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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00013735 ID=TCONS_00013735|Name=TCONS_00013735|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1303bp GCGAAAAGAAATCCGTATTGCCTCAAATTATCAGCATAAATATCTTTATA CATTTTAGTGCTTGTGATATCCACGTGAGAATTGGATTTCGGTGACCGGC AATTTGGACGTCCCAAAATTCCACTTTCGTCAAGATTCGAATCTGATTTC GAGTGAAGTCGCGTGTCTCCTCCACCGTTGACCGATAAATTtccatcgat gacgtcatcgtggTCAGATGAATAGGAGACTGTCCTAGCTCTGGTGTTGG TTGTAGCCTCGTTTTCGAATTGAACCTCATCTTGaatattaatttgattg tcTATCCCTTGAAACACTATTCCATAATCCGAATGATGTTTGCGATGTTT GTAAACCTTTTTCGGGTCCCGGATGTACTCTTTCTGGTGTTTACTTTCAA CCTCTGTACCATCAATTTTTTCACCATCTTTCAGAATGACTGTtccgttt ttataagaatttgtattattatttttgatgACTATATCTTGATTTTCACC CATGTTGTTTTCTGAAACACTTTCAATAATTATGTCCCTCAAGACTGAGC TCGATTTACGTAGCCTGGGTGTCGAAGACAAAATAGCCTGTCTCCGTTCG ACAGATTCGAAATATTTGTTATATTGTTGCAACCCAGTATCAAACGAATA GCCTTGGCGTTGAAGTCTTTTTCTTGGAGTGGTCAATTGTTGGTTTTTGT TGACCAGAGCTGCCGGCGATGTGTTTGAACGTTGGATATTCTTGATGAAA TGTCCCTGTGGTGATGTTACTGACCTTGTTCTTTGAATATCTTTTGTAGA TTGTTGATTCTCCTCGATGTGGTTTTCGTCAAATGTTTCAGATCGTTGGA TAATGTTCGTCTTCGATGACGGTTTTTGAATGTAAAGTGCGTCAGTCGTA TTCGATCGTTGTAAACGTTTAGACGAAGCTCTTTGGTGGACGTTGTTAAT ATAATGTGCTTGATGCTGTGATGTGTTCGTTTTATGTGAATTGCTACTGC TGTCTTTCTTGAGTTGAgtatcaaataaaaatgtttgtaGATTCCTCAGT TCTCGTTCATTGTGATGATGATTTGTAAATGATGAAGAGGAATGATGACG AGTAATTATATTCGGTTGGTAAAGTGTTGAATAAGCAGTTGCCATGGTGA TGTGTTGTTTGTTAATTACTCTCTCTCTCTTTAAAAGCGACTTGAATCAC CGCGAGACAGGAAGGCGACTGAACTTTGATAAACTGCAGGAAAGTGACGA ACAGGATCTTTCTGCAAAAACATCTGTTAAAAGCAACATCAGTCGGCATG ACG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000171:444855..476993- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00013735 ID=TCONS_00013735|Name=TCONS_00013735|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=32139bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000171:444855..476993- (Clytia hemisphaerica) GCGAAAAGAAATCCGTATTGCCTCAAATTATCAGCATAAATATCTTTATA
CATTTTAGTGCTTGTGATATCCACGTGAGAATTGGATTTCGGTGACCGGC
AATTTGGACGTCCCAAAATTCCACTTTCGTCAAGATTCGAATCTGATTTC
GAGTGAAGTCGCGTGTCTCCTCCACCGTTGACCGATAAATTTCCATCGAT
GACGTCATCGTGGTCAGATGAATAGGAGACTGTCCTAGCTCTGGTGTTGG
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GTAAACCTTTTTCGGGTCCCGGATGTACTCTTTCTGGTGTTTACTTTCAA
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TTATAAGAATTTGTATTATTATTTTTGATGACTATATCTTGATTTTCACC
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ATCTAACGTTATATGGACGTTGTGAATGTTAGAAAAACGTTGAAACAACG
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ATCTAACAAATAGCTTTCTAGACAATATTTCACCCAAATTCTTCATATGT
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AATAAATAGCTCCAAATGCTACATAGGAGATTCGATTCTAGTCTCCTCCA
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GTAGCCTGTGAGGATACACGTACTTTAGATTATGGTTATCCTAGGCTAAT
