TCONS_00015598 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00015598
Unique NameTCONS_00015598
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1675

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00015598 ID=TCONS_00015598|Name=TCONS_00015598|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1675bp
GGGTACATCAGTGATACATGATTTGAAATGTCTTGATGGTTAAAGGGATA
ACCATATACACACAAggaacaaaaagaacaaaagaaagaaagaaaaaaaa
gaaagcgtTGACCTAAAACTACACTTTTATGAATGAGCAAGCTTCAATGA
AAAACAGAATGCAGGATACACAGCAAACCACAGAACTTCTCAGTATACCG
ACAACCGATTTCCATCGCCGCTTATCACAAGACAAACCCGTCATAACACC
GACAACACAACAATACCATTGTCATGAAAACAACGTTGTGACACCGACAT
TTACGTCACCCGGTTGTACGTGTCGCAAGTTGTTAAGTCGTCAACCTCAC
ATCCAACGACATTGTGGGTGCAAAGAACAGAAAAACACGAATAAAACTCC
ATCGTATCTTGATACTTCAGACTATATACAATACTGTAATAATTTGACAC
CGGCTGGAAAAACCTACCCTCAATTATGTTTAGAACCACATTTTAACAAC
AACAGTCGCAAAAATAGTGCTCAATCTGCCATTATGCTTACAGACGGCAC
CGAACCTAAAGTTTTGGAACTAAATAATAACCATGATAATTTAACAGAAC
AAAATGGCGGCCATGAAAGACACAATGGTAGTCATAGTGATATCCAAGTG
GATGAGATTGATTTAGAAGAGACTTATTACCCTGAGAAAGTGTTTTGGTG
TTTGGAACGTAAGTCCAGATTCAGACATTGGGCCATTCGCATGACGCTAT
CACcATATTTCGAACGGATAACCATATTTGTAATCTTAATGAACTGTGTA
ACACTGGGCTTGTACGATCCGTATGACGAAGATTGCAAAACTCAACGATG
TCAAATCTTGGAAGGATTCGAAACGTTCATTTATGCATATTTCGTCGCTG
AGATGGTTATCAAAATTATAGCCTCAGGTTTGCTTGGGAAACAAGGCTAT
TTGTCGGAAGGCTGGAACAGGCTAGATTGTTTCATCGTGGTCGCAGGaac
atTCGAGCTGATTTATGGCGATGGTGAATTTTTAAGTTCAGTAAGAGCTG
TCCGTGTGTTAAGGCCCTTACGTGCTATCAATCGTGTACCAAGTATCCGT
ATTTTGGTTACCTTGTTACTGGACACACTTCCCATGTTAGGGAACGTCTT
CATTCTGTGCGTTCTCATCCTCATGGTCTTCGCTATTATTGGTGTTCAGT
TATGGAATGGTATTTTACGGAACAGGTGCGCTTTAACCATCCCTGATACC
ATGCCAGTGTCGCTGCAAAATACAACtgaaTCTCTGATGAAATATTACAT
CCCTGATGACAGTGATGAATGGGAAATCATTTGCCCCACAAAAGATACCT
CCAGTAATCCGGAACTCCAATGTTTGGGCCGGATACAGGGACTAGAAAGT
ATGGTTTATAGTATGCCCGGCTGTAATACCACCTACGGACCAAAGTCTAA
TTTTACGGAACTCGTAGCGAAGAATTTGACACATTGCATTGATTGGAACA
TGTTTTATTCATCCTGCAAAGACTTTGGGCTGAACCCAAATTTCGATGCC
ATTTCTTTCGACAATTCAGGAGTGGCGTTTATCGCAATTTTCCAGGCGAT
GACACTGGAAGGATGGGTAGACATCATGTATTATTTACAGGATGCTTACT
CTTCATGGGTTTGGATTTATTTCGT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000214:139708..161230+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00015598 ID=TCONS_00015598|Name=TCONS_00015598|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21523bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000214:139708..161230+ (Clytia hemisphaerica)
GGGTACATCAGTGATACATGATTTGAAATGTCTTGATGGTTAAAGGGATA
ACCATGTGagaacacgttttttataaacacatccaaaaatttcgaagcct
tcggatgttcttagcattttgagttttaagcctaaaaatgttcttaacat
gttcttattttcgccatttttttgagtatttttgtccattttcctaataa
ATTAGGTGTTTCAGCGTCcaccaagccttaaaatgttcttaacttgttct
tcaTATTCTGGCTATCAAAGCTGtacgttcttatatagtttgttcataTT
GAAAAAAAGTGTAATCGTCCTCCTGGATAATTCCTGCCATGTGAAAGTCA
TATAGGAGTAATGGGTTTTTCCTGAAACAACTGTGCCCTTCCCCAATGTT
GAGGAGGTCAATTTATATTCTACGAGAGGTTAGGTTCTGAATTGCAGTGG
ATACTAAAGTCCCTCAAAAATAAGTAGAATGTCATAGGAGTGTGCTAAAG
TCCCTCAAAAATAAGTGGAATGTCATTTATTGGCTTGATTTCCAACAAGG
GGTGCATGGTTTTTATTCTGAAACAAAACCTAATCTATATTGAGCCGATG
TGTTAATTTTTTCTGGTTATCTTTTCTAAAAGAGTGTGATTTGGAAtaac
ctttcaatcaaaaccgACACGTTTTCGAAACGTTTGATTATAGTACTgcg
ggtttagaaccagctatCATAATTGTTATGTAACATATTCATTCTTCAAT
CCAACCTTTATGCATACTGTACCATTTTTTATAGGAAACCTCAAGCGCCA
TCCTtaatcacgcatcacggcttaaatttttgccctatcattTATAACGC
CAAAAAAATCTAATAACACCATATCACGCCAACACGTAAACCACTAAGGG
TGGAACCTTTCTATTCATTCAATACGGTTAAGATTTTGAAGGCTTTGCGT
TATAATTTGTGCACCTCAAAATCCTTTGTAACATGTAAATTTATTGCTAT
GTCACATTTCTTTGATGTTTGAGTCTCTTATTATATCCAGTCCATGGTTC
AAGTAAAACTCATTGTATGTTTTTCAAGTTCTATTAAGAAAATTAActta
tccgccattatggaataaCATTCGAATATGTAGAGGCGATcgcttacgca
aatcgaacggttgcttccataatggcgtaAGTTACGTAACATGAAAACCT
CTAGACCTTAACTTATCCTCCAttcattatggaagcaaacgttcgaatct
gtagaggtgatcccttacgcaaatcgaacgtttgcttccataatggcgga
