|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000089_pilon:1232488..1239962+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12098 ID=MSTRG.12098|Name=MSTRG.12098|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=7475bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:1232488..1239962+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CGGCCATGATAATTATTATTGCTCAATATGGAAAGGCCTGGGACCAAAGT
AGGTTGCAGATGGAAACTATTCAAATACTGATATTTCGTATTTCAAATTC
AGTTCACATCGTTCAGCAGATCTGATCATTTGAACGGGTAAggtttttta
tcatttgaacgggtaagggtttttttatcatttgaacgggtaagggtttt
tttatcatttgaacgggtaagggtttttttatcatttgaacgggtaaggt
ttttttatcattttaaagaaatttgtaaACGCCTGTTTTATCTCTTGCCT
GAAACATCAATTTTTGGATTCCGAAAATCTATACACCTTTACGACCGTAG
TCGCGGGGTCAGGCGCATGCCACTTATTTATCTAATTATCCCAccaaact
cgatccaatccttatttgacacatttttctattgtctaagTCCGAAAAAA
GGACTTGGACgtttttagtgggataaagcggacaaaaaataccCACGCGG
CAATTTGaggctacggtcaaaaaggtgtatttccTTATGTAGATAATACT
GGGGCAGAAACGGAGGAAAGGGTCCTCGATTTTGAAACTATCGTTTGTTT
CAttgggataatcagatggtttcagattttttgcctGTAGATTCCTTCAA
TGGTTctgagcaaaacctcaaaatattttttgcttaactctttttttaaa
ttgaacaTGCCCACGTGGTAAtcggcggctacggtcgaaaggTGTATTAT
CATACCTCGACTTTGGAAAAGACTTACGCAAAAGGATTTGGAGGCTTCGC
TCAGAATCAGGGATAAGAAATCTACAGGTAAAagatctcaaaccatctga
ttgtCCCTTTAACTCTCTTTTAAGGAGAAGCAAATATGCGTTCGAGTGTA
ATATTAGTGGTGGTGGCGTGCTTTGCCCTGGCACAATGTCAAGCTACCCC
TCGACCAAAAAGGACtagaagaaagagaaaaacgCCAGCTCCTACTGAAC
CTCCGATGGGCAAGAATGAAACAGTTGGTCagctttttaattattttttt
atatatctcTGTAGTGTAAGGTTTTTGAGTCTTTTTAATCAAAGATACCT
TTCAAAGGGCTTTGCACGATATATGGATTTACTTTACTCTAGGGTGTTTA
AGACAACGGAAGATTATACATTAAACGAGCCAACCCTACCTCTGATTCTT
GCACAAACGCACAGCTATCTTCACATGTTCTATTAAACGTCAGGCAATAA
TCATTAACCCGTTCGACTGGCACgtctttaaaaattatatacaGTATCTT
CTCAAAGGGCTTTCTTTATTGTGTTTCCAGCTTATTGAAAGAGGCTACAT
GCACTCTTTATTTGAAATTACTTTACGTTTAGATTACTTGATGAAAGAGG
TTAAAACATTGAGAGGTCAATTGAACCAAATTTCCAGACAATTGATGTTG
CAACAATTTTTCACTGAAGAAAAGATCAGAAATGAAGGATTCTCTGGTAT
TAAACAAATCAGAACTTCGAAAGGTAACATTGAATTTAACAActctttct
caaaattttgtcaaacaGGTTTTTCGCCTTGCCTCAGTACCCCCACTAAA
cttttaaataagaaatataGGAGACTTTTTCCTTCTTCAATGTTTCTTGT
