TCONS_00019761 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00019761
Unique NameTCONS_00019761
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2800

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00019761 ID=TCONS_00019761|Name=TCONS_00019761|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2800bp
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AAAAATATGAAGTCTTTCAAACCATCCAACACTGAAGTTGTTCTATATTC
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TACTGTAAATATTATGGACTGTTTTGTTCATTTGTTTAGGAGGAAGTTAG
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CTAGTATACCAGATAACTCTATCTCCTGCGTTGTTAGTTTCCACGCGTTG
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GATGCCGGGTGGGAAGTATTATTTCATCGAGCACACAGTTGAAACAAATA
GATTCACATTTTTATGGTTGGCCCAATTAAATTTCAGCTTATCCTTGTTC
ATGTATGCATGCTGTTTGAAAAAGATGGAAGAGTCTATTGAGCATGCGCG
ATTCTCCAAGttaacaatcaaacaaagaaatgtcAGTATGCGTAACGCAA
GAGGTCCAATGTTTGCTTTGACTCCTCATGTTTATGGATATGCTATCAAA
TAAAATGCTGGAACATTTTACGTAGAGAGATCAATTATTTGTTGCCCTAA
GATGTGTGCTTCCAGAAATGACTTATAAAAAGATGTATGGAAAGATAGAA
ACCTCCAATGCACTTTTGGTTGAAACATCAAAACGAGGCCATTTTGCTGA
AacgaagaaaaatcaaatattattttttttcttaagatGGTGTGCTTCCA
GAGATGGTGGATAGTAAGTTGTATGGAAAGATAGAAACCTCTCATGCACT
TTTGGTTGAAACATCAAAACGAGGCCAATATACATGACGTCACTAATCCG
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TTTTTCATTCACatcattcattttattttgcatTTGTTATTACCAACGAT
TGTTTCATCGTAAATTATTTATCAATCGAATGAATCGAATAAAATTATCG
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00019761-protein

>TCONS_00019761-protein ID=TCONS_00019761-protein|Name=TCONS_00019761-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=356bp
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KMVQQV
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000335:290874..298099-

Legend: exonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00019761 ID=TCONS_00019761|Name=TCONS_00019761|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7226bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000335:290874..298099- (Clytia hemisphaerica)
