TCONS_00020198 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00020198
Unique Name	TCONS_00020198
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3083

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000350:7208..16722-
coding sequence from alignment at sc0000350:7208..16722-

transcript sequence

>TCONS_00020198 ID=TCONS_00020198|Name=TCONS_00020198|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3083bp
ATTATATCATGCAGTAATacttacatttttttaaatttttttttcagctt
tgGGAAGCTACAAATCAACAAACAGGATTAGAGATGAACTTAATCGAGTC
AACATCACCATTAATCGTGGCGGGCGTGCAGGGCGGaagtttcaattatt
ttgtaATCACGACTTTCAACCAGACCTCGTCTATTGGCGTTGGGAGAATG
GGTCGAGTATTTTTCAAATCGAAGGAGTCAACACAAAAGCATCTTTTAAT
TATCTTTATGAaggaaatcaaacaaaaaatgctcacattttgACCGTGGT
TTATTACTCTGAATATGATTTTGGTTATTATGAGTGCTTTGCTGTCAAAG
GTGATTACGTGTATCACGCGGGAAGATATGTCGGCGGTATCACGTACGTT
GACCCCGATGAAGAGGGCGAGAAAGGTGAGGCGTTGTGGAATGTAGTGGA
AGACATTAGCGTCACGCATACCTATGATAAGAACACCAAAACTCTCCAGT
TGACTTGTTTTCTTGATGATATCGCTTACAACGAGAGCAGTAAAATCTAT
TGGCTGAAAAATCGAAAGTTAATATACATTACCAATAAAAAAGGAGAGAA
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TCCGTTTGGATTATACGGGTCCGATTAAGGAAGATGTAAACGGTGGCTTC
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aaggggaaaaccatTTTCTGATCATGCATTCTGATGAAACCTTCGCCGAT
GACAAAAATAACCATAAATATCAGTTCTATAATTTacgaaaacaaatttt
gatCCCTGAAAGTTCACATTACTCGACGCAACCCATTCATTGTCGTTTTG
CGGCCGGGTGCACCGAACTAGTGATCAGTAACTTTGGTGAAGGGAATGTT
GGAATTTATGAGTGTTATGTCAAACCCATTGGAAGACCTCTCGTTAAAAC
GAATAACTACCAGAGTGAAGAACCTAACCCGAACAAGGCGTTGattgatt
ttcgtattttcgaTTCTGTTGAATGTGGAAATGCAGAGCCAAAACAAGGC
ATCGTGTGGACTGTCAACGATCAGATTCTTGTATTGGACTCAGACCTGGT
CATGGATAATGTGAATNGGACTGTCAACGATCAGATTCTGGTATTGGACT
CAGACCTGGTCATGGATAATGTGAATACGCTGTATAAACCACAAGGGCTC
GACGTCTTAGAGTTCCACAACATTAGTGAAATACAGAACGGGATTTATAA
GTGCTTTTTACGACAAAGTGGAGCTTTGTTATCCGTATATAACGTGGTTT
TGAAACCTGCCTCAGTATATGTCAACAAAACGGAAGAAAAGCTAGGTCAA
TTATTCAAAGTGATATGCCATTTTCCGAACCTAGAACCAGAGCTTGTTTA
CTTAACGAGAGGGACGGAGATTTATTACTATGATGGCATTAATAATGTGA
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CCACGTTCAACTTGGTGGTATTTATAAAGAAGAGAAGAGAATCCTGAGCG
CGTCCATTTCCATTGATCTAGAATCAGTCGCTGCCCCTTTGCAACCCAAC
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AATGATAGTTTGGCCATCAAGAATATCTTACCCAGTGATAATGGTGTTTA
CAAATGTTATTTCAGAGGcatcaaatttcaagaattcaCAATCAACGTTA
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AATGGTTATTGGTTAGGAGCTGGTATTGCCATTTTGATTGTTGGGTTGCT
CATCTTTGCTCTATGGTTGACCAGACTGCAGAAGGTGAAACCactaaaaa
aacattagaacgCAAGGTATCGAACAAAGATGGATAAGAAATCCTAACGG
TTGATTTATTGAAATTGTGAATATAACACAGAGTAGGATTGTCTTAAATT
TCACCGACACTTTATGGTTGATCGAACGAATGTAGGATAATATCAAAGGA
CATTATGAAAAATTCGTTTTCATGGATATATATAAACGGACTTCTgaata
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ttttgacataatcattactctcgatgtgtttgtacgagttccaatcccat
ccacctttgcgttaatctcttgCGTTAATtacatcatttgacaaaagata
tataacaacttgcacgtatctttaatgagccgcattgaattgtgggattg
caactcgtacaaatgtcaaaaaagtgaaaggTGTTGCGGAGATCTATTAG
AAATAATTTtgaatctcgtacccagagccacttgcaccacttttcgattt
tactgatggatattcttaattttgaattgttttagCCTGGGATCTGATAC
GAGGGGTCCTGTACCTTTCTCATTAACTTTATCAACGATCATAAATTGAT
