MSTRG.10102.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10102.1.p1
Unique NameMSTRG.10102.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000069_pilon:798724..813901+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10102.1.p1 ID=MSTRG.10102.1.p1|Name=MSTRG.10102.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15178bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:798724..813901+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAAATCGAACCTTTGAGATTTGAActtatgaaataaattttgtaacTTT ATTCCAATTCTTTATTGAAGACCCTTATTAGAATTTATGTGTAAAATACT AAATTTAGCCTTTTAAATTGGTCAAGTCCATCGTGAGTTTTTAAGAATCA GACAAGCGAGATAGCATAACGTTCTTACAAGCTGTTCACTTCCCTCTATT CGAGAGATCTTGTTTACATAACAATACCAAATGACGTAGCCACAGTCTAA AATTTTTTACATCCACGACAAAACTATAAAGTAGGCGACAATACGCATTA TAATATTTTGTTGTAGTATATAATTCCTATTAATCATTATgtatatagat ttttttttcataacaccTTTATTATACGTATGGGTACTATCCTTGGTCGT TGGCGGCGGtattttatgtttataatacCTCTTTAAAGTACATATTTGAT GGATGATGGTATTTAGTTGGAAATAGGGAAGCACTTGAGAAGCATGTTGG ATGGAGCTTTCTGCATCGACGAAGACAGGTAGGaacaattttactttttc aactGATATAGGGGTAGtcagatatctttttattatttcatgCTAATAGG TAATAAGTAAGACCACCgaatttattttccaaactGGAGATTTCCAAACA ATGGTTGATTTTGtcatttagttttgatttattttgggATTTATTTCTGC TGTTACCTGTTGTTACCTGCTTTTTCGTAGGGCTTAATCTTGAACGGTTT TGTCCGTAAGCAGTACGAAACTCGTACATTGccaaaaaatgtaaattcaa aAGTcccaaactctcaaattgatcaatttcatttttgtagtcaagtctaa aaaaagtaagaataggttaagaacatttcaccctcaattgtggcaatttc ttaagaatacttgatcctcatccaaagtacactattcttataaaaaaagc gtgtattccagaaaaatattcgCATTGGTGGTTAAAGAGTTGGTTTATGG TAGCTCCATCTTCTGACGAGTTTTTGACTGAACGTTTTGATTCAAACCAT GATGATGGATGTACCTTGTTTGGCTAATGATCTTGTTATAGGGTCCTTAT CAGCAAAACCCTTTTTCTAAATGCAGCTGATCTTTCTACCTTTATTGTTA AATCGCTGCGCTCCTCTTGAAATTAGCCTCCAAAAATGTTCAGGCCCTAT ATGCCACGTGTCACTTCTGCTCATAGGAAACAAATAATTTCTCAAATTGG TTTTTCATCATCGGAATCTCTTTCCATCGAGGGAAAAATTTCCCTATGAA ACTTTCTCTTGCGATCTTGTGAATCAAAGTCCAGAAGAATTTCGGTATCT TTCAAAGTAGATTTTGGTCATTTTAATACCAGATTACATGAGTCAAAAGT AACATTGAAATGCttactcgaaaaaaataattgtttaaTTTTGTGATCAA GGAAAATGTTGCGGAGAGACTATCCGTCTAGTGTTCTTTCTCATTCATCT TTACTTTGTTTGCGAGGAATGTTAAGCTCAAACATTTTCTCTATCGGAAT TCTTAAAAGTTGATGATGCACTTCCAATATTTGACTTAGTGAGACAGATA CGAGAGATTTTGGATTACTATCGCCTTTTAGTAATTTTGCGATAGGCCAT AAATACCCTGTGAACTTATTTGAAGTTTTCATCACCAGTGATCGCCAGAA GGTTATGTCAAGCTATGGTGTTTCTGAATCCTGTTTGAAAGAAAACTTAA TTTAGAAATCCTGTTTCTTAGCATATTGGATTCACTGTCACTGTACTAAA CTGTTGGAAAAATTCGACTGAAAGTTTACACACTTGGTCTTTGATTGCGG AATACTTTTGAATGTCCTTTCTTTCAGAACCTCTTTTGACGTTGTTGACC TGGATCTCTGCAATACCAACATTTGGTGTCCTGAGTATGCATTTTGAAAG ATACTGACATTGAGCTTCGATTTTAATTATAAGAGGGTTCCTTTGCTAAC CGCAACTGTGACTTCTACAATTATCATATAAAAATCACCTGAGAGGATTT GGATGCATTTATAATAGTTCAAGGAGAATGAGTTCTAGATAGTGAGTTTG GATTATACATCTGGATAACCCCATACTGTTTTAATATGCAAACATAGTCA ACCCCTCTTTTGATGAGAGTCTTATTTGAAACTGTTTTGTTTTACTGTAG TCAGTCGTTCTTCTTAAACGTCTTTCAAATACGAGGGTAATCTTTCTTAT ATGGACGTTTTTTGGCAATACAGATTATTTGCCAATCTCATCATTGTTAT TTTGGTGCTTATCAAACTTTCATACATGGTAGTATACTCTAATATAAAAT GGAGCCTTCCTTATTATCAGACAATGTTTCTTGTGATTTTGACGAATGGG