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transcript sequence >TCONS_00019335 ID=TCONS_00019335|Name=TCONS_00019335|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1878bp
GAAATTATTTACCCCCTCTCTGATGGCcactgattttttttggaaaatgg
aaaaagGGCCAAGCAGAAGCTGGTATCAACGCCTTTGGTTAAGGCCCCGT
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GTGAAGGTTGGACTCTCCGTAACGTTTGCGTTAGGGCGTCTAGCGTTGCG
CCTACCATTTATCAGACGCCCCTTAGTTGAGAAATTCGCTAAAATCAATA
GGCTACCAGCAGACATGACTGAGGAATCGTTATTCTCAAAAGATATGCAA
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GTTATGAAGAAGTATCTTTACACAATATTCAAAGACCGGGTGTACCATTG
GTTATCAACTTTGGTAGCAACAGCTGACCCCCGTTTATGGCAGATTCTCG
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TGGAAAGACCTGAAAAGTCAATGTTGCCTTTGTagagaatttttatttta
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AGAGCTAGGATTATAAGATACCATTTCGAAAATCTTCCCtaacacttttt
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TCTACCAAAAAGTGGGGGTCATGGCTCCGGCCCCCCCTGTTGATGGGGCC
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AATAcgcaaaatgaaattttgttttttc Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000325:102749..124629- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00019335 ID=TCONS_00019335|Name=TCONS_00019335|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21881bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000325:102749..124629- (Clytia hemisphaerica)
GAAATTATTTACCCCCTCTCTGATGGCCACTGATTTTTTTTGGAAAATGG
AAAAAGGTAAGCTTTGATGACAGTATTTTTTAAGTTTGATTGAATCAAGT
TTGGTGTCTTTTTACCAAAAGGATAACAAAATATCCGTAAATGTTGGCAA
TTCATATGCTTCAGAACAACACCTCTATCTCACAGTCTCGGTGGATTTTC
TTTCCACAGCCGGGATGAAATTTTATCGAAATCCCCTATTGTTCCACTGT
CAAAATATCCAGTGGGATGATTTTGGAGTGCAATTTCTTATCCATTGTAT
TTAAGATGGGGATGAAACAAAATCAACTTTTCAATGGGCTGAAATTTTTG
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AAGAGTCCCACAAGGTCTGAAACAAAATTTTTAATCGAATTTATTCTCAC
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CAAGTTTAGACATAATCAGAATTCATTCAAGGGTTTATGTATATGATGAT
ACATAAAAATTTTCAAATAATTAAGACAAATTTATAAATCTTCACTCGTC
GTGAATATAACTTCTAGTATAAAGAGCAGCCAACTGATTGAAGTTACAAA
TTATCTGTTCTAAACTTTCCATGGAAAATTTATCTATTCTTTTCTTGCCA
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AATATCAATATGTTCCAAGTTTAATAAATCATGGCTAATGGAAAATTCCA
TCTATTCTATGTCCTTTAGTTAAGCGCTGAGATGATCCTAAAAAAATGGA
AACTGTACATACTGTTTGAAAATAAGGAAAGTCTGAAACGCTGACCAAAT
TTGTTTGAGATTTTATTATTTATGAACTGCACTATCTTCTATATGTATAC
AAGCTGTAAAAAGGAGAAAAACAAAACCGAGATACGCAGAATAATTTTTT
TTGTCAATATGCAACATTAAAATGCATACAAAATATATCTACTTAAAATG
ATGTTCTGATCCAGGTCTTTAATCTTCCTTTTTTTTTCAGGACACCCTGT
ATTTATTTGATCATTATCCAGAATGAGTCATAGTTGCCCCTTGAATCTTC
ATGGTTGAGTTGGTTATCCTTTTTTCGGTTGATTTTTTACAGCCCTGTCT
