TCONS_00021257 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00021257
Unique Name	TCONS_00021257
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2196

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000380:191419..200728+

transcript sequence

>TCONS_00021257 ID=TCONS_00021257|Name=TCONS_00021257|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2196bp
cttttttattttttgctgacaAAGCTCAGAGCTCAAGCTCCAGGTTgatc
tttttattttgatttcagtGATTCCTCAGGACTTCTCCAATTACCATCAC
GTGGGTAGCTTGCTGCTGTTGAATTGTCTTGCTCAAAAACTTCTTTTTGT
GGTTCGTTTATAGCCTGTTTATAGGACTCCATCCAAAGCAAAgtagaaat
ttcttttttgtatattttgaagCAAGATCATTATCTTCTTTTTAAATGGA
AGAAGAAATGTTGGGCTTAGGATATGAAGTGGAGTACTTCTCTTCCCTGA
CTGAACGTGTTGATTCTATAGTCATTGTTGGAGAAAATCTAACTGAATCG
AGTTATCCTGACTTTCTCAAGCCTTACCTTGAGGCCATCAAAAATTTGGA
AGAGATTGATGGCGCAATCAAATCTGACATCGCTGTAGTTGCTGTTAATG
CTGCAGTAAAGAGATGTATCTGGGCACCAACAGGTCCAACAAATCGTGAT
TACGATGATGTTCGAAGGTACAAAGATGCTGCCATCAAGGGTGTCAAAAG
AGCTTTAAAAGCTGGATCCAAATCACCTGGAATTGTTGTTTACACTTCTG
AGAAGCAAAGAGAATCAAAAAGATACAAAGAATCCATTATGGTCGCTTTA
CTTGGTGCTATGGAAGCTGTTTATGTTCCAATTGAAATCAGGGAGGCATt
acctgaaaaagaaaagaagatcaCTCGTCTCAGTATTAGCTACAACACAT
CGGAAATCAATCATGACAATTTGATTAAAACAGCATATGGTATTGAATTT
GGAAGaTTAATGGCACGAGATATCGGTGGCTCTGACCCTGAAAGAATGTC
TGCTGCAAATACTGCAAAATATGTAACCGAAGTCTTTCAAGGAACTTCAA
TTAAAGTAAAAGTGATCGAAGACCGAGATGCATTTGTGAAAGATTATCCT
CTCTTTGCTGCTGTTGATCGATGTGCTACAGAGGTGGACAGACACGCAGG
TCGCATCATTGAATTGGAATATACGAGTGATAATGTGTCTGATACCTACA
TGTTCGTTGGAAAGGGTGTAACTTATGACACTGGTGGTGCCGACGTGAAA
GCTGGAGGCGTCATGGCTGGTATGCACAGAGATAAATGCGGAGCGGCAAC
AGTTGCTGGAATATTTGGAATGCTCGAGAAATTGAAACCGAAAGGAATCA
AAGTTGTTGGAAGAATGGCCATGGTTCGAAACAGTATCGGAAAAGATTGT
TACGTTGCCGATGAGATCATCACATCAGCAGCAGGTGTTCGTGTTCGTGT
TGGCAATACTGATGCAGAAGGGCGAATGGCCATGACTGATCCTCTATATC
ATACCAAACAACAGgcATTGGATGAAGTGAATCCACATTTATTCACAATT
GCCACGCTCACTGGTCATGCAGTGGTCGCCGTTGGGCCTGAATACACTTG
CATTATGGATAATGGACCAGCCGAAGAGACAGACACAGCCCGAACACTTC
AAAAAATTGGTCATGGTTTATCTAATCCATTCGAAATATCAACCATTAGA
CGTGAGGATTATGCTTTTTGTGATGGTCGAAATGAGTATGAAGACCTAAT
CCAATGTAACAATCAACCTTCTTCAAGAACACCGCGCGGTCATCAATTTC