TAGTTatggttttcaaagtttttcttggaTATTTCATGATTCGGTGTGTA TGGAAATCGAGGTATGCTTTCTTTGTTACTATGGTAACAAAATGGTCTTC CTTCAGGGAAAATACTCATCCATGAGCGAGGCCTACAGAccatttttatt atcaaatgCAGTGATAAGGTCTTTATCTTAATGACGTATAAGTTAGCACC TTTAAAGCAGGTTCGAGTTTCTGTTTCTGATTTGATTAAATCGTAATACT CGAatgaatgaaatgaatgaaaaaaaatgtcaacaaTGCAATATGTTTTT CAAGTCTTGGTAATGGAATAGGAATACAACGACAGCGTAGAGTATACTTT TGGGCCTTATGAGAAGCACGGAGTAACCAACCCTGTGCAAAATAGCCTCA TAAAGCCTAGAGGACTATTGAAACCTTGGAAAGTTATTTTCCAGTTTACT GGCCTTTTTTAAAGTGATCTAGGTCACTTATAGACCTATTGCGATGTTAG TGACGTCAAACTTTTGGAGTTTCTCAAGATGCTTAAGATGAGTCTGCAAA TTCCATAAATCTATCTTGACTTTTCAATAAGATTGTGAAGAGATAGAGAA CAAACGATCAATCTTATCGATAAATCTGTTTTGACTTCAATACATTTAAT CCTGGaattttcatgtgaaaattccaaaaatatttttctttacataAAAA GACCTCAAGAAAATCACTTAATTCACTTTTATAAGATTTCAGTTGGTCTT TTAAGCGCTCGTTTATGGTTGACCGCGCTTCGTATTCGaaagttgtttta ttttgtccaaaTATCGAATCGGATATTGTATATCGTATTTGACCAAAGGC GGAGACTCTTATTTTCCCTTATACGgaaaaagaattggaaaaactTTCTT CAGTAAGATAAACCATAGAGTGGATTGCTTCAAATCTAAAAAAGCTGTGT ACTAGTACTCAGGCCTTGGAGACTAATTTGCTCGTTTTATTGGATTGGAA TGTCAATATAGTTAGCATTTATTTGATGGAATATCATCTTCTTGACTCGA GAATTTGAGTATTGTATTGATATTGACATTGAGACGTTGTTACCTTAAAC GTGGAAACGGTAAACAGTTTTTCGTTATTGGAAGGTTCGGGTACTGTGCT GTTTTATGGTAATATGTTGAAATTGTTGTGGAACCTCATTCAGAGGAGTG ATGTGTatgtaatgttgttttttcaaatctttactGGGCTTTTACATCAA TTTTGACTCGATCGGTCTTGGTTAATATTACTATCAATTCTCATTTGAGC ATCGGTCCAATCGTAGGGCGAAATTCAGAAAAATGTCGGGGATCGACTCG GTGCTGCTATTCACTTTGTAAGAGAACGTACCTTCGCCTTAGTCTATCTA TGTCACGAGAAGGGTAATTTGGGTActgttatcattattattattctgAG TATGGTACGCGAGAGAAAGTATCCCCTCcctttgcgaaatttttaaaaaa ggatGGTCTTCAGACAGTTAAGCGGAAGAGAAAACTCATAACAATCTGTC TCATTACAAAATTGATCATAACATTAGTCATAAATTTTATTAGTAATGTC TTAAAACATTTTACAAATACATGATGAATTTATCGAACTTGAAGAATGTT ATACTAGTAGGCTTTGAATAATTTGGTTTAGCAAATTTTAATAATCATCT CTTGAAAAAGAATTGTCGACCATTTCCCTAATTAGTTCTTCTATGTTACA AATATGTTACATTTTGCATGATATCGCAAATTGATATCCTTGGGCTTTTT TCCCCTTTTTGAATTCACTTTCATTTCTGCCATATTAGAATCATCTTAGC TTTTAATAATTTAGCCATCACAGCCTtgcgttcttatatagtttgttctt ttttttaaaaacatgtaaATATCTCATAGTTCTAAATTTTTTCGCTATTA GCGAAACTTAAAGTGACATATATTTTTAACTTCttaaaatttctcatttt agaGCTTTGAACATTTAATCATTTTAAGGTGTGATTATATCCAAAAGTTA TGatgaaacattttaaaatacaaaatgtGTAAATCATTATGTGATGTGAT GACCTCGTCTcatctttttgtcattttttctcgTCCATTCATTCACTCTG TCGTGAAAAACAAGTGCATGCATGGTTTTTATCTATAGTCTTGTTAATTT ACTTCTTATCATTTCTTGATAAACCTTGCTGGCTTGCAATGACTGTGAGA AAATTCTACTGACTTCATCAGTCTAGTCTGGATTCGGTGGTTTGTTTGGT TCTGTTGGCTGGAATATCCGTATAACAATGGGTTATATTCTGTTTAGTAG TGTACTCTGTgatttagttttaattttttttttaattttgttgaagaaat tgaaattattccTAAAAAATGTCTTATCCCGAATTAAATCTTTcacatta tttttttgttcataatCAACACTGCATTGTTATCAGTTGTCACCAGTTCT TTTCAAACTTGCCAACAAAACCATCACGGTACACAACATCTTGATAAGTA TATAATGTCTATTAGTTACTAATCATGAAAAGTTGACCTTTTGAGGTTTA TAGGTGTgggaataaaataaaactagattacacccctgtctcacagcccc ggtggaactttttgtcctcagtggggatagaaactcctattgaaatccca gggttagaaattctattgttccaaggctaaaaaatccagtggggatagtt ttggagtgcaatttttaaacattaaatttccaatggagatgaaatcaaag tcaatttcccagtgggggctgaaatttcagggtattttcctacaggggac