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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00016346 ID=TCONS_00016346|Name=TCONS_00016346|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4779bp
GAAAccatttatttaaaattaacAACATTGGTATATACATGGAAATGTTT
TAGATAGTAGACATTAGATACTTGTGTATCGTGAaaggacatttaaaaaa
atNAAACCATTTATTAAATATTAACAACAGTGGTATATACATGGAAATGT
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TGACTCGCTCCCAATCCCTTTGTACCCAGTCTCCTTTACTTTTATCTACG
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GTTCTTGTAATGGCTGTCGGATTTGCTGTTGATTACAGCTGCCATATTGT
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gttttaattttgaaaaatcctcgAGAATGCTACATAACATTTGTTTTTGG
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aaaatatgaaaatgtctTTTCTATTGGCCATACTTGTTGCCCTCAACGTC
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GTCgttgaaaatttattattttgaacttttttttttagtatttaacaTAT
TACTAGGCTGTTGAAATTTTTATCGAAAGGAACACCACTGtaacatgaat
ttttttttgtagaatattttaaaagttga Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00016346-protein >TCONS_00016346-protein ID=TCONS_00016346-protein|Name=TCONS_00016346-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=877bp
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AGFLKYSVYGQAERLFYPQNSFVFKSLDRVKDSFNYYIQNEEFILIRNDG
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DNFQNVSQTLFKALTSDSTIMGNGLSPKRNFPQMFGKFNTDITQQKLDSN
VIRISYPVHFSQTRTKYEQNSKIEKSIIDYLKSKEKELSLEGISLAYNTV
RGLDDSISQNTKDNVSLIGASIFSMILFCTLGMINLQAKIKSHILVSLAG
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KENKDTCFSKVMKAYGNFLMNKFVKIGVVIFAVILLIMGIYGTIHTSLDF
DYKVSGSAKSSYVNWLQTLESNFPFGVFQMDVVLDDPNVNYTDPKIQQIF
KTLDTFPVSKVPELNTSLTVNWMTAYMQWSEAQSLSISGDSFYKNLPTFL
NQFKDFRIDIVQDTETGRISASRIHFFTKDRWSLVFRRDALVNLREACDS
LPIPLYPVSFTFIYVSHLIVIIKATLTNVAICAAVILSITLPFVVNPKVS
LIHFLTFISFLIELLGMMYLWDLSLNSITMLVLVMAVGFAVDYSCHIVHA
YLVSKETGPDEQMKDAISNIGSSILKGALSTLIGILVLSISSSKLFRLFF
KMVFSIILLGLIHGMIILPVILTWFVKNTPSYENQTAEKEFLRNGDGRES
KKQLLKENGQNGGIHMNGGHNGGVVQV Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000233:30220..37915+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00016346 ID=TCONS_00016346|Name=TCONS_00016346|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7696bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233:30220..37915+ (Clytia hemisphaerica)
GAAAccatttatttaaaattaacAACATTGGTATATACATGGAAATGTTT
TAGATAGTAGACATTAGATACTTGTGTATCGTGAaaggacatttaaaaaa
atNAAACCATTTATTAAATATTAACAACAGTGGTATATACATGGAAATGT
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CAGCCAAGAACTAACAGTTGTGTTTCAATTAACCCTTTTGATGGGATTTT
CCATCaagacaattttcaaaatgttagtCAAACTTTATTCAAAGCTCTAA
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CCACAgatgtttggtaaatttaatACGGACATAACTCAACAGAAACTTGA
CAGTAATGTGATTCGAATATCATACCCAGTCCATTTTTCACAGACCCGAA
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TGATCGGGTTCCCATGGAGATCAAAGGTCCTGATCGATTGGGTATGGCTT
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GATCCCTTTTAGGATCCCAAAACGTCAAAGTTTGTCGCTGAGATGCGAAT
