MSTRG.10118.1.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.10118.1.p1
Unique Name	MSTRG.10118.1.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000069_pilon:998190..1017968+
coding sequence from alignment at sc0000069_pilon:998190..1017968+

mRNA from alignment at sc0000069_pilon:998190..1017968+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.10118.1.p1 ID=MSTRG.10118.1.p1|Name=MSTRG.10118.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19779bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:998190..1017968+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTCTCTGATTTGTCTGTGATATTGGTCAATTGACGAGGAGAGATTTGGAA
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GAAAATGTATCTGTTCTTTTCTTGCCAGACTCCTGGGTAAATTTATCTGT
TCTTGAAAAGAATCAGGTTACTGTAAATTTACATCTGTTCTGATTTTAAA
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GACTCTGGACTATCGGTTTTTCGCACTCGTCTTAGACCAGGTGGACACGC
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TGACTTAGATATCAACGAGTGCTTACCTGGTAATAAGCCATGTTCACACT
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tatttggaaaaagaAGTCTTTTGTAGAGGTAAGCTTTCTTATAACAATTA
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CGAATGTCGGTGCAAATCAGGCTTCTCCAAAGACAGTTCTGGAAAATGCT
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AAGACCTCCCTAAGGAACAACCACCGGCAGCGGACCCATCAACTCCATCT
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TCAATCAAAGACACTGAAAGTATCCTCACTGAACTGAAAGAGCTACGAAA
GGGACTCCGTGCGAATGTCAAAACTTTCTCGAAATTAGCTCCCGACGAGT
ATAAATCAATTCAGCCGAGTATCCAAAATGTATTCGATCTCATCAAAGAC
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ATCTCTTCCACGAGGGAGTGGAGGATATCACACACCATCACCTAATCCTC
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GTAAAGATTTCACAGACAAAACTCCAGCTGAACGGTTATCAACACTTTGG
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ATTCATTAACCGGAATCCTTCACTACAAAGCTTCTCACGTGACATTCAAC
TATCATTCTTCACAGCCAATGGCGCCGAGCAGCCAAGCGTGGTTGGTATT
TATCTACTTCAACAAATCACTGTCAACAATCAAACCTTTACCATCTTCTT
CGACAATGGCTGCAGCGATTTTGTAATCACGAAAGATGCTGTCGAAAGAC
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ATCGGAGGAGCAACAACATCATCAAACCATGGCGTCTACACAGTCAACAT
CCCACTTGCAAATGGTCAGCTCGCAACAATGACAGGAGTTTGTCTCGACA
AACTGACACAAACGTTCCCTACGTATCAACTTGGTGAAGCGGAATCAACA
ATTCGTCAAGCATTCCATGAAAATCCATCATACCTACCCAGACTTCCAAA
ATCAGTTGGAGGTGATGTTGACATGATGATAGGTATGGAGTATTTTAAAT
TTCACCCACACATCATCTTCAGACTGGCAAATGGTCTATCAATCTTTGAA
