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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00017308 ID=TCONS_00017308|Name=TCONS_00017308|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2042bp
TTTGTGtcagtcattttcattttggatctccaaatttcaaatcaatttct
tATGGATCAGGCCATCAACGCGATTAGCACAGTCTACAGATCAACAAGAC
AAGGATGCTGTCAGTGCAAGTGACACAACTCTTCTCTCAACTGCTGCTTC
TACAAACGCTTCAGAACTTGTAGAATTCGATACCAGCTCCATGCAAAATG
GTACCAATAGTAATAACAAGTACCACCATCCAAGAACTGGAAGTGGTGGT
CGCTACGTGAACATATCACAAAACGAGAGCCCGTCACGCTTCGCTCCTGG
TCGTGGCGCCATGGACGGGCGGATGGACGGGCGGATGGTCAACGAAGGTC
GATCGTACAATAGTAGTGCACGCGAGGAAGAAGTGTTGTCTTTGTATCGA
TATGATATGCAAGGAAGCCCGATTCCATTTTCGGATCATTCTACAGATGG
TGAAAGCGGGATTTCTGACGCTTATAAGACTCTAATGAAACGTGATTATT
GCTCTTTGAGAAATGGATATAGTAGTTATTCAGCTAGCTCTACACCATCC
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TGGCGATTTATTTGAAACAGATTCGATTTAACTTGAACCGGATTGAAGAG
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GAACCCGAATAAAAGTCAAAAGAGTACATCGAATATTTTTGAAGCCGTAC
GTCGTAACAAACGTGTTATTTACGCAGATTTGGACGATAATCTTGTGTTT
TACTTGTTCCCTAAAAACGAGCTACCTTCAATGACGTTGTCGTTCAAAGT
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TAAAGTTGGGAAGTTTAGATTTGAATGCTGAAATGTTACCAACCACTGTA
ACTTTCGGTGAAACTTTAACGACCGAGAAACGAACACGCTCGCTACAACC
TGTCGTTTTACCGAAAAGCGAGAAATTAGAGATTTTGTTATCACTTGAGT
ATAACGTACCGTCTGCTAAACTTATCGTCAACATAGATCAAACGACTAAA
TTAGACGAGCTAAGATACGAATCCAAacgagaaatcatttttcaagcCGA
ACTTGTCTCACCGACATGCGAGTGCGTTCAACGAAAAACGACTTTTCTTC
GTATATCAGAAGATAACCCTGGCTCTAATAAACCATTCGAATTCGATTTA
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AGAAACGGATTgactaaaaaaaaacataaaagcaAAACGACATAGATATT
TTCAAGTACCtctaacaaataaaaaatagtattttaaagAGATTATCCGG
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GGGGATAgcaattcctattgaaatcttaATGGGGATAGAAACTTCATTGT
TCCAAGGTAAAAAAATCCAGTGATGGTTTTGgagttcaatttttaaacat
tggatctcgaatggggatgaatCAAAGTGGATGGGGTTAGTGAGgttggg
gtcccagcgggtctgtgacaaagGGGTCTTTAGCTTTAACGACCATTCta
agaattattttttgtcaGTTTCGTTTATCTTCTggtgttttttattatat
atcaACATCGTTTAAATTTAAGATGCATAGCTTTGTTTTTCCTGTACATA