TGATGTATATTTGCTACTGggttttgtatatatttatatgaatttttatC
TAAATATATAGAGTATATAATTTCCAAACCCGAATGTCACGCCGTTCACT
TCACCACTTTGATATACAGTTGCCGTTCTAATCTTCGATACGCTCTATGA
CTCGATAATATtggaaagtcaccgtcaacgaGA

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00020198-protein

>TCONS_00020198-protein ID=TCONS_00020198-protein|Name=TCONS_00020198-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=444bp
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NKTEEKLGQLFKVICHFPNLEPELVYLTRGTEIYYYDGINNVNDYSRYRG
HLNEEDYFLEVDYLDLSPGDVGNYTCHVQLGGIYKEEKRILSASISIDLE
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EETYKVVSTNDSLAIKNILPSDNGVYKCYFRGIKFQEFTINVIPPPVIET
TFFSNLNGQNGYWLGAGIAILIVGLLIFALWLTRLQKVKPLKKH

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000350:7208..16722-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00020198 ID=TCONS_00020198|Name=TCONS_00020198|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9515bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000350:7208..16722- (Clytia hemisphaerica)
ATTATATCATGCAGTAATACTTACATTTTTTTAAATTTTTTTTTCAGCTT
TGGGAAGCTACAAATCAACAAACAGTGAGTGTGGACCACTTTTCCTATTC
TCGATGATTCTCAAGCATTTCAATGCCTCTGGAATTAAGTAACTGTTGTT
TTCCAACAAATCTTTCCCTTTGAAGTTCCTTGTTAGCTGAAAGTTTCTTA
TAATCTCTATTTGTGCAAATCAATACTAGATTTCTTAACTCTTAACGCTT
TTATTTTTGAAGGGATTAGAGATGAACTTAATCGAGTCAACATCACCATT
AATCGTGGCGGGCGTGCAGGGCGGAAGTTTCAATTATTTTGTAATCACGA
CTTTCAACCAGACCTCGTCTATTGGCGTTGGGAGAATGGGTCGAGTATTT
TTCAAATCGAAGGAGTCAACACAAAAGCATCTTTTAATTATCTTTATGAA
GGTAAATTATTTTTCCTCATCTTACACGGATGATCTTTCGAGCTCGTGGT
CCACTACAGTGATTCGTACAATCCCTGAATTCCCGATCTCCGAGCAGATT
CTAACATGAATCCACTCTAAAGACCATGGCTCGGTAAGAGAATCTGCACG
AACTGGCTGATCTTCTATATAACCCAGATTTGGGATGCATATTAAATGTG
CTATTGAGAGCAGTGAATGGCTAAAGCAAAATAATTGCTCCAAAATCAAG
CGCCGATTATAGTCACGAATTGCATCCTGTAGAGAGCAATTAATCGTTAA
TCACACTCTTCAATGAGGCGCCAATATTTACAAAATTGATTTTAATGTTT
TTTCTTACATTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNTAATTGCATTCGAAATTTATTTTATGAGAAAGAAAATCAATA
AACAACAATAAAAGAAAGACATAAAGAGAAGAGAAAAATATAAAACTCTC
AGTATAATTTCTGTAATTTACTTTCTTAACTGGGAAAAAGTAGTGAAAGC
CATTGTGCGATTAGCTCGTAATCACATAATAACTCGTACAATTCGAAAAT
TGNAAGTAGTGAAAGCCATTGTGCGATTAGCTCGTAATCACACTCGTGAT
TTTTTTGTTTCGAATTTTCCTCGTCCTTTCGGACTCGGAAAATTAGTAAC
AAAAAAATCACTCGTGCAATTATATTCGAATTGCACTCGTTATCATGTGA
TTACATATACTAACTTTAAAACCAAGACGCTTACGTTTTCGTTTTCAAGC
AAAAGTCAACGCGGTTTTGAATTTTTTGGCTGGTCAGATCGTCACATTCA
CTATATCCCTTTAGGGCAGAGCTTGGTATGCGCAGAATGGTTCATTTGTT
AAGAGATTACTGAATTATATGAATTGTATTTATCAGTGAATTACATTTTT
CAATTTTGTGTCACCAAAGTACCAGTCTGTTCGACAATTTGATGCTTTGT
TTTTATTTTCAGGAAATCAAACAAAAAATGCTCACATTTTGACCGTGGTT
TATTACTCTGAATATGATTTTGGTTATTATGAGTGCTTTGCTGTCAAAGG
TATGCGTCTTCTCACAAACCCCGCTCCATTTTTTAATTCATGGTGGCTGA
CCAGTGGAGGAATAACACTCTTAACTTTATCTATACTATGAGAAACTGCT
CGATTTTTTCCAAGATCTGTTTATAAATCTTTTCGTATTGAAAAAAAAGG
AAAGTGGGGTACCCTCCTAAAGATCAGTGAAATTTTATGAAAGATCCACG
CGCTCTCTTGAAAATAAGCAAGAATCAAAGACAGGTCCCTTCAAAATGAT
AAAAAATCCAGGGGTTTACCTTTTGAAAGTAACCTACTGGGAGGGGTAAG
GTTTTTCTCTAGAATAGCCGTAATAATCCGTATAATTTTCGAATGTTTCC
ATAGGTGATTACGTGTATCACGCGGGAAGATATGTCGGCGGTATCACGTA
CGTTGACCCCGATGAAGAGGGCGAGAAAGGTGAGGCGTTGTGGAATGTAG