TCCGTCTTCAAGGGTGCTGACGGTAGTCTCGGCATCATTGGGGGACCACA
TCAGTCATTTGCTGAAAGTCACAAACAACATTTTGGGCAATTCAACACCT
CGacattcaaatcaaatctcaGTTACCAATCATTGGTCGCCTTTGATACG
TCATGCTTCCATATCAACTCAATGAAGAACTTTGAAGCTTCAGAGAACGT
TGGATCAGAAATTACTTACAGATGTGTCACGTGTCGTGATTGCAAGGCAT
GTAAGAGCCATATCGAAGACATCAGCATCAAAGAGGAAGTGGAGCAAGAT
CTTATCAAGAGATCCATCACTATAAATACAGAATCAAAAGTTGTTACCGC
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ACAAAGCGCTCAAAATTTACTATCAACAACTTCGAAAGCTAAACAAGGCA
GAAAACTTAACCGACAAACAAGACATCATCCTATCCGAAAAGAAGATGCA
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AATCATTGTCAAATCAACTTCATCACTTTATACCTTGGAGAGCAGTATGG
AAACCAAACTCTGTCAGCACTCCTTGTCGAGTTGTGTTTGACGCATCAAG
TCCAACTCCAACTGGCAATTCACTGAATGACATCTTAGCAAAGGGCATCA
ACAGTTTGAACCGATTACAAGACATTGCTCTTCGCTGGAGGATCCATGCT
TCCGCATTCACAACAGATGTTCGCAAAATGTATAACACGATTCGATTGGA
TGTTAGCCACTGGCAATATCAACGCTACTTATGGcaagaaaatttatctt
ttGACGAACGTCCAAAAGAAAAGGTAATCAAGACCTTAATATATGGAGTA
CGATCAAGCGGCAACCAAGCGGAATATGCACTCCGAGAAGTCGCAAAATT
ATCATCCAACCAGTTTCCAGAAGCTGCTGAAATTGTCCACAATGATATGT
ATGTGGATGATTGTGTCAGCGGTGAGTCGTCCAAGAAACTCGCCATTCAG
CGTACACAGGAATTGGAAACAATCAGCAACGGAGGAGGATTCATGCTCAA
AGGAGTTGTCATTTCAGGTGAAGACCCACCAACATCAATGAGTGACGATG
GCAGCTCAGTCTTTGTGGCTGGTATGAAATGGTGGCCCAAGGAAGATCAG
CTATCCATCCATATTCCTCCAATGAATTTCTCAGCCAAGAAGAGGGGTAA
GAAATCAACATTACGTCTCAATCAGATTCCAGACAAGCTCACCCGAAGGC
ATTGTGTATCACGCACCGGTGAAGTCTTTGATCTACTCGGATTACTCTGT
CCAATCACTGCATCACTGAAGCTTGACTTACACCAACTCGTCACAAGAAA
GCTGGATTGGGATGATCAAATCCCAGACGACCTTCATCCACTTTGGATCA
GTAACTTTGAGATGATGGAAGAGCTCGACTCACTCAGATTCAACAGAACC
ATCGTCCCAGAAGATGCAACAAACCTCGATCTCACTACTGTTGACTTCGC
TGATGCTAGCAAATCTTTGATATGTGTATCTATCTACGCTCGTTTCAAAA
GGCGATGTGGTTCATACTCAAGTCAATTAGTTTTCTCTCGTTCCAAATTA
GTACCAGAAGGAACCTCTCAACCACGTGCTGAACTGCTTGCAGCCCTACT
CAATGCACACACAAGTGAAATTGTTAGAAGATCCTTCAAAAAATGGCACC
AATCATCAACAAAGCTGACTGACAGTCAAATCACACTCTACTGGATCAGC
AATGAAACCAAATCACTGAAGCAATATGTTCGTAGCCGTGTCATTGAGAT
CCTCAGATTCACCAACCGAAATGATTGGTACCACATCAAAGGTGAAGATA
TGCTTGCAGATATCGGCACACGACGAGGCACTTCAATCAATGAGATCAAC
AACAAATCAGAATGGTTTAATGGATCAGCTTTCCTCTCTCTAGAGCTGGA
CAAAATGCCaatcaaaactgtatcagaaaTCAAGATGACAGCAGCTGAAG
AGAAGGAGGCACAACTTGAAACATACAACATCTCGACTGCAACTTCATAC
GTCGTTTATTCACCTACTTCTTCATCAAAGATTGCTGAAGAGGTTCAAAT
CAGGCTACAATTCAGCAATTACATCATCAATCCAAACAAGTATCGTTTCA
ACAAAGTCATACGTATTCTAGCACTGATGATCAAATTCATACATCAACTC
AGATTGTCTCACAAAGGATTCATAAAATTTCACTCCAACTCAAGTCTGAA
GGACGTTCTACCAACAGAAGAAGAGATCAGACAAGCCAAGCTTTacttct
