MSTRG.11998 (gene) -

Overview
NameMSTRG.11998
Unique NameMSTRG.11998
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000089_pilon:89952..99465+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11998 ID=MSTRG.11998|Name=MSTRG.11998|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=9514bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:89952..99465+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttgattAATTGTGTTGgaatcttgaacttgattcaggtaactctcatc ctcaGACCTGCCAACCTGTGAAAGGCCAAAACCTTgagacttttattttt ttcctcagaaaaccttgaaattcaggcaaaaaccgtgagattttcgtttt tgatttttttctgttttagacAAAATAGCACTAGGTAAAATATTCTTGCT TGGTTCGGATtccgccatatttgtttacattgaaaaaaaattccgattCT TTTCTTTCATCAAAAGAAATATAAGGGGGATAAAATCGTAAGCGTGAGAG TCTTGAGAACACAACATCAAATTATCTCCCTCATAATTATAGCATTTCCG CTATTTATGGGGGTTTCCGAAGGCTTATTTATACACGGAAAGTGCCCGCG GGTAAAAACAAGTCTTCTGTAGTCAAAATGGTAGGCTAAGcagtgaaaat ttttgacagacagaaaacctggaaaaaccgTGAGGTTTTCGAGGGCACTC GTGAGACCTTGAGATTTGGTCGAAAACCGTGAGCCTCACGAGTAAACCGT GAGCATTGGCAGGTCtgcatccttgttgttgcacaaatacatcctgtacc tagatgactgatgtttttttctgaaagcttgatttcctagtgtgactccA ACTGAATTGTGAGACAGGGGATATTTAAacgtttcaattttcaataaata aaaCCCTTATCTTTCTCGTCTTAtgaatttgctttgtttttgctTACGTT TCGTGAGAAAAGTTGTTTGTTTAGAAAGCTTAGTACTGTTAGTtagtcta atgttgacatctctcttctaattttgacatctGTGTTAATGCACAGTCAT AATGATAATTATGTATGGAATAAATACACGTTATATCATTAGAATAACTA AGAatattctgagcaagaagacaTATGTATCTTTTGGTATGAGCAAGGTA TTTCCGAAATATAAGCCTCTAAAGTTTACGCATAATTagactcaaaacaa aagaatctcgTCACATCACGCTAATCATGCAGAttttttttATCGACAAC aaaaaaaaTCcattaaccaaaacaaactccCTTGAGGGCAAGAAGGACCT GGTACATGACGAGCCGAATTTCCATTGTTATCAAGAagctgttgttctat ctctttACACTTCTCTGCCTCGACCTACTTCCAAAAATCTGAAATGAGCT CAAAGCGCTTTGTTGATCGATTCAATTATAGAGTTGCTTCTTCATTAGTT TTGGAATTTTTAGATACaaaaaaaTGTACGACGCTGTTTTCCATGGAAAC CCTTCAGTCTCCACTATATTATTTTCTCTACTTTTTAGCTTAGAAATTAA CAATAATATAATAGCCTTATCATCAACAATATATTTAAAATGGTAAGTGT CCATACAATATTCAACATTGGCCAACTTCTTTTCTGTCAGGCAACATTTG TTTGCATCGTTTAGGGTTAATTTTCTTGAGTTGCAATTTGCTTTGGCTGg gttaggctgctggcatcagATTCGTGCTTCTTATACTACCtacggttttg tagaggtctgcgattcaaacTGCTGCTAGGTCTTTGACAGGATGATCTAC CTACAATCAATATCTAACATTTATTCTTCTCGCTACAATTCCAGAGTGGA