TCONS_00016962 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00016962
Unique Name	TCONS_00016962
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3657

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000255:868..22689-

transcript sequence

>TCONS_00016962 ID=TCONS_00016962|Name=TCONS_00016962|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3657bp
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AAAAATA

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transcript from alignment at sc0000255:868..22689-

Legend: exon

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>TCONS_00016962 ID=TCONS_00016962|Name=TCONS_00016962|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21822bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:868..22689- (Clytia hemisphaerica)
TCTTAGAGAATATTGGTTTTAGTTGCACTCGATGTTGATGCATTATGTGC
CTGCAGAATAGTTAAGGTAATTGTTATTTAAAATATGTTTTATTATTAAT
CTCTGCTTAGGGGTCTTCTTTAATGAAATGAAAAAGTTACTTTGAAAAGT
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TACACAATTGTTCCTGTTTCTGGGATTGACAACATCAAGGAAGTCTATGA
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GCTAACTGACTGACTAATACACTTTGTATACTCTGTTTTTTATACAACAG
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TAATCTTTCGTTGAGAAATCCAGTACTTGTATATTCAGACAAAAAAATAA
TGAAAGGTGCTGTGGCTAATGAGCATTAATTATTCCTTATATATTTTGCT
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CTAATAAGTATACAGAAGGATTTTATCATGCTGAAATTTCATCAAACAGT
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ATTTTATCCAAGATCTTGTAATTTGTGTTAAATAATATTATGACCAGTTA
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CTTTTATTGCAAAAGTGAATCTCCTCTTTCAAGTCTGGCATAACTTTTTG
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CACTACGGTTGTGTTAATTGCTCCAAAGCGAAATGAACCCAATCTATTGG
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TCTGTATAATTAAATACATCTTATATCTGACTAGCAATACATAGTAACTT
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TTTGCTTTTCAGAGAGAAGCTTCTGGATGAGTATTATGAATGTTCTTATT
ATGGATCAAGTGTATGTATAATTATAAGTCGCATTTTATCGGATAATAAG
TTTTTTTTGGCTTTCAAACTATTATAACCTGTATTTCAAAAATTTCCTGT
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TCCAGAATCATTTCAAAAACACTTGTTTATAGAATTGTTTTCAAATAAGA
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GCTAAGGAATTCTCGTCCTTCATCCAGCTCCGCTATAACATATCCCTGGA
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TATACGATTTGGCTTGGAAGTTAACCAAAGATAACAACGACCTCCTATGG
TGAGAAAAATTCCAATAAATTTTATGATACATTTTCTCAGGTATTTATTT
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AACCTCCCTCCTATCTTTGTCGGTATATATTTTTACTTTTTGGCTTTCTT