agttaCGTAACATGAATTGAAAAACCTCTATAACTATAAAAGATGTGGAA
ATCAAAAGCCACCTGATGGAAAAGCATGGGTAAAAAAGAAAGGCATAATT
ATTTCTCGAGTCCAATATTTAAGCCGAATGTTAAAAAAGGGGGCATCGGT
TTTGGTCAAAAGAGGAACGCCTTCCGTATTTTGTGAAAATATTGCTTCTA
TGTTTTTGACGACATGGAAACAGGTCATTTatgatttgaaaccattttac
AAGTGTACTTCTTTTGTGTTTGGTGTATTGATTAGCATTCATCACTCTTA
TAAAAACGATTCTAAGATACTTTTGTAAAAGATGACACCCCCTGTCTATT
CAACtggttaaaaacttttgatgCCAGAAATGGTCTAAATTTTATTTGGT
TGGAATTTCGGTTTCAATCGTTTACAGCACCAATCACGTTgggagggggg
gggtactaaaAATTATACCTGGAGATGAGAACTCAGTGAATTTTGCAATC
TGGATGAATGCATTTCAGGGTTTTTTTTCTGACAGAGGCTACTTTTTGGA
TGATTTATTTTGTCAGGGGGAGGCGTGTCATCATCATATGATACCAGTTT
GTGGAAGGCTCTGCTTTACTTTTAACTTCACCTGGTGATTTCAGTCAGTG
GCAGGCCTACATTAAAAAGTTTATAAACTCCTTGCCAagtatttttacaa
tttttaatttttcaagaagtTTTAGATAACATCCTATGATTTTGGTATTT
CATGATTATGAGAAAGTTTGTGACAAAAGAGAAGTTTAttgttcaatttt
tcttttcatatacGAGAGCATCGTCACACAGAGAGCCTTCCAATAGGACT
ACTGTTTCGAAAATTTTAATTACATTCTTGTATTTCCATGTCTTGAAAAT
TAACGTTCAAAGTTCTGTTCATTCTGTAAGGTCTTTTAAACGTTCAATCA
ACGTTTGGCTCTGTGGTGTCGTGTCGAATGGACGTCGTGGGGCCGCGTTG
ATCATTCAGATTCGTCATTTTGTGCTATGATATCCTTTTGTGAGATGTGG
GGGGCTCCTTCTCATCGTATGTGTCCTGACGCTTTTCGCGAAAAAATGTA
TTATCttctcaaattttgttttgcgattaaaatcattttggaatttcttt
taTAGTACGTGTGTTGCAAGATATATTGAATCGTTTTCATCATATTTTTG
TTTgatgtataaatttttttttggaatttggatttttttgtggAGGTTTT
TTCCTGATGCTCCGGTGTTTAAAGTTTGTGTTTTTAGAGTTTCGTAATCA
TACTCCAAAGTCTCCGGGAAGGGTGCTCAAGCGTTGGGCATTTATAAACC
ATTAAGGATGGTTCTTAATGGACCAAAGATTTGCTTAATGCTCAGCAAAT
GAGATAAAGGGTGGTTATTAAGGATGGGTGGGTGTCCCTCCTCTTTCTTg
gggtagacagctatcgaaaatgaaattcaaactttttgtacacgcctttt
tttataagaacacgaggctgaagattggtcaaaacctaagaacaatttaa
gaacaatcttaAGCCTCAGATTTCTGAAATCACTTAGAAATACTTTGAAA
GTACTGATTTAAGcagattttaaacccattttaaGCTTTTAAGTAAACCA
AACGAATTAAGAATATTGTAAGAACATTTCGTCTTCTACATGACttaagg
ttcaatctcaaaataagtgtcttggaaaattgaaaatcttgcAATTCTGT
TTTGCCTTTGAGATTGACCTTTTTATGAAAACATGAAAGAAGGCAATCTC
AAACTCAAAAAtgaccaccacagtaaaactttaaattttgtaaggtacta
attttgagatttaacctttagtcatgtgaacGACGATATAaacctgaaaa
tttaaaaaatttaagaacagcccagcctaagGTCAAATATATCGGTTCTT
GGGTGTTGTCTTCCCTCTTGTTAGTGATCCCTTGCAGTGATTGGTTGAcc
agctggcacgcaacgtttatctaatgttcacaacgtccatataacgttag
atgaacgttgaaacaacgttgtgtgcaagcTGGGTGACAATGATGCAATT
TTTGTTTGTGTTATTATTTTGTTGCTTGTTAAAGTGTTTGTTTATTTCAA
TAACAACAACACTGAAAAGCCTAATTTTTGGTTTGAAtactgttttttgt
tttgttggtatTTTGTGCTAAATATGTCATCTATGATTTCGTTGAAAGTG
GAAATTTATATTTGGCTGTGAGAAGAAAACTCCACGATCAAATTTTATTC
AAGTTTTTTGAAGTTCGTCTTCCCTTGTAAGTCTTCAGTGCAGTTCACTT
GCACTTAAGAAGTTAACTAGAAGAACCAACAATTTCTCACAAAAAATACT
TACTAGCAGGCGCGATAGATACTCGTGTTATTGTTAATCAGATAATATCG
GATTAGATTAGATTGGATCGGATTAGTTCGGATTTTTTCGGGTATTAGGT
CAACAATGATAAGTTTTCTGAAACAGACTCGTGGATATAGAGCATTCCAA
TGGTTGTAAAGACATTGTAATCATTTATAATTAGACCCCTTGCATATCTG
CTGACGTGTGCAGAATTCTCCGATGACTTTAGATGTGGCAGAAAGTCTGT
AAGCTCAAGGATAAAAAGAATAGAGTTGAAATTCGCTAGGGATAAGAAGG
ACATTTTTGtaactcaaaaataaaaatgttgaagCTTGGTTATTTCATCA
TCCAATGTTATACTTTCCTTATTACGAGTTTTAGTATTTCGGAACCCGTT
TCTTCCGGGAGAAAATCCTTccattttacttttactttacaAACCGGAAT
TTGTTTTTGCTCATGATTTCGTCAAAAGCTTTCATAACTTGTAAAGATTT
TAGCTTTATTTAACAACCTTTTGAAGTGGGCGTAAAGAGAGACTGTCATT
TTTCGCATATCAAGCTATTTCAGCTATTTCTATTTGACGTTTCTAAACAT
ACGACtatgtttttagatttatgATAAATTCTCGCAGACATATTTTACAA
GGAAAATTATTTGATATTACAATGTCACCTTgaaatttcacattttgaac
TAACACCCTTTAGAAGAAATTGACAGCCTCCTAAAATTTCCGAAAATACC
AGCCGCCTACCAATTTAGAAAAAAGGTTTAAATGTACTTCTCTCTGCCTT
CTTTCTACAAGCAGAGGGTCAGGTGTTATGAATTTAATTGCTAATATATT
CATATCGGAAGATATCGCAGATAAACCCTTTAAAACTTACGGAAACCGGC
AGAAAGTAACATAACAAATGAAGGTTAAAACGGAACGAGATCATCCTCCG
GCTACCGTTTAGATTTCCTTCCGATTTACtcgaagaaaacttttttgtgt
tttataatattttgttaatgttaaaaaattgtttgaattaTGAATTGACT
GTCTAAACTCATCGAGAACTCTGCATCTATTTCTTTTAACTTcttaacac
ccccttctcatagacccactggTACCCCTTCCCACtcgaaaaattggcca
aaatatcgtccccagtggaaaaatttcatataatttaaacaaatttttgt