tcaaaaaatcaacaGAAGAATTGAAACACTTCACcagttcaaaaaagttt
caagataTCTCCCACGAAAAGGATGGTATCATCTACCATACAGAACGAGT
ACTCAACATGAATGACACCACCATCGTTGGTCGATTCAATCAAAGCATCA
AGGATCTCACTTCAACATCATTTGTCGTTCCAATGTTGGAAAAGTTTTCG
CCAGTTGGAATTGCCATTATCAATGAGTTTCATTGGAATCATCCTTCCGC
AAATCACTCTGGTGTCGAAACATCACTTCGATACGTCAATAAAGAAGCAT
ACATCCTCGAAGGACGATCAATTGTCAAACTTATCAGAAAGTTATGTCAA
CGTTGTCGTTATATTCTCAAAAAGACGCTTGACGTTGTCATGGGGCCTGT
TTCAAAACACGTTCTCAACATTGCACTACCCTTCTACACCACACAAGTGG
ATTTATGTGGACCCTTCGATTGTTACTCGCATCACCATAAAAGAACCACC
ATCAAAATTTGGTTTCTGGTATTCTGCTGCTCCACAACTACAACAACGAG
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TTCGCTTCTCATGCGACGTTGGATATCCCAAAACGCTTCTTATTGATGCT
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AGCCCAGCCTCATTGTCGAGATCAACCAATAGGTGCTGAAAATGGAAGAT
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GCTCACTTAGCTCGTTTGAATGGTGGTAACGCTTGGTGTTCAAATGAAAC
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CTGCAACTGGAGCCTCCGATAAAGGATCCAAAACTGAAAACGATTGCAAA
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GTGTTGATATCAAGAGTACTGAACCACTCGGAGACGCTTCAAAACGAGGT
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GTGTTGCCAACAATTTGGCTGGTAGCACCGGTGGCAAAGATACCAGAGAG
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CAAGGACGTGAACATAAGCGATACAGCGGGTGGTACGTCACGCGATATGC
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ATCACTGTCAATGTCATTCTGGTATGACCAAAAAGAATATTGGGGACAAT
ACCTGCGTTGATAGAGACGAATGTTCACTTCCCCAAAGTTACCACGGTTG
TTCGCAAGTCTGTGTGAACACAGAAAGAAGTTACCATTGTGAATGCAACT
TTGGATACCGATTGGCTGCTGATAACAAAACTTGTATCGATATCAATGAG
TGTACTGAGAAAACTGACAAATGTGACAAAAGAACATCAACTTGTCGAAA
CGTCGGCGGTTCTTATAAATGTGATTGTCTCTCTGGTCTGCAACACCAAG
CTGGTGACCGCAAAAAACACCATTGTGTTGATATTGACGAATGTGCGAAA
GGAAATGTAGGAGAGATGTGCCAACACATTTGTCACAACAAGTATCGTTC
TTACGAATGTCAATGTCGACCAGGATTCAAATTATACATCGATGGTCGCA
ATTGTCATGATATTGATGAATGTAAAACATTGAAGAATCCATGTGGATTA
CACGAGCAATGTGAAAACACTGTTGCCACAAAGACTGAACCCAAAGGTTA
TAAATGTGCTTGTGTAAAAGGATACGAAAGAGATGCAAAGACTGGCAAAT
GTGTTGATATCAACGAGTGCTTACCTGGTAATAAGCCATGTTCACACTAC
TGTACCAACACTGAGGGATCCTTCAAATGTTCTTGTGATAAAGgttttta
tttggaaaaagaAGTCTTTTGTAGAGATAAAGACGAGTGTAAACTTGGTT
TGGACAATTGTGATGCTGGAACTTCAGATTGTGTCAATACACACGGCTCC
TTCGAATGTCGGTGCAAATCAGGCTTCTCCAAAGACAGTTCTGGAAAATG
CTCAGCTATAAAATGTGGACCGTTGAACTCGCCAAAAAATGGTTTCCTTC
AGCCTCCAAACTGTTATCaagataaaacaaaacaattccGAGATGTTTGT
CAATACAAATGCAATCCAGGGTATGAGTTAGATGTCGGTTCTGCCCCAGA