gaaatttttgccaaatgttccagtggggctgggcttCAGTGGGtgtgtga cacaggggtgcTAGATTGCAGCTTCTCCTTctctatacacccctgtctcc caGTGAACCGGTGAACAGATGGAAAAATGTCAAGTACACACACTTATGTG ATACAGGGCTGTACTTTGCGATTGTAGGGCATTGTATGGCCCTTCATATG AGACTTTTTTAAGAGGAAGTGTAGATAAGAGTTCTCTCTCAATACATCTT TGAGTTAGGGATCAATGATCATACAGTACCACTGTGAAATGACATAAACT TCTCTACCATATTGTATGGGAAGGATGTGAAGGGTAAGAGGGCTTCGTGC TGGTCTCTTTTCCGTTCATGCGTCAATGCAGAAAAATAGATTATATTGAA CCTCTCTGCATCCTATCCTTAGCAGTTGCCTATTATTAAGCTATTACTTA ACTTTATACTGATTATAGATAATTGTTCTTTTTCCAATgagaaaatacaa atttaattttttttccttatttcctattttctttctttatcattttctct tattttatttttttctgtaatgATTAAAAAACACAAATAGCGCATCGGTA TGTAGAAGGCATTTCTCAATACTTTCAATTGGTTAGGGTACACTGTTACT GCTGCTtgcttttgatgtttttttatgcCGGATTCAAATTGAGATAGCAT TTTATTTGAGAGTATTCCTCTAGTGAATTTGAcggaaaacaaaataattt tttcctaaTTATTATGATGCAGTAGCATTTATGAGAGAACTCGATGTGAt acttttggtattttttatgaggatttatTTTGATGGTTATGATAAGAATT AGATGGTTTCTAATTGGatttaaaaaaacgaaaacttaTTGATTACCAGA CTTCGAGAAAatgaaaagcaaaacaaaagctACTACATTTGCGTTGATTG TTATGAGGTATGTAGTAGCAAAAGCTGCATGTATGAAAAGATATTGAACT CAAGATCTCTGTCAAGATTAAAGTCTAGAGTTATAACAAAGTCCTGGAGT TACTATACAGTAgagtctttttaactcgaacctctttaacTGGAATGTCT CCGCTCGTAGACTCGTTTTTTCGTCCTTTAAGATAACGCCTTACAACAAc attactccataactcaagGCGTGATTTGGCCTTTTTATCGTGATGGGCGc gatctttgatttcaaaaagcgTGAAAAGTGATTaataaaattatgttttt gGTTTGATGACTTGATAGCCTGATTAGCGATCAGGGCATCTGCTAGGGAG GGGGTCTCTGATGATCTATCTACCAACATGCACACCAGACAAAGATAGAA ATTCAACTGGAACTCGAGTTCAATCCTCGTCTTATGTGACAGCTGATTGG TGACTGTATTAATTCCTATCAATTGATTTCGAGTTAACTACACTTCCTTG TTCCAATTGACTGACATAAATAATTAAGGTTTTCTAGCCTTCAGAGCTTG CAATTTCTTCCTTGCAAACAATAATCAATTTTTCTCAGACGCCAAGAATA CCATCCTTATCACTTCTAAATATATTTTGCTACAAGTTGTttaccttttt gagtttttcattttatcagtGGAATTAACTTTCTATCTATTAAGTATGTA TATCATCGAAGCTTGAGAGTGGTGCTCAAGAATATTCGAAAGTTGTTCAG CAAAAACACAAGCAGTTATATCATTTATAGGTGTTACTTTAAATAactgt tcctgtttcatatcaggcacgTGTTTTatatcaggacggtgtctcCTATT GatatattgtgctgaataagcaaaaaattgtttttcttttccaccTTCTG ACCTATCTTGTTCCACGCCTGTGTTAAttcaatatgaaaaagcttTTAGT TTAATCAAAATTGCtgaataagcaaacgatatcactcttattcaaaaaca atacTTGTAACCAGAACCAAAACAGTGTCAAGATAAGGTGCAAAATGACA CGTGGCTACTCTCATCTCAATTTGATTTACAAGTGCATTGAGGGTAGCGG CACATTTATGTTTATCAAGTGTTTGTTTTGGGCAAAACAAGGTTGAATGT AATTACAACTTGGCAATAAGTCTTTCTATTTTTGGTTTTCTCTGTCGAAT ACACCCCTATCACAGTTACCCAAGCGgttaaaagtatttttctttcactc tATCTTTGAGAGTATTTTTCTAAGTCGGCATTTTTTCGGCTAATGGTTTT AATAAAAGTCTTAAGTTGGTAGTTATACCAGTGCTAAGATTTGAACCTCA CCTTTTTAATTGAGTGTAACGCTTCTGAGTGTCTCTTAATCTAAGATTTT ACAGAAGATGCCTCCAGGATAGTCTAGAAAGCTCATCTTtcaatgggata aacttttatTAAAAGGTGTTGTTGTATTTATAGGACATAACGTTATTTTA GTCCGGAAAAACAACTTTATAAATGAATACATTAAGAATCTAGGTATCAA ATTTAAGATTACCATGTTAagactttcacaacaaacttgTAATTTATTTT TGGCATCCCTTTGAAAGCGGTATTCAAAACATATAAGGTCAATTACATAA ATTTCCGTTTGTAAAAATCTGAACATGAGGACACCAAAGGTTTTGCTGTG AATTCGGTTATCTATTTAGTTGGTTCGTCTTGGTTTGATTTTGTTGGTTC TAACTTCTGTAAATGGTGTAAATCATTGTAAATTAACAACTCCTTGCTAA ATTGAGTTGTAAACAGACTTACAGGATATCAATATGGCGTCGAAtgaatt ttatggatttttgtgAAGATTGTTGGTTACATAAGTTATAAAGTCCTAGT GAAACCCTAGAAAAGTTGGCCAAAAATCGtccagagaaaaaaaaagacaa