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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00010095 ID=TCONS_00010095|Name=TCONS_00010095|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=352bp
CAATCAAAATCCAATCTTTTCGAGAAATCAATGAACGAAAGATGAGTTAC
GGGATCGATATTTGGATGTCACAAAAATGGGAAGACTATCGTCTCAAACA
TAACATTTCAAAAGTCATTACACCGCTACTAGGTCTTGGTAGACCTTCTA
ATTTGATCTGGGTCCCTGATACAGTTTTTATCAACGAAATCAATTCTAAA
TAGCATTTGGTTACTGTTAGAAACAATAAGGTGGATATTAATAGCGATGG
CACGGTGCATTTGATCTCCAGAGTCACTGTAGTTGCATCTTGTCGAATGA
ATTTTCGATTCTATCCATTGGATACACAGTTCTGTTATCTCTTCATAGAG
AG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000102:90344..107782- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00010095 ID=TCONS_00010095|Name=TCONS_00010095|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17439bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102:90344..107782- (Clytia hemisphaerica)
CAATCAAAATCCAATCTTTTCGAGAAATCAATGAACGAAAGATGGTAAGA
TTCTCCCTTATTTATATTTTCCATTCCGATTTGTTTGCAATAATCTAACT
AGTTTTCCTATTATTTTAAAGCATTTGGAATCATATTGTACACCTTTCGC
TAAACGAATTAACCCAGGTTCAAATTCAGTTGACGATTTAGAAGTATCTT
CAGAATTTTTTATATTCAAATCCTTCCCAGCTTATTTCTAATTGGAAAAT
AATATAATTTTAGAAGAATGGATTGTATACAAAATCTAATTAGTGAACAT
CAAAATCATATTTTTCCATATCAATGGACTTTCTGAAATATTCATTTGGA
AGACTCTCTTTTTAATTGATATTATAGATTTATTTTCCATTTTGACATTT
GGCCCCTTTCAACGCCTTTCTTTTTAATTGATATTATAGATTTATTTTCC
ATTTTCCATTTTGACATTAGGCCCCTTTTTCGTGGCCTTCGACGCGGTTA
TGCAACAGTAAGACCTTAAATAATTTTTATGATTGAAATCGAATTCTAAT
GTGGAAAAAAATAGTTTTTTTTCAACTCAACAACAAGTCAAGACAAGAGT
CGATCAGTAATGGTCTTAAAAGTATTGATATTTTTAATCATTGAAAGTAT
ATCAATACAAAATACTATTACACAAGAATATATCATTGGTATTTATTCAA
AATGTGATGATGAAGCGATGAAGGCGCATTCGAATAGAACAGATGTACAA
AAACAAGCTTTGCTTTACGACAAAATCATCAACTATACTTTCTATTCAGA
TAGACAGTATGGCAAAATGGAGTATATCAGCTTTGATGTTTGCACCAGTC
AACAACGTCTCTCAAACCTTACTCTGACACTAATCCTAGACTATCAGTTC
CAGTCAGATGTCAACCATACTGAATCTGGAGAAAACGATGGCAAAATACT
TGTTCTATTCGTTTATTTAGAAAAGGATCTTCACAAATTATTATTAGAAT
TGTTATTTGCTCATGGACGTATACAAACATTTCTATTGAATTCTCATCCA
TTGCCAGGTATTATGAATCCATATTACACGGTGATGGATCCTTTAGACGT
TGAAGTTTACATTCTGTTGATACATGCTAAGATATTTGATTGGCAACGTA
TAGGACTGATCTTCATTTCTGGACATGATAAATTATACGTAAATTATTAC
CGTGAGTTTTATGAAAGAGTTATTAACAAACTTAGAACCGAACATCCACA
CTTATGTTATTTCAAAGAAACAGTTGATATACGAAATGAAACTGATTTGG
AATCTATGATATTTAAGCTGCACGATGAACAAGATTCGAATGTTTTGATT
CTCTTTGGCGAACCTGATGATCAGATAACTTTAGTCAGGAAAACAAACAC
AGATTTCCATACAAGACATATATGGTTCACTCACGATATTGGGCATAACC
TTAGAGCAATTTTTCCAGACCCTTACGAATATATTTATCTATTTTCATTT
ACAACTAAACTGAGACAGCAAATCGTTCTAAATCAACTCAAATATGCTTT
CGATATCAAACCACGTTTCGAAAAGCTTTTTGTTGCTAATGGGAAAACAG
CAGAGTTTGCATTTGCTTTGGCTAAAGAGTTTCTGGTACAAATCAACAAA
TTATTTGGTAGATATACTAAAATGAAACCTTATAATCTGGTGAAAGGAGC
