TCONS_00029012 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00029012
Unique Name	TCONS_00029012
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1432

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000720:129580..146780+
coding sequence from alignment at sc0000720:129580..146780+

transcript sequence

>TCONS_00029012 ID=TCONS_00029012|Name=TCONS_00029012|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1432bp
GTAAAATTTACACAGCATAACATAACATGTGAAAGAGAGGGTAAAGAGCC
AGGCAAATCTCTTAATTTTATTGCTTCGTTGTGAACAGTGAAGAGTTGGA
AAAAGAGGAAGAACAAACAAGTCAGAGCTGGCGAAGAAAGTTTAAAAGTG
AGACACTAACAGACACACATAAAATGGCATCAACAGAAACCATGCACTAC
GAGAATAACCGTCCAGAACACAAAGTCTGTCCGAAGTATGGTTTACACAG
TCACATGGTCAAAAACGATTACCGCGAACCGTTCATTGATAAAGGTTACC
GTTGCGAGAACATGAAAGCATGGGACTGCTTCAAGACCATGTTCGTTTTT
AAATGTAACGAAACGTTCAACATCTGGACACATTTCTTACCCTTTGTTAT
ATTCCTGATTAAGTTTGTTTACATCTTCAATACTGAGCTGTCCATCCATG
ATTCCTTTTATTGGCCACTAGCTGCTAATGCCATGGGTATTATGGGCTTT
TGTTTGACAAGCGCATTAGCTCACATGTTCTGCGCTTTATCACTTCAAGC
TCGACACACATGTTTTTACACCGATTACGCAGCTATTAGTATTTATTCAG
TTACCGCTTGGGAAGCGACTTTCTTTTACGGTCGTTTAATATCTGACGGT
GGATTCCCGTATTTTGGAAACACTAGAGCCTCAATGTTGATTTGTTTAAT
CTTGTCTCTTATGAGCACGATACAATGTTGCGCAACACGCCACGTTAAAA
GTGCGCTACGTCACGCACTGCGTGTTGGTTCGTTTGTTATACCATGGATT
TTCGCGGCCGGTCCTTACATGCATCGAATGTTGACATGTGACTCGGAGCT
CGATTGCCAGTACGGAGCCTTCAGTAAGTTTATCAACCACGCCTTATTAT
ACGTGACCGGTGCTATATTCATGGCAACAAAATATCCAGAGCGCTTGTTT
CCTGGTAAGTTTGATGCAATCGGACAGAGTCACCAGATTATGCACCTGTG
TACGGCTTTTGGAGCCGACATTCAATTCGACTCCATCAAAACGGATATGT
TAAGTCGTGAGGCTGCGTTACGTCAACAGCCGTTGAACGACGGTTTTACG
TCGGATTGCGTCTTGTTTACGATAGTTATGGCCGTGAGTAACATGGCGGT
GGCATTTGTGTTCAATAATTTTGTTGACATGATTAAGGaacaaaaagaca
caaaaactGAATAACACCAACAAAAGAAACTAGGATGTCCGTGGTTTTAA
TAATATGAAGAATActgaaaatggtcatttttgacACGTAAAATTCttcg
aattttgatttttaaatcaatcaaaaagattttaatcacgattttcatta
ttatttaaATTATTTAAGATATGTAAATTATCTCtagaaaatgaggaaaa
aaataattctaaaaatcgAGAATCGATTCTCA

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00029012-protein

>TCONS_00029012-protein ID=TCONS_00029012-protein|Name=TCONS_00029012-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=346bp
MASTETMHYENNRPEHKVCPKYGLHSHMVKNDYREPFIDKGYRCENMKAW
DCFKTMFVFKCNETFNIWTHFLPFVIFLIKFVYIFNTELSIHDSFYWPLA
ANAMGIMGFCLTSALAHMFCALSLQARHTCFYTDYAAISIYSVTAWEATF
FYGRLISDGGFPYFGNTRASMLICLILSLMSTIQCCATRHVKSALRHALR
VGSFVIPWIFAAGPYMHRMLTCDSELDCQYGAFSKFINHALLYVTGAIFM
ATKYPERLFPGKFDAIGQSHQIMHLCTAFGADIQFDSIKTDMLSREAALR
QQPLNDGFTSDCVLFTIVMAVSNMAVAFVFNNFVDMIKEQKDTKTE

