|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000078_pilon:120617..126500+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10958 ID=MSTRG.10958|Name=MSTRG.10958|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=5884bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:120617..126500+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CAGAATCGCAGTTTACAAATTCTTGTAAACTTGGATCTAAAAGCGTGTTT
TCAAAGGGCTTTTTGGTATTTATTGTACATTATACTTTGGTGTTGAAATT
TGTCTTGTTAAGAAAGTgcaaaacttttcgaaaaaagatttaattttgac
aaatatgGTAGCTTTAGCTGTGTTATTTATAGTTTTGTTGCCGAGCATTA
TGGCTCACTCCTGGATGTCGTGTCCACCGTAAGTATTTTTTGCACACCAC
CTGTCTAAACCAGTTTCGCATTTGAGCTTGATTCCTTTGGCTGCCATTAT
TTCAATTCGCAACCTGATTCCGATATTTTGACTCACTGGAATGATAGATC
AGGCAGGGGGTGTTTATACCTGTGGATAgatctatgaaaaaaaatttcaa
ctatAACTGGACTTGCTTTGCTTTATGCCATATCATATACTTGCATTTGA
AGTTTATACTTCTCATTCTTAAACAatcttttaaaggttttcacGGGGTC
TACACTCAGCTGAAGCAGCTATCTATGAACTTAGTGGGACATAGGAAGCA
ATGGGGCTCGGTACCGGGAACCCATGGTTTTAACTGGCACTTAGAACACT
TGATCGAAGCTGCTCTTTATTATTCGCAAATTAATAAATCTTCAAATTAA
CTTATtcataatgggcttttccaaaggaatcgtgcaccccctgttgaaga
ggtccatttccgttccaagggggtaaggtttgaattGCAGTAGAATTCCA
TAAGGTTAGaagaaaatccgtcaaaaataagcggaattccaaggggataa
tgattgaaaatttgtaaaaattcgaaattccagaggggtatgatcctata
attgcctggaattccaagggggtaggtcacaaaaggttggacctcctcaa
cagggggtgcacggtttttttctggaaaagcccaatcaaaGAATGAACTC
CCGTAATACAGGACCGGATCTAAGAGGAtccaaaatttacaaaagagAGT
CTCCATTTCCTTATAAGGATTTATTTTACACTTTGTCATGAATTTTGAGC
CATCCTCCTTTCTTAGACCCATCACTCAAACATCCAAgggttttaaattt
tcgagttttcTAAAATTCAACTTCACTCAATCCATTCAACAGGTCATTCA
ATCCATCGATTGGACGTGGTGGCATCATTGGTGCCGTCTGTGAAGCTGAA
TGGGGAACCAGTAAGCATATTTTAATCTAGAAGCCGGTGAATTATGACTG
AGTCCCTCAGGGCAATTGATTTGAAACGCCCCAAAATAAGACCTTCAAAA
TGGAACACTTGCAGTGCAGAGAAGAATTAGCCAaaattgagtaaatttgg
gtgaaaaatcGACCCATACGCTGtattttcttggaaatttttgtAGCAAA
AATGCTAACACTTCGTTTTACTTCAATATTCTTAAAGTGAACTTTCTCTC
ATTTCAACCATTATAGTGTACTTTGCGATGCCTGTAAAACGCAACAATTA
TAGATTTTCTTAACCTAATTCATTTAATAGCTCCGGTGACAGAGGTCGAA
GCTGGTGATCGATTGAAAGTCGGATGGGTTTCCAACAACCACGGTGGTGG
TTACGCAAGAATCTCTTTAGTACCATGGGGCCAAAGGAAAAGTGCACAAG
CCTACAAAGATAACGTGATGAAATTTGCTTGTTATGGACATGACGAAAGA
CCAGGCAAATTTCAATACGGAGATTGTAAACATCCATGTAATGGAAGACC