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AACCCATAATAAATAATTCTGCCATTAAAAATCGTTCTGCTGTTTTGTCT
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TTTTTTGAAAATTGTACCCCATAATGATGGGTTAGTTTATAATAAATCAA
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ATGAAAATCGTCTTCGAAAAAGAGTATCCTCTTCATTTAATTTTTCTTCC
CTATCCAATTTGGCACACGTTGTTTCACGCGTTGTAAACGTTAGTTATGC
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TTTGACTTTTGTTTTTCTTTCTTTTTTTTCAGCTTGCGACTCTTCACGAT
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GTGTATTTTTTATTTAGAAATGTAGTACCTTAAGAGAAGAAATTTTGATT
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CTGCTTCAAAAATGTTGCTTCAAAAATGCTGAGCTTCCATAAAGATTGCA
GTTATTCAACCAATCTTCAAAATAAAAGATAGCGCGTGACGTAACTAAAT
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CTCAGATTTTAAGCTTATATCATTTAAAAGCTTTTCAGGCTCTAATTAAA
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TGTAATGTTTGTTTTAATGTATACGGAAGCATGGCGTTTGCCATAAGATA
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ATCTTCGAAGAATGAAGATCGTAATTTCTATCAGTGTTGATAGCTCTTCT
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TTTACCATTTGTTTAGAGAAGATACCTACAACGAAAAAAAGTGATTGCAA
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AAACGGGAACTCTATTATCTACTGATTTCTTTCTCTCGTTTCCAAGCTTC
TTAAAAATTATTTTGAAAAATAAGGAGGAATGTTAGTAAAATGGAGGAGG
AAGATATTTTAATTTTTTTTCTGCAACCTTAACATTGGCGTGTGCAGCAA
AAATGTTCCAGAATTGAGTGGAAAGTTCAAACTTTCGTGATAGAACAGTA
TAGGTGAAAGATTGGCTAAAAGATGGAGATAACAAGGAAGCATATGCCAA
TATTTTTCAAGAACTCCATTTGAAAGACAAGGAAAATTTTAGAAGATATT
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GGTCTCCACTCCCATGCCTCACGTTTTTTGGCAGGTGACGCTTTCCCTCT
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GGAGTCTTGGCCAATCGTTTCCGTGTTTTTACCACGACAATATACCTAGA
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TGCTTTGTGAATTTTCAAATGAATCCTATCCTGAAGGCTATATCGATAAA
GAAGCAAGAAATGGAAGCATCATCGAAGGGGAATGGCGAGAGGAGGAAAC
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AACATCGAGAGGAGATCATAAATGCATTTGTGGAGCATTTTTGGGGACCT
GGTCAAATACCTTGGCAATGGAAGATGATTTAAATCCCTAAATTGTTTCA
TAATACAGGTCGTATTTTCTTTATAGTTTGCTATTTTATTCGTAGATCCA
TGAGTAATATGTATGAATATATATGATTATAATGACAATTAATAATAAAG
TCTTCTTACAAAAAATACGCTTGAAGCACGTAAATAAAAAATAATTTCAA
TTCATAGTTTGTGATCAGTTCAACGGAGTCGAGCTCGTAAACGGCCTGGG
TGGGTGGGTTCGGGTAGGTGTATGTAGTTCAATTTGTTGCGAACTGCCAA
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AAATTGTGGGTGGTTTAGTGATTCTGCCGTGATCTGACAAAAGGAAGTAA
CCATCAATTTTTGAAAATTCATATTTTTGCAAAAATCAACTCCTAAGAGT
CCAGCTTGTGTTTTCCAGTAGTTGATTTCTAGTAAAAGACTTCTTTTTAT
