|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000175_pilon:157074..164348+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.17426 ID=MSTRG.17426|Name=MSTRG.17426|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=7275bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000175_pilon:157074..164348+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TAAGGGGATTGAATCACTATAAAAGTTGGGAATTTCCAAAAGATGACATT
CATTTCTTTGGAAAGTTACAATAAGCTTGAAAAAGAATAAAACTAACAAT
GTGGACTTTTCACTTGACCCTATTATTTAGTGTAACGCAATTCATTTCTG
GAGGTTATGTGGACAAAGGTATATATAGATTTTTATCTACTTGAACATTT
GTTTGTGAAACTATTTCTATcagttttagatttttatgcACTCGGCAAAA
GAAGAAACTGCCCTATATGTTAGTGCCAAAACTATTAGTAGTGGTCTCTT
TAAGATCGCATTATCCATCAACATCCGTCACAGCCCGATATTTTACCCAG
TTTatatatgtgtgtttttctgtaacggagacggtaaggttctaatttga
ctagatcctgaacAGCTGAGGACGATGGTAactcagcacttttaccgtcc
ttaaTTTTACGGGTCAAAAGTGCGGGttgttccaaatcgcttcagtcact
ttaccgtcctcaaaagagcaaatacataaactcgctagtgaAACAGTGAA
TGCGATTCATGAATATCCTTTTTATACTCAACAGGTGTTCTGATCAGTCG
AAATTATTTAGTTGACCATCTCCCAACATGGAGCCCGACGTGGTACGTCT
CTTTCCAAGTCCAACCTATCCACAAAATCGCACACTGGACAAACGTGGTT
CGATTTACTGCCGGCACACAAGATTTCAAACGGGTTGGTGATCGTGTTCC
GGCTGTCTTCTTTGTACCACATACAACGAAGCTCCATATCTGCACCACTT
TGAATAACCATGTCAACTATTGTTTCAATAGCCACCCGTTGCCTCTTCAC
CAATGGGCTTCTGGTAAGTAACCAACGATACCTTTTGTCCCCGGAGAGGA
GACGCtctagaaaagaaaatctagccaAATTTGAATAAACTCAGGCGAAA
AATCGAaccggtgcattttcttgaaaagtttgaaccattttaaggcaaaa
acgTTCAGATTTTCCAATTGTACACCCTTAGTGTGACCTACGTATGGTAg
atcgtttaccttgagtgcccacCCCTGGACTCTTTTGTCATTACCTACAA
ATCTATCTTTATCTAAGACAATAGCTTAAGAGTCAAACGTGATAGACAAG
CGAAATAATTCGTGTTCTAGTTAACTTTAGATAGATATCAATGCACCATG
GCAACAATATACTAAATATATTTCATAATAAACGGTTGCTTTTCTTTGTT
TACAGTCGAAATTTCGCAAACTCAATCGGCCGCCAAATACCTCTACACCA
TTCGAATCAACGGTCGAACTGTTCATCAAGTTGAAAACAAAGGAGCTCGC
TATTACATGGGTGTCAATGTGTTCAGAGGAGACAACTTTTATGGACCAGC
ACCAGCAAGAATCAGACAATTGACTTACCATAATTTACCAAGTGGTAAAG
ATTATTTTCTTTAGCTTGTTAGTAAAGAAATGTTATCAAATAGTCTCCTt
tcccggggggagggggtactagggttggcagataaggggtatgtgcggat
gggacctccaaaaaccctTACAGaggctgatttttgctgaaaaggtgacc
cttagagagactttttttaaaaagtacttgatatatttgatttttgaaaa
aatccctACCcgtagagagactttgaaagatgaaaaaaccgacccttacc
gtctgcacatatccagcacccatttttgccaaAGTATCCTCTGGTCTTTT
TTACAATGAACAGAACAGAGCTCTATCTTTGAATTATATGATAAAGATTG
CGTGGTGAGAAATGTCCTGGTGGGAAAGTTTATATCTAGAGTTACCTGAA
GTGGTATGAAACTgtcagtagcagaataaaaaagtgtcttttctttctgA
CTGACTATCTAGAGTTAAATACTCTCGAGTTACTTCTAAGTTTTTCATAC
AGCTCTTAGAATTGTATTTTAAGATCAGCTCGAATTAGGGTCTTGAATCG
TTTTAACCCCAAACTCTTTTCAACTTTAGTTctcatttgaaaaatcttat
cacAAGTATTTTCTTGCCTAAATAGTGTATcataattaaaggttttattt
ttacataagtgttcccgtttcataccaTAGTATCTGCCTActgttatgtt
atgctgatataagcaaaaaatgtttttctttaccttattctgactaatct