GTAGTATATAATAAAAAGCAAGCACAAATGAATGATGCAACAAAAAATGT CACCTTGTTTGGTGTGGATATTTCCAGATTCAACAAAGCAAGACAATTCT TCATCTGTACTTGTGGAATATTTTCATTTTATTTACTCTATGGATATTAT CAGGTAGGGAATGGATTATTGATTATTGAAAAACTTGGTTAAACCATCTC CTTGATGCGTGGCTTGTAAAACTAACCGCGGGTATTTCACTTGATTGTGT CATTTTTCTAAAGCTCTTTTCGTTTGAATCAGACTTGTCATTTCTTCATA TTATATGTACTAGTCTCCACTCATTTCAAATCAGTTTTTTTCTACGATGG ACCAAACAGCTGATTGGTTGTAAGTGACGTATTGACTAGTTTTACATCAC TTACAACCAATCAGCTGTTAGGTCTATAATTTATTTATGCCTGAATACAT TGCAATGATTCATATCATGAATAGTGCCTCTGTCTTTTAGCTTAATGTTA TCGTGATTACATATTTCTTTCTTACAGGAGCGGATTTTCCTAATACCTGG CTTCAAGCCTCATGGTTGGTTTCTAACATTGGTTCAATTTGCTTTCTACA CTTGCTTTAGTGTCATTGAAAGTCTTGCTTTATCCATTAAACTTGAGAGA CGGTAAGCAATTTTAGTAATCAACGTCAGATTTCCTTTGTCAGCCCAAGG CAAGTTTCAAACCAGGGTTTGAGCATTTCTTTTTGATAGGAGCTGGTAAA TATTTATCGAGTAGCAGAAAAGCCATATCTTTCCGTCATTGGCTTGACTT GAATCTTAAAAATTAGTATCTTTTTACGAGATATTAAATTTTACTAATGT GGTCATCTTTGGCACTGAGATCACCCTTAACATGGAAATTTCATGTTTTC AAATATTTCCAACCCCACAAACAGAATAGAATGGTAAGATGGAAATGGTC TTACTTTTTCAAAACACTTGTTTTAAGATCGAAAATTCAGTTAGCAAATG TTTTTCATTTTTAACAGCATTCCTATGAAGACATATTTCATTTTGGCATT TCTAACAGTTGGTACAATGGGTATGTCAAACGCCTCCGTTGGTTATTTGA ATTACCCAACACAAGTTATCTTCAAATGTTGTAAACTCATACCTGTCATG ATCGGTGGCATCCTTATCCAAGGTATTATTTTAGATATGGATCGCGGAGG ATTCTTAAAATGAATTTTTATCATCTAATTATAGGTTCATCTTAAAGATG GTGATAACAGAAAAAGAACGAGGGGTCATTTATTAAAATTGGTGCATTCC TCGTCCAGATATTTCGGGAAACTTGATTTTGTCACTTTTCCAATCTTTTT ACTCCCGTCTCGCGCGAACTATTAAATTAGATTAACTTGAATAAATTGTG TCTCTTTCAATTTTGTTGTATACAGTCGAAATCGCTACTTTCTACTGATT ACCAAGAAAAACTATACATGTTTGTCAAGATATTGTGAGCTTACAGTTAA AGATTGTTTGCTGATATTTTTTATGAGGAAAGCTCACTGTAATTTTGATA TATAAAACTTTAAAATCGGTTCGGTTAAACAAAAGTTATGAGTAAGAAAC TAAAAGTTTTTGACCTACCAAGAATGACAAAATTCATTCTTTTTCTTGGC GCACCCGGTACAACCCTCTCTAAGTCGTCAACCGTTTCAAAGTTTTCAGC GCTTTGACAAGCAGATTATTCAATTTCGATTTGAATTTGATTTTCCTTTG TAAAAGTACTTTCATTGACCCATTTTTCTTCTTTTAGGCAAACGTTACGC AACACTGGATTTCATTTCATGTTTATGCATGAGTGTGGGTTTGACACTCT TCGTTTTAGCTGACTCAGCAGTTCAACCAAATTTCAATATTACAGGTATT AGTTTTTTCGTTTGCTAGTTTTTAATTACTTTTTTCTTCCGTCGAAACAA AAATTTACTACGTTTATGACTAAGTCGTTATATATCGCTGCAGCCCATGC TACCACACGCTCACTTTATGGTTTCCAAACCACTCTCTCGTGACATTTAT ATTTATAAAAGAATTTTTCCAAGTATTATTCTAACTTTTCTTGAGACACC TCAAGAAAGGCAAATACTTTCCAGTTTACTTTAGCACGCAAGCAAAAAAA AAAAACAAAAAAAAAACAGGCCAAAGTTTGATCAGCAAGCTGTGATAATT ATAACTGGTTAGATTAGTACAAAAATGGCGTTTTTCTATTTTTCAAACTT TTTTATCTCTTTTCTTTCTAGGGATAATAATGATGTCATTAGCGTTATGC TCGGATGCAGCCATCGGTAATGTCCAAGAGAAAAATATGAAGTCTTTCAA ACCATCCAACACTGAAGTTGTGAGTAATGCTCGATGTTCCTTATTTCTCC GTTGGACTACGTAAAAGGCTTAATTTATGTGGCTTTGGTTTTATTGTTGA TATACTGGGTGGTCCAAAAAAGTGTCCATACAATTCAAATTTGATGTATG