TATCATACAAACTCTTAAAGTACTTCAGTCAGTGTTAATTCGGACAACCA
GTTTAAGGCACGAATTTAAACACTCTACGGTGCAAATGACTTACGATATA
AATAAATATGACGAATACAAGGACACTGGTATTCAAGGTACAATATGTTA
TAAACATGCATGTGATCCAGGTTGGGAACAAACTAGAGGTCAACTTTTAA
AGAATCTTGCAAAATGGAGTTACGAATATGGCTACACATGCCAGCGTTGT
GCTCCCAACTACATTAAACCTAAATACGGATTCCATTTATGCCAGAGCTG
TCCAAAATATCATCAATCCAATGTTGACCATACTCGATGTGTTGACCCGT
ATACTGATATGTTTTTAACCCAAGATCTTCTGTTCTATGCATCAATATCC
TTACCTTGTTTCGGCGTTAGTATCAATGCAATCACACTGATGACTTTCAT
ATTGCACCGAAAAACACCAGTTGTTAAAAGCTCAGATTTCGTGTTAACTG
TTCTACATTTGGTAACATCTTTACTCATTAATGTAGGAATTATATGTCTC
CGGTTTATGAAGCCGGCAAAAATATCATGTTCTATAGATGCTATTTCACC
AGGATTCTTGTATACTCTCTTTATTACCATTGTTTTAACTAAATCACATA
AAATTTTAAAAGCATTTGGCTCAATGAGGAAATTAACAACGAAAAATAAA
CGGAACACAATAGTTCAACAATATACCATAATTGTTGGTTTAATGGTGAT
TGTTATTGTTTTGACATTGATTGCACTAAGCAGCCAATTACCAGAAGTAT
TATCTCAAAGGGATACCCAAAAACTAATCATCTATTTATCCTGCAATAAC
CTATTGCCAAAAATCTTCCAATTTGGATTTTCAGGAATTTTACAAATAAT
TACATTCGTTATTGCGTACCGTGGTCGAAATTTACCGTATATTTTCAACG
AATCAATGTCTTTACTGTACGCTTCGTTTTCGTCAACAATGTCACTCATT
GTGATGTTTATTGTTTTAAAATTTGGAGGGAAAAAAGATCTGTTTTTACC
AGCATCCATCATCTGGGTAGCGGTATCATTGAATTTGAACATTTATGTAC
TATTATGCTATGGTAAAAAGATGTATATTATTTTGTTCAAGAAAGAACGG
AATACTAGAAGTTATATACAAAGGAAAACGTTCGAATCGAACCAATCGGC
TTCATGTCAGACGATCCAATCATAACTTTACATTTTAAGAGAATTTCTAA
GAATAGTAAATGATATGATATACTTTAAAATATATTTTTCATTTTTTCCA
ATTCTGCTTTGTACCTTAACGTTCCAAGTATTATGCATTATCGTCAACAT
GAAAAATATGAGCAATCTGATTGGCTAAAACGCGTACACAAATTCTGTAT
TTTATATTGTACCGTACAAATACAAGACCGTGTTCAAAAAAGGGGTCTGG
TAAGCGAGAGACCGTATTTTGAACTTTTGTATCTTATACAGAAATTTATT
TTGAGAAATGCTTTCGTTTTCTTCTCAAGGCACAAAAAAATGTCAAATAA
GAATGTTTTAAACTTTTTAATGACTTTTCGAAACATTTTCGAATGTTTTG
ATGTTGATTTCACCACAATACAGGAAATGAAAAAAATATAACATAGAGAA
AGACAAATGGAGAGTGAAAAGTTTGTTGATATTTCTCAAGTTGGCGATAA
ACCAGTTATCACATTTTACCCGTACAATATGGGATATATTTTTCTCGTTC
AGAGTTTTCTGTATTTTCCTTGCCTAAAGGCTCGGAAAATATGACGAAAA
TTCTGAACTCGAAAAATATATCCCATATTGTACTCGGTACCGTGCAATAA
ATATTACAAATTAAATCCTATTTCAAGATGGACTAAACTTGCAACCCCAA
TGAGATAGTCACTGTTTATTTTAAGAATATCCGGTGGATTTCAAAATCCC
CACAATCGTTAAATAAGATTTCAAAATCCCCACAATCGTTAAATAAGGTG
GTTTTCCATGCCATTGGCAATTAGCTCTTTCATTACATCACTGGCTAAAA
AATTCTCATCGGTTCACTCTGATCGAGATGTGAACTAACTATCGATTTTA
CCCCCGTCATTAATTCTATAATTCATATAAACTTCTAGATTCCCTAAAAG
AGTAAAAATAATGTATTTTGTGTGTGTTTTTAAGTATTGTTAGGTATAAT
TTACACGTTTGAGGCAAAAATTTACCGAAACGAGGAATAAACTAAGGACA
ATCTGATTCTAAGACCTCAGAGATTACTAAGAAAGTACAGATTCTAACAA
ATTGAACCCATTTTCAGTTTTAAAGTAAAGAAACTAAGCATATCAACTCT
TCAAGCATCTTGGCATTTTGGCTAAATAACGGACCGGTCTGTAAAATACC
AACCGCTCACATGACTAAATTGAAATCTTGCACACTGTCTTAGATGGTCA
ATATCTATCATTGGTGAAATTTTCAAGTCAAAAACTTTAGTAGCAGTAGT
AGCAAGTAGTAGCATTAGCAGCAGTTCCTGAGTTCTGGCAGGTGGTCAAT
