|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00041102 ID=TCONS_00041102|Name=TCONS_00041102|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=300bp
GGTACCCAAAGCAGTGAACAATGTTTATTTTGTGTGGGATTCGGATTTCT
CATTTCGAAAGTCAACCTTTTTTGCTCTTTCGCCTTTGCTCtgtttgttt
tttgatgattttttctttcagatttAGTGAGTTAATACCTAGTAAACTAG
AATGTGCTGTTGAATCAACTTGAAGGTCGAAAATGTTCGTTTATTTAAGC
AAGAAGaTCGCCATCCCCAACAACTTGAAATTGCAATCCATTGGATGGAA
TCGAGATCATGGTTACATTGCATGTGGAGGGGAAGATGGTTTGCTGAAGG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0002704:1..3883- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00041102 ID=TCONS_00041102|Name=TCONS_00041102|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3883bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002704:1..3883- (Clytia hemisphaerica)
GGTACCCAAAGCAGTGAACAATGTTTATTTTGTGTGGGATTCGGATTTCT
CATTTCGAAAGTCAACCTTTTTTGCTCTTTCGCCTTTGCTCTGTTTGTTT
TTTGATGATTTTTTCTTTCAGATTTAGTGAGTTAATACCTAGTAAACTAG
AATGTGCTGTTGAATCAACTTGAAGGTCGAAAATGTTCGTTTATTTAAGC
AAGAAGGTAAGCTTCATTTTCTAATTTATTTTGTCTAAACTTGTATTGTT
TTTGTGTGTTACAATTTTTGGTTGGAGTTTCTGATCAATAGTCCTGGTGT
TTTTTAATTAGACAAATTGCATCGTTTTACTATAGCTGCCAAGTCAAAAT
TTTAAACGCAGGACAAGGTGGGAAGGAAGGGGAGGGCAATATGATGGACA
GATGGTAGCAACTCCAGAAGATTTTTCAAGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAATCCCCCAACTTATATCTGAGACACTTCA
CATGGTCCCCCTTTCCCCCACTGTCAGCGTTGAGTTCTCGGCCATTTTCG
GACTCAACACTGACAGTGGGGTCCGGGGGACGGATTTTTATCTTCCAAAA
ATGTTTAGAAATCTTCTGTCTCAAGATATTTGTTGGGTGATTGCTGCAAC
CTTTTTGCTCTTTTAAAAACTAAAATCTTTTTTTTCTAGATCGCCATCCC
CAACAACTTGAAATTGCAATCCATTGGATGGAATCGAGATCATGGTTACA
TTGCATGTGGAGGGGAAGATGGTTTGCTGAAGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00041102-exon-sc0002704-1575043694:3678..3883 | TCONS_00041102-exon-sc0002704-1575043694:3678..3883 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00041102-exon-sc0002704-1575043694:1..94 | TCONS_00041102-exon-sc0002704-1575043694:1..94 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00041102-exon-sc0002704-1510915933:3678..3883 | TCONS_00041102-exon-sc0002704-1510915933:3678..3883 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00041102-exon-sc0002704-1510915933:1..94 | TCONS_00041102-exon-sc0002704-1510915933:1..94 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00041102-exon-sc0002704-1491911889:3678..3883 | TCONS_00041102-exon-sc0002704-1491911889:3678..3883 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00041102-exon-sc0002704-1491911889:1..94 | TCONS_00041102-exon-sc0002704-1491911889:1..94 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0002704 | supercontig | sc0002704:1..3883 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