cctcgctgaaaataatcagatttAAGCAaatcctcgctgcaaaatatttt
actattttttcaatccccattgaattttctggctcgaaaacaatggaatt
caaatccccagtcatTAACAACAGGAATACCTATGCCCATCAACtattgg
ctgaaaaaatcttactGGGTGATGAGAAGGGGTGTCTCTGAGAACGATCC
ACCTGTATTTTTCTTTAATACATACCTTATCACAAAGAGCAATGGCCGAG
TTGTCACAGGCGTCAGGCTCTCAAACTAGGGATACGCGGTTCGAATCCCG
GCTAGCCGTGGACCCCataaaaacaatcgaaagactgtctaaaagtccta
gattactgggctatccacgtaaaatatcgactctctATCTATACCTTTAT
CTCGTGACGGCCCTGCACTCTTGTTAATCCGAATTGCTCGTCACTcagat
tttttttggtttttactttttctctttttcataCATGACAAGGATCAAGG
TGATGATGGCATTAACGACAGTCTTAAGTAcagacaaaaaattattttat
atatCCTTTTGTCTTTATGAATTTTTACTGCCATTCGTCTTTTATTaagc
ctccaaatacatttgTCTCGACTTGTGtgaaaaaatgctattttttgatg
cTTCGATTTAGTTTATCAGTTTAATTTCATTAATTATAGTTATTTGATAC
GTAAGAAGAGAGGTGGTCTCGTAAGCGCGTATTAGCGTGATCGTAATTTT
TTTGGTTGCGGAAGCGCATGATTGAAAAAAATGNAAGAGAAGTGGTCTCG
TAAGTGCGTATTAGCGTGATCGTAATTTTTTTGGTTGCGAGATTATGTCA
TTCAAGCGCAGAAGCGCatgattgaaaaaagttatgGCTGTGTCAAGGTT
AGATTAGACTGACGGGATTATTGGCTTAATTGCGATCATTGATTAGCAct
tataaaaatcaatttttagtttttacttTATGAGTTTTTACTTTAAGTTG
GATAGTGAGCTACCCGAAGAATGTTGGGGGCGGAGCGCCATTCACTCCCT
TCGACTCCTTGCCGAATTTATGTTCTACGTAATTTGGGGAATCAAGGCAG
AGTTAATTATCAACCTGACTAAATATTCATCAATCGATTATTAAAAGGAC
TAGGACCCAAACCATGTCAAGGAGGCTTGAATTCTCGGTTAAGGAGGGTT
ATAACTTTGCGCTGAACTTGTTAGTGATGGATTATTTGAGATGTTGATTT
TTAGGGAACTTTAATCAATCATTTCAGCCTCTCTTAGTTCATCATCGTTC
AAAGCCGTTTCTTGGTTTATTTTGGGGTTAATATCTCGTGTTGTTAGAAG
TCAAGAAGGTACCCTAGTACCCAGTAAGTAACCCAGGGATCACAGTACTC
AGTAAAGGCCGgtatccactttcgcgcgacacgGGCGAAATGGGTgaaag
ttttacttttttccATCCGTAACGTCAATtgcgaccaatggaattgcttc
atttttcaaccgaccaatgaccttacaaaagcgtcaaaaagttttcgctc
atgtcgtgcgaaagtggagaccggccttaagtaaCCCAGAGATCATAGTA
CACAGTAAGTAACCCAGGGACCCTAGTACCCAGTAAGTAACCCAGGGACC
CTAGTACCCAGTAAGTAACCCAGGGACCCTAGTACCCAGTAAGTAACCCA
CTCCCTGGCATAAGTAACATCATACATGGAGATATCAACCATGATGATTC
AGCAGGAATAAGTATAAAGTTGAGAAACGAATTTCAACTTAtgtattatt
ttttcgtttggACATTCATATAAGATATCATCATAAGCTTGCCCGTGATC
TCTGATTAAGCGACTTAAAGTCTTTTTGTCTCGAATTATACTTCTGCTAt
caaggaaaaaaaagagcTCATTTCAATGTTTAGTTGTAAGAACTTTCTAC
TGTTTTAAGTATTGCGTTTGATTTTGGTTAGTGCAGTGGCaatagtttgg
ttttcaaatgatatcttGAAAAAAGCTATCGCTGGTTCAATCTGACCGAT
AAAATTTGTTTTCCTTATCTGTTTGatttctgtctgtgtgtcagTTTGTT
ATATAATTTCGTGTAATCTTGGCACTGCAAATTGCCATTCAATTTAATCC
GAGAATAATTTCCAGCGATCTAAGAAGgcttttttttctccatttttcca
gggggtaaaatattAATTTTAGGTCGTCCACCCGCACTTTAAcctaatga
aaaaaaagtttccaaggttttttgtttcaaatttaacCATTTTTCAGGGG
TTATCCGCACATTTCCAGCGATTTTTTTAGACTTATATGGATATGTAAGC
AACTTGATCAGTATTTCAGTTaataaatttaatgaaaaatatgtttcaaa
aaatatacaatacaaTAAATTTTGACAGTTTGTAAGATGTggaatttaag
aacattcttcgATGTTCTTATAACTAACTCAATGACGTAATGTATTATTT
TCTTATAACAGATACACACAAggaacaaaaagaacaaaagaaagaaagaa
aaaaaagaaagcgtTGACCTAAAACTACACTTTTATGAATGAGCAAGCTT
CAATGAAAAACAGAATGCAGGATACACAGCAAACCACAGGTCAGTTCGTC
TCTCACACTTTTTCCGCTTTCTTTCCGCTTTCTTGGGTGTCCGGATCAGT
TGTCCTTTTGGTACATCCATGCTACTTCTCACTCCATTCAATGTGTTTAA
AATAGATCAtaaaattcaacctttttgctaacaacccagctggcacaata
CGTTTTTCCAACGTTTATCtaattcacaacgtccatataacgttagataa
acgttgaaacaacgctgtgtgccagctgggaaataaagtaaaatcaattt
tgtcacTTGTTGAGCGACGATGAAGTTTTTCATAAATTGTCTGCCGAGAA
TTCTACAGCATTTTTATGCTAAGCACCTCCGTGACTATTTTGAAAGTTGC
CATGAAAATGGTTATCCAATAATATTCTTTAGTTCTTGGTGATCTGTTCT
CCATTTCTTCATCCGTGTGGTTTatgttatgttttgtttttttggagaTG
AAATATATGACAATGGTTTGTACCAGACCAGATATCCATGGAAATTTTTC
TAAGTATCGCCCTGGTATAAGCAATAAACGTGAGAATCTTTTGAATTGAg
gatttcaaattaattttctttcattttcacagAACTTCTCAGTATACCGA
CAACCGATTTCCATCGCCGCTTATCACAAGACAAACCCGTCATAACACCG
ACAACACAACAATACCATTGTCATGAAAACAACGTTGTGACACCGACATT
TACGTCACCCGGTTGTACGTGTCGCAAGTTGTTAAGTCGTCAACCTCACA
TCCAACGACATTGTGGGTGCAAAGAACAGAAAAACACGAATAAAACTCCA
TCGTATCTTGATACTTCAGACTATATACAATACTGTAATAATTTGACACC
GGCTGGAAAAACCTACCCTCAATTATGTTTAGAACCACATTTTAACAACA
ACAGTCGCAAAAATAGTGCTCAATCTGCCATTATGCTTACAGACGGCACC
GAACCTAAAGTTTTGGAACTAAATAATAACCATGATAATTTAACAGAACA
