TCONS_00040301 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00040301
Unique NameTCONS_00040301
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3206

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00040301 ID=TCONS_00040301|Name=TCONS_00040301|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3206bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0002383:2974..14302+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00040301 ID=TCONS_00040301|Name=TCONS_00040301|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11329bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002383:2974..14302+ (Clytia hemisphaerica)
tcacgcttttagcctgagacgtcctatctcatttacactgggtgacgaat accccatgcaaatgctcaccccgttcatttgccaggatgtgcctgactgt taTAGGCTAAAGGAAGTGATTCTACTTCCATGTCGCCGCTCCAACATTGT TAGGAGTCCTTTAAAGGCTCAATTAGTTCAAGCAggtaaaatttgctata tatatcttttaccaatacccagacgatctcaatcgaacgcaatcgaatct caatcgaacgtcaaaattctgggtaatattcgattgttgTTCCACTCGAC TGgtttgatcgtcgattccgcttgattgagatcgtctggctttattcttg cagcttctcaacatccaagctctcaaaacatcacaagccgaatgaaaata ctttcaatttcccgtagaaattatgcgatgaacaatccgggggggggggt caatgAATCAATGATAGAATGCTTAAAGGACCCTGccaacgcaccggact taacgaacaccggacacgcaaaagtccggtgtaaaatgagaattttttta ccaccggacaatctctacaccggacttaaggaagttggatgtccggtgtt ggagaaggatatttttttccaccggacatgaccagtccggtacTATCAtc gacttattgcgtccggtgtaacgaaaagatactttttgccaccggacaaa tacaccggacagtccagTGCGTTGGCAGGGTCCTATGcttaatcgaacgc aatcgaacatcaatcgaacgcaatcgaatatcaattgaatctgaaaatta caGTTATattcaattgagattcgattgcgtctgacaatcgaatttcaatc ggtcgattgcgttgaTTTGGTTcatgactggttcgatcgtcaattccgtt cgattgagatcgtctggcaatACAATTTCACATTAAGAATCtgagttggt 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_024467XLOC_024467Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00040301-exon-sc0002383-1491911889:2974..3158TCONS_00040301-exon-sc0002383-1491911889:2974..3158Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00040301-exon-sc0002383-1510915933:2974..3158TCONS_00040301-exon-sc0002383-1510915933:2974..3158Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00040301-exon-sc0002383-1491911889:11521..14302TCONS_00040301-exon-sc0002383-1491911889:11521..14302Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0002383supercontigsc0002383:2974..14302 +
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 1.38714 0.0260233 0.803633 0.00218837 3.00646 1.71691 1.75861 5.0002 0.585966 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.686291 3.94196 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00040301 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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