TCONS_00016941 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00016941
Unique NameTCONS_00016941
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4083

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00016941 ID=TCONS_00016941|Name=TCONS_00016941|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4083bp
TTTTAAGAAAtcatatttgaaaaaatgaaacattgaTGGTGAATGATAAA
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TATGGCTTCAGGTAGAAGTAGTTCTTTGAACTCTCTTTCTCAACCTCTAC
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GATCCCTGCAGCCTGGTTACAGTTAGTCAATAATATCACTGTTCTTTTCT
TGGTACCTGTCATCGATCAATTTGTGTATCCAAAACTTGATTCATTGTTC
GAGAGGGCCCCACATTTATTCAGAATGTCTATTGGTATGATTATTGCCAG
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CTGGGTCACACACCAATGAAGTGAACGATGAACATATTAGAATTTTGGCA
AGAAACTTCAGCATCTTTTATCAAATACCACAATACGTATTACTTGGAAT
CTCAGAGATTTTCGTTCTTATTACTGGTTTGGAATTTGCATACTGTCGTG
CACCACGATCGATGCAAAGTTTCGTCACCAGTCTCTTTTTCGTTGTTAAC
GGCATCGGTgctttgctgacgtcagcaattatCGTACTAGGTAACAAATT
AGGTTTCAATTTCATCGGCAAAGACTCCAGTAAGCTCAGTAGGGATGACC
CAGTCCCGCATCTCACAGGAAACTTGGATCATTTTTTCTACTTTATGGCT
TGTTTGAACTTCTTGAATTGGATCTTGTTTGTGATTTACAGTTTACGTAA
GTCTCGTAAGAAACAACGCCGTGATTTGGAACGTACCGTTGCGGCGTTTA
TACAAGGGAGCTATGAAGACTCTCTACGTGCAAGTCCAACGTAAAATTCA
TCCTCGTAAATATGTAACACTATCGAATGTACATATTTATGTACGTAAAC
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ctttactcaaactagtaaAAAAACTTGATATCTTAAACTTTTATGATAAA
AATGTCCTTTGTATTATATTATGTTGATGGGTGCAGCGTTGATATTTGCT
GGTTACTGTCTGTTGATATTATGTTCTGttatttgttgattttttgactt
caaataattttcaattttctcgatttttcaaGGGAAAATGGCAGTGGTTT
GAATAAAGTAAGAATAATGTTGTTATGTTctattatttctattttttaat
caGGACATCGTCATTTTACGTCCCTACTACCTATAGTGTATTAAATACCc
gtcaacattttcaaaatcggTCAATCACAAAATTAATTATCCGCTGAAAT
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CTTTAGGTCAGAATAGCGAGTAGTTTTTGTATTACTAGTGATTTAATTTg
catccaccaaattaagtaTCTAGCTGTTTGGccaaccgccaaattaagta
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AAAAGGGGCACGAAAAGGATACATTTTGCCTATAAGTACTTGAATCCGAG
ACCCACCGTTTTAAAATAAGGGTCGCATTTTGTCACTTTTCGAAATTGAG
TGGTTGCCAGGTTTTTGTTACTTGCTTAATATTAACTTGACCGTTAAAGG
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ttCGGCTTTCTCGGCAAGAGGTGCACCTCCTAAATAATATTTAACTCTCT
AGCTTTAGCGTTACTTAATTAGTTGCAATTTTAGATTTGACATAGTATTT
TATCTTGTAGTGGATTCTTGTAGGTtaattttttgatattattttgacaa
aagttaaaaaggtaaTATTATAGATTTTAGATTAATATATTTTAATGTTA
ATATTAAAGATGGCCACCTTTATGTTCGATTGTCATGTCAAcgattttat
