TCONS_00036192 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00036192
Unique NameTCONS_00036192
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1499

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00036192 ID=TCONS_00036192|Name=TCONS_00036192|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1499bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00036192-protein

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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001423:46838..61397-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00036192 ID=TCONS_00036192|Name=TCONS_00036192|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14560bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001423:46838..61397- (Clytia hemisphaerica)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0001423:46838..61397-

>TCONS_00036192 ID=TCONS_00036192|Name=TCONS_00036192|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=23598bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001423:46838..61397- (Clytia hemisphaerica)
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GCAACGCTGGTCATTATTGTATGGGTCAGTTGCTATCTAATGGTGGATAT
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CTTGAAATTAAGTTGGCCTCGATGGAAGCGTGTCTTGCTTACCCGAAGTA
TCGCCATTGCACCTACATTAGCATTAGCCTTCTACGAAGGAATCAATAGA
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TTACGATGGCTGTGTAGCGCATCACAATCCACATGCTTATATCTTCAATC
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ATTCTGCAGTTGTACAGCAGGTCTGAGGAAGCTGGAATTGTTCTTTGCAA
CTCTGATCACTATAATGGCTGTCACCTTTGGATACGAGGATTCCAATCTG
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GGTCATTATTGTATGGGTCAGTTGCTATCTAATGGTGGATATTAAAAACC
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AATGAATGACTATCTTAATATTTTACAAAGTTTACAGGGAACATATTCTG
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GCTGTGTAGCGCATCACAATCCACATGCTTATATCTTCAATCAAACTGCT
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AAGCTGGCTATGATCAGTTCGAAGAAGAGGACAAAGATGAATCAATGGTT
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GCAAGGAATAGAGAACAAGATACTGTATTTGCCAGCAACGCTGGTCATTA
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GCTTTTAGCTGCAATTATCATTGGAGTTAATATGTACTTTGCAGCACTCG
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AACTTGATGAAAGATTTCACCAATGGAAGGGTTTCTTGAAATTAAGTTGG
CCTCGATGGAAGCGTGTCTTGCTTACCCGAAGTATCGCCATTGCACCTAC
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GCTATGGAGGGTATATTCTTGGGCTGTCAATTTGGACCAGCTGCAATGTA
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GCGCATCACAATCCACATGCTTATATCTTCAATCAAACTGCTTTCTATAA
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TGTATTTGTTGTCAGTGTGTTTGCTCAGTCACGAAAAGTCGACCGCAAAA