ATGGGCTTGAACGATCACCATGAGGAAGAAGTtaagaaattcttgaaatt tgctCGTTACAACCGCCAACAACAACTACGCTCTGTTGAAGGAAGCTTCC AAGATCTTAAAGACAGCCGGTATTTTTCTTACCTGTTCTCACAACATTAT ACAGTATTCCAATGGAAGATATCACACATAGTAATATTTGCAATTTTTAA TCACATCACCAGCAGCTTTATctaatttgacttttaatacATTCAGAGca acaacaaaatatttctaagaATCTTGAAATACCCAGTGAGCCTCTAGGGG ATTTATTGGGaaagaataattttcaaatattagtTTCTTTAGGGaatatt aaattaaataattttatcgtgaattaaaaaatttattaaaaaaatgaata attttatctaatCAGTCATGATCATTTTTAATAAACTTCAAGAGGGCCAA TGGCACCTTGGATTTcctcatttttaaaacattaaaagtATCTTGATTAA AGCAAGTATATCTATTCATGAGTCTGTTTGCTTAATTTTGCAAAAACACT CcacagctccattaaaaacgcAGACAATTTATTCCAATTCTTATTCGACA CTTTGCAGTCAAAAATTGTAAACTCTCTGGTCAAGTGAACCCATTGCAGT GTTGAATCGAACAATTAAGTTACGTCACAcgctatcttttgttttgatga ttggttgaataaCTGCAATCTTTTTTCAAGCTCAATTTGATTACTATGAT AACGATTCAACGAATGTTGTATTTCTTTATTAGACTTCAAGAGGACACGT TCACAAGTGATGAAGTTCAAGAGATGATTGACGGCTTGATGGTGGTTGTC AAAGGAGCTGTAGAAACAGAACTGTTGAACGCTGCTCACACCAATGTCCT TCTGCTCTTCCAGTTATTCAGCCAAGCTGAAAGATGGCATCTCAAATTGC AAGCTGATATCTCCGAACTGGAAAACCAGTACGGATTTGTTGTTTTTAAC ATACTATTTTTACGATGGGGGGTTTTCAGAGATTTTCCACTGTTACAATA TCAATAAAAAGGGCTATATTTTAAAGgtaagttttgtatttgaataaAGA ATTCACTTTAACAAAACTCTTTGATAAGGGGGAATTTGCAATTTTCTATG ATCAACAGACTGTCTTCTCAGGCAATTTTCTCATGACCTGAAGTTCAGGA ACTATTTACACCACCCTTTTTTATTTCACCTCATTTCAGGAAGCTTTTGA AGGATATTGCTGATTTTGAGGAGCAAGAAGCATCTGGTcgaagaaacaaa aatcttgTAAGCTGGGGAATTTTTGATGGATGATATTTTTGTCTGTCTTC TATTTTAAAGACAAAATCTTGAATCCATCTTTAGGAGAAAATGTATTGAT AATTGAGAGAAAGTTACAAAAAGAGGCGAAAATCGTGAGAACCGTGAACG TGCCTAAATAACTTTGTATATAAGTGATCGACAACAAGTAATCCTCTAGT AATGAACCCGCAGATGTATTTTAACAAAGGTATTTCCTcactttcttaaa aataatagctatttttatgttttgtagGATTTGTCAAATTTGGCGAAAAG CAAATTGGAGCCTTTGAATGAAGGTGGATCTGCCGCCTTATTGCAAATGG taatttttttctgcttttgttTGACTCAGCTTGACCTCCTTTAAAGATTT TCCAtgcatatttttttttacagtgaACCAATGAAAGTGTGGGATATTTG TTTATTACATTAGCCATTGtttatgtattacaatgaaaAGTGAAAACAGT GAATACTttcatgttgtcttctgaccagccaccagaaaaaccaacggatc cggcgagactcgaactcacaaccatgccattcgcgggcatttgctctacc attgagtTCGTAGCGGACCCGTAGCTCTATGGTTGAGCAAATGCCCAAGA ATGATAAATAATTAATATCTGTGGTCGCATGCCCAAACCTTTCCGTTAGT