MSTRG.19210 (gene) -

Overview
NameMSTRG.19210
Unique NameMSTRG.19210
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000216_pilon:594390..605612+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.19210 ID=MSTRG.19210|Name=MSTRG.19210|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=11223bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:594390..605612+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGATACTCTTACAGTGAAGAGTGAAGGAAGTCATTGCAATGTCTGTTCAA GATCATTTGAAACTTATATATATCATAATGATGGCTACATCAAGGTTTCT TCAAATTTGACAATGGCCAAGGTGGATGACATATCCAcgttagttttgaa aaaaaagcaaGCGAACTGTGTATCTCCAGGATCATGGTATATCCAATTAT GGGAAGGGTTGATTGCATTAACTTGCTTGTTGACAACAATTCTTGTGACA TTTCAAATAGCGTTCCAAGCCAGTCAGAATGGCCTAATGTTAATGCTTCA CACATTTGATGCcctttttgttttaaacattATTCTGAAGTTTAATATTG GCTACATTGATAAAGGAACGGTagttttaaataaagaaaagatAAAGGAC AGATATTTCAAGAACAGGTTTATTATCGATGTAATTTCATGCTTTTTACT ACCTCTTGattatattgaatattttgatgctGCTGCTGAAGATTTCAAGA AGGTGGCACGTGCATTGAAAGTCTTGAAAATTCTACGTCTCTACAGCTTG ACCTCTTATTTTGGTAAGTGAAGTACTTtgatgggataaacttttgtggg gattcaaaaaaaattgtagttgCCTTAACAacaagatacgccatcttgaa ttttactCCAGATCTGCCAagatagcaattttttcggtccatttttgacg gttacgcaaaaatagaaatcctgaaaatgttatttttgtggccaaaaccc accagtaaaccactccaggtcaaaaaagtcacaaggaccatcagcagaca gctaaaagtgcttccaaacccagattatggaaagtttgaagccctctaca ggaggtgctagagatttttgaatgttttcaaaacattccaaaatcttttt ttcgttcgaattctacaggaggtgctagagattttcgaatgttttcaaaa cattcgaaaatctttttttcgttcgaattctcacttcaatgcagcgactt aatattttttgtaggaaaaagcttcttaatccgcgtatttttttcaaaca accGACAGTCCTGTGTTAATCGGCGCTAATCGAgatttaatcaaaaatta agctaatcggccgctaatccacttttgaacaaccgggccctggaaaaaaa gaacagatatttcaaaaatattgctCTTGTTTTTATCGAAggcacaaaca atttttttgaaaggcacaaactttttataaatggcacaaacttttttttt taaaggcacaaacttttttccaaaaggcacaaacttttatttcaaaggca agaacttttttccaaaaggcacaaactattttttcaaaggcacaaaCTTC TTTTCGAAAGGCATGAAGGCACGAAGGCACAAAGGATTGCAAGGCACGAA AAAAGTCACACTAGTTTTTGAGTAATCTAGACACGAATAATTAGCTTTTT TCAGATCAAAATACAAGATAGACAAAAATTCACTCTTGGCTTTTTAGAAG TTGTTGCTCTTTTCTGACGaaccaaaaatatacaattttcatctaattgC CGACCAATAATTACATGAAATGTGAGGCTAACACTTCACCTGTAATCATC AGTAAATCagtaatttcaaaagttttttatcattgATTACAAAAAGATAT CCATGATGGATTACCTTGCCTACATACCAAACCAaccatttttaaagatt ttcgaGACATTTGCTTGACATGAAGAAAACGCTACATACCAATAACtttg gacattaaatgattcGCAAAATGAtattaacattctattgagatgtgaaa ctggttcaagttgaagaattgatgagaaaatgGGCAGTACAAGAAATATT TGTAATACAAACTCTTAAATGGGCAACACCTCTGGAACAAGTTATATGGG ATTGTTTACCCAGTGACCCCAAAACAATGTCTTTAATGCTTGGTTCTTGC