CCGCCGCCTTCATGATCTCTGCTTCAGGTCTCAAGAAGcACGGTATTGAT
TCCGACCGTCCCTTAAAATACACGCATATGGATATTGCTGGATCATCCGG
TAGCTACCCGGGGACCCCAACAGGTGCACCACTCATAGCTTTAGCCAAAA
TGATGAAGATGTTTTGAATGGTTGGTCGTCGCCCTTACAATTTCTTAGGA
TGTATTCtaatttttaggtttttaaactCTTAGGtaattaactttcttta
ttctCAAAACATAAAAGGGCATCTTTCGTCTTATCTTAGCGAGAAATTGT
AATAATATGGCGGTTTCTTTATTATTCTTGTTCGATCGACTGTCTCGATT
AGTTAATTTTGATCACAATCAAAATgttgtttataattttatttttaagg
ttAAGAtatgatttctttatttttgtaatttgtgGATTAGTTTTTTATGT
Ttggtatttctatttctaagagagtttattttgttttttattccaatttc
tttcaataattTTAGAGTTTATTTTTCGAATAATTTTCGATTTAAA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000380:191419..200728+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00021257 ID=TCONS_00021257|Name=TCONS_00021257|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9310bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000380:191419..200728+ (Clytia hemisphaerica)
cttttttattttttgctgacaAAGCTCAGAGCTCAAGCTCCAGGTTgatc
tttttattttgatttcagtGATTCCTCAGGACTTCTCCAATTACCATCAC
GTGGGTAGCTTGCTGCTGTTGAATTGTCTTGCTCAAAAACTTCTTTTTGT
GGTTCGTTTATAGCCTGTTTATAGGACTCCATCCAAAGCAAAgtagaaat
ttcttttttgtatattttgaagCAAGATCATTATCTTCTTTTTAAATGGT
AAgcaatagatttatttttccTCATCTTATTTTTCAGTAAAaccatttta
ttttgagagtagTAGAAGGTGTATGGAGCATTTATGCAGTAAAGGTTTAT
GTAGTAAGGTTTTTACGTAAAGAGCATAGGATATAATGAATCTAGCAGTA
GCTAAAGCTAGATAAAAAgaatagatttaaaaaacagGGTGTGCTTCACA
GTCACATGTACAGACTTGCCAATGCTCAGGTTTTCATAGTTtctaagttt
caaaattttgaatgcgGGACAACAAGATGGGAACAAAACAAGCCTAAAAA
TTGAGCTAAGGGTGTAGGGATTTTCCAATTGGGGCTCTCTCAATTGAGGG
TCAGTAATCTCTCTCTGGGGTTCTAGGAACAATTTTGCCAATTTATTTAA
TTGCTGAATTGGCAAATTACAAAAACATATCaattgttttagttttttta
tcattaatcCATCATCTTCATCGTGTTATTGTGTTATTTGGTTATTTTTG
CGTAACTTTGAGCTTAATTCTAGTGAATATTTGAAAATGCAGGACATACA
CAGAGGACAATAGGTCAATTTGCGTTGTATGTGTCCCTCAGGATGTGGGA
CACttggtaccgtaagttggtataatattgacatccctctcgacaccctt
ctttagagaaaggaataatatgaaagcttgaatcactgattgaaaaagga
ttatacttctctgaccactaagcaaagaaaaacttttcaacctttctata
aatttcagctgataaaaagggtttcggaattagaggaggggtgttgacat
tagaccaagttacggtaactATGCGGTTTTATAGCAGTGACGTTAGGAat
gaaaaaaagctaaaatataatttatcaaatcaatattgatttttactgaa
