XLOC_009498 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009498
Unique NameXLOC_009498
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000255:868..22689-

Legend: gene
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>XLOC_009498 ID=XLOC_009498|Name=XLOC_009498|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=21822bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:868..22689- (Clytia hemisphaerica)
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CCATCCCATGCTCCCTACTTCATTAGAAATATATTTCCTCTGAGTGGTAA TTCCTTATATTTATGCTCTCCTGTAATGTCAAGTTTGAATTTCATATTGC TATATTTAGTGTGTAACTTCATAGTCAAGCTCAAAAAAATTGAATTCGAG CTGTTTTCAGTGATTGGGTTTTGAAAGTCAAAGTTTTCACCCGTATGATG GCATCCCGTTTTTCTTTTTCTTTAATAACTTTAGTCGTCATGGTCACTAT CTAAATATTTCGGCCCTGAAAATTGAATTCAGTAAGAATCATTTTTCTTT CTTTCTTTCATAGACCAAACAAAAGAAAGCAAGGAGCCTACCGTTCGTTT TGGCTGTACCCAGTGACCTGGAAGAAGGTATTGTACAGTTTATTAAGTGA TCCCAGTGTATCATAGGCTTTATTATCCAGGAAGGATTGTACGGTAATAT CGAAAATATTTTTAAGTCGTCGATACACTAAGAACCAGATAACCGATTTT ACACTTTCTTTTCCTTTAGCGTTATACAATTGAGTCTCCGTAACTCAGAC ACGAACGGGGAACCCAAATTTGTTCGAGTTAGGAGACATTCGAGTTATAG AGGTTCGAGTCAAAGAGACTCTGCTGTAATAGTTCACTTTCTTAATTGTT TATATTTATTTCAATTTATTCAATTTCTTTTAATAGGAATGTCTTTATTG GTAGGAGTACCGCCCGTTGGTGAGAGCTCAATCAAAAGGTACCTGTTCAT CATAATTAAGTATTTTAAGAGGGCTCCTTGACGGGGATTGAGAATTAGTT CAATTATTTTATTTTTCTAATGGACTATTCCAGGAAGAAGTTGTATTTGG GAAAGGTGACCCCTGGTTTTTATTTCAATTTTCAGGACCCCTTTGGATTT TTCTTTTGGACCAGCCTCTCGTTTTACTGACCACCCTGGTTTTTCCACCC ATTTTACTGACTACTCTGGATTTTCAGCCCATTTTACTGACTACCCTTGA TTTTCCACGTAATTTTACTGACCCTGCCTGGATTTTTACATCCGAAAAAC CAGACCAACCTGCACGTCACACCTCCTCAACAGAGAGACTATATCCCAAT TCAATTTCCTATTTATTTAATTTTTTAATTTTTTTCTTTCCAGTTTCTTT GGAGCAGCATTCAAGCAGGCTGGTGAGAAAACACGGTCAAGAGTGCGCCA TGATTTCTTTGACCCAACAGGTAATGTTCAAAAAGGTCTCTTATTTTAGT TTAGCCCACTTTCTGCCCTGCATATTCTAATTAATTAAAAGAGTAGGCGA AAAGTAGAGAGAAAATTGTCAAAAATTTTACTTGGAAAATATTGAACTTG ACACCAGTCAGTGTATTGACGTCAAAAGAGAGCAACGCATCGACTTTAGA AAACCAAGTTTCTACACACTTTGATTCACAATTAGAATTGGATTAGGACC ACTAGGATAGTAGGGTTGTTGATAGTTTTCAAAGAACATTTTTATCCTTC AATTTTAGGTTAATGTTAAACTTTTTTCAGAAAATATAGAATTTTTTTAC AAGTAATTTTGTCAAGAGGGAGGTGAAGAAAATACAATAGCCTAGCTTTT TGTGGTTTCAACGATTCAAACCATTTTGTGGTATTCTTTCCTTAGTCAGC TATCTTTGGACTCAAGTATTTCAAGTTCAAGCGATCAATAATTTTTGACA TCCTTTTCAATTTTTCAATTTTAGTGATCGAAATCAAAACAGAAGATCGG AGTAAATTCTTTGACAATCTAGCAGCTCTCATGGCTTGAGAAATCCCTCA ACAAATTTGTAAGTGTTATCGTCTTAATTATGTATGGATTCTTGAAGACT TGGTGATGGAAATTAATATGGTTCAATGATCAGGGTAGTTGGTTTAATAT