TAGCAAGTTCTATTGGCCCTATTGAATTTAAATTTGGTACAGACAATCTT TCACATAACTCTGAACATCCCTCAAAATTTCATTTTCAGAAAACAATTTT TCGAACAGTTATAAGGTTTTAAAATTCGGGGGTCAAAATTAGGTACATGG TTGGTTTATTCAAGACTGGACTTTATTTCATTCATCGAAAATGGGGGTTT CTTTATTATACACTTCGTTCTTCTTTTAACAGGTTCTATATTCATATGGT ATTGGATTTTGTTACATGTTTGTCATATTGATGTTCACTGGTTCACTTCA AGCTGGTTTTATGTATTATCTGAAGGTAGTGCTGTTCAAAAGGTCTCTGA GAGCAATGTTTAAATTGCTACCCCGAATCACTTTATTTCTAGTTACCAAT TTCTCATTAGTTAGGAATAAGCTAGGTCTCATCCATGCTATATCCGCCAT CTTTGATCGAAGTTTTTTTGAAAGTTGGTACCAATGAAGTATAAGCCCGA AGGGCTAGAAGTCAATCTCCTTGGTAGGATTTGAAGCCAACAAATCCTAC CAAAGTTGCGCGGCCTTGAGCGGCTCGCCTGGTTTTTACACAAATGACAG ATTGAAACTAAAATTTACCGCTAAGTTTCGAAAAAAATATCAATCGTAAA CTATTTATTTTAACTAATTGCTAGATTCAATCTGTCGTCAAAAATGCGGC GCATTTTTTAAGGCTCTACTTTTTCTTGCCTGAGAAAGGTTAGGGATTGA ACTCTAGCCCTTCGGGCTTTAAACTCAATGGTTGGTACCCGCAAAGAACC CATTGTAGTGTTTGAAACTTTGCCTAACGACAAACGGCGCTGCGTCATTA TTTTACAAGCGAAACTAGATCTAGCGCTCTCTCCGCGGGTACCGCTTGGT CCAGGGATATATAAAAGTGGTCTCATCGACTTGACTCGAGACGTTTTTTG AACTGTTTTGTTAATGTCTTGTTCTTTCTTCTACAGATATTCCAATTTTC ATTTTTTACTTTTTAGAATCCATTGGAAACGTATGGTTACTCGTTAGTGT TTTCATTGACTGGTTATCTTGGCATCAGTTTTGTGTTGACTTTCATTCGA TTATTTGGTGCACTGATGACCGTCACAGGTAGAACATTTTTTTATATTAC GGTTAACCCACCAAAACATAAAGGTTTCTTGGCCAACCATGTGACATAAT GTGAATTCTAATAAATTTTTCCGTTTATTATAAAGAGACTAGGGGTCCAT TTGTTTCAGCACCATTTATGCCACTTATGCCACCTTTTTCCCATTTGTTT TATCGAAATGTGTTCAAAAGTGTTAAAAAATACTTACATTTTTACCACCT CAATTTACATTGATCATTTGTGTTCTTTGTGTCAAAGTGGAAGTTTGCCA AGCTTTTCCAAGCAAAAAGAAATTCGCATTTGTTTCTACATTCTGGGTCA AAAGTGGAGAGTAAATTGTAAATGGCGGCAATAATCGAATGCATAATTAC GATGCGTTTCACTTTCGTTTTCTTGTTAGTTTGTTTACATTTCCGACATA ATTTATGCGACCATTATTGACGTAACTAAGAGTTTGCAAGATGGTAGACT TTTGCATTTTAACACGGTTTCCATTTGTTTCAAACGATGGTGGCATTTGG GGGAAAAGTGGCTCAAAAGTGAAATTAATTTTTAAGAAGTCCAAAAAAAA ACAGCAAAGAAGAGGTTATCAGTTGAACACAGTTCTATTTATATACAGAG TATCTTGCGTTTTCTCTGTTTGACTTGCATTAGGACAGGACAGGTGACTT TTTGCTTCGTTTTTTTTCATTATAGATATTTTCGATTTCTCTTTATAGTG ACGACTTGTCGGAAGGCACTGACTATCATAATATCTTTTACTGTCTTCTC GAAGCCTTTCACTATACAGTAAGCTACTTCTATTATAACTGTTTTTACTA ACTAGTCAAATGAATTTACGTACCCATGTCCCAACCACAGATATCTGTAA AGCCCGAAGGGCTAGATAGGCAACTTTAAGCTTTCTCCAGCAAAAAAAAG TGAAGCAAAAATTTGACTTTTTAAATTTCGTGCCGATGGATAGGATCTAG CATTTTAATTGTTTTCGGAGGGCGAGATCAAAAAAAGTAGGCGGCAAACG CTATTTCACATCTCTCAAACCAGTGAAATTGCATATTTTAGTCACGTGAC