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TGTTGGTGTTGTAGGGGCAATTATTATGCCACATAACTTCTACCTTCATT
CTGCACTTGTAAAGTATGTGGTTGTTGCACCAGATCAAGGCCCACTATTG
AAAGGAATGTTTGTGCCGTATTGTAAAAATTGTGATTCTGCAGTTGTACA
GCAGGTCTGAGGAAGCTGGAATTGTTCTTTGCAACTCTGATCACTATAAT
GGCTGTCACCTTTGGATACGAGGATTCCAATCTGGGGAGGAGTGTTGATT
ACAATTTGTGACACTTTTGTTTTCCTTTTCCTTGATAAGTATGGAAGTAA
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TTGCAATTATTGGAAGTGACATGCAGTGCATGCAAAAACCCAAAGCTGGC
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GGCATATTTTGCAGGAGGATTTACTTTCTTGAACTACTTCAAGCAAGGAA
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GTCAGTTGCTATCTAATGGTGGATATTAAAAACCGTAACATGGCTTTTAG
CTGCAATTATCATTGGAGTTAATATGTACTTTGCAGCACTCGGTCTGCTA
CCATTTGCTGTTATACCACTATTAACATTCACAAATGATACCAACTTGAT
GAAAGATTTCACCAATGGAAGGGTTTCTTGAAATTAAGTTGGCCTCGATG
GAAGCGTGTCTTGCTTACCCGAAGTATCGCCATTGCACCTACATTAGCAT
TAGCCTTCTACGAAGGAATCAATAGACTTACTGGAATGAATGACTATCTT
AATATTTTACAAAGTTTACAGGGAACATATTCTGGACAGTTTGCTATGGA
GGGTATATTCTTGGGCTGTCAATTTGGACCAGCTGCAATGTACATTTGGG
CTATTGGTTTGTTGGCTGCAGGTCAATCATCAACCATGACTAAAACTGAT
GTCATAGAAGGAAACTTATTTTATGGTTACGATGGCTGTGTAGCGCATCA
CAATCCACATGCTTATATCTTCAATCAAACTGCTTTCTATAAAAAGACAT
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GCAGTCAAAGAAGCAAACATGTATTATTTCATAGAATCAGGCTGTTGGTG
TTGTAGGGGCAATTATTATGCCACATAACTTCTACCTTCATTCTGCACTT
GTAAAGTATGTGGTTGTTGCACCAGATCAAGGCCCACTATTGAAAGGAAT
GTTTGTGCCGTATTGTAAAAATTGTGATTCTGCAGTTGTACAGCAGGTCT
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CCTTTGGATACGAGGATTCCAATCTGGGGAGGAGTGTTGATTACAATTTG
TGACACTTTTGTTTTCCTTTTCCTTGATAAGTATGGAAGTAATAGGAACA
GCAATTGGCTTTCACCTTCTGTCAGATGGAAAATGGTTGAAATTGCAATT
ATTGGAAGTGACATGCAGTGCATGCAAAAACCCAAAGCTGGCTATGATCA
GTTCGAAGAAGAGGACAAAGATGAATCAATGGTTACCCAATAGGCATATT
TTGCAGGAGGATTTACTTTCTTGAACTACTTCAAGCAAGGAATAGAGAAC
AAGATACTGTATTTGCCAGCAACGCTGGTCATTATTGTATGGGTCAGTTG
CTATCTAATGGTGGATATTAAAAACCGTAACATGGCTTTTAGCTGCAATT
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TGTTATACCACTATTAACATTCACAAATGATACCAACTTGATGAAAGATT
TCACCAATGGAAGGGTTTCTTGAAATTAAGTTGGCCTCGATGGAAGCGTG
TCTTGCTTACCCGAAGTATCGCCATTGCACCTACATTAGCATTAGCCTTC
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ACAAAGTTTACAGGGAACATATTCTGGACAGTTTGCTATGGAGGGTATAT
TCTTGGGCTGTCAATTTGGACCAGCTGCAATGTACATTTGGGCTATTGGT
TTGTTGGCTGCAGGTCAATCATCAACCATGACTAAAACTGATGTCATAGA
AGGAAACTTATTTTATGGTTACGATGGCTGTGTAGCGCATCACAATCCAC
ATGCTTATATCTTCAATCAAACTGCTTTCTATAAAAAGACATATGGTGAC
GTGCAATTGCGTTGGGTATATCATTCATTATCAATGTATTTGTTGTCAGT
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GCAATTATTATGCCACATAACTTCTACCTTCATTCTGCACTTGTAAAGTA
TGTGGTTGTTGCACCAGATCAAGGCCCACTATTGAAAGGAATGTTTGTGC
CGTATTGTAAAAATTGTGATTCTGCAGTTGTACAGCAGGTCTGAGGAAGC
