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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00040777 ID=TCONS_00040777|Name=TCONS_00040777|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2684bp
NGTTCTAAAACTGTTTTTGGGTTCGTTTAGACCTACTATACGCAAGATTG
TGTACCAATATCCACGTTCTgtcaatgttttgaatttttctttgaattag
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TTGTAATTCAACCAATGTTATCATGACCTGGAATGTTTAACTACCGTCCA
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TAGCgtatatgttttgattttttattacaccatttatgtttcacttttat
aaataggtatataatgaaattattttacacttgt Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0002557:12028..14840+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00040777 ID=TCONS_00040777|Name=TCONS_00040777|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2813bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002557:12028..14840+ (Clytia hemisphaerica)
NGTTCTAAAACTGTTTTTGGGTTCGTTTAGACCTACTATACGCAAGATTG
TGTACCAATATCCACGTTCTgtcaatgttttgaatttttctttgaattag
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00040777-exon-sc0002557-1491911889:12028..14243 | TCONS_00040777-exon-sc0002557-1491911889:12028..14243 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00040777-exon-sc0002557-1510915933:12028..14243 | TCONS_00040777-exon-sc0002557-1510915933:12028..14243 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00040777-exon-sc0002557-1575043694:12028..14243 | TCONS_00040777-exon-sc0002557-1575043694:12028..14243 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00040777-exon-sc0002557-1491911889:14373..14840 | TCONS_00040777-exon-sc0002557-1491911889:14373..14840 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00040777-exon-sc0002557-1510915933:14373..14840 | TCONS_00040777-exon-sc0002557-1510915933:14373..14840 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00040777-exon-sc0002557-1575043694:14373..14840 | TCONS_00040777-exon-sc0002557-1575043694:14373..14840 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0002557 | supercontig | sc0002557:12028..14840 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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