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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000073_pilon:533444..543126- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10499.1.p1 ID=MSTRG.10499.1.p1|Name=MSTRG.10499.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9683bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000073_pilon:533444..543126- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTCAGACTTTCTGCTTATGCTTTATTCATTCTTTCTTCAAAATTGGTAAG
GTTTTATTATTTTCTTTCTGATCAAAATCATTTTTATCTAGCCAAAGTTC
TAAGCTAAAAGTATAATTTTGACTTTAAAAAGATATTAGCTTAGCATAGC
AGTTGCAAACAAATTTGGTAAAAATATGCTTGCCTTTTTGTGAAAGATTT
TTTGTATTCCTAATGGCAAAAGACAGTGTAGCTGGAACCTCGATATTCCA
GGATTAGAAAAAGCTATACCTGTTATCTTTTTTCTTTAAAGAATCAACAA
GCCATCAACATTGATTGATACTACACACATTTCCTCAGAAACTTTTAAAA
TTATCCGCCATTATGACTTTCTTGAAGCCGTTCCGAAATTAACCAATCGG
GTTAGGTATCGGAATTCCTATGGGAGTTCTTTTCCGAGATTTGTAAATTA
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TGTTATAGGGTGGTCAGGCCAAAATTTTCCCCTCAAATTTTGAAAACCAA
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GGCCCGATGACTGTTAAACTTTAGCCTATCGCTAATGAGCTGGAAATGAT
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AATTTCTTCTTTTTTCTCGATTTAAAGACGGCCCGTAGATTATCGAAAAG
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AACCGCGAGTCTATAACTAATCCAGCTCATTAGCGATAGCCATTTGAAAA
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CTATTTGTATCTCTCAGAAAATAAACACTTACAGAACGACATAGTTTCTC
ATTTGGAATACCCCCGTGTTTGGACCATTCTATCGTGGGCGAAAAATAGG
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CAAACCCAAAGACCAAAAGATGTATTTTGTTGTGTTGAGAATAGATCATG
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AAAACTCTAATTTTGATCTTCCTTAAGGTAAAGAGGTTGCGAGATTTGGG
TTAGCGAGGCAAAAATCGCTAAAAAACTGGTAAAATCGTAATCCTAAAAA
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ACCTCATTTCACTTTATCGATATTACGCAAACGGCAGTGTGCGCTAAATA
TTCTTGGTTTCGCTTTCGATTACAAGCAAAGGTCTTAGCAACAGGGCGCG
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AAAATACCGATCATCATATAGAGCACTAAAAAATACCCCCTTTCTATGTT
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CGTCCGCTATCAGCCGCGCGGTAATCTTTGTCCGCTTCAATTCTTAGATA
ATGAATAAGAGAGGTGCGCTTAGCTAAGCTGTGCTCGCGGGCGATAAACT
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AAAGCTATAAGAGGTTCATTACTTGTGGATTTTAAAACCTACATAAGCAA
AAACGAAAGTTGTTGGGATGGAAGGAGTAAACGCAAGACAGAAGGTTTGG
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AATAAAAGTTATCACGGAAAAGGACGCGAAAAAAAAAGACATAAGTGTGA
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AATCAACCTGAATAAATGCAATCGAAATTCCAGAGAACTTCATAATTCCC
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GCTGAGTTTTAAACGAATCGTCAAGTTGAAACGAACGATAAATGTATCAA
GGTCTGTTTTATTTACCCCCTGGTGACTTAACAAAAGAGACTTAACTCGA
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TGACCTAAAACCAAAGCACAAAAAGAAGTGGCTTTCGCGCGTTCTGATTG
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TTTACACGTTTCTCGTCGCAAAGATTTGTTCCTTTTGCGGTGTGAAAACC