TGGAAGACATTAGCGTCACGCATACCTATGATAAGAACACCAAAACTCTC
CAGTTGACTTGTTTTCTTGATGATATCGCTTACAACGAGAGCAGTAAAAT
CTATTGGCTGAAAAATCGAAAGTTAATATACATTACCAATAAAAAAGGAG
AGAACTGGGGAATCGCTAATTACAAAGGTAGGTAGAAACATTACTTTTTA
TATTTATTAAAGGCCTCCCAAAAATCAGCCTACAATAATTTCTTACAAAA
TATTGCATTTAATTCACAGAAACTCTTCTCGTAAGGTTTTTAGCCTCGTT
CTGAATACATCTCAATTTCATAAAGAGACTATCAGATGATGTAAACACCC
CTTCTGACAGGGTGAACGGACGTTTCCCCGACGGAAACGATTCCCCGACG
GACGTTTCCCCGACGGACTTTTCTCGAACGGACGTTTCCCCGAATGGACG
TTTCCCCGGCTATGATCGGACATTTCCGGTTGGATTTTTTCAGTGAAAGG
GGCTAAAGTCTAGCCTTCTTCAATTTTTCAAACAAACAGTTGAAATAATT
ATTTTGAGCGTTCGATAACATAAATCCACAAATATCATATTTCTTTATAA
AAACACTAGATATGCTATCTGCTCACTGAGTTCCCTGGAGGTGTGTCCAG
TTTTGAGTTTGGGTTGTCCGCCATTTTTTTTTTTTTTTTGATTTGCCTTA
GAGATTTTTAAACGTCCGAATTTCAAAACATTCGAATCACGCTGTTGACG
ACCAGAGTTGGTAGTGGACTATATGGGGGATCCCAATCCAGTCAAAGTTA
GAGATCAGTTTTTCAATCTCTCATTTCTATCTTTTAGCCGCATTTTCAAA
CAGCTCCGATGAGTTCCGTTTGGATTATACGGGTCCGATTAAGGAAGATG
TAAACGGTGGCTTCACATGTAGTGTCTTCTTGGTGGTGACACCGGAACAA
CCGGACGATGTGGATACATTAGATCGATTACAGCCTTATCGCGTGGTGTA
TGTCGGTCAAACCCTAACAATTAATGAATTTGAAGATGGTAAGATGCAAC
CTCGTCACCGTGTATCCCAGGCTTTATTTACGTTACTGATTGATGTCAGA
GAAGATATATCTGACGCTATCAGTGAACATCAAAAGAAGCCGATAAAACG
CTGGGGGCGTGGTTTATTAGGACATGTAGATTCTCACTTAGTGTGATTAA
GCATCAGAATAGTGATGATAACTCCCGGCCGGCTTTTACTTAGTTGAGGA
TTAAGGGTTGTTTTTCAAGTCTGTTAAGTAACACAAAGCGCTCTCATTAA
ATGTAAGGGTATGGAAAATTTGGTAATTTCAACTATTCGATAAATTTTTT
ATTTAACTCTAGCACCAGCGGACTGAAGCTGTGTAGAGGGTTTTCTTATG
ATATATCGGTGAAGATGCTAGTTAATGCATATGAAATGATATCTTCTTTT
AGATATTTGAAGTTCTCATTTAGGTTTCATTTCTGCTAAGCATTTGTTCT
TTTCTTGAGTTGAAACTCTGCCTCCGGGTCTTGGCTATTAACAGGTGACT
AAAGTGATAAACTTTATTTTAGTTGAACATTTTCGATCAGTGCTTTAAGA
AGATAATTTTATCTATTTTACAGACCCGAATCCTTTTGAAATATCTGCCA
ATTTCAAAGAAAATGAACGAAAGTTAAGCTTGAAATGCAACTACAAGAGC
ATCGAGGGAAAACCCGAGTACGTCTATTGGAATTTCAAGAAGGAAGAAAA
AGGGGAAAACCATTTTCTGATCATGCATTCTGATGAAACCTTCGCCGATG
ACAAAAATAACCATAAATATCAGTTCTATAATTTACGAAAACAAATTTTG
ATCCCTGAAAGTTCACATTACTCGACGCAACCCATTCATTGTCGTTTTGG
TAAGTGGTTTTGAATTTATTTAAATTTCTTTTGCTACCATTAAATCTCTT
CAAATTGTTACAAAAATGTCTAATGTTCAGGCCCTGCTAAGAAAAAATTT
GATACATTTGACTTTTGGCGATTTTTCTTACGTGGGTAGAATCGGTTGTA
GCACTTCTAGCCAGATACTGTCTCGTACTTATACTTACACTTAATATATC
AAGACAAATGTATTAATTAATGTTGAAATAAGTAATAGTTATCGGACAGT
TGCGAGTTCAATATGAGAAATATTTCCATATTGTACGAGAAAATGTCGGA
TAACTGGTTTATCGGTGACCCAAAAAATGCACTTTTTGTGTTGGAAAAAA
GCGCTGCAGCTACCTGCTACAATGCAGCAACATCTTTATGTCATTTATAT
TTTGTACGTGTAAAATACAAGATATATTGTACTCTTTTTAACCAATCAGA
TTGCAGATATTTTTTGGATCGCCGATAACTCCTTTAAGAATGGGCTATTT
CAGAATGAGATTGACTCCCGTGTGGAGGAAGTTTGATATTCTATCAAGGG
TAATGATTCGCCTACCTTTTTGCTGGGGGTCAAAAATATTTTGCAAAAAA
AATAAACAGCTGAGTCTTTAGAACTAAACGAGAAATTTCAGATTAATTTT
CTAAATATGAAGACTTCAACATAGGTAAGAAAATAATTTCCGGGGGTACA
GGCATCAAAATAGGAGAGCTCAAATTGTAGGTCCGTTTGTTTTTTTCCTT
AGCGGCCGGGTGCACCGAACTAGTGATCAGTAACTTTGGTGAAGGGAATG
TTGGAATTTATGAGTGTTATGTCAAACCCATTGGAAGACCTCTCGTTAAA
ACGAATAACTACCAGAGTGAAGAACCTAACCGTAAGTAAAAAAATACTCT
CTTATTTGTTGCAAGGCGAGACCAAATTAATTTGTTGTTCTACGGGCCCC
TAGAAAAATTAATATTGAGTTGGAAAAGGTGGAGGATGGACTTGATAAGT
TTTTTGCAGATATTTTTAACTGAACAAGTTGAAAAAGTTTACATTCATTA