TTGTGGCATTTGTGGCTAAGATCTAGGGAATCTGACTTGTATTTTTAATC
TGTAATTCACTTTGTTGCCATAAAAAGCAAGTGCCAAAAAGAAGATGTAC
ATGTTTTTTGCAAAAACAAACTATAGACGAACATAAGGCTTCGATGACCA
AATAATCAAGAGCAAGTTAAGAACAATTTAAGGCTTTGCAGACTCTTCTA
AAACACCCGATTTCTTAGGAAAATGAATGAATTCACAAAATAGCGAAAAT
AAGAACATTTTTAGACTTTAAAATCAACATCTGAGTATGGATTTTCTTAA
AAAAAAACGTGTAAACTTTTAGGGTTTGTGAAATTATATGCCAGTGAATT
AAAAGAGTTCATAAACATTTTAACAAAATTTTAAGTGAGTAGTTTCAAAC
TCACCGTTTTACACACCTGTGTTTCACGCCCCCACACTGGACAATTTGGC
TAAAATTTCATCCCGGCTAGGAAAAATAGTCTACAGCTGCAGCCTCACTT
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TTGTTTGAGCTGGCAATAATATAATTCTTATTTCTTAGATTTTAGTAGAA
ATTTTCATCCCCCTGTGGGAGAATCCAGTGAGGGTGTAATTGTGTTTTCT
ACTTTTCTCTTCAAATTTCCATAGAATCTTTATGAATAGCAAAGAATGTT
TGTATATAGGTCGATATATTCTTTTCAAAATGGTACATATCAGTTGTTGT
TGTTGTTGTTTTTGACAAGTTTTTGAATCTTTTTTGATAATGAAAGATTT
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TTCGCAGCACAACCTATTTCAAGATACTTATCCTAAGTTTCATTGATATT
TTTTCCTCGTCTTAATGGTGGACTTTTATTACCAATTTCCCTCTTATGTG
AATTTAGAGAAACTATCAGCAAGGTTTACGAAAATGTGAAATTAAAATTT
ATTGAAGTCTGAAATATTGAAAGTTCTTTAATGATTTAAATTTTTTGACA
TTCAAATTTTAGATAAGTGATAATATATATGAGCTCCCCCCCCAGTGGTT
TTCGTGGTGGCGTGATTGGCGTTTTTTTCAAGTTCGTGATTTCGTGATCG
GAGGAACCAACGTGATATCGTGATCAACGTGATCGTAATAGAAATGAGAT
TTTACGCGTGATAACGTGATTGCGTGATTGCGTGATTTAAAATATGACTG
GGGGGCTCATATATTCTTTCAATCTTTAAATACTTTTTTAAATCATTTAA
GGAATCTGGAATACCTTATCGGCCAAAACTTAGTCGACCCTAAGTGATTA
AATTTTGGGTTGGTGACTAAAATTAGTGCTGACTAAAAATTTGCGCCAAA
TTAAAATGTTATAATTCCAATTAAAAATAATTTCCTTATTTTCCAGTATT
TTAAGCTTTCTCCTATTTTCCATCTGCTTGTGAATTTAGAAATGGCCCAA
ATTTTTAGTCGGTCCTTATTATTAGTCGGCCCTTAGTGACTAAATTTTGA
CGAGTTGACTAAAATCAGGGCTGACTAATAATTAAGGCCGACTAAAATTA
AGCTACCTGATAAGATAACTGGTTTGAGTTTGGGATAAAATTCTTATGTG
AACTATACGCTTTTTTAAATTTCTTCCCCATTATTACATTTCTTTAAATT
CAGGCGATTTCGGAACCATTTTGTAGATTTTCAGAGATTGGAAAAGAAGA
TACCTTCACGTTTTTGTTTTAGATTATCTGCTCAAATTTAACGAGTGAAA
TTTAAAAAAAAAATTTAGGGCTCAAATTTTCCAATTTCATTCAATATCTT
GTGAAGTAAAAGCTTTTTGGGTAACTTAATCATGAAAAACGGTAGAATTG
GACCCAAAAAGCATAAAAATTGTATCAGAATACTACATAAAAAGTTAAAC
GTCTTAGAATTTAATGTAAGAGCGAAAGAAAAACGGCAAAACGGGGCCAT
TTTACTCCAACGAGCTACCTTCTAGAGGTTGTAACCTAAGATGAAAGAAT
TTTAAGGGAAAAACAACTGTATAGCTGAAAACAGGAAGCTTCAAAGTACC
CCTTTACCAAAAACGAATTTTCTGGCTCACTATATGGAAAGATTTATTTT
TTCTTCATTTTTCATCTTCATTTTCTTAATTATTTTCTGAATTATTTTTT
TTAGAAACTATTACTATTAGAAAATTTTGAAATAAAATAAAAGAACATAT
TCAGTCAGAATTTTTCTATTTGCACAAAATAATCAATAAAATTCCATATA
ATTTGAGAAAAATTCATATTTCAATAAAAATTTATCGTAATTGAGGGAAT
GGTAGAATCGGATACCACCTGAAACAGTCAAAAGTCTTAGGTTATGCATT
GTCAAAATTTATCAAAAGTACAATTTTTAAATAGGAATTTAATCTAAATT
TTAATTGTATTCGTCTCTTGATTTAGCATACAATTGGAACTTTGAGTTTG