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TCGTTGTTAGTTTTGACACGCCTTCGCCTTAGCAGATTAGTGGACGAACG
AACGAACGAACGAACGAACGAACGAACGAACGAACGAACGAACGAACGAA
CGAACGAACGAGAAATGCCTCTAAAAAGCTTAAACGAACTTGTCAATAAC
ACAACTAAACATTGAAAGAAGTTTAAATCAATTCACTGGAAATTCAAAAT
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AATTATGATTTCAAAAGGAAATTACATCGCATCGTATATCAAAGACAATT
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CAAATGCAATTTGGTATTTCTAAACCAAATAAAAAACTCCATAAACAAAA
TACAAACTAAAATAACTAAAATGGAATCTCTTTAACTCGCAAACTCTTAT
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ACACAGACGTCACAAACTATTTCAATGAATAACTACAATCCGCTTCAAAG
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GAAGTTAACTAGAGGTTCAGTAGACTGGCACGCCAGTCGGGCTGGAACGG
TATCACGCGGGAGAAGTGAGCGTAGGAGTTAGGTAAGCGTAGGAAAAAAA
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GAGTTAACCAGCAGCCTCTCACCAACTTTTGCTCGCTCTCCTACGCAGCT
CCTATTCTGGCAAACGCCCGCCGCCTTTATGTTCCCGCCCTCTGACATGA
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CCTGACTTCCATGTTCCTTTCAATCTATAGATAGCCAGACCGGACGCCTT
CGAAAACAATCAAAAAATGTAAAAGTGTCATGTAGAATCACTCTTAAAGG
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TCCACCTTCCCACATACGGTACAAAAATGAATTATCCAGAAAATTGAACT
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TATCTTACTTTCCGATTGAACGCTTGTGGTTTCGTGTAAAAGAGGCACGG
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GAGCGTACAGTTTTCACGTGAGAAAGATTTATTGCATTGGTAGGACGGTG
ACTTTAAGTGTTCTAGATTGGACAACTACATCAAAACCTTAGCACAAAAA
AAAAAATCAATTAAGCCATTTCTACCCATAGAAAACTACTATAAACTCTA
AACACCCTGATCAAGAAAGTAAGTCCCTTGCACATTTTCAAAATCTCATT
TCTTTTGCCGTGAGAAAACTTTCTATCCTTACCTCACCAAATCAAGATAA
AGCGTAGGTAGAATTTGAAAAAAAATGTTGGACCAGCACTTCCACGCACA
CAGACTTCCCACAAATACCTATATAAATAGCGAGGTTTATCAAAGGATAA
CCGGCAGTTAGTACCACAGCCAACTCTGGCTTCCTCAACACCGGACGACA
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TTAGTAATCACGCTATAAAATTAATAACACAAACTCATTAATTTCCAAGG
AGAATAATTTTTAAAATTAATAGCCCTATCATTATATTGCCCGTTAATGA
GCTGTGTTAATATTCGTAATGGATTTTTAAGGTAAATTCGTTCTTACATA
ACTCATCGACCTGGAAGTTACGTTCAAAGGACTATTCTTGGATTGCAAAA
CTTCGGCATACCCATTGTCTCAATTTTCCGATTTCTAAATTAAACCAGGC
GAATTGGTCTCCCCAAAGCACCAGGATTTTATCGAGAATCTAAAGCTCGA
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CTTTTGACACACACACGCAAGCCATGATTTTCAAGCCCAATATCAGATAG
TGAGGGTCGTTAAGCGATTGTATTTCCGCTAATAATTCCGAAATCCTCTA
CTGGCGCTTACAAAGATTTTCATATAAAAAGCCGATATCTTCGTTTGTTT
ACTTCGTTCATTCGTCAATATACTGTACTATTATTATTTTTAACTCATTA
CACATTTATCATACTCTCATAGAAAACTTCCAACGAAGAAGATTGATTAC
GCCTGATTACGCATCATGTTTGTAATTTTGAAGATTTTTTTTCTTTCCGA
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AACAAGTGGTGTTTGACCGAAAATTGAAGTTGTGATAAACACGACTGATT
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ACTTTTAGTTGGCAGCTTTCTCTTACTAAGATTGGGATGCCACTCCTCAC
CCAGTTACTCTTAATTCGTCCCTTTAATAGCCGATCATTAAATGAGATGC
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TACGCTTAGATTTCTTAAAGGTCACGAAAACATCGTCGATTCCAAATTGA
