TCONS_00037172 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00037172
Unique Name	TCONS_00037172
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4920

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0001587:8704..20206+

transcript sequence

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ACACCGTGTTAAAGATATACGATGACGGCGAGGGAGTGAAAGAGCATAGG
GCAGCCAAAAGGAGAAAGATGGTTGAAAAACGTTCACGCCAACCTCTTGA
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CTTCTCTATAGATACTATACAGAAAAGCTATTGACCGTGGGTTGTATGAA
TTGGAGAGTGAAAACAGAAACCTTACAATCAGTTGTAATGAATGACTACA
ATTCTGACTCTGGAGAGTTTAAAGAATACGATTTTGTTCATGTTACAGCG
AAAACACGTAACGGCGAGCTTGATGTATCATGTTCATGTGTCCTTTATGG
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CCAACCGATTTAAAAGATTTCGTAGATTTGGAAACTATCGAAAAAGCCAA
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ATTGTTTCCAGTGATTCATCAAGTGACGCTATGAACAAAAAAACAAGATT
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GATGACGAGCAAGCAAACTTTCACCGGTTTCGTCAAGGTCATGAATGCAA
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TCGACTTGGCTAAACTTCTTGCTACCTTGACAGCACCTAAAGCAAGCATT
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AATCCCTCTATATGTTTCTAAAAGAGGCACCGCTATCAGTATTTTACGAT
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ttgaatttgacaaaatatcatgggacccaccccctaatttagtaccaata
ccaatctgacaaatttgagt

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transcript from alignment at sc0001587:8704..20206+

