MSTRG.13473 (gene) -

Overview
NameMSTRG.13473
Unique NameMSTRG.13473
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000107_pilon:430379..442244+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13473 ID=MSTRG.13473|Name=MSTRG.13473|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=11866bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:430379..442244+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13473.1.p1MSTRG.13473.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107_pilongenomesc0000107_pilon:430379..442244 +