MSTRG.13872 (gene) -

Overview
NameMSTRG.13872
Unique NameMSTRG.13872
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000113_pilon:382283..391569-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13872 ID=MSTRG.13872|Name=MSTRG.13872|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=9287bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:382283..391569- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAACACCCCTGTCTCACAGCTACGGTGGAACTTTTTTCCTCAGTGGGGA TAAGAATTCCTATCGAAAATCAAGTGGGGATAAAAATTCTATTGTTCCAA GGTTAAAGAAACCAGTGGGAATGATTTTGGAGTTCAGTTTTTAAACATTG ATTTTCGGATGGGGATGAAGTAAATAAGTCAATTTCTCAGTGTGGCTGAA ATTCCCGGGTGTTTTCCTACCGGGGACGAAATTTTTGCCAAATTTTCCAA TGGGGCTGGGGTCCCAGCGGGTCTGTGACACAGGGATGTAAAATAGCTTC AGTTTCGTGGAACTTTTTACAAGTAATTTATGAGTTATTAACTTGCAATT TATATCGCTTACAAATTATATCACAAATTATATACCATTGGACCAAATAC ACTCGAACTCTGTAAGACAAGAATCTCATAATTTGATATTTATAGCTTTT TTGGAGGGGAGTCATCTTGTTTCTAGAAAACAAGGGTTTTTAATGAAGTT TTTTCGTGCATATGGAGTTAATAATTTTTGTTATATCTTTTTAACATTTT TTCCTTGATCCTCCAAAAATTTTGGTTCTTCTTACAAGAAAAGTGTTATA TAATGTATATACTGTGTGTATAAAATAAAGAAATACCTAACAACTCTTCG AAACAAGATTGTAAGAAGTGTGAAAAATTATTGTAGTTGATTCAATGTGG CGTTTGAAATGTGATCGTCGCTGATAGAATTAATTACTAAATATTAAAAA AGAAAAAAAACTGAGGTAATGTACGAAAATGCAAGTAGAAAAATAAGCAT GAATATAAATAAAGTATCATATGTAATTTTGATTCTTAGGGTTAAGGTCC TGCAAAGGCTAGTACCTTAGGTAGAGTACTTCCTAAAAAACTCTCTGTAG GTCTTAGTTGAGATCCACAGAAAGGTATTATTTTGAAAAGGTGTGTAGCT TTCTTAATGTGATTGTTGAAAAGTCTAAATCGTGATTTATATGTAATTAG TGTTTTAACGAGTGTTGAGGAACCATGTACTTTGGATTGTGTTACTGTAG AATAGACGTGTTTTTGTCTATTCTCCGTACCTCAACCACCATCCAATTGG TACATTAAGATATCAATGGTACATAACTCGTTTTGGTGGCAATCTTAGAT ATATCATTAGAAATGTGTAGATGTGTCTCTTACCGATAAATCCAATATCA AGGTTCATGTTTGCCATGTCTGTGTTCAATCTTGTCAGGTTGCGGAAAGA AATTTTCCTCATGGTTTTTCGGTTTTGATATGTTGGGGGTTGGGGATGAG TTGGGTATTTTCAGTTTTAATTTTGTGGGTTATGGGTGCTAAGTGTGTAT TTTCTTTGTTAATTTAGGCTCACTTAATAGTGATTGTTATTGGTGTTGGG ACTCGTTTATTCTTATTGTGTTTTGAATTTGATTTCTTTTGTAGGTTAGG CTCACTTATTATTTATTTATATGGGTGTTAGGACTCGTTTTTTCTATTGC GTTTTTGAAAGTGGTTTCTTTTAAATTCTAGTTTTTGAAGATTACATTTT TTTAGAAAGCATATGTTGTGTATTTTTATGTAAGCATATCTTTGTATTTT