TCONS_00038023 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00038023
Unique NameTCONS_00038023
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length538

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00038023 ID=TCONS_00038023|Name=TCONS_00038023|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=538bp
GCAAAGAAGGCGGTCGCTATTGTGAAGATACAACAAAAACAAGAATTGGA
GGAAGATCCTAATCAACCAGACAACCACAATCAAGTAttaaaaaattctt
aagatttagAAAGACCAATCTTGGATTTACAAATCAAGAATTCACGCAGA
ACAACTCTTGGTGGAGTATTTTACTCGACGCGATGTCTCTCTTGGTCAAG
TTTTACTGAATACAAAACAACCATgTAAAAACATAAATTAACAACAAACC
ATGTCTGCTGATCTCGATCAAGAAATTGCGGCCCTTAAAGGTAAAATGGA
AGAAATGGCCAACTCGTTGAACTaTCTCCAAGAAATGCAGAAACAAACCA
AAGAGCTCATCAGGGAGCATAAAATCGAAAAGTGCATTGAACGAACTTAC
AAAGAGTTCCTCCTCGCTGTCAAGGAAGGCACGTCCAATGACACATCAGA
CCAGGCCTTGGGGAACTGGGTTCGGAACCTGGGCCTGCAGCCCCCAAGGT
CGTTTCAAAAAAGAAAGTACCCTTCAAACTAATAAAAA
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001759:961..11847+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00038023 ID=TCONS_00038023|Name=TCONS_00038023|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10887bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001759:961..11847+ (Clytia hemisphaerica)
GCAAAGAAGGCGGTCGCTATTGTGAAGATACAACAAAAACAAGAATTGGA
GGAAGATCCTAATCAACCAGACAACCACAATCAAGTAttaaaaaattctt
aagatttagAAAGACCAATCTTGGATTTACAAATCAAGGTAACTGTatta
ttttctttggttttctcaacatatataactttttgtttcttAGCAAATCG
AAtttgaattattatttttaagaaGTGGAGTTTCAGAATTATGCTTCACG
ATTCAAATGATTTGATGACCACTGAACTTNCAAGATGAgaagtttttgaa
agtggtcGAAATACACTGATCTAGGTACCAAAGGATATGAGCAACAGAGG
AAATAGAATAGAGACATAAGTGTGCAGTAAATGGAAACATTATATTTTGA
AACGTAAACAAGAATGCCGAAAATGTATAATAGAACTTGGGATGACATTG
GGGATGCATcaagatatatatatatatataactgAGAGCCTAACCCGTTT
TGACGACGGGTGTCCTGTGTAACCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAttaaaaaattcttaagatt
cAGAAAGACCAATCTTGGATTTACAAATCAAGGTAACTGTattattttct
ttggttttctcaacatatataactttttgtttcttAGCAAATCGAAtttg
aattattatttttaagaaGTGGAGTTTCAGAATTATGCTTCACGATTCAA
ATGATTTGATGACCACTGAACTTGATCAAATTCAATCGATTTGAATTAAA
GATGTGATATAATTGTTCTACAGGGGCATGGGAGGAGTGTACCACTAAAA
CAAACGAAAGCATACGTGAGTGGTGACAGGGAGGGGGAGGTCAAGTAGAA
ATGCACCaagcagtggcgtggtgggaaaatttctctggggtggcgAAGGC
AAATATGGCaacctttttaaagattttttgtgtgcgagcgaagcgagaca
gaaaattttgagtttttgaggtgatgaggggcgccatttttattttttca
tttgtcaatctttagatatgggcgcctgaaaatCCTTCTTGGTGCCCCTT
ATTTTAGGCGCCCCTTTGGGCCAggcccctgccaccacgccactggcACC
AAGAGATTGTTATTGCCATTGGAAATGAAAGGTCATCCAAAGTTTAATAA
GATGTTGTGGTTATTTCATTAACAAAGAAGTTTAacttttaattttcttc
ttaaaccccccccccccccgNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNttgctatctaactttcatcatcaggtattcagcatgtag
cttgttaaCACTAAAATAGCTGGCACTTCCTTTTTTTAGATTCCCTTTTA
ATTCTTAGCCTGTGTCATATTTTTCTTGCATTGCTGGCCATTGTTTGAAT
CCAAAACTGCTCGTCTTtggttctttttcttttgttttattttcaggagA
ATTCACGCAGAACAACTCTTGGTGGAGTATTTTACTCGACGCNttgtttt
attttcaggagAATTCACGCAGAACAACTCTTGGTGGAGTATTTTACTCG
ACGCGATGTCTCTCTTGGTCAAGTTTTACTGAATACAAAACAACCATGTA
AGTAGATTGTAATAGAACCATTcctatggatttttttttagttttgaaat
ttctaatGAACATTAGTAAGTAACACCAAACATTTGTTCAAAGTTCTATG
GAATTAAATTTACTTTCTTCCAACTTTCTTTTAGAGAAACCGTAGAAGCA