ATTCATGAAGTCAGAGGTTTCGTGGATTTTCTAATcttttgaaacttgtg tgatTGTAATGTTTTCCTGACTAAAGACACTTTGAATTTGTGATTGTTAT CCCTGACTAGAGAATATACTGTGAACTTGCATTTGATAAACACATTGCAT CTTGGCTTGGAGTATGTTTTAACGACGACATCATTTCTTGTTCAGATTGT TGTGTGGTGTTATCTTTTAGTGCTCCAGTGTAGATAGTGTCGTATATCCC CTGGTTGGATACACGTAGTTCTATGgtgctttttgaaaatgtgttcgaaa tactttaatcgtagaaattttagcaagactaattttagcgtatattagcg agccaggaaaatcttgattttttttggatttattttagcgaatcacgatt tcaaaaaattttgcgtggataaattttagcgaatactcgtattacagtac attattgattgaattcgttttctagcatttttttgcactgaaaccctttc tattgataaaaatgtatcaaggcaatataaccagaaattttgcgtggata aattttagcgatctagcgattcggcgtgttttagcaagatttattttagc gaaaacagggaaaactcgctaaaacgctaaaattagtctcgcgaaaattt ctacgattaaagtatttcGAACACATTATCTTCTTAATATTATTCTTTAA TTTACATCCATTGCCATAATAATATCttatattctctttctaatttACAG TTCTATCTCCATCATAAGATGGGTAAAACTACACTACTATGTTACAATTA TTGATGATGATTTGTGTTTTTGTGATGGCCTTTAGACGTTGATTGGTCTC TTTCCATCCTTGATTGGTTCACGTTTTGTTTGGTTGGTTTAGTCGTCTTG CTTCAGCTTACCGAACGTACATCTGTgtgtttttcctaaaaaatatcaat atacTGAAACGGAGAAAGGGATGGAAATGATTAGACAGTGAAGGATCTAG ATAATGGTTCTTGTAATTTATAAATAAATTGTACTTACTCATCCAGGTGA TGGAAAcatatttatgatttttgtgacttgtggttttcgagaaattaagt tgtttgattttttgtgtttttttttgattttttaggtgGAGTTCAAGATA GGTGTATGTGCATATATCACGAttctttttttaggatttttattGGTTAT TAATGATGAAATGTGGTGTTTTATGTTTGTCAAAGAGCGGATAATATTTG TAATTGATatggttgataatgttttttcCGTCGTTTGATGCTTTGGCGaa ccaatttttttctagagttgtgaaaggtatattttcttttttgtcgagat gtttatgttttttgtaGATTGTTAAATTTATGAATAACGTGTCTGCATCT AGTTGTTCTGTTGATGGTGTTTTCAATATGGGTGTTGAAGTTAAGGTTTT TGTCAAATGTAAGTCCAAGAAAATAGATTTCGTTTGCTTTgtcgattttt ttgttttttattgtataTTGTCTGTCGATTTCTGCAGAACtttttgtaaa tgtgatatgttttgttttgccaaagttgatttttaatttccatttttCAC ACCATGTGATTATTTCATCTAGAAGTTTTTGTAATGCTGGATTTTTTGAG TAGTTTCTATTTCTTCTTAGGTCGTCTGCGAATTGAGAGAGAAATGTATT TTTTCATCTGTAGGAATGTCGCTTGCAAATAATATGAAGAGTAGGGGACT TAGGCAACTGCCTTGAGGGagaatctttttgatttttcgtttTCAATCAG TATATGGATTTTTCTATCGTGTAGGAAACTGTTTATGATGTTGaggtttt tatttgaaatgttcAGTGAATTAAGTTTATACTGAAGAccttttttccat attttgtcAAAGCATTTTTCGAAATCAATAAATATTGCGTCTACGCTTTT TCTTCGATTGAAGGCTTCTGTAATTTTTTGAGTGATTATAAAAAGTTGGT CGTTTGTGGAtcttttttctctaaaacctgattgttctttattgattttt tcgttttcttctgcccattttctaatttttatttcaattgttttttcaaa tattttgcctAGTTGGTTGAGGAGAGTTATCGGTCTGTAGttttttgtgt cattttttggtcctttgtttttatatagCATGATCACTTTTCCCTCCTTC CAACGTTCGGGAAAATATCCTATTTCATAACatgaatcaaaaatattttt taaaatgggTGATAGGCTTGGCTCAAggttttttataattatattttgca tgctgtctatttcaggagcttttttatttgagagttttttattatttttg