AGAAGGCTATTGTCTGATTTAGTAGTCTTTAAAGCATTTATTCTTGTAGT
ATCTAGGTAGCCTGATAAAAACTAGTCATAATTTACTTACGTGCACGGTA
AACCTCTGAAGGCCCTTGAAAATTAACCATCTGAGTAGTCTAGCAAGCTA
GACGACTAATTCAGACGTATTAGAAATAAAGTAAAAAAGTAAATTTTAGT
CGTCTAGAAACCTTTGTGCACTAACTCCAAACAAAAAAAAAGTGTCAATA
TTGCAATTAAAATTTATTCCCGCTCAAAAAAATTTCTTGAAAATAAAATG
TGTGTGGATTTGTGTGTTAAAAATGTTTCATTTGAGTTGATTTTATTTTG
AGAGTTTGTTGTTGCTTAATAAATTGTTTTCTCGCTACGCAAGTTTCTGC
GTAGCTAGGCCCGGTATCTACAAGGCTGGAACACCGGATTCTTCCAGTCG
TTTATACAAACTAAATCCCGTATCATTATTTGTGTTTATTATTAGTATTA
CATGCATTATAAACGACTCCAGTCTACCATCTGAGGAAAATAGTCTTCCC
GCGGAAAATTCTTCAACAAGAATCTTGTTGTGCGCCGGAAAATCAAACAT
TAAGCTTTCTGTGCCCTATTTTTAAACACAAGCAAGCAACTTTGTTGTCA
TTCTCAGTTCTTTTAGACGAGCGTGGTCCTTACGATTTTGAGATTTTCCC
AGTTTTCCCCACTTTTGTTGACCCACTAGGGTAAATTTGTTGGAAGCTTT
CGGTGGTTTTGTGTACTCTACAAACTCAACAAAAATGATCCTCATTTACT
GATAAAGCCTAGAAATTTAACATCTCAATCTTAGACAATATCATTAAGAC
CAGAGTTGTGTATGAATCCCGGGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNATCCCGGGGGGGGGGGGTACTTGGGTTGGTGAATGAGGG
GTATGTGCGGACGGGACCTCCTAAAACCGACCCTTAGAGAGACCAAAATT
TAGTGAAAAAGTGACCCTTAGAGAGACTTTTTCGAAAAATTTTCCCTGAT
TTTCAAAAATTTCCTACCCTTATGAGACTTTTTTGTAATTTTTTCTCTCA
AAATCAACATTTTTTTCTAAAAATCGTAATTTTTCCCACCCTTAGAGAGA
CTACTTTGAAATTTCCTGATTTTTGTAACCCTTAGAGAGACTTTTTCGAA
AAATTTTCCCTGATTTTCAAAAATTTCCTACCCTTATGAGACTTTTTTGT
GATTTTTTCTCTCAAAATCAACATTTTTTTCTAAAAATCGTAATTTTTCC
CACCCTTAGAGAGACTACTTTGAAATTTCCTGATTTTTGTACCCCTTAGA
GAGACTTTGAAAGGTGAAAACCCCGCCCCTTACCGTCCGCACATCCCCAG
CCCCTATTTTTGCCTAAGTCCCCCCCCCCCCGGGGGTATGAATACTGGGG
TGACATCTTTGGTAACAGACTGGTCTATGTGAAATGCCAGCCACGCAATA
TAACTGAACTGAACTTAAAATTTGTCTTATATGACCATTACCGACCTCTT
TGCCAAATACTTTATTGTCCAATTATTTTTGTTGAATGGCAAAATCCAAC
AGCAAATACAATACAATAATACTTTTACGATTCGATTCGATTCGATTTGA
TGATTCGATTAGGGTAAACGCGTTACAGGTATTGTCGTAAACAATTAAGA
AGAAAGAAATTAGAATTTATTAAACCTTCATTAATATCTTAAAGTCTCTA
GAGAAACTACAGCACCTGTAGGTAAACAGTTTTGTTAAAAGTGTTTCTTC
TTTTGCTAAAATTCTTCAGTAGAAGCCACATGCTCAAAAGTTTTCCAAAC
GAACGACACATTCTTATTTCAGTCCCAGCCCTGTTCTTTAAATCGACCTT
ACCAATTTTACCAATTCTATCATGCCCTGTCTATTGGGGTACCTGATAAT
ATTTCCGTTGAAAAGATGAAAACAAACGAGGTGAAAAACAGAAAACATCA
TTTGAACTCTTAAAAAGACTGGAATGGTTATTTTAAAATTACCAGCTGTT
AATAAGTCATTTTCATCAGACCCTATTATTATCATATAGAACAAGTTACA
GTGCTTTACTTCCTTTACTTTAAACCTTAGCCCACGAGGGACACGTATAT
GTGTCCAGAACATAAGCCTAAATACTGAGTCTCAGACTTGAGGCCATACC
TCCTGACCACTTGATTTAAAGGGCATAAACCGAATGCTTGAAAAAATAGC
TCTTTCCAATGGTACATAAACCATCTTCTAAATCAAAAGCTACAAGCTTT
TTTGGCACTTTAAAGTTTTAAGTTTCAAAAGAAAGATTTAGAAAAATTTC
AACTTTTTCATAAAAAAACAGCGTGCACAAAGGATTAAAGTTCGGTGTTG
TGCGTAGTTTTGTAATTTCTGCGCAGTTTTGTAATTGCACCCTTGTGCAC
TTTTGCTATTTCAGAAAAAAATCGTACATTTTTATCCAATAGTTCTATTT
