TCONS_00021208 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00021208
Unique NameTCONS_00021208
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length7729

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00021208 ID=TCONS_00021208|Name=TCONS_00021208|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7729bp
TCTAAAACATGAGGCTCggatttttctaaatttgttcTAGAATTTATGCT
TAAAGCCTCGTGTTCTCATAAAAACTGTTCCTATAAAAATGAAGGCGATT
TTCTTAAACGGAAAAATTGAAGTATTATCAGCATCAGTtagtataaaatg
aaaatttttgaatatctAAACCTATACAAAATATTGCTACAAATACACTT
TGCCGatacaaaatttgttttcaatcaTTCCAAGTTATATATCATAGtca
tataatataaaaatgGTGTATCTCGTATAGATTCAATCACATAGAAAATA
TTTGTCGTTagccaaaaaaagttccaccgttAGAAACTAATGTCTTGGTC
GTCATTTCGTcagtctttttaaagttttgtcgTCAGTCAATTTCGTCAAA
ATTTTATCGTCAGTCAATTTGAAGTTTTGGTCAAAGTTTTTTAGTCAGTC
TGTTTGAAGTTTTGGACAAAGTTTTTTCGTCAGTCTGTTTGAAGTTTTGG
ACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGT
CAGTCGGTTTAAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTAAGTCTGTTTAAAGT
TTTGGTCTGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGTCAAAGTTTT
TTCGTTAGTCTGTTTGAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTT
AAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAA
GCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTC
TGTTTAAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGG
TCTGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGTCAAAGTTTTTTCGT
CAGTCTGTTTGAAGTTTTGGACAAAGCTTTGCCGTCAGTCTGTTTAAAGT
TTTGGTCAAAGTTTTTTCGTCAGTCTGTTTGAAGTTTTGGACAAAGCTTT
GTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTT
AAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAA
GCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTC
TGTTTAAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTCAGTCAATTAGAAGGTTTGG
TCAGGGTTTTATCGTCAGtcattttgaagttttggaaaaagttttttggt
cagtctgtttgaattttttatcaataattttttagtGTGTCAATTTTGTA
CTTTTGATCGAAGTTTAATCGTCAGTCAATTTGAAGTTTTGGTCAAAGTT
TTGCCGTCTGTCTGTTTGTTTGAAGTTTTGGTCGTCAGTCAAGTTTAAGT
CTTGGTCAGAATTTTGTCGTCGATCAATTTGAAGTAATCGACAGAGTTTT
GTCGTCTGTAAATTTGAAGTTTTGGTCAGAGTTTTGTCGTCGGTCAATTT
GAAGTTTTGGACAAAGTTTTTTCGTCAGTCAATGTGAAGTCTTGGTCAGA
GTTTTGTCGTCTGTCAATTTGAAGTCTTGGTTAGAGTTTAGTCGTCTGTC
AAGTTGAAGTTTTGCTCATTGTTTTGTCGCCAGTCAATTTAAAGTTTTGG
TCAAAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTTAAAGTTTTGGTCAAAGTTTTGTCGT
CAGTCAAGTTAAAGTTTTGGACAAAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCGAACT
CTAGGTCAGAGTTTTATCGTCAGTCAAGTTGAAGTCTTGGTCAAAGTTTT
GTCGTCAGTCAAGTTGAAGTCTTGGTCAGAGTTTTGTCGTCATTCAAGTT
GAAGTCTTGGTCAGAGTTTTGTCGTCAATATATTTTAAGTTATTTAGTGA
AAGTCTTGTCGTCAGTCTAGTCTATTGTCACATTGATAAAAGTCAGTATT
GTTTCCAGATATGTAAGGTTCAGTTTTTGTCGTCAGTCTAGCCAATTTTT
CAGTCAATATCTAAGGATTGCCAAGTCAAATTTCAGTCAAGTCgaattaa
tttttcaagtttcaattcagttttcaattttttcaagtcAAGTCTAAGTC
AACATCAAGAGCTGTCAGTCAAGTTTCAGTCAGCGTAAAAAAGTTTTGCT
TTTGGTCAACGTTAGGTCAAAGGTAATGTAAAAGAGTTTTGTTCAAGTTT
CAGTCGATGCCAAAGCTTTCTTGCCAGTTAAGTCAAGTTTAAGTCAATGT
CAGAAATTTTGTCGTCAGTGAAGTCAAGTTCAGTCAATGTTAATACTGTA
TATTTTTTGCGTCAGTCAAgtcaatttccaaattttgcaaTTAGTCAAGT
aaggtttttgacattttcaagtCATATTCATCGATATTCATTTCCAAAAC
CTTTTGGTAAACTAAGTTTGTCGCAAAACGTCAAGACAAGTCAATGTCAA
AGATTTTCCTCGCTTTGTCGTCAAATCTTTTGCTGTCAGTTACAAGTTAG
GTAAAGTTTCAGTTTATCTAAAGAAGCTTTGTTATCTATCATTTCCAGTC
AATGTAAAATAAGGTGAAAGTCATaataattttcgatttctttcaaaaac
tttgtcaTGTAAAGTCGTTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTAGTCA
GTCAAGTCAAGTTTCAGTCTATGTAAAATAGTTTTGTCGTCAATCAAGTC
AAGTTCAGTCATAGTAAGAGAGTTTTGTCGTCAATCAAGTCAAGTTTCAG
TCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAATCAAGTCAAGTCTCAGTCAATGTA
AAGTAGTTTTGTCGTCAATCAAGTCAAGTCTCAGTCATAGTAAGAGAGTT
TTGTCGTCAATCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTC
AATCAAGTCAAGTCTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCAATCAAGT
CAAGTCTCAGTTTTAGTAAGAGAGTTTTGTCGTTAATCAAGTTAAGTTTC
AGTCATGGTAAAATAGTATTGTCCTCAGGTAAATCAAGTCAAGTTTAGTC
AGAGTGAGAGAGTTTTGTCGTTAGTCAAGTTTCAGTCACTGTTACACTGT
TTCAATGTTCTTTGTCAGACAAGGTCTTTAAAAGTCAAGACTTGTAAAAA
GGTTTCATTCAACGATAAAGTCAAGTCAGGAGAAAGAGTTTTGTTGTCAG
