATTCGAATTGTGGTTCTTGGACAGTGTGGTGTTGGGAAAACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000073_pilon | genome | sc0000073_pilon:933013..938530 - |
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