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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00036259 ID=TCONS_00036259|Name=TCONS_00036259|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5372bp
aaaagtaactcgcaactcgtggttctaaatgcaactcgtaactcgtaact
tgtaactcgtaactcgcatatGAAAAATCCTCTGAAAATCAGACTTGAAT
GGATTAAGGAATTCTTATCTATTCCTCTGTACACATAAAAAGGGGGAAAA
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AATTAAATTATATAATTATACGATAAAGCTTAAGAGACTCCTGAGCTAAT
GAGCCTCTTCCCTGGACTAAAAACGCTGTCTCCCTCGAGCTAATAGGGGT
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GTTTGTTGACAAGAGAGAGGAACAGCTAGCTACGAGCTACCATTTTTGTA
CGCTTCTGAACCCGTCATGCATTGCGCAACAAACTGCCGGAGCCGAAAAG
AATCTACTTTTCCGGCTATTTTTCAAACCGCCGGAAATTCCGCTTCTTAT
CTATTCCTCTGTACACATAAAAAGGGGGAAAATAATGATTGGAAACAAAA
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ACCAAAATCCTTGGTGTTTATAGTCCCAACTTTCTAGAGACAGAGAATCG
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TTATGCTGTACTTCCCCAAGGCTTTATGGCCTATCTTGCACTTGGCGAGC
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TTCTTTGATCCTCATGAATCCCGAAAAACCCAACAAAAACATTACTACGG
CTCTGACTTCTAAGAGGTTGTGAGATTGTGAATACTTCGTGGCAATGGCT
ATTAAGGTTTCGTTCTCTAAAATGTCTTTGCGATTCTTGACAGTAAAAGG
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AAAGCTGATGTTACTGCGCCTACTTTCTCTCTGCGAATAGTTAAATGATT
TAAATATAAAGCAACATGAAGGGGGTCGGCTGGACAAGCGTTAATCTCCT
GAAAACTGTTTGTGAAATTGATCCATTTGTTCCAAGCTGGCTTATATTTC
TTCAGTGTCGACTTAGCATAGGCATTCTCAATCAGATCAGGTAGTGTAGA
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GGTGTACCAACGAGGGTGTACCAACAAGGGTAGAGTATTTTGCAACTAGG
CAAGGATACTCTGTCCAATTACATCTTCGCCATTCGAATGTATTGTAATC
ATTTTTCCATTTCTTGATTGAGGCTGTCTCGTGCTGCTGGAATGTTGTTG
TTTTGGAGGTGGTGTAAGGAATCGTCAATTAAGTCTTCTATTTGTGTTTC
ATGAAGGAATTGGTCTTTATGTCCTTTTTTATTAAAAGACATTTGATCAG
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GTCTCTTGCAGAGTGGACTTGAGGCCACTCATCTCATTCTTTAGAGTGTT
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CCATGCTGTATGTTGTGATTTGAATTTCTCAGGTTATAAAAGCTGTGGTT
AAGTATCCTAACCTGTTTGTTGACAAGAGAGAGGAACAGCTAGCTACGAG
CTACCATTTTTGTACGCTTCTGAACCCGTCATGCATTGCGCAACAAACTG
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CTTctctattttttcttcttcttggattacacgttgtttttttttataag
gagccttaactttgctctgagcctggagctCCTTATTTTTAccgagaatt
