|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000081_pilon:174342..182101+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11252 ID=MSTRG.11252|Name=MSTRG.11252|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=7760bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:174342..182101+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttatttcagagCTTCTAGGGAAGATAAATTCTGATCAAGCCAGCCCCA
ATGGTTCTGCTGGTTCCCACGATCATGTGAGAAGGCGGAGGCGGACAAAT
AGTggacgaaaagaagaagaagcaaaagcagaaaccaaagaaaagaatta
cacacctgaacaagtagaagaTGTTGAAAAGTATGCCAACAAATGAGTTT
CTCACCTTGCTTGCCTTCCTTTCTTATTTTGTTAATGATATATAGTTTTG
ATATAGTTTGCCTTTTCCGTCAGCGGAtgcagacctgatttagcaggttg
aagacctgaattaacgtTCAAAGACCTGAATTAAAGGCCAGagacctgaa
ttaacggccAAAGGCCTGAATTAACGGCCAAAGACCTGgtttaacggccg
aagacctgatttagcaaGTCACTGGCCAAAGACCTGATAGATAAGTTAGG
GTCAGTTAAAGTAGCTAGAACCACTCGGCGAGGCATCAGTTGCGATGGTC
CAGTGGTTAGTGCAGTGGTATCGAAGACGAAAGATGTGTTTGAGAGTTTG
AGTTATTGGTATTATAGGATCCAGcccccccTCGGAGATTtggggtacct
aaaaaaaaaagtgttaaaaaagccaggtacctggaagtattcttaaattt
agggagtacctgatatgtttggggtacctgcattttcattagtgggggcg
ggggctgttgtttttgtatgaagtcatcacccttgaattccttgaaaccc
ttgaaacagTCAATATTATTTTGGGGACGCTTGAAATGCAAGATTTatac
ccttgaaacccttgaaatgccaaattttgtggccattttcagccatttta
actttcagaaatacaaaatttttcccattgcgTGGGATACAAACATCGCA
GtgacttaaaaatgagaaaacatacttttgGAACCCCTGAGACTCAAGGG
GATATTCAACGCTCATTCTTAGGGGGTTTACCTTTTAAACCCGTTAAGTG
CCACTGGAATTATATGAGATTGGCAGGTCTGGGTGATAGAATGGGtggtt
gtaaaattatcaattatcagcCAATTTAAGGGCCCTCCTTTacacaaaaa
ttgaatatttataAACCTTTCTCCTTTTGTCGACTGATTtccttgaaatc
tttgaaaactagcaaagatcaactaaaaaccctagaaacccttgaaagtt
tgtggtttataaaaatctcttgaaacccTAGAAAATCATAGTCAAAAATG
ACAcccttgaatttgttgaaaaggAAGTGATGGCTGCCATGGAAGTATTT
TCCCAGGAATgacaaaatagcaaaaaatccctttttgtatttttaacaat
aaaaaaattaaaaatggggTAACTCAAAGTTGGGGGGTTACTtttgaatt
ctaaaaattttgggggtaccAAAATGATTAGGGGTACCTAAATtttttgg
gggtacctgaaccctggaggaccctatggcattttcattctttttagttt
aaaatatttaaacttaatttgttttcaatactAATTCCTattgaaacatc
atataaaaatcttgattgaatttataaaaaaggtttaaaaaataacaaat
ttccaCAATTCATTATCTCCAGGTCTTCCGCCGATAAAAAAGGTATTCGA
CCGCTGCATCAAGTCTTCAGTTTCTAATTCAGGTCTTCGACTGCTAATTC