GAATTTTTTTCGGACTAAAGTTTCATTTTATTTTCTGACAAAAGGATTTT
TATAGCCTGAAAGATGAAAATTGCTTGCAATATTTGCAGTTTATTTTCTG
ACAAAAAGAAGTAACTTGAAAATGTTTAGCTTGAAAGAGCTTGATTAGAA
TAAAACTTGTGTAGATTTTCAAAATCAAGATGTTAAACTCCTTTTAACTC
CTTCCTTTTAAATATTATACTATTCTAGGTTTTGGTCTTTCACAATCAGC
AAAAGTTTTGATCTTAAAACGATACCATTATTAATCTTAAACAAGAAGCC
CAAGGGCATGAAGGCCCAGCATTAAAAGTTTTGTTTCTAAATAAGAGTGA
TAAAGTTTGCTTTAAAATCATCAATTTTAATTTACAAGCTTTTTTATATT
GAATTGGCACGAATGTGGAGCAAGATTGGTCAGAAAGAGGAAGAGAAAAA
CATTTCTTTGCTTATATTAGCACAATATAACAAACTGATATGAAACATGT
GTCTAACATGAAACGGGAACACTTATTTATGTAAAAATAAAACTTTTGAA
AAATCTTTAACAAACATGATTGTGTTAAAGCTCTAACTAAAGGGAGCAAA
AACAAATGATAAAAAGTAAAATAAAAAAGAAACTAGCCTCGAAAAATCTT
TCCTGCAACCACAGCGGCTGCAACCTCGACAGCAGCACTCAAAAAATGCA
AAATTTGTATATAAAAATGTCCATAAAAACTGAACAATTTGGAGTTATTG
GCTGAAATTTTGTACAGTGACTCACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ACTTGCAAAATCAGACAAAACCGCAATACAAGCTGCAACATGGAGAATGC
TCAAAATGCCTTGCAACAACTTTTTCAAAACAGTAGATTTGAGCCCGGCT
CGAACCACCAAAGTTATTTGTCAGTGATTCTGAGCCTGGCATGTGCTACC
AAGCCGCTGCAAAAATTTGAAATTACAAACTCCTACCCCTACCATGAGAT
CCGGTAACTTGCATCAGTGAAGGCTAACATGGTCATGCATAGCCCTCAAA
TGACTGACCAATCAAAGCAGCAAAATTTCAAAACAAATGAACAACGCAGC
TTCGCTCGCAGCTCTACTCTACCATTTTTAATAGACCTTTTTTCAAAGAG
GCCGCCCTNGCTAACATGCATAGCCCTCAAATGACTGACCAATCAAAGCA
GCAAAATTTCAAAACAAATGAACTACACAGCTTCGCTCGCAGCTCTACTC
TACCATTTTTTCTGTTTTGATTTCACTTTGCTATGCATGTTAGCCTCCAC
TGATGCAAGTTACCCGACTTCACGGTATATTGTACAAAAAATTTAATGTG
GGAAATTTGAATTTATCGCTGTCCTCACTTATTTAAATAAAAACCATATT
TCTGAACTTGCGTTTTCTCTTAAAGAGTGTGACCGTTGAAAGAATTTGTT
TCGTTTTCAACTTTGTTGAACGGAATTTTTGTCGAATTTGTCAAACATTT
CTTGTTGTCAAACTTTGTTGAACAGAGTTTTGGTTGAATTTGTCAAACAT
TTCCTGTTGTCAAAGTTTAAGTGGAACTTAATCGAATACTCACAATTTTA
GTGCAGCAACCTTTAAAAATTTTGATTAATTATGTTGTCTGGTATATGTA
CTGAACTGATGTAAACTAAAAAAACTGAGCATGATAGAGACTCCTTTAAA
AAAGCTCAAGAAATATAAAATTTCACCATAATTTTAGGCAGAAAAAGTAT
CAAAATATCCAACAATACAAATAGAGGCTATTCTAGTCAACCTTTTGCTG
TTTGAATAAATTTTTTTGTCGAATATAAAAGAACACACATTTCGCACACG
TTAAGTTAATAATTATTCTGATAAAATGCTTGATTCCTCTTAATCATCAA
GGAGATAGCAAGAGAGTAGTAAGCATTACATAAGAGAACATACCTGTAAT
AATCTGGTTGGTGTTTGATGAGAAAACATCGATGAAAACCCTCAAGCAAA
AATCAGTTTAAAAAATGCAACTTTCAAAATAGTCTTTAAAAGCTTTTAGG
TCAATAAGTATGAGCATCCACTTTTGTGGGTGCAAGTCAGAGCTACACTT
AACTAATTGAAAAACATTTGAAACAGTGAACTTTCCTTTATAAGTCTCAA
GGTCCATAAAGAAATCAAAACATTGACCGACAACCAAAATGTGATTTTCA
GGCGCCATCTTGGATTCCGTTCGGAGCAAATAAACCCACGGCCGCAGTAG
AATCGATATTCTTTACAGCACGCAGCCTAAGACGACCCGAGCAAATCGAT
TAAATTTTATGCGAATTCCCCCGATTGAATCGCACCAAAAGAGCAACCAT
GGCACGGACAGGAGTGAGGACAGAAAAACAGAACACGGCACGGACTGCGG
ACAGACAGGACAGACACACGGAAAGTTCCTCTTGAAAGGCCCCTTCGCTA