ATACTGAGACGATTAATTTGTCTGAGACGAGCAATTTAGAAAATGAGCAT
TATGGAGGAGTGTACTTTTTATTCATGTTTCAATAAATAGGATCTCCTCC
ACAGATCCCATTTTACAAATTACTTGTCTCAGACGATTTTTCCGTCTCAG
TATAAATGGAACTAATATTTTTCTTTTCCTTATCATCTTCTTTGTGATTG
ACCTTTGTCATAAGGATACTTAAAAAGCTTTTTAAAAAGCACTTTACTTT
ATTTTTATATGATTCATTGACCAAAGTACTTGACTATTATTCTGAAAAAG
TCACAAAATAATCCGAATTTACAATGAAGAGTTAGTCCGAGCTGTTCTGA
GTTGTACATAAACAGATACGTTTCTTTTGATTGACTGTGCGCTTTTCATT
AACTAAAATCGGCTCTATCATAAACCTTTGTTAGTTCATTAAAGAGTTAT
GCCGAAAAATGTAATGCTGAGTTATAACTCTTTCAACTCTTAAATTCGAA
ATAACTTATCTTAAGTATGAATGCATTGCAAAAAGGGCATTCATTCTCTT
GAAAAGAGTAGTGATACTGATTAATGTGATATAATTGAAATTATGAGTTG
ATCCGAGTTGTTCCGAGAAGTTCTGAAGAAAGGATTGTATTTAAGATGTT
TTCTAAAGACTGATTTGTTTATTTGGCTTCCTATAGCACTTTAAAATTGT
TAATTTTCGTTGAGAAATTTAATAATAAAACCCAAAGACGTAATGCCGAG
TTTTAACTCTGAATTCTGAAATGAATTATTCTAAATCATCACAAATCACG
TATACTTTGCAAAAAACTAATTCATTTTGTGAAAAAGACCGATGAAACTA
ATTATGTGACATACTTCAAAACTTAAAACTCGGATTAACTCGATTTAACT
CCGTTAGAACAAATCTTTAGGATTTTTATCTACTATTTCACAGGAAATTT
TGGTCAATTTTTTTGTCAAAATTACAAAAGTGCGCAGCCACATGAATACA
AAAGTGCGCAGAAAAATCACAAATCTGAGCAAAAATTACAAAAGTACGCA
AAAAAATTCCAAAACTGCATAGAAATTACAAAACTATGCACAACTTCGGT
GATCTCCATGGTAAACTGGGAAATCTAGAGTAAAAAATGAGTTAAAGTCT
TCTTTGATCAAAATTACATGATGGTTGAAAAGGAAGGTCACAATTTTGAT
CGTTGCTAAGGCGAATCAAAGGAGAAACTTTCTCAGAATGTAATAAAAAT
AATTGTTGAGGATAACCGCATTCATTAAAAATGCTGACGTGTGTAAAGGA
AGGGAAACAGGTCATTAAAATGTCAAAAGGTCATCTCTCAAATACCTATT
AATGTTATTTTTACTTTCACTTTTTAATAACCACCTCATTAAAATAAATA
CAATTAGTGGTCTTAAGGCTCATTTCTTTTGGCAGAAATTTGTTTTATCA
AACACGCGAACGCTACAGAAAGCATTTTTATAAGAACATCATAAAGATAA
AATATATTTGATAGTTCTTGTTAACAAGTGCAGTTAACCGGGTATATCAG
GTTTGCGAGGTGACAGGTATGTCCGAGCCAAAAATCAAAAATCAACCCTA
AAAAAGAGAGAGAAAAAATTGGCGTTTTGGGATCCTTAGAGAGACTTTTC
TCAAAGATTTTGTCGATTTTCACTCGATCTTTGTCCAAATTTTGAAAATC
ACGACCCTTTGAGAGAGGAAATTTCGATTTTCGTGAGTCAATTTGCTGTT
TAATAGTTTTTGTACCCCTTTGAGAGACTTTCGAGGGTGTGAAAAAGGGA
ACCTTATGGCTTTCACATGTCCAGCACCCTTTTTCCCCAAGTACCCCCCC
CCTGGGTCCGTTAGACCTTCGGACTCTAACCGAAGGACATTTAGTCGAAG
GCTAGAGTAGAACCACCAACTTTTAAAGACTCCAAAGACAAGATAAGATG
CATTTTAAACTAACTTCAGGTTAGGATTATTCACCAATCCTCATATACTT
CAAACACAGTATTTACTCTAAGAGAGCCCCTAGTAAGAATAGGGTTTAAG
GGCTCTGGACATACCCAATTTTTCGATTTTACACCAACTTAAATGGCAAT
TTCTGCGTTTTAAAAAGATTAATGTATAACTTTTTCTATATATCCTGTTA
AACCTACCTTTTTAGAATTTAAAATTCGAAAAATTGAAATGCAAAAATTT
AATGAGGAAGAAAACGAAGATTTTTTCGAAGAGGAGTATTTCACCTTTCA
AAGCCCTAATCTTGGTAGAAATCAAACATTTTGGAAAGCTTTTTGGTTCA
GGTGATGTATTTATTTTGTATCTAAAAATACAATTTCGGAAAATTTTTGT
GAAAGTATCTTTCCTTTAAAATCTCCAAAAAAACCCTTTTTTGGTAATTT
TCTCCACTAAATTTCCATACGAAAAGAGCTATAACTTGGGATGTAGCCAA
ATAGAAAATTTTTCCGAAAAAATCTAAATAAAGAAATCACTATGACCAGA
GACCTTAAGGCATTTTATTTAGACTTATTTTATAGAAGGGAGACCGCTTT