agattttttctgtttcaaagtgGTCCGTTCTAGAGTAGATGTTCGTAAAG TTTGTTTCATTGTACCATGTATTGGCGTTGTTTTCATGTTCTATGTCTGC TGTTATGTTACCTTGGAATATCTCCTCCTGACTTTTCCTGAATAGATCAG CTATCTCATCtttttttgttgtatccttttttgttgtgggattgtagatt tttttgatggatgatttttctttttttcctaaGATGTTATTAATACCTTT CTATGAGTCTTTGGAGTTTTTGGAGTTCCCAAGATCTACGTTTTTGTTTG TAAATCTTGACTCAGATTGCCTTATgtctttttggatttttttgtttaga ttgttgaatttggtttttgtgacggggtttctggttcttttgtattcttt ttgtagttttcttttttccttgatgtctttcctaatttgagagtttATGC CGTGGTTTGATCTGTTTATTGATGTTTCTGGGATAACCTTAGTAATTGTT GTGATGTATTTTTCCAGTCTAGAGATGttttcgtcaatttcatttttatt ttttggagggttttggaatttgtttAGAAGGAGgttatttgtattaaccc agttaactttattatattgtttgattttgctgtttatttttgatttttcg agttcgtcttttatttttatttgaaaggaaACCGGGGTGTGGTCACTGCC TACTTCATCTATGTTTTGCGTTGTTATTGAATGAGTTATTTTATTTGGGT CCCATACTGCAATGTCCAATGTGCTTTCTTGGCCTGTGGCCGGATGTTTG TATGTATATTCAATGTGTTCGCTATGTTAGAGATGTTAGAGTAATTTGAG Atcatggtttgagttttctgtaaaccttatttattaagctgtgcattttt ctgatagtggattgtttttataaagaaaagtgtttaatagcattttttat ttctttttcaaaagtatttttcaattgtgttgatagtttctcccaataga tatgctttaatttttggacctaccccggtggggtggaggtcctataaatt aacccgtgttcgttagttagttagttagttagttcgttcgttcgttagtt accaacttttctcgagattggctcattcaatttttctgattttttgcaca aaggtgcattactataaaccctcgaatgtgacggagcccgattttcgaaa aaaatttttttccggccggtagaaccggaaatgtcccgaaaaaagcggtt ttttgagattttctcgagattttatcattagttttttgcgattttttgca catagatgcacattagtactgccgaaaaggtgtcgaaaaccgtttgccga aaaaatttttttgccggtctgtagaaccggaaatgtgccggaaatcgtcg ttttttcacattaacgtcacattttttcattttatttaattgtttcttta cagaaacatgttctttatgatgatgcccaaaacttagcatcgtttgattt ccaaaaaaatcatcctccttaaaaatcgccggaacagccgaaaaccggcg taaaacggttttccttcattttttcaacttatactcgacagattttcatg attttttgcacaatgatgtaaaatggcaatgcccaaaatgtgacagagcc caattttcgaaaaagaaatttttccggccgctagaactgGAAATGtcccg ttaaacatcgatgcgtttcttaattgctttctccgttccaatagatatat aaatcgaaatttaaaattatacattacttccattaaattctaattattcg ttttataaataggtaggtccattaaagtattacttgttctttattatttt gtattttgaccagttatgtcttatgtgtttcattgtttcaatgttctttg attagtttgataaccaggtaggtccataaaggTATCACTTGTTAGTGTTG TTTTTATACTTGTGGTTATTTGAGAGAAGTTctattgatttttatttttt tgacttgCCGTGAAATACTGTGCTGAAAGGTTGGCTTGTTTACTGCTTGT GGACAGTTGTGGATGGTAATGTTACTTTTGGTTTTCTGCTTGCTATGCCT AGCTTTTCGAATGATGTTTTTAGTGCCTTGTCCTTTGCTGGGTCATTCCC GGTTAAtttttttGTGGTGTCTATAATTAGAGAGTATATTTCAgtgtttt ccattttttgtttgtgtaCGGTTGATAATAGAGTGTATAGTAGTGGTAGT AATTCGGTGAGTGGTAATCCTTTTTCGTACTGTTCGAGTTTGTTTGTGAG AGTTAGATTTTCTACTTCCAGGGTTTCGAGGCGGTCGTttagttctttat