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000720:129580..146780+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00029012 ID=TCONS_00029012|Name=TCONS_00029012|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17201bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000720:129580..146780+ (Clytia hemisphaerica)
GTAAAATTTACACAGCATAACATAACATGTGAAAGAGAGGGTAAAGAGCC
AGGCAAATCTCTTAATTTTATTGTGAGTAGAATTAAAAGCCGACAGCAGG
TGCCggttataaaaatatataaaaaaagtcaatcaaaatcaaattatatt
atattcaaattcaaaaatcttttcaatacaagtttgaaaaattatttttt
gaaaatctttgaagaaACTAGAAAATCATTTAACACTTCATATATTCTAA
AGGCTTCGTTGTGAACAGTGAAGAGTTGGAAAAAGAGGAAGAACAAACAA
GTCAGAGCTGGCGAAGAAAGTTTAAAAGTGAGTagaagttttgaaattta
tattttacaaaatatatACCGAATGTgaggaaattttaattttaaaattg
aaaactaGGAAAGCTTGGGAAACGGGCACTCCAGATAAGATTAGTGTGAA
TGCCGGTCATGAGTCGATGATAAGGATCGCTTTGTTTTCAAGACTTTCTT
TTGGTGTCCCAAAAAACTCAGCTTGAGGAGGGAAGCTTTAAGCTAAGCCA
TCAACATCATGAGTTGCGGAATTTCTATGGCAAATCCAGTACTATAAAAT
TGGTGCCGGGTATgtgggtgtcgggtatgtgctaaagcgaccgaggatgg
cattcatagcttcaagCCTAAGGATAGTTGGACAAATAGCTCACAATTTT
GCGCACTTGTTTGTCACTCTTCCTGTACCGGTTAAATGGTTAACCGGTTA
AATGGTAGCCCGGGTATttagtttgtctttttcttatccctagaGAGTTG
ATGAATctaggaaattcccttttcttataccacaagtagttattaagcgc
tcgcCGTAGGTTAAACAAACGTGTACACTAGTAAAGTAACATATGAGAGC
AGTATCCTTAGCTAAGGATAAGGATATCTAATTAGATACACGGTTTTAAA
AGAAAACCAATAAGTTATGGCTCTGACTGGGCTACTCTGAATTTTAGGAG
TTTTTCAGACTTAAATGTTATTGTCATATTAGTTAAAAATGGAAatctgt
acttctcagtaaaggctgttcttaatttgttcttaggttttgaccaaatt
tcagcattgtatttttataaaattgttcttataaaaaagcgcgTAAGGCA
AGGCACGGGTGTCATTCTAAGTAGACGCCAAAACAAAATGGCCTTTACTT
TTGAAACTataactgtaaatcactccctttgACACATCTGTTAGCATTTG
AAGactgaattttgtctcagatgagaagTCAAAAATTGTAGGGTTAatac
cattccttttgaaagcaaattcaactctatggtTNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNaaatggggggggggtccg
aactatGCTCTTTGatatttaagcctaaaaatgttcttaacatgttctta
ttttcgccattttttgagtatttttgtctattttcctaagaaattgggtg
cttTAGAgtccttaacttgttcttaacatttaggCCATCGAAGTTTTATG
TTCTcgtacagtttgttcttataaaaaacgtgaaaTAGCTCTCACTTTCT
AGCAAGGATGTTATAATAAGCACATAAGACGATTACTGTTATGATTTGTT
TCGACAAGAAAGGAAAGTctcatatttaaaaaaacacaCAAGTTTAAacg
ttttatataagaacaaattatataagagcatgaggcttcgatggccaaaa
tgctaagaacaagtttagaacattttaaggctttgtggacacACAAACAt