tcagcctcaaagttccttatcgagttccttatttacatagctgctaagtt
tggataaccatctcttactgttccttaaaacttattttcttattctcagc
ccgagcagttccttaacaattccttattttttggaccattttcagcctcg
agttccttataaacgtcttccttatataaaaaaaacgtgtaactcgTGGA
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CTTTGAGACGCCAAGTCACTATTTCTATACAGGAACATTTGAGCTGGATG
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TTCTGTAAAccgttttcgaaaatctaacaaagctctacaaagcctcctct
tgaCGGCGTTGAACGTTGAACGTCTTTTTTGCACCTCATGCAGATTTTCT
ACTCCTAGAAAATTTCTTACCACTAGACTTTCAATCCATAGCCCAATTTC
CCTAAAGTTGTCTTATTAATGTGAAAAAGCATATTTGGGGGATAATTGTT
TAGTAATGCATTACATTGTACGGCGTTTTGGTATCCTCCAAATACTAGaa
tataaaaaacgaaagcTGAATATGGTTTGTTGAACTATTTTTGAACAAGT
TGGACGTCTAGGtctgtattttttaattttcgtttttcgacgtcagtttt
atcattttgttatgtttttgattatacatagcgagcacctcactaaaaac
cgggatttttcatcacGTTTCTTAgcgagttccactttgacgattttcga
aaaatagaagcctttccaGTGTTTTGACGCAATTTCGATTGTTTTGCTAC
TGCATGAGCTTCGaaaattaaaagtgacgtcaaaaaatcgaatgtttaga
gcccggaaacccgggctcaaaacattcgaaaaagtcgcaaagtggaatag
acgttaatggCGTAAAAAAAACGcaggtgacgtctagtataagCTANATT
TTTTACTTTTCGTTTTTCGACGtcagttttatcattttgttatgtttttg
attATACATGGTTgtctttaaaattgaatatcttgagtttcatttaagtt
tttgaaacaaaactttcaacGTTTACTTATATGCTAAGGATCAATTCAAT
ggaaaaatacgtcaaaaaatttagtttaaaacatgtctttttgaaaacgt
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CCTATTTATCAGTAACAGATTGGGAAAATTTCGTTTGAATTCCATAAACT
GTTTAGAAGTTAAATATAATTTAGTAAAcacaattgacgtcaaaaaatat
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AATCGAACACATTGCCTGCCAATTTAGTAATACCAATCGAAAGCTCACCC
TACTTCCATAATTCAAATGATA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001432:26973..35234- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00036259 ID=TCONS_00036259|Name=TCONS_00036259|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8262bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001432:26973..35234- (Clytia hemisphaerica)
AAAAGTAACTCGCAACTCGTGGTTCTAAATGCAACTCGTAACTCGTAACT
TGTAACTCGTAACTCGCATATGAAAAATCCTCTGAAAATCAGACTTGAAT
GGATTAAGGAATTCTTATCTATTCCTCTGTACACATAAAAAGGGGGAAAA
TAATGATTGGAAACAAAATATGTGGAGCTTATGAAACATCTCTTTTTGTC
TGCTGAGGTTAGGTGAAAATTGCTAGTACAAGAAGAACAAATATATATTA
GTTACATCAAATAGAATAATTAAATTCTTTTCGTCAGTTGGAAATCAATA
TTTTGCATCGTAGTGTGTACTGAGAGGTGTCGTTAGATGGATCAGCTTTT
AATTAAATTATATAATTATACGATAAAGCTTAAGAGACTCCTGAGCTAAT