gtattttttaatacgagAAGCTTTTGGCTAACATATCTGATGGCACATTA
TGGCAGTCTTGTGGGGTAGGACTGAAAATTAGCTTTGCAAAGACTCTCTG
TGTTTGAGAATGATTTTCTCATACATCTCaaagttttggccattttctTC
ATAAGAAATCATTGGATCCGatattgttgtttctttttgttattttttca
gttctagaGATCTTTtgttaatatatatttttaaaatgtcatttaGGATA
ATTTTATAGTATTTGAtacactttttttgtaaa
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00016941-protein

>TCONS_00016941-protein ID=TCONS_00016941-protein|Name=TCONS_00016941-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=602bp
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RRHVLSDRLFAERNKKLAKFCVMLTVTLERTAYYGLLGNLAYFTNVYLDY
TADESVNVTLGFSGLTWISCFIGGILGDSLLGRFNTIITGLIIYIVGYAN
MSYIAHIMNHEIDDDDFDRGRQKLFVGWFLGSLFLISLGEGCFKSNMSPF
GADQIDSNSDNSELRSFFNYFYWAINIGSLMGFSLIVWIQIHFGFCTGYV
VPLSLLGLGALIFIVPRQRNYHILLPKKNVIMIIKILWNALTGKRPHSAY
EEYNPMDGRLDRAKIKYGGKFLDSDVDDVKVLVSLFPTLLFLIIYCSCYY
QVNGLFLVQGMHMRIPTMENEEIPAAWLQLVNNITVLFLVPVIDQFVYPK
LDSLFERAPHLFRMSIGMIIASLAMVSAGLVEYHRKNTAGSHTNEVNDEH
IRILARNFSIFYQIPQYVLLGISEIFVLITGLEFAYCRAPRSMQSFVTSL
FFVVNGIGALLTSAIIVLGNKLGFNFIGKDSSKLSRDDPVPHLTGNLDHF
FYFMACLNFLNWILFVIYSLRKSRKKQRRDLERTVAAFIQGSYEDSLRAS
PT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000255:33569..42382+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00016941 ID=TCONS_00016941|Name=TCONS_00016941|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8814bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:33569..42382+ (Clytia hemisphaerica)
TTTTAAGAAAtcatatttgaaaaaatgaaacattgaTGGTGAATGATAAA
AGTATTAGTTTCCCAATGAGCGACACAGACAATGAAGATGATGAAAGCCT
TATGGCTTCAGGTAGAAGTAGTTCTTTGAACTCTCTTTCTCAACCTCTAC
TCAGCTCTGATGAATCCGAGAGGAACAAGAAACCCAGAAGACATGTACTC
AGTGATAGATTATTTGCTGAACGCAATAAAAAGCTTGCTAAATTTTGTGT
TATGTTGACTGTTACTTTAGAAAGAACTGCATATTATGGATTGTTGGGCA
ACTTGGCATATTTTACCAATGTCTATTTGGATTATACAGCAGATGAGAGT
GTGAATGTTACACTTGGTTTTTCTGGATTGACATGGATCAGTTGTTTTAT
TGGTGGTATATTAGGAGATTCATTATTAGGTCGATTCAATACAATTATCA
CTGGATTGATAATTTATATTGTTGGTTATGCGAACATGAGCTATATTGCA
CATATTATGAATCACGAAatagatgatgatgattttgataGAGGACGGCA
GAAATTGTTTGTCGGTTGGTTTTTAGGATCCCTTTTCCTAATCTCATTGG
GAGAAGGTTGTTTCAAATCGAACATGTCACCCTTTGGGGCTGATCAAATT
GACTCCAATTCAGACAATTCTGAATTGAGATcattttttaattactttta
ttgGGCAATTAACATAGGAAGTTTAATGGGTTTTTCATTGATTGTTTGGA
TTCAGATTCACTTTGGATTTTGTACTGGTTATGTCGTGCCATTGAGTTTA
CTTGGACTTGGTGCCTTGATTTTTATTGTTCCACGACAAAGGAATTATCA
TATTTTGTTACCAAAGAAAAATGTGATAATGATCATCAAAATCTTGTGGA