GTGTATTTTATTATAGACTGGTCTGCAAAGTATCAAATACTCATGTGAAC
GAATTTCAAGGGTCAAAATTTCAAGGTCATAGGACTTGTCAATCTTGATA
TTTTAAGCCCCCCCCTCTCAAGATGTTTCCCTAGTAAAAGAATAGGAATA
TGCTTGAAGGGTTAAGGGTTAAGAACATCGTAAGAACAAATTTTAGACTG
AAAATTTCAAAGTATTAAGCACAGCTTAGTGTGCGCAAACATTTACCAGT
TCCTTATTAAAAAAAAGCGTGTTCCTGTTTTCTTGTATTGTTTGTGATAA
AGTACAATCAATTTCACTTTATACAGAGCTATGGGATCGATATTTGGATG
TCACAAAAATGGGAGGACTATCGTCTCAAACATAATATTTCAAAAGTCAT
TACACCGCTACTAGGTCTTGGTAGACCTTCTAATTTGATCTGGGTTCCTG
ATACAGTTTTTATCAACGAGATCAATTCCAAACAGCATTTGGTTACTGTT
AGAAACAATAAAGTGGATATTAATAGCGATGGCACGGTGCATTTGATCTC
CAGAGTCACTGTAGTTGCATCTTGTCGAATGAATTTTCGATTCTATCCAT
TGGATACACAGTTCTGTTATCTCTTCATAGAGAGTTGTAAGTCATGCTTT
ACGAATTTTTGATTTCATAAATTCAAAAACCCTTTTTTCGGTACTAGATT
CTGTCATCTCCTAGTCAGACCTTGGCCAGGGGCTAGATTTTGGCTGTGTT
AGAGCCAAAAGTTTTCACCATTAAAGCTTGAGGCCTTTTTAGTCGGTCCT
AATAGAGCACCGGTGCTTATTACGTCAAAGCTCGATAGTTTCCATTNACT
ATATGAATTTTTGATTTCAATAAATTCAAAAATTGTTTTCCGGTACTAGA
TTCTGTCATCTCCTAGTCAGACCTTGGCCATGGGCTAGATTTTGGCTGTG
TTAGAGCCAAAAGTTTTCACTATTAGAGCTTGAGGCCTTTTTAGTCGGAC
CTAATAGAGCACCGGTGTTTAATACGTCAAAGCTCGATAGTTTCCATTTT
TAGCCCGGCCCTAATTTGATTTTTATCACTTATACCAGCCTTTATAATGT
CAACCAGGGCTGATAAGGTACACCGTTTTTTCATCCAGTCAACATTGACA
TATTAAACGTTTACATTTTTTGTCTCTAAACTGATATTTTGATTATAGTA
TTTCAGCCTCAACCAAAAAGCAAACCTCTCATAAACTTTTCCTTTTAGTC
GCTTACCCTGACACTTACGTGGATTACAATTGGCGTGTTGGCGTAATCGT
TGAAAAGTATGATCTATCTCAGTATACGTTGGAAAAAGTCGAGACATTCA
AAAATATATCAAAATATGAATCAGGTAGTAAATATTCTCTAAATTTCAAT
ATTTCCACTCAATTCGTAGGGACATTTTGATTTAATATTCGAATAGTTGC
AAACAAAGTTCAGTGCCTTAGCTACCGGCGGTCAGGGGGGCTTAGCACCC
CCTATAATATTTTTAAGAGTGATTTTTTTCATAAAATGGAGTATTTTACC
TTTAAATTTTGCCTTTAATTGAATTATTTTAGTTTTTTGAGTGTTTTTAG
CCAACTTAGAGCTCTAGATTTCCAAATCCCTCCCTCGAGCCAAACCTTGG
TTGGCCCTCATGGTGTCACTGAACTTATGCCCCTCCAATATTAATCCTAT
AGCTACTTTTTCCTATTGTCTAGGGAATTATACAATTCTTCAGGTCGTGT
TTCGTTTCATATTAATAATATTTGAATAGTTGCAAAAAAAGTTTTAAAAT
ATGCTATCTTTGCTGAACACTTTTTGGACTTATCCTGACTAATCCTATAG
CTACCTTTTCCTATTTTCTAGGGAATTATACAATTCTTCAGGTCATGTTT
CGTTTTAAGCGAGGCGTTGAAGTTTCGGTCATCCAAGTATTCTTTCCGAT
TGTGTCTGTTGTTTGTGTTTCAATGATCTCCTTATGGTTAAACAAATATT
CTACATCTTCACGTGTAGGTGAGTAATCATAGAGACAAAAAGTTGGTTAG
GGTACTGTCGTTTTCACTTAAATTCATTGAAATCCTTCCGTTATTGACAA
GGCTGAATAGTTTGGCTCCCTCTATTTCTTAGTCCAAATCGAAAAGAGCA
AGAGAGAATTTTAAAATCCTGTTCCGAAGATAATATAACTGAAGGGACGA
TAAAACTTCTTCCAGTTAAGGAGACATTCGAGTTCTAAAGGTTCCAGTTA
TGAGACTTCGCTATGTATTTATTCATCTTTTTTTTCAACATTATGTGTTA
CTACTTTTTCAACATTGTGTACATTGTGGACCAGACCGAATTTCTCTTTG
TCATTATAACTCTACGGGCTTTTTAGGGCTTGACTATGCGTTATAAGATT
ATTTATTTTTCTTTCCTTTTTTCAGCATTATGCGTTACTACCCTCTTAAC
ATTGTGTACTTTGTGGACCAGAGTGAATTTCTCCTTACCATTGGTCAGTT
ATTTCAAAGCATTGGATTGGTATTTCCTGGTTAGTTTCGTTTTCATTCTG
CTGGTGTTGGTTGAATACACCATTGTGGTTAACGTGGATACTTCAAGAGA