GAGCCTCTTCCCTGGACTAAAAACGCTGTCTCCCTCGAGCTAATAGGGGT
CGGTTCTCTGTGCCAATCTGACCGATCTTTTGACAGGACAAAAAACCATG
GGTCGTTAAGTAAAATATAAATCAAAAATGAAGCTGCCATGTTCAGTTCT
GTATTGCCTCTCGAATCATCTTTTCCGGCACTGTATCGCTAATTCGCAAA
TTTTCATGGAAGTTTTTAGTCCTGCGTGTGACTGACTGATAGTTACCGAA
TAAATGTCTGTCATAAAATTGTTCAATATATGAAAATTGTCTCATCAGGT
AAGTCTATAGGTTAATCGTGTGATCGAATTCCGCGTACGTTCGTTTATGA
TTGATCGACAATTCTGTGTGCGTTCGTTTATGATTGATCGACAATTCCGT
GTGTATTTGCGTATGTACATGTACGTTAATACAATTGTTCCGCATCAATG
ACATGAAAGAAATAGAAACAAAGAAAAGATTAGGTTAAGTATCCTAACCT
GTTTGTTGACAAGAGAGAGGAACAGCTAGCTACGAGCTACCATTTTTGTA
CGCTTCTGAACCCGTCATGCATTGCGCAACAAACTGCCGGAGCCGAAAAG
AATCTACTTTTCCGGCTATTTTTCAAACCGCCGGAAATTCCGCTTCTTAT
CTATTCCTCTGTACACATAAAAAGGGGGAAAATAATGATTGGAAACAAAA
TATGTGGAGCTTATGAAACATCTCTTTTTGTCTGCTGAGGTAACAAAAAA
AGTAAAGCAGGAACCAAAGACAAACACGAAATCGAAACGAAATACAGTAA
ACCAAAATCCTTGGTGTTTATAGTCCCAACTTTCTAGAGACAGAGAATCG
CTTTGTGTGACTGTCCTTGATGTATCTGTCTCGACTATTGCCGAGGGACC
ATCGACCATGTTTGGAAATCATTCTATCGGATACTCCAGCGTTTGCGGCA
GAAGAAGCGCCGCCTGCCCTCAAGGAATGCGTCCCTATCGTTTTTGGGTC
AATGTTTTCTGGAAGATGGATTCTGATGTTTTCGAGAGCACTTGAGTAAC
TTATGCTGTACTTCCCCAAGGCTTTATGGCCTATCTTGCACTTGGCGAGC
CTGCAAATTACAAAATCCTCTTTTGTTATGTTCGCCAAAGCTATGTACTT
CTTTGTCCAAGCGACCGGACAGGCAATCGACTTTGTTTCGCTAATGAATA
TGGTTTCCCCTTCCCTAAGCTGATCAGTTTTGGACATCTCTAGGAAGATC
TTCATGCCCTCTTGGGTGAAAGAAAGATGCTTGAGCTGCAGGGGTAACAA
TTCTTTGATCCTCATGAATCCCGAAAAACCCAACAAAAACATTACTACGG
CTCTGACTTCTAAGAGGTTGTGAGATTGTGAATACTTCGTGGCAATGGCT
ATTAAGGTTTCGTTCTCTAAAATGTCTTTGCGATTCTTGACAGTAAAAGG
GGCAAGAGTTCTTTTCGCGCCTTCCAAAGCTAGTTGAACAAAAGGGTGGT
CAGTAGGAGGGATGAGCCCAGACTTGATGTGACCCCAACGGATTGCTAAA
AAAGCTGATGTTACTGCGCCTACTTTCTCTCTGCGAATAGTTAAATGATT
TAAATATAAAGCAACATGAAGGGGGTCGGCTGGACAAGCGTTAATCTCCT
GAAAACTGTTTGTGAAATTGATCCATTTGTTCCAAGCTGGCTTATATTTC
TTCAGTGTCGACTTAGCATAGGCATTCTCAATCAGATCAGGTAGTGTAGA
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GGGATGAGCAAATAATCATGTCGTTAATGAGACCAACGAGGGTGTACCAA
CAAGGGTAGAGCGTCTTGCAACCAGGCAAGGATAATCGTGTACCAACGAG
GGTGTACCAACGAGGGTGTACCAACAAGGGTAGAGTATTTTGCAACTAGG
CAAGGATACTCTGTCCAATTACATCTTCGCCATTCGAATGTATTGTAATC
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ATAGTGTGTCAGTTTGAGATAATGTAAAATGAGGTTGAACACTAATAGGT
TTCAAAACTACGCACTGGAATAGGTACAGGCAAATTAGAGTGATGTAAAG