GCGCTGGGCCAATAAGGTCAACTCGAATGCAATTATCTCAAAATAAGAAA
AATAGAGTTACTTCATTTTGTCAGATCACGGCAGGATTGTAAAAGCTAGT
CGGTCGAGGCATTTGTTGATTAAAATGCAAGGCCTGTGTTTTGGAGACAA
TTTCTCTTTTACATCGTATGACTACTTGTTGTAAGTTGATTTTCAAATCC
TCCTTCAAATCACACTCAGGAATTTGTTTAATAAGACCAATCAAAAGCTT
TCCAAAAATGTCATCTGCGTCATCATCGGACGATGTTTGTGGTTTGGGTT
TGACATTTCTTCTGGAAATTACACATTCGAGAGCTTTGCTTGCATTAGCC
ATAACTTTATGCAGTTCGTTATTCTGAGTAGCAGCCGTCATCTTAGCTGA
TTTAGCATATGGAGGTTTAGCTTCTTGATAAGGAGAGCCATCATCTTCAA
CAGTTATATTAGAATCAGGTTCATTTGGGCAATTGGATTTAGTTCTTCTT
GGAGTAAACGAGTCCTTCAGAAACTGTAACGCATTAAAAAATTTCCACGT
TGGGACATAAATTTCTCCTGTTTCCATGCCACTTGAGACCGAATCTTCAA
CCAATCTTTTCTGGCCTCCATAATAATTCTTAAGGTCGGTCAGTTTCTTA
GCAATTTGCTTGCCGTTAGCAATAATATTTCTTTCCTTAAGCTTATTTTC
AACAGAAAGCATAGCTTTGAGTCTGATATCCTTATTGAAGTAGTTCTTGT
GCTTCGTGTTATATAAGTTTTCGAAACTTGACCAGATATCTATCAAAGTG
AACACTTCCTCGTTTAACCAGTCTCTCGATGCTTCAGAACTTTTACTTGG
TCGACCAGCTTTCTTTTTTGATGGGACTGTTGGTGGAGGTGGAGGTGGGG
GTGGTAGCGAAGGAACTAGTGATGGTGGGGATCTATCATCTGTATCTTTT
CTGGTAGAATGAACTTGCTCGACATTATGGTCTCCATTGATTTCTGTATT
GTTTTGTCCAGCATTTATCTCAAAATGTGGTTGAGGTGGTTAATGTCCAT
CTCCCCTTAGATATTCGTCACTTGGTTGTCTGAAAATAAATTAAGAAAGA
GCCTCATCATAAATAGTTCTGTAATTGATAAATATATTTAATTTTCAATT
TAATTCAAGCCTGAGTTAAATGCGATTCTCAGTTTAAGCCCTTTAAGCAA
CAACAAACACTGTGAAATAAAGACATGATTCAAATGAATACATAGTAAGT
AGTAGAAAACGTTAGCAGTAAAAATGTAATAAAACTTACATCATTATGTT
TTGTTCTCTCAGCTGATTGAAAAAGAAACCCTTTTGAAAATCTGTCTATT
GCGAGTCTGGAAACATCAAATTTAATAACGCTTACAAATCACGAGCCGCC
AACGCAACTTGAATGAACCTCAAACACTCTCTCTCTTCTTTTAATCTTTT
TTATCTTGTTTTGGAGTTTTTATTTTTCATGCGAAGCCACATTCCTTTTA
AGTTTTTGTTTACACAGAGCGCTAATCCAATTTTCAATAGGTTGCTCGAG
GTTGCTATTGTTCAATAGAAATGAGATTAGGGAGATAATTTTTTAACTAA
TCCTTTATGATATTCTTCAACTAAATACACAGGAAAATGAGGGAAGAATT
AACAAAATTGACAGTATTCTTCCTCTCTTCCTCTATATTCTTCCGTGTAA
TGGAGCCTTACGATGGAGAAAATAAACGAAGGAGAGTAAATTTGTGACGT
AGTGTTGTGTTTCTGTTTCCCCTCCTCTTTCTTTTAATAACAAAATTCTC
CAAATAACCGGCAAGTACATACCTATTACTTACTACCTACTGTAAAATAG
CTCAAAACGGCTCGAAATTACCTATAATATTCAGCATGTTAAGATTAGCA
AAATCGGAAACTTTGGTGGTAAAAAAGTTAAAACTTCTTCTTTTATCGTA
CTTTGAAGACTTCAAAATATATTTTCTCTTTTATTTTGTTTATGACTTTT
TCCCGCGCTTTTTCTATAAAGTTTACAGACACACTTCTTCGTAGAAGAGA
AAAATATTTCCTTCGCGCAATAACTTATTTATTCATGTCAGTTTTATGGC
AGTTTTATTTATAAGNTATTTCCTTCGCACAATAACTTATTTATTCATGT
CAGTTTTACGGCAGTTTTATTTATAAGAAATCGATCAATCTAAAAAATTG
AAATACTTTAAGTAAGTAGAGCCCTATGTTTCACTGGGTACTTGCTGAAA
ATCCTTTGACATGTCTTGACATTTATTGACAAAATGACCCTTTTGAACCA
AACTATTGACGGGTTGTTAAATAGGACCTTTGAAGACTTCATTTTATGTA
GCAGTGCCGTAGCACAACAATTTTTTCAAAAATAGTTATTTTGCAAAATG
CAAAGTTTTTCTTTTTTAATTTGTCATAATTCTTTTAAGTTTTTTTTAAG