TGGAATTGTTCTTTGCAACTCTGATCACTATAATGGCTGTCACCTTTGGA
TACGAGGATTCCAATCTGGGGAGGAGTGTTGATTACAATTTGTGACACTT
TTGTTTTCCTTTTCCTTGATAAGTATGGAAGTAATAGGAACAGCAATTGG
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TGACATGCAGTGCATGCAAAAACCCAAAGCTGGCTATGATCAGTTCGAAG
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GGATTTACTTTCTTGAACTACTTCAAGCAAGGAATAGAGAACAAGATACT
GTATTTGCCAGCAACGCTGGTCATTATTGTATGGGTCAGTTGCTATCTAA
TGGTGGATATTAAAAACCGTAACATGGCTTTTAGCTGCAATTATCATTGG
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CACTATTAACATTCACAAATGATACCAACTTGATGAAAGATTTCACCAAT
GGAAGGGTTTCTTGAAATTAAGTTGGCCTCGATGGAAGCGTGTCTTGCTT
ACCCGAAGTATCGCCATTGCACCTACATTAGCATTAGCCTTCTACGAAGG
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TACAGGGAACATATTCTGGACAGTTTGCTATGGAGGGTATATTCTTGGGC
TGTCAATTTGGACCAGCTGCAATGTACATTTGGGCTATTGGTTTGTTGGC
TGCAGGTCAATCATCAACCATGACTAAAACTGATGTCATAGAAGGAAACT
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ATCTTCAATCAAACTGCTTTCTATAAAAAGACATATGGTGACGTGCAATT
GCGTTGGGTATATCATTCATTATCAATGTATTTGTTGTCAGTGTGTTTGC
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TTGCACCAGATCAAGGCCCACTATTGAAAGGAATGTTTGTGCCGTATTGT
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TTCTTTGCAACTCTGATCACTATAATGGCTGTCACCTTTGGATACGAGGA
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CTTTTCCTTGATAAGTATGGAAGTAATAGGAACAGCAATTGGCTTTCACC
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TTTCTTGAACTACTTCAAGCAAGGAATAGAGAACAAGATACTGTATTTGC
CAGCAACGCTGGTCATTATTGTATGGGTCAGTTGCTATCTAATGGTGGAT
ATTAAAAACCGTAACATGGCTTTTAGCTGCAATTATCATTGGAGTTAATA
TGTACTTTGCAGCACTCGGTCTGCTACCATTTGCTGTTATACCACTATTA
ACATTCACAAATGATACCAACTTGATGAAAGATTTCACCAATGGAAGGGT
TTCTTGAAATTAAGTTGGCCTCGATGGAAGCGTGTCTTGCTTACCCGAAG
TATCGCCATTGCACCTACATTAGCATTAGCCTTCTACGAAGGAATCAATA
GACTTACTGGAATGAATGACTATCTTAATATTTTACAAAGTTTACAGGGA
ACATATTCTGGACAGTTTGCTATGGAGGGTATATTCTTGGGCTGTCAATT
TGGACCAGCTGCAATGTACATTTGGGCTATTGGTTTGTTGGCTGCAGGTC
AATCATCAACCATGACTAAAACTGATGTCATAGAAGGAAACTTATTTTAT
GGTTACGATGGCTGTGTAGCGCATCACAATCCACATGCTTATATCTTCAA
TCAAACTGCTTTCTATAAAAAGACATATGGTGACGTGCAATTGCGTTGGG
TATATCATTCATTATCAATGTATTTGTTGTCAGTGTGTTTGCTCAGTCAC
GAAAAGTCGACCGCAAAATCAAGAGTGCAGTCAAAGAAGCAAACATGTAT
TATTTCATAGAATCAGGCTGTTGGTGTTGTAGGGGCAATTATTATGCCAC
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TGATTCTGCAGTTGTACAGCAGGTCTGAGGAAGCTGGAATTGTTCTTTGC
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TGGGGAGGAGTGTTGATTACAATTTGTGACACTTTTGTTTTCCTTTTCCT
TGATAAGTATGGAAGTAATAGGAACAGCAATTGGCTTTCACCTTCTGTCA
GATGGAAAATGGTTGAAATTGCAATTATTGGAAGTGACATGCAGTGCATG
CAAAAACCCAAAGCTGGCTATGATCAGTTCGAAGAAGAGGACAAAGATGA
ATCAATGGTTACCCAATAGGCATATTTTGCAGGAGGATTTACTTTCTTGA
