TCONS_00036337 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00036337
Unique Name	TCONS_00036337
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	867

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0001443:50340..60349-

transcript sequence

>TCONS_00036337 ID=TCONS_00036337|Name=TCONS_00036337|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=867bp
ttattacgcacgagcgagcgcagcgagcgagtgcgattcttttggcaaaa
gcgcgggaaaaatagctgatatgcggggtgataaaatcgatttttaccct
ttttaagcctcgtttccattcagaatttcgtcgtcgtgtgcaactgtctt
aagtcccaatatggagaattatcgcctgtacccgactgtctgttgtTTGG
CAACTCcgcaaaaacaaacaaataccATTTAGGCGTGAGACAGCGAGGCA
CTAGCTTTTTTGTCGTGATACGTTGATTCAATTTGCGGAACGTCTTTGAT
GAGGCGTAGGTTCAAGTGAATCTGTTTGTTCAGAGTTGTACGTTTCTCGT
TTCTGAAGCGTATCGTCGGCAACCAGCTGTTCATTTCGTACACTGGTCAC
AACCACAACGCAacgaaagcaaagaaaagttAAAAGCCAAAGCTGATTTG
AAAAGATTTCAGAAGAAACAGAATCTCATtcgtttttcaagtttttcaag
tCAACAGattGATGAATGCATCTGGAGATCAACTAATCACAAAAATCAAT
CTTGACGATGGATACCGAACTTCATTACCTATTTTCTACctatttatttt
cattatctACATACACCCGTCACGAGACAACAGGTCCCAATCGACTATTC
TCTACAAGACCAGAAGGAAAACGAAtgatattttaaaatatatagTATAT
TCTAACAAATGTACAATATTCTTCTTCTTTAAGAAATTTATACTTTAATA
TGACATATCTCTTTcatcttttattgaaaaatccaTTAAACACTCGGTTG
AAGTCATTTCCAATTATTTTcccaagaaaaaatatttattctacAGCAAG
AATATTCGATAGATTAT