TCATGTCAAGTCAGGTTTAAGTcaatttctaagttttttttgggTCAGTC
AAGTCGTTCGTTCAATAAAAGGTTTCAGTTAATGACAGAGACTTGGTTAT
CAGTCAAGTCAAACTTCAATCAAAGATATAAAGTTTCTGATAGACAAGTC
AAGGTATCAAagttttttatcaagctttAGTCAATGGCAGGCACCTTTTT
GTCAGTGAAGTTAAATTTCAGTCATTGACAGAAGTTTGCTTTCTGTCAAG
TCAATGTAAAAGAATATTTTGTCAGTAAAATCTCAGTTTATAGGTTTCAG
TCAATGTCAAATACTTCTGTCGTCAGTCAGAGTAAGTGTTAAGTCAAGTG
AAGTTTCAGTCGGAATTAAAGAGTTTTTTCGTTAGTCAAGTTTCAGTTAC
TGTCAAGTCAATGTTCTTTGTCAGACAAGGTTTCGTCTTTAATAAAGTCA
AGACTTGTAAAAAAGTTTCATTAAACAATAAAGACTTTATTTTGAGTCGA
AGCAAATCAAGTCAagtcaattttcattcaatgtaaaaaatgtttttgca
tcAGTCAAGTCAAGTAAGTAAGTCAATATAAATTCTCAATGTCTTAGTCA
ATGACAGGAATTCATCGTCGGGTGACGGCTAGTTTCACTCAATATAATAG
AGTTTTGTCGTCAGTTAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAAGGGAGTTTTTTT
ATCAGTCAGTTCAGGTCAGGTCAGGTCAGCTCAGAGGTCTCATTTAATGT
ATAAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTGTTATAAATTTTGTCGTACTA
AAGTTTAAGTTCATGTAGAATAATTTTGTCATCTGTCAAGTCGAGTTTAG
TCAAGTCGAGTTTCAGTCaataaaaaagacttttgtCGTCAGTCAAGTCA
AGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTC
AAGTCAGGTCAGGTCAGAGGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTC
AACCAATTCATTGTTATAAATTTTGTCGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTA
AAATAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGT
CAATGAAAAAGACTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAAT
GGACTTTTTTCATCAGTCAAGTTAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAG
AGGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTATTAT
AAATTTTGTCGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCATCA
GTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTT
GTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGT
CAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGAAGTCTCATTTAATGTAAGAGT
TTTTTATTGTCAACCAATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTGATAAAGTAT
AAGTTCATCTAAAATAGTTTTGTCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAATG
TAAAAGAATATTCTCGTCAGTCAAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCA
GTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCACTTAACG
TAATAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTAGTCAGATTAAGGGAGT
TTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAATCTCATTTAATGTAAAGGTT
TTTTCTTGTCAACCAATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTA
AGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCGTCTGTCAAGATGTTTATTTGATGTAA
GATTTGAATATCAAGTTTCAGTCAGTGGCAGACTCTTTACTGGCAGTCAA
ATCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGT
CAAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAAT
AGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAG
TTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGCTTAGGATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAA
GTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTC
AATGTAAACGATATTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAA
TAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTG
TCGTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTT
CAGTCAACGTCAAATAGTTTTGTCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAA
AGAGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGTTTCAATCAatataaaagtttttt
gttgtcagtcaagtcaagtcaagtttcagttaaaatccgggtcataatat
ttgagaaaaaaaggaaaattcccaTGAAATCTTATAGTCACAAACAATTT
CGAAGCGCtctggaagggtagagttttaacattagacttaagaccttagg
taggatctgaggatccaaaagtacaagaatggtccaatagcgCTTAGAAT
ATatcctggaagtctataaactcctcccgaattgaaatattcgattaaat
ttaacaaatagcccaaaagcgactttctcgcccgaactttaaatttaGTA
AACAAGGTAATAccgaaattctcaatatattttgaccgagagtGTAGAGT
AAAAGAGTTTTGTCGTCAGTAAGTTTGAAATTGTTTAATCATCAGTCAAG
CCAAGTTTAGTCAATTTCaaatagttttttcaaaattcagtcaAGTCAAG
TTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAG
TTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAATTCAAGTTTCAGTCAATGTC
AAATAGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACTACTTT
TTTCGTCAGACAAGTAAAGTTTCAGTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCA
GTCAAGTCGATTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCC
AAGTTAAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAG
TTTCAATCAATATAAATGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGT
TAAAGTAAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTTAGTCAATGTA
AAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGT
TTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTC
AGACAAGTCAAGTTTCAGTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGT
CGAATTTCAGTTAATGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTT
CAGTTAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTCAAT
TTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTcaaagtaaaata
attttgtcgTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTC
GTCAGTCAAGTCAAACTTCAGTcaaagtaaaataattttgtcgTCAGTCA
AGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAAC
TTCAGTcaaagtaaaataattttgtcgTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCA
AAGTAAAGCAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAA
TAGTTTTTTCGTCAATCAAGTCAAGTTTCAGTCAAAAGTAAAAGAGTTTT
GTCGTCAGTCAATTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAG
TCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAGTC
AATTTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTA
GTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTAAAGT
AAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCCAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGT
TTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATGGTTTTTTCG
TCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCA
AGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTT
TCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTT
AAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAA
AGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTT
TGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTC
AGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAG
TCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000379:259598..269028-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00021208 ID=TCONS_00021208|Name=TCONS_00021208|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9431bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000379:259598..269028- (Clytia hemisphaerica)
TCTAAAACATGAGGCTCGGATTTTTCTAAATTTGTTCTAGAATTTATGCT TAAAGCCTCGTGTTCTCATAAAAACTGTTCCTATAAAAATGAAGGCGATT TTCTTAAACGGAAAAATTGAAGTATTATCAGCATCAGTTAGTATAAAATG AAAATTTTTGAATATCTAAACCTATACAAAATATTGCTACAAATACACTT TGCCGATACAAAATTTGTTTTCAATCATTCCAAGTTATATATCATAGTCA TATAATATAAAAATGGTGTATCTCGTATAGATTCAATCACATAGAAAATA TTTGTCGTTAGCCAAAAAAAGTTCCACCGTTAGAAACTAATGTCTTGGTC GTCATTTCGTCAGTCTTTTTAAAGTTTTGTCGTCAGTCAATTTCGTCAAA ATTTTATCGTCAGTCAATTTGAAGTTTTGGTCAAAGTTTTTTAGTCAGTC TGTTTGAAGTTTTGGACAAAGTTTTTTCGTCAGTCTGTTTGAAGTTTTGG ACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGT CAGTCGGTTTAAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTAAGTCTGTTTAAAGT TTTGGTCTGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGTCAAAGTTTT TTCGTTAGTCTGTTTGAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTT AAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAA GCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTC TGTTTAAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGG TCTGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGTCAAAGTTTTTTCGT CAGTCTGTTTGAAGTTTTGGACAAAGCTTTGCCGTCAGTCTGTTTAAAGT TTTGGTCAAAGTTTTTTCGTCAGTCTGTTTGAAGTTTTGGACAAAGCTTT GTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTT AAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAA GCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTC TGTTTAAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTCAGTCAATTAGAAGGTTTGG TCAGGGTTTTATCGTCAGTCATTTTGAAGTTTTGGAAAAAGTTTTTTGGT CAGTCTGTTTGAATTTTTTATCAATAATTTTTTAGTGTGTCAATTTTGTA CTTTTGATCGAAGTTTAATCGTCAGTCAATTTGAAGTTTTGGTCAAAGTT TTGCCGTCTGTCTGTTTGTTTGAAGTTTTGGTCGTCAGTCAAGTTTAAGT CTTGGTCAGAATTTTGTCGTCGATCAATTTGAAGTAATCGACAGAGTTTT GTCGTCTGTAAATTTGAAGTTTTGGTCAGAGTTTTGTCGTCGGTCAATTT GAAGTTTTGGACAAAGTTTTTTCGTCAGTCAATGTGAAGTCTTGGTCAGA