tgctccacattcgtgtcaatccaatgtgaaaaagctttgcGAATTAAAAG
tcatgagtaagcaaacgatatcactcttatttaaaaacaaaacctttaat
tattATTTCTTTACATTCTAGTTTTCAAACTTGTCCGTAACACCATCATC
GTAGCGAACGTTAAATCAATGATTATCATGTTTTTCGTTTTAATCGTTCA
ATCAATGGTTTTAGTTGATTTAATGATCAAAACTACGGAACTATGATAAT
ACCGCTATACGGTTAAAAAGAAACCCGGGTATCTAACCCAAGGACACAAA
GGGAAAGCAAAAACTATACAGTAATTATTACACCGTCAGTCTGTCAGTAC
AACTTATAACTTATCTTATTTGCTGGATGAAATAAAATCAAGATAACAAA
GTTTTATTCATTGTTGCACAACTCGAAAAGCTTTGCTTTGTTGTCTTGAT
TTGaactttctataaaaaattaaaatggctaccttcaaattgaatttctt
ttaaaCATACAGGAACAGATAGTTAAATACAACATATTATTACTTATTTA
TGGCAGCAAATAATTGATGGTGAGCAGCAGTGTTCCTCACAGCCATCACC
GTCAAAGCAACCAAGAAAGACAAGTAAGTAGTTTCTTCTTTgtgttcaac
attttcatttgtcACATTTTGTGAAAATGAGGCGTCGAGTGGTggaaaaa
caagtttttgtgATTGTTTTTTAACGCCCAGTTTTAACGCCCAGTCACCT
TGAACTGactgccaagtgaaccgctgcgagtgggaatcaaaCCTCAGTCC
ACAGTCCACAGTGCCTAATTTTTATGCAtatccaggggatgtcaatcgaa
aatttcgattgtcgaaccaatcgaactcaACCAAACACCAAAACCAATCG
AACTGATTGGTCGAATCAATTGaactcaatcgaagtgattgatcggacaa
tcgaacccaatcgaatattgacatttttttctcgGTTGATTGGTTTCGAT
TCACTTCGATCGAGCTCGATTGATTCGATCGATCAATTCAATTgagttcg
attggtttcgattgagttcgattggtTTTGATTGAATCGGATTGCCTTCG
ATTAAGTTTCCTTTTTGTGCTTGAGGATTAAAGTCTGAGCAATAACGCTG
TGATCGTCTCCTTTCTACCCTTATTGGCTCCCTTTACGTCAgctcttatt
ggcgttattttttcgTTGCTGCCGTAATAAATAAGGGCCAGCAATaaagg
ggccggcgtaaaaagggccaacgAGGTAACTAGTCTAGATCTATTCCTTC
TACGCTACGACAATGAAAGCCTAGATTTAAGTCTAAGCCAATCAGAAACG
ATTGATCGAATCAACTGAACCCGATCAAACTCAATTGAAGTAATCGATCA
GACAATCGAGCCCAAtcgaaattttacattttttacgaCTTTGATTGATT
TCGATTGTCCGAACGATCACTTCGATTGGGTTCGATCAATTCAATCAATc
atttcgattgagttcgattgagttcgattgattcgattgacaatcaaatt
caattgtgttcgattgacatcccctgggcATAATGCATTTACAAGCATTC
GAGCATTTACCACTGAAAGGCATGATAGTAGATTGTGATCTGATATtacc
agacagtgtcaatcgaacaacttcgaacaaaaatcgcaatcgaaccaatc
gaacgtaatcgaacgcaatcgaataattgcgattcgattatcgttgacta
tgttccattggttcgaATACGATTATGTTCGCTgagtaatcgaagcaatc
gaacggcaaatcctgggtaatattcgattgcgattgattgcgttcgacaa
tcgaattgcaattattcaattgtgttcaattgcattcaattgattcggtc
ttcgatttgttcgattgacaccgtctggatattATGAGATTAAAGTCAAT
ATATCAATCAagattaactcaaatcaaaacacaTACTGtaacaaaaattc
actttcgtttttaaaatatACAATATATTGCTATATTACAGCTATATTCC
TTAAAATACACAGTGCAAAGGTTTATGATGGCAGATAGTGCAATGTACtg
gagatcaggtaacttgcatcagtggaggctaatatgcatagcctttaaaa
tgaatgacctggctggtcattgaaatataaaattaaatcaaaacaaaaat
ggtagagtagtgctgcgagcagagctggttagttcatttgttttgaaatt
ttgctgctttgattgatcagtcatttgatggctatgcaagtttccctcca
ctgatgcaagttacccgacttcacgatATCACCTTTCCATGGTACTCTCT
TTTAAGGTACACATCAATATTTGAATTACGATTATTTGATTAATGTATGA
CCATTACTGCATATATATAAAACACCATACTGTGTCTTAAAGTTtgagaa
atgtttgtttgctAACTCAGCTTTTTTGAATTATATACAAGCTCTTTAGT
ACCGTCGAAGAGTGATACATTGTGCTTCTCTGCCATACTTTGCACGGTGT
ATTTTACCAAATCGCCAATATGTACATTTTAAAGACGAAGGCAAATTTTT