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TTATATGTTTAAAATGTTTACAAGACTAGTCAGTTACAAGTAACAATAAA
CAATAAATAGTGAAAGGTTGTTATGGGGTTTCCCCGGAGAAGTCTATCAG
TAATGCAAGAGAATGAAATTTGGCGAAACCGTCAAACACAGAATCAGATA
GTCTGGCAAAATTCCAGAAGTAAGGATCTAAAACGAGATAGTGTTTTATA
AAAGTCTTGAAATATCTGCCATCACTTGTCAGGAGTGGCCAAAAATATGA
TGACTGCCACATGGGAACGAAAAGCACTCCTTTTCCTCTGCACATTTTTA
GGAATCTGATAGATCTACCGATAAGTCGGATTGGTGGGCACAACCAGTTG
AAATCGTCTTTCCAAGTGATAGAAAAAGCATTGACCTGATTTGATCCGGG
GCAATGGTATTTTGAGTTGAAGTTGCTCACTTTCCTATTGATGTTATCAG
CAAATCTGTCCACAGTGAAGGGACCATAAACCGATTGGATGTATTCAAAT
GTCTCATCATCAATACTCCAGTTGTCTGTGTCTTTTTCTTTTGAGATGGC
GTCGGCGATCTTGTTTTCTTCTCGTGGTACCCAAATAGGGTAGAGAATAA
TGTTGTTCCTGATACACAAGTTGTAGATGGCAAGGGCTAATTCTTGAAGA
TGATGTCGTCTGGATCCTGTTGATATTATTCTGGGAACGTTGTTATTATC
TGTGAGCCACTGCACGCATTGAGATTGGAGATGGTGAGCAAATGACTGAA
GAACATACTTGACTGCTAACAACTCTCTGCTGGTAGAGCTTGTTTCTACT
TCATGGTCGTGGAAGTCACCTCTTGCTATGACTTGGCCTAATTCTTGAAT
CAGGAATCCTCCATAGCTGCTGTTGCTGGCGTCAGAATACACAATTTTTG
TTACCTGAGGTGTGTATCTCATTTTTAGACCATTCGAGTCTTCAAGGTTA
GACAGCCAGAATTTCAATTCATTGATGAGCTCAAAAGATAGGATTTTTGG
AGTGTCCCATGAATACCTGGACTCAATGAAAATGTGCATCTGTTTTGTGA
AGAGTCTAGTCAGGGGGCCAATGGCTAAAGACATTGATGCTATGTGGCCT
GCAATCCTTGATATAGCCCTTGGTGTTGCATGGGAGTGTTGTAGAACATG
ATTGATGTTGAGTAACAGCTTACTTACTTTTTCTTGAGGAACTCGAAACA
TCATGTTGTTGGTGTCTATAATGAAGCCAATCCAAATGCCTTCACGAGTA
GGCGTTAGTTGAGATTTTTTTGAGGTTGATTGTTAATCCTGCTTCTGACA
AGTCTCTTGTAATGGCGTTGCAAAGGATAACTGTTTCATCGAAGGAAGAC
CCTCCACAGATGCCGTCATCAAGATACATGGCACATTTTTTCCCTTCTGA
ACGCCACTTCTTGATTAGTTGTTTCATCAACTTTGTGAAAATGAAACAAG
CACTGCTGAGCCCAAAGGGGAGGACAGAGAACTGGAAAAATTTCATCTGA
CCTTCAATGATCCATGAGAAACCTAAGTATTTTTTGAAGTCTGCATGTAT
TGGGACGTGATGATAACCACTTTTTAAGTCAAAAGTTATGAAAAAATCTT
TTTCCTCTAAAAACTCTGCTACAGTGCTAAGATTGTCATATTTAAACTTG
TTCAAATCGATGAACCGATTTACGTGTCTGAGATCAATGCAAAGCCTTAG
TTTTGGTTTTTCTGCTACTGTTAGTGGATTCACACAGAAAGGGACTGACT
GGGTTTCCTCAATGCAATTGTTCTTGAGCAGTTCTGCAATGCTGGTTGTC
ACAAAGTCATCATGTACGAGGCTCGATCTGTTGTTAGGAGCATAGAATCG
AGGGGGGTAGGCTTTAAAAGGAAGTTTGTAACCATTTGTCACTATGTCTA
CAACATGAGGCGGGGACTTAAGATCATGTTTCCAAAAATCTGCATGGTGT
CTAATCCCACCGGCTGCAAAGGCTTGTTGGCCTTCTTGGGACTCCCAGTC
TCTGAGATTGTATCCTGAACAAATGAAAGTAAACAAGAACAAAGCTAGCT
CTAAAACTGAGAATATGTGGCTGCACTCCGGGGAAAACCCCCTGAGGTGT
TCAAAAACAAATCAATTTCTCGTATATGGAAAAAATAACACAAAAACAAT
AAAAACAAAATTCAAAATCCTTTGGCTTAAGCTTCAACTCAAATTATGTC