cctttttcttaggaaaatggtcaagaaTGCTCACTACatggttaaaataa
gaacaagttaagaacatttcttggcttaaaactcaaaaagttaagaatat
ccaaaggcttcaaaagatttcggatgtttttataaaaaagacgtgtatct
CATTTCGAAGATATATCATATCAAAAGATAACAGCGCAAAAAGAAAAGTC
AAGATGATTTATTTGGTTGGGTTGAAAATGGAAGCAGTGGCGTCACTAGG
GTGTCGCTCCTGAAGACTGAGCGACACccttttttgacaaacaaaagttt
ttgaaagacaagaaataaaaagcgCTAGTAAGAGGACGACGCGCGGCGAC
TAGCGCTCGTACGGACACGCGCGTCGTGCGGCTATTTTAGAAAATCACGT
CGCCTTCAATGGGCGGTTTTAAATTGGCGGCGATGTTTTAAATTGGCGGa
gatatttagattttaataaatttacggCACCGAATCAAAATTCAGTATTG
CGATTCCTTAGCTTAGTAGAGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNATTTCCCTAggacaaaaggaatttcccaaaGGGCAATATCA
TTCTTTTAGAAACCACAAGCTATTATTACGAACGAGACACTCACTCTTTG
AATATTTTCGATCTTATGTGTGGCTCTGCCACCCATTCAACAAATGATAA
ACTCGTCTAATGGTGAGTTGCCGGTTAACCACGTGCAACGTGGCCTGTGT
TTGGGGTTCACAGGTATTGGGATCTTCAGCCCATAACGTCCcccggttgt
ttggaagtatttGGGCGTTATATTTTAACACCGccctaatgaaattaaca
accgCCCTCTAACCgcccatttgaaaattgaaatttgcgacACCCCTTGA
AAATCCTGGCTACGCCACTGGGAAGTAAAGTATTTTTCAATGTCTTAGTC
TGTTGGATCGTTTGCTTTAAACGATCGTGTATTGAACGGTGAAAACTTGA
GAAATGGATAGATAATCATCTATCTATATTTTGGGTGCGTCTATTTTAAT
ATCGGTTTGATGCGAAGGCTATCTTCTCTTTTGCAAAGCGACCTCAATCT
CTTCGAACTCTTTTGGTTTTATGAGATATTAGTTAGTAATACAGTCGTTT
TCGCGATGGcactttaaaaattcaaatttagctTTGGCAAATGTGTGACG
ATCTGACCTTGTCTGGGTTTtattgtttatgtttatgattggcttttgac
tttgaaaagctcatttaatattcaccCCAAAcctggatgaaaaagatcaa
agaagTGCCAATCTGAGCAGATTCCCTCACAGAGCCATGACCTttataga
ctagcaaactagtctgttaatcaATCATGTCAGAGAACATAAATCATGTC
AGGGTAAATAAAAGGCGGCGgtcgtttgctagaataggagctcgGCAGCA
GAACAAGCAAAAgctggtgagaggctgctgattaataGCTtagctttcag
cccttgccaccgacaaaatttcttcctacgctgaCCTAACTCCtacactt
ttcccgcgtgatatcATTCCAGCCAGACTTTAGGGTGAATACGGAGTAAT
AATACGTGTAATGCACGGAGTATCAGAAGCTGCTCAGAGATTAGAGTTTA
AGTCAAAGCGCTGTCATGAATAATCAAGATTTTATTAAGTTATGAACTTT
GACTTCTAAaacgtttatttttttttagttttggtgatgaaaaatctcaa
agaaaAACCTGTTTGAGGTCGTTAGGATGgaagccgggggggggggggat
ttgggaaaaaaggggggatatggggggggggaagggggggggggggggta
cttaggaaAAAATGGATgatatgtgcggacggtaagggtcggttttttaa
gctttcaaagtctctcgggtcggaaaaatcagaaagttttaaattagtct
ctgtaagggtcggaaaattcacgatttttaggattttttttgatttccag
agaaaaaattgtaattaagtctctctaagggtatgacttttttcaaaaat
cgaaaaaaaaattcaaaaagtctctcctTTAAGGGtaaccttttcagcaa