AAATGGCGGCCATGAAAGACACAATGGTAGTCATAGTGATATCCAAGTGG
ATGAGATTGATTTAGAAGAGACTTATTACCCTGAGAAAGTGTTTTGGTGT
TTGGAACGTAAGTCCAGATTCAGACATTGGGCCATTCGCATGACGCTATC
ACcgtatctttttctttttgttattgtgGAGATAATTATGCCATTATGGA
GGTAATGAAGCTAAAGTGTTTTATTAACCAGTAGACAGTGATGAAAAGAG
CAAATCAAAAATGTCCGCTTTTTACACAAGGTATGTATGTATTCTGAGTT
TTAACTTGCGCGGTATTTGGCAACACTTTTGAATGCTAAAGTCTTGATTC
TTTTTCAGATGTTCTATTTTCGGACACTTAAAATGTCCGACAAGTTTTAT
GTAAAGTTGCTTATCATTTCTAGCTCGTCATATTCGTCGATACAGTTTgg
aatttcatcaaattttgctCAACCTATGTTCGATTAATCGGGGAATCATA
AATGTTTCTTTACAGACAAGGTCAAGATAAGTAGCGAATGTTTGAGGGAT
TTTTGTTGGTCCGCTTTATTGGCACCAAAAAGCGTCCTCAATGGCTTTAC
AGGGTCGTTTCAGTTCTCTCATTTGCCATGAATAAGACTTAATGTTAATA
AGTTAATTTAACATCTAAAGTGTGGACGGCTCAACACGACTTCAAAAGAA
GCGCTTAAAGCCCAACAAAAGATTAAAGAAAAAGCGCCATACTAAGTTTA
TATTTGGAGTCCTCTTTGTTCTGTCTTGAGACGTTGAGCGGTCTTATGAT
CAATGGTGTGAAGTTCTAAATACTGATTAAGCTTCATGATAGACAGGAGG
CCAGTCTCTTTTTGATATATCTTTCCGGCATTTTGACTCGTAACAAACCA
ACAAGCAGGAATTTCTCTACTCATATTCACACACACTTGCATACACACAA
GAGAGAATATTTTCTTTGAGACGCTTTATTATATCATGAACAAGTCGTGA
AGAAGCTTATGGAATCATTTCTTGTGACAACTTACAAAAGTATATTTTGA
GATAAAACTTCTTTGACTCAAGCATTCTTGGTAACATGTCATTAAACGCT
CTCTTAAACCGATTTCTTTATCATACAAGGAATGACACTTCTATTCAAAA
AAGCTAAGAATCAATGATTTCTTCGCATATTTTGATCtttaaatgggggg
gggggctatcccagaaatagtctgtagcCCCTATATTGAGGAGGTATCCA
GGGtggtctaaaaaataaaaaatccaggggggtctggacgaggtcgaaaa
tccagggtggtccaaaaaaatgagaaacaaatcCAAAAGGGTCCTGaaaa
gttggaaaaaaatccaggggatcatcttttttaaaaaaaagacctcctca
acattgggggtacaaattttttctggaatagcccaatattCGTTGTCATT
ACTGCTTAGGTACCCCAGTCTCAAAAAAATATCCGAAGTATATTTCCAAG
ATCGTTCCGTAGTTTTGATCCACTTTACAGGTACATcagaacctctataa
ctcgaatgtcttcttaacttgaacaatttttatagtcccttcagttaaca
atgccttagaaaccttactctataactcgaataaatttgtgCCCTCCAAG
ACTGGAGACTTCTATATATAAATCGTAGCAGGTTGAGTCTGAAGACCTTA
AGAATAGAGTTCAGTCATACATGATGATAGGAACATTTTTTGACGTTCCA
ATGAACAAGAAAGTTCTGCTGCCCCAGCTGGtgcacaacattgtttcaac
gtttatctaatgttcacaacgttcaCATAACGTTGCCACATAAccttaaa
tgaacgttgaaacaacgttgtgtgtcagctagGAACGTCAGTTCGTTCTA
TTCTGTTAGCCCATGCTAATTTACGATCATTTGGACCTTTTTCTACAATT
TCCTGCAATTCTCAAAGtggtcccagctggcacacaacgttgtttcaaca
tccacctaacgttatatggacgttgtgaacgttagataaacgttgaaaga
acgttttgtgccagctgggggtAATAATATTCAAGTGTTCTTATACAGTT
CTTATTTTGTATATGGTTTGAATTTGAAAACCTCAAAGGAGACAGCGAAA
ACATAAACAGAAAACTCAGACCATGATATGGTACTTGTAACCTTACCAAA
CATTCAAATTATGCATATTGTAAAATCGTAGCAATGTTTACATATCTTTA
TTGTAGTAACCCCGGAAAGCCGAACTCTATGGCCCggaaaaagaaaatac
aacGTTTACTATGTAAGCATTCCACGAATCAAAACAATTGACCGTTAAAG
CGGAAAATACCTTTACCTACATAACATGGTCACTTTTTGTGATATTATAA
ACTGCTATTAAGATATTACACAAAGCATGACATAATCACGTTATATATAC
AGttgattctctctaattcgatctttaaagGAACAAACATTTTCTTCCAA
TTAGAGaaatgttcgaattacagagagcaatttaaaccactttccagttg
aggggaccaatattttagtccgaataatagaagttcgaattagagagaat
taACTGTACCATAATAGCGTGTTTAGCTTGAAAGCTTACAAAATATCTGC
ACGCTTTTTTAAACAATCGGTAGATTCTCACTATTTTCAGTTCTTTGTAC
AAAAAGAGTCTAGGCTCGACTTATTCCTAGGGCTTTCATCTGATTATTAT
TTGATTTTACAAGATGTTAGCTTCCTTTACTCTTTCCATAAGACTTTACT
TCATAGagaattttagctcattttagCTTTCTGTCCTTCCACTTTCATTA
CCGAATTTTATGAATCGAGCACTTTTACCGTTATTGATTTTTGCGGGTCA
GAaagtgcgggttattccaaatcagTCACTCTACCCTCGCTATTATCGTT
CGACTCAAAACATACAGAGATGCTTAACTTAACATTAAAATTTTTAGCTT
TATTGCTCAAAAGTAAGCCATCACTCCAGATCAGGAAGATTGTGGAAAAT
AGTTTATAACTGGAAAATAAACAAACAGCGATAAGTCGTGATAaagattc
gagttatagaggttcgatcCCTGAAACTTAAAAGATGTCGGTGCATGACG
CACTCGGATTTTTTCCTCGTAATGaagattatttttcaatattacACGAC
GAATTGAAATGGTGTGATTATGTGTATGTGACCTTTAACgtgagaaaaca
ttttttttttcgatgNACGACGAATTGAAATGGTGTGATTATGTGTATGT
GACCTTTAACgtgagaaaacattttttttcgatgGGCGTGACTAGCGGAG
ATAATCAGTGTCTGAGTATAGGTAATTGTCATCAGGCTTTTCTGGAATGA
TTATGATATATAAATAACAAGAGTGAGCGATGAAGAATGACTAGCTTCTT
GTCTAAAGTGATATAAATACGACTCTTAATTATGTGTATTTTGATTGATT
ACTTTGTTTAGTTatatccactgacctttatatatccctggaccaagcta
tatccaccatctttgatcgaagtttttttgaattggtacccgtaaagaag