TTATGAGTGCATTTTCAAGCAACCTAGAGCTCAAATTTTCAAAATTTCCC
CCCTCGGGCCAAACCATGGTTAGCCCTCGACACCGCCGTTCTGGTCTGTA
AATTACTCCTATGGCTTATTTCACGGACCCAGTCCATTTTGAGATGCATA
TCATGATGATTTTTAGAATCAGTATGAAAAAACCTTTCCAACGGTATATG
ATATGACATGTTTTGGAACAAAAATAAAATCAATTTTCGGGCATGCAGAC
TGGTCTGTAAATTACTTCGGTAGCCCATAACTCGGACCCAGTCCATTTGC
AGATATATGTTGTGATGTTTTTTAGAATCAGTGTGAGAAAACCTTTCCGA
CGATATATATCATATGACATATTTTGAAGATAAATTTTTTTTTTTTGCCT
GGGAGGCATTCTGGTCTGTAAAATATACAAACAGGTGTTCCGGAAGTGGG
TCAGAGGCTTAAAATGTCTCTTACCCCCTAAGGTACCACTGTACCAAATT
TCATGCTTTCTAGTCAAAAATGCACAATTGTATTTATTTTTAGCACACTT
TCCCTGGACTAATTCATAAAAAAATAATTTAATATCTCAAGGGATGTGAT
CACCATGGGAATTTTTTGAATACGAGGCAAGTGGTGTCGGTGACGTAATT
TATGAAAAGGTCTATTCATCAGACATGTGGTCACTTTCGATTTCAACGCT
TTTGATAATTATGAATAATTAATAATAATTACGTTTGTTACGTCAGAGAT
TTAAAAGGAAGGGAAATTTTCAAACGCCTATTATTACGCATTGAGAAAAA
AACTTATAATATATAGCTCGTTTTGATCGTCTTGTTCTAAATTTTCTAAA
TGTAACCAAAAATGTGTGGTAAAAATTTGGGCTGACCTCCCCTTTCATGG
ATTCAAGGAATAATGTATGAACGTGTATTTGTTTTCCCTACCCCTCCCTG
TGGACATTGAGCTAAAAGTTCTCGCCCCAGTAAGTTGGGATCTCGAATTC
AAACTCAGTGAAATTTTACTTATTTCATTGCCAACCTAGTAGATTTCAAA
ACATAACCTGGTCAAGTCTATCTTCCGTCTAAGAGGAAAAAAACTTAACG
TTGATTCCGATTTTATCATTAATTTTTGAACTTTTTAAAGTTAATTTTTT
CTTGGGTTCTATTCAAAAGTTTAACATCATTGTCAACATTCAATACTCAA
TATTATTTACTACAGTTTTGTACTTTCAGCCAAAAAATTCACATTCATTT
TATCATAGATATGTGCTGAAGATATGGTTTGTGCCATTTCTGCATTACTG
GAATATGCTGTAAGTTTTCTGCTCATTGTATATTGTGTGTCACTGGTAAG
ATTGTATCCCCTTTCCACAGAGTTCGGTGTATTGGGCTTTTCCAGAAAAA
AAAATTGAATATTGGGAATGGTGGATGAAATATTTTTTCGAAATCTACCC
CCCGGACATTGTGACTTTTGACCCCCCAGACAGCAGGTCTAACCCCCCGG
ACAAGCATCTTTTCACCCCCTGGATTTAACATTACCCTCAAATAAAGTAA
AATTACCCCCAATCAGAGCAAGTTTACCCTCCGGAAAAGGTAAATTTTGT
AGATTATATCCTCCACCTCCATGTACGAACATTTTCTGGAAGAGCCCATT
CTCTCTTCGCATATAACTTGAGTTTGAATACATTTTTAAGAAACATTTAT
TAGGAGACCTATTGAAGTCTATCAGCTTCCTTTGCCAATAAAATTCTTCC
ACCTGCTTAACTTAAACAAGATCTGTAGGCTGCCCCATGTCCCATAACAT
ACTATTGGGAAATATTCGGACGAAAGTGAACAAAGGACTATTTTTTGTCG
ACTTTTTTTAACGTTTCTCAAAGGACTGTTCAAGAATATTGATATGGCTA
CCCAAAGTAATTTTAGGATGAATGTGCACTGACTTCTGCATATTTTGCCC
TATGAGTTTTAGTAAAATTTAGACTAAAAAACTCGTGCTTGTATTTTCCT
ATAACAACATTATACTTAATACAAACTAATTTAATGTAAATCTTTTTTTC
CAGAGAGAAGATATTTCATTTTCTGATCAATTCGTAGATGCTTTGGACGC
ATTGAATAGGTAAGCGGGAAGTAAATGTCTTGAAATATATTGAAATATAT
TGAAACGTTTTGAAATATATTGAAACCGAAACTGATCTAGCCTGAATTCG
GATCGATAAATGGGTGTGGCTTAATCGGATGCTGTGGTTTACACCTCCGT
CTCAATCAAACCAATGTTGCCAATGGCTGGGATTATATTTTTACTATTTA
TTTGTGAAAAGTGTATATTTCTTTTCAATTCTAGATCAAGTATAGATCAA
TTAAATGGAGCAATCGAGCTAGGAAAGAAACAGGTATCTTTTCATATTTT
CTTCTAATATCAATAGAGAATCTCAAAAGATTTTGGTAGGAAATACATCC