AAAGAAGAAAGTCAAAAATGCAAAGAAAGAAGAAAAGGTTAGTGCAGCAA
TTTTTTCCAGTAACCTTTTAAAAGTGTATTTTGATTTTCACTTTATGAAG
CTACAGTGAAACCTCTAATTAACGGACACTCTAAAAGGCAGACACCTCTG
ATTAGCGGACAATTTCATTTTCCCCGGCCGTTTCCTAGTCAAATCATCAT
AAAAAAGTTTCTAAAAGGCGGACACTCAATTATCGGACCCTCTGATTAGC
GGACAATTTTTTTCGCATGAAATGGCCAAAACCCCTATTTTAGCTCTCCA
ATTAGCGGACATTGAATATCAAACGGGTCACAGACGTCCAAAATTGAAAA
AAAAATTTTAGATATTTTTATTTCGAGCACTTATTAGTCTTATTATTCAA
ATTATTTATACAAATTTCCAGTTTTCCCTTGACCCATTCAACGAATTTAG
GTGGGCCAAAGAAATCATAAATCACTGGTACTTCAAGTCCGTACTCACCA
CCTCGATTTAACCTCTTGCCAGTCACTCGAGCTCTTCTATGGCCTAGTGT
CTGCAGATAAGTACTTTAGACCCCAATTTTATATTTTCGACACCCTGGGA
TGGCCTAATTTAAAAATTGGAGCTCCGAGATCAAAAGTTTCTAAAAGGCG
GACACTTCTAATTAGCGGACACTAACCCCTTTCCCCGATGGTGTCCGCTA
ATTAGAGGTTCCACTGTATATAAAGATGATTTGTTACGACCCATCATGGA
ACTTGATCTTATACGGGTACAAATTTCTAACCGTGCCACTATTTCAAGAA
AGTTTGGCGGAACTCTGGCATTTAACCATGCTAATAAACTAGTATGTTAA
TTAATCATGTAAAAGGGTGGGAACTTAAGGGCGGCGGGTGTTTGCTAAAA
TGGGAGCTCCGTAGGAGAACGAGCAAAAGTTGGTGAGAGGTCAGCCCCTC
CTTCCCCGCCCTCTTCCTACGCTCACTTTTCCCGCGTGATATCGTTCCAG
CCCGAATGGTGTGCTGGTCTATAGTCTAGGATTTAGTTGATGGATTCTAA
AAAAACTCCGATATAAAGCCGATGAGGACTCATTTTTGTGGTCGATAAAT
TGATACCCCTTTCTAGACGTGTTTATGGACTTTTTCAAAAGCAAATTTTG
ACTTCAAAAGCGTATAGCTTGAGAATCACTAAGCCAATTTTCATAAGTTA
TATACCAAATTTTAAGTTTGCTTTTCCTCTTTACAATGACAAAATAATTT
ATCAAAAGTTTGCATTATTTCGGACACAGTTAGCAATCAAACCTTTACAC
TTCTTTCTGGGTCACCCGGTGTAAATTAAAAGTAAAGATTTATCATATAT
ACACCCCCTTCTCACAGACCCGGTCGGATCTTTTCAGCCAGTGGAGAAAA
GAATAACGGACTGAAATTCGATGAGGATCGATATTCCCACATTTTTATGG
CTGGAGATTTCAATTCTTTTGTTTTAAGGTCAGAAAATTCAGTGGGAATG
AGAAAAATAGCATAATACTTTGCAATGAGGATTGGTTTAATTGATTATTT
TCAGTGGGGAAAAAATTAGACGATCATTTTCCGCCGGGGACGATATTTCG
GCGAATTTTTCCAGTGTGAAGGGATTCCAGTGGTTCTGTGAAAAGGAGGT
GTATATATTGAAAACAAGTACAAAATAAACGTATGACCATACATACATAA
ACCATATTCTTCATTTTCAAGCGAAATTCTTTGAAAAATGCATCACTAAA
GGAAACTGCTTTGGATTCCGCACGTAGTCGTAAAGCCTCAGAAGCACCAG
GAGCACCAGTCAATGTTAAAGAAGTCTTGAAACGTAAAAGGAAAGTCAAA
TTTGATGATTATGAAACGGGGACTTCGAGAATTGACAGGGTGGCACGATT
TTTGATTCCATGCTCGTATTTCCTCTACAATATTTATTTTTGGTTTGTTT
TTATGGATGAACGACATGCATACGCAGCAGAACACAGCAGACCCATTCAT
AAATGAATGCACGGTTTGTGAGAAAGGTTTAACGTTTTAAATCGTTAGTA
TGGTACGTTTGAAACTGTTTTGATTTGATTAACAACATGAATAAGTTGTT
GGCTTATTTTCATATTTACTCTGACCATTTTCATGAAGAAAAGACATGGT
TACGCTTTGGCATTGCGGTTAAATTTGTATGCTTTCATGTGCTAATTGGA
AACCTGTTCTAAGCCGTTAACCCAGTCATGTTTTTGGTAAAATATTAACA
CTCCGGAGCGCAGTTGTATATTCAAAAATCTTGTTTAAATATATAGTTCA
ACGTTTTTGTTTCTTATAGATAGAACTAAAGCATTATATCAGACAAAAGA
GTCCAATGTCAATGGTAAGACGAATGTACGAAATATTACTGAGTATTTGA
GATAACAACATGTTTATTATTAATGTAAACTGTAGCCTACAATTCTTATA
TTTTTGATAGGTCTTATGTATTATCGACATGGTTTTTCTCTTGATTCTCT
TGATTTTTTTTTGATTATATAAACATAATATAACAATAGAAAGACACTGT