TGGCTGTGAATACCAAGCTGGTAGGCTCTAGTTACACTTCTAACTGGTAT
AAGTCCCGGAAGGGATCAGTTAGACAGATTTGGTATTGGAACAGGCCACT
GGTCagatcatagtataagaaagccgtgGCTTTCTTATACCATGGTCAAA
TTAACTCtgttaggctctgaagatatctggaaGGAtcccaaatttaattt
ttaagatgtgtatctgacagggtcgatttTTTAGTTATTTTCGAACAATT
TTCAGGGTAAAATTTACCAagcattcatatctgacagggatCACTTTTCA
AAATCCAGTGGCACGTCTGCCGTCAAGGACAGTGCCCCCTCTGGGATAAC
GTTCTTCATAATTTTGGTGAACCTCGAATTAAAGTCACGGTGTGCCTGTC
GGGTTTTCTCTTCTATCCATTTTCAGTCTGAAATTGATACCCCAAACAAA
CTACTTGTCTTATACAAAAGATGGAATTCATTAATTCATTGATTTTCAGA
AACCATTCAAAAAGCCCCAGAATATACCTCCGAATGATTTAGATTAGCTA
TAAAGTTGAAGAAATACATTAAGCAGAAGCAAGAATCTAATTCGAAAATC
CCTTAGCTATTGCCTtaaccaaagatttattatacactggataaacgact
cataaaacgatggagagcgaccattgtattttcattgtttcagaaaacaa
ttgatgttctagctttgtccgcaaaggacaactgtcatggcggctcgaat
atgtctgatttttaaaaatgtttatcagtcttatttttaaaaagttctct
agctctttttctttgtacatttgcagaacaaaaagtttgaaagtaaggct
agcattccgagctggatacatttgtgaaatataatgtgagaaaaacatca
ctagacaagaaattcagacaaagtgcttatagtgacacgaaattttcaat
tggaaatatctttccaagactgtccccagaagagctgaaattaacataca
taagacttgagtgtcttggctcctctgtggtatgaaaatcctttggaggc
acgtggtggcaaagtggtttttttgaggttgaagtttgaaaatttccggt
gtcaacatttaagtttcttttacacaacacgtcttttgcatctttctcac
agcttgaaacgtcataacggcttataattagcaattaagtgaaagaatct
gactctcacatgAAGGTTTTAAGTCTCTCTTGGGAATTGGATGaatgatt
ttcgataagaaatgcaataaaaatgcttcgaaaaatcatttattgaggga
aggagagtgaacaataatatcattactgcggacatagctagtacacgaga
aatcggcaaaaatctgttacttgtatatccagtgtataataaatccttgc
cttaactttttgaagaagaaaaacccAATGAAATTACAAAACAACATAAA
GATTTTTCCTACTATAAACATTGCATTGCATAAGTTTCACTAATCCAATA
TtagcaagaaaaagaaaaaggattGTGAAATCGATAAGCTAAGCTTGatt
atctttttatcaaaacttAATGCCTGAGCTCAACATATTAAGCAAGAAGC
CATCTATGACGTACGGAATCTAtgcacagatctgtaaagcccgaagggct
agatttgcggcttgtatcgaaaagtgaagcctatgtttggaaggatttcc
taccaaagtcacgtgactaaaaaatgcaatttcaccggtttgagagatgt
gaaatagagtttgccgcctactttttttgatctcgcgctccgaaaacaat
taaaatgctagatcctatccatcggcacgaaatttaaaaagtcaaatttt
tgcttcacttttttttgctggagaaagcttaaagttgcctatctagtcct
tcgggttttacagatatctgtgaatCTATGTCGTGAGTTTTTCGCAAGCT
AGCGCCCAAATCTCAAGGCTAACTCTGTCTCGTGAAATTTGACCTGTATG
CTGTAGCTTGGGGAGCGGATCTATACCGCGAAATTCTCCAATCTCACGTA
ATAGAAATTGATAAGCATGattaatatgaaaaaaaaacaagcatggaatc
aaatactaaaatggctaattgaccaaatttgaccaaaattctaTCATCCC