CCTTTTTCAGCCAGTGGGGGTGAAAATAACGGGTTGAAATACAATGGGAT
TGGCATTTCCATGTTTTTTTATGGCTGGGAATCTTTAATTCCATTGTTTT
CATTTTTAAGCCATAAATTTTGCTATTTTGATTATTTTCAGCGGGGAAAT
AATTGGAGTATAACTTTCTACTAGGGAAGATATTTTGACCAATTTTTACA
GTGGGAAGGGGTCCCAGTGGGTCTGTGAGAAGAGGGTGTTGAAGTGAAAC
CCAATTCAAAAATGGATGTTTTGAATTTATCCATGACTTTGTACACAATT
TGATTTATAAATTGGGTAATTCTTCTCAAGGACTTCATGAATTTGTTGTT
CTTTCATCTTCTAGGTGTCTAGCATGGTATCACAAGTTCGATCGTTTATC
GATTCACATCAAATCGCATGCGCTGGCCCATTTTTGTATGCTCATATTTT
AGAGGTATGTGACATTTTCTGAAAGGTTTGCCCTTTTTCTATGGTTTCAT
TGTGGTCTATGGACAAAGATCACGCTCAAATGACGTGATTCCATGTAATT
TTGAAAGAAAGAGGAAGCAGTGCTGTTCTTTAAGAAGTTTGTCCTAATTT
CGGACAGCTTCATTTCTTTTTGGTTAGATAGAATTCATTAATCTTTATCT
ACTTAACATTTAATAGAATAGAATAAGTAATTGAATGAATGAATGAATGA
CTAAGTAAATAAATGAACGAATGAGTAAATAAATTAACAAATAAGTAAGT
CTTTTATTAAAAATCTTTTATATGACCCTCTCATATAAATTTTAATTTTA
TCTCAGAATTATCCAATTCAAGATTACTTACTTTTGATTAAATTTAACGC
AACAACAACATCTCATTTCTTTCTCTTCTATCTGTAGGGATCACCAACTG
CTTATATTTTTGCAAAGCCTTGTATCATTGGTCGATTAGCTCGTTTTACA
CTGGAGGTGTACAGCACTATGGTACGATAATTAACTATGTATTCGGATGT
ATTTATCGTGCCTCTGGTATTTCTTTTTCATGTTTCCTTAATTTGATTTC
TCAACGGAACCTCGTTAACCCATTAAATGCCTACCGATACAGGACCGAAA
AAATGAGGAATCTCATAATGCCAGTGACACTTAATAATGGGTTAAGTCTC
CCATCCCATGCTCCCTACTTCATTAGAAATATATTTCCTCTGAGTGGTAA
TTCCTTATATTTATGCTCTCCTGTAATGTCAAGTTTGAATTTCATATTGC
TATATTTAGTGTGTAACTTCATAGTCAAGCTCAAAAAAATTGAATTCGAG
CTGTTTTCAGTGATTGGGTTTTGAAAGTCAAAGTTTTCACCCGTATGATG
GCATCCCGTTTTTCTTTTTCTTTAATAACTTTAGTCGTCATGGTCACTAT
CTAAATATTTCGGCCCTGAAAATTGAATTCAGTAAGAATCATTTTTCTTT
CTTTCTTTCATAGACCAAACAAAAGAAAGCAAGGAGCCTACCGTTCGTTT
TGGCTGTACCCAGTGACCTGGAAGAAGGTATTGTACAGTTTATTAAGTGA
TCCCAGTGTATCATAGGCTTTATTATCCAGGAAGGATTGTACGGTAATAT
CGAAAATATTTTTAAGTCGTCGATACACTAAGAACCAGATAACCGATTTT
ACACTTTCTTTTCCTTTAGCGTTATACAATTGAGTCTCCGTAACTCAGAC
ACGAACGGGGAACCCAAATTTGTTCGAGTTAGGAGACATTCGAGTTATAG
AGGTTCGAGTCAAAGAGACTCTGCTGTAATAGTTCACTTTCTTAATTGTT
TATATTTATTTCAATTTATTCAATTTCTTTTAATAGGAATGTCTTTATTG
GTAGGAGTACCGCCCGTTGGTGAGAGCTCAATCAAAAGGTACCTGTTCAT
CATAATTAAGTATTTTAAGAGGGCTCCTTGACGGGGATTGAGAATTAGTT
CAATTATTTTATTTTTCTAATGGACTATTCCAGGAAGAAGTTGTATTTGG
GAAAGGTGACCCCTGGTTTTTATTTCAATTTTCAGGACCCCTTTGGATTT
TTCTTTTGGACCAGCCTCTCGTTTTACTGACCACCCTGGTTTTTCCACCC
ATTTTACTGACTACTCTGGATTTTCAGCCCATTTTACTGACTACCCTTGA
TTTTCCACGTAATTTTACTGACCCTGCCTGGATTTTTACATCCGAAAAAC
CAGACCAACCTGCACGTCACACCTCCTCAACAGAGAGACTATATCCCAAT
TCAATTTCCTATTTATTTAATTTTTTAATTTTTTTCTTTCCAGTTTCTTT
GGAGCAGCATTCAAGCAGGCTGGTGAGAAAACACGGTCAAGAGTGCGCCA
TGATTTCTTTGACCCAACAGGTAATGTTCAAAAAGGTCTCTTATTTTAGT
TTAGCCCACTTTCTGCCCTGCATATTCTAATTAATTAAAAGAGTAGGCGA