CGAGGAGATCAATATGAAAGAAAGTGTCCCAGAAAACATAGTCCAATTAA
CTAAGAAAATGCTGTTTTCAccagaaaatctttttgattctttttctctt
tcaaaCCAAAAGCCTTCTAAACTTCAGCGgcaattcaaaagaaaaaaaga
aaaacagcaTTTGATTGAAAGTCCTTTATCAGTTATTTTTCTGGGACACT
GTACAGAAAGAAGATATCCAGTTTGCCCAGTTTCGAGAGTCAACGAATCT
ATGTAGTGCATTAATTAGTTTTCCTGAGAGTTGAATGACTTTGAAATAGT
TTCATTTGTACGAAATATATACCCGAGTCATTTCTTAATTGGTCTTTGTT
CTGACTGATTCTGTTGATCCTATTCGGCaacatttaatattttttttatt
ttttaacaggTAAAAACATAAATTAACAACAAACCATGTCTGCTGATCTC
GATCAAGAAATTGCGGCCCTTAAAGGTAAAATGGAAGAAATGGCCAACTC
GTTGAACTGTAAGTACCAGCCTTATATTAAACACACTCAAGGGCTCTGGC
TATAGTCAAACGATAAGTTATGACAatgttttaacaaaaaattgcctATA
TAAGTtgtttgaatttattttatcaCGGGTATGTTATTAGCAATttaatt
ttacaaaaagtgcttagttttaaagGGTAATTagcctttttgtttcaatt
ttttttttaattatctgCAAATGATTGAAATatctatcaaaatttttttt
taaattgctgNaattttttttttaattatctgCAAATGATTGAAATatct
atcaaaattttttttaattgatttatcAAAAGTTAAGACTCTTTTTGTAC
GAGAAATTGGgttgaaaaattggtcaaaagccACAACCGAAAATAGGGTC
CTCAAAGTTGTAATACTtgtctttattttcttcttcatcaaattttttca
atgcaatttttgaatgttcCAATTCGACTAGTTAGCCTAACAGAAAATAA
CACAACAGAAAATGTATAGcataacagaaaatgtataacataacattttt
GTTGTTTACATTCGTCAGTAAAACACATTTTATACACGTCAAATATGAAA
GATTCAATTTTCGGTGCGTCCAAACGAACGAATTTCGCAAGATGAATTTT
TCCGCTTTAAAATCATCCCTATTCTATCACAaaccatttttggacctacc
ccggtggggtgaaggtcctataaattcacctcggtccgttcgtccgtctg
tccgttcgttaccagcttctcgagattgaatcataggaatcatttgattt
ttggtacaaaggtgcaaaacagtggtggccaaaatgtgacggagcccgat
tttcgaaaaataattttttgggcaaatttgggccaaaaaacggctagaAA
ACGGgtattttggactttgtgaaaaattggatcattaaatttttttgatt
ttttgcatgaaagtagggtaccatcataggtaaaagatggctcaagcNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNaag
atggctcaagcagatttttgcaaaaaaatttatttggcttaaaaaacgca
tgtttatctataagaatcactattaataagcatacattaatgttcttggt
caaattaatttctttatgagatagaagttttttttgctcatgagggctta
cttttgaagaatatgtgtgtttagacatgaaattttggttgcttgtcGTG
TTTTTATAGGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNtattaggtattagcttttctcgagattggctc
tttcattctttatgattttttgcacaaagatgcataactataaaccctcg
aatgtgactgagcccgattttacaaaaaaaaatgtttttggacaaatttg
ggccaaaaacggctaaaaaaaagggttttttggactttgtgaaatattgg
atcgttgttttttttctgattttttgcatgaaagtagttAAAGATGGGTC
AAGCAGATTTTTGTAAAATAACTTTTCAGCTCAAAAAACGCATCTTTatc
tataagaatcactattaataagcatacatcaatgttcttagccaaattac
tcaattttttgatgagatagatgtctttttatgctcacgaagtcttgaat
atggaagaatatttcaagagtatgaaatttggtttctaaacgttttgtta
taagaaacaaatgactaattttaataaatcgtcactatttttgttctgaa
tgattgtttaacgttcatgcaCACGTAGATAACAATTATAtgatgtgtta
aatgcataaccaggtaggtccataaaagtatcacttgtcttTCCTTTGTT
TTCCGCAAATACTACCTACTGCTTAAACAGGTTATGATAACtggttcttt
cttttttcttaagaTCTCCAAGAAATGCAGAAACAAACCAAAGAGCTCAT
CAGGGAGCATAAAATCGAAAAGTGCATTGGTAAGTTATTCTTTCAATCCA
TCAAAATCTTTTCGCTGTGAGTTTCACTGTcacaaacaaaaatgaaaatg
gggTTATCTTCTATTCGTCTCTTAGTAGGGAACTAATCCTtattagtcag
gtagaattgcatAACTACCCAGACAAAAATGGTATAGAGATGAATCACCA
AAAAAAGCCCCACCCCTAggaagatgggaacaccctcaaatccataatAG
CGGCGGGCAGGGACTTTCCTCTCGCTGAGTAGATAAAGAAATTagggtca
cttttgaaattaGACCACGTGGTCCTGAGATATGACctctaaagtccaaa
aatgacaattttgattacgtcagcatttttactgaGATAGATAAATTGGA
ACGTCGATGAGCTAATCATGAAGCCCTAATCATTGGcttcgatacttaac