TTTAAGCGaacataaaaatttccatgaaaattctAAATGGAATATAAAAT
GCAAATTGTAATGGTTTTAGAGTCAGCgttctcattttttcattttcact
tttgattAGGCATGAAATTAAATTTCTTAGTGAGGttgaaatgttttctt
ttcatcggGATGGTGgttttttggtcaattcttTTACTGGTTTGGGGATC
CTATCGGGTCTGTGAACTACAAGTGTttaattttaaatggaaaaatACTT
CATATCGGATTCTTTTTAACTTGTCAGATATTGTATGAAATTAGAATTGT
CGAAAAGATCAAATTAACTTTGGTGACAAAAATCTTATTAAATGAAAGTT
TTATGAGAAGAAATTctctaaactaaaaaaatttgacgataaaaaattca
atcaacTAAAACTTTGACGTCGaaaattcaatcaactaaaaaagtttgac
gacaaaaaattcaatcaactaaaaatttgacgttgaaaattcaatcaact
aaaaatctgacgacaaaaattcaatcaactaaaaaagtttgacgacaaaa
aattcaatcaacTAGAAATTTGACGTCGaaaattcaatcaactaaaaatc
tgacgacaaaaattcaatcaactaaaaatttgacgacaaaaaattcaatc
aactaaaaatctgacgtcgaaaattcaatcaactaaaaatctgacgtcaa
aaattcaatcaactaaaaatctaacgacaaaaatttaatcaactaaaaat
ctgacgacaaaaattcaatcaactaaaaatttaaggacaaaatttaatca
actaaaaatctgacgacaaaaaatcaatcaactaaaaatttggcgataaa
aaattcaatcaactaaaactttgacgtcgaaaattcaatccactaaaaat
ctgacgaaaaaaaattcaataagctaaaaatcagaaggcaaaaattcaat
caactaaaaatctgacgacaaaaatttaatcaactaaaaatctgacgaca
aaaattcaatcaactaaaaatttgaggacaaaatttaatcaacgaaaaat
ctaacgacaaaaattcaatcaactaaaaaattgacgacaaaaaattcaat
caactaaaactttgacggcaaaatttaatcaactaaaaatttgacgacaa
aaaTTCAATCAACTACATTCTtcaactaaaattttgactaattagaaatt
taaagggcaaaaaattcaatcaacaaaaaattcaatgactacaaacaaaa
ttcttcaactaaaacTTTAACGAGAGAATCTTTCTAATTAGAAATTTGAC
GACAAAATTCAATCAACTATGGTACTGTAAATGTTTGACTCAAAAATTTG
ATAACGAAAATTCTCTAACTAAAAGTTTGACGATAAAAATATTCACTAGC
TAAAAGTTTGATGACAAACAGTTGGtcgattgaaaatttaacaaaacaaa
tcaaCCAAATGTTTGACAaaagttttaacaaatattttactaaaaaaaca
cCAAGAATTATCCTTCAGTTCAGCCCTAGTGAGAAATTGATTTCTcccaa
tttgaaattcaaaggaaaggttgcactccaaaaccaaccCACTACATTTT
TCTACCCTTaaattcggaataaaataaattctttcaaataaaagattgcc
gaacaaaaattcacaaaatgaaagcgtaaataataaaggtttcacgaaaa
taaaatccatcagaaaaGTCTCTGGTAAGAGTTCCGTCAATACATTTGac
gaaatattcaaaattatttGAGATGACAGAAAACAATGATAGGAAAATTT
AGGTCCAGATTCTAGTCAGAGATTGGCCAAATGTTTCGTTAAATGTAATC
AAAAGGCTTTAGGCTTTTTTACACCAGATAGTCTCCCCTTTGAAAGCAAt
ccaaaagagtaaaaaataaATGTTCATTCATTTAGGGGGCTTAAAGAACT