GTAGTAGTTGGTGGATTCCAACACGTTAACAATGTGGAGATGGATTTCTC TCAATTCACCGTCTCTGtccagtcagtagacaagaattcacttccacATT TTTTAAGGAAGCTTCTTGGATTGATAgccattgaatattttttaatgatt tctttATTGGTTAGGTTGCCAACTTGTTTTAAGCTAATATACCTTTGCTA AAGATTTTCCGTGACCCAATAACATGAGGTTCCTTGTTCAAGGTTTTCct cgattttcaaaattctatctATATTCATTTTTATCCCTTTCTAATAAAAT TTCGGAGAAGGGTTCTATCGAGAATAGAAGATGAAGATATTAAAAAGAGG GGCAAGGGATTGGATCTAGCGATTCTCGTCAATAATTGATTGGTGGTTGc aaataaaatgattttctttctctcatTCTTCTCCATGTTTGATATAAAAA GCACCACCCACCTAATGAGAGTGGAtttctatgaaaaatatttctccaaa agttcatcaaaatcTTTGGAAAGTTTATTCCTTCAttttactgttgtttt tctttttcgttacttagttttattcgtgaagactttttgggtgaaaaatt cTTCATCGAAATTCTCTTTAATGGTATTCCACGAAGACTTCTTTTCACAG AAAATCACCTTCTTAAACTTCTTAGTTTTTCAAGAAGCACGTTGTCAGTG ATTGTTGCTATGTTTATAAGTCGTGTTGCCTTGACAACGCcatgctgagt catcaaaatgTCTTCTTCTGTAACTGTGTTGACGATGAAAACACAAAACT GAATCATAGTAACCTACTAtgaattttcaaactatttttcagtTCTGAAA TGGAGAGTTTTATATGTTAGTTCTTACTGCTTTTTTACTGTGATTGGGTG TATCATAATTGATTTTTATATTGATTAGGTCTACCTAATTAGTATGACCT GGTCTACCTAATTAGTATGACCTAATTTGGTGtttacttaaaaaaaatgt ttcataaaatatttaGACGAATAAGATTTAAACATTTGAACTGAAAGCAA TAAAGGAAATTGGGCACTGTGGAAAATGCGAAGTTGACATTTTGGCCTGT GTTTCTCTTTCTTCATTGTTTATGTTTGTTTTGGAATATGGTTGCAGGAA GGCTAGAATATGTTATGGAATTTTGTTCAGCATCTGAAAGACAGGTTTTG ACAGATTTCATTCAAGTTCAAATGAAGGTACATGGATATACCCCCATATT GAGTGttcttttttcctttgaaaagaTGAACTAGCAATGGAATTGAAAAG ACAATGCAACACCCCTTTtccacagacccggtaggatttttcagccaatg gggataaaaataacggactgaaactcgatggagagTGATATTCCCATATA TTTTATGGCTGGCTATTTtaaaattcctttgttttcaagtcagaaattcA GCGGGAATGGGaaaaaaaGTAGatattttgtagtgaggattgatttattt gattattttacagtggacaaaaatttttcaccgcgacgatattttggcca atttttccagtgggaaggggtcctaGTGGGTCTGTTACAAGGCGGTGTAA TGCAGAAATTTGCCTCGTAAAAATTCTTCCTTTCGAGGTTTTCATTGCAG ACTAGAGAATGctctaaagtaaaaaaattttaaaaatccactttcaaaaa aaatgtaattgcTGTCATTTCACCAATTCTGACTTTTCATCGAGGTCATC ACTTTCaaattgtttcttttctttagtgGGGCTAACCCAATGAGTTCGGT AAATAGGTGGAATGGGAAGAGGTGTTTTCTGTTATCTGTGGTTAcatcga ttttgaaaacgaagatttcgatagaaattccCCACCTTTTTCaagtaaga aaaaatgaagccGCTTTTGGGATGACGGATTGATTATAGCgctttctttg ttgtttttttcactttgcacattttttatggcaatatattttactttcaa cccggcttttgtgtaaaaactacacGGGACACGCGTTTTTAGATGGGAAA