AGAGAAAGCAAGAATTTTCCCATTGTCTTCTACCAAAAAAAC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000264:246514..255710- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00017308 ID=TCONS_00017308|Name=TCONS_00017308|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9197bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000264:246514..255710- (Clytia hemisphaerica)
TTTGTGTCAGTCATTTTCATTTTGGATCTCCAAATTTCAAATCAATTTCT
TATGGATCAGGCCATCAACGCGATTAGCACAGTCTACAGGTTAGTGAATT
TCTTTCGCCGTCTATTTAGACTGCACGCATCCCTTCTAATATTTTTTGAT
ATAGGGGATGCGTATCGTGTATAAAATNGATGCATGCATCCCCTCTGATA
TTTTTTGATACAGGGGATGTCTATTGTGTTTAAAATTCCTGCCCGAGAGT
TACCCCTGTCTTTTTGTTTTTCAGTTTTAGAGACTTGATTAGTAAGTTTT
GTATGACAGATTTTTAAATATCATTTAAAATTTGAATTAAAAATTTGAAT
ATTTAGAGGTTAATACACAATCATTGAGTTTCTAACGCTCTTTAAGAAAA
TTGAAACTTGCGGACAGGAATATTATACACGATACGCATCCCTTATATCA
TTTAAACATATCAGAGGGGATGCGTACAACCTAACCTACATTAACATAAC
TCGATTATTCACGATTTCTGTCCAAAAATTCTTCTCCTGGGGCGGGTGAG
GGGTTGGATTAACTTCTATGCTAGCTAAAGAATAATCGCATAGTATCTGC
TATCGGCACAAACTTTGACTTTTTTTCTAAACTAATTTTTCTGATATTTT
TACGTAAAGTATCTGCCTTGCCAAGTCAATGTTGCAGCAACGACTTACAA
ATATTTATTTATATAAGTCGTTGGTTGCTAGAAACATGTCTATCATCAAG
GTTTATCTATTGATATCTGATGACCTGGGTCGAGAATAGGAAAGAATAGA
AATGAGATTTAGAAATCCTCAGTCTCCTTCATGTACTTATTTTCAATTTC
TGGCTACACTGTCCTATTGTGTTTTTCTGAATCAGTGCGGTATAATGCTA
ACCAATGATATTTCGATGAGACAACAGCCTGAAAACAACAGCCTGGAAAC
AACAAGGGGTCAATTTTTGGGTCTAAGATTTAAATGTTTTTCAATTTTTC
AATTTCGATACTAAGCACAAAAGAACTTTTTCTCCACTTTTTATACAGCT
TCAAACAAAATGATTCATACAATCGACTCTCCTTGATTCGAACCTCTACT
ATTCGAATTTTTCTGTTATTCGAACTAAAAGATTGGTCCCCTCAGCTGGA
AAGTCTCCAAAATACTCTCCGTAATTCGAATCTTTCTTTAATTCGATGAA
ATTTCTTGACCCCTTGAAGATCGAATTAGAGAGCGTCGACTGTACTGAGA
GAAAACCGTATTAGAGCCTTTATAGATAAAAATACAGTTGACAGTTGACT
CTCGCTAATTCGAACTCTAATGGGGAACCTTATTTGTTCGAATAAAATGG
ATTCGAATTATAGATTAGAATTTAAGAGGGTTTCTCCCTGACGGAAACTG
AGAAAAACTTCGAAATGGGCTCTTCCAGAAAATCCGTGGAGGATATATTA
TTTTTTCAATGAATTACCCCTGGACAGATTGACACCTTGGACAATGGATT
TTTCTGGAAGAGCCCAATTATAGAAGGATTCGAATAATAGAAGTTCGAAT
AAGCGAGAGTCGGTTGTACAATTCTCTCTTTCCCAGCGCAATACACTCTT
CTCGAAATGCATAAAATCGTGATACCAGCCATTATAGAAATATTCTATTG
ATTTTCATTGCGAAATGAATACTTGAATTGTTTGAATTCTATGAAAAAAG
TGAAATCGCAAATATTACATCGCTAAATATTTGTACAACTCAAGACGAGA
GTGTACTTTTGGTGGAACTTCGCTTTTTGACGGTGCTGGATCTGTGATAC
GGAGATGTTGAATTTAAGTTTTAATTTGTGACTTTACTGAAGATTCAGCC