ATGCTCTTACTGGGAAAAGGTAAGATTGGTGTTAGCTGTTAGCTTATAAA
ATTATGCATTACTAGTCAACCCACCCTTGAATCAGATTCTGAAAATACTT
TCGTTATTTGAGTTTTTTAAAGTGTCTCAGAAGAGATGATAGGAAGATTT
ATTTGAGGAATTACTCACGGATGTTAAAAACTCGAAACTAAGCTTCGAAG
CTGGTCTTTTTTAGCAAAATTAACTTTGCTTCTAATAGGCCTCACAGCGC
ATATGAAGAATATAATCCTATGGACGGGAGATTGGATCGAGCAAAGATTA
AGTATGGCGGCAAATTTTTGGACAGTGATGTTGATGACGTTAAAGTGTTG
GTGTCTTTGTTTCCAACACTTCTTTTCCTAATCATCTATTGCAGTTGCTA
TTACCAGGTGAGATTTCTTACATTACgtttattcaattttatttttacgc
TTTGATCTTTCATAATCTTTTTGATTTGtaatcctgaaaatgttcttaat
ttgttcttattttaaccattctgtgagtatttttgtcttatgctcttata
tagtttgttcttttaacATAACCTAAAGTCGTTGATTTTAGTCATCTTGA
TGGCTAGATCTTTCACTAACTTCTTAGAAGTCGAAAAGAACTAGTTTATT
AGCACATCCCGGATAAACAGTTGCTCTTAGATTAATTCAATAATGACCCT
ATTTTGAAATTGGTTTAAAATAGCATTCTAATTCAAAACGtcagtttttg
gacctacctggaggtcctttaaattaacctgtgttcgtccgtccgtccgt
ccgtccgtccgtccgtctgttaccaacttttctcgggattgaatcataag
atttttttgatttttggtacaaaggtgcaaaatggtagtgggcaaaatgt
gacggagcccgattttcgagaaaaaaaaatttgggggcaaatttgggcca
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gattgctcaagcagatttttgcaaaaaaattttgttggctaaaaaaacgc
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tcaaattactcaatttttttatgagatagatgtttttttttgctcatgag
ggcttacttttgaaggatatgtgtgtttagacatgaaattttggttgctt
ggcgtgtttttataNgatagatgttttttttttgctcatgagggcttact
tttgaaggatatgtgtgtttagacatgaaattttggttgggttgcttggc
gtgtttttataaaaaactggccaaattcaattttttttataagcacatta
tcaattacttagttattggcttttctcgagattggctcttttattcttta
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cCAATAaggggttttttggactttgtgaaatattggatcattgttttttt
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taaaaaaagaatttttcggctcaaaaaacgcatgtttatctataagaatc
actattaataagcatacatcaatgttcttagccaaattactaaatttttt
tatgagatagatgtttgtttttgctcacgaagtcttaaatatgaaagaat
atttcaagagcatgaaatttcgGTTTctaaacgcttttttataagaaaca
aacgactaattttaatagatcgtcactatttgtgttctgaatgattgttt
aatggtcacgtcacgtacatattaattataaatgtgttaaatgcataacc
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GCAAGGGATGCATATACGACTACTAAAAATCTATttgaaatgtcaatttt
taggtcAATGGTTTATTCTTGGTGCAAGGGATGCATATGCGTATACCGAC
AATGGAGAACGAGGAGATCCCTGCAGCCTGGTTACAGTTAGTCAATAATA
TCACTGTTCTTTTCTTGGTACCTGTCATCGATCAATTTGTGTATCCAAAA
CTTGATTCATTGTTCGAGAGGGCCCCACATTTATTCAGAATGTCTATTGG
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GCTAtgaatctaatttttttctttttttttagttcgaattatagaaagat
tcgaataatataagttcgaattagcgagagtccacCATAAATCTTCTTTT