CCTGATATCAGATATGTGTCTGATATGAAACTGGAACACTAATGTAAAAA
CAAAACCTTTGCGAATGAAAGAAAATTATCTTTCGTAAATTACTAAGAAA
AGCAGGATGAGCTAACCTTGGCTAATTTAGGATGCGTTTTTAGAGATTCA
AAAGAGTAAAATACACTCTCTTTTTTGAGAACAATTATTCTCAGAAATGC
CAGAAAATAAGAACAAATTAAAGGTCAAAACGGTTAAAATAACTGGCTTG
ATATCCAGCCGCAGGAATAACCCAATTTTGCCCTAAAAATTAGGATAGGA
TAAAAGTGATTTGAAGCTAAAATTGATAAGAACAAAGAGATAAGAACAGC
CGAGCCTCTATACAAATTTGCTGCCTCTTATAAAAAAAGAGTGTACAGGG
CGTGTACAGAAGATCTTAAATTTTTAAGCCTCTGAATGTTCCTAATTTTT
TTACTATCAAGCTTGAAGATGTTCTTAACATGTTTTAATTTTTGCCATTT
TGTGATTTGTTGTCCCTTTTTTTAAATCGGGTCAGAAGGACAAAGACTTA
AAATTTTAACTGATTTTCATATTTGAAGAGATAATATTAGTCTAAAGGTT
TTTTATCAAAGATTTGGGAACAACCCATAGTGATACATGTTTTTATTAAT
AAGAATATCACCAAAATCTTTGAAGCCTTTTGATATTCTTAACTATTTAA
GTTTCGAGCCTAAAAAATTTTTTAACATGTTTTTATTTTCCCCATCTTTT
ATGTATTTTTGTCAATTTTCCTAAGATGATTTCTTAGGAAAATTGTTTTA
GAGTCTGCAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTCAATTTGGTCAT
CGAAACCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATATAAAAAATGTGTATA
AGATTTAATCAATGTTACTTATGTTTAGGACTTTCCTGGAACAACGGTCC
CGATCATTGACGTAATTTTTATAGGAATTCTGTATTTTTTCCATTATCTT
TAATACAGAATTTGTCGTTTTATTTTCAAAATTCAATTTTCCAATATCAT
CCTTTCTTCAGTGATGGACAGATAAGAAAAGAATGGAATTCACTTTTGAA
AGGTTACAACCGACACATTCGACCAAATTATACCGGTAAATAAAATATTT
CCATTTTAAGTCAAAATCTTCAAATTAGCCAAAACCATCAAATCCACAAG
CAGATACACCAAAACCATCAAATCCACCAGTATATTCACCAGAACCATCA
ACTCCAACAGCATATTCACCAGAATAGTCGGCTCCCACAGCAGATTCATC
AGAACCATCAACTCCACCTGCAAGTTCACCAACTTCATCAAATCCACAAG
CAGATTCGCCAAAACCATCAACTCCGGCAGCATATTCACCAGAACCATCA
ATTCCACCAGCGGATTCACCAAAACCATCAAATCCACTAGTATATTCACC
AAAACCTATAATTTCCCAGTTATTTTTTCTGGTCACATCTTGGGGCAAGT
GGGTCACATCTTAGGGCTGCTTTTTGGGGTCACATCTTGGGGCAAGTGGG
GTCACATCTTAGGGCAGCTTTTCGGGTCACATCTTGGGGCAGGTTTCACA
TGGCAGGGGTCGTATCTTGGGGCTGTACAGCGGGGTCTGCTAATTAATAA
AAACTACCAAAATAATCTTCATATCACCACAATATGTCGTTTTTTATGAA
ATTTGTCGTTCTTTTTGTCTATTTTTAGTTATGCAGGATTCTTTAGATAA
GCCTCTACGCCGTCGTTTTTGAATCAAAAAAATCTATGAAATTTCAATTG
TGGTGATATGAAGATTATTTGGGTAGTTTTTATTAATTAGCAGCCCCAAA
TCTGAGTAAATTTGGGTGAAATTCGGCCTTTATGGTGTATTTTCTGGAAT
ATTTTTATCCATTTTAAGGCAAAAAACTTCTAGATCTTTCAAAATTTTAG
TCCTAACAACTTTCACTCATCTTTGCTCATCTCAGAACATTTTTTTGATT
TTGAAAAACATTGCCTTAATAGGGCTGGACGTATGTTAGGTTGTTTACTT
TGAGTGCTCCCCCTCTCGAGATATATATCTGTTTTTATATTTTAGTGTGT
TTTGATCATCCAATGCAATTTCCATCTATATTTCCATCTAGGTTCGGCAA
CAAATGTTCATCTTAAAAGCAAAGTGCTTTCTTTTCGAGAAATCAATGAA
CAAAAGATGGTAAGATTCTTCCCTATTTTTATTTCCAGTTGCGATAATCT
AATCTACAAAATGTATTGAGAATTTTGGTTAATTCCTCGTTTTTAGCAGT
TTAGAAGTTCGGGCGAGAAAGTCTCTTTTGGTCTAATTGATAAATTTAAT
CGAATATTTTAATTCAGGAGGGGTTTATAAGCGTCCAGGCTATATTCTAT
AAGATTTCGTGGGCATTTCCCTCTTTTCTCAATTTTTTTTATATCTATTG
ACTCTTTAGAAATATTCATTTGGAAGAGGTTCAAAATTTTTTCTTTTTTT
ATTGATATTCAAAATACCCTAGATTTATTTTCCATCCTGCCATTAGGCCC