aactgaaaactaaaagtttgaaatttagtGAATTTTATAGACCATGATCT
TCAGATAGAGATCCTTCTGAActttaatttgaaatattagaaAAATATCA
GAAACCTTTATTTCAGATATCagaacattagaccaagttacggtaacaAC
TATGCGGTTTTATAGCAGTGACGTTAGGAatgaaaaaaagctaaaatata
atttatcaaattaatattgatttttactgaaactgaaaactaaaagtttg
aaatttagtGAATTTTATAGACCATGATCTTCAGATAGAGATCCTTCTGA
ActttaatttgaaatattagaaAAATATCAGAAACCTTTATTTCAGATat
cagaaaatgaaagtgaaagttttaaagttgtttgaaaatgatttgCATGC
AGCAAGCTAGtttaaatataatttgatttaaaaaaactgattttagcaaa
aattgtACTCAATGTGTGTGTTGCTAAGGTTACTCAATTTTTGATTAGTT
TTATCAAGCttattttttaagaactttATTGGCAATAGCTCTAGCTTAGA
GACATTGAACATTGTGCAATAAATCAGATATTTGGCAGATCAGTTGAAGT
TTGATATTGATATTAAAAAAAGACTTCATGTATATAAGAGGAATAAAGAG
AAGATTATAGAATACATAATCCAAATCTTCACGGAAATGAAcattttagc
ttttttcatttttgcaataATCAATGGAAGTGAGATATTTGCCATGACCA
TTGATTATGTATGTAGGCTATGCTTATTGAGTCATATTTTAAATGTTTAT
CCATAAATGATTTTATAAGCATtagtttgataaaatatttaaaaaatgtt
agtTTTATATGGAGTAAATatgaatttttcatcaaagttaaCCAGGTCAT
ACAACTGGctctagaaaaaattaaaagctcttttgtttattttgtataaa
tTTGCTTTCAAAACTGGCAATTACATTTTAAAATGTTGACAGACTTGCAA
TATTGATAAATgattgtttatatttttgtttttattatatttctgTTATG
AATTTTGTATATATGCTGAGATAATTATAAAGTAATCTTTAATTTCAGGA
AGAAGAAATGTTGGGCTTAGGATATGAAGTGGAGTACTTCTCTTCCCTGA
CTGAACGTGTTGATTCTATAGTCATTGTTGGAGAAAATCTAACTGAATCG
AGTTATCCTGACTTTCTCAAGCCTTACCTTGAGGCCATCAAAAATTTGGA
AGAGGTTTGTATtaacaaaaaatcattaatcaaatttttttattgtgttC
CTTCTTGATAGAATAATATAGAGACCTCAAAGATTTGATTTTATAATGAG
ATTTGTATGGAAGATTTTCTAATTATATATCATGGAGACAATTTTTACTT
AAGATAATGACACTGTTTATTTTCATTGTGTATAGATTGATGGCGCAATC
AAATCTGACATCGCTGTAGTTGCTGTTAATGCTGCAGTAAAGAGATGTGT
AAGCTTTCCTTTGTTTTATAATTTGCAACAGAAATCACTACTAGTTCTGA
AAACATGGACACGGTTGATGNAATTTGCAACGGAAATCACTACTAGGTCT
GAAAACATCAATTGTGGACacggttgatgttttttatccacagtcaatca
tttttatggactgttttactttttcttgacAGTCGATGCCTGGAAAAAGA
CAGCCAATACTCTTAATGAATTATCGAGATTATTTAATTGACTGTTGGTA
TCTGATATTGACTGTCAATATGTGAGATCGACTGTCGATAGCCACAATTG
ATGATTTCAGACCTAGTAGTGAATGTATAGATTGTGGTTGAAATTTATGT
TGGTTGCCggtcatattttcatatttgaaACTCTCTCCCAAATCTGTCAC
ACTATAATTTGCGATTTCTATCCTCAAGACAAAGGatagttttcttttaa
acatttttttgagcCCGAGTCACCTTTTCTAAAAAACAATGTTAACTCAA