aaatcagtctctccaaggttcggttttcggaggtcccgtccgcacataag
tacccctcattcgccaaccctagtaacCCTGGAAGAAAGAACTCTTAAAA
GATGGAGTTAGAGCTCCCAGTAAAAATTaaatacagttgagtctccatac
GGGGAGcaaaaatttttcgagttaaggaaattcaCTTATCTAGTTATTAA
GAAAGGCTTAAAAGGCATTGTCAACTAAAGGGACCATAAAAACCTGTTCA
agttaaaagatattcaagttatagaggttcggtTTAAAGAGACTACGTCA
ATCATCAATGGCGTGTTATAATTTATGATATCAGAGTAATTAGAAACTAC
TTCCTCTAGTGGAGACAATTAGATAAGCCATTACTTttatggaaaaaaga
aaaaaaatcaacggAAAACCAAAAACGTTATGCTGAACTGTAAGACAAAT
GCACAGTACTGCAACAATTTGAAAAGTAGCAATGCTGTCATTTATTGATT
TAAAACAAGATTTGAaggtcattttgaaaattttttttttggctaTTTGG
AGGGAATCTAACCAATTTGATAATGTAGTAAggtgtcttttttattttta
aaaacaacatAGGGTCATTTTAAGAATAAAACTTTCACTGTTTGGGCGGA
TATTAATCAAATGACAGGCCCGGCGGGGGAAGCGGGGagctccccacttt
tgagcaaatgaggttttctcaaattcctaccgaatttatctcattttgag
ccttcagcctccccctGTTACGGTTGTTCCACCGGGCCCGAATAAAGTAA
ATGTTACAAGATAGGATTTTGATAATGTAGAACTTATGAAACTTCTAACT
TCTATTAATTTTCCAGGTGAGACACTAACAGACACACATAAAATGGCATC
AACAGAAACCATGCACTACGAGAATAACCGTCCAGAACACAAAGTCTGTC
CGAAGTATGGTTTACACAGTCACATGGTCAAAAACGATTACCGCGAACCG
TTCATTGATAAAGGTTACCGTTGCGAGAACATGAAAGCATGGGACTGCTT
CAAGACCATGTTCGTTTTTAAATGTAACGAAACGTTCAACATCTGGACAC
ATTTCTTACCCTTTGTTATATTCCTGATTAAGTTTGTTTACATCTTCAAT
ACTGAGCTGTCCATCCATGATTCCTTTTATTGGCCACTAGCTGCTAATGC
CATGGGTATTATGGGCTTTTGTTTGACAAGCGCATTAGCTCACATGTTCT
GCGCTTTATCACTTCAAGCTCGACACACATGTTTTTACACCGATTACGCA
GCTATTAGTATTTATTCAGTTACCGCTTGGGAAGCGACTTTCTTTTACGG
TCGTTTAATATCTGACGGTGGATTCCCGTATTTTGGAAACACTAGAGCCT
CAATGTTGATTTGTTTAATCTTGTCTCTTATGAGCACGATACAATGTTGC
GCAACACGCCACGTTAAAAGTGCGCTACGTCACGCACTGCGTGTTGGTTC
GTTTGTTATACCATGGATTTTCGCGGCCGGTCCTTACATGCATCGAATGT
TGACATGTGACTCGGAGCTCGATTGCCAGTACGGAGCCTTCAGTAAGTTT
ATCAACCACGCCTTATTATACGTGACCGGTGCTATATTCATGGCAACAAA
ATATCCAGAGCGCTTGTTTCCTGGTAAGTTTGATGCAATCGGACAGAGTC
ACCAGATTATGCACCTGTGTACGGCTTTTGGAGCCGACATTCAATTCGAC
TCCATCAAAACGGATATGTTAAGTCGTGAGGCTGCGTTACGTCAACAGCC
GTTGAACGACGGTTTTACGTCGGATTGCGTCTTGTTTACGATAGTTATGG
CCGTGAGTAACATGGCGGTGGCATTTGTGTTCAATAATTTTGTTGACATG
ATTAAGGaacaaaaagacacaaaaactGAATAACACCAACAAAAGAAACT
AGGATGTCCGTGGTTTTAATAATATGAAGAATActgaaaatggtcatttt
tgacACGTAAAATTCttcgaattttgatttttaaatcaatcaaaaagatt
ttaatcacgattttcattattatttaaATTATTTAAGATATGTAAATTAT
CTCtagaaaatgaggaaaaaaataattctaaaaatcgAGAATCGATTCTC
A