TCTGGTAGGAAATCCTTCCAAAGATGAGCTTCACTTTTTGACCAAGGCCG CAAATCTAGCCCTTCGGGCTTTACAGATCTGTGGTCCCAACAAAGCTTTT AGAAAGGCCTCTTTTTGTAGTGGCTCCTGTTCATTACGTGAGCTTTTTCA TGATATGCACCATATTGCAATGTCCTCTGACATTACATCATGGACCCAAC AGCTGATTGGTTGCAAGTGACGTATTGATGGGTTTTACGTCACTTACAAT TAATCAGCTGTTGGGTCCGTGATGTTATGTCAGAAGACATTGCAATGATG CATATCATGAATGGGGCCTTTTTACGCCGACCCTAATATAAAATGTATAC CGAGTTTATCGTTCTACATCTGCAATTTGAGCTTTACTAAGCTCATTTGA CGTCAATCGGTATTTCGATTATCAGCCGGATCGAGAGAGAATGATATATG AGTGAAGGTAGAGAGTCTATCACCATATTTCCCTAATACCCTGCCTGGCA GTACTTAGGATTCGAACACTTGCGGCGTAAGTTTGTGATCGAAACCTTCA CACTACCTAATGTAACAGCACTCCTTTTTGTACCTACAAGTGAAAAACAC CACTAAGGCCTGGCCTGATGGATTTCTGTTTCTGTTCTAGATATTTATGG TCGGGTTGTATCGTGCTTCTTGGTATCTTTTTAAACGTATACAAGAAGAA TGAACAAATTATGAACACTAAGATATTATCCATGATTCATTGGCTAAGTA ACAAGTTAAATAGTCAACACTATGGGAAAATGGTACAACAAGTTTGACGA CTTGTAATATTTTTCTGACAATATTAATCGGAGGTTTTAATCGGATTTAG GTAGATTTTGAGATATTTTTAGGTATTTATTGTTAGTATATTTATTCGAA AATTATTTTTCATATCATGACTTTTGTACTGTAAATATTATGGACTGTTT TGTTCATTTGTTTAGGAGGAAGTTAGTCTCTTTTGGGAAGTTCGCAATGT TCTGCACACCTAGTAAATTTCATATTATCTTTCCATCTTTTTTTTTCTAG ATTAAAAAAAAACAGGAAAAATGTCAACCAATATTATCATCTCCGGTATA ACAGCTTTCTCAGCTATCCAAGTATTTGATGGTGGATTTAGTAGCATTTC AGATGTAGTTGAAGAAATTGGTAATTTTGGTTCTTGGATCCATTCACAAA TGCCAGAGAATCGTTTCTTACGAACGTCAATATACACAATCAGCGCGGTC GCTTTTGTACGCTCTTTACCGTTCATTCTGCNTCAATATACACAATCAGC GCGGTCGCTTTTGTACGCTCTTTACCGTTCATCCTGAGGAGAACTGAATT CTTCCGATATTTTGAAGAAGAGTGTTATTTCTTTCATAGAACTTGTAGCA AACCAGAAGTCATGGAAATGAAAGAGGAACTATTGAAGGAATTAAAGAAC GCAGATTTAACATCTGATAAATTTCCACTAATCAATGATAAATTGACCAT ATTGGAATTGAATATAGGGTCTGGTACTAATTGTTCATATTACCCTGACA ATGCTGTTGTCATAGGAACCGATTTTATAGAGGAACAAAAGGAAAACATT GAGAATAATTTTCTATTCAACGATGATGAACGTTTAACCCTTGATCGTTA TATTCCTACGCGTGTTGAAGAGTTAGCTAGTATACCAGATAACTCTATCT CCTGCGTTGTTAGTTTCCACGCGTTGTGCAGTGCACGTCAGACTAGTCGT GCTTTGTCGGAGATCAAAAGAGTTTTGATGCCGGGTGGGAAGTATTATTT CATCGAGCACACAGTTGAAACAAATAGATTCACATTTTTATGGTTGGCCC AATTAAATTTCAGCTTATCCTTGTTCATGTATGCATGCTGTTTGAAAAAG ATGGAAGAGTCTATTGAGCATGCGCGATTCTCCAAGTTAACAATCAAACA AAGAAATGTCAGTATGCGTAACGCAAGAGGTCCAATGTTTGCTTTGACTC CTCATGTTTATGGATATGCTATCAAATAAAATGCTGGAACATTTTACGTA GAGAGATCAATTATTTGTTGCCCTAAGATGTGTGCTTCCAGAAATGACTT ATAAAAAGATGTATGGAAAGATAGAAACCTCCAATGCACTTTTGGTTGAA ACATCAAAACGAGGCCATTTTGCTGAAACGAAGAAAAATCAAATATTATT TTTTTTCTTAAGATGGTGTGCTTCCAGAGATGGTGGATAGTAAGTTGTAT