Legend: exon

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>TCONS_00037172 ID=TCONS_00037172|Name=TCONS_00037172|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11503bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001587:8704..20206+ (Clytia hemisphaerica)
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atttgccaggatgtgcctgactgccaACCCCCTGTCCCTGTGCCGGCCCT
GCCTGTGCTGTACATACTGTGTGTTGCTGTTTTTATTATACTGGATATTA
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AGTTGGTCCAAAGgtatgaccgctatatggataataatcaGGATTTTAAG
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ctaccagtcgggtgtttaagataaaaactgcaattattgctcttttcaga
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gcccactgtgcctcgtttagttttgttttgtaacaactgaaaatttgaaa
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AACATGGCTCTGTTGTGTCGCGAATAGGCCAACGGTGTCTAATAAGGGCC
ATGATTTCCCTATTTCAGAATAGGTAACTTTTCCAGGATAGGACCGTCTG
CGTCGGCGGGACTACTTCTTTTTTCCTCTGTTCTATCCGTACTTTATTTC
ATCTTTAGGATCTGGAAGTAGTAATACGAAGCCACGTTCTATATATAAAC
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GATTTTGGCTTTCAGCTGCCCacagtcaaaaaagtttaataTCTCTTTCG
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ATTACGCTTATGTCTTCAATATAGGTCGAGGAATGAGAAGGCCCAAAATA
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GGAGTAAACCAAGATGCCTTGCGTGAATTTGGTTGCTGTCACACAAGAAT
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TGGAAACTATCGAAAAAGCCAAGGGATTCTTAGATCATCCAATTGTGTTA
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TTCACGatcccaaaaaaaagttatttcttGCCATAATGATTATTGTAAAT
CTAAAGGATCAAACAGACGTCATCTAGAAAACTTTGGCACAGCTGAAAAA
CTCTGCCCTCACTTGACAAAACTACGAGAAaattttgacgttacgtcatt
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ATCAAATCTTGGATGCCCAAAAAGAACCGGTTAGTTTAATTATATCGAAA
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ACGCACTTACTACGATGGTGGTTTAGTTTTGGATTTTATGAAAAGCAGTT
AATACAGAGAGGTATAAAATGGTTGGCTTCAAAAAGACCCTTACTACTGA
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AGAATGTATTTGACGAAGAAACGGGACTATGGAAATTCCACAAAGGCTCA
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AAAAACAAGATTAAGATCATTTCTGATGCTTCATCCTGAACCTGGACCCT
TTGAATTAAAACCTAACAAGGACGGCGAGTGTGAATGCGGGGTAATTATT
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ATGGTAATTAAAtgaataaatgtttttttacaagaaacagtaaattttgg
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cacacttcgaatctctctgtagtTCGAGCAAATTTCATCTTTCCTTACGA
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cattttttacaGAATGTATGGTACGATGAAGATTCTCCTGACGGTATCCT
TTTCGAAGACGGCAAAACTATTTTGTACACGTTGGTTGGTGCCCACGAAG
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GATGGTGCCAAAGACTTCATTTTCTGTTCCACGAATGCCGTGAGCTGTAG
CTATGAAGTCGGATGGAATTTTGTCGATTTGGTGATGACGAGCAAGCAAA
CTTTCACCGGTTTCGTCAAGGTCATGAATGCAAATTATGGTCGATTCCTG
TCGGAGAAGCCATTCATGACTAAGAATACTTTCATCAAGTGGTGGTTTGC
TTGGGCTTCTGCGATGGGGATCGACTTCCGTAAGCCTTGCTTTGGTTGTG
GCGATAACATCCATATGCTGGCATGTGATGGCACCAAAATAGGAATAACT
CTCAAGCAATCGACCGTCATTCctattgaaacaaaaaataaagagGCTGC
GATTGTTACCCCAAACAAAGGCTTGGATCGAGTTTTTATTGACAAAGAAA
CATATGGAGACAAAAGGACATTGATAAACAACAATGTTAGGAAATTGGCT
CTTCACAAACTTGATAGGGAGTCTCTTACAGATACGCAACTGTTGACAGC
CGTTGCTGAGCTCAATGGTTCAGATGAAGCACTTCTGTTAGCCGTACAAT
ACATGGTTCTTGGAGGAAAAGGAGCAGAAGTGATCGACTTGGCTAAACTT
CTTGCTACCTTGACAGCACCTAAAGCAAGCATTGTTAACTTCTTACCTTG
GAAGCATGTGCCTTTNCTACCTTGACAGCACCTAAAGCAAGCATTGTTAA
CTTCTTACCTTGGAAGCATGTGCCTTTGGTGGAGAAGTTGTTAGTGCTAT
TCGAAGTCGATGAGGTAGTTGATGAAACGTCCCAGTTGTGGCGCTTCAAA
GCCGAATTTTTTAGAGCTTCGATGTCTTTTTTCCCAGAACTCGGAGAATG
GGTAGAGTCATCCATCAGGAGTGCAAAAGGGACAGTACCTGAAAAATATa
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GAAAACGTCGAAGAAGAAAAACCcaacaatttcaaaaagtacaacccccc
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GTTTGCAGTAAAGCCTTCCCGACAGTATCAAAAAAAGGCTGCACCTATCT
CTTCCTTTGGTTCTGCCCCTGTCATGGGCACTGCTATGGATTTCATATTA
TCCCAAAGGCCGAAGGAAGAAAAGATGCAGCTCAATCCCTCTATATGTTT
CTAAAAGAGGCACCGCTATCAGTATTTTACGATTTTGCATGCTCCTTGGA
GGAGTATTGTCGTAATCGAGAGAGTGGCTTCTTCGAACTAACCAGATTTT
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GCTAGAGAACTTTCATTTAGAAAAAAGGCAGCAATTGCAATTGCCAGTTT
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cccttaatttggtatcgataccaacatgactttttgaatttgacaaaata
tcatgggacccaccccctaatttagtaccaataccaatctgacaaatttg
agt

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_021993	XLOC_021993	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0001587	supercontig	sc0001587:8704..20206 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.012253	4.55352e-10	2.00064	1.98359	0.212078	0.973668	0	0.524973	0.0140031	0.596019	0.0684624	0.00718651	0	0.125292	0.125132	0.0229038	0.0428461	0.0496739	0	0	1.01346e-10	0	1.53665e-05	0.000355635	0.226781	0.112589	0.0752127	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00037172 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00037172 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00037172 (transcript) - C. hemisphaerica