AAATTTAATCATCTAAGCAGCTTGCTTTATGGTATTTTTTGACCTACTTT
GTTTGAGTTTAGCCCCTGTCAATACATGTGGAAAATAATATTATTGCAAA
AAAGACAAAATATTAGTATAAGTTAAACCTAACTTTATTTACTGTACCTA
ACCCGAGTCTGCTAAATCGTGTGCCTTTCGGGCATTCTTGCTTTAATATT
TTATACGCCCTCCACGCCTCATGCGCCTCCGTGCCCTCGTTGTTTTGTGC
CACAGCATCTTACACGTTCTTCAAATTCTTTTTGTCTCGTAATATTCCTA
GCAGGAAAAAACAAAAATAGTATTTTCTCTCGTGACTCTGTTCGCGTGAT
GAAAGATATAAAGATATCATAATCCAGTCATCGACTTTATATCCAGTTTT
TGTCTTGATTTTATATTAGATTAATTTACTTTCCAAAAGATTATCAGTGT
TTGAATTCGATCATCTAAATATAAATTTCTTATGAAATGAGACCACCCTG
AACAAGGAAATGAATGCACACGGCTATATTCAGGCTGTGTCATTTATACA
TTATGGTCTCGTACCTCATTTCGGCTGAGTGATTAGGTCGATTGTTTAAA
AGTCCCGAATTTTCAACTAAAGACTATTAAAAAGAATAGCTTAATCCGCA
TATTTTGATACATAAAAGTAATACCTCGCTAGAAAGGTAATTCTGAGTGG
ATGAATTTCAAACATAAAAATTAAGAAAAACTATTTTTAAAAAGTTTCTT
TTATATTGCCAAAAATCCTGAGATTAATTATTATACTCAGCAGTAACTTA
GCTAGACTTTACTGATTGCAAAGATATTTATATATTTCTCATATATCGGA
CGGAGGATCGAGACAAAAATACCATTAGATGCTAGAAATTTCCGTATATT
TCTCATAAATTTACAGCCCTTCAAACAGGGTACATTGTTCTCATTTTCTA
CCCATTTATGGCCATTTTTGGTCATTTCTGGGCCTAACCGTCCATAACGA
ATACTTCAATACCATATGGAAACACCCCTGTCTCGCAACCCCAGTGGAAC
TTTCTTCTCATGGACAGATAAAACTCCAATTGAAATCCCAATGGGGATAG
AAATTCTATTGTTCCAAGGTTAAAAAATTAAGTGGAGATTGTTTTGGAGT
GAGTTCCCTTTTTTCTCAAATATTTTGTCCATGATTGTAGTTCATTACCT
ATATAGGTTTGGACCTGAAATGACGCTACACACCCACGTCCTTTTCTAAA
CCTAATCGAATAAGGGAAGAAACGACGCATTGCGAACAAATAGTCGACTA
TTGCTATGTTGCTGGGCCCGGGGGGACACTGACCTTGACGGCTGACAGGA
ACGTGCCGCTGGGGTTTGAAAAGTTGACCCTGCCAGATATGAATTTTCGG
TAAAATGGTGACCCTGTCAGAACGAAACCCTGACAAGTGGTAAAAGTAAA
AATGACTAAAAGTAGACGAAAAATGAAATTTTTTATAATTTTTACACTGA
AAAATTGTACAAATAACCAAAAGTGGACCCTGTCAGATACACATCTTGAA
AATTAATAGATTTGGAACCCTGTAAGATATCTTCAGAGCCTGAAAAAGGG
ACCGTGACCAGCGGCACGTCCATTACCAAATATTGCCTAAGTGCCCCCCC
CCCCCAATTGCTCCATGCCACTTTGGCTACTGTTTAATTCAAGCCGAAAG
TATCGAAACTTACAATGAAGGTCATAATATTTCAGAAAAAAGTTAAATTT
TCAAAATCTTATAGCCAAAAACGATAAGGTTGGAAAGGTAGAGTTTTAAC
TATAAGTTACACTAAAGACTTAAAGATTCAAAAGTTTGAGAATGGTCCAA
TAGGGCTCAGAATATTGCCTGGAAGTCTGTAATATAAACCCCTCCTGAAT
CGAAATATTTGATTAAATTGAACATTAAATTATTAATAATTATTAAATTG
AAATTAAATTATTCGCCTGAGCTTTAAATGCTAAAAACGAGGAATTAAAG
CTAAATTCTCCATATCTTTTGACCGAAATTGTATGTTCTACACAAAAAAA
CAGACCTATAAAAAGCCATCGATGCTTGAATATACCTGAGGAGTATATAC
GTTTGAAACGAAATTATTCTTATTGAAATTTCAATGTTACAGATGATTGT
GTTTTTTAATAAGTTAATGGGATGATCAATAAGAAGTTTCACTGTCACTT
CTATGATGTTGGTCTTTCAATTATCAGTGAGGGTGGTCTGTTGTAATGTT
ATGTAAAACTTAATCAGCAGATTTTTCCCGCGTAGGATCAGGAGAGGTTT
TAGACATTGACTTCAGTAGCGTAGACAAGGAGACGCAAAATTTGTGTATG
AGAGAGCAGATATTTATAACACAGCAATTATCTCCTGCACAAACTAATGG
ACTTTGAGGCTCGAAGGGGCTACAGAGAAATTATCAACCTTTCTTAGACT
AGAAAAAGTGAAGCCTTAAGTTTTCCCCACATTTAGAAATTTTGTAGACA
AGAAAGCCTAAGTGGCGTAAAAGCCCAGCAGTGTTGGAACTGTCAGCATA