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001443:50340..60349-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00036337 ID=TCONS_00036337|Name=TCONS_00036337|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10010bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001443:50340..60349- (Clytia hemisphaerica)
TTATTACGCACGAGCGAGCGCAGCGAGCGAGTGCGATTCTTTTGGCAAAA
GCGCGGGAAAAATAGCTGATATGCGGGGTGATAAAATCGATTTTTACCCT
TTTTAAGCCTCGTTTCCATTCAGAATTTCGTCGTCGTGTGCAACTGTCTT
AAGTCCCAATATGGAGAATTATCGCCTGTACCCGACTGTCTGTTGTTTGG
CAACTCCGCAAAAACAAACAAATACCATTTAGGCGTGAGACAGCGAGGCA
CTAGCTTTTTTGTCGTGATACGTTGATTCAATTTGCGGAACGTCTTTGAT
GAGGCGTAGGTTCAAGTGAATCTGTTTGTTCAGAGTTGTACGTTTCTCGT
TTCTGAAGCGTATCGTCGGCAACCAGCTGTTCATTTCGTACACTGGTCAC
AACCACAACGCAACGAAAGCAAAGAAAAGTTAAAAGCCAAAGCTGATTTG
AAAAGATTTCAGAAGAAACAGAATCTCATTCGTTTTTCAAGTTTTTCAAG
TCAACAGGTATTATGTTGATACTTTTGGGTTTCTCTTTAAATTTTTAAAT
CATTTTTGTAGTTTTTTGTATCTGTAATATATTGGGAACTTCTTACGGTA
GAGATTTTTTTTTTAAGTTTTGCGTTTACTTTCTCCTATGAAGATGCTGT
ACCCCATACCGATACCGATACCAATATCATTTATGCCGCTGTTACCAAAA
TCATTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCTAAAGGT
TACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCATGATTATTTT
ATACACTTGCGATTGTTTTGATACTTTTGGGTTTCTCTTTTTTTTTAAAT
CATTTTTGTAGCTTTTTGTATCTGTCATATATGGGAACTTCTAAGAGAAT
TTTTTTCAAAGTTTTGCGTTTACTTTCTCCTATGAAGATGCTGTACCCCA
TACCGATACCGATACCGATATCAAATTGCCGCTTTTACCGAAATCGTTCA
AATTTTAATAGTAAGCACCCAAGTGAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAAAG
GTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTCTTTTTGTATATTTATAGC
TTTTTGTATCTGTAATATATGGGAACTTTTAAGANCATTTTTGCAGTTTT
TTGTATCTGTAATATATTGCTGGGACTTCTAAGAGAATTTTTTTTAAGTT
TTGCGTTTACGTTTTACTATGGATATGCTGTACCCCATACCGATACCGAT
ACCGATATCCAATTGCCGCTGTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAA
GCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTTTAAAGGTTACACAGACA
CGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCATCATTATTTTATACACATG
ACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTGGGTTACGCTTTTTTTTTTAATCATT
TTTGCAGTTTTTTGTATCTGTAATATATGGGAACTTCGAAGATAATTTTT
TTTTAAGTTTTGCGTTTACGTTTTCCTATGGAGATGCTGTACCCCATACC
GATACCGATATCCAATTGCCGCTGTACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAG
TAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTTTAAAGGTTACACAG
ACACGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCATCATTATTTTATACAC
TTGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTGGGTTACGCTTTTTTTTTTAATC
ATTTTTGCAGTTTTTTGTATCTGTAATATATGGGAACTTCAAAGAGAATT
TTTTTTTAAGTTTTGCGTTTACGTTTTCCTATGGAGATGCTGTACCCCAT
ACCGATACCGATACCGATATCCAATTGCCGCTGTACCGAAATCGTTCAAA
TTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAAATGT
TACACAGACCTATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCATCATTATTTT
ATACACTTGACTTGCGATTGTTTTGATACTTTTGGGTTTCTCTTTTTTTT
AAATCATTTTTGTAGTTATTTGTATCTGTAATANATCTGTAATATATGGG
AACTTTTAAGAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGCGTTTACTTTTTCCTATGG
AGATGCTGTACCCCATACCCATACCCATACCGATATCCAGTTGCCGCTTT
TACCGAAATCGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAAC
CTAAAGGTTACACAGCTTTTTGTATCTGTAATATATGGGAACTTTTAAGA
GAATTTTTTTTAAAGTTTTGTGTTTACTTTTTCCTATGGAGATGCTGTAC
CCCATACCGATACTGATACCGATATTCAATTGCCGCTGTTACCGATATTC
AATTGCCGCTGTTACCGATATTCAATTGCCGCTGTTACCGAAATCGTTCA
AATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAAAG
GTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCGTGATCATT
TTATGCACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTTGGTTTCTCTTTTTT
TTAAATCATTTTTGTAGCTTTTTGTATCTGTAATATGTGGGAACTTCTAA
GAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGCGTTTACTTTCTCCTATGAAGATGCTGT
ACCCATACCGATACCGATACCAATACCGATATCCAATTGCCGCTGTTACC
GAAATCGTTCAAATTTTAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAG
TAAGCTTAAATAAAGGTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCA
AACTGCGTGATTATTTTATACACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTT
GGGTTTCTCTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAA
ACTGTATGGGTGTTCAGCTGAATGGAAGATACTTTCAATACTTCCCCAAT
TCATATTATGCTGACACAGTCATCCATCAAGATAGAATAAATCAACTTCC
AGACGAGGCCGCTCAGCTGCCAGGACTAAAAGTTGTTGAAACACAGGAGG
ACATGACAGAAGATGAAAAAGGACCTGCTCCCAATCAATTTTTCATTCCA
TTCAACGAGGGAGATGACAGTGTTACTGGGTCAGGCATCACCTGTCCTGT
CGATCCACAGGATGCTGATAAGGAGCTCAAGATGATCATACAAAAAATGA
CTGGATCTGAAGAAATTCTACATCAAGGCGGTGTTGCATCCGCTGATTGG
GATCGAACTCGAGAAGTTCCCATAAAGGAATTGAAAACGCCTGGTTTTTT
TACCATGGTTGCTCCTGACATCTTTGTCAATGGAAGTTGTGACATCACCT
GCAAGAAGTTGGTAACTGTACATCTCGACGAATGGATACAACATATTTAT
TTTGTTGGGGAAGATCGTGTTCCAAAGCATCCATTTCTGAAATTTCTTCT
CCATAACCTGAAATTACGGCAACAGGCACTTGACCATGGAAGCTTTTTGG
TCGCACAGCAGTTGAATGATGCACATCTGACAATTGACGAACTCAGAACA
AATCTGAATGAAAACAATGATCAGAGTGTCCCACTCAAGATCATAANNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNTTTCCAATGATACCAAATTTATAAAGATTAAAGAATTCCTTCAAAAG
TTATAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTTATCGTGAATAGATTGATGA
ATGCATCTGGAGATCAACTAATCACAAAAGTTTGAAATTCAACTTTATTA
ATTAGTTATATCGTTTTCGAGTGCTTTAATCTACTAGCAAGTTGAGTATT
TCTAATGACTATTATTGCTTATGTGGGACTTTCCAAAATGTGATTTGTAA
ATGGTTAAAACCCAATGCTATCTACTTTATATCTTAATTTTACTTCTGCA
GATCAATCTTGACGATGGATACCGAACTTCATTACCTATTTTCTACCTAT
TTATTTTCATTATCTACATACACCCGTCACGAGACAACAGGTATTACTTA
TAGTAAATCGGATTTATTTTTACTTATCAGCGTTTGAAAAATCTTTTTTG
CGATTCTTCCAAGAATAACTTGTAACAGTTCCTGTAAATTTTCGTCTAAA
CTTTAAAGTGTATTTTAAGCNACAGGTATTACTTATAGTAAATCGGATTT
ATTTTTACTTATCAGCGTTTGAAAAATCTTTTTTGCGATTCTTCCAAGAA
TAACTTGTAACAGTTCCTGTAAATTTTCGTCAAAACTTTAAAGTGTATTT
TAAGCAAAATCTGATTACTTGCTAAAATTAATTATGTGCGATATTTACTT
TTTACCTTTCCTGTTTTTACTTGCAGGTCCCAATCGACTATTCTCTACAA
GACCAGAAGGAAAACGAATGATATTTTAAAATATATAGTATATTCTAACA
AATGTACAATATTCTTCTTCTTTAAGAAATTTATACTTTAATATGACATA
TCTCTTTCATCTTTTATTGAAAAATCCATTAAACACTCGGTTGAAGTCAT
TTCCAATTATTTTCCCAAGAAAAAATATTTATTCTACAGCAAGAATATTC
GATAGATTAT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_021387	XLOC_021387	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1575043694:59843..60349	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1575043694:59843..60349	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1510915933:59843..60349	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1510915933:59843..60349	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1491911889:59843..60349	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1491911889:59843..60349	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00036337-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573	TCONS_00036337-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573	Clytia hemisphaerica	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0001443	supercontig	sc0001443:50340..60349 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.935185	1.52529	1.19022	1.17446	3.32798	4.04066	2.95909	2.64587	1.15796	1.26417	0.52905	1.60693	1.20693	1.08116	0.338579	0.465392	1.62554	0.97733	1.2003	0.91434	0.757565	1.48578	0.525934	0.970468	2.12331	1.21798	1.20781	1.0616	0.545008	0.329603

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00036337 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00036337 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00036337 (transcript) - C. hemisphaerica