ccattgcagtgttaaaaattaacctcttacggcgctacatcatcaaaggT
CTTCGAGGGAAAGCAtatcgatgcatttacaccgctattgagtagtgccg
ccattagggtaccacttttcaataAACTCCGATCAATTTTTTCGGGTCAA
ATATTTCTGGGGCGTTCCTGCCGCCACCCACATAACGCCAGACGAAGAAA
GACAATTTCTTATTAATAAGGTTATTCATGTGTAGCAAAGGTTTCGTTAT
GGTGTGATTTTTATGCGAAAAAATCTTCTTTCCTTTCTGATATTGATTGA
TGAATAAGCTGACAATTGAAAATTCCATTCCATTTTAATGGAATGTTTTG
AAAGGTTTTTTTCTTGGTTGATTGACATTAATCCCATCAATGATCATTTT
TAAGGAtgttattttgaccattttatcGTATCGTTATTGTATGCAATGAT
ATTCTATGATTGATAACAACGAATTATAAGCCCGAACTGCTAGAAGCGAA
TTCCTATTCTCACATCTTTTATTTTGAGTGTTTTTGAGAGAAATCCCCTT
ACTTTCTGTGAGGGCATTTCTCCTCTCTGTCCCAGAGTTTTTGAATTACT
TCGTTAGTTAGTTTTAACGTTGACGTTATGTAAACAAATATCTCTAAGAC
AGGGTGTTTTCTATACATGTTTGAAATCATTTAGCTAATTGTTTTCTCAA
TTAACTTTTAATGACGCCACCCGGAATGAAATTTCTTAGTAGATTGAATC
AGTTGAAatcgatcaatcaatcaatcaatcaatcaatcaatcaatcaatc
aattaatcaatcaatcaatcaatcaatcaatcaatcaattaaaaGAGATC
CTACAGGTGTTTTAAATTTCAGGTATTTTCGGTAAAATCGGAAAAAAATT
GTGGTTgtgaattgaaatgaaattttaaaattttgttttaaatcatTATT
AATGACAAACTTTGACCCAATAATTCATAAAACATTCTTAAGCAATTTCT
TGGCCGACTTTTTGCTGATCTGTATAGCAGGTTGCTTTAGCCCGTGGCAA
CTCATGACTTTTTTGATGGACTGGATGGCGCTGGTAAGTGATACTGCATT
AGAACCCGTGCCATCAAAAAAGCAAACTTAGTCTAAAATTGCTCCAACAG
ACAGATAGACAGCCAGACGTACAGACAGCGAAATTTAATAGAAAGTAAAT
TTTCGCTGCGCAAAGACATTCAACAAATATTCCTTAATAAGACTTATAAC
CATGAATCCATCAACAGATATTTCGAACGGATAACCATATTTGTAATCTT
AATGAACTGTGTAACACTGGGCTTGTACGATCCGTATGACGAAGATTGCA
AAACTCAACGATGTCAAATCTTGGAAGGATTCGAAACGTTCATTTATGCA
TATTTCGTCGCTGAGATGGTTATCAAAATTATAGCCTCAGGTTTGCTTGG
GAAACAAGGCTATTTGTCGGAAGGCTGGAACAGGCTAGATTGTTTCATCG
TGGTCGCAGGGTAGgttcacagatatcttatataaaacactagatagagc
ttttcTTCTCCCATTTGAAAGAGAATAATTCGCCATCTTGAAATAAAGTA
GCTCAATCTAGCGTTTTATTTAAGATATCTGTTGGTTGCGGGTTacgtca
ttttcattttaaagtgagtgaaatcaaaaactttaaagCTGAAGAGTGCA
TGTTCTTCAAGCTTCTTTTCATCGAAATAATCAATCAACTTTTGCGAAAA
CGGGGTTGTGACTGCAAAAAGCCACTTCCTCGATTTTTTTAAGAGACTGT
TTATTGCAGAGATCTTTCCATAACTAAGTTTAGCTAGACTTTTACATACA
CAACATTTATTGCCAGTTTATCTTTGTCGCAAAGAAAATACTTTCTATAG
ATGATTTTGCGTTTATGGGGGGGGGCTATACTCGTTTCCTTTTTGTATGT
ATAATTTCTTAAATCGTAAACattttcgcgtttttttttcagaacatTCG
AGCTGATTTATGGCGATGGTGAATTTTTAAGTTCAGTAAGAGCTGTCCGT
GTGTTAAGGCCCTTACGTGCTATCAATCGTGTACCAAGTAAGTCActatt
tacatttttaaagaaaagaaaggtaTCAAGGAAATAAATAACATTAAACT
CCGCTAAAAATTGGTGACAATCTGCGTCTCAAATTGCAGACATTTTCTTA
CCCTATATATAAAGATTTCGATTTGTTTCAAAATGGTATCCGAAGTTGTG
GATATTCTGTCTTAACAAAATTCATATTTTATGGTTTTTTGTTATTCTTA
TCATCTCAAAGTGAGGAGCCAACAATgtctgattttattttttttgtaat
atatttcgcccattgagtttaaagaaGCCTGAGCTAGAGGAGAATCTCTT
GCCATCGGAAATGAAGCCACGCATAACCCGGTCAGTTTTTATAGAAACgc
tagattgaaagtaaaatccatcgCAAGATTTCGAAGAAGTGTCAATGCGT
CCTTATATATAAATTCAGCGCAAATCCTAAGGTTTTACTTTTTCGTGTTT
GGGAGAGGTTGAAGATTCCGCTCTCGTCATTTTGGGATTTTTGACTCAAT
AGTTTTGGCTACTTGTAAATCgaaacgaaataaaaaaaagatcaaaattt
agaattccAGTTGTAAACTTACTATACGCTCACTTCTAGCGAGGTATATA
CCTATTCTTTCCATCTCGTATCTAGGTATCCGTATTTTGGTTACCTTGTT
ACTGGACACACTTCCCATGTTAGGGAACGTCTTCATTCTGTGCGTTCTCA
TCCTCATGGTCTTCGCTATTATTGGTGTTCAGTTATGGAATGGTATTTTA
CGGAACAGGTGCGCTTTAACCATCCCTGATACCATGCCAGTGTCGCTGCA
AAATACAACGTAAGTCACTTTTTCGTTTCCGTTATTAGGACTGCTTtaca
aaaaatgtacaaagtTCTTTCGTCTCAAAAGGATTTTCACCTCAGTGAAG
TGTGTAAAGAGGCTATCTCGCGTCTCAAAATTCAACTAAATTTGAAGAAT
CTTTCCTAATTTTATTATCctattactttattatttgttgTCTGTCGTTC
GATTCCCACTGTGATACTACGGTTCACTTGGCTAATGAACACACCTTCAC
CCgagtcaacccataccatgtgaggggagttgggtaccactactctgata
caagagtgtgggtgataTGCTTGGCATTGTGANCTATCATGACCGCCATC
TTTCTTAATACCGTCACCATGGCAATGGAACATTACAGACAGGTAGGTTC
AGTCCCTTTATTTACAAAATTCGGCACCGCCTTGTAGAAGGAAACGACGT
CTTTGTGTGAGTAGAAGAGATTCTCATGGTATCATTTTAGATTTCATCGT
TTTGACGGATATTCTGTTGNAGAGTGTGGGTGATATGCTTGGCATTGTGA
TGTGTGGTGTCACTCATCCCGTTCCGCGCACAGAACCAGCGGTGTCTGGA
CAGCGCTAAGCGTTCCAAATCGAAAGAGAAGGAATTCCTACTTAGcaagg
agtaggacccattcctCAGTGGGGAGGGTTCATATCATCATGAGATACAA