ACTACTTCAAGCAAGGAATAGAGAACAAGATACTGTATTTGCCAGCAACG
CTGGTCATTATTGTATGGGTCAGTTGCTATCTAATGGTGGATATTAAAAA
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GCAGCACTCGGTCTGCTACCATTTGCTGTTATACCACTATTAACATTCAC
AAATGATACCAACTTGATGAAAGATTTCACCAATGGAAGGGTTTCTTGAA
ATTAAGTTGGCCTCGATGGAAGCGTGTCTTGCTTACCCGAAGTATCGCCA
TTGCACCTACATTAGCATTAGCCTTCTACGAAGGAATCAATAGACTTACT
GGAATGAATGACTATCTTAATATTTTACAAAGTTTACAGGGAACATATTC
TGGACAGTTTGCTATGGAGGGTATATTCTTGGGCTGTCAATTTGGACCAG
CTGCAATGTACATTTGGGCTATTGGTTTGTTGGCTGCAGGTCAATCATCA
ACCATGACTAAAACTGATGTCATAGAAGGAAACTTATTTTATGGTTACGA
TGGCTGTGTAGCGCATCACAATCCACATGCTTATATCTTCAATCAAACTG
CTTTCTATAAAAAGACATATGGTGACGTGCAATTGCGTTGGGTATATCAT
TCATTATCAATGTATTTGTTGTCAGTGTGTTTGCTCAGTCACGAAAAGTC
GACCGCAAAATCAAGAGTGCAGTCAAAGAAGCAAACATGTATTATTTCAT
AGAATCAGGCTGTTGGTGTTGTAGGGGCAATTATTATGCCACATAACTTC
TACCTTCATTCTGCACTTGTAAAGTATGTGGTTGTTGCACCAGATCAAGG
CCCACTATTGAAAGGAATGTTTGTGCCGTATTGTAAAAATTGTGATTCTG
CAGTTGTACAGCAGGTCTGAGGAAGCTGGAATTGTTCTTTGCAACTCTGA
TCACTATAATGGCTGTCACCTTTGGATACGAGGATTCCAATCTGGGGAGG
AGTGTTGATTACAATTTGTGACACTTTTGTTTTCCTTTTCCTTGATAAGT
ATGGAAGTAATAGGAACAGCAATTGGCTTTCACCTTCTGTCAGATGGAAA
ATGGTTGAAATTGCAATTATTGGAAGTGACATGCAGTGCATGCAAAAACC
CAAAGCTGGCTATGATCAGTTCGAAGAAGAGGACAAAGATGAATCAATGG
TTACCCAATAGGCATATTTTGCAGGAGGATTTACTTTCTTGAACTACTTC
AAGCAAGGAATAGAGAACAAGATACTGTATTTGCCAGCAACGCTGGTCAT
TATTGTATGGGTCAGTTGCTATCTAATGGTGGATATTAAAAACCGTAACA
TGGCTTTTAGCTGCAATTATCATTGGAGTTAATATGTACTTTGCAGCACT
CGGTCTGCTACCATTTGCTGTTATACCACTATTAACATTCACAAATGATA
CCAACTTGATGAAAGATTTCACCAATGGAAGGGTTTCTTGAAATTAAGTT
GGCCTCGATGGAAGCGTGTCTTGCTTACCCGAAGTATCGCCATTGCACCT
ACATTAGCATTAGCCTTCTACGAAGGAATCAATAGACTTACTGGAATGAA
TGACTATCTTAATATTTTACAAAGTTTACAGGGAACATATTCTGGACAGT
TTGCTATGGAGGGTATATTCTTGGGCTGTCAATTTGGACCAGCTGCAATG
TACATTTGGGCTATTGGTTTGTTGGCTGCAGGTCAATCATCAACCATGAC
TAAAACTGATGTCATAGAAGGAAACTTATTTTATGGTTACGATGGCTGTG
TAGCGCATCACAATCCACATGCTTATATCTTCAATCAAACTGCTTTCTAT
AAAAAGACATATGGTGACGTGCAATTGCGTTGGGTATATCATTCATTATC
AATGTATTTGTTGTCAGTGTGTTTGCTCAGTCACGAAAAGTCGACCGCAA
AATCAAGAGTGCAGTCAAAGAAGCAAACATGTATTATTTCATAGAATCAG
GCTGTTGGTGTTGTAGGGGCAATTATTATGCCACATAACTTCTACCTTCA
TTCTGCACTTGTAAAGTATGTGGTTGTTGCACCAGATCAAGGCCCACTAT
TGAAAGGAATGTTTGTGCCGTATTGTAAAAATTGTGATTCTGCAGTTGTA
CAGCAGGTCTGAGGAAGCTGGAATTGTTCTTTGCAACTCTGATCACTATA
ATGGCTGTCACCTTTGGATACGAGGATTCCAATCTGGGGAGGAGTGTTGA
TTACAATTTGTGACACTTTTGTTTTCCTTTTCCTTGATAAGTATGGAAGT
AATAGGAACAGCAATTGGCTTTCACCTTCTGTCAGATGGAAAATGGTTGA
AATTGCAATTATTGGAAGTGACATGCAGTGCATGCAAAAACCCAAAGCTG
GCTATGATCAGTTCGAAGAAGAGGACAAAGATGAATCAATGGTTACCCAA
TAGGCATATTTTGCAGGAGGATTTACTTTCTTGAACTACTTCAAGCAAGG
AATAGAGAACAAGATACTGTATTTGCCAGCAACGCTGGTCATTATTGTAT
GGGTCAGTTGCTATCTAATGGTGGATATTAAAAACCGTAACATGGCTTTT