CAGAACTTAGATGAATTTAAAATACCACAATGGAAATGGTACGAAAGTCG
CCCATATTCAAAATCTTGATTAGAGGCTAACAACAAAAGTATGTTGTTTA
GTTGAAGCTTCCAAGCTGCTTGATCTGTTTAGCCCTGAAACGACGTGTCT
CGAGTTTACAGGGTCAATAAAACAGGGTTTAGGGGCTAAAACCATTCTTG
GTGGCAGCGAAGCCTTGCTCAATATAAGATTCAATTTTGAGCAAATTCCA
TGGCTTCTGGCCACCAACGATCACGTGATATCTCTAAGCCAATGAAATTG
TATAGAGTTCAGCTCAGAAGATGAGTTGACAGCACATGGACTTCAACATT
TTAATCAACTTTCTTTTAGCGAACAAGGCGTTGATTGATTTTCGTATTTT
CGATTCTGTTGAATGTGGAAATGCAGAGCCAAAACAAGGCATCGTGTGGA
CTGTCAACGATCAGATTCTTGTATTGGACTCAGACCTGGTCATGGATAAT
GTGAATNGGACTGTCAACGATCAGATTCTGGTATTGGACTCAGACCTGGT
CATGGATAATGTGAATACGCTGTATAAACCACAAGGGCTCGACGTCTTAG
AGTTCCACAACATTAGTGAAATACAGAACGGGATTTATAAGTGCTTTTTA
CGACAAAGTGGAGCTTTGTTATCCGTATATAACGTGGTTTTGAAACGTAT
GTTTACTTTTTGAAAGTTTATATACAATGCCTAGCTATGAATAAACAAGA
ATAATGCACAAAGTGTATCGGTAACACTTTGCTTAGCTGAAATAATATTG
CATAAGTAAATTGAACTGCACTTAGTTTTGTTATAACGGTTACTCTGTAC
CGCCCTCACTGTTAACTTCTGCCTAGTTAACACCCAGAGCCCTTCCTTGT
AAAAGATGTCTAGTTAACACCCTTCCTCGTCATCGCCCTTCCTTATTAAA
GATGTCTAGTTACGCCCTCCTTGGTAATAGCTACTATCCATTCTTTTTTA
CAGCTGCCTCAGTATATGTCAACAAAACGGAAGAAAAGCTAGGTCAATTA
TTCAAAGTGATATGCCATTTTCCGAACCTAGAACCAGAGCTTGTTTACTT
AACGAGAGGGACGGAGATTTATTACTATGATGGCATTAATAATGTGAATG
ACTATTCCAGATACAGAGGTAAGCACTTATCATATTTCAACACCAATGTC
ACAAAAAGCATATATATCAACGGAGTCGTTTTATTTGGAGATTTCGCTCC
AAATTTGCTCGTATCCAGCCCCTTAACTCTCTGTTTAACGATTCTAAATG
CGCTCACAATTATACCACGTTGTCCTGACAACAAGAGTCTTTTTGATTCG
ATTTACTTTTCTTTTATAAATCAAATTTTCACGAATAATATACACCATTT
GAACATTTACGTTGGGTGGCCAGTCATTTTAGATCATCTTTGAGGGGAAG
TCTCTTCCCAGCCCTCTCTCTCCTACAAGATACAAATTTGAGCCGACTCT
TTCCCAAGAGAGAGAAATTCCAGCCAGCTCTTTCCCAAGANTAGTCCTCT
CTCTCCTACAAGATAAAAATTTGAGCCGACTCTTTCCCAAGAGAGAGAAA
TTCCAGCCAGCTCTTTCCCAAGAGAGAGAAGTTCTAGCCGACTTTCCATT
ATTAAAAGATTCCTATCAGGACTATGACCTTTACAGATTGTGCAGAGACG
AAGTGAATTTCCTTTCTTGCTTTATTTAGGACACTTGAATGAGGAGGATT
ATTTCTTGGAGGTGGATTACCTTGACTTGAGTCCAGGAGATGTGGGCAAC
TACACATGCCACGTTCAACTTGGTGGTATTTATAAAGAAGAGAAGAGAAT
CCTGAGCGCGTCCATTTCCATTGATCTAGAATCAGGTGAGCGGCTTTGAT
ATAACACACTGACATCATAATTTTCGAATATGGAAGGAAGTTTCACTGTA
AATCATTACCATGATTTTGTTTTCAATTTACGATGCTATTATCACTTGCT
AATTGAATAGAATGCAGAAAGAAATCCTTTGGGGTTGTTTTGTAAATTAT
TAAGNTTGCTAATTGAATAGAATGCAGAAAGAAATCCTTTGGGGTTGTTG
TGTAAATTATTAAGCCCTTTTTTGGCGGGAAGACGTTTAAAATATCATTT
TTAATATCTCAATCAGGTCTGCTTCCTTTTTTTTCAGTCGCTGCCCCTTT
GCAACCCAACCAAGGAATGGAAATCCAGATTCAATGCAAAGTTCCCGAGT
CGACAACACAAGGCGAAAATTACAAATTATTCTGGTTCAAAGATGACCAA
TTGATAAACAATGGCAACAAGACTTTATTCAAAGAAGAAACATATAAAGT
GGTTTCAACAAATGATAGTTTGGCCATCAAGAATATCTTACCCAGTGATA
ATGGTGTTTACAAATGTTATTTCAGAGGCATCAAATTTCAAGAATTCACA
ATCAACGTTATACGTAAGTTATCAGTTACTCTTAGGTGCCAATTAAACGG
GGTTTCGAATAAAAGGGAGGGTTGGAAAAATTTTTCAAATCAAATAAACG
GGGAGTCCTCCCCGTTTATTACCGGGGGGGGGTTGGAAAATGGACTTTTA
AAAACCCTAAAAAGGGTCAAAATAGACTAAATTTAGGCTTTTTAGAGTAA
AACAAGAAACTTTCCTTTTGGGAGCTGGGAATTTTTTCAAAAATTAATAA
ACGGGGGGGGGGTCCTAATAACGTCCGGGAGGGTTAAAAAAACATTCCCT
CACGGAACATAATGTTAATATAAAATAAGATACAGTTGACGCTCTCTAAT
TCGATTTTCAAGTGATATTGGATTTTCATCGAATAAGCATATCGTATAAG
AAGAGCTTCGATTATAAGAGTTTCTTGTTGAAGGTGACTTTCAATATTAT
CGAATAATGGAGCGTAGCGAATAGTTGAATGAATGCTGGGTCAGAGAGCG
TCAGTTATACCTTTTTGTGAGAAAAACCGTCGGTGAAATTCACCACCAAG