tttgtttattaagATTTTCTATGGTTTCTGTGTAAGAGTTTGTGACTGTT GTTAGTTGTGCGATATCGTTTTCCTGTTTTTCTAATTTGGTTTTGTGGTT GGTGTTTAAAGATGCGATTTCAGAGTATTTAAGGTTCATATCGGTGAGGC TTGATTTCGTGACTTTGTgagctattttttcaatttttggacctacctcc gggtgccccggtgaaggttctataaattaacccatgtccgtccgtctgtt accagcttttctcaggattggctcattagttttttctgattttttgcaca atgatgcaaaatggcaatgcccagaacgtgacggagcccgatttttaaga aaaaatttatttgggcaaatttgggccaaaaactacctaaaaatagggtt ttttggactttgtgtaaaatcctgtcattacttttttctgattttttgta caaagatgaagggcaagattctctaaagaatggctgaagtggtttttccc ggaaaattcttattcgtcTTAAataacggattttcgtattttgggggaaa ttccctttaaccaaataagaaaatatagcttttaacaatgttgactcatt atttttttctgattttttgcacaatgatgcaaaatggcaatgcctaaaat gtgtcggatcccgattttcgaaaaaaaatatatttgggcaaatttgggcc aaaaactgcctaaaaatagggttttttggactttttgcaaaatcctgtca ttacttttttctgattttttgtacaaagatggagggcaagattctctaaa gaatggctgaagtggtttttcccggaaaattctttttcgccctaaaaaac ggattttcgttttttggggaaattccctttaaccaaataagaaaatatag cttttctcaaagttgactcattatttttttctgattttttgcacaatgat gcaaaatggcaatgcctaaaatgtgacggagccagatttttgaaaaaaaa tatatttggtaaatttgggccaaaaactacctaaaaatagggttttttgg actttgtgtaaaatcctgtcattacttttttctgattttttgtacaaaga tggagggcaagattctctaaagaatggctgaagtggtttttcccgcgaaa ttcttattcgccttaaaagacggatattcgtattttggggaaattccctt taaccaaataagaaaatatagcttttctcaatgttgactcataatttttt tctgattttttgcacaatgatgcaaaatggcaatgcccaaaaaatgtgac ggagccagatttttaaggaattttaattattttgggcaaatttgggccaa aaacagcttaaaaggttttctGGGCCTGAATgatttaagagccatttttt ttaaaaaccttcagaataaagaaagtctgatacctcaccctcttagattt tgatgaaattttgaccaaatgatctatcacacaagaaaataagactctga aaatttcaccttgatatctcaagtagttctGAAGATACAACGTCTCAAAG Atgggctactaagcgaaaattgacccctaaaaatcatgaactctggtggg gagcagattttgaaagccaatgaatttttattcaagtacattagaaagct gatttacagtggatttcaagaactttttgtagggaatcagaaaaaatcaa attgagtctccaaaattttccccgaaaatctctagcacctcctgtagagg gcttcaaacgttgcgtaatctgggtttggaagcacttttagctggctgct gatggtccttgggacttttttgaagtaaacttttgacctggagtggttta ctggtgggttttggccacaaaaatagcattttcatgatttccatctttgc gtaaccgtcaaaaatgaccgaaaaaattgctattttggcagacctggagc aaaattcaagatggcgtatctttttaaggcaacaccaaatttttttgaaa ttttcagcaaggcttccttagtaggtctagtttatagcctcaaaaaaatc tcaatgggcttttgaagtctcttaaagatatgatcgattgaaaattagct taacttcgttgttttctccctcgtaaaatgctaaatcaggcccacttaag ggctctaacaggaattttttgtcaaaatattggtttgatcttctctagcc aactaatcattggcattaggggaacaactgaaaaagatttcaggtcattt ccatcaacagatgacattttatgactgtttctttatttttaagtacagaa tatgtaaaaaaatgagactggcatctggcctttcctaccattccagagCC CATATTTCCAGGAAacgcctcaacctttcacagtttggtgaataataatc