AAAAACTTTAGCCACACCAACTTTGTCGGCCGGTTTTTTATGATTTCTAC
CCAAATTCAGGCCTAAGATCTCTTGCCAACTCCATTCTCCATAGAAGTTC
ACGCCCTAACTTTGTCACAATGTATTATTAAAGTGCGTATGATAGACTGA
AAATTTGAGGTAGAATTGATAATTTTCGATTTCAGAAACGAGAGACAGAA
TCTTGGTCCAAATTAACCTTTCTGTAATGTTCACTTCAGTTTTTCTTTAG
CCTAAccaacttttcaaacaatcaaaaattgGTTTAAGATCACTTAGCGG
CAGAATATTGACCATAGCCTTGTAGCAAATCCCCTTCCAAAGGGTTTTTG
AAGGTTATTTTAAGATTCAAGGTGAAATATGGGCACTATGTTAGTCTTAA
GTCCTAGACAGGATATCGATTCTTTTAGCGTTCTTTTGGTTTACATTCAA
TTTCCTTtgaccgtttttttttttgccttcgACCCAATGAGAAATATCAA
TTCCGACCTAGTTAGTGGTTGAAAGGTTTGTTTAGTATCCAGAGAAGATA
TCGCATCTAACCTACAGTTTTGGTCGAAATATATTTGGAATTTTGGCTTA
TTCCTTGTTTTCAGAAATTTgaagttcgggcgaaaaagtcgcttttgggc
aaattgataaatttactcgaatatttcaattcgggaggggtttatagact
tccaggctatattctgagccttattaaACCATTCTTGGAATTTTAGTTCC
TCAAATCCTAAGGCCCTAAGCctcttaagtctagtgttaaaactcccATC
CAATCTAATATAGAGCGCTTCccaatcgtttgtggttgtaagatttcgtg
agaattttccttttttctcaaatattttgactttgGTTGTAGTTGCCTAT
tccatcttttctttttcagtgaaTCTCTGATGAAATATTACATCCCTGAT
GACAGTGATGAATGGGAAATCATTTGCCCCACAAAAGATACCTCCAGTAA
TCCGGAACTCCAATGTTTGGGCCGGATACAGGGACTAGAAAGTATGGTTT
ATAGTATGCCCGGCTGTAATACCACCTACGGACCAAAGTCTAATTTTACG
GAACTCGTAGCGAAGAATTTGACACATTGCATTGATTGGAACATGTTTTA
TTCATCCTGCAAAGACTTTGGGCTGAACCCAAATTTCGATGCCATTTCTT
TCGACAATTCAGGAGTGGCGTTTATCGCAATTTTCCAGGTGAGTGGAGTT
TTCAGCTTGTTCACAatacgttgttttaacgttcatctaacattataCAG
ACCTTCAAAGTAAACGTTAATGTCTGCCCAGAGGGTATACTTTCTTTTCG
AATTATTGAATTAGGGCGTTTATTAAAGGGGGCGTTGATTCGGAGGGGCG
TCAATGTTTCAAGAAAACTTCTTGCCGAAGTCACTTTTATAATGTGAATG
GGAAGTCTTTTTACTTAAGTGAAACTCATTTTTGTATCGAGTAGTACTAT
TTTTATCTATAATCAAAGACAGCTCTCATAGCTTATAGTGTCCGGTTTTA
AATTCATGATATGCACCACTGCAATGACTTCACAAAACTATACAACTTTT
CTGGGTTTTTTTTTCCACCCAATACGTCATTTTTTCTATTGTTTAAGTGA
CGTATTGGGTGGAAAATTATAAAAGTTTTCAGAAAACTCTCCAGTGGTGC
ATATCATGAATCTCTCTTTGTCTTTGTGAACAGGCGATGACACTGGAAGG
ATGGGTAGACATCATGTATTATTTACAGGATGCTTACTCTTCATGGGTTT
GGATTTATTTCGTTGCTTTGATTGTGGTAAGTTCAACTTTGTctccgtgt
attccaggctttatttaagTTACTgatgatggacgccagagaatattaac
TTCTCAACCTCGTCCCTGTGTATTCCatgctttatttacgttactgagaA
TCTTTTTTGGAATCATCAAGTAAGCATCAAACCCTATATTACGAAAGGAA
CGAGGTTGGTAACCTCTTTTCCCCGCATAGCTATAGTTCCTATTTCCTAA
TTAATCTCATAGCTTAGTTCCGAACTTCTTGATTACTCGCATAGCTTAGT
TCCTACTTCTTTTGTTCTTCTCATACTCACGACTTGGTTTCTTCCTTCTT
TTTTCATATAGCTTGGTTCCTACTTCTTGACAAACCTATGTCTTGTTGTG
GTAGCCACACAATTTTCGGAGACGCGTCAACGGGAGTCCGCCCTTATGGA
AGAAGCAAGAAGGAAAGCACGTTCGACAAGTAGTACAATATTCACGTCAA
CGGATACGGAAAGTAACAAGGGCTGCTATAACCAATTACTCAGCATCATG
AAACACTACATCCAAAGTGGGTGCCGTAATTTAAAAGCGAAAATATTTGG
TGAGAAAAGTCAACAGATTTCCAAACGGAAAAAGAAGGGCCGTCATCACT
TGTTGCAGAAGAATGGAGGAGGGAGTGGTCGTAGTAAACAGCCTCATTCT
CACGCCAATGGTGTTGGAGGAGGAGGCAATGttcattatcatcatcatca
tcaccatcatATTCATCATCACCATTTGCATCTATGTAACAGCAACTCCG
CTGCCACCCAACCCAGGGGTGGAGGCCTGACACAACCCAATGGTGATGTG
ATGAATATTGATGGAGATGAAGAGAGGTACTGTCCACCAAACGCATTGAC
CGGTGCTCTTGATGCTTCTACCTCACCCAACTCGAAAGCATTGACTAAGA
CAGTTGGTGCCCCTCTACCATCCACCGGCAGCCAGCAACCGGCAGTACTC
TCTAGGACGACGATAAGACCAACACCTCCTTCCATCATCATAGACGAAGT
ACCGACATGCGATCATCAGTCTGCAGCCCTTATCATCCCTGAAACAGCAG
TTGTGATCTGTCACTCTAGCTCCCTCCCTGGTGCCCTCCAGTCTCAGTCC
CCTTTGACGGCAGTCTCATGGTTCCCTTCCTTCAACAAGTTGCACCGCTC
CTCAACGGCGGCCGCCAGTGAAAATGAATTTGACACGGAGAGTTGGCCAT
GTCGTGGTTACCGATCAGTCGGCGATCCTGCGTGTTGTCCGGACCTAAAC
AAAGAGGCTTATGAACAAGGTATgttattaaatcttttttatcaaaactt
ttacaTTATTCTATAATTTAAGCTAAAATATTACTCTCCTCAGCTTAGAA
AGTGGAATAAAATCTCTGTATGGTTCAAATATTTGTTtaatctaaagaaa
aattgtaatacaccatattttttataagaacaattaggctcgaaattgac
aaaaaataagaacaaattaagaacaattctcGGACTCGAGAATAGCTGaa
gttttagaaaatcaagagGTTAACTctcaaaaaaagaatgaaattataaa
aatcttgaaatttacCTTTaagttaaaaatagaatgagaaCAGTAAGAAT
AGCTGAGTCTCTGCAAAGGTTTActggttcttacaaaaaaaacatattat
aATATTATTCTCGACTAGGAGTGTATGAGGATTGTGACCATGACAGCGAT
TACACGGATGACGATTCTGATGACGAATATGATGATCAAACACCATCCAA
GAAAAGTCCACGGAAAACTTGGATCAATCAGAAACAGAAACTCATTGTTC