aaaacatttaatcgCAACAGGGAGtttttttGGatcattttgtgaatttt attcGCCAACCAGTAGTTCACTCTCTGTCTCGGACCCTTTAAGAGAAAGC AAAATACTTCTAAGCAAATTCTTGTAATATTAGTTCGAGCTCTGGAGTCC AGTCTAGCGTACTGTAAAAATGCGCTAATCACGTAGAATTTATAGTTTCA AAAAGAGTTTTGAAACTGTTccaaaagttttgttttgattttccctCCTT TGACCACCCACTTGAGGCAACGTAAACAGGCTTAAACGGAATAAAGTCCT TTTAAAAATcactgtttcccttccctttaaaaacgataaaaatttcaaac aaagttACAAAGCAAAGACTTTCTTTtagttttgaaaaacatttttgagc gATCGTTTATCTTGAAAGTCTCGTCAGCATGGTGGTTGGTCTGTGTTTTG ACGCACTGTGATTTCGAAAGCTACTTAGGAATCCGACAGAGTTTTGTTCT TGATTTTAAGATCTTGATCTCTCAGTAGCAACATCATCATTCAGATATTA TTAGCACGtttaagattttcttttcttactGATGTATACTACAtttctaa agattttttgtcTTCCTATATCCTTGTTAGACTACTACTGATACAGAGGA GCCGAATCTGCTCAAATCCCTTGTTTTCAATCAGATTATAGAGCTTTCAG CGGTTAAATGATCTTTGGAGTTAGTCCTTATACTTTTATCATACTTTCTA GTCAGTAATTGGGAAAGTTTTAGGGTTTATTTAATTAGTACGTGCTGTGG TTAACTGGTTAAAATCTCATCTTACGTTTACTTATCAAGTGTTTGTTGAG CCCACATACTTAAGAAACAAAACTCGCTCCCAGTTTCCGTTTCACTAAGA GGCGTCGGTGGAGTTCTGAAGGGTTCTAAAGAGGATTCTTTGACTCCCTG ACCCCCTTATTTTCGATATTTAGGTCTAAcggttttttattgtttttgat aaAGTCTAGCTTTCATGTTTATGTTTTCATTTGCTATCTTTTCCCTCCAT GTGCGAATGACGTTTTTCATAGTAAATTAGTGTGGTGACAATGTGTCTCT TTTGTCAACTTAAGGATTTTGTTGGGATTtgtacttttgaatttgttcaA GGGCTTTTAATGACTCAAAAGGGTTGGTTTAAAGAGGTCCTCTTGTCATT TGGAGCCTGGATGAGGTACCAGCTCTTGACGTTGTTtgcaaagtcttgaa tattGTGTCTTTTTACATTTGCCTTGCCTTGAACTTTATGAACTTTATGG AATAAGCGGTTTTTATTCGTTGATGGGAGCCATGAAGAGCTTTTTTGCGA GCTTCGGTTGGATGTACTtattttgagtttgaaatttgttACATTCAGAT CATAATTAGAATCTCTAAGAAAATTTCAGACGTCCTGGTGCCACTTTAAG AATGACATGGATTTTTTAGTGATCATAAAAAAGCCCTGACGGCAAGAAAG TTCGGAAAACTAGCTCTTCCATGTTACTTTGAAACCACAGTACCGGGTGG GGCAACAAATTGATAGTCGAAGAAATACTAGatagcagaaatgcactgta agggtggacttttgatgaATGCACTGCAATGGAGGCAATTTCAGCAAATc caggaaaaattgcaaatttttgcccgAAAATTCCGATTTTTCGGCTttaa aagagttgaaaatttgagaaaaatgtactgtaagggtatgaatttcagcg attttttgctgcactgtaagggtgcgattctaaaagccagaTTTTTCGCC GCACTTACCCTCAGTTGGTAAACTCACTGCACCGACCCCCGCCGGTCACG ATATCAGTGTAGAAAGTTCAGTTTAGTTCCCATGCTTTCTAGAGGCGGTA GAAAAACCCTACGTATGCGAGGATAGTACAAATCAATTTCTCATTCATGA CGAGAGTAATCTAATTGGAAGTTTCTTTATCTAATGAAGTTTAATGAGAT ACTTAATGAAGAAGGCAATGTAATTATTTGGATCAGTTAGATCATTAAGA GAAAGATACATGAGCCGGATTTCTTATAACTCATTATCTTGTCAATCGCT TAACGGCTGCGGATTCAGAGGTTTCTCAAACTTTCTATTGACATACAAAG TTTACAAGGGAAATGAGGCGTCTTGCTTGGGACGTCTCtttttttGTCac ttaatttatttttacatcgaagtctccgtaattcgaaatttccacaATTC AAATGAATTTTCAGCTCAAGTTATGGAAACTCCACTGTATTTTGAATGTA CTCTCAATGAAGGAACCCTTTCAGAAATTTCCGGACCCAGTCAATAAACA GCCCCTtactttcttaatttttttatcaaacgaCGTAATATGTcagcaaa aagttttttcaactttttcgtttttctattttcagaaaattatccGATAC ACAACAACAACAGTCACAAGTGGATAACGGAGAAATAAACGCCTGTCGTG ATAGCGGAAGAAAAATGATTGATCGTCAGGTAAGGTGTTCTAAGGATTTG TAAGGATTAACTTGTTCACTTTGTTACCCCTTCTCAAAGTGTGGCTTGGG ATTTGATTTTGGGGTGTTGAGAATAAAGAAAATCGTGTTGTTCCAAGTTA TAtctatacacccctgtgtcacagacccactgagaccccagccccactgg aaaatttggcaaaactttcgtccccggtgaaaaaaatacccttaaatttc agccccactgggaaattgactttgatttcatccccatttgaaattcaatg tttaaaaattatactccaaacccatccctatgcactggattttttaacct