AGGTCTGCATccgttgacggaaaaaaaatctgcgcCACGGatacaaaatg
ttgttttttaacaatttttgataatcTTTCAAGAGGTAAATCCTTCTAAC
GTTCCTAAAGTCATGATAccactatttcttttttttagaataaaaaaatg
taaagattttTACGAAGTACTTAGTGTTTCGAAATCACCATCAGAGGCAG
ACCTGAAGAAATCGTACAGAAAATTAGCATTAAAATTTCATCCTGATAAA
AATCAAGCACCTGGAGCTGCGGAGGCATttaaaagtattattttttttca
aggcaAATGTTTGCAATATCCATGGTTTATTGTTTAGTTAAAATGTTAAG
GATTATATGAACTTTTTAAGGATAATGATGAAATTTTAGTCATTATGTTG
ACTATGtgttattttttgataattgataataaaaaaatcgacagattttt
atgatattttttatacttatggaaagtgaaatttttgtcTCCTGTCGGTA
TTTTAGATtgaattaaatttaatttttcaaaggaATTGCTGCAGCATTTG
AAACACTAGGAGATCCAGAGAAAAAGCGAAAGTATGATACTTATGGAGAA
AATGCTGGACCAACCACTCGACGCACTCGTAGAAACTATCACGAGGAAGA
ATTTGAAGGTAACTCAACTATTTCTCCTTCTTtcaaaggccggtctccac
tttcgcgcgaaattgGCGACAGTTTTTTcataaccttttttgcctgaaga
aaagattacgtcataaaaaagtttcgcgcgaaaaaaaaataaagttgaag
gaagttactttttttatccgttacgtcaatttcaacCAATTGAGCAGAAT
GGAatcgcttcatttttcaaccgaccaataaCCTTACGAAAACGTAAAAA
GGTTTTCGCTcgtgtcgcgcgaaagtggagactgaCCTTAACTTTTCATT
GTTTATCTATGAAAGTCTTTAAAAACAGCCTGAATCATCCGAGGCGTGCG
ATAGCACGTGCACGCCTCCACGCAACcagaattttttatttgtgCGATCA
GCCTTACCACACGCCATAAATTTCTTGTAAAAATGGTGGTTAGCATTGTC
TTATCACATGTCTAGAATCTCAGATTTAGGTGATTGACCTCACACATGGA
GTTTTCAAATGACAAAACCTGTAAAAGTATAATTATAGAACTAAAACCTG
AATAATATCTTTATTCGTAAGGTTTTTCATCACAGCTGAAGGCCGGTGAG
ATTGTTGACCAGTTGAAGCTAGTGTTTATGTATATCATTTCTATCCTCAT
CACCACAACCTTCTTCTTCTGTTTTAGATATTTCACCGGAAGATATTTTC
AATATGTTTTTCGGCGGAGGGTTTCCCGATGGTAAGATAAACAAAGTTTT
TGTCAACAACTtgcttttttttgtaataccagGAAATTGTTTATCCTACG
AATGtataatgaatgaaaaaatagtttttcaccACAATTTCCATATTCAA
AATTAGATCAGTCCTGTCAGTAACAAGTAAATTTGCTTGATTTGTATATT
ATTTACTTAAACCATACTATACAAGCtgaaacatgttggaaatttgCTTT
TAATGGTTTCTTGTCCGGAGCATCTTTCCAATACATGGAAAAAGACGCGC
AAGCGATCTAAATATCGTTTTAAGAAAAATGTCTTCTGTTTAATTTTGAT
TTGGCTACACATCATTACAAtgctttttatgtttcactttCCAATATATT
GTAATATATTGTATTTTACTTTTTGATCACATCCCGTTAGGCCGAGTTCA
TGTTCGAAGAGGACGTAGAGGTCAACAAACATATTTTCGTCAAAACACAC
ATTCTCATAACAACAACCATCATCAAAACGAAGTAAGCATTGAAAATAAG
TAATGTCTTTGAAAAcctaaataaatcaaaagatcTGCGAAATGATTAAA
AGTTTTGTGTCCGctgtaaaatataattttgtcccggatttattttttgc
aaaaaaactaaTCCAGACATTggttaaaattaataaaaactttttgtttt