GTTTGTAGGAGAAGTATCTTAGGTGTATTTATTTTGATATTTTTGTATTT GTGTTGTAAATTGGTGTTGTTTGTTTTATAAGCTTTTGTTCTGATGTTGT ATCTTATAATTTAAGTATTTAAGTTTTGATAGGTATATTCGTTGTTGGTA ACTTTTATTTATAGGCATAGTAGTGTGGTTTTTTGGTAACTTTTATAGGC ATAATGATGTGTTGTTGGTTATCGGCTTACGTCGTTTTTGGGGTTGTTTT CCTATCATATTGTGGGTGTGTTTTTAAAGCATATTTTGTATTGTTTTGAT GTTGTTTTTGGTAACGTTTAATGGTGTGGTTGTTGGTAACTGTATATTGT GGGTGTATTTTATAAGAATATTTTGTATGTTTTATGTGTTTTTGGTAAAG CATGGTGTGGTTGTTGGTACTATAGGCAACTGGTGTGTTGTGATATGTAT CGATCTTTGTATGTTTTTGTATTTTGTAGTTTTGATGTTGTTTTTGGTGA CGTTTATTTATAAGCATAATGGTGTGGTTGTTGGTAACTATATATTGTGG ATTGTTTTGATGTTGTTTTTGGTAACGTTTATTTATGAGCATAATGGTGT CGTTGTTGGTAACTGTATATTGTGGGTGTATTTTATAAGCATATTTTGTA TTGTTTTTGTTGGTATATTTTGTATTGTTTTGATGTTGTTTTTGGTGACG TTTATTTATAAGCATAATGGTGTGGTTGTTGGTAACTATATATTGTGGGT GTATTTTATAAGCATACTTTGTATTGTTTTGATGTTGTTTTTGGTAACGT TTATTTATAAGCATAATGGTGTGGTTGTTGGTAACTTTTATAGGCATAAT CGTGTGTTGTTGATATGTTATTGATATTTTGTATTGTTTTTGTTGGTATA TTTTGTATTGTTTTTATTGACAGATCTTTGGAGTGAAGTGTTTCATATAA GTTTTGCAGAACTTTTGGCTGTCATTTTGTTGAGAAAAGGAAACTTTTTG CTGATATTTTAATTTGATTAAAATAAAATGGTAGAAGAAAACTTTCCAAT CATAGATATATCATCACTGGTACAAACTCAATGTCAAGATGAAACCATTT TACAAGAAGCAGCCAATCAATTGATGGATGGTTTTAGTAAATGGGGATTT ATTTATTTGAAAGGTCATCCTATTCCTGAAGAATCGATTGCAACATTATT CAAAGAATCTGAAAATTTCTTTACACAACCTGTCGATAAGAAACGAGAAG TAGAAATGGACGCAACAGATAGTGATTATATTATGGGGTATGTTCCATTC AAAATGGAAAGAATCGATCCTAGAAAACCCTTTGATCTCAAAGAAGCCTT TGATTACAAACACCATATCCGACAAGATATGAAACAAAAATTGCCACCGC AATTTACAAAAAGCCTCGAAAATTTCTTTGACGAATGTTATGATTTGTCA TTGCTGCTGTTCAAATTACTCAATAAATCCTTGGATATTGAGGATGATCA ATTTTTCCCAAATTGCCACCGAAAGTCTGGTTATTTTGGAAATGGGACCT TGTTAAGGTCTTTATATTATCCTGGTATAGATTCTAAAGATATTCTTCCA GAGCAAAGTAGATGTGGAGTGCATGCAGATTATGGAACACTAACTTTGTT GTTCCAAAACGCAGAGGGTTTAGAGGTAAAACTATTCAGTGTTCAAAGTT TTCGAGTCTGCTAAATTGCGTGGGTTGCGTGGGTGCGTGGGTCAATATTT TTGCGTGGGTTGATATTTTTGCATGGGTCATTTTTTTGCGTGGGTGCGTG GGTCAAAATATTTTTTGCGTGGGTCAATTTTTTTGCGTGGGTCAATTTTT TTTGCGTGGGTCAAATTTTTTGCGTGGGTCATTTTTTTTGCGTGGGTAAA AAATTTTGCGTGGGCCATATTTTTTTGCATGGGTCATTATTTTTTGCGTG GGTCATATTTTTTGCGTGGGTCATTATTTTTTGCGTGGGTCAAAGTTTTT