TGATATTTTATAGATCTGGGCACCAACAGGTCCAACAAATCGTGATTACG
ATGATGTTCGAAGGTACAAAGATGCTGCCATCAAGGGTGTCAAAAGGTTG
GAAATCTCAGTTTATTGACTATGTATTAGAGTTGACTACTGGCTATCAAC
CTTAAGCAACGAAGCTTCTTGACTACTACTTCAACTGTAATTCAGTATAA
TTCACTTTGGGTATTTTTTACAATAGAGCTTTAAAAGCTGGATCCAAATC
ACCTGGAATTGTTGTTTACACTTCTGAGAAGCAAAGAGAATCAAAAAGAT
ACAAAGAATCCATTATGGTCGCTTTACTTGGTGCTATGGAAGCTGTTTAT
GTTGTATGTAAATTCACTTAAATGAATATTAAAGATCTTATCTTGTCTTG
ATTGTGGTTGTGGTGTCGACTCTGCATTTAAGCGATTTCCAAATGCCTCC
TTACATTCATTTAATTCATGTTTTGAAACTCATTGAATCTGGCTTGCAGG
CTTTTGTATTTATTGTTTCTTCCAAAATCTGCCATAGCAACTAAAAAGCT
TTAAAGTTATCAGTAACAGAAAGTCATGCCGCAAAATATGTGACTTTTTC
TACATCAACATCATGACCTTTAATGAGATCTTCTAAAAGAATACATTTGA
AAACCAAGTTGAGGTACAGCAGAAAAAATCCCACAAAAAATCTCGAGCAC
ACGAGACGATATTGTTTCCTACAAAAATTTATCCcctttcaaaatatgaa
aaccATATTTATGATTATGAATTCATTTCAGCCAATTGAAATCAGGGAGG
CATtacctgaaaaagaaaagaagatcaCTCGTCTCAGTATTAGCTACAAC
ACATCGGAAATCAATCATGTAAGTTACAACCCTATAATAATTTTTTAGga
gttaatttgaaatttttacttaTAACCAATAAAGCATGTATATTgtatca
aaaattttgtttaataTATCAAAAATGTTGTATTATCTTTTTAGGACAAT
TTGATTAAAACAGCATATGGTATTGAATTTGGAAGGTAAATCGTTGAATT
TGGCTTAAATTTCGTCTTACAATCTGGAATATTATATTTCTGGCTTACTT
AAAAATCATTGCTGTTACTCTAACAAAAGATAACATGAGATTACTTCACG
GTTGATTATTTAAATCTGTAACGCTCTTTTCCACCAATTTGTATTCACAT
ATACGAAAATAAAATGTCCAGCTTATTCttaattgttttctttagaTTAA
TGGCACGAGATATCGGTGGCTCTGACCCTGAAAGAATGTCTGCTGCAAAT
ACTGCAAAATATGTAACCGAAGTCTTTCAAGGAACTTCAATTAAAgtaag
tgacgtcacaattatACTCCCAAAAATTGAAGCCTGAGTAATAACATAGC
AGTATTTGTACACAAATGAATGGATTTTCCCGTTCTTAATTCACATTTTA
GATTAATCTATTTTCTCCcctttattttgaattttctttcctTCCAGGTA
AAAGTGATCGAAGACCGAGATGCATTTGTGAAAGATTATCCTCTCTTTGC
TGCTGTTGATCGATGTGCTACAGGTGGagacaatttaaaaatttcatgCT
ACATTGTGTCACGCTTCTTAACATTACTCGCTTTGTTTTCaaggtaaaaa
aaaagattcgatctataaattgcaatttttatttttacttgacAGAGGTG
GACAGACACGCAGGTCGCATCATTGAATTGGAATATACGAGTGATAATGT
GTCTGATACCTACATGTTCGTTGGAAAGGTAATCAAGTGTACTTTATTAG
AATAATCCGAACTTAAAATGACACAAGTCACGGGTTCATAATTAAGGGAA
TCTTTCNAATTTGATTAAAACAGCATCTGGTATTGAATTTGGAAGGTAAA
TCGTTGAATTTGGCTTAAAGAACGTCTTAGAATCTGGAATATTATGTTTC
TGGCTTACTTAAAAATCATTGCTGTTACTCTAACAAAAGATAACATGAGA