GTTTTGTCGTCTGTCAATTTGAAGTCTTGGTTAGAGTTTAGTCGTCTGTC AAGTTGAAGTTTTGCTCATTGTTTTGTCGCCAGTCAATTTAAAGTTTTGG TCAAAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTTAAAGTTTTGGTCAAAGTTTTGTCGT CAGTCAAGTTAAAGTTTTGGACAAAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCGAACT CTAGGTCAGAGTTTTATCGTCAGTCAAGTTGAAGTCTTGGTCAAAGTTTT GTCGTCAGTCAAGTTGAAGTCTTGGTCAGAGTTTTGTCGTCATTCAAGTT GAAGTCTTGGTCAGAGTTTTGTCGTCAATATATTTTAAGTTATTTAGTGA AAGTCTTGTCGTCAGTCTAGTCTATTGTCACATTGATAAAAGTCAGTATT GTTTCCAGATATGTAAGGTTCAGTTTTTGTCGTCAGTCTAGCCAATTTTT CAGTCAATATCTAAGGATTGCCAAGTCAAATTTCAGTCAAGTCGAATTAA TTTTTCAAGTTTCAATTCAGTTTTCAATTTTTTCAAGTCAAGTCTAAGTC AACATCAAGAGCTGTCAGTCAAGTTTCAGTCAGCGTAAAAAAGTTTTGCT TTTGGTCAACGTTAGGTCAAAGGTAATGTAAAAGAGTTTTGTTCAAGTTT CAGTCGATGCCAAAGCTTTCTTGCCAGTTAAGTCAAGTTTAAGTCAATGT CAGAAATTTTGTCGTCAGTGAAGTCAAGTTCAGTCAATGTTAATACTGTA TATTTTTTGCGTCAGTCAAGTCAATTTCCAAATTTTGCAATTAGTCAAGT AAGGTTTTTGACATTTTCAAGTCATATTCATCGATATTCATTTCCAAAAC CTTTTGGTAAACTAAGTTTGTCGCAAAACGTCAAGACAAGTCAATGTCAA AGATTTTCCTCGCTTTGTCGTCAAATCTTTTGCTGTCAGTTACAAGTTAG GTAAAGTTTCAGTTTATCTAAAGAAGCTTTGTTATCTATCATTTCCAGTC AATGTAAAATAAGGTGAAAGTCATAATAATTTTCGATTTCTTTCAAAAAC TTTGTCATGTAAAGTCGTTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTAGTCA GTCAAGTCAAGTTTCAGTCTATGTAAAATAGTTTTGTCGTCAATCAAGTC AAGTTCAGTCATAGTAAGAGAGTTTTGTCGTCAATCAAGTCAAGTTTCAG TCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAATCAAGTCAAGTCTCAGTCAATGTA AAGTAGTTTTGTCGTCAATCAAGTCAAGTCTCAGTCATAGTAAGAGAGTT TTGTCGTCAATCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTC AATCAAGTCAAGTCTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCAATCAAGT CAAGTCTCAGTTTTAGTAAGAGAGTTTTGTCGTTAATCAAGTTAAGTTTC AGTCATGGTAAAATAGTATTGTCCTCAGGTAAATCAAGTCAAGTTTAGTC AGAGTGAGAGAGTTTTGTCGTTAGTCAAGTTTCAGTCACTGTTACACTGT TTCAATGTTCTTTGTCAGACAAGGTCTTTAAAAGTCAAGACTTGTAAAAA GGTTTCATTCAACGATAAAGTCAAGTCAGGAGAAAGAGTTTTGTTGTCAG TCATGTCAAGTCAGGTTTAAGTCAATTTCTAAGTTTTTTTTGGGTCAGTC AAGTCGTTCGTTCAATAAAAGGTTTCAGTTAATGACAGAGACTTGGTTAT CAGTCAAGTCAAACTTCAATCAAAGATATAAAGTTTCTGATAGACAAGTC AAGGTATCAAAGTTTTTTATCAAGCTTTAGTCAATGGCAGGCACCTTTTT GTCAGTGAAGTTAAATTTCAGTCATTGACAGAAGTTTGCTTTCTGTCAAG TCAATGTAAAAGAATATTTTGTCAGTAAAATCTCAGTTTATAGGTTTCAG TCAATGTCAAATACTTCTGTCGTCAGTCAGAGTAAGTGTTAAGTCAAGTG AAGTTTCAGTCGGAATTAAAGAGTTTTTTCGTTAGTCAAGTTTCAGTTAC TGTCAAGTCAATGTTCTTTGTCAGACAAGGTTTCGTCTTTAATAAAGTCA AGACTTGTAAAAAAGTTTCATTAAACAATAAAGACTTTATTTTGAGTCGA AGCAAATCAAGTCAAGTCAATTTTCATTCAATGTAAAAAATGTTTTTGCA TCAGTCAAGTCAAGTAAGTAAGTCAATATAAATTCTCAATGTCTTAGTCA ATGACAGGAATTCATCGTCGGGTGACGGCTAGTTTCACTCAATATAATAG AGTTTTGTCGTCAGTTAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAAGGGAGTTTTTTT ATCAGTCAGTTCAGGTCAGGTCAGGTCAGCTCAGAGGTCTCATTTAATGT ATAAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTGTTATAAATTTTGTCGTACTA AAGTTTAAGTTCATGTAGAATAATTTTGTCATCTGTCAAGTCGAGTTTAG TCAAGTCGAGTTTCAGTCAATAAAAAAGACTTTTGTCGTCAGTCAAGTCA AGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTC AAGTCAGGTCAGGTCAGAGGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTC AACCAATTCATTGTTATAAATTTTGTCGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTA AAATAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGT CAATGAAAAAGACTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAAT GGACTTTTTTCATCAGTCAAGTTAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAG AGGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTATTAT AAATTTTGTCGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCATCA GTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTT GTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGT CAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGAAGTCTCATTTAATGTAAGAGT TTTTTATTGTCAACCAATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTGATAAAGTAT AAGTTCATCTAAAATAGTTTTGTCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAATG TAAAAGAATATTCTCGTCAGTCAAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCA GTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCACTTAACG TAATAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTAGTCAGATTAAGGGAGT TTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGTCTCATTTAATGTAA AGGTTTTTTCTTGTCAACCAATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAA GTTTAATTTCATGTAAAATAGTTTTGTCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTC AAAGTAAAAGAATATTGTCGTCAGTCAAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGT TTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTCTCACTT AATGTAATAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTAGTCAGAGTAAGG GATTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTCAGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTT TTCTTGTCAACCAATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAAG TTCATGTAAAATAGTTTTGTCGTCTGTCAAGATGTTTATTTGATGTAAGA TTTGAATATCAAGTTTCAGTCAGTGGCAGACTCTTTACTGGCAGTCAAAT CAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCA AGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAG TTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTT TTGTCATCGGTCAAGTCAAGCTTAGGATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGT TTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAA TGTAAACGATATTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATA GTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTC GTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCA GTCAACGTCAAATAGTTTTGTCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAG AGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGTTTCAATCAATATAAAAGTTTTTTGT TGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTTAAAATCCGGGTCATAATATTT GAGAAAAAAAGGAAAATTCCCATGAAATCTTATAGTCACAAACAATTTCG AAGCGCTCTGGAAGGGTAGAGTTTTAACATTAGACTTAAGACCTTAGGTA GGATCTGAGGATCCAAAAGTACAAGAATGGTCCAATAGCGCTTAGAATAT ATCCTGGAAGTCTATAAACTCCTCCCGAATTGAAATATTCGATTAAATTT AACAAATAGCCCAAAAGCGACTTTCTCGCCCGAACTTTAAATTTAGTAAA CAAGGTAATACCGAAATTCTCAATATATTTTGACCGAGAGTGTAGAGTAA AAGAGTTTTGTCGTCAGTAAGTTTGAAATTGTTTAATCATCAGTCAAGCC AAGTTTAGTCAATTTCAAATAGTTTTTTCAAAATTCAGTCAAGTCAAGTT TTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTT AAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAATTCAAGTTTCAGTCAATGTCAA ATAGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACTACTTTTT TCGTCAGACAAGTAAAGTTTCAGTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGT CAAGTCGAGTTTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTT GTCGTCAGTCAAGCCAAGTTAAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTC ATCAGTCAAGTCAAGTTTCAATCAATATAAATGAGTCTATTCGTCAGTCG AGTCAAGTTTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCCAG TTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTATCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGT CAATGTAAAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTC AAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGATATT TTCGTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAG TCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTCA AGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCACTCAACGTCAAAT AGTTTTGTCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTGTCGTCA GTAAATTCAATTTTCAGTCAGAGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAATC AAGTTTCAATCAATATAAAAGGTTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTCAAG TTTCAGTTAAAATCCGGGTCATAATATTTGAGAAAAAAAGGAAAATTCCC ATGAAATCTTATAGTCACAAACAATTTCGAAGCGCTCTGGAAGGGTAGAG TTTTAACATTAGACTTAAGACCTTAGGTAGGATCTGAGGATCCAAAAGTA CAAGAATGGTCCAATAGCGCTTAGAATATATCCTGGAAGTCTATAAACTC CTCCCGAATTGAAATATTCGATTAAATTTAACAAATAGCCCAAAAGCGAC TTTCTCGCCCGAACTTTAAATTTAGTAAGCAAGGTAATACCGAAATTCCC AATATATTTTGACCGAGAGTGTAGAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCTTTAAG TTTGAAATTGTTTAATCATCAGTCAAGCCAAGAGTTTAGTCAATTTCAAA CAGTTTTTTCAAAATTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAG TCTATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTC GTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCA AGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACTACTTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTT TCAGCTATTGTAAAATAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAA GTCAAGTTTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTC GTCAGTCAAGCCAAGTTAAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATC AGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAG CCAAGTTAAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCA AGTTTCAATCAATATAAATGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCA GTTAAAGTAAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTTAGTCAATG TAAAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATA GTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCG TCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAA GTCGAATTTCAGTTAATGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTT TTCAGTTAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTCA ATTTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAAAGTAAAA TAATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTG TCGTCAGTCAAGTCAAACTTCAGTCAAAGTAAAATAATTTTGTCGTCAGT CAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAA ACTTCAGTCAAAGTAAAATAATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGT CAAAGTAAAGCAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCA AATAGTTTTTTCGTCAATCAAGTCAAGTTTCAGTCAAAAGTAAAAGAGTT TTGTCGTCAGTCAATTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTC AGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAG TCAATTTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCT TAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTAAA GTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCCAGTTTCAGTCAATGTCAAATA GTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATGGTTTTTT CGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCATCGGT CAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAG TTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGT TTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTA AAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGT TTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCG TCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCA AGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_011870XLOC_011870Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00021208-exon-sc0000379-1575043694:264099..269028TCONS_00021208-exon-sc0000379-1575043694:264099..269028Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021208-exon-sc0000379-1575043694:262471..263800TCONS_00021208-exon-sc0000379-1575043694:262471..263800Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021208-exon-sc0000379-1575043694:259598..261066TCONS_00021208-exon-sc0000379-1575043694:259598..261066Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021208-exon-sc0000379-1510915933:264099..269028TCONS_00021208-exon-sc0000379-1510915933:264099..269028Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021208-exon-sc0000379-1510915933:262471..263800TCONS_00021208-exon-sc0000379-1510915933:262471..263800Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021208-exon-sc0000379-1510915933:259598..261066TCONS_00021208-exon-sc0000379-1510915933:259598..261066Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021208-exon-sc0000379-1491911889:264099..269028TCONS_00021208-exon-sc0000379-1491911889:264099..269028Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021208-exon-sc0000379-1491911889:262471..263800TCONS_00021208-exon-sc0000379-1491911889:262471..263800Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021208-exon-sc0000379-1491911889:259598..261066TCONS_00021208-exon-sc0000379-1491911889:259598..261066Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000379supercontigsc0000379:259598..269028 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.81317e-05 0 0 0 0 0 2.76168e-10 2.85099e-06 0 0 0 0.0407442 0 0.376081 0 2.97314e-07 0 0 0 0 5.31061e-06 4.07472e-10 0.0636807 0.156352 0 1.03815 0 0 0.234947 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00021208 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top