GAGTGGGTCACTATTTTTTGGTGATTTTTTAGCTAACTCGATTTTTTTAC CAAATTAAAACTTTCGAGTTAGCTTAGACGTTTTTTTTGTCAAATCTTGG TCAAGTTAAAATTTTCAAGTTATCTTATACAAAAATGTGTTGTGTATAAA TCTACGAAAACTAAACAAAAGCACACAGTTTTTATGTAGTAACACCTTGT GGTTTATTTTACATAGCTGCACTTATTTACTATAACATTATACAGAATCA ACACACACCCGCCTAATTTTTGTAGACACACTTCAGGATCACACTTTTGA ATTTTAGCATGCTATATTTCAAGATTCCAGTGTCATGGAAATAAACACTA TAACTTTAATTTTCTCCTCCCTTTTCTATTGCTTTGAAAAAAAGTACAGC GTCTTTATTTCGTCCAATTTTTTAAATTGGCCTTTAATGTACTTAAATCA AAGAAATTACAAGTGGGGTGGACGAAATAATTGACAACGATTAAATTGTT TAGTAATCGGTCGCCTAATGAATATAACTTTTGTAGAAAAATTTTCAGAT TTTGTCGCCATTTGCTTTGTTCTTTAACACTCAAAGGAAACCCAAAAGAT TAAAGCGTTGCTATAAGAAGCTTTAAAGCTTCTAAAAAGATTCTACACGT TTTTTTATATAAGAACAAACTATATAAAAACATAAGGCTTCAAATCCAAA AAACTAAGAACATCCAAAGGCTTCGAAAATTGTTGACGTTCTTATAAAAA AAACGTGTATAAAGCTTCCTCTTATAAAAAGACAGCTACAGCTATGCAAC ATAAACAAAATAACCAAAACGTGTTATGTAAAACACATCCAACATTTTGG ATGTGACCAGTTCGAATTTCAAGGGAAGGTATTTTTTCGAATTACAGAGA GAATTTCGACCCACGCAAAAATTTTGACCCACGCAAAAAATATGACCCAC GCAAAAAAAATTGACCCACGCAAAAAATATTTTGACCCACGCAAAAAATT TGACCCACGCAAAATTTTTGACCCACGCAAAAAATATTTTGACCCACGCA CCCACGCAAAAAATTGACCCACGCAAAAATATCGACCCACGCACCCACGC AACCCACGCAATTTAGCAGACTCAAAGTTTTCCCGTCTCAGACGGATTTC CGTCTCAGCGAGGTACAAAAAAAGACTTTTCCGTCTCCAAATTCAACAAA ATTCTGCAAAACATGAATAATATGGCCAGATTTGTTGTTCAAAGTCCATT TCCGTCTGTGATGAAAATTTTGCTTTGACCACTGCTATATTTATGATCAT TTCTAACTTTTTTACTGGCTTATACATTTGTATTAGAAGGTCGTATAAGA AGTAAATAGTGTCCTCTAGTGGTGTCAGCCAGGACTTGTCCATTTAAGTC TTTTTTTAACAACTTACTTTTAATTCTAGCTTTTAAAGGACTTTGATGCA ATGATATAACTAAAAAATTAGTGTCATCTTTCCCTCAGGTTAAATCACCA TCAGGGAATTTCATCAAAGCGAAATTGATCGAAGGAACAATTATAGTGAA TGCAGCTGATCTTTTAGAACGTTGGTCAAGTGGACGAATCAAATCTACTT TACATCGTGTTTCCTTACCGAAGGATACAAACCAACCAAGACAATCAGTT GCATTCTTTGTGATGCCTGACAACGAATGTATAGTGGAATGTTTAGATGG CTCCAATACTTACGAACCAATCACAGCTTTCGATCATATTGACAATATGT ACAAAGCCACATTCAGAGATTGAAAATTAACAACAGACTTTGCACCCACA TTCCTCTTGGTTTGTTTTCATGATTTACTGACCGAAATTAACGTTTGTGT GGCATACTCTTTGTTGTCAAAATAATTAGAAGATATTAAGTAATTAAAGT GGTGCATATTCAATTTTTTTAAATGTTCTTCTACACATCCATGCATGGAC ACTTGGACACAATTCCACAACACAAAATTTAGTTTTTTATACTTAAAGCT