TTACTTCACGGTTGATTATTTAAATCTGTAACGCTCTTTTCCACCAATTT
GTATTCACATATACGAAAATAAAATGTCCAGCTTATTCttaattgttttc
tttagaTTAATGGCACGAGATATCGGTGGCTCTGACCCTGAAAGAATGTC
TGCTGCAAATACTGCAAAATATGTAACCGAAGTCTTTCAAGGAACTTCAA
TTAAAgtaagtgacgtcacaattatACTCCCAAAAATTGAAGCCTGAGTA
ATAACATAGCAGTATTTGTACACAAATGAATGGATTTTCCCGTTCTTAAT
TCACATTTTAGATTAATCTATTTTCTCCcctttattttgaattttctttc
ctTCCAGGTAAAAGTGATCGAAGACCGAGATGCATTTGTGAAAGATTATC
CTCTCTTTGCTGCTGTTGATCGATGTGCTACAGGTGGagacaatttaaaa
atttcatgCTACATTGTGTCACGCTTCTTAACATTACTCGCTTTGTTTTC
aaggtaaaaaaaaagattcgatctataaattgcaatttttatttttactt
gacAGAGGTGGACAGACACGCAGGTCGCATCATTGAATTGGAATATACGA
GTGATAATGTGTCTGATACCTACATGTTCGTTGGAAAGGTAATCAAGTGT
ACTTTATTAGAATAATCCGAACTTAAAATGACACAAGTCACGGGTTCATA
ATTAAGGGAATCTTTCTTTACAATATCAAAGGTAAAAGATCAAGAAAATC
ATTTACatataaaaaaatcagaatTACCCAAACCATTAAATAGTTATATA
ACACACTTTAACCACAAGATCTGCTAATTCTTCTATCCTTCATAAATACA
CAGGGTGTAACTTATGACACTGGTGGTGCCGACGTGAAAGCTGGAGGCGT
CATGGCTGGTATGCACAGGTAAAGTGGCATTTTCCTGATCCCAACATTAA
TTTCACCTCTTACAAACTGCGGTAGGCTCTTCTCATAAACCAATGGAAGT
ATTTTTGCTAACTTATCATTCATAGAAACCTAAGTTTGCCTTTGTTTTAT
GTGCAGAATAGCAAATATGTACAACACTGCAGTCTCCgaaactcgaacac
gcacggggaacacaaatttgtacgatttaaggaaatttcgaggaATTGac
taaggtttataaggcattgttaattaAATGAAGGGaacagaaaacttgtt
cgagttaaggagacattcgagttatggaggttcgagTAATGAAGACTTCA
CTGTGTACTTTAGATTTTGACATACGAGGTTTTCctctcaaatatttttt
ctcctttCATACGATTCTATATTTTGTTTACAGAGATAAATGCGGAGCGG
CAACAGTTGCTGGAATATTTGGAGTAAGACCTTTTTATCGTCTTTTGATT
TCGCTTATGCaaattttgaaatcaacgTGAATACATGCACACCATTGTTT
TAGTGGTTAATCTTCAGcataattttttgttcttttttgcaGATGCTCGA
GAAATTGAAACCGAAAGGAATCAAAGTTGTTGGAAGAATGGCCATGGTTC
GAAACAGTATCGGAAAAGGTacaatttttttaagagtcttcatcCAGTGG
AAGACGCATCATTTAACGCatcatttgcttacacagcatttttaaactaa
agaaaaaacaatttcttGCCCTTCCGTGCTGCTCGAGCACAAATTTTatg
agaatttttcagttaattcTGCTTTGTTTCGCTTATTTCAACATAAAAAA
AACGGtaagatatttttttaaaataatggaACGACTTAATTGATCACATG
TTTCCTTCATTCAGATTGTTACGTTGCCGATGAGATCATCACATCAGCAG
CAGGTGTTCGTGTTCGTGTTGGCAATACTGATGCAGAAGGGCGAATGGCC
ATGACTGATCCTCTATATCATACCAAACAACAGGTTAGTTTTGATACCTA
AACCCCATTTTATGTTTTGGAAGGAATATTGTCTCTTAGAGTTACTCTCG
ATTACAGAAAAGAAGTAAAACACCCGCGTTAGCCAAGTTCTTTAGAGATT