CCTTCACATATTCGCATAGGGTAGAATAACCGAAATTTTTGTGTGAGAAT
TAGTGAATCGGCTATTTTGGATATTAAGGGATTAACTTAAAAAACTAATC
GCAAAAATTTTGCGAAAAGGGCCGGAATTTGTGAAAATTCGAAATACACG
TATTTCCTATTagcggattcatgtaaaaaagtcgcGAAAAACGTTGAGaa
agtctctgattggctgaaatattgcatatacaagcatatttttcaaaatg
tccagagtatgaggtaatctttgcataCCTCCAccaatcaaaagtttgtt
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gtgTATTCACTCACGCGAAATTTACTGCGCTTACTATTTAACCCTTTAAA
GTGCCACGAtcattttttctaagtttttttaaagaaaatcgcgagttcaa
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TAGTTCGTTGGATAGCTTAGAGTCTCTTCTTTCTTTTGCGCGCCTTTGGC
GCCGCCCGATCCAGGAAGGGCGGGGTGGGCAGTGGCTAAGGGGTGGGGGT
AGGTTAGGGGAATTTAAGCAGTGATAGGGTTACTAGTAAGGTATATTTAA
TTTTGAAAAGTGCCCGAAAAACTGTTATTTAATTGCTTTTTTTAATTTTT
AAGGTATGATTATTGCCAGTCTTGCAATGGTATCAGCGGGTCTTGTTGAA
TACCACCGTAAAAACACAGCTGGGTCACACACCAATGAAGTGAACGATGA
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AATACGTATTACTTGGAATCTCAGAGATTTTCGTTCTTATTACTGGTATG
TCTATACACATTCCTGTGTCACATACCCGCTGGGACCCGCGCCCTAGCTA
CTAGAAATTAAAAAAATCGTCCAAGTTACAGCCCTACTGGTAGCATGGGG
TCCACTTGAAGCTTTCTTTATAGACTGGATGGCGTGATGAAGTACGTCGG
TGGACCGTACATCATCAAAAATTATTAAGAAGCAAAGTTCAGTCAGAAGT
AGACTCTAGTCTACCGTACTGGAAGATTGACTTTAATTCCATCAAGGATT
CAATGGAAAAACATTCAACCATTTTCGTCTTAGGAACAATAAATTTTTTA
TCCCGATTGAGATTTCCCTGGAAATTTCAGCGCCATCGTTGGAAGAAAAG
ACATGGGTGTTTATACACTTGACCTCCCTTATGCAAAAATTGCAAATCTA
AGTAATTATTTATTCAAAGAATGGAAAGGTTTTTCTTAACACCCCTGTGT
CACAGCCCCGGACGAACTTTTTTTTCTCAATGTGGATAAAAATTCCTATT
GAAATTGCAATGGGGATAGAAATTCTATTGTTCCAAGGTTAAAAAATCCA
GTGGGGACGGTTTTCGAGTGCAATTTTTAAACATTGAATTTCGAGTGGGG
ATGAAATCAAAGTCAATTTTCCAGTGGGGCTGAAATTCCAGGGTATTTTC
CAACCGGGGTGTTTCTTAACCCTTTCAGTCCCAGGGGACTGCACTGCGGT
CCCTTTATACCCTTCGTTTTTCCCAGAGGACCGCACTGCTGTCCCTGACT
TCTTTTTGAAATTGTGATGTTTTGGCGGGAAATAAAGAAATGTCTTTAAG
TAGCTTTCAAAGAAGATAAGATAGCGCGTCGTGTGCAAAAGACTGcgtaa
aaaaagcttgttcgagtaaaaagttttgtttacagcaaaagtatttgcaa
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TCAGTTAGTAGATACTNGACTGCACTGCGGTCCCTTTATACCCTTCGTTT
TTCCCAGAGGACCGCACTGCTGTCCCTGACTTCTTTTTGAAATTGTGATG
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GTAAGGccgaaaatgggattttttacagcttctatcaatcattatgattt
ttctatgagGGCTAATCAAACAATTATTTTTTCAGTTAGTAGATACTGTT
GTGCTAAACATTTATCAGAAGAATAAATGGGtttaaaccatttttcataa
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ttctctggtcacgtgacacgctgatgacgtcactttgcaattttttttct
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CCTAGGTTTAGTAattccagagatattgaagCATAAGTAAACGCattcaa