TATAAGAGGCTTCATCATCCAATAGTCTCATCTCTAGCTCTTTTggggct taaaactcaatggGTGATTATCATCGGCTATCATATTGATTTCGatattc tttttattatttcaggAAATCAGTCGTCTAAAGGAAGAAAACGACACTTT GAAGAGGAAAATCACTACTTTGGAAAAATCGGTACTTTTTACTTTAAACG aactaattttctaaaaaaaatccaaaaaatcgcATTTCGTGGGAAACttt ttcgtggttttgcctcatttcggacacatttctttcattttctaagggat ttttttaatttttggttaaaaatatTCGGGCTCTAACATTCGTGGTTACG CcagaaaaatcgcgaaaaaaagcaaaaattagttcccttaaggtatggaT AGTTTGCTATCTCAATAGCATCAACCCATTCTCCCGTTTAGAATTGTATT ATTTCCGAAGGAAACCTATTTccattgaaacattttttcagtACAAGATA GTAAAGTTGTTTATTAAGGCGAACCATGAAATGAATACGCAACGAATTAC GTTTTCAACATTCTTTTTCAGACAAACTCGTCTCTGTCAACTCAATCAAG GTTACGAGCGGATCTAGAAGAAGCTCAAAATAATCTATCCTCCTCCTCGC CCAGAAAGGTTTTTCTTGGCTTTCACTCTCATTAGTaaaaaaaTACACAA CCTTTATTTTAtgttgaaaattcaattttaccAGGTTGAATTGGGAGGGC TCTTTATTCATATCAAAGCTTCTTAACGTGTGATTTCAACTTAGCTTAGG GTTAGCTTAGATTAGATTTTAACTTAGTTATTTTATTGTTACCTCTAAGG ATTTGTTCTAATTTTGAACGTAAACTCGAATATTTAGTTAAAATGCACTT CTCAAGTTTCTTTCCGTTTTCAAAGAACGCCTGTTGATTTCTTACACGTG tagttttttcagatgaaaTTAATTGTTGGTTTGTTGGGTGAAAAGctcaa accaatcaaaatcatataaaagaaaatgtttgttttcgtttttcagGATG GCAGCGAGAGAGAAATGCTTTCTGACAAAATATCTTCACTGAGCGACACT TTGAGAGAGGTAAAATTGGTTTATTGCTCAAGAATCAGTAATATAAATTT agtctcgggtacctaatagccgggggggggggttgggtggaaaaagtctc aaaaattaataaacggggggagggggctgaaataagaatgtcctgggtag aaaatttaGTACATAGTGTATTCCTGTTCTTACAATATgatctttcgaat gttttaacATATAAACCTCTTCGAAATTTTATGATATTAGATttcgaaaa agagaaaataaggTTAGGTGTGAGGTAGGAATCGAAGGAGCCAGAAGCGA AGGGTCATTCTTTCTAACTTCGCAATCCTTATTCCAGGCTGAGTTGAATT ACAACAAGAAGTTTTCATCGGTTAATGAAGAACTGGTTGAAGCCAAGGTA TTCATTATTTCATGTTATTAAATGGCGTCCCATGTTTTCAAGCAGTGTCT GTCCTTCTACTTGACTTGTAATATGCCGGTTGTCGGAAAGCACCACGGCT CTCAGAATGTCGTTTATATAAATAGAAGAATATCTCCtcgagtttttgaa aaaatatttgtatcACTGATGATACTGACCTTGCGACTTTTTTACTGAAG AGGAGGCCTCATTGAAActtcaatcaatttttctttttcagcatTACATT TTGAACCTGCAGCACGAATTAGAGACTTTACATGGGGTAAGGAATGATTG TAAAtttcaaatgattttatttAGCCTTGGTTTGAACTCACTCGTTGTAT CTATAGACCTAGACGtaacgaacatcacttgcctcgttttgaaatttcca tggggattaactcccagcggattttattaaaactacttcctattcataaa aaaataatttaatgtcttaagagacataatcaccatggttattgtttgaa tacgaggcgagtgatattcatgacgtattttatgaaaaggacTATTGTGT