TTTAAACTACTTTTTCATGACCTCCAAATGACAGACTCTTCTTATGAAAt
ggtaaaagtaaaaaatcaaagCATGCTTTTTATATGTTCTGGATTAAgct
taggctacgtcatatttTCCTTCCTGTCGATCGTAAAACTCCCTACTCAA
GAATAAGGCCTTAAAAGCCTGGAGTAAACTATTGTGAAGAGTTTAATTTA
GGTTTATAATCCCAAATTGTGGTAAACTATGGTAAACACTTGTCATTATA
CTTCTGTAGCTTCATTTCTGCGaaaactaactttttcattttaatttttt
caggcATTGGATGAAGTGAATCCACATTTATTCACAATTGCCACGCTCAC
TGGTCATGCAGTGGTCGCCGTTGGGCCTGAATACACTGTAAGATCGATTG
CGCttttaattattcaatggcGTGTTCACTTTCAGTCAACAATACGATTA
TTTTTCAAAGCCTGACGATCCTTTCTTTGTATAACTTCGGCTATTGTTAT
ACAAAGGTCTCAAAAAAGCTCTCGTACGGCGTATTGATTTCCCAGCTGgg
acacaacgttatttcaacgttcatctaacgttatattgaCGTTGTGATCA
TTAGATggacgtcgaaacaacgttgtgtaccagctagGCTTTGATGAGTA
TATTttaatgttcaattttttttgtatttcagTGCATTATGGATAATGGA
CCAGCCGAAGAGACAGACACAGCCCGAACACTTCAAAAAAGTACTTCTTA
TTTATATTCACCATTTTCACTTTTCATTGTTTTCCCTtatattctttcat
ttttaatgaTTGTTCTGTCTTTCTTGCTTTTTTAGTTGGTCATGGTTTAT
CTAATCCATTCGAAATATCAACCATTAGACGTGAGGTAAGATGATCAACG
ATTTATTACAGCTGACTATCTTTCATTGAATTTTCAAGGGAATCAGTTTT
TCATCGAATAAACGTTTCGAATGGTAGAAAGTTGTTTATGAATAGTAAaa
cgtcgaataagagagtATCAACTTTAcgtttgaaaaagtttgtttagcAT
GTGTATTATTAGTCTTATTCAAAACAGGCTGTCTTTGAATTTTCAGTTCG
TAATATTATCCGTTATTTACCAATCTTAGGATTATGCTTTTTGTGATGGT
CGAAATGAGTATGAAGACCTAATCCAATGTAACAATCAACCTTCTTCAAG
AACACCGCGCGGTCATCAATTTCCCGCCGCCTTCATGATCTCTGCTTCAG
GTCTCAAGAAGGTTTgtaattcattttctttttcaatctgcataaagaaa
aacaatacaTAATTTTTACTTTGAGGACATCCAAGAGAGCTTGATAATAT
CTTTTAATCTCGTCTATTTAACTAATAGTTTTAGAAGGCATTTTCACAAG
GCTAGTCGGCTAGGcattttttctcatttaaaTCTTAGCCAACGAGGaac
aagtttttatttctttcttttagtaATATCATTTATCTAGTCTATTTAAC
TAATAGTTTTAGAAGGCATTTCACATGGCTAGTTGGCTAGGCATTTTTTG
TCATTTAAATATTAGCCAACGTGAGAaacaagtttttatttctttctttt
agcACGGTATTGATTCCGACCGTCCCTTAAAATACACGCATATGGATATT
GCTGGATCATCCGGTAGCTACCCGGGGACCCCAACAGGTGCACCACTCAT
AGCTTTAGCCAAAATGATGAAGATGTTTTGAATGGTTGGTCGTCGCCCTT
ACAATTTCTTAGGATGTATTCtaatttttaggtttttaaactCTTAGGta
attaactttctttattctCAAAACATAAAAGGGCATCTTTCGTCTTATCT
TAGCGAGAAATTGTAATAATATGGCGGTTTCTTTATTATTCTTGTTCGAT
CGACTGTCTCGATTAGTTAATTTTGATCACAATCAAAATgttgtttataa
ttttatttttaaggttAAGAtatgatttctttatttttgtaatttgtgGA