GGAAAGATAGAAACCTCTCATGCACTTTTGGTTGAAACATCAAAACGAGG CCAATATACATGACGTCACTAATCCGATTGTTCTTGATTGTTTATGTTTT AAATGCACTTTTTTATAGCCTTACATTTTTTCATTCACATCATTCATTTT ATTTTGCATTTGTTATTACCAACGATTGTTTCATCGTAAATTATTTATCA ATCGAATGAATCGAATAAAATTATCGAATATTCTCCCTGGGTGTAATTCA AAAGGTTACTGTAACATTTATTACTC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000335:290874..298099-

>TCONS_00019761 ID=TCONS_00019761|Name=TCONS_00019761|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=9639bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000335:290874..298099- (Clytia hemisphaerica)
ATATTTATGGTCGGGTTGTATCGTGCTTCTTGGTATCTTTTTAAACGTAT
ACAAGAAGAATGAACAAATTATGAACACTAAGATATTATCCATGATTCAT
TGGCTAAGTAACAAGTTAAATAGTCAACACTATGGGAAAATGGTACAACA
AGTTTGATGACGACTTGTCGGAAGGCACTGACTATCATAATATCTTTTAC
TGTCTTCTCGAAGCCTTTCACTATACAAATCCATTGGAAACGTATGGTTA
CTCGTTAGTGTTTTCATTGACTGGTTATCTTGGCATCAGTTTTGTGTTGA
CTTTCATTCGATTATTTGGTGCACTGATGACCGTCACAGGTTCTATATTC
ATATGGTATTGGATTTTGTTACATGTTTGTCATATTGATGTTCACTGGTT
CACTTCAAGCTGGTTTTATGTATTATCTGAAGGGATAATAATGATGTCAT
TAGCGTTATGCTCGGATGCAGCCATCGGTAATGTCCAAGAGAAAAATATG
AAGTCTTTCAAACCATCCAACACTGAAGTTGCAAACGTTACGCAACACTG
GATTTCATTTCATGTTTATGCATGAGTGTGGGTTTGACACTCTTCGTTTT
AGCTGACTCAGCAGTTCAACCAAATTTCAATATTACAGCATTCCTATGAA
GACATATTTCATTTTGGCATTTCTAACAGTTGGTACAATGGGTATGTCAA
ACGCCTCCGTTGGTTATTTGAATTACCCAACACAAGTTATCTTCAAATGT
TGTAAACTCATACCTGTCATGATCGGTGGCATCCTTATCCAAGGAGCGGA
TTTTCCTAATACCTGGCTTCAAGCCTCATGGTTGGTTTCTAACATTGGTT
CAATTTGCTTTCTACACTTGCTTTAGTGTCATTGAAAGTCTTGCTTTATC
CATTAAACTTGAGAGACGGTAGTATATAATAAAAAGCAAGCACAAATGAA
TGATGCAACAAAAAATGTCACCTTGTTTGGTGTGGATATTTCCAGATTCA
ACAAAGCAAGACAATTCTTCATCTGTACTTGTGGAATATTTTCATTTTAT
TTACTCTATGGATATTATCAGATATTTATGGTCGGGTTGTATCGTGCTTC
TTGGTATCTTTTTAAACGTATACAAGAAGAATGAACAAATTATGAACACT
AAGATATTATCCATGATTCATTGGCTAAGTAACAAGTTAAATAGTCAACA
CTATGGGAAAATGGTACAACAAGTTTGATGACGACTTGTCGGAAGGCACT
GACTATCATAATATCTTTTACTGTCTTCTCGAAGCCTTTCACTATACAAA
TCCATTGGAAACGTATGGTTACTCGTTAGTGTTTTCATTGACTGGTTATC
TTGGCATCAGTTTTGTGTTGACTTTCATTCGATTATTTGGTGCACTGATG
ACCGTCACAGGTTCTATATTCATATGGTATTGGATTTTGTTACATGTTTG
TCATATTGATGTTCACTGGTTCACTTCAAGCTGGTTTTATGTATTATCTG
AAGGGATAATAATGATGTCATTAGCGTTATGCTCGGATGCAGCCATCGGT
AATGTCCAAGAGAAAAATATGAAGTCTTTCAAACCATCCAACACTGAAGT
TGCAAACGTTACGCAACACTGGATTTCATTTCATGTTTATGCATGAGTGT
GGGTTTGACACTCTTCGTTTTAGCTGACTCAGCAGTTCAACCAAATTTCA