aaactcattttacGGCTCTGGGAAAGTAGCTGTGAAAACTCCGGGTCTGA
AAGGGTTAATACGATACCCTCAAATGAATTAACTTTCATAGCCACCATCA
GATCGCAAATTTCAGATTCCCTTCTAGTCAGTTAGCATGATGATTAACAG
CTTGCAGACCAGAAGAGTCAGTCAATTGGAGGTATTTAGAGTTACCCCTG
AAAGTAACCGTGACCGTGGACTAGGAATCGGCTCGAAGtgaagaaatatt
caaaaaatcgaGACCTTGATCTAGCTAGACCAATACGCTATTACAATGTT
TCGTAAAATgagtcaaattatttttctgttcaaaaaattctttgtttctA
CTTTCAGATTATCCCTTGcatcttttaaaaatattttaatcattTCTTTT
TTCACAGGTTTGGAATTTGCATACTGTCGTGCACCACGATCGATGCAAAG
TTTCGTCACCAGTCTCTTTTTCGTTGTTAACGGCATCGGTgctttgctga
cgtcagcaattatCGTACTAGGTAACAAATTAGGTTTCAATTTCATCGGC
AAAGACTCCAGTAAGCTCAGTAGGGATGACCCAGTCCCGCATCTCACAGG
AAACTTGGATCATTTTTTCTACTTTATGGCTTGTTTGAACTTCTTGAATT
GGATCTTGTTTGTGATTTACAGTTTACGTAAGTCTCGTAAGAAACAACGC
CGTGATTTGGAACGTACCGTTGCGGCGTTTATACAAGGGAGCTATGAAGA
CTCTCTACGTGCAAGTCCAACGTAAAATTCATCCTCGTAAATATGTAACA
CTATCGAATGTACATATTTATGTACGTAAACATTGATATTTAACGTAAAT
ACGTGAATACTTTATCTTATAACACGCATTTAACGTTCAAACGCAATACG
GCCATTACGGAGTGTATTTGCTGGCGTTATGAATTGTTTGCtacattttg
aaagaaagtagAAAGTAGAAATGATGCTAAGAATGAATCGACTTTGGATT
CACCGTCATTTTATGGGGCTGGCTTTGTTTGATCGTTTCACGATGTACCG
TCCAAGAATTGTTTTACGGCAGTTGACAAAGCTTCTTAACTAAGAAATTT
TTATAGAGAACGtttatttcactgaagattgccatATTCTGTATGGCATG
AAACATCTAAGTAAGAAAATAAACttgttttctttactcaaactagtaaA
AAAACTTGATATCTTAAACTTTTATGATAAAAATGTCCTTTGTATTATAT
TATGTTGATGGGTGCAGCGTTGATATTTGCTGGTTACTGTCTGTTGATAT
TATGTTCTGttatttgttgattttttgacttcaaataattttcaattttc
tcgatttttcaaGGGAAAATGGCAGTGGTTTGAATAAAGTAAGAATAATG
TTGTTATGTTctattatttctattttttaatcaGGACATCGTCATTTTAC
GTCCCTACTACCTATAGTGTATTAAATACCcgtcaacattttcaaaatcg
gTCAATCACAAAATTAATTATCCGCTGAAATTAACATAACTCTTTTGGTG
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GTAGTTTTTGTATTACTAGTGATTTAATTTgcatccaccaaattaagtaT
CTAGCTGTTTGGccaaccgccaaattaagtacAAGGCAAAACTAATACAC
TTAAGGTATGTACATATTTTATAATAGGCAAAAAAGGGGCACGAAAAGGA
TACATTTTGCCTATAAGTACTTGAATCCGAGACCCACCGTTTTAAAATAA
GGGTCGCATTTTGTCACTTTTCGAAATTGAGTGGTTGCCAGGTTTTTGTT
ACTTGCTTAATATTAACTTGACCGTTAAAGGACATCATTTAACGTCTCTT
CTACCATTTGCTTTACACAGCATTTGTGAACAAAAGAAAGCGTAATTTTT
GCCGCACCGCGCGAGAATAAATTTCatggataaaaaaatttcattaccta
gactggagtcgtttataacgcgtgtaatactaataataccaatactaata
ataataataataacacgggatttagtttgtataaaattgttccattcatt
actttttgctttatttctactatgtataaattattcgtctagcttgctag
actattcATTACCTTAAGttagggaagaaattttggcgaaatgCCTAAAA
GTTTCGCCagattcgccaaaatttctttccgccaaatttaaatttgccaa