TTAGTTTTTTATGTTtggtatttctatttctaagagagtttattttgttt
tttattccaatttctttcaataattTTAGAGTTTATTTTTCGAATAATTT
TCGATTTAAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_011899	XLOC_011899	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000380	supercontig	sc0000380:191419..200728 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.85745	7.6165	7.92739	5.9244	17.407	10.0975	19.5624	16.7963	23.8238	23.5356	16.1336	10.8659	13.0484	13.8107	23.0314	30.5938	18.8854	11.8776	7.93307	13.4151	9.91529	7.33883	12.2522	12.1219	11.8525	17.5996	14.7706	11.6721	20.0524	16.1512

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00021257 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: PEPL1 (Probable aminopeptidase NPEPL1 OS=Homo sapiens GN=NPEPL1 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 85.8853 bits (211), Expect = 2.481e-17
Identity = 74/253 (29.25%), Postives = 109/253 (43.08%), Query Frame = 3

Query:  993 HAGRIIELEYTSDNVSDTYMFVGKGVTYDTGGADVKAGGVMAGMHRDKCGAATVAGIFGMLEKLKPKGIK--VVGRMAMVRNSIGKDCYVADEIITSAAGVRVRVGNTDAEGRMAMTDPL-YHTKQQALDEVNPHLFTIATLTGHAVVAVGPEYTCIMDNGPAEETDTARTLQKIGHGLSNPFEISTIRREDY--AFCDGRNEYEDLIQCNNQPSSRTPRGHQFPAAFMISASGLKKHGIDSDRPLKYTHMDI 1736
            H   +  L +T D  + T  +VGKG+ YDTGG  +K    M GM RD  GAA V G F    K   +G K  +     +  NS+G +    D+I    +G  V + NTDAEGR+ + D + Y  K    D +      +ATLTG   +A G  +  ++ N    E    +  +K G  +        +   ++  A  D +N   D    +N PSS         A   I++       I  D P  + H+DI
Sbjct:  237 HPPALAVLSHTPDGATQTIAWVGKGIVYDTGGLSIKGKTTMPGMKRDCGGAAAVLGAFRAAIK---QGFKDNLHAVFCLAENSVGPNATRPDDIHLLYSGKTVEINNTDAEGRLVLADGVSYACKDLGADII----LDMATLTGAQGIATGKYHAAVLTNSAEWEAACVKAGRKCGDLVHPLVYCPELHFSEFTSAVADMKNSVADR---DNSPSSC--------AGLFIASH------IGFDWPGVWVHLDI 465

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00021257 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00021257 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
PEPL1	2.481e-17	29.25	Probable aminopeptidase NPEPL1 OS=Homo sapiens GN=...	[more]

You are here

TCONS_00021257 (transcript) - C. hemisphaerica