CTTTTTCAGGGTCTTCAACGCGGTTTTGTAACAGTATGATATTAAAAATA
TTTTTTTGATTAAGATCATATTTTTATGTGGAGAAAATAAATTTTTTCAA
CTAAACAACACTCCAGACAAGAGTCGATACAGTAATGGTGTTAAAAGTAT
TGATATTTTTTATTATTGAAAGTATTTCAATACAAAATACTATTGCACAA
GAATATATCATTGGTATTTATTCCAAATGTGATGATGGAACGATTAAAAC
GCATTCGAATAGAACAGATGTACAAAAACAAGCTTTGCTTTACGACAAAA
TCATCAACTACACCTTCTATTCAGAAAGACAGTATGGCAAATTTCTTCAA
AGTATGGAGTATATCAGCTTTGATGTTTGCACCAGTCAAGAACATCTCTC
GAACCTTACTCAAACACTTATCCTAGACTATCAGTTTCAATCAGATGTCA
ACCATACTGAATCTGGAGAAAACGACGGCAAAATAATTCTTCTATTCGTC
TATTTAGAAAAAGATCTTCACAAATTATTATTAGAATTATTATTTGCTCA
TGGACGTATACCAACATTACTATTGAATTCTCATCCATTGCCAGGTATTA
TGAATCCATATTACACGGTGATGGATCCTTTAGACGTTGAGGTTTACATT
CTGTTGATACATGCTAAGATATTCGATTGGCAACGTATAGGACTGATCTT
CATTTCTGGACATGATAAATTATACGTAGATTATTACCGTGATTTAAATG
AAAGAGTTATTAACAAACTTAGAACCGAACATCCAAACTTATGTTATTTC
AAAGAAACAGTCGATATACGAAATGAAACTGATTTGGAATCTATGATATT
TAAGCTGCACGATGAACAAGATTCGAATGTTTTGATTCTCTTTGGCGAAC
CTGATGATCAGATAACTTTAGTCAGGAAAACAAATACGGATTTCCATACA
AGACATATATGGTTCACTCACGATATTGGGCATGATCTTAGAGCACTTTT
TCCAGATCCTTACGAAAATATTTATTTATTCTCATTTACAACTAAACTGA
GAGAGCAAATCGTCCTAAATCAACTCAAATATGCTTTCGATATCAAACCA
CGTTTCAAAGAACTTTTTGTTGCTAATGGGAAAACAGCTGAGTTGGCATT
TACTTTGGCTAAAGAGATTTTGGTACAAATCAACAAAGTGTATGGTAGAT
TCACTAATTTTACACCTTATTTTCTTGTGAAAAGAGCTATTTTACTAACT
CTAAAAGTAGTTCAGTCAGTGTTACTTCAGAAAAACATTTTTTCGCACGA
ATTTGTACACTCTACGGTGCAAATGGTTTACGATATAGATAAATATGACA
AATACAAGGACACTGGTATTCAAGGCATATTATGTCATAAGCATGCATGC
GATCCAGGTTGGGAACAAACTAGAGGTCAACTTTTAAAGAGTCTTACAAA
ATGGAGTTACGAATATGGCTTCACATGCCAGCGTTGTGCTCCCAACTACA
TTAAACCTAAATACGGGTTCCATTTATGCCAGAGCTGTGCAAAATATCAT
CAATCCAATGTTGACCATACTCGATGTGTTGACCCATATACTGATATATT
TTTAACCCAAGATCTTCTGTTCTATGCATCAATATCCTTATCTTGTTTCG
GCGTTAGTATCAATGCAATCACACTGATGACTTTCATATTGCACCGAAAA
ACANCCTTGTTTCGGCGCTAGTATCAATGCAATCACACTGATGACTTTCA
TATTGCACCGAAAAACACCAGTTGTTAAAAGCTCAGATTTCGTGTTAACC
GTTCTACATTTGGTAACATCTTTACTTATTAATGTAGGAATTATATGTCT
TCGGTTTATGAAGCCGGCAAAAATATCATGTTCTTTAGATGCTATTTCAC
CAGGATTCTTGTATACTTTCTTTATTACCATTGTTTTAACTAAATCGCAT
AAAATTTTAAAAGCATTTGGCTCAATGAGGAAGTTAACAACGAAAAATAA
ACGGAACACAATAGTTCAACAATATACCATAATTGTTGGTTTAATGGTGA
TTGTTATTGTTTTGACATTAATTGCACTAAGCAGCCAATTACCAGAAGTA
TTATCTCAAAGAGATACCCAAAAACTAATCATCTATATATCCTGCAATAA
CCTATTGCCAAAAATCTTCCAATTTGGATTTTCAGGAATTTTACAAATAG
CTACATTCGTTATTGCGTACCGTGGTCGAAATTTACCGGATATTTTCAAC
GAATCAATGTCTTTACTGTACGCTTCGTTTTCGTCAACAATGTCACTCAT
TGTGATGTTTATTGTTTTAAAATTCGGAGGGAAAAACGATCTGTTTTTAC
CAGCATCCATCATCTGGGTAGCGGTATCATTGAATTTGAATATCTATGTA
CTATTATGTTATGGTAAAAAGATTTATATTATTTTGTTCATGAAAGAACG
GAATACTAGAAGTTATATACAAAGGAAGACGTTCGAATCGAACCAATCGG
CTTCACTCTAGACGATCCAATCAGAATAACTTAATTTTTAAGAGAATTTC
