TCONS_00036332 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00036332
Unique NameTCONS_00036332
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length387

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00036332 ID=TCONS_00036332|Name=TCONS_00036332|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=387bp
TAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAattGATGAATGCATCTGGAGATC
AACTAATCACAAAAATCAATCTTGACGATGGATACCGAACTTCATTACCT
ATTTTCTACctatttattttcattatctACATACACCCGTCACGAGACAA
CAGGTCCCAATCGACTATTCTCTACAAGACCAGAAGGAAAACGAAtgata
ttttaaaatatatagTATATTCTAACAAATGTACAATATTCTTCTTCTTT
AAGAAATTTATACTTTAATATGACATATCTCTTTcatcttttattgaaaa
atccaTTAAACACTCGGTTGAAGTCATTTCCAATTATTTTcccaagaaaa
aatatttattctacAGCAAGAATATTCGATAGATTAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001443:50340..58440-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00036332 ID=TCONS_00036332|Name=TCONS_00036332|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8101bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001443:50340..58440- (Clytia hemisphaerica)
TAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAAATGTTACACAGAC
CTATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCATCATTATTTTATACACTTG
ACTTGCGATTGTTTTGATACTTTTGGGTTTCTCTTTTTTTTAAATCATTT
TTGTAGTTATTTGTATCTGTAATANATCTGTAATATATGGGAACTTTTAA
GAGAATTTTTTTTAAAGTTTTGCGTTTACTTTTTCCTATGGAGATGCTGT
ACCCCATACCCATACCCATACCGATATCCAGTTGCCGCTTTTACCGAAAT
CGTTCAAATTTCAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCTAAAGGTT
ACACAGCTTTTTGTATCTGTAATATATGGGAACTTTTAAGAGAATTTTTT
TTAAAGTTTTGTGTTTACTTTTTCCTATGGAGATGCTGTACCCCATACCG
ATACTGATACCGATATTCAATTGCCGCTGTTACCGATATTCAATTGCCGC
TGTTACCGATATTCAATTGCCGCTGTTACCGAAATCGTTCAAATTTCAAT
AGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAAAGGTTACACAG
ACAGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCGTGATCATTTTATGCACT
TGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTTGGTTTCTCTTTTTTTTAAATCAT
TTTTGTAGCTTTTTGTATCTGTAATATGTGGGAACTTCTAAGAGAATTTT
TTTTAAAGTTTTGCGTTTACTTTCTCCTATGAAGATGCTGTACCCATACC
GATACCGATACCAATACCGATATCCAATTGCCGCTGTTACCGAAATCGTT
CAAATTTTAATAGTAAGCACCCAAGTAAATAAGCAACCAAGTAAGCTTAA
ATAAAGGTTACACAGACAGATAAGTATTTAGTTTTTTCTCAAACTGCGTG
ATTATTTTATACACTTGACTTGCGATTGTGTTGATACTTTTGGGTTTCTC
TTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAACTGTATGG
GTGTTCAGCTGAATGGAAGATACTTTCAATACTTCCCCAATTCATATTAT
GCTGACACAGTCATCCATCAAGATAGAATAAATCAACTTCCAGACGAGGC
CGCTCAGCTGCCAGGACTAAAAGTTGTTGAAACACAGGAGGACATGACAG
AAGATGAAAAAGGACCTGCTCCCAATCAATTTTTCATTCCATTCAACGAG
GGAGATGACAGTGTTACTGGGTCAGGCATCACCTGTCCTGTCGATCCACA
GGATGCTGATAAGGAGCTCAAGATGATCATACAAAAAATGACTGGATCTG
AAGAAATTCTACATCAAGGCGGTGTTGCATCCGCTGATTGGGATCGAACT
CGAGAAGTTCCCATAAAGGAATTGAAAACGCCTGGTTTTTTTACCATGGT
TGCTCCTGACATCTTTGTCAATGGAAGTTGTGACATCACCTGCAAGAAGT
TGGTAACTGTACATCTCGACGAATGGATACAACATATTTATTTTGTTGGG
GAAGATCGTGTTCCAAAGCATCCATTTCTGAAATTTCTTCTCCATAACCT
GAAATTACGGCAACAGGCACTTGACCATGGAAGCTTTTTGGTCGCACAGC
AGTTGAATGATGCACATCTGACAATTGACGAACTCAGAACAAATCTGAAT
GAAAACAATGATCAGAGTGTCCCACTCAAGATCATAANNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCCA
ATGATACCAAATTTATAAAGATTAAAGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTA
AAAGAAAAAAGAGTGCACACTTATCGTGAATAGATTGATGAATGCATCTG
GAGATCAACTAATCACAAAAGTTTGAAATTCAACTTTATTAATTAGTTAT
ATCGTTTTCGAGTGCTTTAATCTACTAGCAAGTTGAGTATTTCTAATGAC
TATTATTGCTTATGTGGGACTTTCCAAAATGTGATTTGTAAATGGTTAAA
ACCCAATGCTATCTACTTTATATCTTAATTTTACTTCTGCAGATCAATCT
TGACGATGGATACCGAACTTCATTACCTATTTTCTACCTATTTATTTTCA
TTATCTACATACACCCGTCACGAGACAACAGGTATTACTTATAGTAAATC
GGATTTATTTTTACTTATCAGCGTTTGAAAAATCTTTTTTGCGATTCTTC
CAAGAATAACTTGTAACAGTTCCTGTAAATTTTCGTCTAAACTTTAAAGT
GTATTTTAAGCNACAGGTATTACTTATAGTAAATCGGATTTATTTTTACT
TATCAGCGTTTGAAAAATCTTTTTTGCGATTCTTCCAAGAATAACTTGTA
ACAGTTCCTGTAAATTTTCGTCAAAACTTTAAAGTGTATTTTAAGCAAAA
TCTGATTACTTGCTAAAATTAATTATGTGCGATATTTACTTTTTACCTTT
CCTGTTTTTACTTGCAGGTCCCAATCGACTATTCTCTACAAGACCAGAAG
GAAAACGAATGATATTTTAAAATATATAGTATATTCTAACAAATGTACAA
TATTCTTCTTCTTTAAGAAATTTATACTTTAATATGACATATCTCTTTCA
TCTTTTATTGAAAAATCCATTAAACACTCGGTTGAAGTCATTTCCAATTA
TTTTCCCAAGAAAAAATATTTATTCTACAGCAAGAATATTCGATAGATTA
T
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_021387XLOC_021387Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1575043694:58414..58440TCONS_00036332-exon-sc0001443-1575043694:58414..58440Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207TCONS_00036332-exon-sc0001443-1575043694:51171..51207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998TCONS_00036332-exon-sc0001443-1575043694:50910..50998Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573TCONS_00036332-exon-sc0001443-1575043694:50340..50573Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1510915933:58414..58440TCONS_00036332-exon-sc0001443-1510915933:58414..58440Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207TCONS_00036332-exon-sc0001443-1510915933:51171..51207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998TCONS_00036332-exon-sc0001443-1510915933:50910..50998Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573TCONS_00036332-exon-sc0001443-1510915933:50340..50573Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1491911889:58414..58440TCONS_00036332-exon-sc0001443-1491911889:58414..58440Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207TCONS_00036332-exon-sc0001443-1491911889:51171..51207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998TCONS_00036332-exon-sc0001443-1491911889:50910..50998Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036332-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573TCONS_00036332-exon-sc0001443-1491911889:50340..50573Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001443supercontigsc0001443:50340..58440 -
Expression
No biomaterial libraries express this feature.
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00036332 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top