aataaattctcgccaaattaaattttctttcaatttagtctCTATTTTCT
ATTTAACCCTTTTTCCCctcttttttcagctaaaatattgaaaaaaaatg
ggtcgttcgccaaaattaattatcgccaaatttagaaattttattaaatc
acCAAAATAAATTCCGTTAAATTGCACCATTCCACCATTGGCGAATGAGC
tcgttcgccaaaatttcttctcttaaggtaattCGGCTTTCTCGGCAAGA
GGTGCACCTCCTAAATAATATTTAACTCTCTAGCTTTAGCGTTACTTAAT
TAGTTGCAATTTTAGATTTGACATAGTATTTTATCTTGTAGTGGATTCTT
GTAGGTtaattttttgatattattttgacaaaagttaaaaaggtaaTATT
ATAGATTTTAGATTAATATATTTTAATGTTAATATTAAAGATGGCCACCT
TTATGTTCGATTGTCATGTCAAcgattttatgtattttttaatacgagAA
GCTTTTGGCTAACATATCTGATGGCACATTATGGCAGTCTTGTGGGGTAG
GACTGAAAATTAGCTTTGCAAAGACTCTCTGTGTTTGAGAATGATTTTCT
CATACATCTCaaagttttggccattttctTCATAAGAAATCATTGGATCC
GatattgttgtttctttttgttattttttcagttctagaGATCTTTtgtt
aatatatatttttaaaatgtcatttaGGATAATTTTATAGTATTTGAtac
actttttttgtaaa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000255:33569..42382+

>TCONS_00016941 ID=TCONS_00016941|Name=TCONS_00016941|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=9045bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:33569..42382+ (Clytia hemisphaerica)
aTGGTGAATGATAAAAGTATTAGTTTCCCAATGAGCGACACAGACAATGA
AGATGATGAAAGCCTTATGGCTTCAGGTAGAAGTAGTTCTTTGAACTCTC
TTTCTCAACCTCTACTCAGCTCTGATGAATCCGAGAGGAACAAGAAACCC
AGAAGACATGTACTCAGTGATAGATTATTTGCTGAACGCAATAAAAAGCT
TGCTAAATTTTGTGTTATGTTGACTGTTACTTTAGAAAGAACTGCATATT
ATGGATTGTTGGGCAACTTGGCATATTTTACCAATGTCTATTTGGATTAT
ACAGCAGATGAGAGTGTGAATGTTACACTTGGTTTTTCTGGATTGACATG
GATCAGTTGTTTTATTGGTGGTATATTAGGAGATTCATTATTAGGTCGAT
TCAATACAATTATCACTGGATTGATAATTTATATTGTTGGTTATGCGAAC
ATGAGCTATATTGCACATATTATGAATCACGAAatagatgatgatgattt
tgataGAGGACGGCAGAAATTGTTTGTCGGTTGGTTTTTAGGATCCCTTT
TCCTAATCTCATTGGGAGAAGGTTGTTTCAAATCGAACATGTCACCCTTT
GGGGCTGATCAAATTGACTCCAATTCAGACAATTCTGAATTGAGATcatt
ttttaattacttttattgGGCAATTAACATAGGAAGTTTAATGGGTTTTT
CATTGATTGTTTGGATTCAGATTCACTTTGGATTTTGTACTGGTTATGTC
GTGCCATTGAGTTTACTTGGACTTGGTGCCTTGATTTTTATTGTTCCACG
ACAAAGGAATTATCATATTTTGTTACCAAAGAAAAATGTGATAATGATCA
TCAAAATCTTGTGGAATGCTCTTACTGGGAAAAGGCCTCACAGCGCATAT
GAAGAATATAATCCTATGGACGGGAGATTGGATCGAGCAAAGATTAAGTA
TGGCGGCAAATTTTTGGACAGTGATGTTGATGACGTTAAAGTGTTGGTGT
CTTTGTTTCCAACACTTCTTTTCCTAATCATCTATTGCAGTTGCTATTAC
CAGgtcAATGGTTTATTCTTGGTGCAAGGGATGCATATGCGTATACCGAC
AATGGAGAACGAGGAGATCCCTGCAGCCTGGTTACAGTTAGTCAATAATA
TCACTGTTCTTTTCTTGGTACCTGTCATCGATCAATTTGTGTATCCAAAA
CTTGATTCATTGTTCGAGAGGGCCCCACATTTATTCAGAATGTCTATTGG
TATGATTATTGCCAGTCTTGCAATGGTATCAGCGGGTCTTGTTGAATACC