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TTTGTCTTGCCTTACTAGAATGAACGAAAATGCTCTAACCTAAGCCTAAA
CCAAAGCCAAATCTTTGAAGCAAGTCAACAAGCAAGCTTATCAAACACTC
CCACGAGTTCCTAGCTGAAAAGCATATGCGATATGCAGAAAAAAAATGTC
ATGCATTTTTATATATACTTCCTTGACTTGTCAAAGCTGTCGTATTAAAG
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AGACCTTTTTCAGATCTGTTTATCTAGCCTATGGTATAAACAAAACAAAA
CAAAACAAAAGTCTAGAATTTTTCCTTCCCTTAAAAGATCTGGAAGTAGG
TAAACGCTCTCTCGAACACTCTGACAAGCCTGACAGACCCCCTGAGTAAG
AGATTGAGACAACGCATCGGTAACAGAAATCCTACCCTAATTCAGGGGGT
CTAATTCAGAATTGATAGAGTCGAAGAAAAATCATGCCACTCATAAAATG
ATAAATTTTCTGACACGAGAAGAAATATCAGAAGAAAATCGACATAAAAG
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AAAAAAACCTAAGTGTAAATGAGCTCTATAACCACTCATCCGCGGTGGCG
AGCTTCCAAAATGTCGAAATTGCTATCCAAGGAATTTTAGAAATGTTAAA
ATTATGCGACTCAAAGAGAGGGAAAGCAAATATATGCTGAAGAGGTTATC
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TGTAGGACACTACATCATGTTGAATGTCTTTAAAAACACCACTGACTCCA
GCAATAAAGCAATAATAAGAAAATATTTAGCACACACGTTTACTTATTAT
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AATATTTCTTGATCTGTTTTAGGTTTGTATCTGAAATGAGACAACAACGT
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AGCGAATTGTTGGAGAAGATTCAAAAATTTTTGTAAATAATTCCCTAACG
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GTGTGGTGACTGTCAAACGTTAAATTCCCCTTTTTCGAGTAAAAAATCCC
TAAAAAGCTAAATTATGTGTATTCGCATCTCATCTCATGATTTGAATGTG
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CAAAAGGTTAATAACTTCAATGAAGAACTCACAGCTCAGACGCTTGACAC
AAAAAAGACTTTATAAACTTATAATTGAACAAATCCTTGAAATTTCGCGT
TAATATAGTTTTCTCAAAAAATATTCATTTCATCTGATATCATCAAATTG
ATGAAAACAGATTTGTATCAAAATACACAAAGAACATTAAGTTGGCACCT
TAAACTCATTAATGCCTTGATTAGCTCATTAATACCATTAATTATTCATT
AGAAATATTAATTGATATCCTCATTTTGTAGCCAATTGATTGACTCCCCT
ATAATGGTTAGTTTCGTGAGAAAGTTTCGCAAAAACTTCGAAGATTGAAA
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ATTAACTCTGACTTTAAGTTGTATTCCTAGGTATTCAACCACAACAGTTT
CTTGTAATCTCGACACCGAAATTGAGAAGCTTTCTTCTTGCCCACATACA
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CTACATGCTGAGAAATGAACGTTATAAAACTCTCCGATTACTTCACAGAC
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ACGTTATATGAGAACATAAGGCTTCGATGGCCAAAATTTTACAAGTTAAG
AGGAATTTAAGATTTCTTCCCGTTATCTTAGGAAAATAGACAAAAATACT
CACAAAATGGTGAAAATAAGAACATGTCTAGAACACTTTTAGATGTTCTT
ATAAAAAACGTGTATCAGATTTCGTAAACTCAAGAGGGTGAAACACAGAT
GAAAGTCAAAAAATGTGATTGATGCCTCAGACTGAAATAAACACAAAACA
ATCTTTTCGAGATGTACCTCAAAATAGTATTCAAAAAATCAACACACCCC
TGTCCCATGCCAGATCAAATCTCTAAAAGATCATCCATTCTGTGCATACC
ACGCTCTGCTCTAAAGGGATATGGCGAATGTGACGATCTGACCTGGTTGT
TCAACCAAAACATTCAAAACCGCGTTGCCTCTAGCTTGAAAATGAAAGCA
AAGCGACTGAAATGTTTATGTTTAATATTCATCCCAAATTTACATGAAAA
AGATTGAAAAGGTGCTCCAACCTGCAAGCATGGTTGAAATATGTTGAGAA
TTTTGGTTATTTTAACGTTTTTCAAGATTTAAAGTTCCGGCGAGAAAGTC
GATTTTGTGCTATCTCTTTAATTTAATCTAATATTTCAATTTGGGAGGGC
TTGGCAGACTTCCAGGCTATATTCTGAGCCTTATTGGACTATTTTTGAAC