TAAGCATAGTCCATTCACTTATGATATGATATACTTTAATTTAAAATATG
ATTATAATTGTTTTTAGATTCTGTATGTATCTGTATCCTAACGCCCCAAG
CATTATGCATTATTCAACCTCTCTGGCTGAAATTTTTTATAAAAAATCTG
TTTTTTTCTTGAATGGGGATCTTTTTCTTATTCAAACTAAACGACCCCCT
CCCCCCTCAACTTTAAAATACACTGTATCACATACCCAGTGGGACTTTCT
AAAATTTCTCATCTCTGTTGTAGACTATCATTATTTTATCATCAACATGA
AAAATATAAGCAATCTGAGTGGCGAAAAATGTGTACATAAATGCTGTATT
TCATATTGTACCGTACAAATCCGGGGGGGGGGGTACTTAGGCAAAAATAG
GTGCTGGGTATGTGCGGACGGTAAGGGCCAGGTTTTTCACCTTTCAAAGT
CTCTCTAAGGGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAGG
TTGGGAAAAATCACGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTCTCACTA
AGGGTAGGAAATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAGTCTCTC
TAAGGGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAGGTTGGG
AAAAATCACGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTCTCACTAAGGGT
AGGAAATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAGTCTCTCTAAGG
GTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAGGTTGGGAAAAA
TCACGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTCTCACTAAGGGTAGGAA
ATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAGTCTCTCTAAGGGTTAT
AAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAGGTTGGGAAAAATCACG
ATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTCTCACTAAGGGTAGGAAATTTT
TGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAGTCTCTCTAAGGGTTATAAAAA
TCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAGGTTGGGAAAAATCACGATTTT
GAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTCTCACTAAGGGTAGGAAATTTTTGAAA
ATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAGTCTCTCTAAGGGTCGGTTTTCGGAGG
TCCAGTCCGCACATACCCCTCATCCACCAACCCTAGTACCCCCCCCCCCA
CCCCGGGGGTACAAATATAAGACCGTGTTCAAAAAACGGGTCTGGTAAGC
GAGAGATCGTAATTTGAACTTTCTTGTTGTATCTTTTACCGAAATTTATC
ATCCCCAGAAATGTTTTCGTTTTCCTCTCAAATCACGAAAAATTGTCAAA
TAAAAGTGTTTTGATCTATTGATGAGCATTCGAATCATTTTCAAATGTTT
TGATGTTGATTTCACCAAAATACAGGGGAAAAAATAAAAAATAAAAAAAA
AGACAAATGGAGAGAAGTTTGTTGATACTTTTCAAGTTGATGATAAACCA
GTTATCATACTTTCACCCGTACAATATTGGATATATTTTTTCTCGTTCAG
AGTTTTCTAATTTTCCGAGTATTTAGACGAGGACGAAAATTTGACGAAAA
TTTTTAACTCGTAAAGTATCTCCCATACCCGGGGGGGGCACTTAGGCAAA
AATGGATGATGGGTATGTGCAGACGGTAAGGGTGGGTTTTTTCACCTTTC
AAAGTCTCTCTAAGGGTCGGAAAAATCAGAAAGTTTTAAATTAGTCTCTC
TAAGGGTTGGAAAATTCAGGATTTTTAGGAAATTGTTTGATTTCCACAGA
AGAAATTGTAATAAAGTCTCTCTAAGGGTAAGACTTTTTACAAAAATCGA
AAAAAGAAAATTCAAAAAGTCTCTCTAAGGATCTCCTTTTCAGCAAACGT
CAGTCTCTCTAAAAGGGTTGGTTTTCGGAGGTCCCGTCCGCATATACCCC
TCATTCGCCCCTCATTCGCCAACCCCCAGGCTCCCATATTATACTCTGTA
GCTATTTATTACGTATTTTTGGTAGCTTTTTGATACTAAAAAGAATTTAG
ATCTCATGACACCCCTAGATGAAAATATACCACGACATTTCAAGATTTAC
TGTACTTGAAACCCCAATGAGATAGTCACTGTTAATTTTGAGAATCCCCG