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aaaattaaaCCCTTAACGGTGAAAGAACCTAAGAAAGTCAAAATTATCGG
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GTATTCCCATAGTAGCACAATTTGGTATCAACAACAAACATCGTTTATCT
CTTAAACGAATGCTTCTCTTTAATTATCTAAGGTCATTGCTAGGTCATGT
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ctaattttttttttgaaactcaaaactttaaagtgccataaaaatttgta
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GCATATGGCAACTTCTTGATGAATAAATTCGTTAAAATCGGTGTCGTCAT
TTTCGCCGTAATTCTCCTCATAATGGGGATTTATGGCACCATCCACACGT
CCCTTGACTTCGATTACAAAGTTTCTGGGTCCGCAAAATCGTCATACGTC
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CCACGTTTTTAAACCAATTCAAAGATTTCCGTATCGACATTGTTCAAGAT
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CATGTGACTCGCTCCCAATCCCTTTGTACCCAGTCTCCTTTACTTTTATC
TACGTCTCACATTTAATCGTCATCATCAAAGCGACTTTAACCAACGTCGC
TATTTGTGCCGCCGTCATTTTGAGTATAACGTTACCGTTCGTCGTTAACC
CGAAAGTCTCTTTAATCCATTTTTTAACCTTCATCtcatttttaatcgaa
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GCTTGTTCTTGTAATGGCTGTCGGATTTGCTGTTGATTACAGCTGCCATA
TTGTGCATGCTTATTTGGTTTCCAAGGAAACGGGGCCGGATGAACAAATG
AAGGATGCGATTTCGAACATTGGATCAAGTATTTTAAAAGGAGGTAAGTC
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ctctctctaattcgatcttcaaaggaCCAAGAATTAGCTTAGAAtttgag
aaagatttgaattacagagagtagtTTAAACTACTTTCGGGATGAGGGGA
CCATTCTttctagttcgaattacagagagatatGAATTATTAAGGTTCAA
AATAGAGAGAGTTGGCTATAATTCTTCAACTTCATtgttcaataatattt
tttgttttctttacatTTAACAGCGCTGAGTACATTGATTGGTATCCTGG
TGTTATCGATCAGTAGCAGTAAACTGTTCCGCCTCTTCTTCAAAATGGTA
TTCTCAATCATTTTACTGGGTCTCATTCACGGGATGATCATTCTACCTGT
AATTCTGACCTGTAAGTCATTTTCcttctaaattttaaatgtaCATTTCT
AATAGAACATACCTCGATTAATTTTAGCGTGACATTAATTTGGCTTGGCG
AAGGAACCATATGTTTTATGTTAGCTCAAGGAACTTTAATGAAACAGTTA
GCTTTACCGgcgatttattttattttggtgaatgataaatttttaaaaat
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ATGAAAATTGCTATAAAGTCTACTTTAAAGTGGTGACTTttcataaaatt
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ttttaagtattttttgttACTTTCCCGGTTCATGCTGAGTTTCAGGGCTG
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TCATAGCGGTACGATCAACAGGAAGTCTCGACAAAAgttcaccgtgaact
ttttgGGTGGTTTCACGGTGAGATATTTTCGAAAGATTGTAGCTTTCGCC
CTGGATTCAACCAAAAATTCATGGCGAAAAATTCATGGCGAAAAATTAAC
CTCATCGCGTTTTAGTGGTCgttgaaaatttattattttgaacttttttt
tttagtatttaacaTATTACTAGGCTGTTGAAATTTTTATCGAAAGGAAC
ACCACTGtaacatgaatttttttttgtagaatattttaaaagttga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000233:30220..37915+ >TCONS_00016346 ID=TCONS_00016346|Name=TCONS_00016346|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=10536bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233:30220..37915+ (Clytia hemisphaerica)
atggCGTGTGGGTGTTTGACCTCGTGGAACCGCTTATGTGGTAAATTTCA
CACTTGTCTTGGCAATTTATTCGAAAAATGGGGCCGATTTGTTTATAAAC
GACCCGCACTAGTATTAGTGGTTAGCCTGGTGACGTCATTTGCGTTGATG
GCTGGCTTCTTGAAATACAGTGTGTACGGACAAGCCGAGCGACTGTTTTA
TCCGCAAAACAGTTTCGTTTTCAAGAGCTTAGATCGCGTTAAAGACTCAT
TCAATTATTACATACAAAATGAAGAGTTTATATTGATTCGAAAcgatggt
