TCONS_00017588 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00017588
Unique NameTCONS_00017588
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1143

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00017588 ID=TCONS_00017588|Name=TCONS_00017588|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1143bp
CTGGCTAATGATGAAACACAACTCAAAGGTCAGAAAAGGCTGTTTCATAA
TATCCAGATATTGTTAATATAAAGAGATGGTTTGAGGTAAAACTCATTAA
ACAGTTTCTTGGCTTTAATATTTTTGCATTGGTTGACAGAATCTAGGGAC
AATTGCTTAGCGAGAATCAGATAATTATGTAACATTTTTTGAGAGTTAAC
CTGAAATAGCTTGTTAAATCAACTGCCATTCATACCCCTTTACATATTCC
ACCATTTCTTTAATGGTCTTAATTAAAGCTTCATAGGTCTCTTTCGACAG
GAGATTGACAAAAGCAGCACATTTTAGTTCTGGTGAACATTTGGTGCATG
AAATCATTATTAATCGACAgattttggataattttgtaACGAAATGCGct
taaaaaacacaaatttgtaAAGACGTCAAGGTCGAACCAGTTTTGACCCC
CTTGTCAGGAGAGAGTTTCGACTTAAAGTCAACTAACATTCAAGACAACA
CTTGTCTCGATATTGCTGCTAGGGGATTTTGGATTCCAGGACAGAAGGCA
TTTTCTGACGCAAGGGTTTTCAACCCAATTGCCAAACGGCTCTCGAATTC
CAATATTTCCAAAGCATATGACTCGAACGAGAAAGAAAAGAAGCGCGTAT
ACAATTTGAGAATTTTACGAATTGAGCACGGCTCATTCACTCCTATTGTT
TTTACCGCTATGGGCGGCATGGGAAGAGAGACTAAGTGCTTCTATAAAAG
ACTCAGTGAACTTTTATCAGAAAAACTAGATGAACCTTTGTCAGTCACAA
CAACTTGGGTTAGAAGAAAGGTGGTCTTTGCTCTTTTGAGTTCAGTTCTC
TTGTGCCTCCGGGGCAGTTGAACTCCATGGAGCAAAGATAACCTTCCTTC
ACTCTCCAAAAGTTCAAGCGACTGTGAACAGTTATGTtctatttgaattt
attgaatataagATATATAACAAATTTTGTTAggtgaaaacaatcaaata
tctttccaaaaccaTTGTGAAATTTAACAGTATATCCTACAGTATAAATA
TATTAAAGAATAaattataataataaaaaaaaaaatgtgttacatttttc
aaaatttatcttGGTTTTCTGTTTCTGCTTCAAGCAAGTTTAC
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000271:90931..104409+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00017588 ID=TCONS_00017588|Name=TCONS_00017588|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13479bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000271:90931..104409+ (Clytia hemisphaerica)
CTGGCTAATGATGAAACACAACTCAAAGGTCAGAAAAGGCTGTTTCATAA
TATCCAGATATTGTTAATATAAAGAGATGGTTTGAGGTAAATGTGGAAGC
CCGAAACAGTGTGGTGTGTTACAACGCTCTTTATTGATTCAGAGGctaga
aaaatacaaagaaagccTACAGTACttagaatttaaaataaaataaaaat
agctaAGTTCCGAATTCCGGAAATCAGTCAGTTCCGGATGGAAGGGGCCA
ATACCGGAATACGGAAAACTATACGGAACTCCAAAAGTAAAATGGCCCTA
GAGCAAATAGAGGGCAAATAGAGGCCAGAAATAGAGTATGAAGCCAAATC
GACCAAAGGACAAAATGCAATGCCCAAAAGACTAATGGTCTGTGACCAGA
AAAACAGCTAGGAAAAATGACTCCAAGGATCGACTAAACGAAAGTCACAG
ACCAGGTCAAAAGTTGAccaaaatacaaggaaaaatctaaagaatcctaG
AGAATCTAGTAccaaaaaagtgtacaaaaataggaaaaattacaagtcaa
aaatataggaaaaaaCTTACTGAAACATAAGCTCCAAAGCACTGTGTATG
GATGGCTCCACAGGAaataccaaaataaattctcaagtaaatccaaaatg
aaaatcaattcAATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATAGGAA
AAACTTACTGAAACATAAGCTCCAAAGCACTGTGTATGGATGGCTCCACA