TTTTCGATCCTCAGATCCTAAGGTCCGAAGTGTTAAGTCTCATGTTAAAA
CTCAGAGTTAAAACTCTACCCTATTCCAACCTATTATAGCACTAACAAAT
CGATTGTGGTTTCAAAACTTCCTGGTGGATTCCCCTTTTTTCTCAAATAT
TATGACTTTGATTGTGGGCAGATTCTTTTACGGGGCCATGGCCTTTAGAA
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TGTGCTGCCACTCAATTCAAATTGTGCTGCCACTCAATTCAAATATTCAC
GTTTGTAAGACTTTTATCTTCCAAGCCTCCGTTTGATAAGTTTATTGACA
TTTATAGCCTTTTCGACGCAATCTATCTTTTAGATGACATCAAATACAAA
TGAAAGACAGCCTTCTCTGCCAACATTACCAGTCAACTATTGAATAAAGC
GTTACCTCAATCGAATCATTCTAATGTCACTTCTAATTCATTACGTAATC
TAATCAATTTACTTTTTGGTCGAAAACCAATAAAAAGCTACGCTTCACTG
ACGCAAAACTCACTAATTTGACGGAGAGAAGAAGTTTAATCTATTAGCCA
AACCTCTTTTTGTCTCATCAAGGAGTTTAATTCCATTAAGGTTTTCTAAA
TGCGACCAAAAAGTAATTACTTGATTACGTTCCCAGTATATATCCAATTA
TCGAAATTGGAAAGCTACAATTTTCGCGGAAATAAAAATAAAGTTATGGA
TTTTTGCTATGGTGACATAAAGTAAACATAAACAAACCAATGGAAAGGGT
TGTCCGGACGCATTTTTGTAAAGAGTACAAAGAGTACGGACAAAACTCTT
TAGTCCTGCAGATAACTTTTGTTTCGACTTTATTATTTACCAGGTCGGAG
AAGCTTATACATCGTCCATCTCACTATTTAATTAGTTGTGTAGCAAATCA
GAGCGGATGTTCTTGGATGCTTAACATTCTACAGAAACTTCTATCCTTTC
TTTTCGCAATATCTAAATCTTTCATCCTGACAACTTTATACATCTCCAAG
TCAACAAAAAAGTCGGATTCTAAGCAATAAAACGCTCAGGAGCTTTATAA
GTGGTTATCCTAAAATGCTGGGACTTTTTTATATTGTTTTGGTTCAAAAT
TTGTACAAAATGTGTCAAAGTAAAAGAAAACTGTTATAATGTGCTTCAGT
CTAAAGGTACAAAAACAATCGATGTGTTAAATATCTGGGTATTACGTGAA
AGATGGTACTTGATGTCTAACTGCTTAGTACTCTAGAGAAGGGTAGATAA
TAAGTGGAGAATCCAGGGAAAAAAGTCATTCTTACTTATATGATAGATAT
CTACCGAAAGAAGAGCCTTCGGGGTACGCAACCGGGTAGCTCAGTCGATG
AAGCATTCACCTTCTAACTCAGTGAATGAGTTTCACCTCAGCATTCGATC
TCCCTACCACAAATAGAAAAGGGATAGACTGCCACTCCCGGTTCCGCCGA
CAACCACCTACTAAACTGCATATAATATTTAAATCGCAATCTCATTTACA
TTCTATAACCTCTGGTGAAAACTACCTTCCTTATTCCGCCAACAGAGATC
AATCCCAACACATTCAACCCTCACCATCTTTCTTACCTAGTGAAGTCAAC
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TTGTGATATTTTGATATTTGCATAAATCTCGTTTTTCTCTCTCGAAATAC
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ACTCTTCTCCACACTGGAAAGTGACTAATCATTCTGAAGTTCCATTCAAA
AGCGTGATCCACCATTCCGAATTCTAACCGGCTAGAAACAAAAGCCAGAT
GTGTTAATTAACTTTTGAAAGAGGATTTCGAATAATAAGATTAGAATATT
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GGCACGTTGATTGGAAAATTCTGTGCAGCAATTTGGAAACCTATGCCGGT
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TTTGCATTGTAGAACTCGAAAGTTTTCTCATTTCTGTGCAAGATCATTTC
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TTTCACCATGTAGTAAAACAAACCGAACATTTTCCCACTAAACTGTAAAC
GAACCTCTACATAAACAGACAGGATTAACGCGTGAAAACAAACTCCGAGA
TTTTAACGCTTTAAGTCAAATAACATTAGATAAAACTTAGCACAGACTTA
TCAAGTAAGGTCACAAAAACATTGAATGGTTTTTATAAGAATAATTATAT
AATAATAATATATAAGAACACGAGGCTCAATTTTAGCTAAGAACATATTA
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AGATGCTGTAACCCATCAAGAAATTTGAACCCAAAACAATGGACCTTATC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000171 | supercontig | sc0000171:444855..476993 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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