TGATATTTTCGATAACCCACACCCAAATACACCCATCAACCGTTTACGTC
ATAATTGTGTCGGTTACGACTTCATCAGAGTCGAATCTCTGGTGAGTACG
TCAAAGACTTATTTTATCAATTGTTGTTTTAGCTCCACCGGTGATCGAGA
CAACTTTTTTCTCCAATTTAAACGGTAAGTCTTGAGTAAAAAATTACGCG
TTTTTTTTATATGTTGTCTCGATAAATGGAAATCTAAATTGTCTATCTTT
GCTATAAAAATTCAACCAACTCTCTGAAGGGGTTCCCAAAAATAAGAAAA
TCTAAATTGTCTTCCCACAAAAAGGGTCCTAAAAACGTCAAAAGGTTTCC
TTTCATAAGTTTCGATCTTTACTTGCAGACATATTTTCGTTTGGATTTTT
TTACCTTCTTAAGCTTCTTAAACTTCAGCCAAAAAACGGCTAAATAAAAG
GTTTGTGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGAATGTGTAT
CATTGTTTCAATTTTCCTTGATTAGTTTTGATAACCAGGTAGGCCCATAA
AAGTATCACTTGTTACTTGCAGACATTTTCGTTTGGATTTTTTTATCTTC
TTAAACTTCTTCATTTTACCGCTTAAGGTCAAAATGGTTATTGGTTAGGA
GCTGGTATTGCCATTTTGATTGTTGGGTTGCTCATCTTTGCTCTATGGTT
GACCAGACTGCAGAAGGTGAAACCACTAAAAAAACATTAGAACGCAAGGT
ATCGAACAAAGATGGATAAGAAATCCTAACGGTTGATTTATTGAAATTGT
GAATATAACACAGAGTAGGATTGTCTTAAATTTCACCGACACTTTATGGT
TGATCGAACGAATGTAGGATAATATCAAAGGACATTATGAAAAATTCGTT
TTCATGGATATATATAAACGGACTTCTGAATAGCGCACCGCGCTGAATAG
CGCACCGCGCTGAATCTAAAAATATATTTTATTTTTGACATAATCATTAC
TCTCGATGTGTTTGTACGAGTTCCAATCCCATCCACCTTTGCGTTAATCT
CTTGCGTTAATTACATCATTTGACAAAAGATATATAACAACTTGCACGTA
TCTTTAATGAGCCGCATTGAATTGTGGGATTGCAACTCGTACAAATGTCA
AAAAAGTGAAAGGTGTTGCGGAGATCTATTAGAAATAATTTTGAATCTCG
TACCCAGAGCCACTTGCACCACTTTTCGATTTTACTGATGGATATTCTTA
ATTTTGAATTGTTTTAGCCTGGGATCTGATACGAGGGGTCCTGTACCTTT
CTCATTAACTTTATCAACGATCATAAATTGATTGATGTATATTTGCTACT
GGGTTTTGTATATATTTATATGAATTTTTATCTAAATATATAGAGTATAT
AATTTCCAAACCCGAATGTCACGCCGTTCACTTCACCACTTTGATATACA
GTTGCCGTTCTAATCTTCGATACGCTCTATGACTCGATAATATTGGAAAG
TCACCGTCAACGAGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000350:7208..16722-

>TCONS_00020198 ID=TCONS_00020198|Name=TCONS_00020198|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=10680bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000350:7208..16722- (Clytia hemisphaerica)
GTCAAAATGGTTATTGGTTAGGAGCTGGTATTGCCATTTTGATTGTTGGG
TTGCTCATCTTTGCTCTATGGTTGACCAGACTGCAGAAGGTGAAACCACT
AAAAAAACATTAGCTCCACCGGTGATCGAGACAACTTTTTTCTCCAATTT
AAACGTCGCTGCCCCTTTGCAACCCAACCAAGGAATGGAAATCCAGATTC
AATGCAAAGTTCCCGAGTCGACAACACAAGGCGAAAATTACAAATTATTC
TGGTTCAAAGATGACCAATTGATAAACAATGGCAACAAGACTTTATTCAA
AGAAGAAACATATAAAGTGGTTTCAACAAATGATAGTTTGGCCATCAAGA
ATATCTTACCCAGTGATAATGGTGTTTACAAATGTTATTTCAGAGGCATC
AAATTTCAAGAATTCACAATCAACGTTATACGACACTTGAATGAGGAGGA
TTATTTCTTGGAGGTGGATTACCTTGACTTGAGTCCAGGAGATGTGGGCA
ACTACACATGCCACGTTCAACTTGGTGGTATTTATAAAGAAGAGAAGAGA
ATCCTGAGCGCGTCCATTTCCATTGATCTAGAATCAGCTGCCTCAGTATA
TGTCAACAAAACGGAAGAAAAGCTAGGTCAATTATTCAAAGTGATATGCC
ATTTTCCGAACCTAGAACCAGAGCTTGTTTACTTAACGAGAGGGACGGAG
ATTTATTACTATGATGGCATTAATAATGTGAATGACTATTCCAGATACAG
AGCGAACAAGGCGTTGATTGATTTTCGTATTTTCGATTCTGTTGAATGTG
GAAATGCAGAGCCAAAACAAGGCATCGTGTGGACTGTCAACGATCAGATT
CTTGTATTGGACTCAGACCTGGTCATGGATAATGTGAATNGGACTGTCAA
CGATCAGATTCTGGTATTGGACTCAGACCTGGTCATGGATAATGTGAATA
CGCTGTATAAACCACAAGGGCTCGACGTCTTAGAGTTCCACAACATTAGT
GAAATACAGAACGGGATTTATAAGTGCTTTTTACGACAAAGTGGAGCTTT
GTTATCCGTATATAACGTGGTTTTGAAACCGGCCGGGTGCACCGAACTAG
TGATCAGTAACTTTGGTGAAGGGAATGTTGGAATTTATGAGTGTTATGTC
AAACCCATTGGAAGACCTCTCGTTAAAACGAATAACTACCAGAGTGAAGA