tggaacaatagaatttctatccacattggaatttcaataggagtttttat cccaactgaggaaaaaattccaccggggctgtgagacaggtgtGTATCCA TATATCTTGAGTTAACACAAATGTTACCAACTCCGGCTATTATTCTGCTA AAATGGCACACGTATGAATTTAAAACGACGTTAAAATGAGTTTAGTAGGC TCACTGAAGAAACATGTATATAAACAGTTTGAGTTACGTAAAACCCTATC ATGTGGAGTAGCTCTCTGGGTTAACTGTGAGCTTGTGTAGCGTCCAtttt tgtttgtccttttgttttgtttatttcgtGACGTCATCATAATGGCGGCT CTATTGAGTGACTCGCAGTCAGTGTACTGCTGTGCTTCAAACAGGttttt ttGTATTGCAATTGATTTGTAGACTAGAACTTAACCTCGTTAAAGCTTGG CGGTGAGCTAGCCGGGTGATCATAGATTAATGAAAGCTtgttgttttata agaatacctaACTGAGCCTCCAAAATCAATAATTATTTCAAGATGGGTGA TTTATGTCTTAACCCTTTTGAACCCTTGGAATCAAAACTGACTTGGCGCC TACtcataaaattttcacaatGTGTCTTGATTTTCGAATGACCCTGATTT CACAATCTAAAGGTCAATGTCAACTAATTTGTTTTGGCTAAAACACCACG TCAAATTTGCAGTGCGTGCTTATCATCACAAATTCTGTCAAGGACAAAAA AGAACATCAAACATCTGTtccagtaaaattttcaaggGTTTAATggctta ttttgaatttgtcttTTTACAAAGCCTGTTTAAGATTGAGAAGAATCTCC TGGATTTTCCCATATGTTTGTTtactttaaatgttcttataagataTATT ATCCTTACAATAAATTCATTTTATCTTATGACATTAAAAGCAATTAAGTC GTCTTACCGGTTTGTACTATTTTGTAATTGGGTTAATTTGTGGGTAACCC atctcttcatttttttattatgtaCAATCTTTTGGCAGCCATCTTGTCTT TTCCTTTTCCTCTGTCATCATATCAACACAAagagatatttcattttttt tgaattcttgaaagttttagtttttatttatttctctgGTGAGGAAAGGC AGTTGGTTTTTGTTGATGTTGAAGAGTATTGTAAAATTTGTAAAGACTTT TTACCAAGATGGTGTATTTATAAAGATTGGAAAAGGATTGCTCTATACTG TAAAGAGACAAATTTAAGCTCGGTGCAGACATTTTGGAGAAAATATTTGT TGTTGATTGTGTAGCAACAAAGTTTTTAAGACTTTTGTTGCTTAATTTAT ATTGCGTAGAACAATGAGTACTTTCGATTTCGAGAAGGTTTACAGCTCGT TTTGTGAGAAAGCTTTACATCGCTATTCAATTGATTTGGGAAAGGTGGGT GCTTTTTAGAAGTATGATTCGAAGCATTTATTGGGTTCAATGCTAGGGCT GTACACCATAAACAAAACTTGTTTTTCTGCTATTTTATATTGCGTGAGCA TTTTCGTTGGAAATATAATGCTAAATGGCATATCAAATTATTTAGAGAGG CTGATGATTAAACACCAAGCAATTTTACTGCAGCAGGATGAAAAGGTTTT TGGTGTTCTTAGAAAATATCCACTCTCTTATTTTATCTTTGTCCGATGAA ATTGGCCTTTTTCAACTGTTTCACGGACCAAGTTTATGTCccagtttttt cttttgttcgtCGAGACGAGCTATTAACTGTGAATCATCATTATCAAAAt ttgttcttagaaaaaaacgGCTCGATTTCATGAGATCTGATAAAGACGAG GTTATCTTAGTCTTTAACATGTGACGTCACTTTACAATTAAGTAACAAGT TAAGGCTTAACGCGCTTAGTCATCAAAACACAGTTCTTAAAATCCCCTAA TTAATTTTGAATGAAGATTAATTGATATACATTAGCCAGAATGATAtttt aatggttttgttatgtttttgattttttttagccTGGAACAAAACGGTTT TACAACTTGACATCTGAATATGAGAAGACGGCGGCTGGTGATCATGAAGA TGTTTCGGACTCCGATGAAAGCCGCTTATTTGTAGTAAACGACGGTTATT CATCCGACTTATCCGACATGTCGTCAATTCAtcgtcatcaaaataatttg tcaACAAAACGCGTCTTAAAAACACGACAAGTGCTCGATTCAAAACGAAA CAGCGTGGTTATCGACGAATATTTATCCGATACAGATCTTGATTCGTTAA GGACATCAACTCGAAACGAACAACGTAAAAAGAGATCGAAAAGTCACCGA TTGATGAAAGACGAATCGAAGATTTATcgagaaaatttgttcgagaaAGA CGATAAAGATCGTAAACGAAGATCGTGGACTGATTCGGGTGTTTCACTTT CGTTATCGAGAACTGACCAATCGAGATGTGGAACTTTTGATCACGGTGTA TCGATTAGAAACACtgaaatggaaaatgaaaaccAAACACATTTAGAAGT TCCTTTACGGCGTCGAACGGCTAGTCAACTTCGAAAGACATCGACTGAAG CAACTAAATCGTTTAATCGATTGTCTCAAATCACGAATCGAAGCTCTTTA ACGAATGTATCGATCTTAACAACGACATCGATGACTTCTCTCAGTTCGAT CATCTCACCATCGGAATTAGAATATATTTCAGAATCTGAAAGTTATAGTT CATctgatgatgatattcttacTGATTCCCTCTTGAGAAATTTGAAACAT ACTCCTGGCGGTGGCTCACAATTATCAATGACATCTACAGCTTCTACAAT