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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00016609 ID=TCONS_00016609|Name=TCONS_00016609|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1530bp gGACGGTAAATATACTGATTTACTGTCGTCCTCAGTGAGTCAGAATGTAG ACAacttagaaccttaccgtctccgtcgctttAAAACGtacatacataaa ctcactattAAAAACTTTGGTGGGTATTTAAATTAGCGGATTAAGATCGA AACCTCTAAAAAAACCCAAATCTTCCAAATCTAACCCCCACTTAAATAAT ACACTTCAGGTAGGAAGAATGAACCAGCGTTTTGATATTAAATTGGAGAA GATTTCTGTTATAATGAAGACGTTGGTCATTGTTACAGCATTTTTCATGA CACTCAATGATTGCAAAGAGGTACCTACAAAAGCAGAAATTCAGGAAATA TCTGGAAGCAATGACATCCACCCTAACAAGGACTACTTtggaaaaaatgt caaaatcaaCAATGATAGTTTATTTGTTCTGGCTAACAACGATGTTTACG TTTACCGAAGAACCAATCACAAGGCCAAAACATTAAATCAAATTCAGAAG TTCACTGTGCATTGGCATTTAGGATCTCCGGGCAATACGGCAAAAGGGCC TGGGATTACTCTTCAGGGCATTGCGATAGATAACGATTACTTGTTTGTTC AAATGGCATTAGGATGGGATTCAAATAGCAGGGGAATTATATGCCAATGT CAAGtatacattttgaaaaacgGTCTCTGGGAATACTCAAGGTCCTTAAG GATGACTGTACAAAGTTACTATGATTTGTATGGATTTTCGATGTCAGCTC ATAATGGAACATTAGTGATCACATCTCCAAGTAGATTCAAGTCGCAATAT CCTGCTGGTAAAATTTACATTCACACTATTGGCTCTTGGAAAAGAGAAGA ATTGTATAAATTGGGCCGATTTGCATTTGGAATCTCCGCAGCAATATATA ATGATACGATTTCCGTAGGAGATACTAGTTGTACCAATACTACACATGAT TGTCAAGTTTACATTTATTACCATTATCAATCAGAACAATGGGTGGAGCA ACAAGCTATATTCCCAGAGAATAAAACTCATTACGGAAAATTCGGTAGCG TGGTGGCATTGAatgagaaatttttatttgtaatCGGTTATGAAAAGTCT TCTAAAGGTTATACAAGGACAGTCTTTGTATATAAAAAAGCAGTGTTTTA TCAGACTGTCAAGTATGACCTGCATCAATTATTGCCAGATACTGCTGAAA TTTACGATCCAATACAATTTACTACAATCACCTCATCCTTAAGCACGTAT GGAAATTACTTGGTAGCCGGTACAGCTGCTTTGAACCATGACGGTTCTGT GTTTGTTTATACATACAATGATTTCACAGATACTTGGATCCAAAAAGAGA GGTTGCTACCGTCGCACAGGGTCAACTATTTTGGGTGCTCTGTTGCGACC ACAGGCAATTTAACAGTGGTTGGAAGTGATTTCAGTTGGGCAGAAGGTTC ACCAGATGGCAAAGCATTTGTTTATAGCACGTGGGTACCACCTGCAACTC CTATGCCTACCACAACCCAATCAAAGACCA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000243:278118..294939- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00016609 ID=TCONS_00016609|Name=TCONS_00016609|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16822bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000243:278118..294939- (Clytia hemisphaerica) GGACGGTAAATATACTGATTTACTGTCGTCCTCAGTGAGTCAGAATGTAG
ACAACTTAGAACCTTACCGTCTCCGTCGCTTTAAAACGTACATACATAAA
CTCACTATTAAAAACTTTGGTGGGTATTTAAATTAGCGGATTAAGATCGA
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GACATTTCTCCGTGCTCTAGGGCTAAAAACTGCCATTTGTGAGGTAAAAC
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ATCTTTCAGTTTCCATACCTTAACAAACCATCGACCTCGTTTAAATTCAC
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ATGACAGGGGGCAAACCCTTAGGACCGCCCGTGGCATCTTTAATTGGACG
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AAGCGACTTCAAAAACAATTGAAATGGAATATTCCAGATAAAAGAACAAG
ACGTATGGAACATCCTGAGACGTCCAAGAAGGACGTTCTAAAAACACTAG
CGAGCGTTCTATTTCATCTACTTTATTTACTAGTTTAGTATAGTATTAGA