ttaaatataagcaggctacttcaactaaatgggtttaacagtacttaatt cctattcaaaaactttttagactcattcagaaatcctactttgacaataa tttgcgctttaccgcaaaatttctaagtccaagtgtttTGATtaatctgg agcaaaattcaagatggtgtatctttttgCGTCAAcaacaaatctttttg aaactttcagcaaggcttccttagtaggtctagtttatagcctcaaaaaa tctcagaggatttctgaatgagtctaaaaagtttttgaataggaattaag tactgttaaacccatttagttgaagtaacctgtctatatttaaaaataat attcatcaaactgtgaaaggttgaggcttttcttgaaaatataggccctg gaatggtaggaaaggccagatgtcagtctcatttttttacatagtctgta cttaaaaataaagaaacagtcgtaaaatgtcatctgttgatggaaatgac ctggaattttttacagttgttcccttaatgccaatgattactctcgggta ccttatagccgggggggggggggttggaataagcagggggggttggaaaa aatctcaaaatttaataagcggggggggggttggaataaaataaaaatgt cctgggttgaaaatgtttgataaggaggctaatacagcagaattaagaca aaaaaaggaactttcaaaaacattttcccaaaaattaataagcggggggg ttggaataagaatgtcctgggtggaaaattttcgaaaaattaattagcgg ggggggggacggctattaggtacccgagagtagttggctagagaagatca accaatattttgacaaaaattaacctttagagcccttaagtgggcctgat ttagcattttaagagggaaaaaacaacgaagttaagcaaattttcaatcg atcatatctttaagagacttcaataACCCttactgttgttttttttcacc aaaaatgtTCCTCAAGGGCCTCAACGTAAGGCTCTGATTATCTTAAACCT CATAAAATTCCGCTTCTAACGGTACCAACGCATAGAATGCACCCTAAGTT agctagggggggggggctaaaccatttttgtttgattaGGGGCcgtattt ttcagaaaatattggaggctagcttgctaggggggTATGCTGAGTGTTGT GTAGTAGAATtgggggcagagctgataggttgaagatattttaaattatg ttcaAAATAtatgctgtggggaaggtttcaccccccttgaaaattttttt tgcctgtggaacaaaaaatttatcaagaatttgcatgcaaaatttctttg atattttgccttgtgaaggtgggggctatgtttctagaatttagcctGGG GTTATTTTCCTTacccccccctgaaaaatgctgggggctggaccctTCTG CACACTATGTAACAAGAACGTTAAcactgaatttttttcaaggtcaCAtt tttttCTGCCAGACTATATTCCTTCGTTCCTTCCAGTTCCTTCTTGactt tcttttctattttctctaAAATGACTTTGTCCAATCAGCTTTCGAAGAGT AGAAGTAGAAAtttttttAGAACAGTGTTGTGATATGGAATGTTATTTAg ctatactctcgggtacctaatagccggggtggaaaatttttgaaaaagag gctaatacagctgaattaggacaaaaaagggaactttcaaaaacattttc ccaaaaattttataagcgggggggttggaataagaatgtcctgggtggaa aattttcgaaaaattaattagcggggggggacggctattaagtacccgag agtagttcaATATCTTTTGACCTGGACTAAAGATGCAATAAGATTGGAAT CTGtatcaatattttatttttttcaacagGACATTACGAAGATCAGCTGG GGTTCAACACCAAAGCACTAAGGTCGTTCAAGTATTTCTTGATAGCTTAC ACATTGATTCACAGTCTTTCATGTGGATGGTTTATGTTAGCATGTCCAAA TGAAGCAGATGTTAAAGGATCTTTTAAATGCTACAGCGATGGATGGGCTG TCGTCAAGAAACAAAGTAAACTAAACCTTGTCTTTTACTAAAGTTACTTA ACCTTAGTTTATAAAGTGTGGTA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19210.1.p1MSTRG.19210.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000216_pilongenomesc0000216_pilon:594390..605612 +