GTAAGGTTTAGATTGTAATTGATCACATGTTTAAATCTGTAAACAAGaga
tttaaaatttgatgactggaattttgagtaaaacaaaggaaataaaGTGA
GTAAAAAGTATGGCAGAAAAGTGCAATATATCACCCTTCGATGGTATTGA
ATAGATATGAACGTGGAGCAATCTTTGatcgaaaacaaaaagaaatccaa
aatatttgtttacctCAACCAAAAAGAGCAATAGACCGATATCtggtctg
atatgaaacatgaaaACCGATATCTCAATCTAAAAAATGAGAGTTTTATG
TAATTTAAATTTACACAAGAATGATTTAATAATTTATTATAATGTCCAAT
CTTAAATTTAaccacaaaaaatattttgtccaagAAACCTGAACTTTTCT
AAGACGATGTCATAGAATCCCGAAAGCTCTATTCAATCTTAAAGATTAAT
TAAAAATCTCTAAGATTAATATTAACCTCCTTtaaaaaacataacttttt
aatGGAACTAATCATATaccaattttttagaatttaaaaaatcaaacttt
gttggTCAATAAATTTCTGTTAAGTTTTTGTTGTCAAACTAATAGAAACT
aagaactgaagaaaaaaatgtgcatGATGTGCCTGTTAAACTGATGGCCA
CTACTCAAAGCTCTAAAGTCTCTGCACACTAATTTACTGGTCGTACTTTG
TGGAACTATAATATTTGTCAGGTTTGCTAAACTTTCTCTGTTGTCATACT
TTGCAGAAGTTCCTTGAATTTTAATCAAACACTCGGATTTTTTAAGACAG
TCTGGATTACATGATATGACATGAGATTGATAATTGATGATTAAATGATT
TGCattcagattttaaaaatcgGCAATGATAATCAAGGTTTGTCTAATTA
ATATTTATTAGTTAATTTTATTGGGTGATCAATAGTGCTAATCTATCATT
TATCAGTTATCTAGATCATGATTGCTGGTCAAGAATTtataaatttcaag
aattttttaagTTGTAAATGTAACGTCTGATGTTTCTGAAAAGCTATTAC
ATGTATAaacagtgctgcaaatagggaaatatatattatttaaaacaaat
ttcaatcaattagaattgattattgatatattattattgattagttatCA
ATTGCTAACAATAACACAAGGCTAAGGATAAGCAATCAATTATATACTGT
CAAAGGACAAGAAAAAACATATCATCCATGTAGCATTATGTCTGATGTTT
TAGATAAAAccaagaatgttttttttgccCTTGGGAATAggcttcttttg
aaaaacaaagTATTTTAGTTGCCttggaaatatataaaaagtattttgCA
AAGAAAGCATGTTTTCACCATTTCTTTTGCAACTAAACTTACTACTATTG
ACTTATCACCTTGGCTATACAAGATATGAAATTGTGAAGGTTTGATTTTG
TTTAATTACTTTAAAGCAGTGCTCAGACAAGACAAGTTAAACCCTCTTAA
TGGCAAGcagggggtagaatctaccaccctagataattttttatcaatat
gatCATATGTAGTTTATATCAAActtacaaaaagtaaaaaataattgaca
CAACATGCATTATCATAATTTGTTctctattttttctatttctccATTTT
CCTTAACACTGCAGATCACTGGATAGCATCATCTTAATCACTAAAACTat
tggatttgaaaaattattatttctttGTAAAGAGGATATATTCATCCcat
ggaaaattttgaaggttgctaaaaacctaaaaattacaaaaattcttTGT
CTACACATCACTTTGTTTAGGTCTTGGTTTGATGAAACAAATTGCGGCAG
TTAACAAATCATTTAAAGCTAAAGCAAAACCCAAGAAAAAATCAGAGATT
TGCTTTGTTGAATTCAAGAGATCTGCTGAAACTGGTTGGTATATTTTGTT
TGTGCGGGACAactgaaactctaaattttgtCATCAATACAGACCAAAGA
GATTTCTCCctgtttcaaacttttcaacctgaattttattacacaaaaac
ttttgaaaggtTTAATCTTTAGCTAAGCTTTGTTGTCTTGTTCAATTTTA
AATGCATGCattctttctccttttttttGGATAATCTAGGTCAAAGGATC
TACAAGCTGAAGAGACCAAAACATAACAATGGAATGAAAAGAAGAATATC
AAATACTGGTAAATGTGCAGTTACATTATTTTATGCACTGGGTAATATTG
AGGTACCTAAATCTAAATAGAGTTGTGTGTCTTGTATGTATTGAAATTTC
CACTctttcttgttattttcatcaGTAATCACTGCAGATGAGCAAGTTTT
GGATATTGATGCAGAAAATTCAAACTGGCAAATTGCAGAAAATGTGGACA
CCATCGATAATGAAGAATTAAATGACATAATCCACCAAAGTGATACAAAA
AGTAGATATCATATCATCATCCCTT
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000175_pilon | genome | sc0000175_pilon:157074..164348 + |
|