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TCCATGATTCCCGGTTAGGGTGATAAAAACACCAAAATTGAAAAACCAGT
CTCTCATAGGGTACCTTTTTTGGGGAAAATGTGGAAAGTCCATCTTTCGA
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GACAATAAAAATCGGAGATTTTTATTCAGTTGAGCTCGATGGATATTTGA
CGAAGCGAAGCTGAATCTTCAAAATATTTCAAAATCTTTCGAACTATGAC
GTATGTAACAAACCTAATTATTTGCATTTACTTGAGCCATCTTTTACCAA
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TGTCTGCAAATAAGTATTTTAGACCCCAATTTTGTATTTTCGACACCCTG
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GGGGCGATTTTAGCCATACTAAATTGAAAATTTCTCCCATCGGCGCAAAC
CATGGTTGCACCTCCTCGTTCCCCTTGTGAAAACTATTCACGCTAATTCA
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CACGTTTTTACCAAACAAAGCTACCTATACTTTTAAAAGATTTCCATTAT
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CCCCTGTGTATTACTAAAAATAGAAAAACAGAGGTCCAGATTTTTCGGAT
GTTTCCGATAGGAAAAATGATATAATCTTGACTTACGCGTATGAGAATGC
CGAAAAACGTAATCCAAGTAATGGACAAAACATAGTTTATCTTTTTAAAT
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CTGAAATCTCTTTAAGACACGTATAGGAACAGTGGGAAGTATAAAATTTA
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ACTTAATCTTGCGGTTGTGGCCAAAACGCTATTTTTGACGGCTATTTCAT
TTAGGGTTCAATATTTATTATAATTTGACAGGGATTTAAATGGCGGATTT
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TTTTTTCTAAAGAAAATCGCTAGTTCAAACTTAAAAGGCTTATTTCTCCG
GATCTATAAGGAGTTAGAAGCTCGTTTATAGTCCGTTGGATAGCTTAGAG
TCTCTTCTTTCTTTTAGGCGCCTTCGCACCGCCTGATTTAGGAAAATCGG
GTTGGGCGGTGGCAACTGCGCAGACCTGCCTGAATGATAGAAAGGTGCCA
AGTGGTAAACTTCAAATTAATTCGCTGGAGGACAGAATCAAATAAATCAG
GGCCAAATTTGGAGGTTCTTGGCTCACTCCTTGACCAAAAATGGTGAAAA
ATGGTCAAAATCTTAAATTTGTTTTTGACTTTTTAGCTTAAAATCTCGCT
GAAAAGACTCAATTTAGATTTTTTTTTTGCTTGACCATGAAGCCCAATCC
AATTCCTACGAAGTAGACCAAAAATGACGATTTCTAACTCAAACTGGGCA
TTACATACATAGCCCATGTCTGATATATACGACATTGGCACTTAAAGGGT
TAATATTTGACCTTAAAATGAAGATCTTAGTTAATGTTTGACTCGAAAGG
TTATGTTAATTTCAGTGGGAATTTTATTGGACGGCGATGGCTGATATTAG
CGAGTTTATTTATTTTCAATTCTAAAGACAGTAAAGTGACTAAAGCGATT
TGGAAAAACCCGCAGTTCTGACCCACAAAATCGAGGGCGGTAAAAGTACT
GATTTACTGTCGTCCTCAGTCAGTCAGAATGTAGACAACTTAGAACCTTA
CCGTCTCCGTCACTTTAAAACGTACATACTCACTATTAAAGGTGGGTATT
TAAATCAGCGGATTAAGATCGAAACCTCTAAAAAAACCCAAATCTTTCGA
ATCTAACCCCTACTTAAATACCGTATTACTTCGAATAAACGCCCGGGGCG
TTTATTTAATTTTTTCGATTTTAAGAGGGGCGTTTACTTGAGGGGGCGTT
TAAAAGAAGGGGACGTTTATTAAATTATTTCAGTTTCAAGTCGAATATTT
AGAGCAAATATGCGTTTAAAAGAAGGGGGCGTTTATTCGAAGTAATACGG
TATTACACTTCAGGTAGGAAGAATGAACCAGCATTTTTATATTAAGTTGG
AGAAGATTTCTGATTAAATGAAGACGTTGGTCATTGTAACAGCATTATTC
TTGACACTCAATGATTGCAAAAAGGTACCCACAAAAGCAGAAATTCAGGA
AATATCTGGAAGCAATAACGAGCATCCTAACAAAAAGGACTACTTTGGAA
AAAATGTCAAAATCAACAATGATAGTTTATTTGTTCTGGCTACCAACGGT
GTTTACGTTTACCACAGAACCAATCACACGGCCAAAACATTAAATCAAAT
TCAGAAGTTTTCATCTCACACAGTGTATGGGTTCAGTCAGGGCATTGCGA
TAGATAACGGTTACTTGTTTGTTCAAACGGCATTCTGGGATACAACAGTG
GGGATTGTATGCCAATGTTTTGTATACATTTTGAAAAACGGTCTTTGGGA