TTTTTCCGCTGCAATGATTATTTCAAATAAAGGTGCTAGCAGTTAAAAAT
TCCAGTGGCAAAATCATAGTGCATTTCTTTCACAGTAAGGTTGAGCCTTT
TTTTATTCTAGCGATTCTAGCGCATGGTAACTTTTGTAACTTTAGTTGGT
ATCTAATGTCTTGTTATAAAAAAATGAAAAATTTGATAAATTTCATAACG
ACATTAAATTTCTTTGCTTATCTCGTAGTGTCATTTTTGTATATAATTTT
TTCCCAATTGCAACATACTGAGAAAAAAAAGAGACAAATGTTTAAAAAGA
TTACAGAAAGCTATATGATAAATCCAAGTCACGCAATTTCATTTAACTTA
TGTTTTTAAAACATTCAAAAAATGTCAAATATCGATTGTCTTACCATAGA
GTTTTATTTTGAATAATTTCTACTCGTGATAACGTTGTCACGCAATCCAT
GTCATTTGTCCGGCTTATTGCTCAACTCAAAGCACAAGAGTCGGATGTGG
GTAGGGGCTCCTAGGCAAATTTGTCTTCCATGTACAATCAGTGACAAAAT
ACTTGGCACAAAAGGGAAATTCACCGGGTTGTTTTGAAACCACAATCGAT
TTGTAAGTGCTCTAAAGTAGGTTGGAATGGTAGAGTTTTAACTCTGAGTT
TTAACGCTAGACTTAAGACTTATGACCTTAGGATGTGAGGATCCAAAAGT
TCAAAAATGGTCCAGTAGCGCTTGAAATATAGCCTAGAAACCAATAAATC
CCTCCCAGATCGAAATAATCGATGAAATCAATTTTCGAAAAATGGTAAAT
TAGCCAAAAGTGCAAATATATTATGGCACGGATTGTAAGTAACAAGGGAT
CCTTAGAATCGAAAAAAAAGAAGACCTTAGGATCTGAAGATGCAAAAGTT
CAAGAATAGTCCAATAAGGCTCAGAATATAGCCTGGAAAAACCGCAAAAA
CCAAAAAGTGCTGACGTCAACAAAATTAGTTTTTTAAATAACTCCAGTTT
GAATAAAGGTAGAAACATGAAATTTGGATCGGATCAACGGTGTATATCAT
TGAAAGGGTCATTTTACAAAAAATAATTTTTCGAAATTTTGCTGTCGTCA
GTAGAAATCAGCAAAATACAAAACTTTGCAAAGAAATGCTGATGTCAGCA
AAATTTCAAAAGACTTTTTTTGCAAAATGATCCTTTTAATAATATACACC
GTTGATNTGATGTCAGCAAAATTTCAAAAATTATTTTTTGCAAAATGATC
CTTTTAATGATATACACCGTTAATCCGCCGATCCAAATTTCATGTTTCTA
CCTTTAGCCAAAGTGGAGTTATTTAAAAAACAAGTTTTGCTGACGTCAGC
CCTTTTTGGTTTTTGCAGTTTTTTGCGAAAATGAGGGCGTAAACAATTAG
GTAACACCCCTACAGGGAAACTTCAACATGGTGCTCTTCTTATTAAATCA
TTTGCTCCTTTTCTGCCGGCTAATGTTCTTTAAAAATTATGGTAATTTTC
ATGTTTTTGAGACATGCCATAACTTACCTGAGAACAAATTATATAAGAAC
ATAAGATTTTGATGGTCAGAATTTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAG
GCTTCGCAGACTTGAAAACAGCCAATTTCTTATCAAAATGGACAAAAATA
CATAAAAGATGGGGAAAATAAGAACATTTTTAGACTTGAAACTTAAAAAG
TTAAGAACATCTTAAGGCTTAAAATACTTTTATGTTCTTAAAAAGAAACG
TGTATCCAGTCTTGAGCGTGTTCTGGAATCGTCCTCGCATTACCAACCTC
TCCAAACCTACTCCAAAGAGACACCCCCTTCTCACAGGCCCACTTGGAAC
CCTTCCCACTGGAAAAATTGGCCGAAATATTGTCCCTGTTGAAAATAATC
AGATAAGCAAATTCCCACTGCAAAATAAAGTGCCATTTTTTCCATCCCAT
CTAAATTTTCTGGCTAGAAAACAATGTATTTCAAATCCCCAGCAATAAAA
AAATATTAGAATTTCAATCCCCATTGAGTTTTGGTCCGTTATTTTTACCC
TCACTGGATCATAAAATCCCACCGTCTGTGAGAAGGGGGTGTGCAAAGAC
CAATTCTGCGATGAGACGAATTCCCTTAATCCAAACTAACAAAATGACTG
ATTTTATTTCTGCTTTAGAAAATTATCTACATTAGGTAACGGATAAAATA
GAACTGGAACCGAAACTATCATAACAAGGGTCAATGCAGGGAAAGGTTTA
ATGTCCAGTATTTAGGAAGCACTGTAATGTACTCTGTACTCTGTAGTGAA
TTGTTTAAACATTTATACACCTCTGTGTCACAGAACCAATGGGACCCCAG
TCCCACTGGTCCCTATTGGAATATTTCAATAGAAAATTTTCACCGGGACT
GTGAGACAGGGGTGTTTTCATGTTTTCTTATACCTGATTTATTTTGGTCT
AGTAAAATTGTAACAATTTGTATGGAGGTCTTAGCCATATCCACACAGTT