CATTTGCTAAAAATATTCTTAGTTTCTAATAAAACATGATGTACCAGAAA
GAAATGTATACAATTTTCTGAAGATATTGTGGGCTTCCGATTCTGTCATT
TGGAATATGTTAAAAATTTTTAACATAACTTTTAATTAAGTGAACCGATT
TTAAAGTTTTCATACCAAAAAGCTTTCCTATATCGTATAAAATAGAATCG
ACGAAAAACCGTAACCTCTACTCGCAATATCTTGACAAACCTGTATACCT
TCTTTTGGCGTACCCGGTACATTTCCTGAGATGACTTGAGTTTTGGCGAT
TTGACGTCATTATTTTCTAACCTGAAAATTCCCGAAAAATCCGCAGAAAA
TCAGTCCACCCTAATCGGTTATAACTTAGTCGGCTCTAAGTGACTAAGTT
TTGGCTTGTTGACTAAAATTAGTGCCGACTAAAATTTTGGGCCAACTAAA
AATTTGGGACAAATTAAAAGTTTATAATTTCGCTTTCCTTAACCAACTTT
TTTGAATACCACATCATTACGTCCGCGGCAATTCATTATTTCGTCCGCTA
TTATTCATTATATATTAGTCGGCCCTTAGTGACTAAATTTTGATGAGGTG
ACTGAAATTAGGGCCGACTAATAATTAAGGCCGACTAAAATTAAGGCCGA
CTAAGGTTTTGACCGATAAGGTACATTCTGTACGGCATTAATATTTTCAT
GCTTATAACCTCTCTAATAATCCCACAGTTTACGGCTCGAAGAAGACAAA
AAACAAAACGAAAACTGTACATTTTAATAGGAATAATCTATATAAGAACA
TTGATGAACAAAATTTTAAGAACAAGTTAAAAACATTTTAATGCTTCGTG
GACTCTAAAGCAGCTAATAGCATACCGTCGCGAATCTAAAAATAGACATT
GATCTTTATGTTTGACTGAAATTCAATGCCATCACCCTTCGCGTTTATTA
CGCTTGCACGCAAATTACACTCAATTACAAAGAACAAGTAATAACTTTCA
CGACTTTTGAATTAAGACGAAAAGGACTGTGGGATTGAATTTCGGTCAAA
TGAGAGAACTAATAATCATGATGTTTGCATTACGAAGCGCTATTCATTAG
CAATTTGCTGAAATAAAGAACATTCTAAGTACAAGGCTTCAAAGATTTCG
GACGTTCTTATAAAAAAGAGCTAAATCATTATTCTCACTCTCAAGTGTTC
ATTTACAAACGCCCATCCGCCCTAAATTCCGCCTTTCGAAATACGAGATA
AGATCATTAAAGGAATCATAGTTTTGTTTTAAAAGCCGAAACATCTTTCT
ACCGTCATCTGCTTAAAAATAAAGGATAAAAAATGGGGAAACTACTAAAA
AGATGATGAAAAAGGCTTATCCAGCAGGTGTTTTTTACGGTTTCTCATTT
TCGGTTTTCTTTTCTTTTTCACATATTATATTTCTTTGAAATTTATTTTG
CTTCTACAGGGGGAAATTTTTTCATTTCCCTCGCTCCATTCATGAAAATA
TTTTCTGTGTTATTATTCACGAGAGTTAATTTACGAATGGTTATTAGTAA
TCATTTTTATATTAATCTTTCTGTGTTATTTCAGTTCGTTCTTCGTGTTT
CTTCTTCGTTTTTCGTTCTTCTTCGTGTTGTTATAAATGGTTGATAATGT
TTAATTATTTGGATTTAGGTCTCTAAGGCCTTTAAATTTTGAACCGATTA
GTCAGTAAAACTTGCTAAATGATATTTATGACAAAGTGGTAGTAGAATAG
GTCTAAAATAAGTTAAATATCTGTCTCAAAATAATTTGCAGCTGGAGAAA
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CGTTTAAAAGATATTCGTGAGTGGAATATTATCAAGTAAAAATTTGGGAA
AAAAAAGGAAAATGAAAATGAAAAACGAAGAAGAAAAAAATCAATTTCTT
GTAGAAATGTGGTATAATTACAATTTTCACAGCAGTGATTCTTCGATCTA
CGATCATCATCACTGTGAAAAGATTTTTCAAAAATATTCATTCAATCAAA
AGATATCAAACTAAGTTTATTGCCGGTTGATCGACAAAAGGCTGTTTTTT