TTGGCATATTTTTGTTTTCTCTTATATTTATATTTTGATAAAATTTATAT TTTGATAAAACCTTTTTTTTTTACTTGTTTTTATATTTCTCATATATATA TTTTTTTGATTAGGAATTCATACAAATCTTGAGTACCTTAAGGGAACTCG CCAAAATTCGCCAAAATTAGTTCCCGCCAAAATTAAATATTTTGCTCACT CGCCAAAATAAGTTCCCGCCAAAATTTAAATTTTTTGTTTCCTTGCCTAT TAATAACCCCTGAAATTCATCAAAATTGCTCAAAATAAGGCAAAATAAAA CATATTTACGCTGTCATTCGCCAAAATTAGTTCCCGCCAAAATTAAAAAA TTCACTATTCACCAAAATAAGTTCCCGCCAAAATTAATTTTTTTTAAGAT TTTCGCCGCTCGCCAAAATTAGTTCCCGCCAAAATAAGTTCCCTTAAGGT ACAGGGATCCCACTCCTCCTAAAATTCCTAAAAATCCTAAAATAAGACAA AACTCCTAAAATCCTCCTAAAACTCAACAAATTCTCCTAAATTCATAAAG TCTGAAAACTTTATCAAGCACGACGGTAGCAAATTATGTTTGTATATTTG TATAATCAGACAGGAAGCTAAGATTTTTTTCTCATTAAAGTCAAAACAAA CTGGGAGTAGTAAGCTACCTGACCTTGAAACAACATGTTTAAAATATATT TTTGCACTGAAATATTTGGAACAAAAGCCTATGTTAATTGAAAGAGTGCA GACTGTGTTCAACAAAGAGGGCTCAAATGTTCAAGAACAAGGTTTGGTGG TTTGCGCCCTCATCTGTGAATTTTTTACTTGAGCATAGAATGCACCCCCC TGAACTTAGGGGGGGGGCTAAACCATTTTTGCTTGATTGGGGACTGTATT TCAAAAAAAGATACTGGGACTAGCTTGCTAGGGGGTTGAGTGTTAAGTAA TAGAACTGTGGTCAGAGCTGATAGGTTACAAATATTTTAAATTATGCCAA AAATCTATGCTGTGGGGAAGGTTTTGACCCCTCTTAAAAAAATTTATCTT ATCTTATTAAGAATTTGCATATAAAATTTCTATGATATTTTGTTTTGTGA AAGTGGAGGCTAAGTTTTAAGAGTTTTTCTGGGGCTTTTTTTCCTTCGCC TCCCCCCTGAAAAATGCTGGGGGCTGGACCCCTCTGCACACTATGGCATA GGCTTTGTTAGAACGAATAATATAATACGTAAAGTAATTTTATTTCAGTC TTCCTGTGGGTGATTTTTTTTCGGTAGAACATCTTTCTAATGGCTGACTT CAGGTCGATTTTAGAAATTTATTTCTTAAATTTTCCTAAAATGCTCCTAA AAAATTGAAAATTCTCCTAAAATTCTCCTAAAATTTGGCCAAAATCCTCC TAAAATTTGTCCTAAAATTAACATAATCAGGCGTGGGATCCCTGAAGGTA CGCAATCACTGAAATGATCTAGATCTTCCTTTATATTTAGTTTATAAGGG CGTAACTTCTGAAACTATGAACCAAACATAAATATATCAATAAGTGCTTA AACTGACAGCCTTTTGAGCTTTAGCCTTTTTCAGTGTCGCTTCTCAAGTT ATGAGAATAAGTGTACACTATTTCTGGGAGAATTTCTTCATAAATCTTTT TAAATTTTTAATTTCAGAGAGAGTATATAATGGTAGAAGAAAACTTTCCA ATCATAGATATTTCATCACTGGTACAAACTCAATGTCAAGATGAACCCAT TTTACAAGAAGCAGCCAATCAATTGATGGATGGTTTTAGTAAATGGGGAT TCATTTATTTGAAAGGTCATCCTATTCCTGAAGAATCAATCGCAACATTA TTCAAAGAATCTGAAAATTTCTTTACACAGCCTCTAGCAACTAAAAAAGA ACTCTCAGTCGATATCAACGATACTGATAATATTTCTGGTTACACTCCTT ATAAAATGGAATCATTTGATTCATCCAAACCGTTCGATCTCAAAGAAGCA