ACCGTAAAAACACAGCTGGGTCACACACCAATGAAGTGAACGATGAACAT
ATTAGAATTTTGGCAAGAAACTTCAGCATCTTTTATCAAATACCACAATA
CGTATTACTTGGAATCTCAGAGATTTTCGTTCTTATTACTGGTTTGGAAT
TTGCATACTGTCGTGCACCACGATCGATGCAAAGTTTCGTCACCAGTCTC
TTTTTCGTTGTTAACGGCATCGGTgctttgctgacgtcagcaattatCGT
ACTAGGTAACAAATTAGGTTTCAATTTCATCGGCAAAGACTCCAGTAAGC
TCAGTAGGGATGACCCAGTCCCGCATCTCACAGGAAACTTGGATCATTTT
TTCTACTTTATGGCTTGTTTGAACTTCTTGAATTGGATCTTGTTTGTGAT
TTACAGTTTACGTAAGTCTCGTAAGAAACAACGCCGTGATTTGGAACGTA
CCGTTGCGGCGTTTATACAAGGGAGCTATGAAGACTCTCTACGTGCAAGT
CCAACGTAAaTGGTGAATGATAAAAGTATTAGTTTCCCAATGAGCGACAC
AGACAATGAAGATGATGAAAGCCTTATGGCTTCAGGTAGAAGTAGTTCTT
TGAACTCTCTTTCTCAACCTCTACTCAGCTCTGATGAATCCGAGAGGAAC
AAGAAACCCAGAAGACATGTACTCAGTGATAGATTATTTGCTGAACGCAA
TAAAAAGCTTGCTAAATTTTGTGTTATGTTGACTGTTACTTTAGAAAGAA
CTGCATATTATGGATTGTTGGGCAACTTGGCATATTTTACCAATGTCTAT
TTGGATTATACAGCAGATGAGAGTGTGAATGTTACACTTGGTTTTTCTGG
ATTGACATGGATCAGTTGTTTTATTGGTGGTATATTAGGAGATTCATTAT
TAGGTCGATTCAATACAATTATCACTGGATTGATAATTTATATTGTTGGT
TATGCGAACATGAGCTATATTGCACATATTATGAATCACGAAatagatga
tgatgattttgataGAGGACGGCAGAAATTGTTTGTCGGTTGGTTTTTAG
GATCCCTTTTCCTAATCTCATTGGGAGAAGGTTGTTTCAAATCGAACATG
TCACCCTTTGGGGCTGATCAAATTGACTCCAATTCAGACAATTCTGAATT
GAGATcattttttaattacttttattgGGCAATTAACATAGGAAGTTTAA
TGGGTTTTTCATTGATTGTTTGGATTCAGATTCACTTTGGATTTTGTACT
GGTTATGTCGTGCCATTGAGTTTACTTGGACTTGGTGCCTTGATTTTTAT
TGTTCCACGACAAAGGAATTATCATATTTTGTTACCAAAGAAAAATGTGA
TAATGATCATCAAAATCTTGTGGAATGCTCTTACTGGGAAAAGGCCTCAC
AGCGCATATGAAGAATATAATCCTATGGACGGGAGATTGGATCGAGCAAA
GATTAAGTATGGCGGCAAATTTTTGGACAGTGATGTTGATGACGTTAAAG
TGTTGGTGTCTTTGTTTCCAACACTTCTTTTCCTAATCATCTATTGCAGT
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ACTTGGACTTGGTGCCTTGATTTTTATTGTTCCACGACAAAGGAATTATC
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TATGGACGGGAGATTGGATCGAGCAAAGATTAAGTATGGCGGCAAATTTT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR000109POT_fam
IPR018456PTR2_symporter_CS
IPR020846MFS_dom
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0016020membrane
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0006810transport
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Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
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GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006857 oligopeptide transport
biological_process GO:0006810 transport