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TGCTGTCCCATGTTTTGTCAGATAGTTCCACAAGTTAGAGCTGTTGATGG
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CTTATTACGGACATTCGTGCCCAGTTCCAGACAATGTCTCTCTTCTTATA
CAAAACCTAGCAAACTTCCACTTGAAATTTTTATGAAAGCTGAAATGAAT
TATATATCAAAATTTAATATTCCATAAGTTGGTCTAATGTTGATATCCCT
CCTATAATTTCAACACCCTTTAAAAGAGATTCGATTAATAGGGCATAATT
GTAGTTGAGTTCCGACACGGGATTGTAATTCAATCCCAACGAAATTTTGA
AGAATTTTTGTTAAGAAAGAAGAAAAATGGCAGGACTGAACTGCAAGTAT
ATAATATAGTATTTGGCGGGACTGAACTGCAAGTGTATATAGTATTTGGC
GGGACTAAACTGCAAGTATATATATAGTAACTGAACAATAACTTTCCTTT
TGTTAGTTTACTCTCTTTAAAAGAAGGATTGGCTGCTTGAACTTTGAAAA
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TGGTGTTTGTGTTTTTCTACTTGGCTTTTTAAACTTTATGTCTATTGGTT
TTTGGTTCTTTTTTGCATAAAATTTTCATTTCTTGACAGAATGTTTGATT
GGTTTGACTTATATATTTAGAAAAATTCAAAAAAAACCAAAAAACGTATA
ATTATAAAAATATTAGTGCCTTTATATGTTTCATCTTTATTTTATTTAGT
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ATAGTAATTGGTGGGACTGAACTGTAACAATAGATATAGTAACTGAACAA
TAATTTTCCTTTTGTTAGTTTATTTAAAAAGTCCATACCAAAGATACACT
ATTATAATTTAAAGCCCATTACCAATTATTGCCCGTTCTTTAAAAGCATT
ATAGAAAGGGGTTATTCTAAAGAACGGAAGATACACTGTTATAATTTAAA
GTCCATTCCCAATTATTTCCTGTTCTTTAAAAGCATTATACAAAGGGGTT
ATTCTAAAGAACGGAAGATACACTATTATATCTGATAGTGCATACCCAAT
TATTGTCCGTTCTTTAAAAGCATTATACCTTAAGGGGATTAATTTTCGCG
GGGATTATATTTCGCGAATTTCGCGAGTTTTTTCGAAATTCGCGAAAATT
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ATAATCCTCGCGAAAAATTTAAAATCATGATTTTTGCCTGAAACCCTAGG
AAAATGAAAGAAATTCGGTCAAAAAGGGGCTGATTCGCGAAATTTTATCC
CCGCGAAAATTTAGAATTCCCGTCTTCGCGAAAATAAGTCCCGCGAAAAT
TAAATTATTTCGCGAAAAAATTGTCTCGCGAAAATAAGTTACCGCGAAAA
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TATACAAAGGGGTTATTCTAAAGAACGGAAGATACACTGTTATGATTTAA
AGTACATTCCCAATTACTGCCTGTTCTTTAAAAGCATTATACAAAGGAGT
TATTCTAAAGAACGGAAGATACACTATTATATCTTATATTCCATACTCAA
TTATTGGCCGTTCTTTAAAGGCATTATACAAAGGGGTTATTCTAAAGAAC
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TTTAAAAGAACTATACAAAGAGGTTATTCTAAAGTAATAGTACCCATCGA
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CTCTACGATCACTAAGCAAAGAAAAAAGTTTCCATTAGCGATTCCAACCT
TCATACCTTACCTTCAACCTTCATTCCTAACTCTAAAAAGGGTGTCGCCG
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GTGCCATATTTTCATTAATTGCTATCCAATATCAATTGTTTTATTTTGGT
TTTATTTTGTCCAATTAAATAAAGTAAAGCACTTTCATCTAATGCCAGCA
TACAGCTAGGTATGATGAAACTACAGGTGGCATGTCGATGATAGAGAAAT
CTACGGTATTGTCTAGATTTCCCAAATACTAATTGAGGGCAAAATAATTA
CTTTCTTTAATTCATACTGGGTGTCCCAGAAAAAACCCTTCTTTAAGGTG
AATTTTCTTGAACTTTTAAGGAATTAATTCCTTTCATTGCTAAAACATTA
CTTTTCAAAAAAGTTAAGAAAGGTGAAAAACAAGGGTAGTAAATCATCAT
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TCATTTGTGGCCAGTTTCCAAAGGTGGTCAACAATCGAGGAGATGTTGAG
TGGCCCCCAAGATCACCCAATCTCACTGTATGTGATTTCTTTTTGTGGGG
TTACATGAAACAACAGATCTCGCAGCAACACTAAAATTCGCATTCCCAGA
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AAATGACTCCTCATAATTTAATTTTATCCTTTCTTTTTCCAATGCAAAAT
GATCGATTCTTTCAGATTCTTTAATAACAGTTGATAGAACTCGAGAAAAT
TCACTTCAAAGTGGCACAGAAAACTAGGTATGCCCACACCCACTGTTGTT