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ACTAGGATAGTAGGGTTGTTGATAGTTTTCAAAGAACATTTTTATCCTTC
AATTTTAGGTTAATGTTAAACTTTTTTCAGAAAATATAGAATTTTTTTAC
AAGTAATTTTGTCAAGAGGGAGGTGAAGAAAATACAATAGCCTAGCTTTT
TGTGGTTTCAACGATTCAAACCATTTTGTGGTATTCTTTCCTTAGTCAGC
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TCCTTTTCAATTTTTCAATTTTAGTGATCGAAATCAAAACAGAAGATCGG
AGTAAATTCTTTGACAATCTAGCAGCTCTCATGGCTTGAGAAATCCCTCA
ACAAATTTGTAAGTGTTATCGTCTTAATTATGTATGGATTCTTGAAGACT
TGGTGATGGAAATTAATATGGTTCAATGATCAGGGTAGTTGGTTTAATAT
CTAACCTTTTGGATGTAGGTTTTGACAAGCCATAAATTAGACCCAACACT
GTTAATATAAGAATAAGAAACTTTTTGAATATTATCTGGCATTGATTGAG
ATATTAAATGTGACTTGTATGATGGTGGAAATGTTGTTGATAATCTATGT
TTTGATTGGATACAACTTCGTCGAAATGAGGAATCATTTAAAGGACAAAT
TTGGATTTGTTTGTAGGAAATTTATGAAGGAGAGTCTTGATTTCCTTATA
AGGATTATGGGTTAAGAAACACTCTCTGTCATAAATCTTGAACCCTACAC
CCTTTGATCCGCCACCGGGTGAAGGAAGATGTGATGCTACCGCCCCTCTA
TGGTGGAAATGTTAATGATATCGCGCCCTGATTTTCGTTTGGTATTAAAA
GAACTGAACCTTGAAGATGATGTGAACATTTTTACAGTTTTGAACCTTCT
CAGCTGGCACACAACGTTGTTTCAACGTTCATTTAACATTATATGGACGT
TGTGAACATTAATAAAGGTTGAAACAACCTTGTTTGCCAGCTGATGTATG
ATGGTGATGGAGAGAACACACGAATCTCGAGAATCTATTTCAAAGGTGGC
AACAACGCAGTGAAGTGGTATTTTGAACAATAATGCTCGTTAGATGCATA
AAAAAACTCTGACTCAATCCAATATTTGTTTCTGTTACAGTTCCAAATTG
CAAAAGTTGGACAGACTGTCAACGAAGATCTTTCCTTAATCTAACTCAAT
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GTGTCAACCTAACATTGACTTATGGGTAACCTAGGTTTAGCAACTTATTC
TGTCCTCTTAAAATTTACCTCTTTTGTGCAAACACGTTATCCGAAAGAAA
ATTTGAGTATCGGAACTAGACACATAAGAGCCTTTAGCGTAAAAGATTGT
TAAAAGAAAGGCGTTAATTTCTTGTAATACTTTGTTTAGCTTTATTATCA
AATTATCCGTTGTTGTCGATAACGACTTACAATCTGTAAAGTTTCCTTTA
TCGACAACAAAGGATATTTTGCCAATAAAGCTAAATAAAGTATTACCAGA
CATCCAACAACATTCAAACCAATCTGCCATTAAGGCCCTAGAGTCAATGA
TGAGCTCTGTTTGTACTCTAGCAGAAAGTACAAGTATCTAATATGAAAGG
AGAGTTTTTATCAATTTCATTAGATACCCCTTGTTAACCCTTTAAGTGTC
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TAAAGGCTTATATCTCCGGATCTAAAAGGAGTTAGAAGCTCGTTCATAGT
CCGTTGGATAGCTTAGAGTCTCCCCTTTTTCTTAGGCGCCGCCCGATTTA
GGAAGGGCGGGATGGGCGTCGGCTAAGGGGGGTAGGTAAGGGAAATTATA
GCGCTGCGTGGACCTGACTGAATGATAGAGAGGTGCCGGGTGGTAAAACT
TCAAACTATTTCGCTAATTCACTAATTTTGTTTTTTTTATGACTTTTTAG
CTTAAAATCTCGCTGAAAAGACTCACTTTTGATTTTTTTTTTTTTGCTTG
GCCATGAAGCCCAATGCGATTCATACGAGTTAGACCAAAAATGACAATTT
CTAACTCAAACTAAGAATTACAGGAGGGCTTCGCCCTCCTACATAGCCCA
TGTCTGATATATACGACATTGGCACTTTAAGGGTTAAAGATATCAAATGT
AAATATTACTCTAAAAGTACCAAAAGAGTGCTAAGAAGAGGCAATTATTT
AAAATATAACGTTTTTAAAATATCAGATACTGTGTAACACAATAATAATT