CTAACCTTTTGGATGTAGGTTTTGACAAGCCATAAATTAGACCCAACACT GTTAATATAAGAATAAGAAACTTTTTGAATATTATCTGGCATTGATTGAG ATATTAAATGTGACTTGTATGATGGTGGAAATGTTGTTGATAATCTATGT TTTGATTGGATACAACTTCGTCGAAATGAGGAATCATTTAAAGGACAAAT TTGGATTTGTTTGTAGGAAATTTATGAAGGAGAGTCTTGATTTCCTTATA AGGATTATGGGTTAAGAAACACTCTCTGTCATAAATCTTGAACCCTACAC CCTTTGATCCGCCACCGGGTGAAGGAAGATGTGATGCTACCGCCCCTCTA TGGTGGAAATGTTAATGATATCGCGCCCTGATTTTCGTTTGGTATTAAAA GAACTGAACCTTGAAGATGATGTGAACATTTTTACAGTTTTGAACCTTCT CAGCTGGCACACAACGTTGTTTCAACGTTCATTTAACATTATATGGACGT TGTGAACATTAATAAAGGTTGAAACAACCTTGTTTGCCAGCTGATGTATG ATGGTGATGGAGAGAACACACGAATCTCGAGAATCTATTTCAAAGGTGGC AACAACGCAGTGAAGTGGTATTTTGAACAATAATGCTCGTTAGATGCATA AAAAAACTCTGACTCAATCCAATATTTGTTTCTGTTACAGTTCCAAATTG CAAAAGTTGGACAGACTGTCAACGAAGATCTTTCCTTAATCTAACTCAAT CATATCATTCTCTGGGATTTGATAATGTAATTCTTAACTTGTTTACTTTT GTGTCAACCTAACATTGACTTATGGGTAACCTAGGTTTAGCAACTTATTC TGTCCTCTTAAAATTTACCTCTTTTGTGCAAACACGTTATCCGAAAGAAA ATTTGAGTATCGGAACTAGACACATAAGAGCCTTTAGCGTAAAAGATTGT TAAAAGAAAGGCGTTAATTTCTTGTAATACTTTGTTTAGCTTTATTATCA AATTATCCGTTGTTGTCGATAACGACTTACAATCTGTAAAGTTTCCTTTA TCGACAACAAAGGATATTTTGCCAATAAAGCTAAATAAAGTATTACCAGA CATCCAACAACATTCAAACCAATCTGCCATTAAGGCCCTAGAGTCAATGA TGAGCTCTGTTTGTACTCTAGCAGAAAGTACAAGTATCTAATATGAAAGG AGAGTTTTTATCAATTTCATTAGATACCCCTTGTTAACCCTTTAAGTGTC ACGGTCATTTTTTTTCTAAGTTTTTTAACGAAAATCGCTAGTTCAAACTT TAAAGGCTTATATCTCCGGATCTAAAAGGAGTTAGAAGCTCGTTCATAGT CCGTTGGATAGCTTAGAGTCTCCCCTTTTTCTTAGGCGCCGCCCGATTTA GGAAGGGCGGGATGGGCGTCGGCTAAGGGGGGTAGGTAAGGGAAATTATA GCGCTGCGTGGACCTGACTGAATGATAGAGAGGTGCCGGGTGGTAAAACT TCAAACTATTTCGCTAATTCACTAATTTTGTTTTTTTTATGACTTTTTAG CTTAAAATCTCGCTGAAAAGACTCACTTTTGATTTTTTTTTTTTTGCTTG GCCATGAAGCCCAATGCGATTCATACGAGTTAGACCAAAAATGACAATTT CTAACTCAAACTAAGAATTACAGGAGGGCTTCGCCCTCCTACATAGCCCA TGTCTGATATATACGACATTGGCACTTTAAGGGTTAAAGATATCAAATGT AAATATTACTCTAAAAGTACCAAAAGAGTGCTAAGAAGAGGCAATTATTT AAAATATAACGTTTTTAAAATATCAGATACTGTGTAACACAATAATAATT TTAAATAAATATTGAAAAAATA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016962TCONS_00016962Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016961TCONS_00016961Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016961-proteinTCONS_00016961-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000255supercontigsc0000255:868..22689 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
11.88 11.61 20.98 22.99 24.3 16.87 24.16 24.93 24.8 24.93 21.39 20.48 10.6 10.2 11.13 13.14 18.72 17.31 9.36 9.6 13.47 14.57 11.46 12.26 16.11 17.19 6.82 4.72 7.16 6.8