ATATTACAGCATTCCTATGAAGACATATTTCATTTTGGCATTTCTAACAG
TTGGTACAATGGGTATGTCAAACGCCTCCGTTGGTTATTTGAATTACCCA
ACACAAGTTATCTTCAAATGTTGTAAACTCATACCTGTCATGATCGGTGG
CATCCTTATCCAAGGAGCGGATTTTCCTAATACCTGGCTTCAAGCCTCAT
GGTTGGTTTCTAACATTGGTTCAATTTGCTTTCTACACTTGCTTTAGTGT
CATTGAAAGTCTTGCTTTATCCATTAAACTTGAGAGACGGTAGTATATAA
TAAAAAGCAAGCACAAATGAATGATGCAACAAAAAATGTCACCTTGTTTG
GTGTGGATATTTCCAGATTCAACAAAGCAAGACAATTCTTCATCTGTACT
TGTGGAATATTTTCATTTTATTTACTCTATGGATATTATCAGATATTTAT
GGTCGGGTTGTATCGTGCTTCTTGGTATCTTTTTAAACGTATACAAGAAG
AATGAACAAATTATGAACACTAAGATATTATCCATGATTCATTGGCTAAG
TAACAAGTTAAATAGTCAACACTATGGGAAAATGGTACAACAAGTTTGAT
GACGACTTGTCGGAAGGCACTGACTATCATAATATCTTTTACTGTCTTCT
CGAAGCCTTTCACTATACAAATCCATTGGAAACGTATGGTTACTCGTTAG
TGTTTTCATTGACTGGTTATCTTGGCATCAGTTTTGTGTTGACTTTCATT
CGATTATTTGGTGCACTGATGACCGTCACAGGTTCTATATTCATATGGTA
TTGGATTTTGTTACATGTTTGTCATATTGATGTTCACTGGTTCACTTCAA
GCTGGTTTTATGTATTATCTGAAGGGATAATAATGATGTCATTAGCGTTA
TGCTCGGATGCAGCCATCGGTAATGTCCAAGAGAAAAATATGAAGTCTTT
CAAACCATCCAACACTGAAGTTGCAAACGTTACGCAACACTGGATTTCAT
TTCATGTTTATGCATGAGTGTGGGTTTGACACTCTTCGTTTTAGCTGACT
CAGCAGTTCAACCAAATTTCAATATTACAGCATTCCTATGAAGACATATT
TCATTTTGGCATTTCTAACAGTTGGTACAATGGGTATGTCAAACGCCTCC
GTTGGTTATTTGAATTACCCAACACAAGTTATCTTCAAATGTTGTAAACT
CATACCTGTCATGATCGGTGGCATCCTTATCCAAGGAGCGGATTTTCCTA
ATACCTGGCTTCAAGCCTCATGGTTGGTTTCTAACATTGGTTCAATTTGC
TTTCTACACTTGCTTTAGTGTCATTGAAAGTCTTGCTTTATCCATTAAAC
TTGAGAGACGGTAGTATATAATAAAAAGCAAGCACAAATGAATGATGCAA
CAAAAAATGTCACCTTGTTTGGTGTGGATATTTCCAGATTCAACAAAGCA
AGACAATTCTTCATCTGTACTTGTGGAATATTTTCATTTTATTTACTCTA
TGGATATTATCAGATATTTATGGTCGGGTTGTATCGTGCTTCTTGGTATC
TTTTTAAACGTATACAAGAAGAATGAACAAATTATGAACACTAAGATATT
ATCCATGATTCATTGGCTAAGTAACAAGTTAAATAGTCAACACTATGGGA
AAATGGTACAACAAGTTTGATGACGACTTGTCGGAAGGCACTGACTATCA
TAATATCTTTTACTGTCTTCTCGAAGCCTTTCACTATACAAATCCATTGG
AAACGTATGGTTACTCGTTAGTGTTTTCATTGACTGGTTATCTTGGCATC
AGTTTTGTGTTGACTTTCATTCGATTATTTGGTGCACTGATGACCGTCAC
AGGTTCTATATTCATATGGTATTGGATTTTGTTACATGTTTGTCATATTG
ATGTTCACTGGTTCACTTCAAGCTGGTTTTATGTATTATCTGAAGGGATA
ATAATGATGTCATTAGCGTTATGCTCGGATGCAGCCATCGGTAATGTCCA
AGAGAAAAATATGAAGTCTTTCAAACCATCCAACACTGAAGTTGCAAACG
TTACGCAACACTGGATTTCATTTCATGTTTATGCATGAGTGTGGGTTTGA
CACTCTTCGTTTTAGCTGACTCAGCAGTTCAACCAAATTTCAATATTACA
GCATTCCTATGAAGACATATTTCATTTTGGCATTTCTAACAGTTGGTACA