AATTCTGTGAATCGGATTGTTTTAAAGTATCTATCATGACCGCCATCTTT
CTTAATACCGTCACCATGGCAATGGAACATTACAGACAGGTAGGTTCAGT
CCCTTTATTTACAAAATTCGGCACCGCCTTGTAGAAGGAAACGACGTCTT
TGTGTGAGTAGAAGAGATTCTCATGGTATCATTTTAGATTTCATCGTTTT
GACGGATATTCTgttgaaagaaagtttttgttttgtaaATCCGATTTTCC
cggtttttcttttcttacatccccgatttgataaaatcttgataaaaatt
atgtcattattttttatgaaacaaaaatccGATTTTACCTGTTCTGTATT
TCCCTGATTTTTCAGCCTTCATCAATGACGATGGCGTTGGAGATTTTCAA
CACGATTTTTACAACCGTCTTCCTGATCGAATTCGTGCTCAAATTCACAG
GCTACGGTTTCTATGGTTACATAAAAAACGCGTTTAATGTATTCGACGGC
ATTGTTGTCATCATATCAATCATCGAATTAGCCGGTAGCCGAGCGGGTGG
CGTTTCCGTATTACGGACATTTCGTTTGATGCGGATATTCAAGTTGATCC
GGTTTTTGCCGACTCTTCAGAAGCAAATCCAAGTGATGTTGGAAACATTG
GATAGTGTCATGACCTTTTTAGGTCTTTTGACAATCTTTATCTTTACTTC
ATCAATTTTGGGTATGCATCTGTTCGGTGGTAAAATGAAAGTGGACGGTG
TTGTTGTTCGCCATAATTTTGATGACCTGCTCTGGTCCCTCATTACTGTA
TTTCAAGTAaggctttttttctttttagctctGGCTTAGACAGCTGACTT
TCATTATTTCCAACAAAAGACCAATGTTTAGCAATATAATTGCGATGGTT
CATAGCTCTACACTTTAGACATTTAACTTTCCTTATTTTCNaaagtcgct
tttgggcaaattgataaatttactcgaatatttcaattcgggaggggttt
atagacttccaggctatattctgagccttattagACCATTCTTGGAATTT
TAGTTCCTCAAATCATAAGGTCCTAAGCCTCTTAAGCCTAGCGTGAAAAC
TCATCCCATCCAATCTAATATAGAGCGCTTCCCAATCGTTTGtagttgta
agatttcgtgagaatttcccttttttctcaaatattatgactttggtTTT
AGTTGCCTTTtccatcttttctttttcagtcaATCTCTGATGAAATATTA
CATCCCTGATGACAGTGATGAATGGGAAATCATTTGCCCCACAAAAGATA
CCTCCAGTAATCCGGAACTCCAATGTTTGGGCCGGATACAGGGACTAGAA
AGTATGGTTTATAGTATGCCCGGCTGTAATACCACCTACGGACCAAAGTC
TAATTTTACGGAACTCGTAGCGAAGAATTTGACACATTGCATTGATTGGA
ACATGTTTTATTCATCCTGCAAAGACTTTGGGCTGAACCCAAATTTCGAT
GCCATTTCTTTCGACAATTCAGGAGTGGCGTTTATCGCAATTTTCCAGGT
GAGTGGAGTTTTCAGCTTGTTCACAatacgttgttttaacgttcatctaa
cattataCAGACCTTCAAAGTAAACGTTAATGTCTGCCCAGAGGGTATAC
TTTCTTTTCGAATTATTGAATTAGGGCGTTTATTAAAGGGGGCGTTGATT
CGGAGGGGCGTCAATGTTTCAAGAAAACTTCTTGCCGAAGTCACTTTTAT
AATGTGAATGGGAAGTCTTTTTACTTAAGTGAAACTCATTTTTGTATCGA
GTAGTACTATTTTTATCTATAATCAAAGACAGCTCTCATAGCTTATAGTG
TCCGGTtttaaattcatgatatgcaccactgcaatgacttcacaaaACTA
TACAACTTTTCTGGGTTtttttttccacccaatacgtcattttttctatt
gtttaagtgacgtattgggtggaaaattataaaagttttcagaaaactct
ccagtggtgcatatcatgaatctcTCTTTGTCTTTGTGAACAGGCGATGA
CACTGGAAGGATGGGTAGACATCATGTATTATTTACAGGATGCTTACTCT
TCATGGGTTTGGATTTATTTCGT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_008709XLOC_008709Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:139708..139762TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:139708..139762Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:139708..139762TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:139708..139762Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:139708..139762TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:139708..139762Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:147119..147246TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:147119..147246Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:147119..147246TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:147119..147246Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:147119..147246TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:147119..147246Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:147840..148410TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:147840..148410Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:147840..148410TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:147840..148410Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:147840..148410TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:147840..148410Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:153125..153367TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:153125..153367Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:153125..