TTCAACTATCTTCACCATGTACACCCAGAGATGAAGGACAAATTACCAAG CACTTTCCTACAATCGTTAAAAGACTTTTTCGATCGCTGCCATGAATTAA CACTTTTGCTATTCAAACTCCTGGCAATCTCATTGGACGTCAACGATTCA GATTACTTTCCAAACGCACATCAAAACATAGGCTTTCTTGGTAACACAAC AGCATTGAGATCTTTATATTATCCAGGTGTTGATTCTAAAGAGATTCTTC CTGAACAAATTAGGTGTGGTGAACATACAGACTATGGAACGTTAACTTTG CTTTTCCCAAAAGCTGAAGGTCTAGAGGTAAATATAATCAGCTTTTTCGA GAACCAAGAGAATCCTACTGTATTGATGCTTTCAAGTGAGGCTCCGCTGT TCCTTTTATTTCTTGATTGTTTGGCTGGAGTTTTATTTTTAAGCCGTTCT TAACTGCTCTCGGGTACCAAATAGCCGGGGGGGGGGGTTGGAAAAAATCT CGGGGAGGGGGTTGGAATAAGAATGTCCTGGGTGGAAAATTTTCGAAAAA TTAAATAGCGGCGGGGACGGCTATTAAGTACCCCAAAGTAATTTTCTTTA CTCGAGAGCGTATAAGTACCTACTTGGTCGCCCATGTTTGAAATTGTAAT CTTACATCTTACATCATCAATTTTACATCATAATCTTACAGATGTTCTTG TGCTTAGAATTGATCAATTGAGCCTCATGAGCCTCGTTTTCTATTGAAGA GCCCCCTCCCCCATCGGACCTTCGATTCACGCAATCACGCAAAGTTTTTT CGCAATTCACGCAATATTTGTTCACGCAAAGCTTTCCAATTCACGCATTT ACGCAAGTCAAAAAGCCCATTCACGCATTCATGCAAACCGCTAGGGCTCC CATCGAAACTGTTCTTAACTTCAATTTGAATAGGTATTCATTGTATGGAG ATTACTAGGGCACTTACGGTTTGTATTTCTATTTCTATCGTATTTTGATT AAGTTTTCTAAAGCTCAATATACAACATACAAAAACGGCCTTTTTGGACG CGCTCTGAACTGTCTGGGGAACAAGATTGCATAAGCATTAGCATTTTGTC ATATTTTTTTCGGTCAATTCATTATTGACGTATATTCTTACTTATCTATC TGTCAGGTTAAATCACCATCAGGGAATTTCATCAAAGCGAAATTGATCGA AGGAACAATTATAGTGAATGCAGCTGATCTTTTAGAACGTTGGTCAAGTG GACGAATCAAATCTACTTTACATCGTGTTTCCTTACCAAAAGATACAAAC CAACCAAGACAATCGATTGCATTCTTTGTTAACCCAGATAACGAAACTTT GGTGGAATGCCTCGATGGTTCAAATACTTGCAAACCTATTCGTGCTTCTG ATTGGTTAACAAAGAGGTTTGGGGAGACTTTGAGTTAGAATACTCTGCTG ACTTTATAACTAATAATGTTTTACAGATTCCCAGGCCACCTTGCAAGCAC ATGGTGGGCCTCTATAAATCGCTCATACATTGGTTTGGTTTATTAAAGTT TTTATAAAGTTAGAATTTTAATTACATCTCGTATTTCTTTCACTGGACCC GACCTGCTTGCTTGCAGTTTGTGAACATTATTTGAGTGCCATTACCTGAA AGTTAATGAAAAGCTTACTTCTGACCTTTATTTAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13872.3.p1MSTRG.13872.3.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
MSTRG.13872.2.p1MSTRG.13872.2.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
MSTRG.13872.1.p1MSTRG.13872.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000113_pilongenomesc0000113_pilon:382283..391569 -