TGCTTATTGCAATGAATTTGGTCAATGGGATTTTAGAGGCAAATATGAAG
CTCGTTGTGTCCCTATTCGTTGTCCAAAGATTGCACTGACCTCCAACATG
CGTGTTGCACCAAGTTCTTGTGCCACTCAAGGTGGTGAATACAACAAAGA
TTGTCTTATTTACTGTATTAATGGAGCTACATTAACTGTCGGCTCTAATA
GACTACTTTGTCAACAAGATGGAAAATACAGCCCTTCATTggataaaaat
atgaaatgtgTTGCCGTTAAAAAATTGGAGTGTCCAAACGATATTGTGCT
GAAGCTTCCACTCGGCGCTCATTCCATGGCTTTGCCTTTGGAAAAACTTG
ACAAAAAACTGGACGCGTCTAAATTGTCATCTGAACCAAGTGGGGTTTTG
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GACTCGAACAACTCAGTTCTCATCCTCTTCCTGTACTTTTTACGTCACCG
TACAAGACAAAGAAGCTCCGGTCATTGAAAATTGTCCGGAAAAAGTCTAC
GTGAAGTTAAATTCGCCAAGCGGATTGGTGAGCTGGACAAAACCTATTTT
CAAGGATAATGTTGGTATCACAAAAAGATTTGTCAACTTAAGAAATGACG
CCATCCGTGGTGAACATGTTTATTATGTATACTATGCAGCAAGTGATGCC
TTCAACAATGAAGCTGTATGCCGATTCTTCGTCCACGTCTCAGcTGAATA
TTGCGACAAAACAAACTTACCAGGAGCAGACGGAGCAAGCACCTTCTTCA
TCGGAAATCAACCAAATCTTCGCGTGCTTGTCAATTGCCAAGCCAATCAT
GTTCTCGCCTTCAATAACACAACCCCTGCAAATATGTTCCTTTGTCAAAA
TAATCAATGGGGATATGTACCCGATTGTGTTGAAACCTTACCAAAGACAT
CTGATAACTGCCCTGCTGGGTATAATATTATCAAGCCCAATCCATATGTT
CCCATAGTTTGTGcTAAATGTCCTAAAGGAACAGTCGAAGTAAATGGCGT
ATGTGAGAAATGTCCAAAaggtttttacaacagtcaaaCAGGATCTGTGA
AGTGTACGCAATGTCCCCAAGGAACCACCACACAAGAGGATGGACAAAAA
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TCCGATAAAGGATCCAAAACTGAAAACGATTGCAAAGTGGTTCCTGCACG
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ATATCAACTGTATTGCTATTGGCAACCCTGCACCACGTGTTGATATCAAG
AGTACTGAACCACTCGGAGACGCTTCAAAACGAGGTCAACAGATACGAAC
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CAAATGCCACCGCCCAAGATATCGCAGTTTATGAGTGTGTTGCCAACAAT
TTGGCTGGTAGCACCGGTGGCAAAGATACCAGAGAGTGTccaacaaaact
ttttaaaccAGTCACGTTGTGaATGGCTAGATTACTGGTCATTGCTTGTG
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ATAGGTGCTGAAAATGGAAGATTGAGAGACGATCAATTTGTTGCTTCAAG
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ACGCTTGGTGTTCAAATGAAACTGATCCAAAGCCTTTCATCAAGGTTGTT
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GTCTGCAACACCAAGCTGGTGACCGCAAAAAACACCATTGTGTTGATATT
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CGGTTCTGCCCCAGATGCTTATTGCAATGAATTTGGTCAATGGGATTTTA
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CTGACCTCCAACATGCGTGTTGCACCAAGTTCTTGTGCCACTCAAGGTGG
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CTTTGGAAAAACTTGACAAAAAACTGGACGCGTCTAAATTGTCATCTGAA
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CTTTTTACGTCACCGTACAAGACAAAGAAGCTCCGGTCATTGAAAATTGT