ATATTCAAGTTCCTTAAAGATTACTAAGCAAAGTTATGACAATGATTTAT
ATGGGAACTCGATGTCAGCTCATAATGGAACATTAGTGATCACATCTCCA
AGTAGATTCAAGTCGCAATATCTAGCAATTGCTGGTAAAATTTACATTTA
CACTATTGGCTCTTGGAAAAGAGAAGAATTGTATAAATTGGGCCACTTTG
CGTTTGGAATCTCCGCAGCAATATATAATGATACGATTTCCGTAGGAGAT
ACTAGTTGTACTGATACTACATATGATTGTAAAGTTTACATTTATACCAG
AGGTAAATCAGAGGAATGGGTGGAGCAACAAGCTATATTCCCAGAGAATA
AAACTCATTACGGAAAATTCGGTAGCGTGGTGACATTGAATGATAAATTT
TTATTTGTAATCGGTTATGAAAAGTCTTCTAAAGGTTATACAAGGACAAT
CTTTGTATATAAAAAAGCAGTGTTTTATCAGACTGTCAAGTATGACCTGC
ATCAATTATTGCCAGATACTGCTGAAATTTACGATCCAACACAATTTACT
ACAATCACCTCATCCTTAAGCACGTATGGGAATTACTTGGTAACTAGTAC
AGCTGCTTTGAACCATGATGGTTCTGTGTTTGTTTATACATACAATGATT
TCACAGATACTTGGATCCAAAAAGAGTGGTTGCTACCGTCGCACAAGGTA
AGTGTTTTATTCATTAGTTTCACCCTTCTTGACTATTAGTTATTTTTGTA
TTAGTTACTCTTTGTGTTATAAAGGCGAAACACATTTAATTTATTGTTTT
ACGGGCAAACCTCCAGAAAAATTTGAGTCGGTCGGTCGGTATCATAAAAA
TAAATTTGTCAAATATCAAAAACAAAACCTTCCGTTGAGATTTTTCTAAT
CCAAGGCTTTTTCAACTTGTTCATTTAAAAACGAAAAACCATAAGTCTAA
CCTTGAATATTACATATTCAAAATTATCATTTTTGATTGTTCAGGGTCGG
TCGGATCCGTAAAACAATAAGTTAATCTATTCTCGCCTTAATGATAATTT
TAATAAGATTATCATCTTAAAGGTTTTCTACGGGAATAAAAGGAGCATAT
TTTAGGCAGTGTCTTCGTGCTGAGTCAGAAAAACTTAAAGCTACTTTTTT
ACGCAACGATATCCTGCAAACAAGTGAAAGAACTAAAGTTGTTTCGAGAA
GTGACCTCACATTCTATTACTTTTGTAAATAAAAAAATAGCAAAGTTTAG
AGGTACTGGTTACACCTGTATGACTGACTGCAATTAATCGAAGCCATTAT
GACGGACATACCTTCATTATACACTACAGTATATCATGACGCAGCAATCA
TGATCTAGTGTTGTAGTTTAAAATTCTATAAAAATGTAGGTTTTATTTAA
ACTTGTTTCAAGGTCAACTATTTTGGGTGCTCTGTTGCGACCACAGGCAA
TTTAACAGTGGTTGGAAGTGATTTCAGTTGGGCAGAAGGTTCACCAGATG
GCAAAGCATTTGTTTATAGCACGTGGGTACCACCTGCAACTCCTATGCCT
ACCACAACCCAATCAAAGACCA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| TCONS_00016609-exon-sc0000243-1575043694:293570..294939 | TCONS_00016609-exon-sc0000243-1575043694:293570..294939 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016609-exon-sc0000243-1575043694:278118..278277 | TCONS_00016609-exon-sc0000243-1575043694:278118..278277 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016609-exon-sc0000243-1510915933:293570..294939 | TCONS_00016609-exon-sc0000243-1510915933:293570..294939 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016609-exon-sc0000243-1510915933:278118..278277 | TCONS_00016609-exon-sc0000243-1510915933:278118..278277 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016609-exon-sc0000243-1491911889:293570..294939 | TCONS_00016609-exon-sc0000243-1491911889:293570..294939 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016609-exon-sc0000243-1491911889:278118..278277 | TCONS_00016609-exon-sc0000243-1491911889:278118..278277 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000243 | supercontig | sc0000243:278118..294939 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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