TATGTTACTATGACAAAATGTAAACACGAAAAGGTTACTGTAAAAGTTAG
TAAGATAGAATAATTGTCCTTTCATTATTTTCCTGTTTCTTTTGCGCCAG
ATGCTTTCTTATTGTCTAATTGAAGTTGGGGTATTTTTGGGAGCTCCTTG
GTGGTAAATTCTCTCTCAAAGGGGCAATGTTGAATGTAATGACCAGTGAT
CTTGCAATTGTAGCAAACAATGTCGTCCATTTTGTTTTTGAAGGTCTTTG
TGCCATCATAGGTCTTAGGTCTATGTGTCGACGAGGTAGAATACGAAGAT
GAAGGAGAGTCTCCTTTTGAATCAAATTTTGATTTCTTGAGTTTATCTCT
GATGGTGGAGGCAGCTTTGATGGCCTTTTTTAACTTTTTCTCCTCCTCGT
CATCAGAGGCTAGTTCATCTGATTTAAACTGTTGTACGGTCAACCACCCA
TCTCGGTCCGCAATACAAATACATTTAATCCTGTCTTTAATTAACTTCTT
ACCTTGATTGAGGCTGTCTCGTGCTGCTGGAATGTTGTTGTTTTGGAGGT
GGTGTAAGGAATCGTCAATTAAGTCTTCTATTTGTGTTTCATGAAGGAAT
TGGTCTTTATGTCCTTTTTTATTAAAAGACATTTGATCAGCTTTCCTTTT
CTTCGAGAGCTTCTCTGTTGTTCTTTGCAGTTTAGTTTCTGTCTCTTGCA
GAGTGGACTTGAGGCCACTCATCTCATTCTTTAGAGTGTTTGTTATGTCA
GTCTTGACTTTGTTCAAAAGATTTGTCACTTGTCTTTCATCCATGCTGTA
TGTTGTGATTTGAATTTCTCAGGTTATAAAAGCTGTGGTTAAGTATCCTA
ACCTGTTTGTTGACAAGAGAGAGGAACAGCTAGCTACGAGCTACCATTTT
TGTACGCTTCTGAACCCGTCATGCATTGCGCAACAAACTGCCGGAGCCGA
AAAGAATCTACTTTTCCGGCTATTTTTCAAACCGCCGGAAATTCCGCATA
TGATCAAGCTAGCTTCTACTTCTACAAGGCTGGATATATCTTAATTGCAA
GTAATCCTTTTAAATGTTCAATTAAAAGTCTCCAGAAGTGAGGAATAAAA
ATAACTATTAAAAATGATTGAAAAAGCTGAAGAGAATTTTCTTCTCTATT
TTTTCTTCTTCTTGGATTACACGTTGTTTTTTTTTATAAGGAGCCTTAAC
TTTGCTCTGAGCCTGGAGCTCCTTATTTTTACCGAGAATTTCAGCCTCAA
AGTTCCTTATCGAGTTCCTTATTTACATAGCTGCTAAGTTTGGATAACCA
TCTCTTACTGTTCCTTAAAACTTATTTTCTTATTCTCAGCCCGAGCAGTT
CCTTAACAATTCCTTATTTTTTGGACCATTTTCAGCCTCGAGTTCCTTAT
AAACGTCTTCCTTATATAAAAAAAACGTGTAACTCGTGGATATTACATGG
GAATGCCAATAGATTATTGCACTTTTTCCTCAATTAGATGAAGACTTTTT
TAATAATAAGAACAAGAAAGCCTAAGCGGTGTAAAGGCCCAGCAAGGTTG
GCACTGTCAACATATTTTTCCGTTGCAGAATTACCATACAACAGGAGCAA
ATTTTACGCTAAAACGCGTGTGTTTACAACGTTCTGTAAACAGTTTTCGA
AAATCTAACAAAGCTCTACAAAGCCTCCCCTTCACAGCGTTGAACCATCG
TCTTTTTGCACCTCATGCAGATCTCCTACCATTAGACGAGCTTTGAGACG
CCAAGTCACTATTTCTATACAGGAACATTTGAGCTGGATGGGTTAAAATT
AACCTTCTTCCCAAATATAATTTTTGCTTTCGAAGAATTCTTATTATAAC
TTTCAAAACATATATTATACTTTGTTCTGGTTTGAACTCTGATCTTTATG
AAGAATGTACATTCTTTTGAACCAGCAAGCCAACTGTGGCATGCGTAAAT
TTAGTTTTTTTATTCAAGGTTATGGCAAGAGGGCCTTTTAAACTTTCACT
TTAAAATTGTCTCTCTAATCTATATCAATACGCTAAAACGTTCTGTAAAC
CGTTTTCGAAAATCTAACAAAGCTCTACAAAGCCTCCTCTTGACGGCGTT
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TTACATTGTACGGCGTTTTGGTATCCTCCAAATACTAGAATATAAAAAAC