TCCAGAACTGAAATTTCAGTATTATAGAGTACGTAGTCAAAGCAATGTTG
GTCTATTGAAATGTCAAACCAGCTCAGCCCACCAACAGAGTTATGTGGCT
TCAAAAATATATTAGATGAAGTTTAATGTCTATTAATTTAACTTCAATTC
TTTTCCTAGTAATAAAGATACAATAAATCGCTAATGAAACTGGCCCCATG
ATCGAAAACCGAATTGCGAATCTTTCATTTTAATTCAGTCGTTTTTCGTA
CATCCAAAAAACGTCGTTTTCGAAATTTAGCCAGACATTGATAATTATAG
ACTTGGATTATGATAAAACCAAATGTCATTATGTAAAAATTGTATTTTTG
CAATGTGTCGTTTTAAAAGAAATATCTTTAAAAGAAAAGAAAAATCAGCG
AATACCGAATTTTTGATGCACGCGATGTTTGTCACGAAAATTTTGTAGCT
TTGATAATTGTCCAACGTTTGTCTTTTGTCCTATCCTATGATATCGCTAT
TTGATTGGTTGATGACAAAAGAATTTTCCCCTTGACATGACAACTGCGGT
TTGATTAGTTTATTTAGATCTTTATTATTTACTTAAATGACATGTCTATT
GTGTCTCTTCTAAAAGACAATAATTTCTATTATATGTAGATATGAATCGT
CTATTGTTATCGGAATCGACCTTGGACAGTATAAATACTGCTCCATTTAC
ACAGGGCCAAGCAGAAGCTGGTATCAACGCCTTTGGTTAAGGCCCCGTCT
CAATTTAACAAGATGTCAACGACAAAAGTGAAGATTGCAAAACCATTCGT
GAAGGTTGGACTCTCCGTAACGTTTGCGTTAGGGCGTCTAGCGTTGCGCC
TACCATTTATCAGACGCCCCTTAGTTGAGAAATTCGCTAAAATCAATAGG
CTACCAGCAGACATGACTGAGGAATCGTTATTCTCAAAAGATATGCAAAA
AACGTTGATGAAATGTCAGATCACTTATTTATCGATCAAAGTAAAGAAAG
GAAAGCCTATCAAAGATTATAAAGCGTTGAGAATGTTGGATGATGGAAGT
TATGAAGAAGTATCTTTACACAATATTCAAAGACCGGTATGTTTAAAACA
CCTTTTTTTATTTTTGACAATTTTTTTGTCGGATTCGAACACATACATTA
CACGTTTTTCTTTTTGTAAGAACAAACTATATAATAACATAAGGCTTCGA
TGGCCAAAATGCTGTTTGTGATTTTCTAATTGAATTACCATACATATGGG
GAGCGGAATCGGCCCTTTTTTCGGACGGAGTGGCGGAATTTGGCGAAAAT
TTAGACGGAATTACGGAAATTGGGTTCTCTGACGGAGACGGAAAATTAGA
CAATTTTAGTGCGGAAAAACAGAATTTAGGAAAAAAAATTGCGGAATTTC
GGAATTGGTAAAAGATATTCCGAATTTGCGGAATTTTCGACAAAAATATT
GAATTTCAAAGGAATTTTNAGATATTCAAAATTTGCGGAATTTTCGACAA
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ATGCACCGTAAGGATCGATTTTTCGCTCAAATTTGATCAAACTTTGCAAA
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GGTCGTTTTTGAATTGAGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNGCCCCCCCCCCCCCCCCCCGGATCATTTTTAACCAAA
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AAAACTTATCTGCCAATAATGTAAGTATTGAGGAGGCAAATCACTACTAA
ATGTTGCAGAATTGATGCGGAAGTAAGCAGAAAATTAATAGCTCTTTAAA
AATAGATTAACACACATTGGACTGACTCCTCTTCCAATAATTTCGCAATC
TCACAATTATGATGCGCTAAAGCAGGGACATCAGAAACGTTTGTATGAAA
CTTGTTGTGCGAAAAAGGCAGCTGTAACTAGACTTCGTTTTCAATCAAGT
TTTCTGGTGAGATCTAAGTTCAAGGGAATGTAAAAAGCTGACATAATTTC
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CTTTCGTGATTACATGAGTTTGAACAAAAAAAAATTTAAAACTTTCATTA
AAAAAATACATAATTTATTTCATCATGTGTCAAATACAATGAAATTATCA
AAAAAACTGAGCAAATTATGTATGAGTTATATTGTTATATGGGTTATTGA
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GCTCAAACAACCTTCAAGCAACAACAACCTGATCAATAAAATCAAAGGAG
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ACGCAATATTTCAATAAACCCCCGGTTTTGTAGCGATTGGTATGCTTGAA
