MSTRG.10361.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10361.1.p1
Unique NameMSTRG.10361.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000072_pilon:85403..106949+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10361.1.p1 ID=MSTRG.10361.1.p1|Name=MSTRG.10361.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21547bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:85403..106949+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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accctagtaccccccccccccggggtctgTATCTACAAATTAGGCATGTT TAATTCGAAACGAGTTCAAAGCTATGTAGCGAAGTGAGGTCAACTCTCTA CCGCAGGTAGCTGTTTAAGGCCTATCCTGTCCTGTTCGAGTTAAAGGAAC CGCAATCTTTACATAATATCACCCAGCTGGAGTCGTTcatgttttcttct tctttttttttccataGGGCATTGTCTTTTATCCGTGTTTTCTTGGAAGA AGTAATGACAGGCGAAGAGGATTTAGTGAAGTGCGCCAAAAAAGCTTACG AAAATTCACTCAAACAATTTCACGGATGGATGGTGCAAGGAATTTTCTCA GTAAGTCTAATACATCATCGgtcttatttttatattttttctggtTCGGT GCAATTATAAGCACTAGCAAAATATCGACTAAATAAAATCTGATTGGCta ccaacctcgttcccaggcgtattatcagcttttttatgcttactgataac GCTAGATAATTTTTTCTCTGGCgccaatcagtaacgtaaataaagcctgg aatacacggggacaaGGTTGATTGGCTGTATTTAAATATCGACTCGTCCT CAGAAAATTTCGTTAAAATCAAGAGTTAATTTACTAGatttttttcgtgc aaattacaTGGATTCGAAGACCCATGTAATTCGGGCTCTACCTTTTTGCC CAGTTAACTTTGAGATCTTACGATTAGCCTTTgccaattttttcttgaaa gttttAGCTCTATAAATTGTGAATTCAACAGAAAGCTGTTAATTATAAAA TATGCTTACAGTTTCAGCCAACAACTTGCTGTCTAAATCTCAATTATATT CTTGCATACCTACTTTTCTAGAAAGAGCAGTTTACTTTAATGGTAAAGAT TATGATAATGCCTATACACGCCCtttttataaaacaattttataacaaCA CGAGcctgaaaattgaccaaaacctaagaacaaattaagaacaatctgag cctcagatttcagaaattactaagacaatacatgttttttggacctatcc CGGTGGAGGTCCCATAAATTAATCTCTGTCcattcgttcgtccgtccgtc cgtccgttcgttaccaacttttctcgagaatggcttattagttttttctg atttcttgcacaaagatgtgtaactataaacccttcgAATGTGACGgggc cgattttcgaaaaaaaatatcttttgggcaaatttgggccaaaaaacggc taaaaaacgggttttttggactttgaatcactattaataagcatacataa ATGTTctcagccaaattactcaattttttgatgagatagatgtttttttg ctcacgaagtcttgaatatgaaagaacatttcaagagcatgacatttttg tttctaaacgtttttttataagaaacaaacgactaattttgatagatcgt cactatttgtgttctggaACGTTATGCTTAGAAACGTTATGctcgaaaga aaaaacattttcttattttaagtaaagaaactaagcgtttaaagaacatc gtaagaacaaaatataagCTTATTTGTAAcatattgaataatttttaCTT TAAGACTTAAATCTTTatctttctaaaatatttttagttggCAATGAAAG CGGTACCATATCGTAAAGATTTCATGAAATCTCTTGGTCCTGATACCACC GAGGATGTAGTCTTggctgaaatgaaagaaactgtCACCACAATGGCTGC AAACATCGATCAATTGAACCAATTTTATTTGGATACTAAACAAGATAGCT CACAAAAagtttagatttttattttgactttctaTAATATACTCCTTAGT TTATTAGTATTCTCTGGCTGGCATTCTTGAAGGCTCAAAAGATTCTAAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000072_pilon:85403..106949+

>MSTRG.10361.1.p1 ID=MSTRG.10361.1.p1|Name=MSTRG.10361.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3060bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:85403..106949+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgtcttcattctTTGGCAAAGCTATCAACAAATACCAACCAATCCCAGA
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TCCCTTTCTTTGATGTGTTAGGGTCCACGGCATTTGCACCAGTCAAATCG
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CAAGATAGCTCACAAAAagtttagatgtcttcattctTTGGCAAAGCTAT
CAACAAATACCAACCAATCCCAGAAGATGGTAAAATCAACACTGatgctt
ttttgaaagcttgCAGTGAAATTGTCCCTTTCTTTGATGTGTTAGGGTCC
ACGGCATTTGCACCAGTCAAATCGGATATCAATGGAAACATTGCtaaatt
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AAGCTTACGAAAATTCACTCAAACAATTTCACGGATGGATGGTGCAAGGA
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aaactgtCACCACAATGGCTGCAAACATCGATCAATTGAACCAATTTTAT
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TGGCAAAGCTATCAACAAATACCAACCAATCCCAGAAGATGGTAAAATCA
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GTGTTAGGGTCCACGGCATTTGCACCAGTCAAATCGGATATCAATGGAAA
CATTGCtaaattacGTAAGAAGTATGACACTAATCAAGAGAAATTTATAA
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TATCCGTGTTTTCTTGGAAGAAGTAATGACAGGCGAAGAGGATTTAGTGA
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ctgaaatgaaagaaactgtCACCACAATGGCTGCAAACATCGATCAATTG
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gtcttcattctTTGGCAAAGCTATCAACAAATACCAACCAATCCCAGAAG
ATGGTAAAATCAACACTGatgcttttttgaaagcttgCAGTGAAATTGTC
CCTTTCTTTGATGTGTTAGGGTCCACGGCATTTGCACCAGTCAAATCGGA
TATCAATGGAAACATTGCtaaattacGTAAGAAGTATGACACTAATCAAG
AGAAATTTATAACACTGCAAGACATTGTGAACAGTGAAATTGAATCCAAC
ACAACCAAAGCTAAAAATTCCGCCACTGACGCTTTGTTATGGTTAAAAAG
GGCATTGTCTTTTATCCGTGTTTTCTTGGAAGAAGTAATGACAGGCGAAG
AGGATTTAGTGAAGTGCGCCAAAAAAGCTTACGAAAATTCACTCAAACAA
TTTCACGGATGGATGGTGCAAGGAATTTTCTCAttggCAATGAAAGCGGT
ACCATATCGTAAAGATTTCATGAAATCTCTTGGTCCTGATACCACCGAGG
ATGTAGTCTTggctgaaatgaaagaaactgtCACCACAATGGCTGCAAAC
ATCGATCAATTGAACCAATTTTATTTGGATACTAAACAAGATAGCTCACA
AAAagtttag
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10361MSTRG.10361Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10361.1.p1MSTRG.10361.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10361.1.p1.exon1MSTRG.10361.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10361.1.p1.exon2MSTRG.10361.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10361.1.p1.exon3MSTRG.10361.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10361.1.p1.exon4MSTRG.10361.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10361.1.p1.exon5MSTRG.10361.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10361.1.p1.exon6MSTRG.10361.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000072_pilongenomesc0000072_pilon:85403..106949 +