ATTATGGCAACACACAGAGTGGATCATCGTATTGTTCCATTCACGATCAT
TCAAACAACATCCGAACAGTCGGCATGGGAGAGTTCATCGGCGTCCTTAA
TGGTGTCGAGTTCCGAACAAGACATAACGATTTCCGTTTGAATCAACCTC
ACAGCACTAAAGGAGATTATCATGCAGTAAGTCAACCCATAAAACTTTAT
AAAGTTTCTCGATCTCCTACCAGCCAACGAATACTGTAACACAAAAGTGT
AGTGGCCAAATGAATTAGTTCAAATCTAAAATGAAGATTAGTCTCACCTT
AACATCGGTTACAAAACGCCAACCGAgcttatattcatgatatgcaccat
tgcaatgtcttccacggacccaacagctgattggttggaaGAGACATATT
GACTGTTTTTACGTCACtaacaaccaatcagctattggatCTATGATAtg
atgtcagaagacattgcaatggtgcatatcatgaatatgtgTGATTTTCT
GCGACGGaaacggtaaggttctaatttgactagatcctgaccagctgagg
acgacggtaaatcagtacCTTtatcgtcctcgattttgcgggtcagaact
gcaggTTATTCTATATCGCTTCAGTTaatctaccgtcctcaaaagtgcaa
gtGAACAAGTAGTATCTAATCTCGTTAATTAACCATTCccatatataaaa
aatattattttcacaCGTTATTACGTATTACCATTGTTCGACATTCATCA
AATTATTCTAGAATTTATTCTCGTTGTGATAGCGGTTGAGAAATACTGGT
GTAATATAATATGGCTGGGGTTAGGATTGGAGGTGTTGTTACGAAGAATA
TGAATTATGACTACAGTAGTTCTTGGATTATTTTTCTTCCTTAgattgaa
ccaatcaaattccCTGATGTTCCACCAGAAGTGTTACAGAAACCTGATAT
CCAATCACAAATCCAGGAAATGAGAGAATGGTTCAAAGCATGGAGAGATA
GTGACCACACTGTACGTGATTATaggaaatatttcaaaccaGTGTTGTGT
TATTTGGAAGGTGCATGGACAACCAAACAAGGAGATTCCATTGATGAACC
ATTTGAAAGTGATCGACATTCCATCGATGCTGACTCTTGGTTTGATTTGC
aagaaaaggtgaaaaaaaactttttcgtaaCTTGTAACGGGCTGTGCACA
tatatttataaagcccgaaaggtTAGATGGAaggctttaagctcttccaa
gcaaaaaaaaaagaatatcacaaaaaatattgctcctattgttttcgaaa
acccgcaaagcttcttattggtcaagtgctgaaattacattgtaatgtca
cgtgacttaggtgggatttcctacctaacctcgacactcttttcagcaaa
agcacgatatctagcccttcgggccttATAAATCTAAGGATGTCCATATA
GAGGCGGGATGGCGCGGTTAGCGTATGAACATGCATCACTTTTCATTTAT
TTCCCGACTAAAATGAAAGTATGACAGTCTTTCAGTCAATCACAACAAAG
ATACATCTATGTGTCAGGAACCCGGTGGGACCTCCGCCCCAATGGAAGAA
ATGCTACATATCATTTCTATCCttattgggatttcgatagaaattttcat
ccccaccgGGGCTGTCAAATAGGAATGTAAAAATCTAACGAAGTTTGCCT
ACTGGAATAAATTTGTTGACAATATGATTAGTTCTTGACTGGTAACCaag
gagagagagagagagaggtcAAATGGTCTCTGCGTTTGCTCCATAAACAA
TGGCCTTCCGATTCGATCCTTGCTCCTTCTCTGTTCCGTTCATAGGAGAT
CTAGCGTGTATTTTGCTAAAAGAACAAGTCCTACATTATGCTGGGGTTAT
CCACATAAAATATGGATTCTACTCATTGAGCCTTCTGTAAGGGCTATCAA
ATACGTAGTGTCAACTAGCATGAACTCTAAAATGGTAAGTCCTAAATTAT