TTAAATAAATATTGAAAAAATA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_009498	XLOC_009498	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000255	supercontig	sc0000255:868..22689 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00016962 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CDC45 (Cell division control protein 45 homolog OS=Homo sapiens GN=CDC45 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 419.083 bits (1076), Expect = 6.364e-132
Identity = 219/544 (40.26%), Postives = 350/544 (64.34%), Query Frame = 1

Query:   55 RIVKNLFQQDNVQYTIVPVSGIDNIKEVYDEHKEQIKYFLLINCGGNIDF-DVLEADEDSTFFIVDSHRPLDLNNVFKE-QIKILIKEGDATIDEIPDPEKVIXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXKRQKTSNVSYLEKQVKKKRWATEREKLLDEYYECSYYGSSTALTLYDLAWKLTKDNNDLLWLAIVGLTEQYLFSKIEGEKYFEDCTGIKDHVIRHNMT--DDEHTQSVACMKIVFEKELRLGMYRHWSLFESFMNSRYTVCGLRLFTMKGRKRLHELFADIGLPIVQCKQKYSSMDVEIRKDVKGWIEGIAEKYGMDDISFGSFASQYGYKTKICAEDMVCAISALLEYAREDISFSDQFVDALDALNRSSIDQLNGAIELGKKQVSSMVSQVRSFIDSHQIACAGPFLYAHILEGSPTAYIFAKPCIIGRLARFTLEVYSTMTKQKKARSLPFVLAVPSDLEEGMSLLVGVPPVGESS-IKSFFGAAFKQAGEKTRSRVRHDFFDPTVIEIKTEDRSKFFDNLAALMA 1671
            +I++ LFQ D+VQYT+VPVSG   ++  + EHKEQ  YF+LINCG N+D  D+L+ DED+ FF+ D+HRP+++ NV+ + QIK+LIK+ D    E+P  E +   E+++E      +  +E S+            R +   V    ++ +++ W   R  +L +Y +  Y+G+S+A+ +++LAW L+KD ND+LW AIVGLT+Q++  KI   KY  D   ++ HV RHN    D+E+T SV C +I FE +LRL +Y+HWSL +S  N+ YT    +L+++ G+KRL E  AD+GLP+ Q KQK+ +MD+ ++++++  IE  A K+GM D+   +F+  +G+K K  A D+V A  +L+E   +D S +D F+ ALD+L+RS++D+L   +EL KKQ+ +    + S + ++ +   GPFLY  ++EG+P   +F++P  +  L++  L+ +   TK ++ + LP V+A P  +E G   +VG+PP  +SS  K+FFG AF++A E T SR+ H+ FD +VIE+K EDRSKF D L +L++
Sbjct:   34 KILQALFQCDHVQYTLVPVSGWQELETAFLEHKEQFHYFILINCGANVDLLDILQPDEDTIFFVCDTHRPVNVVNVYNDTQIKLLIKQDDDL--EVPAYEDIFRDEEEDEEHSGNDSDGSEPSEKRT---------RLEEEIVEQTMRRRQRREWEARRRDILFDYEQYEYHGTSSAMVMFELAWMLSKDLNDMLWWAIVGLTDQWVQDKITQMKYVTDVGVLQRHVSRHNHRNEDEENTLSVDCTRISFEYDLRLVLYQHWSLHDSLCNTSYTAARFKLWSVHGQKRLQEFLADMGLPLKQVKQKFQAMDISLKENLREMIEESANKFGMKDMRVQTFSIHFGFKHKFLASDVVFATMSLMESPEKDGSGTDHFIQALDSLSRSNLDKLYHGLELAKKQLRATQQTIASCLCTNLVISQGPFLYCSLMEGTPDVMLFSRPASLSLLSKHLLKSFVCSTKNRRCKLLPLVMAAPLSMEHGTVTVVGIPPETDSSDRKNFFGRAFEKAAESTSSRMLHNHFDLSVIELKAEDRSKFLDALISLLS 566

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00016962 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00016962 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
CDC45	6.364e-132	40.26	Cell division control protein 45 homolog OS=Homo s...	[more]

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TCONS_00016962 (transcript) - C. hemisphaerica