GTCGTTTTCAACGTTTTTTACTACTTTATAGAGTCAACCAGCAATAAACT
TTGTTTGATATCTTTTGATTGAATGAATATTTTTGATAAATGTTTTCACA
GTGATGATGATCAAAGATTGAAGAATCACTGCTGTGAAAATGGTAATTAT
TTTTCTCCAGCTGCAAATTATTTTGAGACAGACTTTAGTTTTGTAATTGC
AGTTTACAATTCGATTCGAAAGCTTTCTTTTTGTCAGCTATTAACAGAAG
GGTAGGGTGTCACCCTCCCATCTTTCTTATGATATAACGAGGTTTAACAT
ATTTTCAAATGGGATTGAAATGTATTTTTTAACTAGAGCGATCTTTTTCC
ACATTTTTGACAGCCGTACGTTTAGGGTTGTTTGTTAGGCACAGTGCTGT
TTTCATTTCAAGACTGATTCGCAGGCCTCTGTACGTCAGCATAGAAAATT
TTGTGTTAGAAGACGAGCAAAAGCCTATCGCAATGAGTCATTTCAAGTTT
TATTCATACATGGGGATGGACGAATATTTCCAGGGGGTTATACGAAGAAC
AATTCCCAGGGGTCTAAAGAAAGTTTTTTTTAATTTTTCCAGGGGGTAAA
ACTTCTAAAACTTCCAGGGGTAAAAGCCTGATTTTACAGTTCTTCCACCC
TCACTTTAAATTTACAATATACCTTATTACATAAGAATAAGTGTTAATTA
AAACCCTTTACTTAAAACCAGCCCTGGTGTCCTTGAAAAAGCAAATAAAA
TTAGTGATAATCTTTTTGCATGTTAATCTCAAGGCCGTAAATTTTGTGTC
TACTTATTTTCGTGTAATAAGGTACATTGATAGCCTTTCTGTTGTAAACT
TAATTGTATTATTTCCAAACTATTGTAGATGGTGGCATTCGTGTCTAAAC
TTTTCATAGACATAAAATTTTCACAGCGTTGAGTCCTCGGGTAGAGTCTC
CATTACTTTAACCCTCTATTGTCTCTATCATTCAATAACTCGATCAAATT
CGTTGGTACCTGTGGAGATTTCCTTATAAACTCCTAGAAAAGAAACCTCT
ATAACTCGAATATTACCTTAACTCGAATGGTTTTGCTGTTTCCTTTACAG
ATATCAGGCCTTTATGTCTCGAATACATGCTTTTTATAAGAAACGGTAAA
TTTTGGCTCCACTGAGCTGTTCTTAGCTTTTTGAAATTTTAAGGCTTAAA
TATTCTTACGATGTTCTTAAAAATGGATTTAAAATTTGTTAAAATCAGTA
CTCTCTTAGATTGCTCTTAATTTGTTCCTATGTTTTGGGGTATATTTACT
AAACGAAATCTAGGAACATGGTATACACTCTCTTTTTTAATAAGAACCAG
TAACTTTTGACGATGCTCGACTGTTCTTATTTTTTGACACCTTGAGTTTG
AGCCTCAATTGTTCCTATCCTGTTCTTACTTACAAGATGAAATTGAGGTA
TTTTAGGCTTTATATCCAAATTTTAGAGGATTTTTACTACTTTGACCCCT
AAATTGCTTGAAATTGAGCAATTCAATGGAACATTGTTCTTAATTTGTTC
TTATAAAATAAAAAGAGAGTACCTAGTATATTTTATAAGGCTTTGCCAAA
TTTGATGGCATAGTGAATTAAAAATGAGTGAGCTTCCCTTGATCTTGACA
AGAATCCACATTGATTTAGACAAAAATGAAACATAATTTTTATCCCAGCA
GGATATTTAAATTTCATTTGACGGAAATCAGGGTTAAATCGGCGGAATAA
GGGAATCGGGTACCCCCTGAAACCCGAATAAGAACCTCTTCAAATCCGCA
CTGATTTAGACAAGTTGATTCCCAAAAATGAAACATAATTTTTAAGCCAG
TAAGATATTTAAAATTCGTTTGTAGTAGTGATGAGCCCAAGAGAAACAGG
ATTTGGTTAAGCGTGGGAGCATGGATTTTTTCCTTTTTTTCTTTTCATGT
TTTGACTTATGATATCAGATTTGTCTCAAAATGTCTGTAATTCTTCAAAA
AAAAATTTGTCAAAAATCTACCTTGTTTTTCCCTAAAAAAATTTTCTATT
TTCTCTATTTAGGCCTATTTTTCTTTGCTTCTTCTTTTTTTCACCACGAA