CCGGAAAAAGTCTACGTGAAGTTAAATTCGCCAAGCGGATTGGTGAGCTG
GACAAAACCTATTTTCAAGGATAATGTTGGTATCACAAAAAGATTTGTCA
ACTTAAGAAATGACGCCATCCGTGGTGAACATGTTTATTATGTATACTAT
GCAGCAAGTGATGCCTTCAACAATGAAGCTGTATGCCGATTCTTCGTCCA
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CAAGCACCTTCTTCATCGGAAATCAACCAAATCTTCGCGTGCTTGTCAAT
TGCCAAGCCAATCATGTTCTCGCCTTCAATAACACAACCCCTGCAAATAT
GTTCCTTTGTCAAAATAATCAATGGGGATATGTACCCGATTGTGTTGAAA
CCTTACCAAAGACATCTGATAACTGCCCTGCTGGGTATAATATTATCAAG
CCCAATCCATATGTTCCCATAGTTTGTGcTAAATGTCCTAAAGGAACAGT
CGAAGTAAATGGCGTATGTGAGAAATGTCCAAAaggtttttacaacagtc
aaaCAGGATCTGTGAAGTGTACGCAATGTCCCCAAGGAACCACCACACAA
GAGGATGGACAAAAAGATGTCACCGGTTGTCAAGCCATGTGCGGCGAAGG
TGAATATTCGAAGAATGGTATGAAAGGATCAAGCGGTTGTCTCTCCTGCC
CTGAAGGCTCCTTCCAAAATGTTAAAGGACAAACACAATGTAAAATCTGC
CCTGCAACTGGAGCCTCCGATAAAGGATCCAAAACTGAAAACGATTGCAA
AGTGGTTCCTGCACGTATCGTTCAATTCAACTCGACTGCCACCTTCACTG
CCGGTGGAAGTTTCCATATCAACTGTATTGCTATTGGCAACCCTGCACCA
CGTGTTGATATCAAGAGTACTGAACCACTCGGAGACGCTTCAAAACGAGG
TCAACAGATACGAACATCTATTGCAACCGGTAAAGGATTTATCGTGCACC
GTCAGTTGACCATCACAAATGCCACCGCCCAAGATATCGCAGTTTATGAG
TGTGTTGCCAACAATTTGGCTGGTAGCACCGGTGGCAAAGATACCAGAGA
GTGTccaacaaaactttttaaaccAGTCACGTTGTGaATGGCTAGATTAC
TGGTCATTGCTTGTGTGTGTTTGGTTGCTATAGTGACAGCCCAGCCTCAT
TGTCGAGATCAACCAATAGGTGCTGAAAATGGAAGATTGAGAGACGATCA
ATTTGTTGCTTCAAGTGAACACAACGAATATCATGGTGCTCACTTAGCTC
GTTTGAATGGTGGTAACGCTTGGTGTTCAAATGAAACTGATCCAAAGCCT
TTCATCAAGGTTGTTCTTGACGGGGAGTATGATATTTACGCGATAGCAAT
CCAAGGACGTGAACATAAGCGATACAGCGGGTGGTACGTCACGCGATATG
CAATTCTTGAACATTACACAGACTTTAGGGGACACGATGGATACAAACAA
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TGTCGAAACGTCGGCGGTTCTTATAAATGTGATTGTCTCTCTGGTCTGCA
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AGAGACGAATGTTCACTTCCCCAAAGTTACCACGGTTGTTCGCAAGTCTG
TGTGAACACAGAAAGAAGTTACCATTGTGAATGCAACTTTGGATACCGAT
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GAAAACACTGTTGCCACAAAGACTGAACCCAAAGGTTATAAATGTGCTTG
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Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.10118	MSTRG.10118	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.10118.1.p1	MSTRG.10118.1.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


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Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000069_pilon	genome	sc0000069_pilon:998190..1017968 +

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MSTRG.10118.1.p1 (mRNA) -