gttagcgATAGAGGGCGAAAATCagcgatgaaaaatgaaaatgttttgtc
cTACATTGTTTGTTATTTTCTATcccaaaaaagaacaataaactTTTAAT
TCCTCACATGTCTAAATTCTTCGTACAGGTATTGGCgctggaaattattt
tttttctgcagACACCTAGTCATAACACACAGTCATACCAGTCTCTTTCT
ATCATTTAGTGATAGTGGTTTGAGTCTGGCACAATGTTTCAAAATTCTGT
AGAGTTAGGAGGAATTTCTGTGATATTTTATCTTAAGAGGGTGAATCTCT
TTCTGGCGGGTGCTTGCCACTATGTTTTACAAAAGTAATTCATccaattt
ctgtttttttcttcagaacGTATCTTCACTGTATCCTTTGGTGCAGATTC
TACCTGTTCTTCTTATCATCCTCTTCTCGATGCTCAGTAGTTTCCTTATT
CCCGAACCAATATTCAGCTTTCAACCTACATCGTAAGTATATTACAATAC
ACATTTTCGACTGTACCTGTCTATTCAGGggagggggggtcggtagtaaa
atatcagacatatatgagtaataaaaggatttttacgaatttttacatac
caccacccagacttttggaagaggtattttactaccctggtagtaaaagt
ttttgggacaatttgtcataaagaccacctattttttggttgcttttcgg
actgattttacaaaaaaagctaaacaatgattatttctgtgacacatttt
tcactttgtgcaaaaataaatgtttttccCTTAAAATTTAAGTCTTTTCT
ATATTGACAAAATatctcgagaattttttgtttgcagcaaacaactttcc
aacagaagattttttcaagttattaaaattttcagattttttcagaaaag
tcatccaaaaaattaaaagaattacaaaaatagctaaaatttgctaattt
taccagttttaactacccaggtagtaaaactttttcaacatttaacacat
aaataccacccattttagtatttaactaccctgggtagtaaatctttttt
cgatttttcgtcacaccaccaccgtagtaaacgtcattatgtgtgagatt
ttactaccgaccccccccctggtcTATTGCTACCCTAAAACcgccccagt
ctttttttttgcgCTTAAaggaaatagaaaaaagtgtaaaaaaagattgg
atcgagtttagggtgtgaaattaaataataaagtggcacacgTCTGACTt
gtgcgactacggtcgaaaagttgTATTCAGCAGTATTCagaactttgtga
aatattatGCTATAAGTATACTGAATGATAGTAAGAAGcaattcaatagg
taaaagtgtgctattgagatttattaaccttGAGATGATGTAATATtgag
ttgaatatacatcacccAGTGTTAATAAATCCAacaaccaacttttacct
atttaTTTAATACCTGCCTATTATAATAAAATATAGAATTAAGGTCGAAA
CATTAAACTAGTAAAAATAAACAATGAAATAAATACATTTTCTGGTCATA
GGAAAGTGTTTGCTCTCTCTATTTGAATTAGTTGCTTCCCCATTTAACTT
TCATTAACCCAGAAGTGTGTGGTACCTTGAATACTGAAGCCTGATCTCAA
CTGAATCAAGATAAGAAGATCAGTAGAAAATAAGACTTTGTTAACCACAT
GTgccaatttaatttttatttccaaaGTAACATTTTTCTCTTCACAGACA
ATATCGATATCCAATGACAACATTCAAACTTGGTATAAAATACTATGTTA
AGGTGAGTATATTATTAATAACAATAGATTGTTTAACAGTTCTGACATTA
GTCGTAGTATAAGTAGATGGTTTTGAATCGAACTCCAGATTTCAAGATCT
tgaagagagaaaaaattacatagtttctaccccccctACATTCagggggg
tcttgggttttgatgaaccaaaagcaaaggggtgttaaaagtatgacttt
cctaaggggggttgccagttaagggggaatcttccttgaattatgcgaaa