TCTTTAATGTTTCTAATGTATTCTATTATAGTTTTATATATTTTTCAGCT
CATAATTTAATAACAAAACGTTGAAGAAAAAAAGGAAAACATATTTCTAT
ATTTCGTCTCCACCAGCAGAGAGAAGATCTACCTTTTTAGATTTCTCTGT
CTTTTTTCATTTTTGTTCTTCATTTTTCTATCGTCTTATCTTCTTCATAT
TTCATTTTTCCTTCACTATATGCACAGGGAGGAGAAGGGTGATATGTTTT
GTCCTTATATTTCGCAAAATAAGAAAAACTTCGACAGAAAGTTTACGATA
ACAATCGTAATATATTTGAAATATTTAGGAAAATATTTTCTTACCCTAGG
TGGGACGATATTTACAAATTTTTGATTTCGGTTTTGTAAGAGGTGTAAAA
ATTTACGGCAACGAAAAATTATGTTCACGAAGCTAACTAAATTTCCAAAT
TGAGGTTAGTTTTTTGCCCCGCGAATCATCTTTTGTTCAACTGTTTAAGA
TTACAAATCCATGTGAGGCTCAATATATGAAGAAATCTACTTGAGATTTC
TGATGGCTTTTGAATGAACAAAGGATTTAATTTACAGCGATTTTCGAAAT
ATTTTGAGATTACTATTCAATATGAATTCCGATCCACCTTTTTCGGTTTG
GTATTTTCAGAAGCTTCGGCAACCTTTTAATCGACATCACATCTAGACAA
ATATTTCAGTTAGATTTTCTTAAATATTTTTCACTATCCAATCATAATAG
GCTGAAAACTGCTCATCTCATGTGAGAAATCGTTCATTTTAACGATATTC
TAACTCGGTTTAGCGTAATAATAATGCTCTACAGCACTAGTTTTTCTAGC
TGTGGACTGGACGTGCTTTTAGCGAGATTTAATTGGATTGAAGGTAGATA
TTAAAAATTGATCACGGAAAAACTAGTAATCTAGTGATAGAAGTTTCGAG
TGTTTAAAATTGGTTTGCAAAAATTGTGGCATGATAGTTGTCACTTGTAT
CGAGACAGTCGGCTAATTTTAAAGTTTAATTAACCCCCTCCCCTCTTAGC
ATTCCCTTTCCTAATTCTAATTGTATCTTTAACCCTTATCCTCATTCTTC
TATATAGACATCAAAACCAATAAAAAAAGTTAAAGTATAGCGTGTGAACC
CACATTATCCAAAATGGGTAATGGTCAAACTCTGTTACCTTTAGATCAAC
AAGACAAGGATGCTGTCAGTGCAAGTGACACAACTCTTCTCTCAACTGCT
GCTTCTACAAACGCTTCAGAACTTGTAGAATTCGATACCAGCTCCATGCA
AAATGGTACCAATAGTAATAACAAGTACCACCATCCAAGAACTGGAAGTG
GTGGTCGCTACGTGAACATATCACAAAACGAGAGCCCGTCACGCTTCGCT
CCTGGTCGTGGCGCCATGGACGGGCGGATGGACGGGCGGATGGTCAACGA
AGGTCGATCGTACAATAGTAGTGCACGCGAGGAAGAAGTGTTGTCTTTGT
ATCGATATGATATGCAAGGAAGCCCGATTCCATTTTCGGATCATTCTACA
GATGGTGAAAGCGGGATTTCTGACGCTTATAAGACTCTAATGAAACGTGA
TTATTGCTCTTTGAGAAATGGATATAGTAGTTATTCAGCTAGCTCTACAC
CATCCAGGATTGTTAATCGATATAGCTCTCCTATTGAGGGAAAAGATGTG
CCCTATACTTGCGCATTGGATATTAATTTAGATTATACTGTACATGTTGG
AAAATTGGCGATTTATTTGAAACAGATTCGATTTAACTTGAACCGGATTG
AAGAGTTTGTTTTGGATGGGGCGCGCATTCGTGGAAAAGTTAAATGTTGT
TTGATGAACCCGAATAAAAGTCAAAAGAGTACATCGAATATTTTTGAAGC
CGTACGTCGTAACAAACGTGTTATTTACGCAGATTTGGACGATAATCTTG
TGTTTTACTTGTTCCCTAAAAACGAGCTACCTTCAATGACGTTGTCGTTC
AAAGTCACTATTTGTAAGAAGTTGTTCCGTGAATTTACAATAGGAGAAAA
CTTTGTAAAGTTGGGAAGTTTAGATTTGAATGCTGAAATGTTACCAACCA