153367TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:153125..153367Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:153125..153367TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:153125..153367Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:153850..153944TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:153850..153944Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:153850..153944TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:153850..153944Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:153850..153944TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:153850..153944Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:154583..154766TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:154583..154766Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:154583..154766TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:154583..154766Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:154583..154766TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:154583..154766Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:156377..156695TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:156377..156695Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:156377..156695TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:156377..156695Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:156377..156695TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:156377..156695Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:161151..161230TCONS_00015598-exon-sc0000214-1491911889:161151..161230Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:161151..161230TCONS_00015598-exon-sc0000214-1510915933:161151..161230Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:161151..161230TCONS_00015598-exon-sc0000214-1575043694:161151..161230Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000214supercontigsc0000214:139708..161230 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.0962032	0	0	0.436519	0.00533596	0	0	0	0	0.133009	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.277878	0	0	0	0	0	0	0	0
Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00015598 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CAC1H (Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1H OS=Homo sapiens GN=CACNA1H PE=1 SV=4)

HSP 1 Score: 216.468 bits (550), Expect = 2.950e-59
Identity = 163/333 (48.95%), Postives = 220/333 (66.07%), Query Frame = 3 
Query:  690 VFWCLERKSRFRHWAIRMTLSPYFERITIFVILMNCVTLGLYDP-YDEDCKTQRCQILEGFETFIYAYFVAEMVIKIIASGLLGKQGYLSEGWNRLDCFIVVAGTFEL-IYGDGEFXXXXXXXXXXXXXXXINRVPSIRIXXXXXXXXXXXXGNVFILCVLILMVFAIIGVQLWNGILRNRCALTIPDTMPVSLQNTTESLMKYYIPDDSDEWEIICPTKDTSSNPELQCLGRIQGLESMVYSMP---GCNTTYGPKSNFTELVAKNLTHCIDWNMFYSSCKDFGLNPNFDAISFDNSGVAFIAIFQAMTLEGWVDIMYYLQDAYSSWVWIYF 1673
            VF+CL + +R R W +R+  +P+FE +++ VI++NCVTLG++ P  D +C ++RC ILE F+ FI+A+F  EMVIK++A GL G++ YL + WNRLD FIVVAG  E  + G    LS++R VRVLRPLRAINRVPS+RILVTLLLDTLPMLGNV +LC  +  +F I+GVQLW G+LRNRC L   D+  V   N T  L  YY  ++ +E   IC ++  +    +Q    I G   +   MP   G      P++   E V      CI+WN +Y+ C+    NP+  AI+FDN G A+IAIFQ +TLEGWVDIMYY+ DA+S + +IYF
Sbjct:   79 VFFCLGQTTRPRSWCLRLVCNPWFEHVSMLVIMLNCVTLGMFRPCEDVECGSERCNILEAFDAFIFAFFAVEMVIKMVALGLFGQKCYLGDTWNRLDFFIVVAGMMEYSLDGHNVSLSAIRTVRVLRPLRAINRVPSMRILVTLLLDTLPMLGNVLLLCFFVFFIFGIVGVQLWAGLLRNRCFL---DSAFVRNNNLT-FLRPYYQTEEGEENPFICSSRRDNG---MQKCSHIPGRREL--RMPCTLGWEAYTQPQA---EGVGAARNACINWNQYYNVCRSGDSNPHNGAINFDNIGYAWIAIFQVITLEGWVDIMYYVMDAHSFYNFIYF 399
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00015598 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
CAC1H2.950e-5948.95Voltage-dependent T-type calcium channel subunit a... [more]
back to top