ctccttATTATGTAGCCCTGATCATgggcttttagaaaaatatgaTTTAT
TATGTTTAGATCAGCCGTTGGTAAGATAAAACtattttaaaatcgtttaa
aactgttatttttgctgagtcaaattttaaaatcggAAATCTCGCCAACG
GTTAGTTTTAAAAATactaaaccatatatttttctgaaagcctgtctagt
tatttttgacttttgaaaaccattaaaaatcagttatcaagggtccccGG
GACAAACTAGggtggagcatgttgcattgcaccatcGCGAAAAcctctcg
tgtccccaagcctttagggattgaaaattgttccgaattttttgtgtttt
cattttctaaataaaaatttactgtAATTCTATTGTAGAACGAACTTACA
AAGAGTTCCTCCTCGCTGTCAAGGAAGGCACGTCCAATGACACATCAGAC
CAGGCCTTGGGGAACTGGGTTCGGAACCTGGGCCTGCAGCCCCCAAGGTC
GTTTCAAAAAAGAAAGTACCCTTCAAACTAATAAAAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_022688XLOC_022688Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:961..1098TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:961..1098Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:961..1098TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:961..1098Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:961..1098TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:961..1098Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:7922..8007TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:7922..8007Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:7922..8007TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:7922..8007Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:7922..8007TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:7922..8007Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:8570..8668TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:8570..8668Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:8570..8668TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:8570..8668Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:8570..8668TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:8570..8668Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:10824..10889TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:10824..10889Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:10824..10889TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:10824..10889Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:10824..10889TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:10824..10889Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:11699..11847TCONS_00038023-exon-sc0001759-1491911889:11699..11847Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:11699..11847TCONS_00038023-exon-sc0001759-1510915933:11699..11847Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:11699..11847TCONS_00038023-exon-sc0001759-1575043694:11699..11847Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001759supercontigsc0001759:961..11847 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0.627166	1.1736	1.27155	12.1694	17.2033	14.3896	21.4808	2.18088	0.0670988	9.95301e-05	1.66797	1.78276	5.09788	6.93334	8.9934	11.2172	13.685	4.80502	2.19945	14.104	11.7585	4.87183	12.8665	21.9833	26.8717	3.65757	1.74107	3.13939	2.75933
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00038023 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top