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TACCATTTGCTGTTATACCACTATTAACATTCACAAATGATACCAACTTG
ATGAAAGATTTCACCAATGGAAGGGTTTCTTGAAATTAAGTTGGCCTCGA
TGGAAGCGTGTCTTGCTTACCCGAAGTATCGCCATTGCACCTACATTAGC
ATTAGCCTTCTACGAAGGAATCAATAGACTTACTGGAATGAATGACTATC
TTAATATTTTACAAAGTTTACAGGGAACATATTCTGGACAGTTTGCTATG
GAGGGTATATTCTTGGGCTGTCAATTTGGACCAGCTGCAATGTACATTTG
GGCTATTGGTTTGTTGGCTGCAGGTCAATCATCAACCATGACTAAAACTG
ATGTCATAGAAGGAAACTTATTTTATGGTTACGATGGCTGTGTAGCGCAT
CACAATCCACATGCTTATATCTTCAATCAAACTGCTTTCTATAAAAAGAC
ATATGGTGACGTGCAATTGCGTTGGGTATATCATTCATTATCAATGTATT
TGTTGTCAGTGTGTTTGCTCAGTCACGAAAAGTCGACCGCAAAATCAAGA
GTGCAGTCAAAGAAGCAAACATGTATTATTTCATAGAATCAGGCTGTTGG
TGTTGTAGGGGCAATTATTATGCCACATAACTTCTACCTTCATTCTGCAC
TTGTAAAGTATGTGGTTGTTGCACCAGATCAAGGCCCACTATTGAAAGGA
ATGTTTGTGCCGTATTGTAAAAATTGTGATTCTGCAGTTGTACAGCAGGT
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TGTGACACTTTTGTTTTCCTTTTCCTTGATAAGTATGGAAGTAATAGGAA
CAGCAATTGGCTTTCACCTTCTGTCAGATGGAAAATGGTTGAAATTGCAA
TTATTGGAAGTGACATGCAGTGCATGCAAAAACCCAAAGCTGGCTATGAT
CAGTTCGAAGAAGAGGACAAAGATGAATCAATGGTTACCCAATAGGCATA
TTTTGCAGGAGGATTTACTTTCTTGAACTACTTCAAGCAAGGAATAGAGA
ACAAGATACTGTATTTGCCAGCAACGCTGGTCATTATTGTATGGGTCAGT
TGCTATCTAATGGTGGATATTAAAAACCGTAACATGGCTTTTAGCTGCAA
TTATCATTGGAGTTAATATGTACTTTGCAGCACTCGGTCTGCTACCATTT
GCTGTTATACCACTATTAACATTCACAAATGATACCAACTTGATGAAAGA
TTTCACCAATGGAAGGGTTTCTTGAAATTAAGTTGGCCTCGATGGAAGCG
TGTCTTGCTTACCCGAAGTATCGCCATTGCACCTACATTAGCATTAGCCT
TCTACGAAGGAATCAATAGACTTACTGGAATGAATGACTATCTTAATATT
TTACAAAGTTTACAGGGAACATATTCTGGACAGTTTGCTATGGAGGGTAT
ATTCTTGGGCTGTCAATTTGGACCAGCTGCAATGTACATTTGGGCTATTG
GTTTGTTGGCTGCAGGTCAATCATCAACCATGACTAAAACTGATGTCATA
GAAGGAAACTTATTTTATGGTTACGATGGCTGTGTAGCGCATCACAATCC
ACATGCTTATATCTTCAATCAAACTGCTTTCTATAAAAAGACATATGGTG
ACGTGCAATTGCGTTGGGTATATCATTCATTATCAATGTATTTGTTGTCA
GTGTGTTTGCTCAGTCACGAAAAGTCGACCGCAAAATCAAGAGTGCAGTC
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GGGCAATTATTATGCCACATAACTTCTACCTTCATTCTGCACTTGTAAAG
TATGTGGTTGTTGCACCAGATCAAGGCCCACTATTGAAAGGAATGTTTGT
GCCGTATTGTAAAAATTGTGATTCTGCAGTTGTACAGCAGGTCTGAGGAA
GCTGGAATTGTTCTTTGCAACTCTGATCACTATAATGGCTGTCACCTTTG
GATACGAGGATTCCAATCTGGGGAGGAGTGTTGATTACAATTTGTGACAC
TTTTGTTTTCCTTTTCCTTGATAAGTATGGAAGTAATAGGAACAGCAATT
GGCTTTCACCTTCTGTCAGATGGAAAATGGTTGAAATTGCAATTATTGGA
AGTGACATGCAGTGCATGCAAAAACCCAAAGCTGGCTATGATCAGTTCGA
AGAAGAGGACAAAGATGAATCAATGGTTACCCAATAGGCATATTTTGCAG
GAGGATTTACTTTCTTGAACTACTTCAAGCAAGGAATAGAGAACAAGATA
CTGTATTTGCCAGCAACGCTGGTCATTATTGTATGGGTCAGTTGCTATCT
AATGGTGGATATTAAAAACCGTAACATGGCTTTTAGCTGCAATTATCATT
GGAGTTAATATGTACTTTGCAGCACTCGGTCTGCTACCATTTGCTGTTAT
ACCACTATTAACATTCACAAATGATACCAACTTGATGAAAGATTTCACCA
ATGGAAGGGTTTCTTGAAATTAAGTTGGCCTCGATGGAAGCGTGTCTTGC