CAAAGCTGATAACGAGAATATTTCAGCCACCGATCCTGAGAAATATATAG ATATGCAATTAAGGTTATATCAAAAGCAAAAACAACAAACGAATAAATGT CAAAAACAATCACATTCTCGTAAAAGAAGCAACAGCCTCATTCAGAAATT CAAATCGCATTTTCATAAATCAAAACAGCAGAGTCCGAATCGTAGCTCCA AAGATGTGTCGTCAGAATTCTCCTttgagaaagttgaaaaagattCTAAT CAGAAATATGAAGTCATTACGACTGATTTTCTAAAGAAACTGAGAGACGA AGAATCAGCGCCTTTAGATTTTTATGTTGATGACGTTCAGTATGAAGATG ATCTAAGTGATGAAGATGATGAGAACCAATCAAAAGACCCATTGGAAAAT TTCTCATCCAAGCCACATAacaaagaacataaaacttttcttggtaaatt ttttaaaaggacACGCTCTTATTCGGTTTCACCACaacttgaaaagaaaa cacCGAAATCACGATTTAGTAGAAATTCGTTTCGAGCAAGCACTCGATCG AATCCTGAAATGCCATCTAAAgaagataatttttcaaatgttggaCGATA TACATCGATGgataatttgaatttgaaagaagGTGGCCACCAACAAGACT CTGAAAATTATACACCGAAAATGAACAGAAGTGAGACTTTTAGTGGAGCT ATTTCATATAATCATGAAAATCGAACCATGTACGATTCAAACTTTAATCG AAACCAATTGCCAACACAATCACCTACTATAATGCAAAAACAATGTCTCG GTATTCCGGCTCACGGTTCTGTTACTCCGAAAGCGAGCAGTCCAGATTTC TCGAAAGAATCACCAATTCCACCCCCTTCACCGACGCCAAGCGTTtttga tttagaaaaattccAACAAGTACACATGCCGTTAGACCGTTGTAACTGTG AAGAATGTATGTACGCAGACTATCTAGACTATCTTGAGTTTCAACGATTT CGAAGGTATTATTCTCAATCTTGTTGTGGACCGTGTTGTATGGCTCCAAC TGATCTCCCTGTATCTCCACATACACCACAAATGGCGCCCATGCGTATTT CTCCACGCCATGTACACCCTGAAGCAAATATCATAGCACCTTTACCGGTG ACCaaagaaactgaaaaacaaGCCAAAAATCTTCGCACCTCAATTTACGA ATCTTTTGTATAATActatatttttaatgaaatcaatatttttcttaaag caGTTTTTATTTATAATGTTGAAATAATTAGAATAACCATTTTTAATACA AAACTTCAGCCTCACTTCAAACGCAGTC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000069_pilon:798724..813901+

>MSTRG.10102.1.p1 ID=MSTRG.10102.1.p1|Name=MSTRG.10102.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6480bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:798724..813901+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGGATGGAGCTTTCTGCATCGACGAAGACAGaaaattatccGATAC
ACAACAACAACAGTCACAAGTGGATAACGGAGAAATAAACGCCTGTCGTG
ATAGCGGAAGAAAAATGATTGATCGTCAGccTGGAACAAAACGGTTTTAC
AACTTGACATCTGAATATGAGAAGACGGCGGCTGGTGATCATGAAGATGT
TTCGGACTCCGATGAAAGCCGCTTATTTGTAGTAAACGACGGTTATTCAT
CCGACTTATCCGACATGTCGTCAATTCAtcgtcatcaaaataatttgtca
ACAAAACGCGTCTTAAAAACACGACAAGTGCTCGATTCAAAACGAAACAG
CGTGGTTATCGACGAATATTTATCCGATACAGATCTTGATTCGTTAAGGA
CATCAACTCGAAACGAACAACGTAAAAAGAGATCGAAAAGTCACCGATTG
ATGAAAGACGAATCGAAGATTTATcgagaaaatttgttcgagaaAGACGA
TAAAGATCGTAAACGAAGATCGTGGACTGATTCGGGTGTTTCACTTTCGT
TATCGAGAACTGACCAATCGAGATGTGGAACTTTTGATCACGGTGTATCG
ATTAGAAACACtgaaatggaaaatgaaaaccAAACACATTTAGAAGTTCC
TTTACGGCGTCGAACGGCTAGTCAACTTCGAAAGACATCGACTGAAGCAA
CTAAATCGTTTAATCGATTGTCTCAAATCACGAATCGAAGCTCTTTAACG
AATGTATCGATCTTAACAACGACATCGATGACTTCTCTCAGTTCGATCAT
CTCACCATCGGAATTAGAATATATTTCAGAATCTGAAAGTTATAGTTCAT
ctgatgatgatattcttacTGATTCCCTCTTGAGAAATTTGAAACATACT
CCTGGCGGTGGCTCACAATTATCAATGACATCTACAGCTTCTACAATCAA
AGCTGATAACGAGAATATTTCAGCCACCGATCCTGAGAAATATATAGATA
TGCAATTAAGGTTATATCAAAAGCAAAAACAACAAACGAATAAATGTCAA
AAACAATCACATTCTCGTAAAAGAAGCAACAGCCTCATTCAGAAATTCAA
ATCGCATTTTCATAAATCAAAACAGCAGAGTCCGAATCGTAGCTCCAAAG
ATGTGTCGTCAGAATTCTCCTttgagaaagttgaaaaagattCTAATCAG
AAATATGAAGTCATTACGACTGATTTTCTAAAGAAACTGAGAGACGAAGA