ACCTAACCATGCATTCTGATGAAACCTTCGCCGATGACAAAAATAACCAT
AAATATCAGTTCTATAATTTACGAAAACAAATTTTGATCCCTGAAAGTTC
ACATTACTCGACGCAACCCATTCATTGTCGTTTTGGTCAAAATGGTTATT
GGTTAGGAGCTGGTATTGCCATTTTGATTGTTGGGTTGCTCATCTTTGCT
CTATGGTTGACCAGACTGCAGAAGGTGAAACCACTAAAAAAACATTAGCT
CCACCGGTGATCGAGACAACTTTTTTCTCCAATTTAAACGTCGCTGCCCC
TTTGCAACCCAACCAAGGAATGGAAATCCAGATTCAATGCAAAGTTCCCG
AGTCGACAACACAAGGCGAAAATTACAAATTATTCTGGTTCAAAGATGAC
CAATTGATAAACAATGGCAACAAGACTTTATTCAAAGAAGAAACATATAA
AGTGGTTTCAACAAATGATAGTTTGGCCATCAAGAATATCTTACCCAGTG
ATAATGGTGTTTACAAATGTTATTTCAGAGGCATCAAATTTCAAGAATTC
ACAATCAACGTTATACGACACTTGAATGAGGAGGATTATTTCTTGGAGGT
GGATTACCTTGACTTGAGTCCAGGAGATGTGGGCAACTACACATGCCACG
TTCAACTTGGTGGTATTTATAAAGAAGAGAAGAGAATCCTGAGCGCGTCC
ATTTCCATTGATCTAGAATCAGCTGCCTCAGTATATGTCAACAAAACGGA
AGAAAAGCTAGGTCAATTATTCAAAGTGATATGCCATTTTCCGAACCTAG
AACCAGAGCTTGTTTACTTAACGAGAGGGACGGAGATTTATTACTATGAT
GGCATTAATAATGTGAATGACTATTCCAGATACAGAGCGAACAAGGCGTT
GATTGATTTTCGTATTTTCGATTCTGTTGAATGTGGAAATGCAGAGCCAA
AACAAGGCATCGTGTGGACTGTCAACGATCAGATTCTTGTATTGGACTCA
GACCTGGTCATGGATAATGTGAATNGGACTGTCAACGATCAGATTCTGGT
ATTGGACTCAGACCTGGTCATGGATAATGTGAATACGCTGTATAAACCAC
AAGGGCTCGACGTCTTAGAGTTCCACAACATTAGTGAAATACAGAACGGG
ATTTATAAGTGCTTTTTACGACAAAGTGGAGCTTTGTTATCCGTATATAA
CGTGGTTTTGAAACCGGCCGGGTGCACCGAACTAGTGATCAGTAACTTTG
GTGAAGGGAATGTTGGAATTTATGAGTGTTATGTCAAACCCATTGGAAGA
CCTCTCGTTAAAACGAATAACTACCAGAGTGAAGAACCTAACCATGCATT
CTGATGAAACCTTCGCCGATGACAAAAATAACCATAAATATCAGTTCTAT
AATTTACGAAAACAAATTTTGATCCCTGAAAGTTCACATTACTCGACGCA
ACCCATTCATTGTCGTTTTGGTCAAAATGGTTATTGGTTAGGAGCTGGTA
TTGCCATTTTGATTGTTGGGTTGCTCATCTTTGCTCTATGGTTGACCAGA
CTGCAGAAGGTGAAACCACTAAAAAAACATTAGCTCCACCGGTGATCGAG
ACAACTTTTTTCTCCAATTTAAACGTCGCTGCCCCTTTGCAACCCAACCA
AGGAATGGAAATCCAGATTCAATGCAAAGTTCCCGAGTCGACAACACAAG
GCGAAAATTACAAATTATTCTGGTTCAAAGATGACCAATTGATAAACAAT
GGCAACAAGACTTTATTCAAAGAAGAAACATATAAAGTGGTTTCAACAAA
TGATAGTTTGGCCATCAAGAATATCTTACCCAGTGATAATGGTGTTTACA
AATGTTATTTCAGAGGCATCAAATTTCAAGAATTCACAATCAACGTTATA
CGACACTTGAATGAGGAGGATTATTTCTTGGAGGTGGATTACCTTGACTT
GAGTCCAGGAGATGTGGGCAACTACACATGCCACGTTCAACTTGGTGGTA
TTTATAAAGAAGAGAAGAGAATCCTGAGCGCGTCCATTTCCATTGATCTA
GAATCAGCTGCCTCAGTATATGTCAACAAAACGGAAGAAAAGCTAGGTCA
ATTATTCAAAGTGATATGCCATTTTCCGAACCTAGAACCAGAGCTTGTTT
ACTTAACGAGAGGGACGGAGATTTATTACTATGATGGCATTAATAATGTG
AATGACTATTCCAGATACAGAGCGAACAAGGCGTTGATTGATTTTCGTAT
TTTCGATTCTGTTGAATGTGGAAATGCAGAGCCAAAACAAGGCATCGTGT
GGACTGTCAACGATCAGATTCTTGTATTGGACTCAGACCTGGTCATGGAT
AATGTGAATNGGACTGTCAACGATCAGATTCTGGTATTGGACTCAGACCT
GGTCATGGATAATGTGAATACGCTGTATAAACCACAAGGGCTCGACGTCT
TAGAGTTCCACAACATTAGTGAAATACAGAACGGGATTTATAAGTGCTTT
TTACGACAAAGTGGAGCTTTGTTATCCGTATATAACGTGGTTTTGAAACC
GGCCGGGTGCACCGAACTAGTGATCAGTAACTTTGGTGAAGGGAATGTTG
GAATTTATGAGTGTTATGTCAAACCCATTGGAAGACCTCTCGTTAAAACG
AATAACTACCAGAGTGAAGAACCTAACCATGCATTCTGATGAAACCTTCG
CCGATGACAAAAATAACCATAAATATCAGTTCTATAATTTACGAAAACAA
ATTTTGATCCCTGAAAGTTCACATTACTCGACGCAACCCATTCATTGTCG
TTTTGGTCAAAATGGTTATTGGTTAGGAGCTGGTATTGCCATTTTGATTG
TTGGGTTGCTCATCTTTGCTCTATGGTTGACCAGACTGCAGAAGGTGAAA
CCACTAAAAAAACATTAGCTCCACCGGTGATCGAGACAACTTTTTTCTCC
AATTTAAACGTCGCTGCCCCTTTGCAACCCAACCAAGGAATGGAAATCCA