GAAAGCTGAATATGGTTTGTTGAACTATTTTTGAACAAGTTGGACGTCTA
GGTCTGTATTTTTTAATTTTCGTTTTTCGACGTCAGTTTTATCATTTTGT
TATGTTTTTGATTATACATAGCGAGCACCTCACTAAAAACCGGGATTTTT
CATCACGTTTCTTAGCGAGTTCCACTTTGACGATTTTCGAAAAATAGAAG
CCTTTCCAGTGTTTTGACGCAATTTCGATTGTTTTGCTACTGCATGAGCT
TCGAAAATTAAAAGTGACGTCAAAAAATCGAATGTTTAGAGCCCGGAAAC
CCGGGCTCAAAACATTCGAAAAAGTCGCAAAGTGGAATAGACGTTAATGG
CGTAAAAAAAACGCAGGTGACGTCTAGTATAAGCTANATTTTTTACTTTT
CGTTTTTCGACGTCAGTTTTATCATTTTGTTATGTTTTTGATTATACATG
GTTGTCTTTAAAATTGAATATCTTGAGTTTCATTTAAGTTTTTGAAACAA
AACTTTCAACGTTTACTTATATGCTAAGGATCAATTCAATGGAAAAATAC
GTCAAAAAATTTAGTTTAAAACATGTCTTTTTGAAAACGTTTGCCGGTAG
GAGTGGAAAAAAAAGGTGAACCTTTTGCACAATCACCAGGAAATGAAAAC
TGGTAGGGACACAGCAATATTTTTGCTATTGAAAGTTAGCCCTATTTATC
AGTAACAGATTGGGAAAATTTCGTTTGAATTCCATAAACTGTTTAGAAGT
TAAATATAATTTAGTAAACACAATTGACGTCAAAAAATATCACTTTTTTT
GCATTCTGGTCCGTAAAATAGACACCTACAAGAAAATTTCGGACAGCAAA
CAAGTAAATTCGGAAACTTAGAGAAGACATAGTGCTACATGATGATATAT
GTTTGCACGTGCCTCTACGACTGTCATAGTTGACCTCCCACAGCTCCCAG
ACTAATACCATCGCATAAAATTTTAATTTTCCAACTATTCAATCGAACAC
ATTGCCTGCCAATTTAGTAATACCAATCGAAAGCTCACCCTACTTCCATA
ATTCAAATGATA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00036259-exon-sc0001432-1575043694:32723..35234 | TCONS_00036259-exon-sc0001432-1575043694:32723..35234 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036259-exon-sc0001432-1575043694:26973..29832 | TCONS_00036259-exon-sc0001432-1575043694:26973..29832 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036259-exon-sc0001432-1510915933:32723..35234 | TCONS_00036259-exon-sc0001432-1510915933:32723..35234 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036259-exon-sc0001432-1510915933:26973..29832 | TCONS_00036259-exon-sc0001432-1510915933:26973..29832 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036259-exon-sc0001432-1491911889:32723..35234 | TCONS_00036259-exon-sc0001432-1491911889:32723..35234 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00036259-exon-sc0001432-1491911889:26973..29832 | TCONS_00036259-exon-sc0001432-1491911889:26973..29832 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0001432 | supercontig | sc0001432:26973..35234 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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