CTGTAACTTTCGGTGAAACTTTAACGACCGAGAAACGAACACGCTCGCTA
CAACCTGTCGTTTTACCGAAAAGCGAGAAATTAGAGATTTTGTTATCACT
TGAGTATAACGTACCGTCTGCTAAACTTATCGTCAACATAGATCAAACGA
CTAAATTAGACGAGCTAAGATACGAATCCAAACGAGAAATCATTTTTCAA
GCCGAACTTGTCTCACCGACATGCGAGTGCGTTCAACGAAAAACGACTTT
TCTTCGTATATCAGAAGATAACCCTGGCTCTAATAAACCATTCGAATTCG
ATTTACCACAGGAGGATTTACTATTGAACACATTGATGCTTAGTGTTTCG
TACTCAGCTACCCGTTGGCTGCAACAAGAGAAAATTGGCTGGATAGCTTT
CGGACGAAATTGTAGCGGTCAGGTCGAAGCAGAACACTGGGACATGATGA
TTAGCCAATCATCTTTAAATGAACCCGCCGTCCAGTGGCATTGCCTATGC
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TCCGGCCTTTAGCTACACCCCTGTCTCACAGAGCCGGTGGAACTTTTTCC
TCAGCGGGGATAGCAATTCCTATTGAAATCTTAATGGGGATAGAAACTTC
ATTGTTCCAAGGTAAAAAAATCCAGTGATGGTTTTGGAGTTCAATTTTTA
AACATTGGATCTCGAATGGGGATGAATCAAAGTGGATGGGGTTAGTGAGG
TTGGGGTCCCAGCGGGTCTGTGACAAAGGGGTCTTTAGCTTTAACGACCA
TTCTAAGAATTATTTTTTGTCAGTTTCGTTTATCTTCTGGTGTTTTTTAT
TATATATCAACATCGTTTAAATTTAAGATGCATAGCTTTGTTTTTCCTGT
ACATAAGAGAAAGCAAGAATTTTCCCATTGTCTTCTACCAAAAAAAC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00017308-exon-sc0000264-1575043694:255622..255710 | TCONS_00017308-exon-sc0000264-1575043694:255622..255710 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017308-exon-sc0000264-1575043694:246514..248466 | TCONS_00017308-exon-sc0000264-1575043694:246514..248466 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017308-exon-sc0000264-1510915933:255622..255710 | TCONS_00017308-exon-sc0000264-1510915933:255622..255710 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017308-exon-sc0000264-1510915933:246514..248466 | TCONS_00017308-exon-sc0000264-1510915933:246514..248466 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017308-exon-sc0000264-1491911889:255622..255710 | TCONS_00017308-exon-sc0000264-1491911889:255622..255710 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017308-exon-sc0000264-1491911889:246514..248466 | TCONS_00017308-exon-sc0000264-1491911889:246514..248466 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000264 | supercontig | sc0000264:246514..255710 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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