TCGGATTTCAAAATCTCCACAAACGTTAAATAAGGTGGATTTCCATACCA
ATGAGCAATTAGCTCCTTCATTACGTCACTGGTCAAAGAATTCACATCGG
TTCACTGCAACTGGGGTTTGGAAATCTAACTCTTGATTTTACTTGATTTT
ATGAATTGTAAAAAGTTGTAGATTCCTTAAAGACTAAAACTCTGTTTTTT
GTGTGTTTTTTTATATAATTTACACGCTTTCTTTTATAAAAACATGAGGC
TGAAAACTGACTGAAAAATGATTAAGAAGTTACAGATTTCAGATTTAATA
GATTTTCTGTTATTAAGTAAAGAAACATTAAAAACATCGTAAGAAAGATC
GAAGCCTGAGAATCTCCAAATAAGCCCAGTCAAAATTTACTGATTCTTAT
AATAAAAAAACGTGTATTTCACTTTATACAGAGTTACGGGATCGATATTT
GGATGTCACAAAAATGGGAAGACTATCGTCTCAAACATAACATTTCAAAA
GTCATTACACCGCTACTAGGTCTTGGTAGACCTTCTAATTTGATCTGGGT
CCCTGATACAGTTTTTATCAACGAAATCAATTCTAAATAGCATTTGGTTA
CTGTTAGAAACAATAAGGTGGATATTAATAGCGATGGCACGGTGCATTTG
ATCTCCAGAGTCACTGTAGTTGCATCTTGTCGAATGAATTTTCGATTCTA
TCCATTGGATACACAGTTCTGTTATCTCTTCATAGAGAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00010095-exon-sc0000102-1575043694:107739..107782 | TCONS_00010095-exon-sc0000102-1575043694:107739..107782 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00010095-exon-sc0000102-1575043694:90344..90651 | TCONS_00010095-exon-sc0000102-1575043694:90344..90651 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00010095-exon-sc0000102-1510915933:107739..107782 | TCONS_00010095-exon-sc0000102-1510915933:107739..107782 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00010095-exon-sc0000102-1510915933:90344..90651 | TCONS_00010095-exon-sc0000102-1510915933:90344..90651 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00010095-exon-sc0000102-1491911889:107739..107782 | TCONS_00010095-exon-sc0000102-1491911889:107739..107782 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00010095-exon-sc0000102-1491911889:90344..90651 | TCONS_00010095-exon-sc0000102-1491911889:90344..90651 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000102 | supercontig | sc0000102:90344..107782 - |
Blast
BLAST of TCONS_00010095 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: GBRB2 (Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2 OS=Homo sapiens GN=GABRB2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 83.9593 bits (206), Expect = 1.261e-19 Identity = 49/118 (41.53%), Postives = 68/118 (57.63%), Query Frame = 3
Query: 3 IKIQSFREINERKMSYGIDIWMSQKWEDYRLKHNISKVITPL-LGL-GRPSNLIWVPDTVFINEINSK*HLVTVRNNKVDINSDGTVHLISRVTVVASCRMNFRFYPLDTQFCYLFIE 350
I I S ++E M Y + ++ Q W D RL +N+ PL L L R ++ +WVPDT F+N+ S H VTV+N + ++ DGTV R+T A+C M+ R YPLD Q C L IE
Sbjct: 66 IDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQAWRDKRLSYNV----IPLNLTLDNRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIE 179
The following BLAST results are available for this feature:
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