GAAGCTAATGCCGTCATAAAAAATAGGGAAGATGTGGGATGGTTGTGTTA
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AAGAATAGACATTTGAGAAGCATCTCCATATACAATTTATAATTGATTTT
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CTTGCAAAACATTTTTAAAAGAGGAATCAGTACCACTCTCAGGTCTCAAG
CTTTCAATCAACCAACAACTTCAAAAGAAATGCTGAGAGCTGGAGGGATT
GCATCCATGTATAGACTTCCGATCCACAAGAATACTGAAGGTAGAAAGGT
TTTTATATATATCCTGAAAATAAGTATAATAAATGAATTTGTTTTTCTTT
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ATTCTCAACATATAACTCTTTTTTTATTTTTCAAGATCTTGATGTTTGTT
TTGTTGGTATTCCTTTGGATGTTGGTGCCAGCAACAGAACTGGCACAAGA
TTTGGCCCAAGAGCTATTCGAACTGAATCAGTAATGGTACGCTCAATAAA
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TTCCAAAATAATATAAATCTTCATTGATACTGCTTTTTTTTTTTTAGGTG
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AATCAGTATAATTTAGAAGAAGCTTGTGGACAGATAAAAGTTCAGTATGA
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CTTTGACTTACCCCATTCTCCAAGCCATACATGTAAGTGCACGAAAATCA
AACATACAGACTTCATACAAATTCGAAAAGGATTGCTAAAAAAGAAATAA
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CTACAGGAGAAATATGGTAAAGTATGTCTGGTTCACATCGATGCACATAC
TGATTTATATGGACCATTTTATGGTAGCAAAATATGGCATGGAAATCCTT
TCGGTAATGCTGTTCAGGAGGGTTTGTTAGATTGCAACCGCACTGTTCAA
ATTGGTCTCCGTGGTTCTGGATATGGTGATGACTATGATGTTCCACGTAA
CCTTGTAGGTTTTATATTCTATTTTTCATTCTTCTTCTGTTATCAAAAGA
ACATTTCTTCGTGAATGAAGACCAGTATTAATTATAACACTTTCAATAAA
GTTAGTTGCTAAAGTCTTACTTATACCATAGAATAGAAAGTAATGTTAAA
ATGTTGTTTAGGGATTTCGAGTAGTTCCAGCGAAAGATTGTTGGTGGAAA
TCAATGACTCCATTGATGGAGGAAGTTCGTGAAATGATTGGAGATCGACC
AGTTTATCTGTCTTTTGATATAGATTCACTCGATCCTGCGTATGCTCCTG
GGACAGGTATTTCTTAGGGCCAAGTAGTCTATTAGCATTTTCTGAAGTAT
CTATAACCATTGAATTTCATATATACCCGAACACAATTCTTGCAATGAAT
AATTATTCCTTATTTCATTTTACTGCCTGTTTCCATTTTCACTTTCATAA
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TATGTTTATATTTATATGTTATATGTTATTGATATTGATATGTTATTATA
TATTACTCTATGGTAGATATGAAGAAGTATCCTACAGCCTTTTACATGTG
CAAAGCATGACACTTATCATTATCAAAATTATTGGGTAGGGAAGAAAATC
GATATGAATATCCGCAGAATTTTAACCTTTTTAATATATTTTTTATAGGT
ACACCAGAGATAGGAGGATTAACATCAGTTCAAGCCATAGAAATCATCAG
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GTCCCTATCATCCCCAATTCTTCTCTATAGTGACAAATAATATGGATAGT
AGAAGCTATTTGTAACAGCTGCCAAAGATCAGGAAGTGGAGATAACATCA
CTAAATTATTTTCTCGTCCGTTTTTAGGTATCGCCACCTTACGATGTAGG
AGGAATGACGTCTATTCACGCTGCAAACTTGTTGTTTGAAATGCTTTGCA
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ATGGGGAACATATTGTTAGGCGCACGCGAAAAAGTCATCTCTTTTTAATC
GCATACGTCATTTTATTTAAACGCACAAAAACAAATGCACCATTTTAGAG
AATATCTTTCAAATTTTATATTTTTTTCATAGTCATGGGAAATATTTTTT
TTCAAAACAGAAATTTGAATTATTAGAAATTTTTATACATTTTATACATT
TATACAGATTGTAAATTTTAATCATTTTTGAAGCCGAAATATAGAAATTC
ATACACACTTATTTGATCTTAAGGTGGTAGTCTACCCAAAAATAAAAAAT