TTACCCGAAGTATCGCCATTGCACCTACATTAGCATTAGCCTTCTACGAA
GGAATCAATAGACTTACTGGAATGAATGACTATCTTAATATTTTACAAAG
TTTACAGGGAACATATTCTGGACAGTTTGCTATGGAGGGTATATTCTTGG
GCTGTCAATTTGGACCAGCTGCAATGTACATTTGGGCTATTGGTTTGTTG
GCTGCAGGTCAATCATCAACCATGACTAAAACTGATGTCATAGAAGGAAA
CTTATTTTATGGTTACGATGGCTGTGTAGCGCATCACAATCCACATGCTT
ATATCTTCAATCAAACTGCTTTCTATAAAAAGACATATGGTGACGTGCAA
TTGCGTTGGGTATATCATTCATTATCAATGTATTTGTTGTCAGTGTGTTT
GCTCAGTCACGAAAAGTCGACCGCAAAATCAAGAGTGCAGTCAAAGAAGC
AAACATGTATTATTTCATAGAATCAGGCTGTTGGTGTTGTAGGGGCAATT
ATTATGCCACATAACTTCTACCTTCATTCTGCACTTGTAAAGTATGTGGT
TGTTGCACCAGATCAAGGCCCACTATTGAAAGGAATGTTTGTGCCGTATT
GTAAAAATTGTGATTCTGCAGTTGTACAGCAGGTCTGAGGAAGCTGGAAT
TGTTCTTTGCAACTCTGATCACTATAATGGCTGTCACCTTTGGATACGAG
GATTCCAATCTGGGGAGGAGTGTTGATTACAATTTGTGACACTTTTGTTT
TCCTTTTCCTTGATAAGTATGGAAGTAATAGGAACAGCAATTGGCTTTCA
CCTTCTGTCAGATGGAAAATGGTTGAAATTGCAATTATTGGAAGTGACAT
GCAGTGCATGCAAAAACCCAAAGCTGGCTATGATCAGTTCGAAGAAGAGG
ACAAAGATGAATCAATGGTTACCCAATAGGCATATTTTGCAGGAGGATTT
ACTTTCTTGAACTACTTCAAGCAAGGAATAGAGAACAAGATACTGTATTT
GCCAGCAACGCTGGTCATTATTGTATGGGTCAGTTGCTATCTAATGGTGG
ATATTAAAAACCGTAACATGGCTTTTAGCTGCAATTATCATTGGAGTTAA
TATGTACTTTGCAGCACTCGGTCTGCTACCATTTGCTGTTATACCACTAT
TAACATTCACAAATGATACCAACTTGATGAAAGATTTCACCAATGGAAGG
GTTTCTTGAAATTAAGTTGGCCTCGATGGAAGCGTGTCTTGCTTACCCGA
AGTATCGCCATTGCACCTACATTAGCATTAGCCTTCTACGAAGGAATCAA
TAGACTTACTGGAATGAATGACTATCTTAATATTTTACAAAGTTTACAGG
GAACATATTCTGGACAGTTTGCTATGGAGGGTATATTCTTGGGCTGTCAA
TTTGGACCAGCTGCAATGTACATTTGGGCTATTGGTTTGTTGGCTGCAGG
TCAATCATCAACCATGACTAAAACTGATGTCATAGAAGGAAACTTATTTT
ATGGTTACGATGGCTGTGTAGCGCATCACAATCCACATGCTTATATCTTC
AATCAAACTGCTTTCTATAAAAAGACATATGGTGACGTGCAATTGCGTTG
GGTATATCATTCATTATCAATGTATTTGTTGTCAGTGTGTTTGCTCAGTC
ACGAAAAGTCGACCGCAAAATCAAGAGTGCAGTCAAAGAAGCAAACATGT
ATTATTTCATAGAATCAGGCTGTTGGTGTTGTAGGGGCAATTATTATGCC
ACATAACTTCTACCTTCATTCTGCACTTGTAAAGTATGTGGTTGTTGCAC
CAGATCAAGGCCCACTATTGAAAGGAATGTTTGTGCCGTATTGTAAAAAT
TGTGATTCTGCAGTTGTACAGCAGGTCTGAGGAAGCTGGAATTGTTCTTT
GCAACTCTGATCACTATAATGGCTGTCACCTTTGGATACGAGGATTCCAA
TCTGGGGAGGAGTGTTGATTACAATTTGTGACACTTTTGTTTTCCTTTTC
CTTGATAAGTATGGAAGTAATAGGAACAGCAATTGGCTTTCACCTTCTGT
CAGATGGAAAATGGTTGAAATTGCAATTATTGGAAGTGACATGCAGTGCA
TGCAAAAACCCAAAGCTGGCTATGATCAGTTCGAAGAAGAGGACAAAGAT
GAATCAATGGTTACCCAATAGGCATATTTTGCAGGAGGATTTACTTTCTT
GAACTACTTCAAGCAAGGAATAGAGAACAAGATACTGTATTTGCCAGCAA
CGCTGGTCATTATTGTATGGGTCAGTTGCTATCTAATGGTGGATATTAAA
AACCGTAACATGGCTTTTAGCTGCAATTATCATTGGAGTTAATATGTACT
TTGCAGCACTCGGTCTGCTACCATTTGCTGTTATACCACTATTAACATTC
ACAAATGATACCAACTTGATGAAAGATTTCACCAATGGAAGGGTTTCTTG
AAATTAAGTTGGCCTCGATGGAAGCGTGTCTTGCTTACCCGAAGTATCGC
CATTGCACCTACATTAGCATTAGCCTTCTACGAAGGAATCAATAGACTTA
CTGGAATGAATGACTATCTTAATATTTTACAAAGTTTACAGGGAACATAT