TCTTTAGGGCTGTCTTCGTAAATATATATCCTAATCAAGACTTCGGAAAT
ATCTGCAAAATGAATATAGCATTACCATTGAAAAGGAGATCATCATTCAC
TTCTAGGTTCGATTCACATCATACACTGGTTCAAAAAGTTTAGGAGAAAA
TTTGGCTTTCCTTCCAACAACCATTATGAGATTCGAGAACAGTACTCCAG
TATTCGCACAATGGAACTACCGAATCTTATGTCATCCATTGAACCAATCT
GTACCATTGACCAAATTCAAACCAGCTGAAGATATTGCATCACGAATGAA
GCGTAAAATGTCCTGGGAACAATACAGTAAATCACGATCAGCACGTTTTG
AATTAGACCGTGACTTGAACCCAGACGAAGCAATGTTCCGTGAGAAGGAT
ATGGCACGCAATTTCCTTGATAAACTCATGGAAGAGGTTCCCGGTAAGAA
CAACTATGGTGGAAGAATCGAAGATGCAGGATTTGATGCTGAAGTGCAGG
ACTTTAATGGAAATGGTCCTCTGGATGTGTCTAGATATCATCGCTGGTTT
AAGATGGCCAACAAAGATGCAATGGGAAGACAACAATCCCACAGAGGTAT
TCGGAATATgcctttgtttgaaaaaaagagaaaactaaCATGGAGAAGTg
ggcaaaaaaataataatgagctcttctgaaattagaaaaattcattcgag
tgataaaaaaatcaatcagTTTTCACCAATCTTTAATTGCGATTTTTCCG
TCTAGGTTATGCTGATTCCTACATGTTTGCTGCCAAGACAACACAAAGCA
GAGTCAGTGGACTACACATGAGAGCTTGCAGGAAAGTCAAATACAAGGAC
GGTACAAGAAAACTCATTTGTGAAAACCGTAATGAGAAATGGTCGTATGC
TATCCCCTTGGAAATTATCTACATGACACCATTGAGTAAATGGAATCCAT
ATGGTATCAAATACAACCCTAATTGCGCTGGTTATGAAAACACCAATGAT
ACACGAAAAGGAACAGGATTGTGTGCTGATTATTCCAGAGCTAAGAAACA
TGCTTGTGATCGATTCTACTACATCACACCAAGTGAATTCTTCAGTGCCA
GTAGTGAAGGTGAAAAAGATCCCGCTGATACAGCTAAGAAGGGTTTCTGC
ATGTTAGACAGAGATGGAAATGGAGTTGTTGCTTCTCCATCTGGTACTCG
AATCATGTTCCCTGAAATCAAGGGGGTTGGTAAACTCAGACAACGCTTCC
CAATCTCACCAATTCATGGACATGGAACTCCCGTCTGGAAAAATCTGAAT
GCTCTTGCTGATATGTTTATGCATAACGCATCCTACCATTTCATGAAAGT
CAATCCAAAATCAGGTGTTGAAGAAATCGAATTCACCTACATGTTGCAGA
CATCCAGAAATCCTAATGTCACACCTCATGAGCATTACTTCAGCTTGGTC
AAATCACAATTCGATAAATTGGTAGCAACTGGTCGACCAATGGTTGTGGA
GACTGATATTCGTGAATCACATTCTCACACTTTAAAGATCAAATGGAACA
AAGTCACCAAGCAACTCCAATACCTCAAATGTAGTGGTCAATCATTGTGT
GGAGATGAACATCCAAAGCTGTTGATCAGATCTACCGATTAGAAAGAGAT
AGAAGTgacttctttttctttataccaTATATTTAGCCATAAAGTATTTG
TCTATGTAAGAGATATATTCAAGGATATATCAACTTATTTTTGAGAAAGA
CTAATCATATCCTAAGAGCTAGAATTTGAAACTAAAGTTACATATGTTTG
TTTATTATTCAATGCGGCCGTagcatttttttcaattgtCGCAGCTCGGC
GAAAATTTGAACTAGAAAACGGAAA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000089_pilon | genome | sc0000089_pilon:1232488..1239962 + |
|