ATGGGTATGTCAAACGCCTCCGTTGGTTATTTGAATTACCCAACACAAGT
TATCTTCAAATGTTGTAAACTCATACCTGTCATGATCGGTGGCATCCTTA
TCCAAGGAGCGGATTTTCCTAATACCTGGCTTCAAGCCTCATGGTTGGTT
TCTAACATTGGTTCAATTTGCTTTCTACACTTGCTTTAGTGTCATTGAAA
GTCTTGCTTTATCCATTAAACTTGAGAGACGGTAGTATATAATAAAAAGC
AAGCACAAATGAATGATGCAACAAAAAATGTCACCTTGTTTGGTGTGGAT
ATTTCCAGATTCAACAAAGCAAGACAATTCTTCATCTGTACTTGTGGAAT
ATTTTCATTTTATTTACTCTATGGATATTATCAGATATTTATGGTCGGGT
TGTATCGTGCTTCTTGGTATCTTTTTAAACGTATACAAGAAGAATGAACA
AATTATGAACACTAAGATATTATCCATGATTCATTGGCTAAGTAACAAGT
TAAATAGTCAACACTATGGGAAAATGGTACAACAAGTTTGATGACGACTT
GTCGGAAGGCACTGACTATCATAATATCTTTTACTGTCTTCTCGAAGCCT
TTCACTATACAAATCCATTGGAAACGTATGGTTACTCGTTAGTGTTTTCA
TTGACTGGTTATCTTGGCATCAGTTTTGTGTTGACTTTCATTCGATTATT
TGGTGCACTGATGACCGTCACAGGTTCTATATTCATATGGTATTGGATTT
TGTTACATGTTTGTCATATTGATGTTCACTGGTTCACTTCAAGCTGGTTT
TATGTATTATCTGAAGGGATAATAATGATGTCATTAGCGTTATGCTCGGA
TGCAGCCATCGGTAATGTCCAAGAGAAAAATATGAAGTCTTTCAAACCAT
CCAACACTGAAGTTGCAAACGTTACGCAACACTGGATTTCATTTCATGTT
TATGCATGAGTGTGGGTTTGACACTCTTCGTTTTAGCTGACTCAGCAGTT
CAACCAAATTTCAATATTACAGCATTCCTATGAAGACATATTTCATTTTG
GCATTTCTAACAGTTGGTACAATGGGTATGTCAAACGCCTCCGTTGGTTA
TTTGAATTACCCAACACAAGTTATCTTCAAATGTTGTAAACTCATACCTG
TCATGATCGGTGGCATCCTTATCCAAGGAGCGGATTTTCCTAATACCTGG
CTTCAAGCCTCATGGTTGGTTTCTAACATTGGTTCAATTTGCTTTCTACA
CTTGCTTTAGTGTCATTGAAAGTCTTGCTTTATCCATTAAACTTGAGAGA
CGGTAGTATATAATAAAAAGCAAGCACAAATGAATGATGCAACAAAAAAT
GTCACCTTGTTTGGTGTGGATATTTCCAGATTCAACAAAGCAAGACAATT
CTTCATCTGTACTTGTGGAATATTTTCATTTTATTTACTCTATGGATATT
ATCAGATATTTATGGTCGGGTTGTATCGTGCTTCTTGGTATCTTTTTAAA
CGTATACAAGAAGAATGAACAAATTATGAACACTAAGATATTATCCATGA
TTCATTGGCTAAGTAACAAGTTAAATAGTCAACACTATGGGAAAATGGTA
CAACAAGTTTGATGACGACTTGTCGGAAGGCACTGACTATCATAATATCT
TTTACTGTCTTCTCGAAGCCTTTCACTATACAAATCCATTGGAAACGTAT
GGTTACTCGTTAGTGTTTTCATTGACTGGTTATCTTGGCATCAGTTTTGT
GTTGACTTTCATTCGATTATTTGGTGCACTGATGACCGTCACAGGTTCTA
TATTCATATGGTATTGGATTTTGTTACATGTTTGTCATATTGATGTTCAC
TGGTTCACTTCAAGCTGGTTTTATGTATTATCTGAAGGGATAATAATGAT
GTCATTAGCGTTATGCTCGGATGCAGCCATCGGTAATGTCCAAGAGAAAA
ATATGAAGTCTTTCAAACCATCCAACACTGAAGTTGCAAACGTTACGCAA
CACTGGATTTCATTTCATGTTTATGCATGAGTGTGGGTTTGACACTCTTC
GTTTTAGCTGACTCAGCAGTTCAACCAAATTTCAATATTACAGCATTCCT
ATGAAGACATATTTCATTTTGGCATTTCTAACAGTTGGTACAATGGGTAT
GTCAAACGCCTCCGTTGGTTATTTGAATTACCCAACACAAGTTATCTTCA
AATGTTGTAAACTCATACCTGTCATGATCGGTGGCATCCTTATCCAAGGA