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000720:129580..146780+

>TCONS_00029012 ID=TCONS_00029012|Name=TCONS_00029012|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1041bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000720:129580..146780+ (Clytia hemisphaerica)
ATGGCATCAACAGAAACCATGCACTACGAGAATAACCGTCCAGAACACAA
AGTCTGTCCGAAGTATGGTTTACACAGTCACATGGTCAAAAACGATTACC
GCGAACCGTTCATTGATAAAGGTTACCGTTGCGAGAACATGAAAGCATGG
GACTGCTTCAAGACCATGTTCGTTTTTAAATGTAACGAAACGTTCAACAT
CTGGACACATTTCTTACCCTTTGTTATATTCCTGATTAAGTTTGTTTACA
TCTTCAATACTGAGCTGTCCATCCATGATTCCTTTTATTGGCCACTAGCT
GCTAATGCCATGGGTATTATGGGCTTTTGTTTGACAAGCGCATTAGCTCA
CATGTTCTGCGCTTTATCACTTCAAGCTCGACACACATGTTTTTACACCG
ATTACGCAGCTATTAGTATTTATTCAGTTACCGCTTGGGAAGCGACTTTC
TTTTACGGTCGTTTAATATCTGACGGTGGATTCCCGTATTTTGGAAACAC
TAGAGCCTCAATGTTGATTTGTTTAATCTTGTCTCTTATGAGCACGATAC
AATGTTGCGCAACACGCCACGTTAAAAGTGCGCTACGTCACGCACTGCGT
GTTGGTTCGTTTGTTATACCATGGATTTTCGCGGCCGGTCCTTACATGCA
TCGAATGTTGACATGTGACTCGGAGCTCGATTGCCAGTACGGAGCCTTCA
GTAAGTTTATCAACCACGCCTTATTATACGTGACCGGTGCTATATTCATG
GCAACAAAATATCCAGAGCGCTTGTTTCCTGGTAAGTTTGATGCAATCGG
ACAGAGTCACCAGATTATGCACCTGTGTACGGCTTTTGGAGCCGACATTC
AATTCGACTCCATCAAAACGGATATGTTAAGTCGTGAGGCTGCGTTACGT
CAACAGCCGTTGAACGACGGTTTTACGTCGGATTGCGTCTTGTTTACGAT
AGTTATGGCCGTGAGTAACATGGCGGTGGCATTTGTGTTCAATAATTTTG
TTGACATGATTAAGGaacaaaaagacacaaaaactGAATAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_016495	XLOC_016495	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00029012-exon-sc0000720-1491911889:129580..129651	TCONS_00029012-exon-sc0000720-1491911889:129580..129651	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00029012-exon-sc0000720-1510915933:129580..129651	TCONS_00029012-exon-sc0000720-1510915933:129580..129651	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00029012-exon-sc0000720-1575043694:129580..129651	TCONS_00029012-exon-sc0000720-1575043694:129580..129651	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00029012-exon-sc0000720-1491911889:129832..129906	TCONS_00029012-exon-sc0000720-1491911889:129832..129906	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00029012-exon-sc0000720-1510915933:129832..129906	TCONS_00029012-exon-sc0000720-1510915933:129832..129906	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00029012-exon-sc0000720-1575043694:129832..129906	TCONS_00029012-exon-sc0000720-1575043694:129832..129906	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00029012-exon-sc0000720-1491911889:145496..146780	TCONS_00029012-exon-sc0000720-1491911889:145496..146780	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00029012-exon-sc0000720-1510915933:145496..146780	TCONS_00029012-exon-sc0000720-1510915933:145496..146780	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00029012-exon-sc0000720-1575043694:145496..146780	TCONS_00029012-exon-sc0000720-1575043694:145496..146780	Clytia hemisphaerica	exon