ATCAGCGCCTTTAGATTTTTATGTTGATGACGTTCAGTATGAAGATGATC
TAAGTGATGAAGATGATGAGAACCAATCAAAAGACCCATTGGAAAATTTC
TCATCCAAGCCACATAacaaagaacataaaacttttcttggtaaattttt
taaaaggacACGCTCTTATTCGGTTTCACCACaacttgaaaagaaaacac
CGAAATCACGATTTAGTAGAAATTCGTTTCGAGCAAGCACTCGATCGAAT
CCTGAAATGCCATCTAAAgaagataatttttcaaatgttggaCGATATAC
ATCGATGgataatttgaatttgaaagaagGTGGCCACCAACAAGACTCTG
AAAATTATACACCGAAAATGAACAGAAGTGAGACTTTTAGTGGAGCTATT
TCATATAATCATGAAAATCGAACCATGTACGATTCAAACTTTAATCGAAA
CCAATTGCCAACACAATCACCTACTATAATGCAAAAACAATGTCTCGGTA
TTCCGGCTCACGGTTCTGTTACTCCGAAAGCGAGCAGTCCAGATTTCTCG
AAAGAATCACCAATTCCACCCCCTTCACCGACGCCAAGCGTTtttgattt
agaaaaattccAACAAGTACACATGCCGTTAGACCGTTGTAACTGTGAAG
AATGTATGTACGCAGACTATCTAGACTATCTTGAGTTTCAACGATTTCGA
AGGTATTATTCTCAATCTTGTTGTGGACCGTGTTGTATGGCTCCAACTGA
TCTCCCTGTATCTCCACATACACCACAAATGGCGCCCATGCGTATTTCTC
CACGCCATGTACACCCTGAAGCAAATATCATAGCACCTTTACCGGTGACC
aaagaaactgaaaaacaaGCCAAAAATCTTCGCACCTCAATTTACGAATC
TTTTGTATAAATGTTGGATGGAGCTTTCTGCATCGACGAAGACAGaaaat
tatccGATACACAACAACAACAGTCACAAGTGGATAACGGAGAAATAAAC
GCCTGTCGTGATAGCGGAAGAAAAATGATTGATCGTCAGccTGGAACAAA
ACGGTTTTACAACTTGACATCTGAATATGAGAAGACGGCGGCTGGTGATC
ATGAAGATGTTTCGGACTCCGATGAAAGCCGCTTATTTGTAGTAAACGAC
GGTTATTCATCCGACTTATCCGACATGTCGTCAATTCAtcgtcatcaaaa
taatttgtcaACAAAACGCGTCTTAAAAACACGACAAGTGCTCGATTCAA
AACGAAACAGCGTGGTTATCGACGAATATTTATCCGATACAGATCTTGAT
TCGTTAAGGACATCAACTCGAAACGAACAACGTAAAAAGAGATCGAAAAG
TCACCGATTGATGAAAGACGAATCGAAGATTTATcgagaaaatttgttcg
agaaAGACGATAAAGATCGTAAACGAAGATCGTGGACTGATTCGGGTGTT
TCACTTTCGTTATCGAGAACTGACCAATCGAGATGTGGAACTTTTGATCA
CGGTGTATCGATTAGAAACACtgaaatggaaaatgaaaaccAAACACATT
TAGAAGTTCCTTTACGGCGTCGAACGGCTAGTCAACTTCGAAAGACATCG
ACTGAAGCAACTAAATCGTTTAATCGATTGTCTCAAATCACGAATCGAAG
CTCTTTAACGAATGTATCGATCTTAACAACGACATCGATGACTTCTCTCA
GTTCGATCATCTCACCATCGGAATTAGAATATATTTCAGAATCTGAAAGT
TATAGTTCATctgatgatgatattcttacTGATTCCCTCTTGAGAAATTT
GAAACATACTCCTGGCGGTGGCTCACAATTATCAATGACATCTACAGCTT
CTACAATCAAAGCTGATAACGAGAATATTTCAGCCACCGATCCTGAGAAA
TATATAGATATGCAATTAAGGTTATATCAAAAGCAAAAACAACAAACGAA
TAAATGTCAAAAACAATCACATTCTCGTAAAAGAAGCAACAGCCTCATTC
AGAAATTCAAATCGCATTTTCATAAATCAAAACAGCAGAGTCCGAATCGT
AGCTCCAAAGATGTGTCGTCAGAATTCTCCTttgagaaagttgaaaaaga
ttCTAATCAGAAATATGAAGTCATTACGACTGATTTTCTAAAGAAACTGA
GAGACGAAGAATCAGCGCCTTTAGATTTTTATGTTGATGACGTTCAGTAT
GAAGATGATCTAAGTGATGAAGATGATGAGAACCAATCAAAAGACCCATT
GGAAAATTTCTCATCCAAGCCACATAacaaagaacataaaacttttcttg
gtaaattttttaaaaggacACGCTCTTATTCGGTTTCACCACaacttgaa
aagaaaacacCGAAATCACGATTTAGTAGAAATTCGTTTCGAGCAAGCAC
TCGATCGAATCCTGAAATGCCATCTAAAgaagataatttttcaaatgttg
gaCGATATACATCGATGgataatttgaatttgaaagaagGTGGCCACCAA
CAAGACTCTGAAAATTATACACCGAAAATGAACAGAAGTGAGACTTTTAG
TGGAGCTATTTCATATAATCATGAAAATCGAACCATGTACGATTCAAACT
TTAATCGAAACCAATTGCCAACACAATCACCTACTATAATGCAAAAACAA
TGTCTCGGTATTCCGGCTCACGGTTCTGTTACTCCGAAAGCGAGCAGTCC
AGATTTCTCGAAAGAATCACCAATTCCACCCCCTTCACCGACGCCAAGCG
TTtttgatttagaaaaattccAACAAGTACACATGCCGTTAGACCGTTGT
AACTGTGAAGAATGTATGTACGCAGACTATCTAGACTATCTTGAGTTTCA