TCTGGACAGTTTGCTATGGAGGGTATATTCTTGGGCTGTCAATTTGGACC
AGCTGCAATGTACATTTGGGCTATTGGTTTGTTGGCTGCAGGTCAATCAT
CAACCATGACTAAAACTGATGTCATAGAAGGAAACTTATTTTATGGTTAC
GATGGCTGTGTAGCGCATCACAATCCACATGCTTATATCTTCAATCAAAC
TGCTTTCTATAAAAAGACATATGGTGACGTGCAATTGCGTTGGGTATATC
ATTCATTATCAATGTATTTGTTGTCAGTGTGTTTGCTCAGTCACGAAAAG
TCGACCGCAAAATCAAGAGTGCAGTCAAAGAAGCAAACATGTATTATTTC
ATAGAATCAGGCTGTTGGTGTTGTAGGGGCAATTATTATGCCACATAACT
TCTACCTTCATTCTGCACTTGTAAAGTATGTGGTTGTTGCACCAGATCAA
GGCCCACTATTGAAAGGAATGTTTGTGCCGTATTGTAAAAATTGTGATTC
TGCAGTTGTACAGCAGGTCTGAGGAAGCTGGAATTGTTCTTTGCAACTCT
GATCACTATAATGGCTGTCACCTTTGGATACGAGGATTCCAATCTGGGGA
GGAGTGTTGATTACAATTTGTGACACTTTTGTTTTCCTTTTCCTTGATAA
GTATGGAAGTAATAGGAACAGCAATTGGCTTTCACCTTCTGTCAGATGGA
AAATGGTTGAAATTGCAATTATTGGAAGTGACATGCAGTGCATGCAAAAA
CCCAAAGCTGGCTATGATCAGTTCGAAGAAGAGGACAAAGATGAATCAAT
GGTTACCCAATAGGCATATTTTGCAGGAGGATTTACTTTCTTGAACTACT
TCAAGCAAGGAATAGAGAACAAGATACTGTATTTGCCAGCAACGCTGGTC
ATTATTGTATGGGTCAGTTGCTATCTAATGGTGGATATTAAAAACCGTAA
CATGGCTTTTAGCTGCAATTATCATTGGAGTTAATATGTACTTTGCAGCA
CTCGGTCTGCTACCATTTGCTGTTATACCACTATTAACATTCACAAATGA
TACCAACTTGATGAAAGATTTCACCAATGGAAGGGTTTCTTGAAATTAAG
TTGGCCTCGATGGAAGCGTGTCTTGCTTACCCGAAGTATCGCCATTGCAC
CTACATTAGCATTAGCCTTCTACGAAGGAATCAATAGACTTACTGGAATG
AATGACTATCTTAATATTTTACAAAGTTTACAGGGAACATATTCTGGACA
GTTTGCTATGGAGGGTATATTCTTGGGCTGTCAATTTGGACCAGCTGCAA
TGTACATTTGGGCTATTGGTTTGTTGGCTGCAGGTCAATCATCAACCATG
ACTAAAACTGATGTCATAGAAGGAAACTTATTTTATGGTTACGATGGCTG
TGTAGCGCATCACAATCCACATGCTTATATCTTCAATCAAACTGCTTTCT
ATAAAAAGACATATGGTGACGTGCAATTGCGTTGGGTATATCATTCATTA
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AAAATCAAGAGTGCAGTCAAAGAAGCAAACATGTATTATTTCATAGAATC
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TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:51552..51701TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:51552..51701Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:51162..51235TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:51162..51235Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:50687..50762TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:50687..50762Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:50289..50366TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:50289..50366Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:49640..49681TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:49640..49681Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:49318..49392TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:49318..49392Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:46838..46874TCONS_00036192-exon-sc0001423-1491911889:46838..46874Clytia hemisphaericaexon