GGAaataccaaaataaattctcaagtaaatccaaaatgaaaatcaattcA
ATAACTCTAAATGTTAACTTTAAGTGTCTCCAACGAGAAGTGAAAATGGA
GTTTCTACAAACTCCTCAAAACGTCTACACGTTCTCATAACAATTTCTAG
ATTGAATTCAAAAGCAAAAAAGGGCgataaaaatagagaaaattgtGCAT
TGGAGCATTAAATTCATTAAATCTCCATCGTTTGCGAGAATATAGATCGG
ATTCGTCGAACTCTCCTGGTGGTGGTAAGATGACTTTGCTTTTCATGGTC
AGCAAATTCATAGGTGATAGTGCCATTGGTTCTGTTGGGTCGCTTACGGT
GTCGACAGTTAATGGTCTTGAGTTGATAATTGATTCTACTTCGACAAGCA
GTGTTGTGAGGGTTTCAGTGTTGAGACTTGGTCCTTGAGATTTCAAGAGT
GCAGCAAGGATCCTTCTGATACTTCTGATGTGACGCTCCCACACACCACC
CATATGACTTGAGGCTGGGGGATTGAATTTCCAAATCCAATCACCGTCTT
GCTCGTTCATGTATTTTGCAATTCTGTCATGGTCCATTTCTGAGATAGCC
TTCTTCAACTCTCTTTCGGTGCCAACGAAGTTAGTTCCATTGTCTGAGTG
CATTGAACGAACTTTTCCTCGTCTTGAGATGAATCTTCTTAGAGTCATGA
TGAATGTGTCGGTTTCTANTGAAGCGATCTTTCGATGTTTGGAGCTTTAC
AAATGATGCGTACGAAACGTACGATTAATGCTACGATACGACATAGCCTT
TTCCAATTTGAGATCTGCTTGCTTAACCTCAAAAACACATTATTTGTTGC
ATCTTTTATCATGATTGCGTTCACTTTCTTTAGTTCTGTATCGTTTGCGT
CTATCTTGGTCGAGGGCTTTGATTTCTTCCACATACTCTCGTCTTGCCAG
AGGAATTTTGGCCCATGTATCCACATCTTNGTGAAGATAACTCCATAGCG
TTTTAATTCCCTCCTCAGCTCTTTGACGATGAATGGTCCGAAGAAATCCA
CCCCAACGTAAGTGAATGGTGGTGATTCGACAACTCTTGCTTTTGGTAGA
TCAGCCATGATCTGATTGGATGTTGATCCTCTGAGGTAGCGACAAATGAC
ACAATGGTAGATAATTTTTCGAACAAAGGTGTTTCCATTGACAACCCAGA
AACCATGATTTCTCAATTCGTGAAGTGTGTGTAGACGACCTCTGTGAGCA
CACTTCTCGTGACACCATCGAACGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTGTGGA
GATAGCTCAAAACCACCTCACTGTCGGTCCAGAATACATGTTTGGCATCT
TTGATTTGTACTTCTTTCTCGACAAGATTGCAGATCTTTGTGGATAATAC
TCCTGCTGTCAGCTCAAGCCTTGGTATTGATACAAATTTAATTGGTGCAA
CACGTGATTTGCCAATTACTAAGGAACAATGGATTTCTCCTTCTTGGTTG
ATTTGTCTCAAGTATGTCACTTGTCCATATCCTCTCTCAGAAGCATCTGA
GAAGTGGTGGAATGATTTCTCAACTGGTGTACCGAAGTCATCTGGCTGAT
AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNAGGGATGCATCCTTGAGTGACGATCCAAGATCCTC
TTTTGGTAGAGAATTGAGCACGGTTTGACTGTTGGTTACGAACTTTACGA
GGTTGAATCCTCCTCGTTTACATAGCGATTTGACACCCTGTATCATTTCA
ATGGTTTCTTGTTCGTCATCTTCTGATTTCAACATATCATCGACGTAGAA
ATTGTTGAAAAGAATGTTTCGTATCTTGTCGGGGAAATCTTCTTGATTGT
CGATGGCTGTTCTTCTGAGTGCATAACTTGAGCAGCTTGGTGATGATCCT
GCACCAAAGACGTGGACGTTCATTTCGTAGTCGATAGGTGTTGTAGTTAG
ATCGTTGTCTTTCCACCAAAGGAAGCGAAGAAGGGATCGTTGATGTTCAG
GAACAAAGACTTGGTAAAACATAGCTTGAATGTCTGCCATTACTCCAATC
CGACCTTGACGAAAACGTGACAGAACTCCAACAATTTGATTGGTCAAGTC
TGGCCCGGTTAACAATTGTTTATTCAGTGATTGAGTCTGGAACTCAGCTC
CACAATCCAGGACGACCCAGACTTTCCCTGGTTTTCGTGGATGATACACT
CCATGGTGAGGAAGATACCAAACTTGCTTGTCATCTGGTAATGGTTTGGC
GATTCTTGCATGACCATTCTTCAATATGGTATCCATAAACGTCATGTAGT
GGTCGAAAAAGGTAGGGTTGCGTTCAAGTTTGCGTTTGAGACTTGCTAAT
CGTCTTTCTGCAATGCGTCTGTTGTTTGGTAAGTTGCTTTCTCCATCTCT
GAGTGGTAATGGAAGTACATAGTGACCATCCTCAATCGTTGTCTTTTCTT