GCGGATTTTCCTAATACCTGGCTTCAAGCCTCATGGTTGGTTTCTAACAT
TGGTTCAATTTGCTTTCTACACTTGCTTTAGTGTCATTGAAAGTCTTGCT
TTATCCATTAAACTTGAGAGACGGTAGTATATAATAAAAAGCAAGCACAA
ATGAATGATGCAACAAAAAATGTCACCTTGTTTGGTGTGGATATTTCCAG
ATTCAACAAAGCAAGACAATTCTTCATCTGTACTTGTGGAATATTTTCAT
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GCTTCTTGGTATCTTTTTAAACGTATACAAGAAGAATGAACAAATTATGA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR013657UAA
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0055085transmembrane transport
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0055085 transmembrane transport
Blast
BLAST of TCONS_00019761 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: S35B3 (Adenosine 3'-phospho 5'-phosphosulfate transporter 2 OS=Homo sapiens GN=SLC35B3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 402.134 bits (1032), Expect = 2.779e-130
Identity = 201/343 (58.60%), Postives = 251/343 (73.18%), Query Frame = 1
Query:   37 ATKNVTLFGVDISRFNKARQFFICTCGIFSFYLLYGYYQERIFLIPGFKPHGWFLTLVQFAFYTCFSVIESLALSIKLERRIPMKTYFILAFLTVGTMGMSNASVGYLNYPTQVIFKCCKLIPVMIGGILIQGKRYATLDFISCLCMSVGLTLFVLADSAVQPNFNITGIIMMSLALCSDAAIGNVQEKNMKSFKPSNTEVVLYSYGIGFCYMFVILMFTGSLQAGFMYYLKNPLETYGYSLVFSLTGYLGISFVLTFIRLFGALMTVTVTTCRKALTIIISFTVFSKPFTIQYLWSGCIVLLGIFLNVYKKNEQIMNTKILSMIHWLSNKLNSQHYGKMVQQ 1065
            +  +V + G+++S+FNK  QFFIC  G+F FYL+YGY QE IF + GFK  GW+LTLVQFAFY+ F +IE L L     RRIP KTY I+AFLTVGTMG+SN S+GYLNYPTQVIFKCCKLIPVM+GG+ IQGKRY   D  + +CMS+GL  F LADS   PNFN+TG++++SLALC+DA IGNVQEK MK    SN+E+VLYSY IGF Y+ + L  T  L     +  KNP+ TYGY+ +FSLTGY GISFVL  I++FGAL+ VTVTT RKA+TI++SF  F+KPFT QY+WSG +V+LGIFLNVY KN   M+   L  ++ L NK       + + Q
Sbjct:   61 SVDDVVVLGMNLSKFNKLTQFFICVAGVFVFYLIYGYLQELIFSVEGFKSCGWYLTLVQFAFYSIFGLIE-LQLIQDKRRRIPGKTYMIIAFLTVGTMGLSNTSLGYLNYPTQVIFKCCKLIPVMLGGVFIQGKRYNVADVSAAICMSLGLIWFTLADSTTAPNFNLTGVVLISLALCADAVIGNVQEKAMKLHNASNSEMVLYSYSIGFVYILLGLTCTSGLGPAVTFCAKNPVRTYGYAFLFSLTGYFGISFVLALIKIFGALIAVTVTTGRKAMTIVLSFIFFAKPFTFQYVWSGLLVVLGIFLNVYSKN---MDKIRLPSLYDLINKSVEARKSRTLAQ 399          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00019761 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
S35B32.779e-13058.60Adenosine 3'-phospho 5'-phosphosulfate transporter... [more]
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