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molecular_function GO:0005215 transporter activity
Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00016941 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: S15A4 (Solute carrier family 15 member 4 OS=Homo sapiens GN=SLC15A4 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 206.453 bits (524), Expect = 8.503e-56
Identity = 168/544 (30.88%), Postives = 273/544 (50.18%), Query Frame = 3 
Query:  249 VMLTVTLERTAYYGLLGNLAYFTN-VYLDYTADESVNVTLGFSGLTWISCFIGGILGDSLLGRFNTIITGLIIYIVGY------------ANMSYIAHIMNHEIDDDDFDRGRQKLFVGWFLGSLFLISLGEGCFKSNMSPFGADQIDSNSDNSELRSFFNYFYWAINIGSLMGFSLIVWIQIHFGFCTGYVVPLSLLGLGALIFIVPRQRNYHILLPKKNVIM-IIKIL-WNALTGKRPHSAYE--------EYNPMDGRLDRAKIKYGGXXXXXXXXXXXXXXXXXPTLLFLIIYCSCYYQVNGLFLVQGMHMRIPTMEN-----EEIPAAWLQLVNNITVLFLVPVIDQFVYPKLDSLFERAPHLFRMSIGMIIASLAMVSAGLVEYHRKNTAGSHTNEVNDEHIRILARNFSIFYQIPQYVLLGISEIFVLITGLEFAYCRAPRSMQSFVTSLFFVVNGIGALLTSAIIVLGNKLGFNFIGKDSSKLSRDDPVPHLTGN-LDHFFYFMACLNFLNWILFVIYSLRKSRKKQRRDLERTVA 1793
            V+LT  LER A+YG+  NL  F N     +   ++    L F GLT++    GG L D+ LGR   I+  L +Y++G             A +   A ++N      D      +         L L+ LG    K+N++PFGADQ+      +  R FFN+FYW+IN+G+++    I +IQ +  F TGY +P   +GL  ++F+   Q  +    P  +    + KIL ++  + KR              + +      D  K+ +GG F +  V+DVK LV + P  L LI Y + Y+Q+   +++Q +H+RIP + N       +PAAWL + + + +L L+P+ D+ V P L         L R+++GM     +  +AG++E  R N     T      ++   A + S+++Q+PQY+L+GISEIF  I GLEFAY  AP+SMQS +  LFF  +G+G+ + S ++ L   +    IG  SS     +    + G  L+++F+ +A +     +LF+I S+   +    RD +R+ A
Sbjct:   40 VLLTELLERAAFYGITSNLVLFLNGAPFCWEGAQASEALLLFMGLTYLGSPFGGWLADARLGRARAILLSLALYLLGMLAFPLLAAPATRAALCGSARLLNCTAPGPD---AAARCCSPATFAGLVLVGLGVATVKANITPFGADQVKDRGPEAT-RRFFNWFYWSINLGAILSLGGIAYIQQNVSFVTGYAIPTVCVGLAFVVFLC-GQSVFITKPPDGSAFTDMFKILTYSCCSQKRSGERQSNGEGIGVFQQSSKQSLFDSCKMSHGGPFTEEKVEDVKALVKIVPVFLALIPYWTVYFQMQTTYVLQSLHLRIPEISNITTTPHTLPAAWLTMFDAVLILLLIPLKDKLVDPILRRHGLLPSSLKRIAVGMFFVMCSAFAAGILESKRLNLVKEKTINQTIGNVVYHAADLSLWWQVPQYLLIGISEIFASIAGLEFAYSAAPKSMQSAIMGLFFFFSGVGSFVGSGLLAL---VSIKAIGWMSSHTDFGN----INGCYLNYYFFLLAAIQGATLLLFLIISV---KYDHHRDHQRSRA 568
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00016941 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
S15A48.503e-5630.88Solute carrier family 15 member 4 OS=Homo sapiens ... [more]
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