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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00039637 ID=TCONS_00039637|Name=TCONS_00039637|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1453bp
caaaatcaatTCATTTAACAACTATTTTAAGatacaaaacatttaaaata
acatgaacaaaaatattaaaatgctGGACTTGTATTGGATTGATTTATAA
GTATTGTAATGGAATTTGTCTTTGTCAAAATCGTTAATTATTTGTGGTTA
AGTATTGTTATTGGTGTCATTGTGATGGGATTTATGTTCGTGAAATGATT
GTTAATGTGGATCCATTGCTAACCATCTAAAGAAACAGCCAGTTAATTTG
AATCATCATTGGTATCATGCATACTTTGAATTGGTCCAAAAATACTAAAT
CAAAGTATATACAGagaaaaaacacacaaaaacaGGATTACGGCCAAATT
TCTCCTCGATCAGTACCAAGTCATGAATGTATGTATATATTCACTAATTG
CAAAATGATTATAGCAGCTCTCCCCTACAACAAACAACATTGATGTTCTT
CAATTGAAAATCAGATCTCGAATCACAGATGGTAGTTCACCGTTATACTG
TTGCTTTTACTGTGGATAAAACATTACCGTCAGTTTGCTCACATTTaaat
atttcattgaaaatttgattattggaaaggttgctGATGTTaacgttttc
aagaaaattctaCTTGATTTAAAGTGATCAAAAAATACTACATCGTTAAA
TTAGCTTGTCTGTTGTCTGGATTGGTTTGCCCTTAGTTTATTGGAAAATC
AtgtgtttttttaattctctaCCAATGTAAATAAATCCATTGGTTTTGTT
TGGTGTGGTTTGTATTCGTTGTTGAAAATCATTGCTTGGATGGACTTGTA
CGattaaaaagactttaatttgtTACCAGCTGAATGATTAAACGAACCCT
TTTTATATAGACAAAATAATTGAACTGTAACTTTTCATGTAAATAAATCT
ATATTtttaaagagttaaaaaatgtttttaaaattctcCATTGTtatatt
taatattttacttgtttcaaaaaaattgtcaatcaTTCTGTAATATTTAT
CCCTTTGATTCCCATGACTCTACTAATTACTCTTCTCTCTCGGATTAGTT
GTGAGTGATATTCAGCGCAGCTAGCTCATTTTATCCTTAGATACCAAACT
CTGAAACAGATGGACAAACGAGTAAGGGAATGAATGAAAAACGACTTAAT
CTTgtcctttcaaattttaaatatatCATGATTATATTCAAAACAGATCA
GGGAAAAGTTCATATTCCTCAAGGTGTTTTAAACACTACTTTGAGTGctt
tatattaaaaaattgttgCAATAGAACGGCTGTGTCTCCATAATAAATTA
TGGAAATTGGTAACGTCCAGCCACACATCAGATTCGATCTGACAGCTCAC
ACTGTACCATTCTTAGTATCTAGTTTTTAGTATCCACGCATTTTATCTTA
AGGAACTCATCCTTTGTATCTTTTAATcacttaagccggagcttccagcg
cag Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0002154:4672..7126+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00039637 ID=TCONS_00039637|Name=TCONS_00039637|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2455bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002154:4672..7126+ (Clytia hemisphaerica)
caaaatcaatTCATTTAACAACTATTTTAAGatacaaaacatttaaaata
acatgaacaaaaatattaaaatgctGGACTTGTATTGGATTGATTTATAA
GTATTGTAATGGAATTTGTCTTTGTCAAAATCGTTAATTATTTGTGGTTA
AGTATTGTTATTGGTGTCATTGTGATGGGATTTATGTTCGTGAAATGATT
GTTAATGTGGATCCATTGCTAACCATCTAAAGAAACAGCCAGTTAATTTG
AATCATCATTGGTATCATGCATACTTTGAATTGGTCCAAAAATACTAAAT
CAAAGTATATACAGagaaaaaacacacaaaaacaGGTTAGTGCATCGCAA
GTTTTTTGAACAGCAACAACAATATATTGTATTCTTTCCTCGCTCAATCG
TATCAGGCttcatgttgattttttttcaatattgatGAGTCTCTTTTACA
GAGCTATTCAGGTGTTATAACCTGTTATAACTAGTTTAGCACAAATAAAA
ATgagtacatatttttttattagaacaccaaATATTTCGGCTAGATGGAC
TTATTTTCTTGCAAATTTCCagcctaaaaaatgttcttaagcttgttctt
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CGGCCAAATTTCTCCTCGATCAGTACCAAGTCATGAATGTATGTATATAT
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TAAGGAACTCATCCTTTGTATCTTTTAATcacttaagccggagcttccag
cgcag
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00039637-exon-sc0002154-1491911889:4672..5006 | TCONS_00039637-exon-sc0002154-1491911889:4672..5006 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039637-exon-sc0002154-1510915933:4672..5006 | TCONS_00039637-exon-sc0002154-1510915933:4672..5006 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039637-exon-sc0002154-1575043694:4672..5006 | TCONS_00039637-exon-sc0002154-1575043694:4672..5006 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039637-exon-sc0002154-1491911889:5367..5495 | TCONS_00039637-exon-sc0002154-1491911889:5367..5495 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039637-exon-sc0002154-1510915933:5367..5495 | TCONS_00039637-exon-sc0002154-1510915933:5367..5495 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039637-exon-sc0002154-1575043694:5367..5495 | TCONS_00039637-exon-sc0002154-1575043694:5367..5495 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039637-exon-sc0002154-1491911889:6138..7126 | TCONS_00039637-exon-sc0002154-1491911889:6138..7126 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039637-exon-sc0002154-1510915933:6138..7126 | TCONS_00039637-exon-sc0002154-1510915933:6138..7126 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00039637-exon-sc0002154-1575043694:6138..7126 | TCONS_00039637-exon-sc0002154-1575043694:6138..7126 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0002154 | supercontig | sc0002154:4672..7126 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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