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00036192-proteinTCONS_00036192-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001423supercontigsc0001423:46838..61397 -
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
8.42827 9.31562 13.3588 11.1112 29.8322 24.2091 21.3801 22.1791 25.4632 34.7755 36.8711 29.5368 28.0564 28.9189 26.7517 40.2329 22.2732 22.8885 22.6511 25.1518 23.3906 23.4331 16.3905 20.5304 16.6338 16.5481 16.1024 16.5467 54.0421 33.9318
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR001046NRAMP_fam
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0016020membrane
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0006810transport
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0005215transporter activity
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006810 transport
cellular_component GO:0016020 membrane
molecular_function GO:0005215 transporter activity
Blast
BLAST of TCONS_00036192 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NRAM2 (Natural resistance-associated macrophage protein 2 OS=Homo sapiens GN=SLC11A2 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 455.292 bits (1170), Expect = 4.385e-154
Identity = 242/370 (65.41%), Postives = 294/370 (79.46%), Query Frame = 2
Query:  143 GTVTGLHLAEVCHEKYPKIPRLIVWVMVEIAIIGSDMQEVIGTAIGFHLLSDGKIPIWGGVLITICDTFVFLFLDKYGLRKLELFFATLITIMAVTFGYEYVVVAPDQGPLLKGMFVPYCKNCDSXXXXXXXXXXXXIIMPHNFYLHSALVKSRKVDRKIKSAVKEANMYYFIESAIALGXXXXXXXXXXXXXAQAFYKKTYGDVYDGCVAHHNPHAYIFNQTKTDVIEGNLFYGGIFLGCQFGPAAMYIWAIGLLAAGQSSTMTGTYSGQFAMEGFLKLSWPRWKRVLLTRSIAIAPTLALAFYEGINRLTGMNDYLNILQSLQLPFAVIPLLTFTNDTNLMKDFTNGRILKTVTWLLAAIIIGVNMYF 1252
            G VTGLHLAEVCH +YPK+PR+I+W+MVE+AIIGSDMQEVIG+AI  +LLS G+IP+WGGVLITI DTFVFLFLDKYGLRKLE FF  LITIMA+TFGYEYV V P Q  +LKGMFVP C  C +  ++QAVG+VGA+IMPHN YLHSALVKSR+V+R  K  V+EAN Y+FIES IAL +SFIINVFVVSVFA+AF+ KT   V + C    +PHA +F +  +  +  +++ GG+ LGC FGPAA+YIWA+G+LAAGQSSTMTGTYSGQF MEGFL L W R+ RV+LTRSIAI PTL +A ++ +  LTGMND+LN+LQSLQLPFA+IP+LTFT+   +M DF NG   +    +L  II  +NMYF
Sbjct:  126 GVVTGLHLAEVCHRQYPKVPRVILWLMVELAIIGSDMQEVIGSAIAINLLSVGRIPLWGGVLITIADTFVFLFLDKYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVTVKPSQSQVLKGMFVPSCSGCRTPQIEQAVGIVGAVIMPHNMYLHSALVKSRQVNRNNKQEVREANKYFFIESCIALFVSFIINVFVVSVFAEAFFGKTNEQVVEVCTNTSSPHAGLFPKDNS-TLAVDIYKGGVVLGCYFGPAALYIWAVGILAAGQSSTMTGTYSGQFVMEGFLNLKWSRFARVVLTRSIAIIPTLLVAVFQDVEHLTGMNDFLNVLQSLQLPFALIPILTFTSLRPVMSDFANGLGWRIAGGILVLIICSINMYF 494          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00036192 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
NRAM24.385e-15465.41Natural resistance-associated macrophage protein 2... [more]
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