GATTCAATGCAAAGTTCCCGAGTCGACAACACAAGGCGAAAATTACAAAT
TATTCTGGTTCAAAGATGACCAATTGATAAACAATGGCAACAAGACTTTA
TTCAAAGAAGAAACATATAAAGTGGTTTCAACAAATGATAGTTTGGCCAT
CAAGAATATCTTACCCAGTGATAATGGTGTTTACAAATGTTATTTCAGAG
GCATCAAATTTCAAGAATTCACAATCAACGTTATACGACACTTGAATGAG
GAGGATTATTTCTTGGAGGTGGATTACCTTGACTTGAGTCCAGGAGATGT
GGGCAACTACACATGCCACGTTCAACTTGGTGGTATTTATAAAGAAGAGA
AGAGAATCCTGAGCGCGTCCATTTCCATTGATCTAGAATCAGCTGCCTCA
GTATATGTCAACAAAACGGAAGAAAAGCTAGGTCAATTATTCAAAGTGAT
ATGCCATTTTCCGAACCTAGAACCAGAGCTTGTTTACTTAACGAGAGGGA
CGGAGATTTATTACTATGATGGCATTAATAATGTGAATGACTATTCCAGA
TACAGAGCGAACAAGGCGTTGATTGATTTTCGTATTTTCGATTCTGTTGA
ATGTGGAAATGCAGAGCCAAAACAAGGCATCGTGTGGACTGTCAACGATC
AGATTCTTGTATTGGACTCAGACCTGGTCATGGATAATGTGAATNGGACT
GTCAACGATCAGATTCTGGTATTGGACTCAGACCTGGTCATGGATAATGT
GAATACGCTGTATAAACCACAAGGGCTCGACGTCTTAGAGTTCCACAACA
TTAGTGAAATACAGAACGGGATTTATAAGTGCTTTTTACGACAAAGTGGA
GCTTTGTTATCCGTATATAACGTGGTTTTGAAACCGGCCGGGTGCACCGA
ACTAGTGATCAGTAACTTTGGTGAAGGGAATGTTGGAATTTATGAGTGTT
ATGTCAAACCCATTGGAAGACCTCTCGTTAAAACGAATAACTACCAGAGT
GAAGAACCTAACCATGCATTCTGATGAAACCTTCGCCGATGACAAAAATA
ACCATAAATATCAGTTCTATAATTTACGAAAACAAATTTTGATCCCTGAA
AGTTCACATTACTCGACGCAACCCATTCATTGTCGTTTTGGTCAAAATGG
TTATTGGTTAGGAGCTGGTATTGCCATTTTGATTGTTGGGTTGCTCATCT
TTGCTCTATGGTTGACCAGACTGCAGAAGGTGAAACCACTAAAAAAACAT
TAGCTCCACCGGTGATCGAGACAACTTTTTTCTCCAATTTAAACGTCGCT
GCCCCTTTGCAACCCAACCAAGGAATGGAAATCCAGATTCAATGCAAAGT
TCCCGAGTCGACAACACAAGGCGAAAATTACAAATTATTCTGGTTCAAAG
ATGACCAATTGATAAACAATGGCAACAAGACTTTATTCAAAGAAGAAACA
TATAAAGTGGTTTCAACAAATGATAGTTTGGCCATCAAGAATATCTTACC
CAGTGATAATGGTGTTTACAAATGTTATTTCAGAGGCATCAAATTTCAAG
AATTCACAATCAACGTTATACGACACTTGAATGAGGAGGATTATTTCTTG
GAGGTGGATTACCTTGACTTGAGTCCAGGAGATGTGGGCAACTACACATG
CCACGTTCAACTTGGTGGTATTTATAAAGAAGAGAAGAGAATCCTGAGCG
CGTCCATTTCCATTGATCTAGAATCAGCTGCCTCAGTATATGTCAACAAA
ACGGAAGAAAAGCTAGGTCAATTATTCAAAGTGATATGCCATTTTCCGAA
CCTAGAACCAGAGCTTGTTTACTTAACGAGAGGGACGGAGATTTATTACT
ATGATGGCATTAATAATGTGAATGACTATTCCAGATACAGAGCGAACAAG
GCGTTGATTGATTTTCGTATTTTCGATTCTGTTGAATGTGGAAATGCAGA
GCCAAAACAAGGCATCGTGTGGACTGTCAACGATCAGATTCTTGTATTGG
ACTCAGACCTGGTCATGGATAATGTGAATNGGACTGTCAACGATCAGATT
CTGGTATTGGACTCAGACCTGGTCATGGATAATGTGAATACGCTGTATAA
ACCACAAGGGCTCGACGTCTTAGAGTTCCACAACATTAGTGAAATACAGA
ACGGGATTTATAAGTGCTTTTTACGACAAAGTGGAGCTTTGTTATCCGTA
TATAACGTGGTTTTGAAACCGGCCGGGTGCACCGAACTAGTGATCAGTAA
CTTTGGTGAAGGGAATGTTGGAATTTATGAGTGTTATGTCAAACCCATTG
GAAGACCTCTCGTTAAAACGAATAACTACCAGAGTGAAGAACCTAACCAT
GCATTCTGATGAAACCTTCGCCGATGACAAAAATAACCATAAATATCAGT
TCTATAATTTACGAAAACAAATTTTGATCCCTGAAAGTTCACATTACTCG
ACGCAACCCATTCATTGTCGTTTTGGTCAAAATGGTTATTGGTTAGGAGC
TGGTATTGCCATTTTGATTGTTGGGTTGCTCATCTTTGCTCTATGGTTGA
CCAGACTGCAGAAGGTGAAACCACTAAAAAAACATTAGCTCCACCGGTGA
TCGAGACAACTTTTTTCTCCAATTTAAACGTCGCTGCCCCTTTGCAACCC
AACCAAGGAATGGAAATCCAGATTCAATGCAAAGTTCCCGAGTCGACAAC
ACAAGGCGAAAATTACAAATTATTCTGGTTCAAAGATGACCAATTGATAA
ACAATGGCAACAAGACTTTATTCAAAGAAGAAACATATAAAGTGGTTTCA
ACAAATGATAGTTTGGCCATCAAGAATATCTTACCCAGTGATAATGGTGT
TTACAAATGTTATTTCAGAGGCATCAAATTTCAAGAATTCACAATCAACG
TTATACGACACTTGAATGAGGAGGATTATTTCTTGGAGGTGGATTACCTT