CCATGATGGACATAAACCTTTTGTCTTCGACTGACATGTGTGAATCTTCA
AAGTCGATACGTTCGTTAGACTGGTTTTCGACAAAATCAGTGTTGTACAA
CGACTCGTACATTTCTCCAATGTCCATTTCTTTCACATTGGTCTTGAAAA
CGAAGTGATTACTCTTTGATTTTTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGCATGGCTTGTCTACTGGTTGAAGATTG
ATGCGTCTTTGGTTGATCAAAGCGTGACGCCGCAGGTGGCTCCTGCATGA
CTTGTCTGCCGATTGACGGTAGGAGTGTCGACGATTGATCAAGGTGTGTC
GACGATTGATCAAGGTGTGACGCTGCAGGTGGCTCCTGCATGGCTTGTTT
GCTGGTTGAAGATTGATGCGTCTTTGGTTGTTCAAAGGGTGACGCCGCAG
GTAGCTCCTGCATGGCTTGTTTTCTGGTTGAAGATTGATGCGTCTTTGGT
TGATCAAAGCGTGACGCCGCAGGTGGCTCCTGCATGACTTGTCTGTAGAT
TGACGGTAGGTGTGTCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGGCTCCTGCTTGGCTTGAC
TTGTGTCAGTTTGATCTTCATTCGAGGTTCTTGTACGAAGCACATCAATC
CTTGCTGAAGATAATGCTATCTGACGTTGTAGTTTCAGTTCCTTTGTCCT
TTGAGCATGGTCATATTCTTCTTCAATGAATTTTGACTCTGCTAGTAGTT
CGGCTCGTTTGATCTCTTCTTCAAGCAGTTGATCAGAAAGTTGACTATGT
CTCGATCTTACTTGGTGAACTCCATGTTGGTGATGTGGATCCTGACTTCT
TCGACGATTTGGAAGAGTGAGTGGATTTTGACAACTTGGAAACCATTGAA
GAACTTGAAGAATGTGACGATCGTAAGGATTTAGGTAACCTTGATGATTT
AGAAGATTTCGATGATCGTGATGATTGCAAAGATTTACGTGATGGTGCAG
tgcttctttcttcttcttgaaGATTTAATGTCTGTATTCTGTCGTAAACT
GACTGTTTTACGACATTGATTTGATCATCAACTGTGGTAAACCAATACTG
GTCTTCAGCCTTTTCGTGTGGGTCGAGTAACTCGTTCAGCTCATTGTGAG
TGCCCTCGAAAGTTAATGCTGTCTCGTTGTACTGTTGAAGTCGACTCTTG
ATAAGACTTTGATCCAGCAGGGCTAATGTTTCCATCATAGACTTGCCTCG
TTTCTCTAATCTGTTGAGAAGTCTTTTTCGTTCAGCAAATAAGTGTTGAA
TGCGTGATTTCTTACCCTTCTCAGTTAGTTGTCTTTCTCTTTTTGGGTAG
CGACGTGTTGGGGATAGAGCTGTTGCACCAAGTAAAAGCGATCCTGTTTC
ATCATCTTGAGATGGTATGCTCTGTTTGTCATCAGGTTCCTCGACAACTT
GGGCATCTCCTTCATCTCTGGGTTGATTGACTTCTATGGCGGTCTGGTCA
ACTTCTATGGTGGTCCGGTCGACATCTGTGACGGTACGGTCAACATCTGT
GGCGGTACGGTCAACATCTGTGACGGTACGGTCAACATCTGTGGCGGTAC
GGTCAACATCTGTGGCGGTACGGTCAACATCTGTGGCAGTACGGTCAACA
TCTCCATCTCCATTGTGAACTCCAACGAGTTCTAAGGGACGATCGACATC
GTCTCCATTCATTCTTATGTTTCACTTTGTGGAAGCCCGAAACATTGTGG
TGTGTTACAACGCTCTTTATTGATTCAGAGGctagaaaaatacaaagaaa
gcctacttaaaatttaaaataaaataaaaatagctaAGTTCCGAATTCCG
GAAATCAGTCAGTTCCGGATGGAAGGGGCCAATACCGGAATACGGAAAAC
TATACGGAACTCCAAAAGTAAAATGGCCCTAGAGCAAATAGAGGGCAAAT
AGAGGCCAGAAATAGAGTATGAAGCCAAATCGACCAAAGGACAAAATGTA
ATGCCCAAAAGACTAACGGTCTGTGACCAGAAAAACAGCTAGGAAAAATG
ACTCCAAGGATCGACTAAACGAAAGTCACAGACCAGGTCAAAAGGTGAcc
aaaatacaaggaaaaatctaaagaatcctaGAGAATCTAGTAccaaaaaa
gtgtacaaaaataggaaaaattgcaagtcaaaaatataggaaaaaaCTTA
CTGAAACATAAGCTCCAAAGCACTGTGTATGGATGGCTCCACAGGAaata
ccaaaataaattctcaagtaaatccaaaatgaaaatcaattcAATAANNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGAGcattaaaaactaa
ttaaattaAACATTAAAACGCGATATCATACGCTAATTCCCAAATGGGAA
TATAGCTACCAAAACAACATACGTCATAATATGACAAGTCTCTTGAGGCC
AATGTTATCATGGCCGCAACAGGTAAAACTCATTAAACAGTTTCTTGGCT