CATCGAAAAAATTGTCGAATTCTGGTTTTTGGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000073_pilon:533444..543126- >MSTRG.10499.1.p1 ID=MSTRG.10499.1.p1|Name=MSTRG.10499.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6993bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000073_pilon:533444..543126- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTATCGCCACCTTACGATGTAGGAGGAATGACGTCTATTCACGCTGCAAA CTTGTTGTTTGAAATGCTTTGCATTCTACCAGGTGTCAAGCACAACGAAT GAGTACACCAGAGATAGGAGGATTAACATCAGTTCAAGCCATAGAAATCA TCAGAGGGTGCAAAGGATTGAATATTGTTGGTGCTGATTGTGTTGAGGGA TTTCGAGTAGTTCCAGCGAAAGATTGTTGGTGGAAATCAATGACTCCATT GATGGAGGAAGTTCGTGAAATGATTGGAGATCGACCAGTTTATCTGTCTT TTGATATAGATTCACTCGATCCTGCGTATGCTCCTGGGACAGGAGAAATA TGGTAAAGTATGTCTGGTTCACATCGATGCACATACTGATTTATATGGAC CATTTTATGGTAGCAAAATATGGCATGGAAATCCTTTCGGTAATGCTGTT CAGGAGGGTTTGTTAGATTGCAACCGCACTGTTCAAATTGGTCTCCGTGG TTCTGGATATGGTGATGACTATGATGTTCCACGTAACCTTGTGCTCGCCC ATTTGAAAGCTTTCAAGTTGGAGATGTTGGAGATGTCTCCTTCAATCAGT ATAATTTAGAAGAAGCTTGTGGACAGATAAAAGTTCAGTATGATGAACTC ATAAAAAATGGGTGTATTCCACTTACCATGGGAGGAGATCACACTTTGAC TTACCCCATTCTCCAAGCCATACATATCTTGATGTTTGTTTTGTTGGTAT TCCTTTGGATGTTGGTGCCAGCAACAGAACTGGCACAAGATTTGGCCCAA GAGCTATTCGAACTGAATCAGTAATGGTACGCTCAATAAACAACGATACA GATGGCATTCTTGCAAAACATTTTTAAAAGAGGAATCAGTACCACTCTCA GGTCTCAAGCTTTCAATCAACCAACAACTTCAAAAGAAATGCTGAGAGCT GGAGGGATTGCATCCATGTATAGACTTCCGATCCACAAGAATACTGAAGG TATCGCCACCTTACGATGTAGGAGGAATGACGTCTATTCACGCTGCAAAC TTGTTGTTTGAAATGCTTTGCATTCTACCAGGTGTCAAGCACAACGAATG AGTACACCAGAGATAGGAGGATTAACATCAGTTCAAGCCATAGAAATCAT CAGAGGGTGCAAAGGATTGAATATTGTTGGTGCTGATTGTGTTGAGGGAT TTCGAGTAGTTCCAGCGAAAGATTGTTGGTGGAAATCAATGACTCCATTG ATGGAGGAAGTTCGTGAAATGATTGGAGATCGACCAGTTTATCTGTCTTT TGATATAGATTCACTCGATCCTGCGTATGCTCCTGGGACAGGAGAAATAT GGTAAAGTATGTCTGGTTCACATCGATGCACATACTGATTTATATGGACC ATTTTATGGTAGCAAAATATGGCATGGAAATCCTTTCGGTAATGCTGTTC AGGAGGGTTTGTTAGATTGCAACCGCACTGTTCAAATTGGTCTCCGTGGT TCTGGATATGGTGATGACTATGATGTTCCACGTAACCTTGTGCTCGCCCA 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CTGGATATGGTGATGACTATGATGTTCCACGTAACCTTGTGCTCGCCCAT TTGAAAGCTTTCAAGTTGGAGATGTTGGAGATGTCTCCTTCAATCAGTAT AATTTAGAAGAAGCTTGTGGACAGATAAAAGTTCAGTATGATGAACTCAT AAAAAATGGGTGTATTCCACTTACCATGGGAGGAGATCACACTTTGACTT ACCCCATTCTCCAAGCCATACATATCTTGATGTTTGTTTTGTTGGTATTC CTTTGGATGTTGGTGCCAGCAACAGAACTGGCACAAGATTTGGCCCAAGA GCTATTCGAACTGAATCAGTAATGGTACGCTCAATAAACAACGATACAGA TGGCATTCTTGCAAAACATTTTTAAAAGAGGAATCAGTACCACTCTCAGG TCTCAAGCTTTCAATCAACCAACAACTTCAAAAGAAATGCTGAGAGCTGG AGGGATTGCATCCATGTATAGACTTCCGATCCACAAGAATACTGAAGGTA TCGCCACCTTACGATGTAGGAGGAATGACGTCTATTCACGCTGCAAACTT GTTGTTTGAAATGCTTTGCATTCTACCAGGTGTCAAGCACAACGAATGAG TACACCAGAGATAGGAGGATTAACATCAGTTCAAGCCATAGAAATCATCA GAGGGTGCAAAGGATTGAATATTGTTGGTGCTGATTGTGTTGAGGGATTT CGAGTAGTTCCAGCGAAAGATTGTTGGTGGAAATCAATGACTCCATTGAT GGAGGAAGTTCGTGAAATGATTGGAGATCGACCAGTTTATCTGTCTTTTG ATATAGATTCACTCGATCCTGCGTATGCTCCTGGGACAGGAGAAATATGG TAAAGTATGTCTGGTTCACATCGATGCACATACTGATTTATATGGACCAT TTTATGGTAGCAAAATATGGCATGGAAATCCTTTCGGTAATGCTGTTCAG 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000073_pilon | genome | sc0000073_pilon:533444..543126 - |
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