ACGATTTCGAAGGTATTATTCTCAATCTTGTTGTGGACCGTGTTGTATGG
CTCCAACTGATCTCCCTGTATCTCCACATACACCACAAATGGCGCCCATG
CGTATTTCTCCACGCCATGTACACCCTGAAGCAAATATCATAGCACCTTT
ACCGGTGACCaaagaaactgaaaaacaaGCCAAAAATCTTCGCACCTCAA
TTTACGAATCTTTTGTATAAATGTTGGATGGAGCTTTCTGCATCGACGAA
GACAGaaaattatccGATACACAACAACAACAGTCACAAGTGGATAACGG
AGAAATAAACGCCTGTCGTGATAGCGGAAGAAAAATGATTGATCGTCAGc
cTGGAACAAAACGGTTTTACAACTTGACATCTGAATATGAGAAGACGGCG
GCTGGTGATCATGAAGATGTTTCGGACTCCGATGAAAGCCGCTTATTTGT
AGTAAACGACGGTTATTCATCCGACTTATCCGACATGTCGTCAATTCAtc
gtcatcaaaataatttgtcaACAAAACGCGTCTTAAAAACACGACAAGTG
CTCGATTCAAAACGAAACAGCGTGGTTATCGACGAATATTTATCCGATAC
AGATCTTGATTCGTTAAGGACATCAACTCGAAACGAACAACGTAAAAAGA
GATCGAAAAGTCACCGATTGATGAAAGACGAATCGAAGATTTATcgagaa
aatttgttcgagaaAGACGATAAAGATCGTAAACGAAGATCGTGGACTGA
TTCGGGTGTTTCACTTTCGTTATCGAGAACTGACCAATCGAGATGTGGAA
CTTTTGATCACGGTGTATCGATTAGAAACACtgaaatggaaaatgaaaac
cAAACACATTTAGAAGTTCCTTTACGGCGTCGAACGGCTAGTCAACTTCG
AAAGACATCGACTGAAGCAACTAAATCGTTTAATCGATTGTCTCAAATCA
CGAATCGAAGCTCTTTAACGAATGTATCGATCTTAACAACGACATCGATG
ACTTCTCTCAGTTCGATCATCTCACCATCGGAATTAGAATATATTTCAGA
ATCTGAAAGTTATAGTTCATctgatgatgatattcttacTGATTCCCTCT
TGAGAAATTTGAAACATACTCCTGGCGGTGGCTCACAATTATCAATGACA
TCTACAGCTTCTACAATCAAAGCTGATAACGAGAATATTTCAGCCACCGA
TCCTGAGAAATATATAGATATGCAATTAAGGTTATATCAAAAGCAAAAAC
AACAAACGAATAAATGTCAAAAACAATCACATTCTCGTAAAAGAAGCAAC
AGCCTCATTCAGAAATTCAAATCGCATTTTCATAAATCAAAACAGCAGAG
TCCGAATCGTAGCTCCAAAGATGTGTCGTCAGAATTCTCCTttgagaaag
ttgaaaaagattCTAATCAGAAATATGAAGTCATTACGACTGATTTTCTA
AAGAAACTGAGAGACGAAGAATCAGCGCCTTTAGATTTTTATGTTGATGA
CGTTCAGTATGAAGATGATCTAAGTGATGAAGATGATGAGAACCAATCAA
AAGACCCATTGGAAAATTTCTCATCCAAGCCACATAacaaagaacataaa
acttttcttggtaaattttttaaaaggacACGCTCTTATTCGGTTTCACC
ACaacttgaaaagaaaacacCGAAATCACGATTTAGTAGAAATTCGTTTC
GAGCAAGCACTCGATCGAATCCTGAAATGCCATCTAAAgaagataatttt
tcaaatgttggaCGATATACATCGATGgataatttgaatttgaaagaagG
TGGCCACCAACAAGACTCTGAAAATTATACACCGAAAATGAACAGAAGTG
AGACTTTTAGTGGAGCTATTTCATATAATCATGAAAATCGAACCATGTAC
GATTCAAACTTTAATCGAAACCAATTGCCAACACAATCACCTACTATAAT
GCAAAAACAATGTCTCGGTATTCCGGCTCACGGTTCTGTTACTCCGAAAG
CGAGCAGTCCAGATTTCTCGAAAGAATCACCAATTCCACCCCCTTCACCG
ACGCCAAGCGTTtttgatttagaaaaattccAACAAGTACACATGCCGTT
AGACCGTTGTAACTGTGAAGAATGTATGTACGCAGACTATCTAGACTATC
TTGAGTTTCAACGATTTCGAAGGTATTATTCTCAATCTTGTTGTGGACCG
TGTTGTATGGCTCCAACTGATCTCCCTGTATCTCCACATACACCACAAAT
GGCGCCCATGCGTATTTCTCCACGCCATGTACACCCTGAAGCAAATATCA
TAGCACCTTTACCGGTGACCaaagaaactgaaaaacaaGCCAAAAATCTT
CGCACCTCAATTTACGAATCTTTTGTATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10102MSTRG.10102Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10102.1.p1MSTRG.10102.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10102.1.p1.exon1MSTRG.10102.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10102.1.p1.exon2MSTRG.10102.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10102.1.p1.exon3MSTRG.10102.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000069_pilongenomesc0000069_pilon:798724..813901 +