AGACCCTGCCCCACTTGAAAATTAGGTAAAACTTTCGTCCCGGTGGCAAA TGTGCCCCACAAGTTTAGTCCTACTgggaaatttactttttttatccCCA AACTGAAATTCAACggaaaaaaattacactccaaaacctTCAACATTGGA CTTTTTGAACtgggaacaataaaatttatatctTCATCTGGAtttcaata aaataatttcacCCCCAATGTGggggaaaagttccaccggggtgtgagac aggggtgtatcatgCTTCTTCACGATTCTTAGTTTGGTGTAAAGGGATGT CATAACGCTATTTGACTCACTTTTATACCTTAGGAATTTTGTAGCAACAT TAAATTCAATACTTTAGGAATTCGACAAGAAGTTTTCTGAGACCACTCAA TtcaagaatttgaagaaaatgttaGAAGGGAAGAACACGCAGCTGAAGGA GCTTCGCGTTCGTGTTAAAAAGTAAGCGTTATAAGATACATATGTATAAT TGAGCAAATCCCCGAAAATTAGGATAActcatttttcgaaaagaaatgTT TATTATTGTTGTGGAGATAAATAAGGTTTTTGATACTCAAGGGTCTTGAT TGAGATTGTAGAGCATACAACATTACTTCGATcaaacgccccgggcgttt ataatttgtttttttttagtttttaaatttttccttCAAGAAGAGGCTTT TATTCGAGGGGTGTTTAAAAGAagagggcgtttattcgaagtaatacggt aaatGAAGATGACTCGATAAAGGATATTTCACTAAATCTTTTATCAGACC TGGCAGCTTTGAATTTTTCTCTTCTGATTCTTGTCTTCATTTCACTTTGT TTTCTCTAGATATGAACCTGATTGCGAACTGTAGAAAGAAAAGGCTGACT TCTCAACCTGGTTGACGTCATACACTCAAAGCGATCAGATGCACATCAAA AGAGATTAATATAGCAgattgaaaatattaaataaaaattttaaggcaCA TTAGGCttttttatactttgctgtaaaattcatacagtttttaaattcat tttttaattatttatgtatttCAATTCTCGAAAATCTCGCTCGAGAAAGA TAGTAGTAGGAAGGCTTGaaaaaaaTGTGGctttaaaggcttggggacac gagaagtttttttcgcattggtgcaatgcaacatgctccatcccaccaac ctaaAACGCCTTCTCGTGTCTCCACTCCATTCTTCTAAAATCAGCGtatc ttttgggtatttccctcacttttgtctcatgaaacgaaaaaagaaaccac gggacacgcactttttttcttgcgtTGGTGGGAtgaagcatgttgcattg caccaacgcgaaaaaaacttctcgtgtacCCAAGTCTTAATGCTTATATG CCTTTCGAATTTTTGATGCAAAGCACTACGTTTCCAGCCACAATACTTTC CCTTGCTATTTTCACGCGATTGATCAAAAGTGATTTGCTTCCAATTTTGA TTTATGTGgaattttttgttgttcttaAAAATATGATGTAtgtaatgaaa atattgaaacctTCCTTCGGTCTTACGGGAAGTTTTGCTTCAGGTGATTA CATAAGGTAATGtaaatagattttaattgaagataaaattgtagaaaaat aaaatacccagaagaaaggaaaaatCGTTTTCTTAATTCTTGTAGAGAGG ACTCCTTTTCTAACCCAAGAAAAGTTTCTCTAATTATTTTTCGACATTTT TCTAAGAATGCAAC
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11998.1.p1MSTRG.11998.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
MSTRG.11998.2.p1MSTRG.11998.2.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000089_pilongenomesc0000089_pilon:89952..99465 +