GACTTGAGTCCAGGAGATGTGGGCAACTACACATGCCACGTTCAACTTGG
TGGTATTTATAAAGAAGAGAAGAGAATCCTGAGCGCGTCCATTTCCATTG
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GGTCAATTATTCAAAGTGATATGCCATTTTCCGAACCTAGAACCAGAGCT
TGTTTACTTAACGAGAGGGACGGAGATTTATTACTATGATGGCATTAATA
ATGTGAATGACTATTCCAGATACAGAGCGAACAAGGCGTTGATTGATTTT
CGTATTTTCGATTCTGTTGAATGTGGAAATGCAGAGCCAAAACAAGGCAT
CGTGTGGACTGTCAACGATCAGATTCTTGTATTGGACTCAGACCTGGTCA
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GCTTTTTACGACAAAGTGGAGCTTTGTTATCCGTATATAACGTGGTTTTG
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TGTTGGAATTTATGAGTGTTATGTCAAACCCATTGGAAGACCTCTCGTTA
AAACGAATAACTACCAGAGTGAAGAACCTAACCATGCATTCTGATGAAAC
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GATTGTTGGGTTGCTCATCTTTGCTCTATGGTTGACCAGACTGCAGAAGG
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CTTTATTCAAAGAAGAAACATATAAAGTGGTTTCAACAAATGATAGTTTG
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AGAGAAGAGAATCCTGAGCGCGTCCATTTCCATTGATCTAGAATCAGCTG
CCTCAGTATATGTCAACAAAACGGAAGAAAAGCTAGGTCAATTATTCAAA
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GTTGAATGTGGAAATGCAGAGCCAAAACAAGGCATCGTGTGGACTGTCAA
CGATCAGATTCTTGTATTGGACTCAGACCTGGTCATGGATAATGTGAATN
GGACTGTCAACGATCAGATTCTGGTATTGGACTCAGACCTGGTCATGGAT
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GTGGAGCTTTGTTATCCGTATATAACGTGGTTTTGAAACCGGCCGGGTGC
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CTGAAAGTTCACATTACTCGACGCAACCCATTCATTGTCGTTTTGGTCAA
AATGGTTATTGGTTAGGAGCTGGTATTGCCATTTTGATTGTTGGGTTGCT
CATCTTTGCTCTATGGTTGACCAGACTGCAGAAGGTGAAACCACTAAAAA
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CAAAGATGACCAATTGATAAACAATGGCAACAAGACTTTATTCAAAGAAG
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TCTTGGAGGTGGATTACCTTGACTTGAGTCCAGGAGATGTGGGCAACTAC
ACATGCCACGTTCAACTTGGTGGTATTTATAAAGAAGAGAAGAGAATCCT
GAGCGCGTCCATTTCCATTGATCTAGAATCAGCTGCCTCAGTATATGTCA
ACAAAACGGAAGAAAAGCTAGGTCAATTATTCAAAGTGATATGCCATTTT
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GCAGAGCCAAAACAAGGCATCGTGTGGACTGTCAACGATCAGATTCTTGT
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TATAAACCACAAGGGCTCGACGTCTTAGAGTTCCACAACATTAGTGAAAT
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CCGTATATAACGTGGTTTTGAAACCGGCCGGGTGCACCGAACTAGTGATC
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CATTGGAAGACCTCTCGTTAAAACGAATAACTACCAGAGTGAAGAACCTA
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TCAGTTCTATAATTTACGAAAACAAATTTTGATCCCTGAAAGTTCACATT
ACTCGACGCAACCCATTCATTGTCGTTTTG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_011343	XLOC_011343	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00020198-protein	TCONS_00020198-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000350	supercontig	sc0000350:7208..16722 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR003599	Ig_sub
IPR013783	Ig-like_fold
IPR013106	Ig_V-set
IPR007110	Ig-like_dom

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00020198 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00020198 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00020198 (transcript) - C. hemisphaerica