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00029012-protein	TCONS_00029012-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000720	supercontig	sc0000720:129580..146780 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0.331641	11.0446	13.8959	7.34789	5.46944	2.3781	3.07588	0.953915	1.40278	2.3965	0.387547	0.040114	2.45207	1.86801	4.50035	2.65657	3.12304	1.4273	1.0999	34.696	17.1227	1.49975	0.844265	0.735659	0.29551

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR004254	AdipoR/HlyIII-related

Vocabulary: **Cellular Component**
Term	Definition
GO:0016021	integral component of membrane

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
cellular_component	GO:0016021	integral component of membrane

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00029012 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: PAQR6 (Membrane progestin receptor delta OS=Homo sapiens GN=PAQR6 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 125.561 bits (314), Expect = 5.903e-32
Identity = 97/322 (30.12%), Postives = 142/322 (44.10%), Query Frame = 3

Query:  243 LHSHMVKNDYREPFIDKGYRCENMKAWDCFKTMFVFKCNETFNIWTHFLPFVIFLIKFVYIFNTELSIHDSFYWPLAANAMGIMGFCLTSALAHMFCALSLQARHTCFYTDYAAISIYSVT--------AWEATFFYGRLISDGGFPYFGNTRAXXXXXXXXXXXXTIQCCATRHVK---SALRHALRVGSFVIPWIFAAGPYMHRMLTC-DSELDCQYGAFSKFINHALL--YVTGAIFMATKYPERLFPGKFDAIGQSHQIMHLCTAFGADIQFDSIKTDMLSREAALRQQPLNDGFTSDCVLFTIVMAVSNMAVAFVFN 1166
            L  H V   + E  I  GYR     A DC  + F    NET NIWTHFLP   FL + + +        + ++WPL    +    +   S  AH F ++S + RH C++ DY A+S+YS+         +  A++ +G L       +F    A            T   C +R ++     L   LR G+F  P++F   P  +R+  C      C   A S    + L    +TG +F A+  PERL PG+FD IG SHQ+ H+C   G   Q +++  DM SR A L  Q    G     V   ++ A  N+ +   F 
Sbjct:   10 LQVHQVPRVFWEDGIMSGYRRPTSSALDCVLSSFQMT-NETVNIWTHFLPTWYFLWRLLALAGGPGFRAEPYHWPLLVFLLPACLYPFASCCAHTFSSMSPRMRHICYFLDYGALSLYSLGCAFPYAAYSMPASWLHGHLHQ-----FFVPAAALNSFLC------TGLSCYSRFLELESPGLSKVLRTGAFAYPFLFDNLPLFYRLGLCWGRGHGCGQEALSTSHGYHLFCALLTGFLF-ASHLPERLAPGRFDYIGHSHQLFHICAVLGTHFQLEAVLADMGSRRAWLATQEPALGLAGT-VATLVLAAAGNLLIIAAFT 317

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00029012 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00029012 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
PAQR6	5.903e-32	30.12	Membrane progestin receptor delta OS=Homo sapiens ...	[more]

You are here

TCONS_00029012 (transcript) - C. hemisphaerica