tttcaatttttttcttttccaataaAGTTAAagggggtgtgaaattttaa
attaatttcctaaaggggggttagcacttaaggtGGGGGTTCTCTTACCT
AtgggggggggtcttgacccctctagaagcTATGGTTGATTCGACCTTAC
AGCTTATCACAACAATACCATAAcaactaaaatttacaaaaattattttg
tttcagGACCGGCATGTACGGCAAAAACATGAAGATTACAATTCTATAGA
ACTTAAAATCGAACGTGAATTTATAGAAACACTTCAAGTTAGATGTTATC
GTGAAAGACAATACAGTAAGCTTTCATGTTCTTTCGTTTCGTAAAtcctc
aaagttcttcttttcgcaCGGAATAACCATGCGGTTTTGAGccgtgacct
ttcaattttgaaactcaaagCCCCGCAGCAAGTCAGGgcgggatgggtgg
agcaaggaGTCAACTAAGGCGGAGGGAAAAATTGCCGACTTTCATCACGT
GACCAGtcatttttctcataagcaattctgcataatttatcaaaattaca
AGAACATGCACTAATATGTACtaaaaagtccattttccaTCTCAGACGAA
AAACATTGCTTTCACCACTAGTCTATTGTccacattttttcattttccta
tgaatttttcaacttttttgatgaaaaaggcCAAATTTGTAAACTCGAAA
GCAAAAATTGGTtcccgcgaaaataagttcctttAAGGTATCACTAATTC
TAACTGATTGGTTGTACAGgatttccagatctggaaatatATACATTTTC
ATAGCCtaggaaatgaaatttttttccctgTGATGAAAGATATATCATTT
GATCTGTTTACtaattcttctttcatttttcttcttattaCAGAGGCAGA
ATTACGGCAGCAAGGCCACATGTGGGGAAGTCGTGAACTACTTGAAAAGG
CGGATAATTATCATCCTGAGTCATGTGACAAGCTGAAAGAATTACAAGGT
CGTGTTCATGAttaaaagagaagagaaaagtGGCGGGTAGATGATTCTCT
TTATCAATTAAATTGAGATGTGAATTACCAAGTTATTGTCCTTCATTTTG
GATTGGAAGATTGAAAGTCTCTAAATTTTCCCAAAGGAAATATGGATGTA
ATGGTTTTTCATTACCGCCAACCAGAGTATCAATCGATATGTCTTCAAGA
TAGAAAAAagaatgttgttgttttttacaAGTTAATTAAGGTCACAGTTA
CATGAAAATGGGCACTTGTAACTAAGAAATTTAAGTAGTTCCAAAATGGT
TTGAATGACAATGACTAAATTTATGATGCTGCCTTGACAGTTACAATTGG
AAAAGTTTGGAAATTGTTTTTCCTGGatatttagaccatgttcacgtgtt
actgttccgtttcgttcCGATATGGTTTTCGTTatggatcgagtgtgttc
atattggtttcggaacgtttcggtgtaagaaaacggagcagtcccattct
gataaaaaaagtggtgcgaaaccgtttcgatctgttttgctttgtaacgt
cttgtttttgacatttcaaattttgactttcaCACTTGTTTTGgaaccgt
ttcggaacggaacggaacggaacggaaccgtaacgtctgaacattgAAGA
CGAGaagaaaatctggaaattttcattactggcttgttttaaattatcaa
aatttatatatataatGCTGAATTAACGTttatttttgatcttttttttt
tttttgtgtttagaaagtgattttgtttatatgattttcttttagttttg
tgcgtatattgtattataatgaatttttttttaatacaacaTACAAATCG
AATTTGATATTATTCAGAATTCCAAAAATTAGAGATACTAttattaaaaa
ttgataaatgatCAATATTAGTCGAAAAAGATAGAAGATAGAAATTAGAA
ATTAGATTCG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000081_pilon | genome | sc0000081_pilon:174342..182101 + |
|