TTAATATTTTTGCATTGGTTGACAGAATCTAGGGACAATTGCTTAGCGAG
AATCAGATAATTATGTAACATTTTTTGAGAGTTAACCTGAAATAGCTTGT
TAAATCAACTGCCATTCATACCCCTTTACATATTCCACCATTTCTTTAAT
GGTCTTAATTAAAGCTTCATAGGTCTCTTTCGACAGGAGATTGACAAAAG
CAGCACATTTTAGTTCTGGTGAACATTTGGTGCATGAAATCATTATTAAT
CGACAgattttggataattttgtaACGAAATGCGcttaaaaaacacaaat
ttgtaAAGACGTCAAGGTCGAACCAGTTTTGACCCCCTTGTCAGGAGAGA
GTTTCGACTTAAAGTCAACTAACATTCAAGACAACACTTGTCTCGATATT
GCTGCTAGGGGATTTTGGATTCCAGGACAGAAGGCATTTTCTGACGCAAG
GGTTTTCAACCCAATTGCCAAACGGCTCTCGAATTCCAATATTTCCAAAG
CATATGACTCGAACGAGAAAGAAAAGAAGCGCGTATACAATTTGAGAATT
TTACGAATTGAGCACGGCTCATTCACTCCTATTGTTTTTACCGCTATGGG
CGGCATGGGAAGAGAGACTAAGTGCTTCTATAAAAGACTCAGTGAACTTT
TATCAGAAAAACTAGATGAACCTTTGTCAGTCACAACAACTTGGGTTAGA
AGAAAGGTGGTCTTTGCTCTTTTGAGTTCAGTTCTCTTGTGCCTCCGGGG
CAGTTGAACTCCATGGAGCAAAGATAACCTTCCTTCACTCTCCAAAAGTT
CAAGCGACTGTGAACAGTTATGTtctatttgaatttattgaatataagAT
ATATAACAAATTTTGTTAggtgaaaacaatcaaatatctttccaaaacca
TTGTGAAATTTAACAGTATATCCTACAGTATAAATATATTAAAGAATAaa
ttataataataaaaaaaaaaatgtgttacatttttcaaaatttatcttGG
TTTTCTGTTTCTGCTTCAAGCAAGTTTAC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_009837XLOC_009837Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00017588-exon-sc0000271-1491911889:90931..91016TCONS_00017588-exon-sc0000271-1491911889:90931..91016Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00017588-exon-sc0000271-1510915933:90931..91016TCONS_00017588-exon-sc0000271-1510915933:90931..91016Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00017588-exon-sc0000271-1575043694:90931..91016TCONS_00017588-exon-sc0000271-1575043694:90931..91016Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00017588-exon-sc0000271-1491911889:103353..104409TCONS_00017588-exon-sc0000271-1491911889:103353..104409Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00017588-exon-sc0000271-1510915933:103353..104409TCONS_00017588-exon-sc0000271-1510915933:103353..104409Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00017588-exon-sc0000271-1575043694:103353..104409TCONS_00017588-exon-sc0000271-1575043694:103353..104409Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000271supercontigsc0000271:90931..104409 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.584573	0.569018	0.516099	0.389214	0.695049	0.785115	0.922468	1.45454	1.25121	0.454873	0.712629	1.49565	0.619785	0.592911	2.01273	1.4976	3.10131	2.88982	1.59869	2.03094	2.14623	1.36105	1.24869	0.714959	0.862214	0.677957	2.7139	2.77934	1.17713	0.93469
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00017588 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top