cgaaatatattgaataGTGAGACATTCAAAATGGCGCATAAGCTGCATAA
AGACATTTTACAGATTAAAGGGTTTGACAGTTACTGTTTGGAGCAGCCAA
GAACTAACAGTTGTGTTTCAATTAACCCTTTTGATGGGATTTTCCATCaa
gacaattttcaaaatgttagtCAAACTTTATTCAAAGCTCTAACGTCAGA
CTCTACCATTATGGGGAACGGGCTATCGCCGAAGCGGAACTTCCCACAga
tgtttggtaaatttaatACGGACATAACTCAACAGAAACTTGACAGTAAT
GTGATTCGAATATCATACCCAGTCCATTTTTCACAGACCCGAACCAAATA
TGAACAgaattcaaaaatcgaaaaatcgatAATCGACTACTtgaaaagca
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CGTGGATTGGATGATAGCATTTCGCAAAATACAAAAGATAATGTATCGCT
TATTGGTGCTTCGATTTTTTCCATGATTTTGTTTTGCACTTTGGGCATGA
TTAACCTCCAGGCAAAAATCAAAAGTCATATCTTGGTTTCACTAGCTGGG
ATCTTGGCTGTTTTGTTTGGTATAGGGGCTGGTTTTGGACTCGGTTTACT
AATCGGGCAACCTTATGTCGGATTCATCGGGGTTCTCCCGTTTTTGGTTT
TGGGAATCGGAATCGACGATATGTTTATTATAATGCACCATCTTGATCGG
GTTCCCATGGAGATCAAAGGTCCTGATCGATTGGGTATGGCTTTGAAACA
CGCTGGTTTGTCAATTTTAATGACCACCTTAACCGACTTGGTTGCATTTA
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gcatttttatcgattttgtttgcttttttgatgattttgaccTTCTTTCT
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GCTTACCTTGTTTTCATGGTGATGAGAAATCAGAAGAATTGAtgttgaaa
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AAGACCCTTGATACATTTCCAGTATCAAAAGTACCCGAATTGAATACAAG
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CCTTATCGATCAGTGGTGACAGTTTCTATAAGAACCTTCCCACGTTTTTA
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ACGCATCTCGGCATCCAGAATACACTTTTTCACCAAAGATCGTTGGTCAT
TAGTTTTCCGCCGTGATGCACTTGTCAATCTGCGTGAAGCATGTGACTCG
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CCGTCATTTTGAGTATAACGTTACCGTTCGTCGTTAACCCGAAAGTCTCT
TTAATCCATTTTTTAACCTTCATCtcatttttaatcgaacttctTGGAAT
GATGTATTTATGGGATCTCTCTTTGAATTCAATCACTATGCTTGTTCTTG
TAATGGCTGTCGGATTTGCTGTTGATTACAGCTGCCATATTGTGCATGCT
TATTTGGTTTCCAAGGAAACGGGGCCGGATGAACAAATGAAGGATGCGAT
TTCGAACATTGGATCAAGTATTTTAAAAGGAGCGCTGAGTACATTGATTG
GTATCCTGGTGTTATCGATCAGTAGCAGTAAACTGTTCCGCCTCTTCTTC
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TCTACCTGTAATTCTGACCTGGTTTGTCAAGAACACACCATCATATGAAA
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AAAAAACAATTACTGAAAGAGAACGGACAAAATGGCGGCATTCATATGAA
TGGTGGGCATAATGGCGGTGTAGTTCAAGTATGAatggCGTGTGGGTGTT
TGACCTCGTGGAACCGCTTATGTGGTAAATTTCACACTTGTCTTGGCAAT
TTATTCGAAAAATGGGGCCGATTTGTTTATAAACGACCCGCACTAGTATT
AGTGGTTAGCCTGGTGACGTCATTTGCGTTGATGGCTGGCTTCTTGAAAT
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GTTTTCAAGAGCTTAGATCGCGTTAAAGACTCATTCAATTATTACATACA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
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Annotated Terms
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Vocabulary: Cellular Component
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GO Assignments
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| Category |
Term Accession |
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GO:0016021 |
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Blast
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