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TGCACGAAATTCATTCAAATATTTGAATGTTTCGAAATACTGTAAAAAAA
CGAGGCTTTGAACTTTGATCATTTCATTCCTGTAATTCCGCATCTCTGAA
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ACAGAGTTTAAGGCATTTTTAATGATTGAATACATTGCGAGTGCAATTGT
TCCCATAGCATTATGTCAAAAACATTATGATAACATTTCTGTTGAGGTAG
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TGCATAAATTCTTTGGATGATGATTAAAAGCATGTCCTTCCATATATCTT
TATGCTTAAACCATTGAGTTTAAAGCCCGAAGGGCTAAAGTAGAATCTCT
AACCTTTCCCAGCCAAGAAAAAATGAAGCCAATTATTTCCCATCCAGAAC
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TTTGTTTTTGAAGACTGCATTTTTTTAAATCTAGTGATGGATTTTAGTGA
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GGGTAAATTTGACTTTTTGACCTCTCCAATAGGAAAATTCCAATTAAAGA
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ATTTGCATAAAAAAAATAACAACCACATTCTAATTAAGCGTTGGTATACA
TTTTCCTCTCAATTAAAATGATTGATAATTCTCTTTTTAAGGTTTGTTTA
CCTTGCCCGATTATAATGACAAGGAAATTTCGTAATACCTCAGGCTTATT
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TGTTGTTTTTGTTTTTCTGAAAACGATTTTATAAGTATGCGTTGAGGCTT
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TGCGTCAAGTGACATCAAGTAGCTCCTCAGACCACCAACAGTTAATAAGG
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CAGGTTTTTTATAAGAATCGGCAGTAAATCTCTTCTTATTGGTCTATACG
TAGTTTCAGCTGAAATAGTCCAACAATAATTTTTAACACGCTGACTCGTT
TATAAAATGCTTAAACGATCCTAAATTTAGAAAGTCTTTTATTTCCTTCT
TCCATAGTATAAGAAAGCTGAAAAATTGGAGAAAAAAATCCAGAGGGGTC
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AGACTACCCTGAATTTTAGTCCTCGTTTTACCTCCTTAACATAAGGGGAC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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|---|
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000325 | supercontig | sc0000325:102749..124629 - |
Blast
BLAST of TCONS_00019335 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: IOD3 (Thyroxine 5-deiodinase OS=Homo sapiens GN=DIO3 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 120.553 bits (301), Expect = 7.131e-30 Identity = 62/144 (43.06%), Postives = 93/144 (64.58%), Query Frame = 1
Query: 445 PLVINFGSNS*PPFMADSRSFLELKNQYEEQMDFVIIYIEEAHPTGEWVFKDQEQIT-QHKSIEDRITQASKLQKTYPTISIYVDQMSNKLNNAFGAFPERXXXXXXXXXXXQGGSTPINYSLKDLEKWIAKYVSKME--RPEK 867
PLV+NFGS + PPFMA +F L +Y+ +DF+IIYIEEAHP+ WV D I QH+S+EDR++ A LQ+ P ++ +D M+N ++A+GA+ ERLYV+ ++YQGG P Y + +L W+ +Y ++ RP +
Sbjct: 160 PLVLNFGSCTUPPFMARMSAFQRLVTKYQRDVDFLIIYIEEAHPSDGWVTTDSPYIIPQHRSLEDRVSAARVLQQGAPGCALVLDTMANSSSSAYGAYFERLYVIQSGTIMYQGGRGPDGYQVSELRTWLERYDEQLHGARPRR 303
The following BLAST results are available for this feature:
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