CTTTTATTTTGATGAAGTCTTCCTTTGAACAGTTTTATAACATAGCGGAA
CATCTTCTTGCCCTTAGAGCATTTTGAATTTAGGTCACATGGGTTTGAAA
AAAGGGAGACAATTAATCATATCACTCTGAATGGTCACTTTCTACTAACT
GAGACCACGTTACACTCTACGGtaccgtttcgctccgaaaggaaatgaag
ccattatattggttaaattcaagttttacgtcacttctaaccaatagtaT
GGCTTCATTTCATTTCGGAGGAAAGCGGAACCGTTACGTGTGAACATCTG
ATAAACACGTATTTTAAACCTTACGTAATACACACGTAACATCAATTATA
TCTTACGCTTTTTCTAACAGACCCAGAAGATGTTGAGCGTTTCGACACCA
CTATTGGGATTCCAACCAACCTTGCTGATGGTTATTATTCACTCCAAGTC
TCAATGTTGGTTGGTAATGGTGGTGTCTATAACAGCTGTGGTAAAATAAA
GGTCACCGGTGGAAACCCTTCTTACAACTGTTGGTCAAGTAACAGACCAG
TGACTAATAAATGTTTAAGATCTGGTGGACCAGCAAGATCAGTTATCGAA
TCAGGTTGGTGTAATTATTTTCCACATGCTTATTATCATGAGAGCAACAC
TTTAGAAAAACATAAGAAAgcctacccagctggcacacaacgttgtttca
acgtttatctaacgttcacaaggtctatatataacgttagatgaacgtta
aaacaacgttgtgtgccagctgggtaagcgGTGTGAAAAAGGCCCAGCAA
TGTTTTGTCAGTTTTGTCATATTTTCGAAGCAGAGTTTCCATTTTAACTT
CGTTTTCAACTTGAGTACCCAAGAATTGACATTTCGCTGCGCGCCTTTTT
CTCCTTAATATTACATGAAATCCAAAACatctattttttttgttttattt
cttatGGTTGTAATATAAAAATAGCTTCTCACATAAATATTTTCTACTTT
TAGGAACGAAACGTGGCGATTTTTGTTACGGTCTTGATGGCTCCATTGGA
ACCGTCGATGATAACATTTCAGACGTCCCCATCAATGTGGAATGTGACCC
CCGTGTTGCGTGCAGCCAATCAACAAACACTGCTCTATGTTACCGTGATT
TCCCTTCAATGGCTAAAATCATGGTGagatattttttcgatttttcgatt
ttttgataaAGGATAAAGGAAATTCTAATTTGGTTTTTATATATTATGAC
CCTAATACCCATGTGTCACAAACCCGATAGAACCCCGCAGCTTAACTGGA
AAATTGGGCCAAAATTTCATCCACGTTTGGAAAAAGTACCctataatttc
agccccactgggaaattgactttgattttatcctcatTTGAAGTTCTATG
TGCAAAATATTGCACATCCAAAACCATCGCCATTGGATATTTTAAagctt
cccagctggcacacaacgttgttttaacgttaatctaacgttatatggac
gttgtgaacgttagataaacgttgacacaacgttgcgtgccagctgggtt
tggAACAATATTGTTTCTATCCCAATTGTGTGATCTCGATATGATTATTA
TTCTATAGGTGTaggaaaaggttccaccgggatTCTGAGACTGGGGTGTC
CTAATGTTTGAAATTATCTTTATTTTATAGACTGCCTCAAGAAATCCCCG
TCAACCAAATTGTAGATCCTACAACACATTACCCGTCATctccaaataaa
aatgaaaataacgaTGGTGGAcgtaatatttatttatttaaatttaaaat
tttgaaactgttGTAGTTAAGTATCTTCTTTACCATAAACTATGGAAGGA
TAATCTGTAATCTGTTTGCAACCTAAAAActtatttatttcttgacatTA
AAATTTTCGGATATTGTAAGTACGGGAGTTTgcactttgaaaaatatgaa
catAATTCACATGATACAAGCtaaccaatcagat
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000078_pilon | genome | sc0000078_pilon:120617..126500 + |
|